4ORI | Genus

Total Genus 131

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	131
sequence length	361
structure length	355
Chain Sequence	HFYAEYLMPGLQRLLDPESAHRLAVRVTSLGLLPRATFQDSDMLEVKVLGHKFRNPVGIAAGFDKNGEAVDGLYKLGFGFVEVGSVTPQPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAQLTADGLPLGINLGKNKTSEDAAADYAEGVRTLGPLADYLVVNVSSPNTQGKTELRHLLSKVLQERDALKGTRKPAVLVKIAPDLTAQDKEDIASVARELGIDGLIVTNTTVSRPVGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRIPIIGVGGVSSGQDALEKIQAGASLVQLYTALIFLGPPVVVRVKRELEALLKERGFTTVTDAIGADHRR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Fluorine Modulates Species Selectivity in the Triazolopyrimidine Class of Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Rattus norvegicus
total genus	131
structure length	355
sequence length	361
ec nomenclature	ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date	2014-02-11

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4oriA00

5U4NA 1ZHAA 3BW2A 3W7GA 4MKNA 3EXRA 2V9DA 4DEFA 3G1FA 3CT7A 4GE8A 2Y63A 1FDJA 2JKEA 3HO8A 1S3HA 3RU6A 2C19A 5LNUA 3GYEA 3TQ0A 1H7WA 2FFCA 4MPQA 1TQXA 4WQ6A 1GPWA 4CCCA 3GX9A 3W3OA 3PUEA 2VFDA 1VJIA 3NQCA 1B57A 6ALDA 3HG5A 3HB9A 3FOKA 5F1UA 4N4QA 2PCQA 3DZ1A 5F2GA 1TV7A 1RR2A 4UTTC 1T96A 3TU9A 4JXCA 3TAKA 4D2JA 2O7QA 4IGHA 4QNWA 4FX8A 3K30A 1HL2A 4N9DA 1XXXA 4KWWA 2DORA 1THFD 3TIMA 1R30A 5LHFA 5D2TA 5IBXC 1F5ZA 4GRSA 4HIBA 3QC3A 1FBAA 3CB8A 3E12A 4BR1A 3GNDA 4H6KA 3GXPA 5CZ0A 1HUVA 4ZL1A 3CIWA 3BG9A 1X1OA 4JTSA 1XI3A 3JR2A 2ZZ6A 3MMTA 2EHHA 4OGZA 1P0KA 3M6YA 4Y8FA 4NJJA 2QAFA 2AAMA 3GLCA 1HFBA 4HNUA 1EP2A 3EXSA 1KTBA 1SW3A 3VFLA 2YSWA 5BOOA 3IGUA 4UR8A 1FCUA 3KVMA 3G1YA 1SQ7A 5HR6A 1UBSA 3G24A 3NAVA 4K39A 3MYPA 2QUUA 3M47A 1LOQA 4LU0A 5I3KA 2QCLA 1O4UA 3MI3A 1QOPA 1A5BA 1V7YA 2XN2A 4R34A 1SR9A 1QO2A 4RV8A 3FA5A 5DXYA 3C2FA 1FQ0A 2ZRZA 5LSMA 3W7HA 1NAL1 2TSYA 4JS3A 2YYUA 4FB7A 1PCWA 4O54A 3UYCA 5D32A 1H7OA 3WJWA 5CPMA 4PC8A 1KTCA 1IXNA 3O16A 3YPIA 4LTSA 4Z1CA 3AO0A 1PL9A 4LVGA 3HG4A 4K7VA 5J5RA 1NF7A 1GJPA 1FWTA 1WQ5A 3WJSA 2QDGA 5CGQA 3L5MA 3UWWA 4NJHA 3DKJA 2X30A 4ZQNA 4JDBA 1VH7A 1W37A 1ZENA 4N4PA 1YADA 3CC1A 3BG5A 1LBLA 3L0GA 5GVJA 3OBKA 3W2UA 4LVAA 1PV8A 1OFDA 5AC7A 3A24A 3S8HA 1GOXA 3SGZA 5FF4A 3S5ZA 2ZZ4A 3N2XA 4NX0A 2ISWA 3W6YA 3W7OA 1TJRA 4PEKA 1K7EA 2Y85A 5HWNA 2PRHA 3NG3A 2Z2UA 2YPIA 2NUYA 3CWNA 4HNVA 3EWXA 3STFA 1Y0EA 3LCFA 3W74A 3G1AA 5K4XA 1A5CA 1KM3A 4UFLA 3C2OA 5AHLA 1TPWA 2NWRA 4O0KA 1GVSA 4QSHA 4RXGA 1L6WA 3HGRA 1BEUA 3W84A 4QM1A 4GWEA 2X1SA 1G4PA 4O4WA 5EL1A 5G1TA 1L9WA 2J88A 4LVDA 2A4AA 1X1ZA 3A22A 3EX6A 3BLFA 4X22A 1K8ZA 3O05A 1DHPA 4I7UA 4AVFA 4AH7A 1QMLA 1FCBA 3P7YA 1W5PA 2WOQA 4QNEA 5F2MA 4OU1A 1EP1A 1OHLA 4O53A 2ABBA 1Q6QA 4LVBA 1Z42A 1G67A 3LERA 4O19A 1P0NA 2YX0A 4IMEA 1W5NA 2E6FA 4WJEA 5C2XA 1TO3A 3NPUA 3NM3A 2E09A 1KV5A 1TQJA 3W9ZA 3MHUA 2H8XA 3W75A 1EB3A 1KA9F 4M6VA 5F2IA 3BV4A 2W79A 1Q6LA 2Y7GA 1EWEA 1AW2A 1EP3A 2VXNA 4E38A 3O6YX 3QW4B 1PIIA 1GT8A 5AHEA 2FB3A 2A7NA 2P10A 3N14A 4XZ9A 2H3DA 2VFGA 3C8FA 4Y90A 1UJPA 3W1RA 5EBUA 5CKSA 1P1XA 1LLWA 3T44A 3W2MA 4NXSA 1A5SA 5K9CA 4N6FA 1EPXA 1TREA 3NOEA 4FNQA 3HQ1A 3RLUA 3W7IA 1FUYA 2V2DA 4YXGA 1RVGA 2X16A 3W83A 3BVJA 3GXTA 5HINA 2P1FA 1KBJA 2F7FA 5I3FA 4DO4A 1TPVA 1LOSA 2QJGA 2WSRA 3TFXA 4JD4A 1LROA 2Q3OA 2ZRWA 3GNNA 1IF2A 3USBA 2RFGA 3EWWA 1EUAA 2XN1A 1DJQA 3G3MA 3W7RA 1OFBA 4ZVJA 4K7YA 2H3BA 5C6MA 1KFBA 1B9BA 3TMQA 4S2BA 1H51A 1PCKA 4QAIA 3G1SA 1K8YA 4CNNA 5AFDA 2V2HA 2C14A 1LRTA 1LP6A 1TSIA 2ZTJA 5G1YA 3ATZA 4OHQA 3C2RA 4U4MA 1BWLA 1WBJA 2ZFAA 1OFQA 5HWJA 1X6UA 1YTEA 1HO1A 2NZLA 4KFPA 1JCXA 2Y7EA 3QPZA 3NL3A 3TK7A 1K02A 5EY5A 3N9RA 2G95A 3P67A 3R13A 2Q3RA 2VFHA 3DBPA 5D2VA 4OV9A 4DBDA 3L0NA 3KX6A 4ADTA 3HMJG 3P82A 1OX6A 3NQ8A 3QEZA 2A85A 2O7SA 3TE9A 3H54A 4AEOA 5DCDA 3TCEA 3WJZA 1GVQA 4ADSA 2QCHA 4UTWC 2WNZA 2CU0A 1AMKA 3GDTA 2VEMA 1SW0A 4MY9A 1XUUA 4Q33A 2BXVA 4JY8A 3L2IA 3LHVA 4FX7A 4KFOA 4Q32A 2DZSA 3UWUA 4KKXA 1F73A 2HS8A 5IM51 1RQEA 1JRCA 3UWVA 1TTIA 3RMJA 5BRBA 3CWOX 1L2UA 4IXHA 3PBWA 3LTPA 5TQLA 3A9IA 4PH6A 4CLMA 4TMCA 4RJEA 1FWSA 1KFCA 3B0PA 3LXCA 3FYPA 4N6EA 3S5NA 3G8RA 3RLVA 2GVGA 3LV6A 1H61A 3PSVA 3CEUA 2XFWA 1WYIA 2EF9A 1D9EA 4ZQOA 4MIMA 3NVTA 2RDUA 3NXFA 4CCDA 4WX2A 2ATMA 2A7PA 4WOZA 1ZJIA 1VHNA 2CZEA 1A53A 3DU0A 2J6XA 3W87A 3NQAA 2B7NA 1NVMA 5KZMA 1KM6A 3WJYA 1ICPA 5AHIA 3DFTA 1SU5A 4GC4A 4MJMA 3MUXA 2GPTA 1VLIA 5LKYA 3LLFA 3UZ5A 2C13A 1KV8A 5D33A 3MW7A 3BW3A 1C8VA 3W1TA 1A5AA 1SPQA 3LCWA 3QPYA 3VCRA 4CQ8A 5D03A 3B05A 4AWUA 3NDOA 4WUIA 5D05A 1QCWA 3B03A 5I3HA 4FO4A 2H90A 3SSJA 3G8EA 1W5MA 3W73A 1OFEA 5FEWA 3PBVA 3FJLA 3T4CA 4YCOA 1TPEA 3G18A 3F4NA 1FWNA 4X3ZA 1OX5A 5K7JA 1FCQA 1ZAIA 2DJLA 3H53A 3IEBA 3WK2A 4PL1A 3QQ1A 4BI7A 4JTLA 1D3GA 2A0NA 2BWGA 2TYSA 4XWUA 4ADUA 4C1KA 4A29A 5D2XA 3NQGA 5ABTA 3LCGA 1SO3A 3M0ZA 2CLOA 3L65A 3PF3A 5TBOA 5I3JA 2Y61A 4HHPA 1NF0A 2JK2A 3PB2A 4PA8A 3LI1A 4Y96A 4JTEA 3ABQA 1LCOA 3W1AA 5KZEA 3ABSA 1IXPA 3R5EA 4ORIA 3M5ZA 3UPBA 2W6RA 3MHFA 4JTJA 2DZXA 3TR2A 4UTJA 4XKYA 3R89A 4HT3A 1LYXA 3C52A 4P61A 3Q2DA 3LRMA 2PE4A 1H50A 3JS3A 3LCHA 4A2RA 1FXPA 4YLWA 2YFNA 5FEPA 3M9YA 3BARA 2Z6IA 4GNJA 5FEZA 3TUUA 1O5KA 2CZDA 2FJKA 2GOUA 2NXGA 3UXAA 3Q37A 5FF2A 2YCEA 4Y9AA 3QZEA 3TH6A 1S5TA 3MP5A 4FNRA 1XFBA 4MLRA 3BLEA 3W85A 3OA3A 2FPVA 4K8HA 3TDFA 3ZR4A 4NX5A 4EF8A 3GZ3A 4R7JA 1FWRA 3A21A 1JCJA 4ZQPA 4DQWA 1YLVA 1SZEA 2ALDA 4LS0A 4QQ3A 2VEPA 4PCFA 3HF3A 3W86A 4KWVA 2QCDA 5E1QA 4UFHA 1JCNA 1SSGA 4XBSA 5LNVA 3B8DA 3ZS4A 5D02A 1I2QA 3C56A 3HPZA 3DFSA 4DPPA 3S6DA 3W23A 3P74A 1WAUA 3U6WA 5HUOA 3UQNA 3N73A 1B4EA 3QJAA 1EIXA 4NT0A 3TC6A 1XUZA 2J24A 3QQ0A 4PL2A 3SI9A 2WQPA 2QCFA 4UTTA 1FY6A 4FXSA 4RZ6A 3BK0A 3M5XA 3T55A 3TJLA 4XKYB 3ABRA 3DFOA 4FNSA 4MZ8A 3SFKA 4L4LA 5AOUA 5C55A 1OYBA 3A5FA 3G1HA 3VE9A 2E77A 3ZFHA 3L66A 3M5VA 4HKPA 3PS7A 4YWIA 1QPOA 5IBXA 3LM7A 1H1ZA 1OG0A 1OFOA 3LCXA 1W5QA 3LX9A 5MHBA 4ZQMA 2C15A 3GR8A 3PM6A 3MBFA 5F4SA 1TPB1 3PG9A 1I8JA 1ZNNA 1UCWA 3UWQA 1TCDA 2F84A 4JDYA 4LV4A 1JUEA 2QCDB 1SFLA 2KZHA 3EWBX 3KRSA 1VS1A 3GK0A 4HN4A 3TFCA 4WXYA 1VQTA 4Z1BA 4OQVA 4JIPA 2VENA 3TQVA 1DVJA 2WPBA 4GFSA 1VGAA 3W7QA 3TNOA 2DZUA 3KVLA 3O15A 4BF9A 2LLEA 1D3HA 3TMLA 3MP4A 3RNDA 3W2JA 3B4UA 1I45A 1B4KA 3L0KA 5G4WA 1EUNA 3MO7A 3TQKA 2NUXA 3AJXA 3GR7A 4UNKA 3WFAA 1XBXA 3PULA 4NNCA 1ZFJA 4UFMA 2QCCA 1G4EA 2DZVA 4LWWA 3S1WA 1PE1A 3N9SA 2V5BA 4M19A 3BO9A 4IJBA 2GUUA 2QJHA 5C54A 3O8AA 1SW7A 1TJPA 4AXKA 3B04A 1VCVA 1ALDA 4UC5A 3P62A 1BKSA 4O18A 4EWND 2X1TA 3G0XA 4JN6A 2EPHA 2ZBTA 1PVNA 3HG2A 2DZPA 3OVPA 5CSRA 1JQXA 1IXOA 3QW3A 5CZJA 1OYCA 5LNWA 5KITA 2QKFA 2YFOA 4LW7A 5DCEA 1HTIA 1HG3A 5H91A 1ZAJA 3U2OA 3N2MA 5AHNA 3SY5A 4ALDA 5F4WA 4UMBA 4LRSA 5HNRA 5DN1A 1JUBA 2OZ0A 4TR9A 2RKXA 2Y88A 4FX6M 2NX9A 1GZGA 3SW6A 1VYRA 4GBUA 4QJ1A 3S1VA 4UIOA 4GUHA 1OK4A 3THQA 3IV3A 3TSMA 3UY7A 3GB6A 1TRIA 1T0OA 4JTGA 4IX0A 3INPA 4DO5A 3TROA 1H60A 1WA3A 5G5IA 1ICSA 4QISA 4JTIA 3P5YA 4UXDA 3W7LA 3ZWSA 1GG0A 3QYQA 2YW3A 1SO5A 3W1QA 3C61A 4I7WA 1LOLA 1G7VA 3QSTA 5HR7A 5CZSA 3ATYA 4JTKA 1AL7A 2YGYA 1OABA 4JYFA 1F7BA 4FNTA 3IVUA 4O1AA 3IRDA 1AL8A 3C2VA 2HSAA 4MJZA 4RZ5A 4BI6A 2ZRXA 1N8FA 3CM4A 3M5YA 5FF3A 2QCEA 1GQNA 4FNPA 3E96A 3OVRA 3GAKA 1OFAA 1XKYA 3FKRA 2CLLA 5DBUA 3G1VA 2HMCA 2GQAA 3F4WA 4LC6A 3TAOA 3NPWA 3DI1A 2VELA 3EX2A 1MEHA 3G22A 4IX2A 2EKCA 4IMFA 2V81A 1DQXA 2CLKA 5KINA 3PB0A 1IIGA 1F6PA 4IPIA 3IVSA 5L9FA 3W1MA 4LY8A 3C0JA 3QRHA 1WX0A 2FTPA 3UWZA 2FB2A 5G2IA 3W7NA 3LHZA 1IGSA 4LS2A 1EA0A 3E49A 1W3IA 4MLJA 2TRSA 5CPOA 3LHTA 2JGQA 4MZ1A 1NSJA 2DU2A 1L6SA 3R12A 3IIXA 1MO0A 4UTUA 5I3IA 4XQ6A 4JTFA 2NWSA 5TIMA 5AYXA 2PRLA 1C9DA 1RZMA 3N34A 4UFJA 1SUXA 5HWMA 4S2CA 1ZY9A 4GUIA 3T78A 1G69A 3L5LA 1W54A 4NVTA 1QDSA 4K8EA 3CU2A 2UV8G 2B7OA 2PRMA 4LNYA 1XL9A 1G6CA 2NXHA 1XBVA 2B7PA 3UWYA 2E6YA 2X1RA 2Y7FA 1FDYA 3N19B 3NGJA 4LS1A 3TXVA 1TYGA 2QCNA 3S1UA 4BI5A 4H4IA 2VEIA 2Q8ZA 3LBMA 4LUIA 2HS6A 2WKJA 1H7NA 1A50A 1JRBA 2NX1A 4W9TA 5LNRA 2OMAA 2FPTA 2J9YA 3HPXA 4IWWA 1Q3NA 4NU7A 3Q58A 3DAQA 1TMHA 2RH9A 1LLZA 1ME8A 4UTMA 2TPSA 2B4GA 1QPQA 3TJXA 3W7EA 2QR6A 2C0AA 5CPNA 3NQ2A 1YXYA 4FEZA 5K9DA 2VFEA 5DY2A 1OJXA 4UTWA 5D30A 5T26A 5H2ZA 1JCLA 3OHIA 2Y70A 1G4SA 4N2YA 5E93A 3C4UA 3LB0A 4NZFA 3UD6A 3OG3A 1YPIA 5CZTA 3SR7A 4MYAA 4BWLC 1MZHA 5C5YA 3G1XA 5K3VA 2C18A 3KVKA 1QO5A 1UB3A 1QPRA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4ORIA

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