1F5ZA

Crystal structure analysis of n-acetylneuraminate lyase from haemophilus influenzae: crystal form i
Total Genus 122
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
122
sequence length
293
structure length
293
Chain Sequence
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQVGSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKVLGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTNDLIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords N-ACETYLNEURAMINATE LYASE
molecule tags Lyase
source organism Haemophilus influenzae
total genus 122
structure length 293
sequence length 293
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.3.3: N-acetylneuraminate lyase.
pdb deposition date 2000-06-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00701 DHDPS Dihydrodipicolinate synthetase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1f5zA00
1O5XA 1EWDA 3BG3A 1H7NA 1DBTA 3IGXA 3NQVA 2ZRXA 1I2RA 3IV3A 4O19A 1IGSA 4P2VA 4MYXA 2YYTA 4UTJA 1P5BA 1B4KA 4XBKA 3VFLA 2C3ZA 3LB0A 3QQ0A 1H60A 4YXGA 1HUVA 1JCNA 4WY0B 1KM3A 1UBSA 4BR1A 2B7QA 3P67A 4GFSA 4DO4A 1O4UA 4FNSA 1JRCA 3MBDA 3OA3A 4NQ1A 5CG7A 1KM0A 1OX5A 4BK9A 5I3IA 2WNQA 3DI1A 1JCXA 4O4WA 1KFLA 3DU0A 1A5AA 4MY9A 2GQ9A 3W75A 2BXVA 3MP3A 3VE9A 3KRUA 2ZQ0A 3P82A 4UR7A 3BW2A 2NUWA 5DY2A 4N6FA 2W6RA 3LXBA 1OF6A 3UPBA 3NL3A 1HTIA 3LLDA 5J5DA 1N7KA 2H3DA 4DO6A 1GTHA 2YYUA 2ZZ2A 5FEZA 1A5SA 3W84A 3G1HA 4FB7A 4TR9A 5AYXA 2ZFAA 3W7MA 1H62A 3KAOA 3M5YA 1ZENA 3H54A 3PY2A 5F1VA 5BRBA 3ZR4A 4WOQA 3CTLA 4ONVA 4AHQA 3G18A 2V81A 4X22A 3R89A 1TPB1 1LBLA 3NQAA 4M7SA 3TKFA 4LVAA 1KA9F 1F76A 3FIGA 3QW3A 4JGDA 4UCGA 1OHLA 4RCXA 2FTPA 4N4QA 3W7EA 3T44A 3LV5A 2XFWA 1YDNA 1W56A 1OYBA 3TNOA 3CEUA 3NQ8A 4LOCA 4ADTA 3W83A 1FXPA 3FA5A 2VFHA 3ABQA 4BFAA 3BW3A 1MEIA 2E09A 1KM2A 2H8XA 4OHQA 2ZZ3A 3HPZA 1EB3A 4JX5A 1O5KA 1G7VA 1TYGA 3LV6A 4BI6A 4CNOA 5I3GA 4GUGA 1TPFA 4IGHA 1KTNA 4HNUA 4Z1DA 1LP6A 3W7GA 5G2WA 3BG9A 1D9EA 3TUUA 5BMWA 2PRHA 2WOQA 1LROA 1RQBA 4S2BA 4KKXA 5HQEA 3NPWA 1KFBA 1YPIA 3P5YA 4EWND 4DPPA 4MZ8A 3EWXA 3FJLA 1HL2A 1SW7A 3BV4A 1YTEA 2DZUA 5LNVA 3L5MA 3S5YA 5AN7A 1B57A 1KFCA 3W2JA 2E77A 2F84A 5DLCA 2FDSA 2Z0IA 5FF3A 4UC5A 3W1UA 4HSNA 3RMJA 1KFEA 1IXOA 3M16A 3F1QA 4IXXA 3NOEA 1M5WA 3G0UA 3W3OA 2PE4A 1DQXA 3DI0A 1MO0A 3RF9A 5HWNA 6ALDA 1J4EA 2P10A 4FNRA 3HBLA 3M0ZA 4H6KA 2R91A 1W5MA 2OZ0A 4N6EA 1G4PA 3EEGA 3EXSA 5FEPA 3QEZA 4AWTA 2WNZA 2YW3A 5CZ0A 2E1DA 2GPTA 3DH7A 3EWZA 3O06A 5KZDA 3PUOA 4A22A 4HIBA 3LCWA 3PUDA 1X8FA 4GWEA 2ZRZA 2NV2A 3M44A 4CNPA 5AFDA 4FNQA 4OV9A 1AK5A 4O10A 2TPSA 1OJXA 5FESA 3C0JA 3C8FA 4NZJA 2YCEA 1M6JA 4AVFA 1OX4A 5I3KA 1WOBA 5IBXA 3W7IA 4O4VA 1VS1A 3NPUA 4EVZA 4LUIA 1PCKA 2YR1A 2NWRA 3QSTA 3KVJA 3W7DA 4JTEA 1R46A 1EP1A 1H7XA 3W1TA 2BWGA 4I7WA 2Z1BA 1H7WA 4N02A 4X9SA 4MZ1A 3LBMA 4XQ6A 2NXGA 5AHFA 3RLUA 2HTMA 4B5NA 4MYAA 3V1PA 2UV8G 2DZWA 4NJGA 4Q33A 4IPIA 3TXZA 4CQ9A 3MHGA 4AH7A 3NVTA 2ABAA 5LGZA 4K38A 4NNBA 2A6NA 1KV8A 1TO3A 3G8EA 4POCA 1XC4A 3L65A 3PG8A 3LXCA 1K03A 3IRDA 2C16A 4MOZA 4Q4KA 4OWGA 2YZRA 1UCWA 3W1MA 3C61A 1TV8A 1WXJA 3EX4A 1V5XA 1VRDA 3O6CA 1WDWA 3HG3A 1GYNA 3DFSA 1GTEA 4OT7A 1XDLA 3LCGA 4XUGA 3W7QA 1K7XA 3LCXA 2BZNA 3DZ1A 5U4NA 2A7PA 3LM7A 1W37A 1GZGA 3FS2A 1ML1A 4UTTC 3O63A 4CLMA 3M43A 2Q8ZA 2RDTA 1OABA 1D3GA 3BG5A 3NQ7A 2A6LA 1PHQA 3S42A 3NL6A 3VE7A 2EGZA 1YXDA 3B0PA 1RZMA 1H51A 3LTPA 2Y62A 3L0NA 5AOUA 4JX6A 1OX4B 1I45A 1TPUA 4IWWA 1IXNA 4S1FA 1DKWA 1FY6A 4JTHA 4R33A 1ZJIA 5LHEA 1TTQA 1GQNA 3TR2A 1SSDA 2TYSA 2NXHA 1G4SA 2ATSA 3OVQA 5U7SA 4QNWA 1WYIA 1I2PA 3I7SA 1KLZA 4N9CA 4KFOA 5EKYA 3CC1A 5G4EA 1YPFA 4QISA 3MO7A 4MFDA 3PF3A 4WY0F 4AF0A 3PC0A 1RVGA 3RU6A 5K9CA 1AW5A 2NWSA 1SW0A 3TSBA 3B03A 4M5PA 1TPH1 1EX5A 3I7QA 2ABBA 4PL2A 4QSHA 2V30A 2Y70A 3WFAA 1OVDA 1C9DA 1TPEA 3C52A 3GXNA 3UWUA 4ZL1A 1SO3A 2QCLA 4BI7A 4Z08A 3O6YX 1NFBA 3W73A 1S5VA 1NVMA 3KRZA 3DENA 3BGGA 3KXQA 3NGJA 3NXFA 3CB8A 3TQVA 4OQVA 4WXYA 3WJXA 4EF9A 3TDFA 3TXVA 4LS2A 3MUXA 2DU2A 1HO1A 4Z0JA 3NR0A 3TK7A 1LDCA 3BLFA 4FXRA 3PB2A 1ZALA 2LLEA 3TJLA 2FPTA 2VENA 3D0CA 3O15A 2VEPA 4U28A 1LOLA 2GUUA 5F2LA 5C54A 3GAKA 1PCWA 2Y7GA 3THQA 1GVFA 5I3FA 5F2IA 4YWIA 1HFBA 1TSIA 3GDLA 3W72A 4K7VA 1N55A 4MIMA 1EUAA 3WK3A 3FFSA 3UZ5A 2QAPA 1LLWA 1P1XA 3N3MA 1SUXA 1L9WA 1X6UA 4NNCA 5K4ZA 3NZRA 1R30A 4LVGA 3SIZA 5IBXC 1MEHA 2ZRYA 4O0KA 3HF3A 2PC4A 1TTIA 3BGJA 3FYOA 1LORA 4JICA 1LRTA 4KFPA 4JEQA 3RNDA 3G1FA 1LLZA 4PC8A 5F4WA 3S1VA 1PE1A 1QPNA 2JK2A 3HGOA 2HS6A 1VCGA 5F2MA 3F4WA 3I68A 3M47A 5KZMA 3I65A 1KBJA 5AHNA 4AF0B 2JKEA 3DKLA 3W9ZA 2V5LA 5DCBA 1TQXA 3HO8A 5D09A 5AYZA 2X2GA 4ALDA 2ZZ7A 2PCQA 2WPBA 3OVPA 1BWKA 2VFFA 4QIUA 2ALDA 4LC8A 2B7PA 1OYCA 3NL2A 4Q32A 5E93A 3T4CA 4NJJA 4LNYA 3EX1A 1Z44A 3TX9A 1U83A 4RK8A 2DZXA 3CEPA 2QJIA 2Z6JA 5E1QA 3Q2DA 4TMCA 4UTIA 3V75A 3QZEA 5AHLA 2C14A 4KFNA 1S5TA 3JS3A 4GBUA 1FQ0A 2JKPA 5D37A 1CW2A 5IM51 1G69A 4YL2A 5H91A 3GXPA 4Y6GA 3N9RA 4UNLA 5ABTA 1SFLA 4GJ1A 1OFOA 1TRIA 3TE9A 3BK0A 5G1TA 4HHPA 2QUTA 1TTPA 2NX1A 5EL1A 3HGRA 1C8VA 5HWJA 3KVKA 4FX7A 1SU5A 2E5CA 5J5RA 1LBMA 2ZZ1A 2ZYFA 4FEZA 3G1VA 4JTJA 2A7NA 1MEWA 4RKAA 3I6RA 3GB6A 2ZA3A 3PBYA 5DN1A 1R2SA 4KWVA 1WBHA 4LT9A 1IXPA 3P80A 4UTUA 4IPJA 3RLVA 1RQHA 4LRTA 5FI8A 4FXSA 4NJIA 4IMCA 4TX9A 2AGKA 1LM1A 2EAWA 2HSAA 3G0XA 3PULA 3O07A 2E6AA 3ABSA 1F6KA 2E6DA 1WV2A 3O16A 4CCDA 2PRMA 1WQ5A 5LNWA 3IIPA 4K37A 3SECA 2V2DA 2JKAA 4JTUA 5E0KA 3C56A 1FX6A 4PA8A 3IVUA 3W1QA 3W2LA 2ATMA 4XZ9A 4MJMA 4NVTA 5CZSA 1RV8A 3W7HA 2WV8A 4JS3A 4R53A 3CIWA 1DL3A 1FWRA 4UR8A 3W23A 3W22A 3MYPA 4YCPA 1LYXA 5T26A 3IIOA 1JVNA 4O18A 2O7QA 3G8RA 3GVGA 3E9AA 1XDMA 1ZY9A 2WKJA 3FYPA 1JR1A 1XCFA 3GDMA 4MLJA 3NQ6A 1KLYA 4ML9A 1TJPA 3NQFA 5AC6A 2EF9A 4GUIA 3EXTA 1PIIA 3BLIA 1PS9A 1QPOA 1XKYA 4HNVA 1WX0A 1QFEA 1X7FA 1I2OA 4GXMA 1FWTA 1W5QA 2FB3A 2OT1A 4I7UA 1AL8A 2FQIA 4HNNA 3LHZA 4DF0A 3MYOA 2G95A 3FJ6A 3NEVA 1Z42A 4Z1BA 1EPXA 4G1KA 3GR7A 1O95A 2YFNA 4A2SA 1K8ZA 3C2RA 4AXKA 2ISSA 3TAOA 2FPYA 1ZNNA 3WJZA 2GJLA 3ATZA 4RLIA 3UWWA 2H8ZA 3GLCA 5G2HA 5CSSA 1VCFA 3FKRA 3R2GA 1G4EA 2V2HA 3DHFA 3WJSA 3UXAA 1TREA 3ZS4A 4A2RA 4MPQA 2QKFA 1F5ZA 4M19A 2CLFA 5KINA 2C15A 4RV8A 3LLFA 3LRLA 4O11A 3QRHA 3TAKA 3H53A 4LS1A 2Y61A 3QMRA 2QDGA 4JY8A 4UFMA 3THAA 1OFRA 3FOKA 4PTNA 4ADSA 4A29A 1BTMA 1LZOA 2Y63A 2X1TA 5D2YA 1LRNA 4RZ6A 4OU1A 1WA3A 4EIVA 4LU0A 1FDYA 2DORA 3CLMA 2YX0A 4ZQCA 3IVTA 3LCHA 3LTSA 3W2KA 4FNPA 3A5VA 3CWOX 3QM3A 3SFKA 4QNEA 4DBEA 4FIRA 4FO4A 3NM3A 3P61A 3HG4A 4RX0A 2J88A 2Q3RA 3GDKA 4NX5A 3GK0A 5AC8A 3ZWTA 1YLVA 4O13A 3PS7A 2VFIA 4I9AA 3C4UA 3DFOA 4WOZA 1VQTA 5L9FA 2ZRWA 2G96A 3VCRA 5BOOA 4ZVJA 2QR6A 1NF7A 1AW1A 1OYAA 1ICSA 3S9YA 4OBTA 2VKZG 1K3UA 3A9IA 1TQJA 1I8JA 3W76A 3EB2A 2B7NA 3TJXA 4IMFA 3E96A 1UUMA 4FX6M 3IIZA 4O16A 3L0KA 3IIVA 2YXGA 3QQ1A 1QMLA 3NQGA 4RZ4A 1Z48A 3MP5A 4JIQA 3MW7A 4J9JA 2VELA 1TCDA 2GVGA 4A21A 4RXFA 4HPJA 3NQEA 3P62A 1FCVA 1F2JA 5DBUA 5FF7A 2OCZA 2OJPA 3SSJA 1DORA 3M7WA 4FIQA 4HSOA 5D2XA 4O1AA 2X16A 3TU9A 2P0OA 3UY8A 1BEUA 2A4AA 4IOTA 2Y6ZA 1KTCA 2QCEA 1F05A 3KVLA 4WJEA 2A1YA 5F1UA 1FCUA 2CLMA 1P0KA 1KV5A 4K36A 1DQWA 1H7OA 2GOUA 1QR7A 2GQ8A 2V8ZA 1QAPA 3BO9A 4M6QA 5G5IA 2GVLA 3UD6A 1LBFA 3TMQA 3RK8A 1L6WA 1O60A 3W7LA 2NV1A 2QUVA 3W7CA 3UWVA 3TSDA 3W74A 1DHPA 3NDOA 3WK2A 3UPWA 1EUNA 2J9YA 3S6DA 4ZZ9A 1GG1A 3LBCA 5F4SA 2Y89A 3S0CA 2RHGA 3OBKA 4K8HA 4UTKA 5H2ZA 4ZQPA 5KTLA 2QCNA 4TMBA 1N8FA 3QFEA 1TB3A 1YXCA 4O1DA 2Q3OA 3LGEA 3O8AA 1Q6LA 1VZWA 1OF8A 2W79A 3CWNA 3R12A 4O1CA 4NU7A 5C2XA 4LVFA 1TV5A 3S1WA 4UFKA 5D02A 1AW2A 1DJQA 3CQ0A 1A53A 4O12A 3DFQA 1XL9A 2C13A 3T55A 3U6WA 3MP4A 3EWYA 5D38A 1OG0A 5I3HA 3Q58A 3N19B 3QYQA 3STGA 2ISVA 4CQ8A 3QPYA 3TQ0A 3P8IA 1LTDA 3PSWA 4E0CA 5I3JA 1JCLA 1ME9A 3R8RA 5KSWA 4HNTA 2EPHA 3LX9A 4L4MA 1ME7A 3H55A 1EEPA 3LI1A 4K8EA 4CCEA 4K6AA 5HJLA 3B05A 2ZA2A 2BSLA 3C3NA 1GWJA 1A5BA 3DBPA 5K2ZA 1SSGA 1VLIA 4I7VA 5CZJA 4DEFA 5CPMA 1I2NA 1H7PA 1T0OA 3TMLA 3N73A 1A5CA 4WXZA 1TPC1 3P81A 2Y7EA 1K7EA 3W86A 1R47A 4NT0A 2WNNA 1B3OA 4GE8A 4QITA 4JXCA 4DO5A 1ICQA 3LHUA 4UMAA 4O8RA 2QCGA 2D73A 3L5AA 4O17A 4O1BA 3PSVA 3WK0A 3NG3A 4RXGA 2IQTA 3NM1A 2Y85A 3NL5A 3LHVA 3S8HA 2VEKA 3QF0A 4NUWA 5HUPA 4DXVA 2VFGA 1T99A 4RZ5A 4YCOA 3UZJA 3ANYA 4Y9AA 1CI1A 5CKSA 3SI9A 3R5EA 2RFGA 1ICPA 3HMJG 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3PM6 A;  3MJM A;  2VT0 A;  1UD4 A;  1HP4 A;  3HV8 A;  1XG3 A;  4V1X A;  5CPN A;  4BEQ A;  3PVF A;  1BG4 A;  1Z41 A;  4TOQ A;  1G7U A;  1UA7 A;  4IP4 A;  3N1A A;  5ABH A;  1CGW A;  4HT3 A;  1G6C A;  4OEC A;  1BXN A;  2PDF A;  2QJH A;  4Y8E A;  3LYE A;  4IQE A;  2JIW A;  4BQ2 A;  4HHM A;  4GZE A;  2ZZ4 A;  4N9E A;  1FWH C;  2PDY A;  3GUG A;  1CLK A;  1PWL A;  1I4N A;  4FOK A;  1TTJ A;  2Z28 A;  1VC4 A;  4WJX A;  1A3H A;  2PU1 A;  1P0E A;  4L9Z A;  1LF1 A;  3UJE A;  1SR9 A;  2NQJ A;  1Z6K A;  3MSD A;  5DCD A;  3TA9 A;  4AIU A;  2E4T A;  4QQU A;  4F66 A;  3S47 A;  5B7Z A;  4YTS A;  2WLZ A;  4S3E A;  1DWG M;  1S1R A;  4OV4 A;  4UTW C;  3ZT7 A;  2ACQ A;  1GNX A;  3AWO A;  4LAM A;  2J8F A;  4IPP A;  5CGQ A;  1GZ1 A;  1W0M A;  3C5Q A;  3V35 A;  3LHY A;  4JIP A;  1SQ7 A;  3EPO A;  5IHS A;  1TRD A;  1S38 A;  4FHA A;  1E5N A;  2JGY A;  4Z1Y A;  4U5I A;  4KET A;  3S1G A;  1UH3 A;  3OEX A;  1BXC A;  1UWU A;  5EPD A;  3MDU A;  3GKF A;  3QC3 A;  3VKJ A;  3W7R A;  4HBK A;  1FCQ A;  4BKN A;  3L21 A;  4HNC A; 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