3UYCA

Designed protein ke59 r8_2/7a
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
246
structure length
241
Chain Sequence
PRYLKGWLEDVVQLSLRRPSLHARPIISLRERILEFNKRNNTAIIAVYKRKSPLNVERDPIEYAKFMERGVVGLAILTEEKYFNGSYEDLRKIASSVSIPILMWDIIVKESQIDDAYNLGADTVGLIVKILTERELKSLLEYARSYGMEPAIVINDENDLDIALRIGARFIIISSHDLETLEINKENQRKLISMVPSDVVKVVASGISERNEIEELRKLGVNAFEIGSSLMRNPEKIKEFI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Bridging the gaps in design methodologies by evolutionary optimization of the stability and proficiency of designed Kemp eliminase KE59.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Kemp eliminase KE59 R8_2/7A
total genus 92
structure length 241
sequence length 246
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.-.-.-:
pdb deposition date 2011-12-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uycA00
5HJLA 5DCBA 3BLEA 1JRBA 3MHGA 4JTJA 2JGYA 1G69A 2OT0A 1K02A 3MMTA 3GDRA 2NWRA 2QJIA 1JUEA 4UTTC 3BLFA 5CGQA 3W7QA 2Q8ZA 4UNKA 2ZRZA 3PUEA 4O1CA 1Z44A 2ISWA 1LYXA 1IF2A 3P81A 3TAOA 1W5PA 2DZTA 2QCLA 1TRDA 1KFJA 4PL1A 5C54A 4GUFA 1W8SA 4RXFA 2CLLA 1T0OA 2FFCA 1LOLA 3DFQA 1TTIA 3NDOA 2B7OA 3FIGA 4Z1AA 2QUVA 1CX9A 5DLCA 1LORA 2DZXA 3PSVA 3GKFA 4BWLA 4JDBA 3QPZA 3S5ZA 3M1ZA 4MUZA 1VQTA 3L5AA 3M0ZA 2V82A 4GUIA 2WSQA 1EP1A 1OYAA 4XWUA 4NNBA 4MLJA 5BRBA 1C29A 4O28A 5LNRA 1TPDA 4JX6A 5FEXA 1JVNA 4UXDA 1SZEA 1VCFA 1DV7A 4JYEA 4IX2A 1QAPA 1UUOA 3USBA 2QAPA 4DF1A 2XN2A 3M6YA 2I1OA 4BR1A 1FCVA 5HNRA 1VS1A 3THQA 1I45A 3G1HA 4HHPA 3IIVA 1U5JA 3NOEA 4O50A 4LRSA 4WZHA 4ZQNA 4N6FA 3W07A 1HO1A 4UMCA 3NQVA 3S1XA 3V75A 1FCBA 2C16A 3W2MA 3CIWA 1FXPA 3HF3A 2NXHA 2YGYA 3UD6A 3GKAA 4H3DA 1VYPX 3DHFA 3DFNA 2VC6A 1YXDA 3R5EA 5LKYA 3ZFHA 3KX6A 3HG4A 1VCVA 1I2OA 3G1DA 1TB3A 5H91A 1F73A 3DHDA 3PWAA 2X2GA 3W7LA 3QMRA 3E12A 1KTBA 1TQJA 2NV1A 3AO0A 1Z48A 4LT9A 3O05A 1L6SA 4JTIA 2NXIA 2YYTA 3QSRA 1EEPA 4LS2A 4UTIA 4LNYA 2YFNA 3QYQA 2O7SA 4QIUA 3CWNA 1GJPA 2G5WA 3DKLA 3TMQA 1A5AA 5FF7A 3TC6A 3ZR4A 4JTGA 1XBVA 4FNPA 1OFRA 2C1HA 2YX0A 1EIXA 3BV4A 4Z1DA 2QF7A 3BG9A 1ZAHA 4AWUA 2A7NA 5EA9A 1P1XA 1XBYA 3GLCA 4OHQA 3L65A 1H60A 5SWUA 3GVGA 2J9ZA 3W1AA 1W5NA 1W3NA 5HUPA 3N3MA 2HS6A 2KZHA 4O4WA 4MY9A 4FF7A 2E6AA 4PC8A 5HMSA 4DBEA 3LRMA 5CZSA 3K30A 3L2IA 4BI6A 1G4TA 4GBUA 1TMHA 4JX4A 3UWZA 5D30A 4A2RA 2H90A 4ADTA 3O63A 1FCUA 1WX0A 3JRKA 3PBUA 4R53A 5AHLA 4XBSA 2A5HA 1GG1A 1P4CA 1QCWA 1QPQA 2QDHA 2RKXA 2DZWA 4FO4A 5G2HA 3BG3A 1Q6QA 4XZ9A 4LWWA 2FPYA 3UY8A 2O7QA 3FFSA 6ALDA 3W7OA 3S1WA 4KFPA 2ZA3A 1XI3A 1BWLA 2NX9A 2CZ5A 3INPA 3UWUA 3W7PA 3HMJG 2C14A 2NWSA 3NM3A 4U28A 4I9AA 4AHQA 3PG9A 3MUXA 2Y70A 4TMBA 1P0KA 3UXAA 4EVZA 3PBWA 3O1NA 2EKCA 2Q3OA 4WX2A 3TQVA 4BWLC 5I3KA 2FDSA 2DZSA 3W75A 4NXKA 3E49A 4S2CA 4MFEA 3T44A 3KXQA 1OJXA 3NA8A 1H1YA 3SJ3A 2BXVA 5DXXA 2R91A 2YZRA 1W5QA 5L9FA 3CEUA 1Q45A 2A4AA 4FNTA 1BWKA 4WXZA 3JR2A 2ZRVA 5TBOA 1PHQA 1TJRA 1H63A 3FKRA 1GOXA 1KFCA 2B7NA 1YXYA 4MFDA 3QF0A 3L0NA 3CM4A 1XBXA 1PHWA 4HPXA 4K8EA 3G0SA 5F1VA 1J4EA 3QRHA 3M5XA 3M5YA 3MHFA 1K3UA 3IIZA 4HN4A 1UUMA 2VFIA 3N2MA 2RDWA 2VOMA 3BW3A 3P5ZA 4H4IA 4GNJA 4AMAA 2YXGA 3C4UA 2YR1A 3EX6A 2B4GA 3NQDA 1VHNA 4JN6A 1X1OA 1MEWA 4HSOA 4K39A 2OX1A 4XKYB 2HSAA 4O18A 1H7NA 3SZ8A 3A21A 3GNDA 3N19B 3TROA 3S42A 4RK8A 2YYUA 4NX5A 1TPFA 4S1FA 3W87A 3NQMA 3W7GA 3W1TA 1WA3A 3H53A 1KM2A 1V7YA 5U4NA 3NVTA 1YDOA 4LRTA 1L6YA 2QCHA 3LHVA 4PFMA 2ZA2A 3L67A 2AQWA 4JX5A 4A3UA 4IPJA 2VFDA 1SO4A 3C3NA 3GXPA 2V2DA 2WPBA 4L4MA 2FLIA 1AK5A 1XL9A 4JDYA 4D2JA 4HT3A 1G7UA 2WSYA 3L21A 4LVGA 5AN7A 1SSGA 2ZZ7A 5CPOA 4FIQA 4JEQA 3W7EA 3SIZA 4EOUA 2X16A 4IJBA 5A5WA 1G4EA 1W1ZA 4HKPA 3VNDA 1SSDA 2GUUA 1SZGA 4UTJA 2J6XA 1DKWA 1VR6A 1DBTA 2E6FA 2V0TA 4MZ8A 3MI2A 5C5YA 4UR7A 5I3FA 4IX0A 2AGKA 3SW6A 3PR2A 1XDLA 4WY0A 5BOOA 3LCIA 3PVFA 1SZNA 3HGSA 4OT7A 1N8FA 1K03A 1OX4A 4R34A 3G0XA 1SQ7A 1Q6OA 4ORMA 3B04A 1EX5A 2BLEA 3GR7A 1BKSA 2ZZ3A 4UTTA 3TQKA 4AHPA 4AF0A 1TV7A 2QCFA 4UFKA 4LVDA 1TQXA 4WXYA 4EF9A 4N6EA 3I65A 3IGUA 4O19A 1XDMA 3M43A 3O8AA 3PY2A 3NQ6A 4LVBA 2G96A 3FEMA 2NX1A 1XC4A 3PULA 1XM3A 4DQWA 1JCMP 3HJZA 5K9XA 2V2CA 2B7PA 1O5KA 1SFLA 1XKYA 4ML9A 4TMCA 3UNDA 3W84A 3PBVA 2GJLA 3NL5A 3IEBA 4Y96A 3C52A 1I8JA 2Y7FA 3TIMA 2E6YA 4AH7A 2CLKA 1A50A 4M6VA 3FJLA 2CLFA 5AOUA 1LOQA 3W2UA 3ABRA 3UWQA 2DZPA 3NQEA 4HSNA 1RQHA 1BEUA 2QCDA 3P84A 4W9TA 5D05A 1KFEA 1XFBA 2DJLA 2QJHA 3F03K 3LRLA 3PSWA 3DI1A 1RV8A 3NAVA 3CC1A 4M6QA 4CLMA 5KITA 3W70A 1FUYA 5F1UA 4Y6GA 1K8YA 2Z1BA 3GDMA 3RU6A 3LGEA 2A1YA 5ABTA 1TPH1 1H7PA 4CCEA 2J88A 1X6UA 4C1KA 2DZVA 5LNSA 3G1AA 1YPFA 3A22A 1ZNNA 4JTLA 2DORA 4X3ZA 1SW0A 3CEPA 3DFSA 3QQ0A 3MP5A 3LHYA 3KRZA 3NPUA 1LROA 1OFOA 5KZDA 3LCHA 3IVTA 3PUOA 1TV5A 4JXCA 1QPNA 4MIMA 3HPSA 3RK8A 2ZCGA 3T7VA 1I2RA 1YTEA 3HPXA 4UC5A 3W7KA 3GIYA 3LRKA 1DJNA 2YPIA 1YDVA 3LXCA 1Q3NA 5J5RA 3HQ1A 4JTUA 3LM7A 1OFEA 3M7WA 3OHIA 1VGAA 1U83A 3LX9A 3LXBA 3TE9A 2WQPA 4IQLA 2ZRWA 1VLWA 3KVJA 1VZWA 5AYXA 1GYNA 3NPWA 1GPWA 1OX6A 3B0PA 1H1ZA 2FPVA 3NL6A 3IIOA 1Y0EA 1Z41A 1KM6A 2H8XA 1LLWA 3U8GA 4R7JA 5LGXA 1GEQA 4IOTA 3W7HA 2NUXA 2JGQA 3FLUA 2Y85A 3DGRA 2EPHA 4UTKA 1JQXA 4I7UA 4IXHA 3GYEA 2GVJA 3E9AA 1Q6LA 1E51A 4LC6A 1FBAA 1X1ZA 4IMGA 3NQ8A 2V8ZA 2BWGA 2BX7A 4NZFA 4FX7A 4UFJA 3U2OA 4BFAA 2Y62A 2YW3A 3WJZA 4DXVA 3STCA 1XCFA 1M5WA 3W88A 4UTUA 2H8ZA 1RVGA 4DF0A 3T55A 5BNKA 5FEPA 2WO5A 1OFPA 4KWWA 1AW5A 1R2RA 2DZUA 1VHCA 3TUUA 1TTQA 4WQ6A 2CWNA 2IQTA 2JKAA 4MPQA 5HINA 4N9EA 4DF2A 3N73A 1QOPA 4FNUA 4MYXA 4TX9A 3EWUA 2V81A 1AMKA 4MLRA 4POCA 3HIJA 3EWXA 1W5MA 3TQ0A 1T8XA 2OT1A 1LRQA 3NQAA 4BI7A 1VJIA 4U4MA 4ZQMA 3WK2A 3YPIA 4RZ4A 4Z1CA 2ISSA 2YSWA 4RZ5A 1FX6A 3PUDA 3KVMA 3QH2A 4FHAA 5C6MA 2A85A 3WK0A 3GAYA 1OFDA 4JS3A 3CPRA 1RQEA 1GVRA 3QM3A 1F05A 3W2JA 2EHHA 3JS3A 4OGZA 3EX3A 2XN1A 4RV8A 1YTKA 1FQ0A 2NX3A 5CSSA 3W7NA 1VPXA 1G67A 2C15A 2Y6ZA 4GUJA 3TU9A 3HG2A 4AAJA 5EL1A 3ANYA 2DU2A 4MY1A 2ISVA 3KOFA 5HR7A 1PL9A 2C19A 4Q32A 1TV8A 3GNNA 4TO8A 3HPZA 3NL3A 3LTPA 1ML1A 2V9DA 4IGHA 3W7MA 3B05A 3CB8A 5CPMA 2ALDA 4ZVJA 4GUHA 2J9XA 4O10A 4PODA 2R94A 1A5SA 3CLMA 5FF2A 2JBMA 3UWWA 1F76A 3MBDA 3NL2A 1O60A 1G6CA 1H7OA 2ZRYA 3BGJA 3C56A 3GDKA 4NNAA 1HTIA 1Q6RA 1W37A 2DP3A 4NZJA 2B0MA 4M7TA 1TTJA 1JUKA 3TFXA 1SO3A 3DAQA 1RZMA 1LBLA 3OBKA 4QQ3A 1O95A 3QSTA 1B4KA 4UFMA 3B06A 5K9DA 1L6WA 1DHPA 3C2FA 1LM1A 4IUOA 5D33A 2CZDA 3LXAA 3P7YA 1M7PA 1PCKA 5H2ZA 5FF4A 5EBUA 1RD5A 1D9EA 4JTEA 3TSBA 4EF8A 1H61A 1UJPA 4LV4A 2Y88A 4NJKA 1KTCA 4KFNA 1R2SA 1JUBA 3DFTA 4RX0A 3VI2A 4QISA 4O53A 3NQ2A 3LCFA 3NPXA 1GVFA 3OA3A 3KVLA 5BW6A 1FDYA 1I2PA 3I7SA 3PM6A 2VEPA 1H50A 4JTTA 1CW2A 3WJYA 4NT0A 1VYSX 2W6RA 3M16A 3ZWTA 1ME9A 4NJIA 3I7RA 4Z0JA 5FI8A 3L0GA 2R14A 5MHBA 4FX6M 3SY5A 3H55A 3W76A 3PB0A 3W1NA 5C2XA 2WJZA 4JY8A 3E02A 4UMBA 3CHVA 3NZ1A 1NEYA 5FEWA 4WY0F 1P0NA 1EB3A 3TA6A 4O0KA 3EWZA 3Q37A 5G1TA 1QPOA 1TTPA 3N34A 5D09A 4UUIA 2Q8LA 2V5BA 1LBFA 2OZ0A 3TH6A 1UB3A 4UNLA 2TPSA 2W0UA 4BK9A 1IXPA 1WBHA 1QWGA 3W1UA 3W86A 3TXZA 1MEIA 3P74A 2HS8A 3NQFA 3P5YA 2VELA 4DBDA 2TRSA 3C2EA 1K8ZA 3W7DA 2CZEA 4ZQCA 5F2LA 5AB3A 4O12A 5DN1A 3LLDA 3G18A 2CFFA 1W0MA 4R33A 3STEA 3W85A 2NUYA 2RH9A 4NNCA 5G4WA 1ZJIA 1FWSA 5AHMA 3LLFA 3SFKA 2ZYFA 1SPQA 3T4CA 1WAUA 4YCOA 1R30A 4J9JA 4XTDA 3EXRA 3C8FA 3M5VA 4KWVA 3BW2A 3G0UA 4O54A 3W7CA 3TCEA 4HNUA 3PF3A 5DCDA 1VCGA 1KW1A 2E09A 3O6CA 1J2WA 4ZQOA 2QR6A 5CZTA 2DJXA 4MJZA 4PEKA 2YFOA 1HG3A 1FWTA 5CPLA 1LRNA 4E38A 3GAKA 2CLIA 4O16A 4LY8A 1GVQA 4Z0SA 4IMEA 2ATMA 4QNWA 1DORA 2PRHA 4TR9A 4X9SA 4LS0A 2E68A 3C6CA 5D37A 1S5WA 1SO6A 2YW4A 3H54A 3KAOA 3LBCA 3HOJA 1Z42A 4MYAA 3MYOA 4HNVA 5KMYA 3IVUA 5DY3A 3WK3A 3SECA 2CLHA 4PA8A 1TPB1 3L68A 1N7KA 3UPBA 4RZ6A 3M41A 4H6KA 3IIXA 2QUUA 1FXQA 3ATZA 4ZZ9A 4JTHA 3NPVA 3BK0A 5U7SA 3R2GA 1F2JA 4NXSA 5T26A 4I7VA 3E96A 3MP4A 3ABQA 1KM3A 3C2OA 4DPPA 5I3JA 1ICSA 2QAFA 1TRIA 1UASA 5BMXA 3MO7A 1ICPA 4IWWA 2CLEA 3FA5A 1SU5A 1W5OA 2VKZG 3W1MA 5CPNA 1PIIA 5I3HA 3WFAA 4KFOA 1KM5A 1ALDA 3HBLA 3MJYA 1QFEA 2FJKA 2A21A 2VEIA 4NJJA 3P80A 3V1PA 3FS2A 5FEZA 4NVTA 1KM0A 1XUUA 5HUOA 4K7VA 1TPVA 3TC7A 3UY7A 1YTDA 5K4ZA 4N2YA 3WJXA 1KA9F 4E0CA 5F2GA 1FWRA 2OCZA 4FNRA 5AHFA 3C2RA 3PS7A 2C13A 5AYZA 4PTNA 1LZOA 4JD4A 3U6WA 3EX1A 3B0VC 1AL7A 4DPQA 4HNTA 4Y9AA 3EWBX 4UMAA 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 2ZDR A;  3W1R A;  2FB3 A;  4OE7 A;  3R89 A;  2J9Y A;  3N14 A;  3QMS A;  1TIM A;  5L6U A;  3TJX A;  3PBY A;  4LVA A;  5D2T A;  5K3V A;  1T99 A;  3I68 A;  4QAI A;  5F4W A;  1O94 A;  4JTK A;  1KLY A;  3KRS A;  2ATS A;  1UCW A;  2CW6 A;  1MEH A;  2GPT A;  3BAR A;  2ZBT A;  1A5B A;  3TKF A;  3QW3 A;  1OFB A;  3GX9 A;  1B3O A;  3P60 A;  5HWN A;  3G1X A;  4HNN A;  5D2W A;  2PRL A;  3LI0 A;  4X2R A;  2JKE A;  4O15 A;  1UBS A;  2FTP A;  2QCM A;  4Y8F A;  4OV4 A;  2VEN A;  3UXD A;  2VFE A;  3G22 A;  1C9D A;  3G1F A;  2RHG A;  1VYR A;  3OG3 A;  1H7X A;  1W3I A;  4O0Z A;  5G1Y A;  3RF9 A;  1G7V A;  1KBJ A;  1VRD A;  3UWY A;  3OVQ A;  2HTM A;  2A7R A;  1SO5 A;  3N9R A;  3CQ0 A;  4JYD A;  4ICN A;  5F4X A;  5KZM A;  2QCN A;  2VFH A;  2ZRU A;  3ZS4 A;  1ME7 A;  1PV8 A;  5G2W A;  3B4U A;  1OFA A;  3S1U A;  4CNN A;  3QPY A;  1ZCO A;  3O06 A;  4HPJ A;  5AFD A;  4O1A A;  2A7P A;  3QQ1 A;  3F1Q A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3T8Q A;  3W6L A;  3WQF A;  2OT0 A;  3HQO A;  2VD8 A;  3UXI A;  4G6C A;  4HPH A;  2NVD A;  3BLF A;  2PDC A;  1B3X A;  1VJS A;  4O1C A;  3TYZ A;  2CEQ A;  4F79 A;  5CSU A;  3E1F 1;  3VU2 A;  5LA2 A;  5FCZ A;  2VP8 A;  3FGC B;  4MWA C;  1W8S A;  4RXF A;  1T0O A;  1K1D A;  3OA5 A;  1U5H A;  4Z1A A;  5DLC A;  1JYN A;  2GVE A;  3URA A;  3PSV A;  4MF4 A;  4A3Q A;  2V3F A;  4MUZ A;  1OGB A;  4NNB A;  5BRB A;  2VRJ A;  3GH5 A;  1TPD A;  2ZC8 A;  5FEX A;  3BAX A;  4UXD A;  4F0M A;  3USB A;  1PWL A;  1RH9 A;  5A8M A;  2ISD A;  3M6Y A;  4Y9N A;  4DYE A;  1VS1 A;  1I45 A;  1XH2 A;  3IIV A;  1MFU A;  1U5J A;  1AQF A;  3NOE A;  4D71 A;  2OEM A;  5EML A;  2P3E A;  4YHE A;  4HK5 A;  4EK7 A;  1Z6K A;  4N6F A;  2Z28 A;  3DIP A;  3S1X A;  3V75 A;  4FK9 A;  1V0N A;  4TOQ A;  2NXH A;  3TWB A;  1DQU A;  1X39 A;  3DHF A;  3R5E A;  1PX3 A;  2VUR A;  1AOD A;  3KX6 A;  1OEP A;  4QTG A;  1GOR A;  1TB3 A;  4EAY A;  3OBA A;  3QMR A;  1IYX A;  3E12 A;  1TQJ A;  2NV1 A;  3AO0 A;  5EFF A;  1VJZ A;  4E6M A;  4RE3 A;  4W87 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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