4ORIA

Rat dihydroorotate dehydrogenase bound with dsm338 (n-[3,5-difluoro-4-(trifluoromethyl)phenyl]-5-methyl-2-(trifluoromethyl)[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrimidin-7-amine)
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
361
structure length
355
Chain Sequence
HFYAEYLMPGLQRLLDPESAHRLAVRVTSLGLLPRATFQDSDMLEVKVLGHKFRNPVGIAAGFDKNGEAVDGLYKLGFGFVEVGSVTPQPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAQLTADGLPLGINLGKNKTSEDAAADYAEGVRTLGPLADYLVVNVSSPNTQGKTELRHLLSKVLQERDALKGTRKPAVLVKIAPDLTAQDKEDIASVARELGIDGLIVTNTTVSRPVGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRIPIIGVGGVSSGQDALEKIQAGASLVQLYTALIFLGPPVVVRVKRELEALLKERGFTTVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Fluorine Modulates Species Selectivity in the Triazolopyrimidine Class of Plasmodium falciparum Dihydroorotate Dehydrogenase Inhibitors.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Rattus norvegicus
total genus 131
structure length 355
sequence length 361
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2014-02-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4oriA00
3S1WA 3EWBX 5H91A 2WNQA 3DFNA 4NX0A 3HIJA 3GDMA 3QFEA 3W2NA 2NX1A 1SZNA 4JGDA 1TQXA 1W3TA 3UZ5A 4LRSA 2GOUA 1GVQA 4RZ5A 2BWGA 4LU0A 4IMFA 4OBTA 1KM5A 2CLEA 3P7YA 5DY2A 2NV2A 4UXDA 1YXYA 4HSOA 3R5EA 2E6DA 2FIQA 4IUOA 4O10A 4Z1CA 3L5AA 3T78A 3TFCA 2DZSA 1AG1O 2TYSA 2O7SA 4K38A 1OFOA 3TNOA 5J5RA 1HL2A 4RX0A 1W5NA 3ABQA 3TV8A 2A4AA 1X1OA 4NJIA 4AF0B 3F03K 3HPSA 3L66A 1A50A 2QCHA 3HB9A 4ZVJA 2QCNA 1SO5A 1SZEA 5HMSA 1OG0A 4RXFA 1UASA 4WZHA 3VFLA 4JYEA 3FFSA 1UBSA 3PBVA 2E1DA 4UTUA 3GLCA 3N19B 3DFQA 1YADA 3G3MA 3OIXA 3TC6A 2EHHA 1M7PA 3MWAA 4PA8A 1TTPA 1HO1A 3BG5A 1QPQA 2Y7GA 3WK1A 1U83A 4UTWC 2ZZ4A 4DF1A 4UFJA 4ZQOA 1C29A 1ICSA 3TSMA 3N2XA 3HMJG 1VYSX 1NF7A 4NNAA 2Q3RA 2OZ0A 3CHVA 2E6AA 1I2NA 2V0TA 4UR7A 4N4PA 1GVOA 5CZTA 5HNRA 3OG3A 1ZHAA 4UIOA 5CKSA 4NZFA 4UFLA 4JXCA 3LLFA 5H2ZA 4BFAA 1XBZA 3PC0A 3QSTA 2DZPA 2NZLA 4RLIA 1R46A 2XN1A 2Y61A 5KITA 4HN4A 2ZDRA 1PL9A 5A5WA 3WFAA 3N9RA 1TO3A 3MP3A 4YMZA 2YDAA 3Q37A 3C3NA 4IPJA 2GVJA 3C4UA 5CPLA 3FJLA 4M6QA 1FWSA 1TTJA 2YPIA 3HGSA 4GUHA 4JIPA 5HWJA 5G1TA 3QC3A 5DBUA 1VGAA 4JR5A 1EWDA 1I4NA 1YDNA 5E93A 1EUAA 3KHJA 2YW3A 4AHOA 3E0IA 2EKCA 3W1LA 4EF8A 1JRCA 5I3GA 1J4EA 5GVJA 1HTIA 4NVTA 4O1BA 5AHLA 3M43A 3GDLA 4PL1A 1IIGA 2BX7A 3C0JA 4WY0B 3M5ZA 3PG9A 3FEMA 3C52A 4XKYA 1PHQA 3CU2A 1WA3A 1FX6A 5TBOA 1EP2A 2H8XA 1KLYA 2YZRA 1KTCA 2WKJA 2QR6A 1FWNA 2H3DA 3DFOA 3BG9A 1TJPA 3TE9A 1BWLA 5DY3A 2WSYA 1K3UA 4Y8FA 1EX5A 3OVRA 3ABRA 3B05A 5K9DA 4OU1A 2WNZA 1P1XA 4UNKA 2ZZ2A 1UCWA 2JBMA 3R13A 1MEHA 2C19A 2A21A 3LERA 5LNSA 4O0KA 3RLUA 4MLRA 1LOLA 4ADSA 3EKLA 3W22A 3HJZA 3FKKA 2RH9A 1IXQA 1QDSA 1QWGA 3PUEA 3T40A 2XFWA 4CNNA 3L5MA 3BPWA 1DOSA 4MJZA 4BI6A 5IM51 1YPFA 2Y63A 3UZJA 2O7QA 4FNQA 1F7BA 3PBWA 4CQAA 3M0ZA 4QIUA 2R8WA 5K2ZA 4JD4A 3O05A 3P80A 4KFPA 4LC6A 2ZRXA 2PURA 1RR2A 4N9CA 2OCZA 1EP1A 4IMCA 2PRMA 4WOQA 3RK8A 4M19A 4UFKA 1OHLA 3H53A 3A9IA 3IIOA 3L0KA 4NQ1A 3EX3A 3NL3A 4JTUA 4QQ3A 5HR7A 3W85A 4HNVA 2VEIA 3IVUA 4FEZA 4JTGA 2Q3OA 1O94A 2A1YA 1H50A 1VJIA 1K7FA 2YCEA 4UCGA 4RXGA 3W86A 4FO4A 5AC7A 4NJHA 3UQNA 3QSRA 1UJPA 1OFEA 5LHEA 4FXSA 4LS0A 2GJLA 1OFBA 2X1RA 1OJXA 2G97A 3DZ1A 1PS9A 2WQPA 1ML1A 4FHAA 5CZSA 3BK0A 4U28A 4I7VA 4J9JA 1T0OA 2CZDA 5FF0A 2ZCGA 3O1NA 3G1DA 2ALDA 4AF0A 3U6WA 1IIHA 3LCHA 1OFDA 2PCQA 4MY1A 3S5ZA 3LGEA 1PVNA 3TXVA 3B0PA 3N3MA 4N9DA 3G1SA 1GPWA 3S5NA 3PAJA 2C16A 3QH2A 1TQJA 1KTBA 2JKEA 1L6YA 1HG3A 2W6RA 1OK6A 1Q6OA 3NZRA 3EWYA 3R12A 2Y7DA 3SECA 5KSWA 4JY9A 3BV4A 1VLWA 1FWWA 4UC5A 1ME7A 3W1TA 3DI0A 3QYQA 2ZZ6A 3LRMA 1SO4A 4Q32A 2C14A 4IOTA 3DFPA 2B4GA 1Z41A 3K30A 2CZ5A 1PIIA 1A5SA 1MZHA 1B4EA 2ZA3A 5G4WA 1BWKA 4FF7A 4YLWA 3THAA 3WJSA 2QCGA 3PUDA 3TCEA 1HFBA 1SQ7A 4WX2A 2CLMA 3WK0A 4MKNA 2DJXA 5D04C 1L2UA 1OABA 3HPXA 3MBFA 3O06A 3RMJA 3S42A 1RQEA 3UWQA 4OGZA 3CPRA 1G4EA 2Z0IA 4K7VA 3TIMA 3HOJA 1AK5A 3G0XA 4K6AA 4JTEA 1R47A 4GRSA 1VCVA 4FNTA 2Y88A 3C2OA 5K4XA 2ZRVA 1J2WA 3GYEA 5K9XA 4HT3A 3LXAA 1ZENA 1WOBA 1DKWA 2YYUA 5AHIA 5EPDA 1VYRA 4NUWA 2D73A 4FNUA 3VE7A 3W7RA 1NSJA 3ELFA 4EOUA 3LCXA 2FPVA 1EWEA 4QJ1A 4IWWA 1VHNA 3W2LA 3W71A 5HWNA 3EB2A 3WK2A 3LXCA 1XC4A 3EEGA 4HNNA 1LBFA 4AWTA 4WY0A 4UFHA 3G1YA 3TC7A 2HS6A 2DZWA 5F4SA 3SSJA 5BMXA 3CWOX 5KTLA 2ABBA 3A23A 4N6EA 5F2GA 1G67A 1W37A 3IGUA 1W8SA 3NQ2A 4ZQMA 4N02A 4N9EA 4OV9A 1TPUA 2CWNA 4CNOA 2HSAA 2ISWA 3CQ0A 4UTHA 4MZYA 3LHUA 2R91A 3UNDA 4C1LA 5AOUA 3A22A 4A21A 3UXDA 1XUUA 2NX3A 4QNWA 4DO5A 1TSIA 2DP3A 4MJMA 3NM1A 3HPZA 1KFCA 2J27A 3O6CA 5LHFA 2X1UA 3AJXA 1WBHA 2CW6A 3TW6A 3M44A 3LHYA 4AEOA 1GG0A 4LC8A 2P10A 4JTTA 3W9ZA 1GYNA 3FYOA 4DO4A 3G8EA 2QAPA 3KVMA 1EA0A 1GEQA 1KFJA 1XBXA 3NL6A 4WQ6A 2ZZ1A 4JDBA 1TPFA 2E77A 3A5VA 3QPYA 3MBDA 3BW4A 3MI3A 2NXHA 5I3IA 5BW6A 4AXKA 1SW7A 4RR4A 1YTEA 1JCMP 2YSWA 1M7OA 4U4MA 5TQLA 3L9CA 1K8YA 2YXGA 4QAIA 1H7NA 3FLUA 3LOTA 4JYFA 2VFFA 4MZ8A 3OVPA 3N73A 4IXXA 1LRQA 4O53A 4TO8A 3GR8A 4RJEA 4BWLA 2VEPA 1GTEA 3NQCA 3PF3A 2A6NA 4PCFA 4NX5A 5D09A 3LTPA 3L65A 1TTQA 4OQVA 4LWWA 5CPNA 3WJZA 3W75A 1PCWA 5I3HA 3LBMA 4UNLA 2NLIA 1F6KA 7TIMA 1W56A 2C18A 4O19A 3Q94A 2QCMA 3IRDA 1G4PA 3EX2A 3M5VA 5FF2A 4JX5A 4I7WA 5HINA 3G8RA 1OVDA 5AC8A 5LNUA 3ABSA 5LNWA 3E49A 4FNPA 1SO6A 4FX8A 3TH6A 5C2XA 1OFQA 1SU5A 4O0ZA 1W54A 3B06A 4E2BA 3QRHA 1H7OA 1K7XA 5D30A 4E0CA 3OVQA 4K36A 1AW5A 1VHCA 1M5WA 1WBJA 3TR2A 1XM3A 3TU9A 4PL2A 4ONVA 1TV7A 1RVGA 2YFOA 3FIGA 3I7QA 1G7UA 4N2YA 1VQTA 2W0UA 2GUUA 5G2HA 3NGJA 2X2GA 2V8ZA 4RZ4A 1H7WA 1OX5A 2NWSA 4S2BA 3RLVA 4LUJA 3O8AA 2HTMA 1JCYA 1QMLA 2R14A 3CLMA 1OX4B 3GDTA 2DJLA 1F2JA 1LBMA 4M7SA 3PB0A 3BGJA 1FCUA 3IIZA 5EA9A 4P2VA 3NZ1A 2C0AA 4UMBA 1TCDA 3ABOA 3HG4A 3H54A 3EX1A 2YGYA 1QNVA 3PS7A 1X7FA 4FXRA 4O1DA 4O57A 3USBA 2CFFA 3PM6A 3M5XA 1YTKA 1S5TA 5LGXA 1H51A 4M5PA 4XWUA 4LV4A 2C3ZA 1U5JA 1GTHA 1SZGA 1ZAJA 1OF6A 1XUZA 1A5CA 3W7PA 3NQGA 4WJEA 4MYAA 2PRHA 3N2MA 4XUGA 1V7YA 3W7OA 3T4CA 2GVGA 3H55A 1LDCA 1KV8A 2J6XA 1OYBA 2VENA 5CSRA 3CT7A 2G96A 1I2PA 3W7GA 2VEKA 1LZOA 2VFEA 1JULA 4AB4A 3MI6A 4R34A 4RKAA 2WSRA 1QOQA 1FCQA 1QO5A 1LOSA 5MHBA 4Y96A 3P5ZA 3NDOA 3I7RA 1KFBA 3QMSA 3TMLA 4GE8A 5LZLA 1UB3A 2C13A 3HBLA 4HPXA 3I7SA 4M6VA 1G6CA 1LRNA 3W88A 2YX0A 4DEFA 1XDMA 3RF9A 5IBXC 4GUGA 1TJRA 3M16A 3ZWTA 4CCCA 2BSLA 5LNVA 1DQXA 2WJZA 3L21A 2Z6JA 3B8DA 2NXGA 1JQVA 1ALDA 1D3GA 3C2FA 3MHUA 4C1KA 1DVJA 4IGHA 1KM1A 1D3HA 3MP5A 2X30A 4DPPA 1QAPA 2QCCA 4E2DA 4QM1A 2J88A 1DORA 5F1VA 4ZMGA 2CZEA 3LCFA 1VYPX 4UR8A 3IIXA 4NT0A 1Y0EA 4TX9A 3LXBA 1F74A 2QDGA 4HHPA 1PCKA 3LCWA 4IMEA 3FA5A 3KRZA 4QISA 3Q2DA 3HG3A 4JTFA 1GZGA 2P1FA 4QITA 3B0VC 1MEWA 1SFJA 1BKSA 2LLEA 4ORIA 4IMGA 4D2JA 3TMQA 2V81A 3DI1A 1OFRA 2TMDA 3ZS4A 5I3FA 8TIMA 1TV8A 2F84A 3P82A 1TRIA 3SR7A 3TSDA 5CGQA 4MY9A 4JTLA 1TB3A 5D05A 2OX1A 3GDRA 1SW0A 5F4WA 2RDWA 5KZDA 3EWXA 4K8EA 3F4NA 3TDFA 1VCFA 3DKLA 3MHFA 1VR6A 2VOMA 4O12A 5AB3A 3EWZA 3ZFHA 4NNBA 3W1XA 1H62A 1K8ZA 3VNDA 2WPBA 4LTSA 3T7VA 3S1VA 2FLIA 2X16A 2VFDA 4NXKA 1Q6QA 2GQ9A 1YLVA 3KVLA 3TROA 3HGJA 3W1PA 3W87A 2V9DA 1TPB1 1O95A 1XXXA 1W5QA 2DZTA 3S0CA 4UTTC 3U8GA 1FCBA 4KWWA 4HSNA 4UTWA 2ATSA 4O54A 1WYIA 3BARA 1LORA 3PVFA 4ADUA 3PSVA 1H7XA 3BW3A 3W2UA 4AVFA 1MSSA 2X1TA 4YL2A 1YXCA 4JS3A 1QCWA 2A2IA 3GB6A 3V75A 1SFLA 1KM0A 2V2CA 4HPJA 2JGYA 2KZHA 2B7OA 3NO5A 5FESA 2WV8A 5DBTA 2CLOA 1KBJA 3LCLA 1AL8A 1GVRA 1WX0A 3LI1A 3R8RA 5C55A 4O4WA 4A22A 5CG7A 3W1RA 4WXYA 1XI3A 5HWMA 2B7NA 2YYTA 4TR9A 2CLLA 1T8XA 3A5FA 1SPQA 1LROA 1TIMA 2CZFA 4AHQA 3W3OA 3HG5A 5LGZA 1TMHA 3LDVA 3EWWA 1KM3A 4OHQA 3WJWA 3S5YA 5L6UA 1VPXA 3NR0A 3MYOA 2NV1A 3STEA 2XN0A 1WXJA 1G4TA 4NNCA 1KA9F 3NG3A 4HNUA 5EYWA 1OYAA 4N9BA 5AFDA 1F05A 4MFEA 1XKYA 4O11A 3EX4A 3OHIA 1T96A 3LBCA 3BGGA 3QQ1A 4L4LA 5KZMA 3LLDA 1OK4A 1OX6A 1OX4A 5BOOA 3QMTA 3MI2A 1OYCA 3KRSA 4CQ9A 5DXYA 2FTPA 5G5IA 3S5OA 3GNDA 3TQKA 4POCA 3M9YA 3N9SA 4HIBA 4RV8A 2TRSA 3A21A 2A5HA 3LI0A 5KZEA 2QCLA 4MYXA 5E1QA 4JY8A 4MUZA 1D9EA 4Z1BA 2JK2A 2JKAA 1KV5A 2J24A 3TX9A 3GZ3A 2WOQA 3NL2A 1H63A 4UTTA 3C2EA 4H4IA 1THFD 3GXTA 1H7RA 1G7VA 3STCA 3INPA 2E5CA 3W7HA 2JKPA 2DZVA 2I1OA 2VFIA 1WQ5A 1R2RA 5FF4A 4GUJA 4CQ8A 3EXTA 3NQVA 6ALDA 1SO3A 2OT1A 2AQWA 2OJPA 1O60A 4TIMA 1HO4A 3SW6A 2E5DA 4YCOA 5D2XA 1MO0A 4DF0A 3LV5A 1SSDA 1ZY9A 2Y7FA 1V5XA 3E96A 3LRKA 1N8FA 3PUOA 2ABAA 3IGXA 4NU7A 4EIVA 3RNDA 2ATMA 3GKAA 1YYAA 1XDLA 3NAVA 3KVKA 4MVAA 2J9YA 4YXGA 3NEVA 4OWGA 3SZ8A 3KVJA 1ADOA 4IXHA 4A3UA 3DHDA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3TVA A;  5AKQ A;  4UQA A;  3EWB X;  4GC3 A;  3D5H A;  3GDM A;  1BQC A;  4KCT A;  3IRS A;  1A4M A;  1MWO A;  2J6V A;  3OYZ A;  1PDY A;  3VDC A;  2NX1 A;  1SZN A;  1W3T A;  4I8D A;  4FP1 A;  1Z6K A;  4QQU A;  1PEZ A;  4TOQ A;  4LU0 A;  1NQK A;  3MT1 A;  4JPG A;  2CLE A;  2GQ3 A;  3OG2 A;  3P7Y A;  4LCS A;  1KRC C;  1CPU A;  3AS0 A;  3NGF A;  1YXY A;  1EIB A;  3KL3 A;  3R5E A;  4IUO A;  3T78 A;  2DZS A;  1AG1 O;  2GGI A;  2O7S A;  1CT5 A;  3T9P A;  3SCO A;  4OKD A;  1E15 A;  1I6N A;  3DOP A;  4D6H A;  3VNL A;  1W3J A;  3UR5 A;  1NOU A;  4QEH A;  3EDK A;  3HB9 A;  2QCH A;  3WLL A;  1NFP A;  3BJT A;  2YA0 A;  5HMS A;  1WO2 A;  2AQO A;  4H7V A;  1R7A A;  5T8G A;  1UBS A;  2E1D A;  2Y5S A;  3RXZ A;  1VJS A;  3GG7 A;  4AWE A;  4HVX A;  3OIX A;  4DY1 A;  4B5S A;  2YB4 A;  4S3G A;  3MWA A;  4PA8 A;  1HO1 A;  3BGA A;  2DT1 A;  3IUH A;  4UTW C;  4DF1 A;  4UFJ A;  3ZT7 A;  5TAO A;  3TSM A;  1RCQ A;  1VYS X;  1TE1 A;  3BLO A;  2I56 A;  2V0T A;  1C7T A;  4N4P A;  1GVO A;  5JBF A;  4D6D A;  1XH0 A;  2OZ8 A; 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