2PCQA

Crystal structure of putative dihydrodipicolinate synthase (ttha0737) from thermus thermophilus hb8
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
283
structure length
283
Chain Sequence
MILPPIPTPFDREGRLDEEAFRELAQALEPLVDGLLVYGSNGEGVHLTPEERARGLRALRPRKPFLVGLMEETLPQAEGALLEAKAAGAMALLATPPRYYHGSLGAGLLRYYEALAEKMPLFLYHVPQNTKVDLPLEAVEALAPHPNVLGIKDSSGDLSRIAFYQARLQEFRVYTGHAPTFLGALALGAEGGILAAANLAPRAYRALLDHFREGRLAEAQELQKKLFPLGDLLAKGGVPLLKQALRHLGLPAGYPRPPYPAESPLWERFLPVLEGLKEEGWVL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Thermus thermophilus
publication title Crystal structure of putative dihydrodipicolinate synthase (TTHA0737) from Thermus Thermophilus HB8
rcsb
molecule keywords Putative dihydrodipicolinate synthase
total genus 101
structure length 283
sequence length 283
ec nomenclature ec 4.2.1.52: Transferred entry: 4.3.3.7.
pdb deposition date 2007-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2pcqA00
5H2ZA 4K39A 1EUNA 1SO5A 2CZDA 5D09A 3Q37A 4AF0A 1YXYA 3CWNA 4PEKA 4TIMA 2Y62A 4Z1CA 2E1DA 4FNQA 1MSSA 5I3KA 3LCFA 2NXGA 2E68A 3TJLA 2V5LA 5G2IA 3S1WA 4ICNA 3S5OA 5G2WA 4E0CA 4AB4A 4D2JA 3UWQA 3G24A 4DF1A 1OFBA 3Q94A 3QSRA 1P5BA 4WXZA 1FY6A 2J6XA 4RJEA 3SY5A 2R91A 4XBKA 2G5WA 5HR6A 3QMTA 3W7QA 1B9BA 1I8JA 1L9WA 4AXKA 1I2RA 1LRQA 1TTPA 3FKRA 1P0NA 3S5YA 1DOSA 4GE8A 4ZQMA 3G1FA 2CLOA 4MFDA 1SQ7A 4M19A 3O16A 1XKYA 3MUXA 3NQ8A 2BX7A 3SW6A 2WNQA 4A29A 2WKJA 2H6RA 1LBFA 4RR4A 4JX4A 1OK6A 3BV4A 4QAIA 4DELA 4ADUA 5FF0A 3OVPA 5E0KA 3LHYA 3PF3A 1KTCA 3LCGA 3L21A 2Q8ZA 5D38A 4BI7A 2V82A 3MYPA 3G1HA 3TMQA 3M6YA 4WQ6A 4XKYA 3S6DA 1L2UA 1TTIA 3PBYA 4NUWA 3F1QA 5CPLA 5CSRA 3DI0A 1ZNNA 1AW5A 1Q6RA 3NQ6A 4H3DA 5K7JA 4N9EA 4MYAA 3NL6A 1KFCA 5HWMA 4K38A 1B57A 1LBMA 2R8WA 4IPIA 3B4UA 4N9BA 4YMZA 1PL9A 3U8GA 4UR8A 4UTTA 3PG9A 1OX6A 1ZFJA 2E5DA 3OVRA 1TV7A 3LRMA 3VNDA 5AHEA 4JEQA 1SSGA 1KFJA 1JCNA 3LTSA 3KAOA 4QNEA 4AWTA 4E2DA 3KX6A 1SO3A 3O05A 2Z1BA 1R46A 4J9JA 5AYZA 1W3IA 5CZ0A 5CZJA 2X1SA 3RU6A 3TC6A 3W23A 2Z2UA 3EX2A 1PV8A 4M7TA 4GUIA 5D2WA 3TV8A 5J5DA 5KTLA 1DV7A 2X2GA 1BKSA 3P5YA 2ZZ5A 3OA3A 2G97A 4PFMA 2V81A 3W1XA 3F03K 1TPH1 3NQVA 4UTIA 2RDWA 3W73A 4EF8A 4AHOA 1UBSA 2RFGA 3DFQA 2Z6JA 3LLDA 2E6FA 3FS2A 3KOFA 5C5YA 1XBVA 3ANYA 4AEOA 2CZ5A 3S1UA 4K8HA 4CCDA 2FPTA 1ONRA 3B8DA 4LV4A 2GQ8A 1JCXA 2H90A 5G2HA 3DHFA 3PAJA 3HPZA 5BOOA 4Z08A 2WPBA 4OWGA 2C14A 1T96A 3N9SA 1M7PA 1W37A 4R53A 2RDTA 2C3ZA 3NR0A 3BLFA 1PHQA 5G4EA 4O50A 4KFNA 1EWDA 1KTBA 2GVGA 1WQ5A 3UYCA 3TMLA 5HWNA 2C13A 3W83A 1FQ0A 3BW3A 4HHPA 1H50A 3LHUA 1VZWA 4FX6M 3INPA 1XM3A 2QCGA 4O53A 3PM6A 2X16A 1J5TA 4LTSA 4FNTA 3T7VA 3UWWA 4M6QA 4CQ9A 3G1AA 3NL3A 3W1UA 4WY0B 1XUZA 1YYAA 2JKAA 2A85A 2ZZ2A 5CPOA 1TPC1 3UPBA 3BPWA 2GPTA 5FEXA 4DF0A 4DBDA 2E09A 3B06A 1VQTA 2PRMA 3HPSA 3DI1A 1NEYA 4E38A 3I68A 5D2YA 4JYDA 4LS1A 3FOKA 2ZBTA 2IQTA 3W7RA 3SFKA 2CLKA 3L5MA 1S3HA 4JD4A 3BW4A 4MOZA 2ZDRA 1TV8A 3PSWA 3EWZA 2PE4A 3N14A 4KWVA 4NX0A 2YDAA 2QUUA 3TC7A 4UXDA 1D9EA 5F2MA 4DF2A 2A1YA 1IIHA 1N8FA 5HR7A 1XFBA 4XZ9A 3K30A 2AAMA 3R13A 5AHNA 1VGAA 1WAUA 3G1SA 3ABSA 4OU1A 2ISVA 3W72A 3DFTA 2ATSA 1XDMA 2ZRYA 4BK9A 3BO9A 1QPOA 1GOXA 5I3GA 4LOCA 5LGXA 2ZCGA 4H4IA 4CNNA 3A9IA 3HO8A 2C18A 4NJKA 1WDWA 3IIOA 2E5BA 1CW2A 3PC0A 3E02A 2V8ZA 1IXQA 1OG0A 3QEZA 1HUVA 3LM7A 1FWNA 1NAL1 1RD5A 3S0CA 1K7FA 4Z1BA 3GNDA 3W7MA 3TR2A 2YW4A 2ZRUA 2P1FA 4L4LA 3UQNA 4GC4A 1I45A 4FXSA 1X6UA 3N2MA 3VCRA 5TIMA 2A2IA 3TJXA 1AW2A 1LRTA 1SO4A 2I9EA 3P60A 2W79A 1EP1A 1NSJA 3DFOA 4N6EA 1RV8A 4DO4A 1W3NA 3LCLA 2ZZ4A 3R2GA 4RXFA 4ORMA 3SSJA 1QPNA 5K9DA 2YW3A 4EOUA 2CWNA 3FJ6A 3NQEA 3P80A 4O0ZA 3LV5A 2YPIA 5DCDA 1C9DA 3P5ZA 3F4WA 2ISWA 2NLIA 2V5BA 2J24A 4RXGA 1OX4A 3O6DA 4O15A 3M5XA 3TQVA 1EUAA 1EPXA 4IMEA 2D73A 3WK3A 2XN2A 3QRHA 1ZENA 3G22A 4LRTA 3MMTA 2F84A 4QIUA 3TAOA 4Y9AA 1JCMP 1KW1A 3DBPA 4FB7A 2A7RA 1KFBA 2E77A 4K8EA 5D04C 4HIBA 3HF3A 3TUUA 1ZAIA 3ATZA 3MBDA 3LRLA 3C52A 1TV5A 4MZYA 5DBUA 2WJZA 3C3NA 5CZTA 2C19A 3LXAA 2V2HA 3A23A 4PL1A 3O6YX 1YLVA 4NXSA 4NU7A 2FQIA 4UR7A 1KFKA 1CI1A 1GPWA 1K7EA 4ZVJA 3M44A 3CC1A 3N9RA 1TSIA 4LS0A 4LY8A 3PBUA 2VXNA 1PE1A 3P62A 3STCA 2XFWA 2VKZG 2A7PA 3BW2A 4EIVA 5HINA 1OFOA 1WOBA 2NWRA 1F5ZA 4Z1DA 3T78A 2VFIA 2Y89A 4LC8A 3NPWA 2ZTKA 1PCWA 2DZSA 5G5IA 2Y7DA 2YFNA 3GVGA 4AWSA 4N6FA 1SZGA 1TO3A 3EXSA 1GT8A 1K03A 4FX7A 3QQ0A 2ZRZA 3LCHA 3LXBA 1OFQA 4LT9A 1DKWA 2ZZ3A 4NZFA 5L6UA 1GVOA 2V30A 3LDVA 3LCIA 1K3UA 2ZQ0A 8TIMA 4DO6A 4NJIA 2E6DA 2DZTA 4UTJA 5MHBA 1A5AA 2GJLA 4JTKA 3GLCA 4IPJA 5AHMA 3HG5A 1VLIA 1KV5A 1KM4A 5FI8A 3T40A 3W7JA 3STEA 1H1ZA 2J9XA 5D33A 5G4WA 4ADTA 4OT7A 3IIZA 3HQ1A 3TQ0A 3GB6A 5TQLA 5LSMA 1XI3A 2Y61A 3L5AA 3DZ1A 1YDVA 3PY2A 2VEIA 4UMAA 1TYGA 3UY7A 3GDLA 1UUMA 3UWYA 3W7OA 1H7XA 1G4EA 2QF7A 1KFLA 1FCQA 3GXTA 1QO5A 4JTLA 2OMAA 3GDKA 5LKYA 3RNDA 3GR7A 4OE7A 3NOEA 3N34A 3W7NA 1F05A 2QJHA 4NJJA 4NJHA 3M7WA 4FO4A 2NV2A 4UTTC 1SW7A 4JGDA 3G1DA 4NNAA 3L65A 4FNPA 2GQ9A 4JIQA 3S5ZA 3C2EA 3GDRA 1UB3A 3W7HA 5AC6A 1OFRA 3GIYA 1DL3A 4UIOA 5F2IA 3ABOA 2A6LA 3QMRA 4JY9A 5H91A 2V2CA 3NQ7A 2Y88A 4GJ1A 3VKJA 4ZL1A 4YCPA 4N2YA 1G4SA 3QH2A 4O1BA 3FJLA 2C1HA 2ISSA 1X1OA 3DKLA 4HSOA 4TMBA 3V1PA 1DQXA 1TTQA 1VJIA 2ZA2A 4I7VA 4UMBA 1JJKA 3TW7A 1ICSA 3NNTA 4CLMA 2VFHA 3MBFA 3SGZA 3W87A 3M47A 3QF0A 5C55A 1EB3A 2DJXA 2EGZA 5G1TA 3QJAA 3WJSA 1K8YA 3TK7A 3UD6A 4RZ5A 3QYQA 3W1QA 4BF9A 3IRDA 4JIPA 1WXJA 2NV1A 5FEZA 1AL8A 1Q6OA 5CPNA 4O54A 3IVTA 1LDCA 1OJXA 1RZMA 4JYEA 1AK5A 3VFLA 1H62A 1TJPA 3LX9A 3NXFA 1WBJA 5AC8A 1N55A 1TPUA 3RF9A 1JVNA 1N7KA 3H53A 2RDUA 5KZMA 3OEXA 3T44A 4JTUA 4O18A 2AGKA 1L6YA 4OGZA 3M1ZA 1KLZA 3Q2DA 1XBZA 3OG3A 2VENA 3W9ZA 1TPDA 2B7PA 4YCOA 5HQEA 4Y90A 3SZ8A 3HIJA 3N73A 4Q33A 4UCGA 3EKLA 5FF4A 2WOQA 5J5RA 2HSAA 3NPVA 2HS8A 1GVSA 3GDTA 4I7UA 3ZFHA 4PTNA 1ICQA 1YPFA 4XBSA 3EX3A 1GYNA 5K4ZA 2Z6IA 2QDGA 3R89A 5U7SA 1AW1A 1ME9A 3C4UA 4ZQRA 7TIMA 4HNTA 2QKFA 1X1ZA 1F2JA 2P0OA 4MY1A 1B3OA 4BR1A 1LYXA 1W5QA 1H63A 4O57A 3I7RA 3SI9A 4PODA 3NYZA 1H60A 3NGJA 3IV3A 2CLMA 3O15A 2CLIA 3A21A 5F4XA 4RKAA 5FF3A 3IGUA 4QISA 4O10A 1ADOA 3W1LA 4CCEA 4GUFA 1W31A 4CCCA 3G18A 1KLYA 3TCEA 2QAFA 2YCEA 4TR9A 4IXHA 5HNRA 4AF0B 2ZA1A 2DORA 1GG0A 2LLEA 3EWBX 5A8GA 4AVFA 3F4NA 2JGQA 1XCFA 3NQAA 1T0OA 3JRKA 1Q6QA 5CG7A 5F2GA 3PB0A 2TSYA 2C16A 1TJRA 3FEMA 2OZ0A 1VCVA 5D02A 3NPXA 3UPWA 3UXAA 4IOTA 4FIQA 3B0VC 2W6RA 3P67A 1SUXA 5HWJA 3B0UX 1FCVA 4JTEA 1VPXA 2FDSA 5LHFA 1IF2A 3PULA 3QPZA 4QSHA 4R7JA 3S5NA 2YR1A 5FEPA 4E2BA 3P81A 3RK8A 4ZZ9A 2FLIA 2J9ZA 2FB2A 3CEUA 3GK0A 3FLUA 1O4UA 2Y70A 1LROA 3W1AA 3W2MA 3U6WA 2QCMA 1LCOA 4M6VA 2Z0IA 1KA9F 1K7XA 1FDYA 2O7SA 1ICPA 5BW6A 3CLMA 2FPYA 1LP6A 2VEKA 5DXXA 1MEIA 4O1DA 1GG1A 3NAVA 1G7VA 5LNVA 4LC6A 1A50A 4K37A 3LLFA 4LVFA 4XKYB 1AMKA 2GVJA 4GUHA 4UFLA 3M9YA 2F7FA 3KVMA 4ZQPA 1OVDA 1TREA 4WX2A 3EX1A 4DPQA 3L2IA 3S42A 4LVDA 4QITA 1VCGA 2VFFA 1DJQA 1PVNA 1VYPX 1H7PA 1EP3A 3CIWA 1HTIA 3MW7A 4K6AA 1WV2A 1AG1O 1GQNA 1F76A 1ZHAA 3O8AA 4N9DA 4CNPA 1G67A 1LLZA 1X7FA 2TMDA 5D2VA 1B4EA 1V5XA 4MJMA 2OT1A 1H7WA 3W84A 3MHUA 2BZNA 1LTDA 2XN1A 4Z0JA 2V2DA 5I3IA 1KM3A 2GOUA 2A4AA 3A5VA 4QNWA 4I7WA 3IIVA 1OYCA 4JXCA 5C6MA 3W07A 3LCWA 2XN0A 5LNWA 4YXGA 1NVMA 1A5SA 3L68A 4JICA 1W5MA 1XBYA 1JUBA 1OFPA 4BWLC 5EMUA 3N19B 1ZCOA 4IJBA 4MVAA 1TPFA 3WK0A 3P8IA 3TW6A 2PC4A 3WJYA 5D32A 3C2VA 1VRDA 3EXTA 3DXIA 3DHDA 2A6NA 3QC3A 2WO5A 1Q6LA 2DU2A 2VOMA 3MHFA 3W1TA 2EAWA 5AHIA 3C2OA 3W3OA 2CLHA 4O4VA 4XUGA 3TX9A 2A21A 2ZZ6A 4IUOA 3E96A 3M5ZA 3W70A 2A5HA 1GZGA 2B7QA 2C0AA 4IMFA 2JK2A 1W1ZA 2C6QA 5D05A 1C29A 3EWWA 1QAPA 1JQVA 2H8ZA 2QCDB 2B4GA 3LRKA 1LBLA 4KKXA 4RX0A 1LZOA 3IIXA 4W9TA 1H7NA 4K36A 2Q3OA 3BGJA 1IXOA 1I2OA 4NVTA 4A22A 5K2ZA 1FCBA 2UV8G 2CZFA 2QCHA 2JKPA 1NF0A 1WOAA 5ABTA 1YADA 3AJXA 1GEQA 1NF7A 4MZ8A 2NXIA 4LNYA 4XTIA 2E5CA 3C2FA 2YX0A 1XC4A 3LV6A 5DCEA 5KZEA 1FWSA 4X22A 1JCJA 3G1XA 1OYBA 1EA0A 4HT3A 2BTMA 1ZAHA 1RPXA 3PS7A 3W1PA 2V0TA 4N4QA 2GVLA 2GQAA 3WJWA 2CU0A 1OFDA 4UNLA 1I2QA 3KRZA 4NNCA 1ZJIA 3C6CA 4OQVA 4JYFA 3QW3A 3CM4A 1SZFA 3P82A 3M16A 3W22A 4EVZA 1QFEA 2YYUA 3G8RA 5FEWA 2ALDA 1ME8A 3TA6A 1VS1A 4HNNA 1VHNA 1ZAJA 1MZHA 1FWWA 4BFAA 2NXHA 3UWUA 4UFIA 1TRDA 4BI6A 1BTMA 3W88A 3UZJA 2Y63A 4O19A 5GVJA 1JULA 4K7YA 5CZSA 2Y7FA 1QPRA 3WJXA 2QR6A 4S2CA 2QCEA 5L9FA 3IVSA 3LB0A 1WBHA 5K9CA 5KZDA 3UWZA 4UC5A 3BVJA 1UUOA 4NJGA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3H2N A;  5FKY A;  3WUE A;  5HMF A;  1SO5 A;  2CZD A;  3LA4 A;  1SYT A;  1YXY A;  4PEK A;  3B97 A;  2ODO A;  3B9O A;  1MSS A;  2NXG A;  2E68 A;  3TJL A;  5G2I A;  3AQU A;  4ICN A;  3E0F A;  4KRZ A;  3S5O A;  1KBL A;  3KLK A;  5G2W A;  4AB4 A;  3K4D A;  3IJ7 A;  3G24 A;  3UWQ A;  1OFB A;  4CVU A;  1OD0 A;  1O7A A;  2R91 A;  3RRA A;  4XBK A;  4ZO9 A;  3W7Q A;  1E4M M;  4AXK A;  4F8X A;  1PTG A;  1I2R A;  4FF5 A;  4PTD A;  1Q8J A;  4QCE A;  2GJR A;  4JCL A;  3TQP A;  3O16 A;  5D9N A;  2XIN A;  1M04 A;  3I3E A;  4A29 A;  1XIJ A;  2WKJ A;  1VFO A;  4JX4 A;  4Z17 A;  4JL2 A;  3OVP A;  7XIM A;  2VCA A;  3E38 A;  3QV6 A;  1KTC A;  3L21 A;  2VGG A;  3T2O A;  4Q7B A;  2WKL A;  4XSL A;  2V82 A;  4YHG A;  4WQ6 A;  2WVS A;  3S6D A;  1L2U A;  1GW9 A;  3F1Q A;  3DI0 A;  1RCQ A;  3WSU A;  4G7E A;  4AZC A;  1O1H A;  2ZXB A;  3ZO9 A;  3NL6 A;  4FS9 A;  4DBU A;  2D0F A;  1LBM A;  1U5V A;  4YMZ A;  3L12 A;  1PL9 A;  3EOL A;  4KRT A;  1E43 A;  1W3J A;  5TF0 A;  2XSA A;  3VND A;  5AHE A;  4OOZ A;  1PX8 A;  1SSG A; 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