4MVA | Genus

Total Genus 97

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	97
sequence length	255
structure length	255
Chain Sequence	MRHPLVMGNWKLNGSRHMVHELVSNLRKELAGVAGCAVAIAPPEMYIDMAKREAEGSHIMLGAQNVDLNLSGAFTGETSAAMLKDIGAQYIIIGHSERRTYHKESDELIAKKFAVLKEQGLTPVLCIGETEAENEAGKTEEVCARQIDAVLKTQGAAAFEGAVIAYEPVWAIGTGKSATPAQAQAVHKFIRDHIAKVDANIAEQVIIQYGGSVNASNAAELFAQPDIDGALVGGASLKADAFAVIVKAAEAAKQA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
source organism	Escherichia coli
publication title	Structural, kinetic and proteomic characterization of acetyl phosphate-dependent bacterial protein acetylation. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Triosephosphate isomerase
total genus	97
structure length	255
sequence length	255
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date	2013-09-23

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4mvaA00

3NQ8A 1XC4A 1EP1A 2QR6A 2RDTA 4LV9A 4PC8A 2RH9A 1I8JA 3IGUA 1PCKA 3W7HA 3BW3A 5AHMA 3SZ8A 1WBJA 1IGSA 4MIMA 1XKYA 5CKSA 2VENA 4M6VA 3NG3A 3QMTA 1ME7A 3DH7A 3G8RA 1YXCA 4AAJA 4UXDA 4DO5A 2QJGA 4DF0A 1EUAA 1G67A 1N7KA 3W74A 1RZMA 3GXPA 1F76A 1CI1A 1KFKA 3EX6A 1UBSA 4OT7A 2PRLA 2WNQA 5F2LA 2E1DA 3F4WA 5D33A 1FCBA 4KFNA 5KITA 2NV1A 3QSRA 2JK2A 3W76A 3JS3A 3Q94A 4KFOA 4A2SA 1QO2A 5LKYA 1LOSA 2CLMA 3LDVA 3O8AA 4MY9A 1KFEA 3N34A 4E0CA 3BK0A 1ME9A 1OYAA 3DZ1A 1I2QA 4BWLA 2NV2A 3S9YA 1IIGA 4ALDA 2Y63A 1WOAA 1VLIA 3HGJA 4N4QA 1N55A 2VEMA 4MUZA 3MUXA 4LVGA 2Y7EA 4O53A 2QAFA 1DHPA 4NNCA 1GG1A 1KW1A 5U4NA 3A22A 4CNNA 2Y88A 3HGRA 5LNWA 2DZVA 4S2BA 3W7KA 3KVJA 3GDMA 2E5BA 2A6LA 4QITA 5GVJA 4DO4A 4HNTA 4LV4A 4S2CA 3GR7A 3TA6A 5T26A 1GVSA 1KFCA 4PL2A 4X2RA 2WJZA 1JCYA 1TV8A 1FXPA 3FLUA 4CQ8A 3QQ1A 3IGXA 1PL9A 3WK2A 3ABQA 3B0PA 5HJLA 3C2VA 3BGJA 3EXSA 3TK7A 4IUOA 3S0CA 2QCCA 1VHCA 1VS1A 3L2IA 3THQA 2Q8LA 3G0XA 2F84A 4WJEA 3N9RA 2WSQA 1AW2A 3G0SA 4HNNA 1P0NA 2NWRA 5G4WA 3RU6A 3NL3A 5LHEA 4LWWA 2I9EA 3FJ6A 4WXYA 1XXXA 3CLMA 3PVFA 4LTSA 3PB0A 2YX0A 3WJXA 6ALDA 4XKYB 2NLIA 3MJYA 1XBYA 3OG3A 2VKZG 1VHNA 4UTMA 3NL2A 4JTSA 3W07A 1EPXA 2NWSA 3PSVA 3O06A 4H3DA 3DKJA 5AN7A 1SFJA 3C2EA 3PG8A 3O6CA 2QCGA 4UNLA 5DXYA 2OX1A 5KINA 2HS8A 1W31A 2E6YA 4ORMA 1LM1A 3IIXA 1LRQA 4DQWA 1PHQA 3VFLA 4O4VA 1RQEA 2ZFAA 5EMUA 1TPB1 1JRCA 1S5VA 3NQGA 3W7PA 2QDHA 3IVSA 1PE1A 3ANYA 1H63A 1W8SA 4LVBA 5D2TA 1ALDA 4GJ1A 3FKRA 3VKJA 3T40A 4OGZA 3TX9A 2GVGA 1WX0A 4GUFA 4UNKA 4JIQA 1R2SA 4JX5A 4JXCA 4AWUA 4LS1A 3QW3A 4UIOA 4CQ9A 4IPIA 1OHLA 3PUEA 4LU0A 1PV8A 1V7YA 5DCDA 1TPUA 3B06A 5SWUA 3S42A 1M5WA 2FDSA 4IXHA 5BNKA 1NFBA 1YPIA 4FX6M 2IQTA 2PE4A 1TPDA 4DBEA 3CU2A 3RLVA 3O05A 2EHHA 4DBDA 1KBJA 2VEKA 2ATMA 2WPBA 3CWOX 4HPXA 4NJKA 1QOPA 3TSMA 1SSGA 3I7QA 4POCA 3BG5A 1L6WA 3MI6A 4LVDA 3I7SA 1L9WA 3WK3A 5LGZA 1I2PA 3LHWA 4N9EA 3LV6A 1GZGA 3P81A 1FCUA 2ZRVA 4UTLA 4PH6A 2ZA2A 3HMJG 3F03K 4FIRA 5A5WA 2ZZ6A 2WKJA 5F2MA 5L9FA 3H55A 5H91A 4NNAA 2B7NA 2VFDA 3M5ZA 5TQLA 5LNUA 4AHPA 3M41A 4BI7A 1WYIA 5K9XA 3OHIA 2R14A 4ZZ9A 1QWGA 5HUOA 3BLEA 4YXGA 1F6KA 4AWTA 4HIBA 3W2KA 3C2FA 1YTKA 4JDYA 4DELA 1G7VA 3HBLA 2QCLA 4Z1DA 1MEIA 2HS6A 2CLOA 4OBTA 5CSSA 2YW3A 1IXNA 2D73A 4O54A 1XUZA 2GPTA 1B3OA 1KA9F 5AOUA 2NX9A 1IXPA 2X30A 4QNWA 1GEQA 3NOEA 3NQ7A 3KFTA 1HL2A 3DI0A 2E6DA 1QPQA 1OYCA 2DZXA 4NJJA 2JKAA 4XTDA 2HSAA 4QAIA 3SGZA 3TR2A 3BPWA 3LTSA 4IX0A 1HUVA 3MYOA 1KTNA 2DORA 1ZAIA 3W2MA 1JCXA 3E96A 4MY8A 3OIXA 3G1XA 2V2CA 1W3TA 4QISA 3KVLA 1C9DA 3W3OA 3IIZA 1Q6OA 1Q3NA 3MP5A 4LY8A 2A7PA 4Z0SA 4N9DA 5DBTA 4QJ1A 2V8ZA 1RPXA 4Y8FA 4C1KA 2FTPA 3R13A 3M9YA 3A21A 1T96A 1QCWA 1TTPA 2CFFA 3DFSA 4IMDA 4M5PA 4WY0F 2BXVA 2BX7A 4JYFA 3WJWA 2NUXA 3CPRA 4AH7A 1YXYA 3BO9A 1DBTA 4WY0B 1FWWA 5IBXA 2ZZ3A 2Z0IA 4MLJA 3MI3A 3IRDA 3LCHA 5AHNA 4YCPA 5TBOA 3TW7A 5C6MA 4WUIA 4EF8A 3P84A 1P0KA 2CLIA 1VZWA 4NXKA 1HO1A 2AGKA 1V5XA 2PRHA 5I3GA 3G1DA 3TMQA 5AHIA 3UNDA 2QDGA 4BWLC 5DLCA 2XN2A 3HG4A 4NJGA 3HGOA 1VQTA 1SFLA 2FIQA 4P61A 4O1DA 1B57A 2H8ZA 4Q33A 3K30A 3GLCA 1UASA 1TMHA 5D30A 4XQ6A 4NZJA 3PBYA 1SW7A 4PA8A 1B4EA 2YW4A 5KZMA 4JY9A 3BV4A 1OFAA 2I14A 1HTIA 4HN4A 2E5CA 4KKXA 1L6YA 3RNDA 3ZWSA 4IWWA 3W84A 1H7OA 3T7VA 4Z1CA 5EYWA 3NZRA 1OK6A 3QQ0A 4UMAA 1YLVA 2X1SA 1S3HA 4FB7A 1R46A 4JTKA 3W2UA 4O16A 4WQ6A 1SPQA 3PWAA 4ADSA 4X3ZA 2OJPA 4RJEA 4Y96A 3W72A 4KWVA 3NQCA 1X7FA 3PM6A 5CZTA 1BKSA 5C5YA 1JQXA 4IMFA 1P5BA 4UC5A 2J27A 3U8GA 4K7YA 3DXIA 1TPC1 4RLIA 3P82A 4B5NA 3LBCA 1OJXA 2YR1A 2GOUA 1JUKA 2I1OA 5FF7A 3MHUA 1VRDA 2CLFA 3ATZA 4JNMA 1JCNA 3WK0A 1NEYA 4UMBA 2C6QA 1ZHAA 1ADOA 3BARA 2Y6ZA 3S5OA 3I68A 1EP3A 3BW2A 1L6SA 1JRBA 5HULA 4FNPA 4JICA 2RDWA 2QUTA 2A85A 1A5SA 4A29A 1W5QA 1PIIA 4UR8A 1TREA 1OFEA 1OVDA 3TXZA 4RV8A 2E6FA 5EL1A 1I2RA 3NPVA 3PBVA 2R94A 3LV5A 3Q2DA 5MHBA 2YFNA 4RKAA 3NA8A 4O17A 3NO5A 4BI5A 1OX4A 2NUYA 3V75A 4H6KA 3M16A 5LNVA 3ABOA 2Z6IA 4M7SA 2O7SA 1FCVA 3UY8A 1H51A 4GUHA 2QUVA 3TW6A 3P62A 4BR1A 3GAYA 2J6XA 1K8ZA 1QOQA 1S5WA 3IIPA 3BG9A 1XL9A 4MJZA 3G8EA 3B8DA 3EX4A 3LTYA 5FF0A 4XWUA 3HF3A 5BMWA 3S1XA 1LCOA 3IVTA 4LC8A 1FQ0A 3DFNA 3LXAA 1GOXA 2O7QA 2YGYA 2CZ5A 3LHZA 3QPZA 4I9AA 4GE8A 5G1TA 1YTEA 3BW4A 5DCEA 2FB2A 5FEPA 1JR1A 5F4SA 3JR2A 3GK0A 3HIJA 3KRUA 2C16A 2V0TA 4PODA 2YSWA 4ZQPA 2C0AA 1LOQA 1OFBA 5AYXA 4CCEA 1UCWA 2FPVA 1EA0A 3N14A 3MP4A 2ISWA 1JCLA 2P1FA 2Q8ZA 3NQVA 4NXSA 1K7FA 5AHLA 1TRDA 3W75A 3NPXA 1JUEA 1H60A 3JRKA 1T99A 4YLWA 1KM4A 3QM3A 3LLFA 3QF0A 3TJXA 3FYOA 4LS0A 3PR2A 1TPVA 5G1YA 3UYCA 2TSYA 3KOFA 3UWWA 3NQDA 2J24A 3QEZA 3W7CA 4CCCA 1Q6RA 3B0UX 5E1QA 1E51A 2Y7GA 3MBFA 3WK1A 4HSNA 5I3HA 4FIQA 2QCDA 1ZY9A 2UV8G 4AF0A 2GUUA 3PC0A 5EPDA 4MFDA 4UTKA 4MZYA 4TMBA 2Y7DA 3UWUA 4WX2A 4BI6A 1W5PA 3NL5A 5AFDA 3SIZA 3O07A 2VFFA 3W71A 4QSHA 3RK8A 3HGSA 4HSOA 3THAA 2ZA3A 3S1UA 4CQAA 2Y85A 3M47A 3UXDA 1KM5A 4FX7A 2H6RA 1TPEA 5AHFA 4IXXA 4CLMA 1QR7A 1ME8A 4O0ZA 4TO8A 1W3NA 3IVUA 2ZTKA 3NYZA 2OMAA 3W73A 2R8WA 1KLZA 4X9SA 5HR7A 4LRSA 4O0KA 3TH6A 4IOTA 3W2NA 4AHQA 3G3MA 2FJKA 1F74A 3GDKA 3QRHA 4NZFA 4J9JA 1TSIA 3Q37A 3W7LA 4MJMA 1VH7A 3R2GA 3W7NA 3QSTA 3W86A 1WQ5A 1TRIA 5DELA 1BWLA 3LHUA 2H3DA 2ZQ0A 3C3NA 4Z1AA 3CC1A 1K8YA 4DF1A 1PS9A 3SGUA 1TV5A 3CIWA 1G69A 1SO5A 5I3JA 2VOMA 1FY6A 4LW7A 1LLWA 2C3ZA 2LLEA 1HO4A 3HG3A 1NF7A 4MLRA 5IBXC 3LGEA 3CB8A 1YDVA 4Y90A 1KM3A 1VCFA 4LVFA 1G7UA 3TSDA 1F6PA 1SW0A 4Y9AA 1VPXA 4L4MA 4FNTA 4UCGA 4JX4A 5DXXA 3STFA 2F7FA 4O11A 4E38A 4JDBA 1OF8A 1W54A 1Y0EA 2QCEA 3G18A 3MMTA 2C18A 3N9SA 2Y62A 3M43A 5HQEA 3NL6A 4BFAA 1SUXA 2Q3OA 1DKWA 4DXVA 2OT1A 5U7SA 4FNRA 1GG0A 4O57A 4FO4A 5EA9A 1VYSX 3EWYA 1GVQA 3DFQA 3S1VA 1KTCA 4O4WA 3I65A 3L9CA 4JTTA 4PTNA 3WJYA 1KLYA 1C8VA 3RMJA 3FEMA 2G96A 3G1YA 2RFGA 1YYAA 3L0KA 1G4TA 2H8XA 2DZWA 2WV8A 4MZ8A 4KWWA 2E68A 2GJNA 2B4GA 4LRTA 4K8HA 2B7PA 2DP3A 2QCHA 5FF2A 3YPIA 2CZFA 5F1UA 5KZDA 3RFAA 2CWNA 5C54A 5F2GA 1NVMA 4JTIA 3W83A 1PHWA 3H53A 1OYBA 3STEA 4JTEA 4GXMA 3MW7A 4Q32A 3B05A 1FXQA 1Q6QA 2QAPA 3KHJA 1O5XA 1KBIA 2V81A 2G95A 1XFBA 5G2IA 2QJHA 4NX5A 4S1FA 4NQ1A 4RK8A 5CPOA 1TQXA 3SR7A 4LUIA 2ISSA 1DJQA 1TO3A 3DHDA 1VYRA 5FEZA 1W3IA 4O18A 4U28A 2FB3A 3MWAA 3QMSA 1OFPA 4R34A 4WOQA 1ZENA 3DGRA 4O13A 4ADUA 1JVNA 4FNUA 2R91A 3W1AA 1R2TA 3W1MA 3EWUA 1TTQA 3EXRA 4CNOA 4TX9A 1AMKA 3H54A 3F1QA 4XBKA 3UWQA 1BWKA 5AYYA 2QKFA 5LZLA 4R33A 3NQ2A 4R53A 3N3MA 3W7GA 3FA5A 1VGAA 4WOZA 1K03A 3W9ZA 2TRSA 1WOBA 3LB0A 2DU2A 1XDMA 2V2DA 1FWTA 1TV7A 3HJZA 3TQVA 3G0UA 3ZR4A 1ONRA 4GC4A 1K02A 4OV9A 3LCLA 1QNVA 1LRTA 1SO4A 4WD0A 2VEIA 3B4UA 1XUUA 5AYZA 4TIMA 5G2HA 3MP3A 5I3KA 1VLWA 1SZNA 3IV3A 3CM4A 4N2YA 5D09A 1MSSA 4ML9A 3EX3A 1JQVA 3R89A 4AEOA 3W1PA 4UFJA 4MYAA 3UXAA 4PL1A 5HR6A 3GXTA 4FF7A 5A8GA 6TIMA 1P4CA 2YYUA 1DORA 5TIMA 1F2JA 1I4NA 5LNRA 1EUNA 5AC7A 2C13A 3IIOA 4A3UA 3KAOA 2C19A 3WJSA 2JKPA 4XKYA 2ABBA 3A5VA 5CPNA 1JCMP 2B0MA 4FX8A 5K9CA 5CZJA 2QEZA 5DY2A 2X1TA 3LM7A 3FIGA 5EKYA 3PUOA 3W1RA 3DFPA 3CIXA 1VCVA 3C52A 2X16A 3NEVA 5G4EA 2OCZA 2YYTA 1Z41A 3C61A 3DKLA 2NXGA 1GYLA 5CPLA 3C4UA 4ONVA 3NDOA 3PB2A 4ORIA 1EB3A 4JTLA 4JD4A 3TQ0A 2ISVA 1FDZA 2V82A 2Z1BA 3DFOA 1QPOA 4UFIA 7TIMA 3GYEA 2V5LA 2VELA 3IGSA 3E49A 3M1ZA 3L0NA 3TNOA 4NT0A 2X1UA 4UTJA 2JGYA 5AC6A 4AMAA 3NM3A 2W79A 1TPH1 4OWGA 1AK5A 4GUGA 2PRMA 3NNTA 3L21A 4OE7A 3DAQA 1SO3A 1Z48A 5D37A 5DCBA 1D3HA 3W87A 2C1HA 3C2OA 3QW4B 3M44A 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4JTJA 1O95A 2ZBTA 2ZTJA 3CEPA 4FHAA 3LCXA 1IF2A 3W1TA 1X1ZA 4MKNA 4HNUA 1SZGA 5D2YA 5FESA 1GVFA 1F5ZA 4OV4A 3LI0A 3HPXA 5CPMA 3T44A 3KRZA 1BTMA 3P7YA 4JN6A 3C2RA 1SU5A 2DZUA 3LERA 4GUIA 5BMXA 3GX9A 4WY0A 1WA3A 1O4UA 3UQNA 2E6AA 3A23A 1ICPA 2BZNA 3P8IA 3RF9A 1AG1O 4AWSA 3VCRA 3SI9A 5LSMA 2OZ0A 4XZ9A 5KSWA 2QF7A 2HTMA 5KMYA 3P8JA 4R7JA 4GWEA 2FPYA 2CW6A 1GWJA 5IM51 3HG5A 4IMCA 1TQJA 5L6UA 2EAWA 4X22A 4IGHA 4DEFA 3TFCA 1H1ZA 3PULA 1K3UA 5D32A 3VE7A 4ZQRA 4A22A 5BRBA 4EOUA 1A5CA 3O63A 1H50A 1FDYA 3Q58A 4NUWA 4ZQCA 2YDAA 5E93A 3TUUA 1J5TA 1R2RA 5CZSA 1WDWA 2VXNA 3P74A 1OFOA 3T55A 1R47A 3IIVA 2BTMA 4UFKA 4UUIA 1KFLA 4HT3A 3BLIA 4AB4A 2Y7FA 4Z0JA 1ZFJA 2DZSA 3TAOA 1OK4A 2JBMA 2ZRUA 1OFRA 5K4XA 1ZCOA 3UWVA 2A1YA 1QAPA 3LRMA 3QMRA 5EBUA 5LGXA 4FNQA 4O12A 4HHPA 3EX1A 4L4LA 4YMZA 5F2IA 4EWND 2GJLA 4JGDA 2A0NA 3W88A 3KVMA 3W7OA 3FOKA 1LZOA 3BLFA 4GRSA 3WJZA 1UUMA 1ZAHA 4N6FA 1CW2A 4MVAA 1TB3A 2VFEA 4Z1BA 1ZAJA 1UB3A 3W85A 2V5BA 3FYPA 5FI8A 3A5FA 3OVQA 1H7PA 4LVAA 3RLUA 2C15A 5KZEA 1QPRA 4UTTA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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Chord Diagram

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