3MHGA

Dihydroxyacetone phosphate carbanion intermediate in tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
TLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLEILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
publication title Structure of a class I tagatose-1,6-bisphosphate aldolase: investigation into an apparent loss of stereospecificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
total genus 127
structure length 323
sequence length 323
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mhgA00
2QCCA 3GDLA 5CPLA 4N4PA 1FY6A 4NX0A 1W5NA 4DPQA 1T0OA 3W1UA 1UB3A 4UTHA 1IXPA 3DI0A 1UASA 1VGAA 2NWSA 3LHUA 3LTPA 2WSYA 3NL3A 1F05A 3GLCA 1DBTA 1SZNA 1TV5A 2C15A 1RQEA 3NQMA 5FF0A 3JRKA 2CZEA 3O6YX 5DXXA 2TRSA 3C2OA 3MBFA 3O06A 1F5ZA 3HF3A 3TW6A 1KFEA 1UJPA 5G4WA 2C1HA 3G8EA 1TIMA 2ZZ2A 4XTIA 2V0TA 4XQ6A 4FIRA 2QDHA 1GG1A 3OHIA 4R33A 3IGSA 3IVUA 3OEXA 1DORA 3TC6A 4O18A 3UPBA 3PUEA 5I3IA 4LS2A 3UYCA 2C13A 1K7XA 4TU1A 2E6DA 1QOQA 5FESA 2ZZ3A 1ZCOA 4M6QA 4BWLC 3M5ZA 4FNTA 2VFGA 3G1VA 4OQVA 1XDMA 4JY9A 3NA8A 1JRBA 4JYFA 5AOUA 1A5SA 3ZWTA 4A22A 2DZUA 3ABOA 2FPYA 5BW6A 3HGJA 1DV7A 1HG3A 3G1XA 3O07A 3WK3A 5A8GA 1K8YA 1N7KA 2PRLA 5EMUA 4JIPA 1P5BA 3U2OA 2C16A 1J2WA 2A7NA 4MLRA 1W3IA 3GXNA 1ADOA 1M7PA 2NWRA 1G4SA 4O13A 1FXQA 5IBXC 3GDMA 3PBVA 3TAKA 1M6JA 2QCDB 2GUUA 3R89A 4CCCA 5G4EA 1YDVA 3PBWA 3SFKA 2JKPA 3CC1A 2NV2A 3GIYA 4HT3A 3B0UX 2A6NA 2I1OA 4DO5A 4HNUA 3W1AA 2PRMA 5D05A 4ZMGA 1TTPA 3SY5A 5HWMA 5AYZA 3SR7A 4Z0JA 2YYTA 1JCJA 1FWTA 1LRNA 4HNVA 5HULA 1H60A 4AHQA 4O50A 1XBVA 1XI3A 2C14A 3STGA 2W0UA 2B7QA 5I3FA 2GVJA 3G1YA 2HSAA 5KZDA 2B7PA 1KBIA 2HS8A 2VEMA 1MEWA 4ZQPA 1R2RA 1EWEA 5K2ZA 3L0GA 3PWAA 1PHWA 1RPXA 1WOBA 3O05A 3UWWA 4DXVA 2VENA 2QCLA 3GKAA 3B8DA 3W1NA 1TQJA 4NZJA 1B9BA 5HUOA 3NZRA 5HWJA 4NZFA 3A5FA 1L6WA 4NT0A 2P1FA 3LM7A 3L0NA 5F4WA 2Y7GA 1BTMA 2VFDA 5K4ZA 3M0ZA 3NNTA 2VC6A 5CPNA 3W7CA 3W2MA 1SUXA 1C9DA 1H7WA 1R47A 4MIMA 4DF0A 4N6EA 4NNCA 4R34A 4LV9A 4OE7A 4K8EA 4Q32A 4IMFA 2A85A 5F4XA 5HR7A 1JCNA 3STFA 1I2RA 1XKYA 1ICQA 4K38A 1FBAA 1H7XA 1K3UA 1GWJA 3W7JA 1JRCA 3O6CA 4H3DA 4HSNA 2ZRVA 1ICPA 7TIMA 4FB7A 5AYYA 2IQTA 2XN2A 3IRDA 5F2IA 1KTCA 3W22A 1RR2A 1LBFA 4FXSA 1AL7A 1NF0A 3MYOA 3G0UA 3A22A 1HTIA 3W7KA 1O94A 1VYRA 4QJ1A 5AC6A 3NM1A 3DFTA 3N19B 4Z08A 2QAFA 3WJWA 4A2RA 3W7EA 3LCWA 1TTJA 1XBYA 3L68A 4O1AA 1ZNNA 3W2LA 3CWOX 3G1HA 2R91A 2J6XA 3EEGA 2E5CA 1LORA 4MLJA 4OU1A 4M7SA 4P2VA 2VFFA 3W75A 1RQHA 3S5NA 2QKFA 2R14A 1EX5A 1LROA 2JKEA 2W79A 2QJGA 4A21A 1XM3A 2OZ0A 2GJNA 4HPJA 4DBEA 1AW5A 2BXVA 4U28A 4BF9A 4WD0A 3LCGA 4IUOA 4TO8A 4TMCA 1GVQA 4IXXA 3W2JA 5DN1A 2Z2UA 3TE9A 1Z42A 1VRDA 3BV4A 2WV8A 1F7BA 3I7RA 1X7FA 1JVNA 1K7FA 4RZ4A 5C2XA 5KINA 2VXNA 1GQNA 4JTIA 3LV6A 5D2TA 3HIJA 3S1UA 3E0IA 3EWYA 3W76A 1JQXA 2GVGA 1W3NA 3S8HA 2JK2A 4N9CA 4QQ3A 4DF1A 3W84A 3M47A 2FPTA 4FF7A 3SJ3A 3DAQA 2Z0IA 4N9DA 3F4NA 3HMJG 5H91A 4QITA 1G4EA 3KVMA 1ZHAA 4WOZA 3USBA 1WXJA 1JJKA 1UBSA 5K9CA 4XZ9A 3E49A 4RZ6A 3T78A 1QPQA 4YLWA 3GVGA 3MYPA 3TH6A 1M5WA 1VCGA 1V7YA 2G95A 1SSDA 4D2JA 1P0NA 1GVRA 1LRQA 3G3DA 2B7NA 3H54A 1QMLA 2GPTA 2Z1BA 4BR1A 5GVJA 1GYNA 3NG3A 5LNUA 3P84A 4UFHA 1O95A 2X16A 4NNAA 1YXDA 4Z1BA 2RDWA 3T40A 1OF8A 3C3NA 3HPSA 3BK0A 2ZRYA 3DFSA 3HQ1A 3NL6A 3K30A 1DQXA 2CLLA 4JS3A 1KFBA 3EX1A 4WY0A 1KM0A 8TIMA 2BLEA 1PHQA 1Q3NA 1G67A 3PBYA 2B4GA 1TRIA 2B7OA 2NX1A 3E02A 2FPVA 1ZAIA 1A50A 1WA3A 2Y70A 3FYPA 3P5YA 4JICA 1ZY9A 5C6MA 2DZVA 3FYOA 3GR7A 2A1YA 1LBMA 3DFPA 5AN7A 2CLEA 3M9YA 3F03K 5TIMA 2GVLA 3NL2A 4KFNA 5AC8A 5FF4A 1VYSX 3NEVA 3W9ZA 4DELA 1LDCA 4Y6GA 3O15A 1WBJA 4UUIA 1H5YA 3BLEA 1QNVA 1RQBA 1F2JA 1XXXA 1KM5A 3LXCA 4LV4A 4N2YA 3M41A 1HO1A 4JGDA 3IV3A 2CLIA 3LGEA 4MY8A 2VELA 3TX9A 5HJLA 2AGKA 4JR5A 4OGZA 3ZR4A 5F1VA 1VHNA 3LHWA 4GUFA 3ELFA 4ORMA 2RKXA 1O4UA 3NM3A 4O1BA 3KOFA 3W1XA 3C2VA 3NXFA 2CLMA 1T96A 3I65A 3PR2A 2YW4A 4AMAA 2QCDA 2J9XA 2ZRZA 1XUUA 3NQ2A 3UY7A 4LVDA 5AC7A 5KTLA 5K7JA 1VLWA 4I7VA 2BSLA 1A53A 4FX6M 2Y62A 3Q58A 3W23A 3W7HA 3Q37A 2E68A 1AW1A 3KRZA 4MVAA 4WY0F 2H90A 3GYEA 1OJXA 4UCGA 5G2HA 5KZEA 4LC6A 1OX6A 3GNDA 3IEBA 2ZTKA 3RNDA 3W2KA 3V1PA 4X2RA 2WQPA 3PUDA 4RCXA 4AF0A 2TYSA 2ZA2A 1DL3A 5FF2A 2Y85A 4I9AA 1G4PA 3KVKA 4XBKA 5D30A 4HPXA 1QPOA 2W6RA 3FOKA 2ZZ7A 3LCFA 5E93A 4NU7A 3DFQA 1KBJA 2WOQA 3WK0A 1MZHA 2RDUA 3P62A 3NVTA 4K36A 2CLOA 2VOMA 2CZDA 1OABA 4P61A 1R2SA 3EXRA 4O12A 3NAVA 5CPMA 1R30A 4H4IA 1AMKA 2GQ8A 4K7YA 3PB0A 4O4VA 3H53A 2ABBA 4RLIA 1NSJA 4N02A 2V2CA 1BWLA 3ABRA 4JTFA 3LTSA 4JXCA 1LM1A 4RK8A 1SO4A 1PE1A 4MUZA 1FXPA 4IPJA 2OX1A 1SO6A 3G1SA 2CZ5A 5CZSA 3FEMA 3ATYA 4GUIA 3W1PA 1P0KA 1YYAA 3LBCA 5U7SA 2VFIA 2RHGA 2YFOA 1TPFA 5EBUA 4UFKA 2GJLA 1ZFJA 4E0CA 2Y89A 2J27A 4TX9A 1GJPA 1F6PA 4NUWA 4O11A 1IXNA 3SGUA 4UNKA 4EF8A 2ZDRA 1K8ZA 4EVZA 3R13A 1W5QA 1VQTA 4LY8A 4MY1A 5J5RA 1Z44A 1H51A 3W7MA 1WBHA 3CWNA 4POCA 2VEKA 4GBUA 4IMGA 2ZA1A 1GOXA 4O1CA 1LLZA 3ABQA 3FFSA 1L6YA 4LS0A 3W1MA 4ZZ9A 2HMCA 3W1TA 3QF0A 3DHFA 3NQGA 4FX7A 2I9EA 2V5LA 2EAWA 4WQ6A 4E38A 3L66A 3KVLA 3MHUA 3TFCA 2NUXA 3P61A 4O57A 2QCGA 3LHTA 3H55A 4PC8A 3LRLA 4K37A 5AHLA 1UCWA 2DJLA 5LGXA 3JR2A 3M44A 4OWGA 4IMEA 3SGZA 4GXMA 3QYQA 1JUBA 3W7RA 1AW2A 3BLFA 4HNNA 3GZ3A 3MP3A 1SR9A 2QDGA 4X9SA 3BVJA 5D32A 2Q8LA 3SECA 2NUYA 1KFLA 2RDTA 4DO4A 1TTQA 3W86A 1ZAJA 2Y63A 5G2IA 4MFDA 1FX6A 4PFMA 1JCXA 1H1ZA 3OIXA 3PS7A 5TQLA 1LOLA 1W5PA 3UWZA 4O10A 3QH2A 3TXVA 5KMYA 3NPVA 1IF2A 1VZWA 3G3MA 1KM3A 1LOQA 3W1QA 4XBSA 1GYLA 4UR8A 4UFMA 4IGHA 4UMCA 3QJAA 3LOTA 4EWND 1TCDA 4FXRA 4UTWC 3TFXA 2FTPA 4ALDA 2ZTJA 3LXBA 2V81A 1FWRA 1FDJA 2ISSA 2V2DA 1H61A 3NYZA 3EWZA 3N34A 3W7DA 1QCWA 3W83A 3IIZA 3ATZA 3MBDA 1TO3A 3TNOA 2I14A 3QW3A 4B5NA 5KITA 5DLCA 3MI6A 5AHEA 2X1SA 4A3UA 4LUJA 1OK4A 3NPWA 2NXIA 2EPHA 3BGJA 3TQ0A 2NZLA 2A21A 1VLIA 1FCUA 1XBZA 2C6QA 3SW6A 3PG8A 4IJBA 3G1AA 1G6CA 3S5OA 1TV7A 3QPYA 3GK0A 2DZTA 2C19A 4FNSA 4R7JA 5I3KA 2H3DA 5CSRA 2NXHA 4YCOA 2J9ZA 2HS6A 3YPIA 3O1NA 3LCIA 3WFAA 1KM6A 6ALDA 4O17A 2OT1A 3NQDA 2DZXA 4BK9A 4UTTA 5HQEA 2Y61A 2DU2A 1X8FA 3EB2A 3A5VA 1JULA 4N6FA 1FWSA 1G7UA 1KTBA 1PS9A 4O8RA 3NPUA 4JY8A 3O6DA 1XCFA 1ZALA 4X3ZA 1DHPA 3KRSA 5EYWA 4K6AA 5G5IA 1PCKA 3O63A 3MI2A 2ZZ5A 1GPWA 1R2TA 2ALDA 4UNLA 5G1TA 4LRTA 3STCA 1XL9A 3LV5A 1I2OA 4UFIA 1OYBA 2YZRA 4Q33A 3HG5A 2YCEA 4JTKA 5I3JA 3P8JA 1QR7A 3UD6A 4O14A 3UQNA 3RK8A 3P82A 4JNMA 1Z41A 3R2GA 5BNKA 2BTMA 1EA0A 4LW7A 1ICSA 3EWWA 1G4TA 3U8GA 1EWDA 4Q4KA 1YPFA 3MO7A 3DU0A 1ML1A 2E6YA 3NOEA 3MP4A 1CI1A 5L6UA 3EX3A 3UXDA 1W1ZA 2QF7A 4XWUA 3SZ8A 3PULA 2OT0A 1PCWA 1WAUA 3S6DA 1KA9F 4LS1A 3U6WA 4O16A 3W7QA 1EEPA 3L67A 3TMQA 3VE9A 4YMZA 2V5BA 3W2NA 5AHFA 3ABSA 5FI8A 2H3BA 3QMRA 3LI1A 2VFHA 4HSOA 4CQ9A 4JTJA 3E12A 1TB3A 2OMAA 2R94A 4YCPA 1VJIA 5F2MA 1TYGA 3NQEA 2A5HA 2JGYA 1JCMP 4IQLA 5DCEA 3PBUA 3L5AA 3LHZA 3LRMA 1OFQA 1GVSA 3JS3A 2FB3A 3IIOA 3WJZA 3BW2A 5KZMA 3L2IA 1H7PA 1S5TA 1OG0A 3TU9A 3P5ZA 5D37A 5AHNA 3NZ1A 3NGJA 3C4UA 2C0AA 3TW7A 4M7TA 2Q3RA 3BPWA 3W74A 2JGQA 4PEKA 2E77A 5FF7A 3OBKA 5FEPA 5D09A 1TPUA 3IVTA 3EX2A 3F4WA 3QQ0A 3NQFA 5U4NA 2E6FA 3BG3A 3DFOA 3TCEA 5LSMA 3LERA 1QWGA 3LX9A 3C52A 3DKLA 4UC5A 5CG7A 3F1QA 1PL9A 3LLFA 3VE7A 2Y6ZA 4FEZA 3S1VA 3W7PA 4JTGA 1F73A 2AAMA 2FB2A 2E1DA 3CLMA 4JTSA 4AHOA 5D02A 3HGRA 4QNWA 1F76A 1UUOA 2G96A 1C29A 2NLIA 4HIBA 5HUPA 3EXSA 4QAIA 4HN4A 1DJNA 1Z48A 1D3GA 4M6PA 4BI7A 2ZYFA 2YGYA 3HGOA 1I8JA 4UMAA 4MZ1A 2FIQA 3LDVA 3M5YA 3EWBX 4NQ1A 2JBMA 3FJLA 3FKKA 5BOOA 3HG4A 3PUOA 3WJYA 4Y8FA 1DVJA 5LKYA 5LZLA 3HBLA 4UR7A 2F7FA 2Z6IA 4JTHA 5D2XA 4C1KA 5D33A 4PL1A 3HPXA 2C18A 3TA6A 1XUZA 5D2VA 5CSSA 3N3MA 2DZPA 3EXTA 4WUIA 2RFGA 3VI2A 1YTEA 1KW1A 1O5KA 5KSWA 1TSIA 3M5VA 3IIPA 3GXPA 3Q2DA 5LHFA 4WXYA 1NAL1 4H6KA 4UTIA 3EX4A 5EA9A 2QCHA 1KTNA 3MMTA 4CQAA 3UY8A 1B4EA 5AB3A 4GUJA 3GR8A 3CQ0A 2JKAA 3T44A 4WZHA 3GDKA 6TIMA 1EP3A 1O60A 2QR6A 4LT9A 4RXFA 1OK6A 1RVGA 2QCFA 5LNSA 2E6AA 3FJ6A 3HG2A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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