2BSLA

Crystal structure of l. lactis dihydroorotate dehydrogense a in complex with 3,4-dihydroxybenzoate
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
311
structure length
311
Chain Sequence
MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPRYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase
source organism Lactococcus lactis
publication title Interaction of Benzoate Pyrimidine Analogues with Class 1A Dihydroorotate Dehydrogenase from Lactococcus Lactis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords DIHYDROOROTATE DEHYDROGENASE A
total genus 114
structure length 311
sequence length 311
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2005-05-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 2bslA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2bslA01
2R8WA 5FF7A 3LLFA 3NVTA 2FPVA 1W54A 1WBJA 1FQ0A 1ZNNA 1ZAHA 3KVLA 4K39A 3UXAA 1T99A 5FESA 1TV8A 3DFQA 2V5BA 2R91A 4NX0A 3WK1A 1N7KA 3M7WA 3UY7A 2O7QA 4K6AA 1TPVA 3UY8A 3QW4B 3TAKA 3ZFHA 3W88A 4L4MA 3GYEA 3OA3A 3ZWSA 3W2KA 1OYBA 2VEPA 3GKFA 3G0SA 1P5BA 2GJLA 4GWEA 5C6MA 2AGKA 1GVFA 1W37A 2QAPA 5HWMA 1VS1A 1W3IA 2EAWA 4ADSA 4DPPA 3A22A 3HGJA 3NPWA 4NJKA 5LHFA 3W1TA 4NVTA 3B04A 5C2XA 4IXHA 2CZDA 3LBCA 4LS0A 5LNUA 3W7HA 4H3DA 3VKJA 2FJKA 2QCHA 2WNNA 4O1BA 2ABAA 2W0UA 1YYAA 4JTHA 3B06A 2WQPA 5K2ZA 4BWLC 3PC0A 4JGDA 1KFKA 3W76A 1KFJA 4KFOA 1QR7A 3JRKA 2ZZ5A 4JTJA 1Q3NA 1VGAA 3HQ1A 3ZWTA 3W73A 4E2DA 3UWYA 4N9BA 3UD6A 1RZMA 4P2VA 1W3NA 3HO8A 5BNKA 4LS2A 3EWWA 3MMTA 2EHHA 5IBXA 3QYQA 1RV8A 3NQDA 3PM6A 3LCIA 3W2MA 4JTEA 4O16A 3SY5A 2JKAA 3Q58A 3QPZA 1EA0A 1F76A 3C2VA 3N19B 5DXXA 5F4XA 1PVNA 2C3ZA 2I9EA 4W9TA 2VOMA 1S5WA 4ONVA 2E6AA 2QCEA 1OK4A 2TSYA 3TK7A 1ONRA 5K3VA 4ZQNA 4O1AA 4OE7A 5U4NA 3OIXA 2OMAA 3LCFA 3LCGA 4M6PA 4JYEA 3BGJA 3JS3A 4IX0A 2YXGA 1OFEA 3OBKA 1KFLA 2ZZ4A 3MI6A 2NLIA 1UBSA 3K30A 5D30A 3W2JA 4JX5A 2BLEA 3G3DA 5J5DA 1WDWA 1FXPA 3KHJA 3N9RA 3NQCA 4K38A 1BTMA 1Q6QA 1WBHA 4NXSA 1JJKA 2WKJA 2VENA 5DCBA 4Z1CA 1OF6A 1DBTA 5G1YA 3T4CA 2VEMA 3CEUA 1K8XA 4MYAA 3WJSA 1C9DA 4GE8A 2A1YA 1SZGA 1KM1A 3P7YA 1O5XA 4AHPA 3CWOX 1ZY9A 3HG2A 4LOCA 1GG0A 2TRSA 3W1LA 1DOSA 3M5VA 4IMEA 4NJJA 1K03A 1Z48A 1JRCA 4MZYA 4MYXA 1SPQA 2BXVA 2NWSA 5LGZA 3BGGA 3TW6A 5HUPA 3EX4A 5FF0A 4GUGA 1B9BA 1XBXA 4O57A 5FEPA 1K8ZA 3ATYA 4FB7A 5D02A 3L2IA 3W7MA 3WFAA 5C55A 3BLEA 1TPC1 5LNVA 1EWEA 4I7UA 1ZENA 5BOOA 4HPXA 2Y7DA 3E49A 5KTLA 3N9SA 1Q6RA 4ADTA 3FS2A 2Y88A 4JTFA 1BEUA 1OK6A 3U2OA 3LHVA 2GQ9A 1Q6LA 2QF7A 3DU0A 5EMUA 2PRLA 1I2QA 3LRMA 1BWKA 3N2MA 2V5LA 4P61A 1FWTA 4NQ1A 3A9IA 2V2CA 3TFXA 4Q33A 4OU1A 5CGQA 4NJGA 1TQJA 4Q32A 2NUWA 1VHNA 3QZEA 4IMFA 4R53A 2E5CA 3P60A 2LLEA 4L4LA 1WV2A 2YFOA 2ZQ0A 2NZLA 1KBJA 4NJIA 4O8RA 1DV7A 2ABBA 1KFEA 2B7OA 1KM2A 5CZSA 4LNYA 1H62A 4JICA 3R13A 3MW7A 4LRTA 1I2RA 4DEFA 1GEQA 1DJQA 3O07A 4BI7A 4U4MA 2WNZA 1B4KA 3IIVA 5D03A 1R30A 3CIXA 1YTDA 3FJ6A 1UB3A 4AWSA 3L68A 3OVPA 1B57A 3LBMA 4KFNA 2DJXA 2FFCA 1G4EA 3IGSA 2E6DA 2XN1A 2DZUA 2YZRA 1F5ZA 3DENA 1K7FA 3QQ0A 1H50A 1JCYA 2I1OA 1PL9A 4WZHA 1FCUA 4FX7A 1FY6A 1O95A 2PE4A 3MBFA 2VFEA 1LLWA 5LNRA 3P8IA 3QSTA 4UTJA 1WXJA 1LCOA 5DBUA 1WAUA 4UXDA 1OYAA 4TR9A 4LC6A 1ME7A 4M5PA 1HFBA 4R33A 4FF7A 1LYXA 4HPJA 5FF4A 3NQFA 4GFSA 1XM3A 3QQ1A 5FF2A 2F7FA 1FWRA 2WSYA 4A2SA 3CWNA 5G2WA 5HULA 3W7NA 3W2LA 1KV8A 4G1KA 2CLIA 3NA8A 3GVGA 1TPFA 3P74A 4N6EA 3ABOA 3QF0A 1EB3A 2AAMA 4Z1AA 2B7QA 2WV8A 4UTWC 5HR6A 3USBA 3N34A 2E5BA 1YDVA 3MWAA 5EL1A 1VZWA 2FIQA 5G5IA 1ZAJA 5HR7A 4LVGA 3LCWA 2H90A 4YL2A 1OX6A 1H7RA 1TTPA 3NQEA 2P0OA 4MIMA 4ZQOA 4HNUA 5J5RA 4YWIA 4O11A 3NO5A 4PCFA 4EF8A 4JEQA 3TSBA 5LZLA 3LCHA 1KLZA 3T7VA 3NPUA 3NZRA 3HG4A 2AQWA 4UTIA 1PV8A 5G4WA 1A53A 3QFEA 3W1UA 1A5SA 4OWGA 4YMZA 3MP3A 1XBVA 3SI9A 5HJLA 1YPFA 4OV9A 4LRSA 3G1FA 2CZFA 1FWWA 5D04C 3LI1A 1SO4A 2H8ZA 4RX0A 4ZQPA 3U6WA 4BI6A 3LHUA 3HGOA 2QUVA 4O17A 1L6YA 3C0JA 3OG3A 3P82A 2V82A 4EVZA 5DN1A 3WK2A 2FB3A 5D2VA 1SO5A 3IEBA 2UV8G 2E77A 3DFSA 4MY1A 1GG1A 3MHFA 4DO5A 1TPDA 3EB2A 4DF1A 3TIMA 1EP2A 2V2DA 1OFPA 1YLVA 3FKRA 4JR5A 2DP3A 4IOTA 1OABA 1VCFA 2ISWA 2EF9A 5DCEA 1GYLA 3IIPA 3P84A 3H55A 3I6RA 3TW7A 3GNDA 3V1PA 3FIGA 3S1WA 5L6UA 3UWWA 5D38A 4WXZA 1EUAA 1SR9A 1OFQA 3N2XA 3HG3A 4IGHA 3LX9A 4MVAA 5L9FA 1M6JA 4RXGA 2G5WA 4X22A 3W83A 3HOJA 3ZR4A 4XKYA 3BW2A 1TJPA 3GK0A 4PA8A 3BK0A 1SFLA 5CZ0A 2BZNA 5AC7A 1U5JA 2YYTA 3NOEA 3TUUA 1UUMA 1HO1A 1DKWA 3QEZA 4PC8A 3C61A 5KITA 3OVQA 1VCGA 3BG5A 2JGQA 3GR8A 5D2TA 3TSDA 1MO0A 2RDTA 3I68A 2VC6A 2V81A 3W7GA 1LRTA 2V9DA 1H61A 1UCWA 1XUZA 3A21A 1XC4A 4HT3A 2D73A 5KMYA 3EWBX 1RQEA 1W5MA 4HNVA 3L21A 3NQ6A 2DJLA 1LROA 1VPXA 2CLHA 4EF9A 5D09A 2I14A 1EUNA 1BWLA 1KW1A 2RH9A 1YDNA 2CWNA 3QSRA 3LCLA 3BARA 3YPIA 2Z6JA 4FXSA 1P0NA 4ZZ9A 3QMTA 4XBKA 1ME9A 3GDKA 3QC3A 1W5QA 2ZZ2A 4MPQA 2PRHA 3IVUA 4ORIA 3F4NA 3EX1A 1G6CA 4JD4A 4AAJA 1H60A 2DU2A 3G1YA 3QH2A 1JCLA 1KFBA 4Y9AA 3NM3A 4JYDA 2DZXA 4O0ZA 3TX9A 4A29A 1IIGA 3NZ1A 1C8VA 3Q94A 1ADOA 1LORA 3HGRA 2QDHA 3RLVA 3MYPA 1XL9A 4A22A 2C18A 4OQVA 3VE7A 4WUIA 2KZHA 1YXDA 4Z1DA 3PY2A 4EWND 3I7QA 4BF9A 3MP4A 1NSJA 3MP5A 1LTDA 4AHOA 1ZCOA 5D2XA 1VR6A 4I9AA 4QNEA 1D3HA 1AW5A 3GB6A 3P61A 1UUOA 1I8JA 1SZNA 3DI0A 1F73A 4QISA 3LCXA 4UMAA 1C29A 1SFJA 1G7VA 4JXCA 5C5YA 1FBAA 4M7TA 1KM4A 4O0KA 3O16A 2Q8ZA 4C1LA 3ZS4A 5K7JA 1QO5A 4YLWA 2A21A 3LV5A 3W7EA 1QO2A 4NZFA 4XBSA 1TSIA 2VKZG 1YPIA 2C14A 1WOBA 3W86A 4S1FA 2TYSA 1XXXA 3SFKA 1JUEA 5HQEA 1TPWA 1QFEA 2DORA 1KM6A 1VYSX 3GR7A 4N9DA 1OHLA 5HWNA 2NWRA 1JUKA 3M1ZA 3PBYA 1L2UA 2B7NA 1G4PA 2Y89A 1SW3A 4Y6GA 4TX9A 4GUHA 4IUOA 1QMLA 3LXAA 1IGSA 2ZZ3A 3L65A 3LV6A 2QCLA 4Y90A 2Y70A 4LV4A 5I3IA 4X2RA 3S8HA 1TIMA 2ISSA 3T40A 1FCQA 3W1AA 1DVJA 4K8EA 3S1VA 4RLIA 2A85A 1J2WA 1A5CA 1RQBA 4CCCA 3MJYA 4JIPA 2Z1BA 4UR7A 3TXZA 4XKYB 1R2RA 4FNUA 5AHNA 3HJZA 4MFDA 1KM5A 2H3DA 5E93A 1H1ZA 5F2MA 1JCMP 2J27A 3LDVA 2B4GA 1RD5A 3BPWA 1TPH1 3TXVA 2X1SA 2VEIA 4QM1A 2NX1A 4FNQA 1YXCA 2A7NA 2QR6A 4DBDA 3LTSA 3DFTA 1EPXA 1A5BA 2X1TA 3DZ1A 3NQ7A 1LOSA 1OVDA 4U28A 1FX6A 1JCJA 3DXIA 3R2GA 2NX3A 4UNKA 1TJRA 2YDAA 3O6CA 2B0MA 4YCOA 3C4UA 3LTYA 4RCXA 4PODA 4WX2A 3HPXA 1CI1A 3E0IA 3W71A 3EWZA 4FX6M 4O50A 1F05A 3CIWA 2YSWA 5LKYA 3S5ZA 4UTLA 1R46A 3ABRA 4GXMA 1JCNA 3GIYA 1VYRA 2CU0A 1KA9F 3EWUA 2CLLA 4UIOA 3TAOA 2QCDA 4WQ6A 1LDCA 3L5AA 2C16A 2VFGA 4DO6A 1EIXA 5AN7A 1J4EA 2NXIA 2QCCA 1ALDA 4S2BA 3PUOA 1H1YA 4MLRA 4O14A 3GDLA 4JTGA 4QSHA 2Y61A 2Y6ZA 4QNWA 4RXFA 3RF9A 1OFOA 1W5PA 5C54A 1H7PA 2BTMA 5FEXA 5DY2A 3STEA 5SWUA 3WJZA 3ANYA 3DKJA 4KWVA 3B05A 1MEIA 5DY3A 3S1XA 2PURA 1T96A 2H3BA 5HINA 3LLDA 3FEMA 4JDBA 1O94A 1GZGA 2CLFA 3W7JA 3LI0A 8TIMA 1XKYA 1KTCA 1OX4B 4PL2A 3PF3A 1X8FA 2NXGA 3W1RA 3NAVA 3P81A 1TTQA 3AJXA 2W6RA 3C2FA 2DZWA 3VNDA 3G3MA 3GXNA 4IMDA 3UYCA 3NDOA 1W56A 2VELA 3O63A 5CPMA 5D32A 3H53A 3W22A 3NEVA 2NV1A 5EKYA 1KTBA 4XTIA 3CPRA 5HMSA 5EPDA 4K7VA 4PTNA 1LOLA 1ICPA 1W5OA 3GNNA 4RZ6A 5F2IA 4O52A 1IIHA 1DL3A 1A50A 2H6RA 4FX8A 3P80A 3KX6A 3L66A 1THFD 3W7OA 2C0AA 3M5ZA 1WX0A 4ZVJA 3C8FA 3EEGA 3ABSA 4LVAA 3VE9A 4UNLA 4RK8A 5LNSA 1VH7A 2C1HA 4GUJA 5D05A 2W79A 1ML1A 2V30A 3TKFA 2ZRVA 3F4WA 1L6SA 1VLIA 4YCPA 4UTWA 4MY9A 4M6QA 4N6FA 2C6QA 3LRLA 4J9JA 3TJLA 1FCBA 3P62A 4GBUA 4DO4A 3GXPA 4MJZA 3W7QA 2ZRUA 1R2TA 3G8RA 3G1XA 3B4UA 4WJEA 3NQMA 2Y7FA 2RHGA 3B0PA 1LRQA 2ZA3A 2GVGA 4DBEA 3QMRA 2FTPA 3TC6A 3GAKA 2YR1A 5LHEA 4Y96A 5TQLA 3UXDA 3HMJG 4JTIA 2GJNA 4QQ3A 2R14A 3W87A 3QMSA 3M43A 4LVFA 2GQAA 4MLJA 1DQXA 2VFDA 1R47A 2J6XA 4MFEA 2NX9A 3UWQA 3TC7A 1F74A 3O1NA 2RDUA 3W72A 1P4CA 3LOTA 5FI8A 4NNCA 4M19A 3W2NA 1W31A 2DZTA 1SZFA 2NUYA 1TYGA 1OFAA 3A24A 1PS9A 3C6CA 3KVMA 2OX1A 1X1OA 4PFMA 3T55A 3BW4A 4O54A 2ZTKA 4WY0B 1I45A 2NV2A 3FYPA 3MI3A 5I3JA 3DI1A 3RK8A 3G0XA 3LM7A 3M0ZA 2Y63A 3B03A 4LU0A 1EEPA 1S3HA 3M5YA 5AYYA 2QCDB 1TCDA 2QJHA 3DAQA 4LV9A 2ALDA 4AWTA 2RKXA 1EWDA 4JNMA 1SU5A 3L0KA 2H8XA 3O6DA 1NEYA 2P10A 4CNOA 4HHPA 2CLKA 2GUUA 2TPSA 3RFAA 5D37A 2C19A 1YTKA 3IVSA 3HPZA 4UTUA 3VI2A 1GVRA 1G4SA 1K02A 4RR4A 1SO6A 5MHBA 1TTIA 4N9EA 3CLMA 1I2PA 3C2EA 2HSAA 4FNPA 6TIMA 3KOFA 3LXCA 3O06A 4DXVA 2TMDA 3HBLA 3W70A 4NJHA 3IIOA 3BG3A 5F4SA 3PB2A 3B8DA 1NAL1 1S5VA 2ZA2A 1OJXA 5AC6A 4BI5A 3G8EA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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