3AHTA

Crystal structure of rice bglu1 e176q mutant in complex with laminaribiose
Total Genus 195
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
195
sequence length
471
structure length
471
Chain Sequence
WLGGLSRAAFPKRFVFGTVTSAYQVEGMAASGGRGPSIWDAFAHTPGNVAGNQNGDVATDQYHRYKEDVNLMKSLNFDAYRFSISWSRIFPDGEGRVNQEGVAYYNNLINYLLQKGITPYVNLYHYDLPLALEKKYGGWLNAKMADLFTEYADFCFKTFGNRVKHWFTFNQPRIVALLGYDQGTNPPKRCTKCAAGGNSATEPYIVAHNFLLSHAAAVARYRTKYQAAQQGKVGIVLDFNWYEALSNSTEDQAAAQRARDFHIGWYLDPLINGHYPQIMQDLVKDRLPKFTPEQARLVKGSADYIGINQYTASYMKGQQLMQQTPTSYSADWQVTYVFAKNGKPIGPQANSNWLYIVPWGMYGCVNYIKQKYGNPTVVITENGMDQPANLSRDQYLRDTTRVHFYRSYLTQLKKAIDEGANVAGYFAWSLLDNFEWLSGYTSKFGIVYVDFNTLERHPKASAYWFRDMLKH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Hydrolase
source organism Oryza sativa japonica group
publication title The structural basis of oligosaccharide binding by rice BGlu1 beta-glucosidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase 7
total genus 195
structure length 471
sequence length 471
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.21: Beta-glucosidase.
pdb deposition date 2010-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3ahtA00
3AOFA 4H8UA 1NWUA 4PCTA 3RDKA 3ARWA 1BAGA 3WDRA 4BCEA 3LPGA 1V6YA 5E6YA 5TD4A 4W8AA 2W63A 4KWUA 1ZJAA 2OSWA 2DEPA 2XIIA 1WCGA 1J0YA 4LPCA 1W1YA 2WVSA 2BHYA 3I3EA 1QI3A 1VFFA 3LMYA 3VIJA 2PWDA 2VTFA 3GH7A 3CZKA 4YN5A 4JL2A 3E1F1 3N13A 4AXNA 3RMEA 1UOKA 1V3IA 1OT2A 4D1JA 1CXIA 3N04A 1MW1A 2ZXQA 3NDYA 3MUZ1 3ZQ9A 4UQ9A 1XHGA 5M03A 1KQYA 3SCOA 2DDXA 4RE4A 1JYXA 2YA1A 3CGTA 3W24A 3SEPA 4GI6A 1MW2A 2VOTA 2CPUA 1UYQA 5GNYA 3KZSA 4AD2A 1IZKA 3RJXA 3WNMA 4UQDA 1X6LA 3WMSA 3GNRA 4XX6A 3HJEA 4FLOA 2MANA 4ACZA 4V27A 1XH0A 1EGZA 4AW7A 5I77A 4W86A 1VIWA 3GTNA 3MMUA 1HJVA 2GJXA 4ZE5A 2VURA 1UZ4A 4U31A 5DEZA 4GPNA 1GHSA 3ARVA 3RIKA 5ABFA 4F79A 1TE1A 4FK9A 1E55A 1B3YA 3DYPA 4HOWA 3AJ7A 5BWFA 5HXMA 2A3CA 4FMVA 1H0GA 4M29A 4PUEA 3VMOA 5LA1A 4JZ5A 4DWSD 2VT0A 4D6JA 3IJ9A 4MNKA 1UWIA 3B8SA 5BRQA 3OZPA 1ZBWA 4DUVA 4ZXOA 1JNDA 2VNCA 3WNPA 2Z1KA 5IFPA 1VAHA 2EJ1A 3TA9A 3S6TA 3HMCA 1KXVA 1GQLA 5HDRA 2G3IA 4GZEA 2CITA 2V38A 2UY3A 4Z2HA 3KL3A 4UOQA 4PYSA 4UQEA 4OIFA 1KR1A 1GQIA 2EQDA 4BQ4A 4C7DA 3AS2A 2XIBA 4UZUA 1C7TA 4TVCA 2DQXA 1EDTA 5JIPA 3QGVA 3GXDA 2DPEA 3WIJA 1H49A 2YA2A 1PX8A 5BRPA 3KWXA 1E9LA 5BROA 3AMLA 1JZ7A 1XSJA 5I78A 5E0FA 3ZJ6A 3CZJA 1VB9A 2WC4A 4WKHA 1PBGA 3M6DA 3W53A 3OLDA 5DO8A 4CU8A 2J7DA 3W38A 2ESCA 4X0NA 2YLLA 1ZB5A 1E73M 3GBDA 3FY1A 3SCTA 3CUFA 3VDAA 2G3MA 3WNNA 1B1YA 2DT1A 5A2CA 1CENA 2QLYA 2BXYA 1EQPA 4CD4A 1ODUA 3AXIA 1WDQA 4W5ZA 5BXPA 1E6QM 3EDKA 1VEMA 3AZRA 2DSZA 3BAYA 4CU6A 3J7HA 1LWHA 1BQCA 1OIFA 1R86A 4L4OA 1LL4A 2G8ZA 3OGRA 2ZUSA 5FKYA 3BGAA 3WMBA 3CHFA 2YDQA 1V6XA 2YDRA 3CZGA 4GINA 4J28A 2F2HA 2VJXA 5ABEA 1HP5A 1HXJA 4QLLA 2AOSA 3FAWA 2VRKA 2PC8A 2W91A 1UH2A 2ZIDA 3QHMA 1MXDA 1BYCA 3NYDA 4HMDA 3NJ3A 4J27A 1WZAA 4MNJA 3L2MA 1E4IA 2OWXA 4J3VA 2D22A 3F5LA 3FAXA 1O6IA 1DWIM 4CVWA 3F5JA 2XSAA 1QI4A 3POCA 1LWJA 1WP6A 4LQ1A 3RM8A 4U2YA 3FHQA 4W8BA 3PBGA 2VR5A 2WHKA 2CBJA 3IAQA 4P7NA 1QHZA 1V0MA 3VUPA 4M56A 3WDJA 1SYTA 3CO4A 4DM2A 5DF0A 4HMCA 1RP9A 3N17A 3TOPA 3WKZA 3PZGA 4XZWA 2ZUVA 2E9MA 1JD7A 3O2LA 5BXTA 3VMPA 2GDVA 2WB5A 4GKLA 5C70A 5A6KA 3PZMA 5AC5A 3LPPA 1FP8A 4OOZA 2BHZA 1GOKA 3VIGA 1V02E 4JAWA 4HPHA 2VMFA 2JF6A 2YBUA 5FL0A 1OD0A 5A6AA 3QHOA 3VDBA 3ZO9A 1LQ0A 1WPCA 3N9KA 4IISA 1TA3A 1JNEA 4NRRA 4DWSC 1TZ7A 3F4VA 4AD5A 4S3JA 1UKOA 3AZSA 2WMIA 2NW0A 2WZIA 4D6HA 1OM0A 1EO5A 2CCRA 1NH6A 4Q7NA 2XGBA 3U7BA 1BFNA 2E8YA 5IXEA 1Y7VA 3NCOA 3ZIZA 3VGFA 2FDMA 3AMKA 3AHXA 4PMQA 1DWHM 4WKFA 1UH3A 3CPUA 1C3FA 3VGEA 3PZTA 1XCWA 1KCLA 4W7UA 1ECEA 3UG4A 3WF4A 2OYMA 3IJ8A 4PMVA 4S3KA 2VL4A 3SCWA 4B16A 3K46A 1US2A 1E40A 3W6LA 4EK7A 1HNYA 2OSYA 1KCKA 5I0DA 3VU2A 4WKAA 4DWSA 1EDQA 1FP9A 2BXZA 2XWEA 2CERA 4F9DA 1XH2A 1QOXA 2VX5A 4BQ3A 4OOUA 1ZBKA 1J9YA 4MJ2A 4JFTA 1R7AA 4PTMA 4WLCA 3AIEA 4CD5A 3ARPA 3WEMA 4MAVA 4CKQA 4JIEA 5FD0A 1J0ZA 1DP0A 2UY4A 4NI3A 1W2PA 2Y8KA 2A3BA 5DMYA 3AHTA 2D0HA 2YIHA 3ECQA 1B2YA 2A3AA 3VILA 3UCQA 1KBKA 1UR0A 1AVAA 1J0HA 2G3JA 3AFBA 3AXHA 1NOFA 1E6SM 1UD6A 4D1IA 5I23A 2X0YA 5E09A 3SIMA 1LLOA 6A3HA 5LA0A 5JBEA 4JKMA 2WWDA 3DYMA 5IFTA 1K9TA 1PIGA 4AYSA 2VZTA 3VM7A 2W62A 3CBWA 1CGTA 1WDSA 4J7RA 3WNKA 4UCFA 4RL3A 3VVGA 1M01A 4K68A 4OUEA 2C0HA 1GPFA 2CNCA 4P8XA 1DEDA 4E8DA 1HJUA 3AMCA 1RH9A 4YHEA 1OD8A 2QHAA 2V3GA 1F4HA 3TTYA 4QFUA 5C8BB 1AQHA 2VCAA 3II1A 2XJ7A 2BHUA 3CHCA 4F8XA 1UQZA 4IPNB 2JF7A 4XB3A 4HU8A 1V02A 1CGWA 2XTKA 3ZT6A 2E8ZA 2WANA 3EMQA 2DH3A 3AROA 3NUKA 3BLPX 1I75A 3VIOA 3MKKA 5A6BA 4HMEA 3QHNA 2ZXAA 1V0LA 3NSNA 1H11A 1PX4A 1NWSA 5D9OA 1UZ1A 4UFMA 4QAWA 3DECA 3MMWA 1WZMA 1TG7A 2YL6A 1Q6GA 1PIFA 2NT0A 4HP5A 1UHVA 5A2AA 6TAAA 2ZOXA 1OWQA 4OKDA 2WMJA 1PAMA 2FHCA 4EAMA 2OSXA 1KR0A 4WJXA 3VTRA 2WMHA 1VEPA 3ZR6A 4UTFA 1GORA 3N18A 4BZYA 4X9YA 3MMDA 3WH5A 1E4MM 2B31A 3MUAA 1US3A 1JD9A 5I5RA 2WPGA 2J7BA 3ARTA 2VVSA 2JIEA 2WC7A 2J79A 3W81A 3APGA 1J10A 4JFUA 1E0WA 1V6UA 2ZUTA 1SFSA 1PZ3A 2G41A 4IPLA 2XYLA 2RGMA 1D3CA 1HKKA 3N1AA 1UD5A 4MTVA 3FHAA 1J18A 3UG5A 4P8UA 5CSYA 3VD5A 1JI2A 1CGYA 2AMGA 2YL8A 1WE5A 2GJPA 3CZEA 2CETA 1MXGA 3WD1A 4D6IA 1ZBCA 3OLGA 1M7XA 1W3LA 1SMDA 5ECUA 2BY3A 3CZ8A 3LPOA 1QNPA 5HNNA 1C93A 1V6WA 1JGIA 3ARZA 3VD3A 1FHDA 3MUIA 3WFLA 4HOZA 3ZOAA 2DH2A 1FHLA 2UY5A 4PUDA 2V3DA 1EA9C 2Q8XA 7TAAA 4AZBA 1B31A 1V03A 2V3FA 2XFFA 4DUXA 3U57A 3I3BA 3QOKA 1IZJA 1GW1A 2W67A 2CIPA 2PWHA 4YHGA 1AMYA 3ALFA 2F61A 1NWTA 5HPOA 1HP4A 1TMQA 1HKJA 1E3ZA 4PMUA 1GCYA 4UQBA 5FOOA 1E6PA 3VGBA 3A6OA 1UD2A 1D2KA 4FLSA 1CGVA 4PMOA 4PMYA 1EQCA 3AMGA 3WD4A 1MFVA 4W87A 4AZ5A 1AQMA 1HL8A 3PZ9A 4GO9A 5LA2A 2ZUWA 2RGLA 2ZWZA 1JG9A 1E6RA 1GOQA 3JUGA 4PMDA 1TVPA 4MB4A 3AXXA 2VCCA 1JAKA 3L4WA 2WNWA 3GDBA 2V3EA 4TX8A 1BYBA 1OCQA 3CIVA 1QPKA 5CG0A 1V08A 4N42A 4H04A 1UWTA 2EPMX 3B9DA 4MDPA 3WEOA 3GM8A 3NSXA 1V3KA 1DHKA 5A8NA 3WNLA 2ZXDA 1BSIA 1GJWA 1G5AA 3RJYA 1X6NA 1MQPA 1PPIA 4P7RA 3THCA 4AZHA 4TUFA 4ACZB 4CGTA 4U2ZA 1BF2A 1BLIA 3CMJA 5A8PA 1R87A 3WF2A 4CN1A 2A3EA 1OGBA 1QNSA 5A6SA 2GJXB 2A3HA 2VZOA 1CNVA 1VF8A 3SCPA 4PSPA 4GZIA 5A69A 1VRXA 1IT0A 3NDZA 4PTVA 4W84A 3WD0A 3AQUA 3AICA 3VKKA 1UG6A 5ABFB 4MB5A 2PB1A 1Q6DA 3WDIA 3ZJ7A 1KXTA 4D72A 4OBRA 3PZUA 4W7VA 5KEZA 1OB0A 1E4NA 1UR8A 2ZWYA 2GDUA 4AD4A 3OA5A 3W27A 4CCDA 3VINA 1TR1A 1B3WA 1UKSA 4D6GA 4NRSA 4PMXA 4QCFA 2W5FA 5I3DA 3AI0A 4H41A 4XV0A 1E56A 4QCEA 4GO8A 5D8WA 2JALA 1WZKA 4EANA 4MDOA 1TUXA 1WNOA 4IUGA 2VRJA 4MB3A 2WAGA 1C8XA 1KBBA 3WBEA 1OSEA 2ZE0A 4D6CA 1OT1A 1W1TA 2BY1A 1TVNA 3EBVA 3U5YA 2J47A 1V3JA 1GVIA 3CH9A 2X1IA 3VNZA 5AYIA 1GOMA 2XVNA 3DC0A 2XGIA 1U2YA 4TTGA 3SCRA 1E0XA 3ZT7A 2BNJA 1ZU8A 3W26A 3W29A 1E6XM 2QPSA 3GNOA 5A8MA 4AD0A 1QHPA 1UKQA 2J7EA 3N15A 4X0VA 1TCMA 1H1NA 1Q6CA 2X8RA 3VIIA 1EHAA 2FHFA 1B3XA 2BVYA 2WC3A 1UA7A 1K9FA 4PMNA 3MV11 3RM4A 2VO5A 1J01A 2XUCA 3BAKA 3F5KA 5GPRA 1JFHA 1K6AA 1PEZA 1KWKA 3ZM8A 3WUFA 4UOZA 4OZOA 2C7FA 2W92A 1UKTA 2ZUNA 1R85A 3UESA 3WD2A 1ODZA 1CXLA 3DYOA 2WK2A 3K4AA 1UD8A 1KFWA 2X2YA 3FXYA 3OG2A 3ZSSA 4KGJA 3TTOA 1UR9A 3ARUA 3BAJA 2JE8A 1EDGA 1UQYA 1BGGA 1GOOA 4MJ4A 1IV8A 3CHEA 2WWCA 1C8QA 4HTYA 1WZLA 1KQZA 3RCNA 2FH8A 4AC1X 4H8HA 1VFUA 4EE9A 1OIMA 1JDDA 2CKSA 2BY2A 3VIMA 4U3CA 3FN9A 2XSBA 4FLQA 4Z2IA 5IDIA 2D1ZA 4UFJA 3DHUA 5E70A 3WSUA 1EIBA 3VD4A 2UY2A 3W0KA 1E3XA 4GZJA 3AIRA 2XVPA 1PZ2A 2J7CA 1XRVA 2WLZA 1QVBA 1JI1A 1XH1A 2D0GA 4QDMA 3VNYA 2XWDA 4KH2A 2EXOA 3A4XA 3WUGA 1UWQA 4UFKA 2PI6A 2QMKA 3UETA 1UD4A 1B0IA 3LPFA 1ISXA 4GI9A 1G0CA 1O7AA 1BHGA 1C92A 4XZBA 4J3SA 1VJZA 3ZMRA 1H0IA 2XVLA 1HVXA 2O9PA 4W93A 1TA3B 1J0IA 4GI8A 3K1DA 2OLHA 4JHOA 1ITCA 5EB8A 2YL5A 1OGGA 3EDDA 2PF0A 4HA1A 3VMNA 2O92A 1KB3A 5D9NA 2J4GA 7CGTA 1JZ5A 2WMIB 2HVMA 1VBUA 2O9OA 1E6ZA 4CUCA 1J0KA 4GXPA 2D3LA 3L4UA 4URIA 3WUBA 4Z2GA 5CLTA 2Z1SA 4V28A 4CN4A 3T2OA 4LXFA 3OGVA 4J3TA 1CXFA 5CGMA 1CDGA 4UFIA 4M82A 2CESA 2WCGA 4CU7A 2V5CA 2D2OA 1CLXA 4UQCA 5EFFA 3BAIA 1WDRA 3MSGA 3UR8A 3QOMA 4AISA 2GK1A 1ISWA 4JKKA 3G6MA 1E5NA 4W7WA 1LG1A 2QMJA 4MNLA 2WYSA 2PBOA 3BAWA 1ZJBA 1I1WA 1GHRA 1L8NA 2DT0A 4DWSB 3CTTA 4H2CA 5A94A 3O9NA 1W1VA 1UWSA 3T0AA 1HJXA 4D71A 7A3HA 3VD7A 3D3AA 5D9MA 2JEPA 3BXWA 1JZ6A 5GNXA 4DUWA 4LGXA 3M7SA 3BCDA 4AEFA 1HVQA 3VIPA 1W1PA 1E72M 3WFZA 3FNDA 1J0JA 1ZL1A 2J7FA 1H2JA 4W8LA 3BAXA 1JXJA 1DWFM 3GH5A 4MADA 3T09A 1KXQA 5GNZA 3WDHA 2D3NA 3HU7A 2ZX8A 5BXSA 1A3HA 1JL8A 1HL9A 1ITXA 4PRWA 2WVVA 4Y7EA 5FL1A 1EXPA 4OJYA 4P7OA 3CZLA 4CD8A 4FLRA 1V3HA 1CEOA 1JIBA 1VENA 1QI0A 4GQRA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AOF A;  4H8U A;  1NWU A;  4PCT A;  3RDK A;  3ARW A;  1BAG A;  3WDR A;  4BCE A;  3LPG A;  1V6Y A;  5E6Y A;  5TD4 A;  4W8A A;  2W63 A;  4KWU A;  1ZJA A;  2OSW A;  2DEP A;  2XII A;  1WCG A;  1J0Y A;  4LPC A;  1W1Y A;  2WVS A;  2BHY A;  3I3E A;  1QI3 A;  1VFF A;  3LMY A;  3VIJ A;  2PWD A;  2VTF A;  3GH7 A;  3CZK A;  4YN5 A;  4JL2 A;  3E1F 1;  3N13 A;  4AXN A;  3RME A;  1UOK A;  1V3I A;  1OT2 A;  4D1J A;  1CXI A;  3N04 A;  1MW1 A;  2ZXQ A;  3NDY A;  3MUZ 1;  3ZQ9 A;  4UQ9 A;  1XHG A;  5M03 A;  1KQY A;  3SCO A;  2DDX A;  4RE4 A;  1JYX A;  2YA1 A;  3CGT A;  3W24 A;  3SEP A;  4GI6 A;  1MW2 A;  2VOT A;  2CPU A;  1UYQ A;  5GNY A;  3KZS A;  4AD2 A;  1IZK A;  3RJX A;  3WNM A;  4UQD A;  1X6L A;  3WMS A;  3GNR A;  4XX6 A;  3HJE A;  4FLO A;  2MAN A;  4ACZ A;  4V27 A;  1XH0 A;  1EGZ A;  4AW7 A;  5I77 A;  4W86 A;  1VIW A;  3GTN A;  3MMU A;  1HJV A;  2GJX A;  4ZE5 A;  2VUR A;  1UZ4 A;  4U31 A;  5DEZ A;  4GPN A;  1GHS A;  3ARV A;  3RIK A;  5ABF A;  4F79 A;  1TE1 A;  4FK9 A;  1E55 A;  1B3Y A;  3DYP A;  4HOW A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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