3QSTA

Crystal structure of trichomonas vaginalis triosephosphate isomerase tvag_096350 gene (val-45 variant)
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
251
structure length
251
Chain Sequence
RTFFVGGNWKANPKTVQEAEKLVEMLNGAKVEGNVEVVVAAPFVFLPTLQQKLRKDWKVSAENVFTKPNGAFTGEVTVPMIKSFGIEWTILGHSERRDILKEDDEFLAAKAKFALENGMKIIYCCGEHLSEREAGKASEFVSAQIEKMIPAIPAGKWDDVVIAYEPIWAIGTGKVASTQDAQEMCKVIRDILAAKVGADIANKVRILYGGSVKPNNCNELAACPDVDGFLVGGASLEAGFINIVNSNVHSK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Trichomonas vaginalis
publication title Crystal structure of Trichomonas vaginalis triosephosphate isomerase TVAG_096350 gene
rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase, putative
total genus 86
structure length 251
sequence length 251
ec nomenclature
pdb deposition date 2011-02-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qstA00
4N02A 3M7WA 3KHJA 4I7UA 1TTQA 4S1FA 1SO6A 1AW2A 5G4EA 1XDLA 2PRHA 6ALDA 3LRLA 1TPDA 3WK3A 2XFWA 1EPXA 1F7BA 5FESA 3PY2A 1KA9F 2VOMA 2FPTA 4UTHA 4CQAA 4WXYA 5HUOA 5KITA 1TJRA 5K2ZA 4KFPA 4IMDA 3NZRA 1XXXA 3VNDA 2CZDA 3EKLA 5BMWA 3HG3A 4RK8A 5MHBA 1OYCA 3C56A 3GYEA 3BW4A 3NDOA 5F2GA 4Z1CA 1VHNA 3MI3A 5E93A 3HPXA 2QAPA 3W1XA 4I7WA 4LVAA 2Y70A 4CNNA 4XWUA 3HIJA 1WOAA 3LXCA 4UTTC 2ZRXA 1S5WA 3ELFA 3GXTA 2V2CA 1TRDA 2NXHA 4MY8A 5I3FA 2GJNA 3BW3A 4O28A 3GR8A 1F05A 1OYBA 1KFLA 4N9BA 2C6QA 2Y61A 2V81A 2ZRWA 3P74A 1L6WA 1O60A 1ICSA 3UWVA 2VELA 4MUZA 3FYOA 1EIXA 2V82A 4GE8A 5DCBA 4RZ6A 3S1WA 3TMQA 2A7PA 3QMTA 4NU7A 4D2JA 3Q94A 3M41A 1G6CA 5DXYA 4FXSA 1YDOA 4Z0JA 1OF6A 1A5BA 3QMRA 3GZ3A 4AWSA 3QQ0A 1H7WA 4IQLA 2CLHA 2CZFA 5G1TA 3FOKA 3H54A 2O7SA 3IGUA 4ZQRA 4NQ1A 3EWWA 4XTIA 3F4NA 2NUXA 3O07A 3TAKA 4CCEA 4A29A 3PBUA 2J9YA 5K3VA 5AFDA 1LBLA 1J4EA 4M7SA 3ABRA 1ZAHA 3BV4A 3P8JA 3PF3A 3Q58A 4GUHA 1M6JA 5D09A 4Y9AA 1BWLA 1SSGA 3LGEA 2PC4A 3QJAA 2A21A 4ML9A 4GRSA 5J5RA 1RQHA 3ZWSA 1RZMA 1JULA 5IBXC 2JGQA 2BZNA 2A7NA 3KVJA 4O53A 5L9FA 3M1ZA 4LV4A 3E02A 5DY3A 3RF9A 3TX9A 4DF2A 1QMLA 2TRSA 2BX7A 3U8GA 4LV9A 3NQ7A 1KM5A 4RCXA 2Z6IA 4GJ1A 1UUMA 3R2GA 5LGXA 4YMZA 3SGZA 2BLEA 5D33A 3VE9A 3VFLA 2J9XA 3CTLA 3PG9A 1OFAA 3QEZA 3VE7A 3B04A 1Z42A 1XM3A 3L0NA 2E6YA 2XN1A 1ME8A 4JIPA 3BLIA 1XUZA 4PFMA 2VEIA 1W8SA 1JR1A 1XBVA 3NNTA 3TJLA 4O1CA 4O4WA 5C5YA 1XCFA 3M47A 4EVZA 4UTIA 1YTDA 4HSOA 3MO7A 1H60A 1D3HA 1G69A 3LTYA 4O14A 1FBAA 5GVJA 4FNRA 3OBKA 1MEHA 4RXGA 3EX1A 2GVLA 1XL9A 3UWUA 1O4UA 3QW3A 4JTIA 4UFLA 3NL6A 3DFNA 2WNQA 1GZGA 2BTMA 4N4PA 3HPSA 4IPJA 1NF0A 3LV6A 5LHEA 2X30A 1H61A 4R33A 1TIMA 4BI6A 1YXDA 5CZTA 2CU0A 1OFPA 3ZWTA 2C18A 3C61A 3HJZA 2ZZ4A 1SUXA 4JNMA 3G8EA 4O12A 3W86A 3RLUA 4PL2A 4BK9A 3WK1A 1VZWA 1TPB1 3CIXA 3EEGA 1PE1A 1WBJA 4JYFA 1SU5A 5G2WA 1OX5A 1KFJA 1FWSA 2YFNA 3GDRA 3PBYA 3KVKA 3LOTA 1NSJA 4FNTA 4E0CA 3QH2A 4FF7A 2OCZA 1KM4A 2CFFA 4H4IA 3JRKA 4MIMA 2DZUA 1RVGA 4WY0A 1D9EA 1SW0A 2ZZ5A 3W6YA 1PHWA 2OT0A 2YR1A 3L0KA 4L4LA 3TE9A 4IMGA 3C0JA 3KAOA 4YCOA 3A23A 4HNTA 1OABA 5CPOA 3W2NA 3OHIA 4GFSA 5LHFA 3QC3A 1FY6A 3W1LA 1QOQA 3VKJA 4JIQA 4EF9A 4IGHA 4HNUA 5LSMA 1G7VA 4H3DA 2HTMA 4MZ1A 2QCLA 4UR8A 1EWEA 2R91A 3JS3A 3TXZA 1GVQA 1P1XA 1PCKA 2QDGA 1YLVA 4WX2A 1LLZA 1BEUA 1IF2A 3R8RA 1I45A 5KSWA 3SY5A 3GAKA 2J27A 2B7NA 4ZQOA 3LV5A 1QO2A 2H8ZA 2QDHA 3MHGA 3G1DA 4JTJA 3W7RA 2A0NA 3SIZA 1PS9A 1SO5A 3NQ6A 2WJZA 1IIGA 3DFOA 4O11A 4R7JA 1TPVA 2YYUA 3TC6A 3W22A 5CGQA 5EBUA 4UTTA 3W7JA 5HNRA 3OVRA 3GKFA 3L9CA 4FX8A 4IMEA 3V1PA 5BRBA 3B4UA 1R2RA 5K4XA 1TTJA 1KTCA 4NJGA 1F6KA 2WKJA 3LERA 1ML1A 4JTTA 5F2IA 2B0MA 2D73A 2CLMA 2Q3OA 1YPFA 1YDNA 1VCVA 3MBDA 4EF8A 2X1TA 1GPWA 3LCGA 3GAYA 3O05A 3W2MA 2Y7FA 4LS2A 3W7QA 2ZTJA 4YWIA 1AL7A 2ZFAA 4UMCA 2B7QA 2C3ZA 3W76A 1EP3A 3LDVA 3BG5A 4NJIA 1R46A 1X7FA 3GLCA 3IIOA 1HUVA 1UUOA 1X1ZA 4ORMA 1LLWA 1W5MA 4RLIA 3L5MA 2QCDA 3W2JA 1VS1A 3SJ3A 1LBFA 2W0UA 4LS1A 1EX5A 4HPJA 2DZSA 4K39A 3W1AA 3P84A 5TIMA 3HGJA 3KXQA 2Z6JA 1GVFA 3W72A 4JD4A 3LM7A 3RK8A 3QRHA 2QJGA 3D0CA 4LC6A 2QCFA 2RKXA 3C2FA 3MI2A 3HB9A 5FEWA 3P61A 1TQXA 1H51A 1LP6A 1FWWA 1LYXA 1H7XA 3DFSA 3G1VA 1FDJA 4XKYB 2UV8G 3G3DA 1SZNA 2Y85A 4O4VA 3V75A 1QFEA 4HN4A 4BWLC 2IQTA 2CLIA 3DAQA 2V8ZA 3OVPA 3TUUA 1B4EA 3M44A 4N2YA 5IBXA 1ICPA 3L68A 4GNJA 4ZQCA 4NUWA 2R94A 4ICNA 3GX9A 2J88A 3TSMA 1Q6RA 1WX0A 3STGA 1A53A 4Z1BA 3P62A 1OX4A 5G4WA 2YW3A 1FCUA 5FI8A 3HPZA 3UWWA 4DO4A 2TMDA 1N55A 4OV9A 3I65A 1JUKA 1NF7A 3LBMA 2A7RA 2ZZ3A 3NQ8A 4MJMA 4OBTA 2BSLA 1ALDA 4Y8FA 1UBSA 2DZTA 3DKLA 3TSBA 5DLCA 1KM3A 4LNYA 4JX6A 3NPUA 4AF0B 3TFCA 2QJIA 3EXTA 2XN0A 3W1PA 5D30A 2WPBA 3OG3A 4AHPA 1I2NA 1VH7A 3A5FA 2LLEA 1OJXA 3NXFA 4LVFA 3CT7A 4UMBA 4BI5A 3OA3A 4K36A 3O15A 1UASA 2FIQA 3STEA 3S1UA 3TA6A 5I3HA 3TSDA 3O06A 4B5NA 2GJLA 2F7FA 3PR2A 4OE7A 1FWNA 4O1BA 2VXNA 5AYYA 1EP2A 4IPIA 3NQGA 4JY8A 3R13A 5HR6A 3M0ZA 1JCJA 1PIIA 1VYPX 3S9YA 1P0KA 4MZYA 2VENA 1XKYA 4DEFA 1JJKA 1EP1A 3L66A 4IUOA 4Z1DA 4UNLA 2A2IA 4ZVJA 1H7NA 3S1XA 2B7OA 4MJZA 4AVFA 2FLIA 1AW1A 3NM3A 3NL3A 2E5BA 1VLWA 2QCGA 3G18A 5HQEA 1C8VA 2H3DA 2WNNA 4QSHA 1LRNA 4UTUA 1AW5A 2CLEA 4N9CA 3KRUA 2EGZA 5G5IA 4UIOA 4IX0A 2EKCA 2VKZG 3IVUA 5C6MA 1MXSA 5F1UA 1SQ7A 3JR2A 3DHDA 2PRMA 4S2CA 4O10A 5TBOA 4U4MA 3FKRA 4DF1A 3ZS4A 4FIQA 5CPLA 5DN1A 5D37A 1HG3A 2Y88A 1ZHAA 2V2DA 4UFIA 1H1ZA 1Q45A 3LXAA 3B05A 4X3ZA 1VHCA 3W2KA 1WA3A 4DO6A 3LHYA 2WSRA 1JCYA 3CEPA 3EWUA 5AOUA 4X22A 1TO3A 3R89A 3CB8A 2BXVA 5LNSA 1W37A 2R14A 2HSAA 5F1VA 3MHFA 1Q6OA 3W1QA 3A9IA 1WYIA 5D03A 2VEMA 1W5QA 3PSVA 4O15A 5G2HA 1KM6A 2BWGA 1IXPA 2X2GA 1EUNA 1EA0A 1XBXA 2C0AA 2RHGA 3NPXA 3L2IA 2TSYA 3GR7A 3S5NA 3NPVA 4Q4KA 3G0UA 3GDTA 2KZHA 3W7CA 2ABBA 3W7GA 4CQ9A 3G0XA 1KFEA 2Z0IA 4CCDA 2NUWA 2YCEA 1OFEA 5FEZA 1S3HA 5CKSA 1RR2A 1GQNA 1LRTA 4GUIA 1ZY9A 1OFBA 2YGYA 3SI9A 3W84A 1VPXA 3BK0A 1VCFA 1SO4A 4EOUA 4UR7A 3DH7A 3W83A 3G1XA 3LHZA 4JXCA 3PUDA 4O18A 1A5AA 3UPBA 3M5ZA 2VFDA 1EWDA 2WNZA 3W88A 5BMXA 2R8WA 1WBHA 3NQVA 3WJXA 1TPFA 3TXVA 1H50A 2ZZ2A 3P5YA 4KKXA 3N9SA 4GBUA 1OFDA 2YSWA 1QAPA 1SO3A 5CSRA 4EIVA 3GK0A 1TRIA 1P5BA 4NNAA 2ISWA 1CI1A 3TC7A 3IV3A 4OU1A 3GXNA 3UYCA 3S8HA 3B0UX 1DQWA 2X1RA 5U7SA 5I3IA 3CU2A 2CLLA 3PB2A 1GYLA 1JRCA 1QDSA 1LZOA 1QOPA 2GOUA 1KFBA 5D02A 3W85A 4ALDA 1FCVA 1F6PA 1W56A 1G4SA 2NUYA 3BLFA 2CZEA 1KLYA 5DCEA 5EL1A 2DZXA 1NFBA 1TCDA 1MZHA 3SR7A 4GC4A 1FUYA 1XBZA 1ICQA 3EKZA 3G22A 4HKPA 4C1LA 1QNVA 4BR1A 3DU0A 4ZQMA 4LUJA 4POCA 1UCWA 3SECA 8TIMA 5I3GA 1YTKA 5CZSA 1VC4A 4UFJA 3TQVA 1LBMA 4UMAA 1L2UA 4RX0A 1OK6A 1KTNA 4MPQA 3IEBA 3B06A 3O6YX 1JVNA 5LNUA 4O50A 3L0GA 3NYZA 3UPWA 2Q8LA 1LOSA 2FQIA 3LI0A 3CC1A 3RFAA 3W07A 1TREA 4K8EA 3SFKA 2NZLA 3N19B 1GTEA 2A85A 4A2SA 4WY0B 4LUIA 5AHNA 4QNEA 2RH9A 4L4MA 1I2RA 5K9XA 2O7QA 2QR6A 2A1YA 5KTLA 4C1KA 1I2PA 5DBTA 3UWYA 4GUFA 2A4AA 1FCBA 3THAA 2CLKA 3TJXA 2ISSA 3KFTA 1AG1O 5AC7A 4XBSA 4MOZA 4WZHA 5HWNA 1KFKA 1LCOA 1FCQA 1OK4A 3BVJA 3M9YA 1T0OA 1KTBA 4MLRA 5K9CA 4IWWA 5DBUA 4YCPA 2ISVA 5AHEA 5EA9A 2FPVA 1BWKA 3W3OA 1Z44A 3ZR4A 4TIMA 3ABOA 3NQEA 2JKEA 3LCFA 1I4NA 2Y62A 1OYAA 2H6RA 1XI3A 3DFQA 4OHQA 2E6FA 4HHPA 1ME9A 1ZALA 4FO4A 1GVSA 2AAMA 1P4CA 1KV8A 1GWJA 1FX6A 4O54A 1SFLA 4DXVA 4QNWA 2PE4A 2VFGA 3EX6A 4MY1A 4MYAA 3G1FA 3H55A 5D2VA 4IJBA 4HSNA 3EX4A 3TKFA 4M6VA 2QEZA 3MMTA 2VFFA 1Q3NA 4MY9A 1K7EA 1TYGA 3S0CA 3S42A 1YADA 4XQ6A 3QPYA 1GVRA 2QCDB 1O95A 1VLIA 2G5WA 3UZJA 4LS0A 2V5BA 1QPQA 3TCEA 4OT7A 5CZJA 3S1VA 3TV8A 4JTEA 5LGZA 5G1YA 1H62A 3THQA 1F2JA 5D2TA 1ME7A 3UWQA 5LZLA 4UTWC 1L6YA 4HPXA 3TQ0A 3SW6A 1ZENA 2NLIA 4N9DA 4IMFA 1GOXA 4XZ9A 1C9DA 4RXFA 3IIZA 1W3TA 2VEKA 1TMHA 2RFGA 3DBPA 1QR7A 3UXDA 5K4ZA 3W7HA 3DZ1A 3WFAA 1PVNA 4RZ4A 2F84A 3BARA 3I7QA 4RZ5A 2NXGA 4X2RA 1T99A 2C13A 2DP3A 4JTLA 5F4SA 4DELA 4M19A 1DL3A 1OX6A 3USBA 1B9BA 4JDBA 2TYSA 3GVGA 3N73A 3HGRA 1PL9A 4UFHA 4PCFA 3LLDA 1GVOA 3T78A 4XBKA 1K03A 4NX0A 3MBFA 3HG4A 1I8JA 3PB0A 4HNNA 3W7KA 4XTDA 3S6DA 5SWUA 1I2OA 4PODA 2V5LA 3LX9A 1W0MA 3NVTA 4TX9A 1KBJA 4UUIA 2Y7EA 4NX5A 3LCIA 4DBDA 1AL8A 3MW7A 3KRSA 2NV1A 2QCHA 5E0KA 1B4KA 1PV8A 3M43A 4IOTA 1DJNA 3QF0A 1GTHA 4QM1A 4RV8A 1PCWA 3WK0A 3EB2A 4O52A 4MKNA 2E5CA 5HINA 1VR6A 3C52A 4PC8A 3N14A 5IM51 1Z48A 3W23A 4TR9A 4UTLA 5J5DA 4MLJA 4O0KA 2QAFA 4ZZ9A 5CPMA 1DQXA 4DF0A 4LRSA 1ADOA 1HFBA 3B03A 4TU1A 4RKAA 2QF7A 4KFNA 2QUUA 4JN6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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