3MHGA

Dihydroxyacetone phosphate carbanion intermediate in tagatose-1,6-bisphosphate aldolase from streptococcus pyogenes
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
323
structure length
323
Chain Sequence
TLTENKRKSMEKLSVDGVISALAFDQRGALKRMMAQHQTKEPTVEQIEELKSLVSEELTPFASSILLDPEYGLPASRVRSEEAGLLLAYEKTGYDATTTSRLPDCLDVWSAKRIKEAGAEAVKFLLYYDIDGDQDVNEQKKAYIERIGSECRAEDIPFYLEILTYDEKIADNASPEFAKVKAHKVNEAMKVFSKERFGVDVLKVEVPVNMKFVEGFADGEVLFTKEEAAQAFRDQEASTDLPYIYLSAGVSAKLFQDTLVFAAESGAKFNGVLCGRATWAGSVKVYIEEGPQAAREWLRTEGFKNIDELNKVLDKTASPWTEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
molecule keywords Tagatose 1,6-diphosphate aldolase 2
publication title Structure of a class I tagatose-1,6-bisphosphate aldolase: investigation into an apparent loss of stereospecificity.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pyogenes serotype m1
total genus 127
structure length 323
sequence length 323
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.1.2.40: Tagatose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2010-04-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01791 DeoC DeoC/LacD family aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mhgA00
1Z41A 1JJKA 3C2OA 1OABA 5DY2A 3VFLA 3I7QA 1ZJIA 1EEPA 5G4WA 4JXCA 4ZQOA 3VE9A 3GKAA 3MHFA 3W1TA 1TPWA 1ME7A 3C6CA 3G1XA 1OVDA 3OIXA 4JTSA 2CLKA 3QZEA 1QCWA 3P80A 3T4CA 3W74A 1UUMA 4PODA 3VCRA 3N2MA 1KM3A 4O13A 2NV2A 1TO3A 4UMBA 3W3OA 2QR6A 3FA5A 5CZ0A 4UTMA 1WA3A 5AB3A 4FEZA 3IIXA 4PA8A 2PURA 4GXMA 2QCGA 1UBSA 3G1HA 2E77A 4H4IA 1J4EA 1NEYA 5AN7A 2Z6JA 3DFOA 1OFDA 4G1KA 1VQTA 3OHIA 5EMUA 4JIPA 2AGKA 1GTEA 1WAUA 4WUIA 3NQ2A 1JUKA 3DU0A 3DGRA 1TTJA 1ICQA 1M5WA 3IEBA 1X6UA 1LBLA 4LWWA 4NVTA 1XBZA 3TFXA 3QSRA 3UWWA 1G67A 4ZQPA 1GWJA 2O7SA 5DCBA 2ABAA 1PE1A 5CPNA 3V1PA 3C2FA 3PBYA 3KX6A 5HMSA 1H51A 3W1PA 3MYPA 2QDHA 2GPTA 1JR1A 1YYAA 4JTHA 5DELA 2RH9A 1HTIA 2DZTA 4O10A 4ORMA 2J9ZA 3JRKA 2ZZ7A 1KM5A 4WY0B 3OVQA 4HT3A 1KV5A 1OFBA 2ZRVA 5TBOA 4LRSA 1FY6A 1IXOA 3GK0A 3MI6A 1VR6A 5AC8A 5C54A 1VPXA 3LX9A 1AW2A 5K4ZA 3STGA 1EB3A 1VYSX 5HUOA 2DZSA 3K30A 4ML9A 4QM1A 3EKLA 3F03K 5DXXA 4O12A 3W7GA 3NZ1A 2WNQA 5IBXC 3UWUA 3QFEA 5D05A 5AC7A 1SFJA 4O4VA 4NXKA 2NV1A 4JTUA 3W86A 4JTKA 1PV8A 1FDYA 2NUXA 1LDCA 3NAVA 5I3HA 3QQ0A 2Y6ZA 3C56A 2G95A 2O7QA 4RX0A 3INPA 1HO4A 1TRDA 5C55A 3LTPA 1GYLA 5FEWA 1SSGA 2CLEA 3T78A 4UTWC 4BK9A 2WSRA 1OX6A 3PWAA 3MP3A 2VFEA 1G4PA 3W1MA 1FWRA 1P0NA 1XBVA 3ZWTA 4POCA 3HPXA 4ONVA 5F1UA 1OF6A 4O54A 4JYDA 4K7YA 1LOSA 5KZMA 1TREA 2GUUA 4RR4A 1EP3A 5F4XA 1QWGA 3TROA 4E2DA 3TX9A 1I8JA 4MFDA 3S5ZA 1I2PA 4N4QA 3S1XA 1YDOA 1KBJA 1TB3A 1AG1O 1MO0A 3TAOA 1G7UA 2ATMA 3STFA 3W1UA 7TIMA 4X9SA 3O63A 3WK3A 1DJNA 1GQNA 1K03A 3W2LA 3NPXA 4YL2A 3VI2A 1W31A 3PBUA 1GYNA 4WQ6A 3S1WA 1S3HA 1JCNA 3C52A 3TSDA 3PG8A 4AF0A 1PCKA 3O8AA 2R94A 1MXSA 4GRSA 4DXVA 1U83A 3CEPA 3QF0A 4UUIA 3NQCA 3UZ5A 1EA0A 3GLCA 3I6RA 3C2VA 4NJHA 1T99A 2Y7GA 1SO6A 3AO0A 4Z1BA 4LS0A 3W7QA 3FJ6A 1OYCA 5K9CA 1O95A 1O5XA 2ZA3A 1H63A 1RQBA 4Z1DA 4XTDA 3VNDA 4DELA 1I2QA 1ZHAA 3Q2DA 3VE7A 1LRNA 2RDWA 5K7JA 3LXCA 1VLWA 1WBHA 3BARA 4NJGA 2A6NA 3S5YA 5I3JA 2UV8G 2QF7A 5LHFA 4JTFA 3C8FA 3STCA 3TAKA 3FFSA 2HMCA 3R12A 3TC7A 5EA9A 5CGQA 4C1KA 1VCGA 1XBXA 4O1DA 3TH6A 1F5ZA 1TV5A 5D38A 2ZTKA 3PUEA 1JCMP 5KITA 3HBLA 4CQ8A 3TQVA 1G4EA 4M6VA 1J5TA 1LBFA 4QIUA 4DBEA 4CNOA 5LHEA 4Y90A 4PH6A 2AQWA 4IOTA 2Z2UA 1R2RA 1FCBA 5K4XA 4CLMA 3W1AA 2TRSA 2A7NA 4B5NA 5CSRA 5CPMA 2FQIA 4FXRA 1OFOA 3LXAA 4HNTA 1ZAIA 3O16A 4WOZA 3MBDA 1WDWA 3NQGA 3P82A 1RD5A 1ZENA 1Z48A 3NEVA 4IUOA 1XUUA 1QOPA 4TU1A 3HG4A 4A21A 1JCLA 2G97A 4OGZA 5KINA 2DP3A 2GVJA 4AEOA 1NF7A 2F84A 4MIMA 4QNWA 5F1VA 1LZOA 1S5WA 2X1UA 3LDVA 1GVFA 1AL7A 4K38A 3DHFA 1YADA 1PCWA 3DAQA 1VZWA 4WOQA 2V2HA 1SO4A 3PY2A 3IVTA 1XC4A 3STEA 4Y96A 5AHIA 3R5EA 2TYSA 3SFKA 3SIZA 3W7NA 3W71A 1YLVA 3LOTA 2B7PA 3NXFA 4U4MA 1VH7A 4E2BA 4AHOA 2BZNA 4LVBA 2BX7A 1KLZA 3N14A 5HUPA 2J24A 3P67A 3LHVA 2FPYA 4NQ1A 2QAFA 3W7RA 3UWYA 1LM1A 4FX6M 1UJPA 1DJQA 3UXAA 2ATSA 3QSTA 4MY8A 4RZ6A 2E5BA 4O18A 1QPRA 1SPQA 4NJJA 1L6WA 4UFIA 2PC4A 1A5AA 5H91A 3DFNA 4AHPA 1EWEA 3A23A 3NM3A 5G1YA 5EKYA 4KFPA 1GT8A 4OHQA 3TNOA 1FCUA 3M43A 1JCYA 3DI1A 1GOXA 2FDSA 2VOMA 4MJZA 4N4PA 1KTBA 4P61A 1OK4A 1K7EA 2H8XA 1QR7A 3G1VA 1MEIA 2JGYA 1BKSA 5L9FA 1CI1A 4U28A 5HR7A 2NX9A 5AC6A 5F4WA 3IIOA 5D2VA 3PR2A 2QCEA 4JTEA 5C2XA 1KM1A 2ZRUA 2OX1A 3W73A 1LROA 4X2RA 1H7NA 3EX2A 4PL2A 2FB2A 4EOUA 1G69A 1KBIA 4MLRA 4MVAA 5J5DA 1LRQA 4QAIA 1Q6LA 3NQ8A 5IM51 1DVJA 2YPIA 3WJWA 1HL2A 3MW7A 4ADTA 4JYEA 2A4AA 3LB0A 3OA3A 4JD4A 2EF9A 3GKFA 2JBMA 1XBYA 1TRIA 4ZL1A 3HGSA 1YPIA 3HG2A 1TCDA 3ABRA 3BLIA 3GDKA 3WK2A 2XN2A 4CQ9A 2A2IA 3MI2A 1EPXA 1KW1A 4NT0A 5K9XA 3P5ZA 1U5JA 3P8IA 4DF1A 3CM4A 3GAKA 1BWLA 1W3NA 4UTTC 1VJIA 1TPEA 5T26A 3IIZA 1JRCA 3B06A 4CCDA 4RJEA 3FYPA 4MZYA 4K8EA 5HNRA 2BXVA 2YGYA 1N7KA 4N9EA 2JKAA 1KFCA 4JTIA 1Q6RA 1LBMA 4PL1A 4IJBA 1AK5A 2HTMA 2CZFA 1P0KA 1TPB1 2QCDB 3IGXA 1OFQA 4JEQA 1H7RA 5FEZA 1OJXA 3P5YA 2NWRA 3HIJA 2J9XA 2QJGA 3W1QA 5CZJA 5A5WA 3R13A 1K8ZA 4L4MA 2ZFAA 1I45A 3UYCA 3EWBX 3LTSA 3EX4A 2DZVA 1A5SA 2IQTA 2QDGA 4R7JA 4LC6A 4HHPA 1HG3A 1MZHA 3W7LA 1GZGA 4NZFA 4AF0B 3KRZA 2ZZ5A 2VKZG 3N9SA 3ATYA 3IIVA 4JGDA 3NL3A 4Z0JA 2ZRWA 3HPSA 3EXRA 5E93A 5DBTA 2C19A 2DZUA 2YDAA 3W1XA 4R53A 3W7KA 1I4NA 2ZA1A 3SI9A 4BR1A 2I1OA 1LLZA 4GNJA 2ZZ1A 4OBTA 3SECA 2YW4A 1D3HA 3DZ1A 2J9YA 2PRHA 5HQEA 1DORA 5F4SA 4LUJA 3W7IA 3MMTA 3SW6A 3TFCA 4FIRA 4MUZA 4LVDA 1SW7A 1V5XA 4FF7A 4O50A 4R34A 2QCHA 1V7YA 5DY3A 3E02A 4LC8A 1AL8A 2QKFA 3A21A 1B3OA 1SZFA 1UCWA 1AW1A 2E68A 2E6FA 2V5LA 4DF2A 3MP5A 2H3BA 3M0ZA 2WO5A 3EWWA 3R2GA 3L0NA 2G96A 4OT7A 3NQAA 4YMZA 2ZBTA 4IPJA 1OFPA 3W83A 4LV4A 3S9YA 4ADUA 3RFAA 5D03A 1IXQA 2RDUA 2W6RA 4EF8A 2OZ0A 5FF7A 3TXVA 5FI8A 2FJKA 3QW3A 3RNDA 3TE9A 1YDVA 1GPWA 4DPQA 1IXNA 1ZY9A 4IMCA 4I9AA 4LVAA 4LVFA 1QDSA 3HGJA 4ORIA 1W5QA 3G3MA 3QEZA 3W7MA 3SGUA 3P81A 3C3NA 5AYXA 1QFEA 1KM4A 3W84A 3S8HA 3LCWA 4PC8A 1W54A 4LVGA 4M6QA 3B0UX 1L6YA 3C2EA 1TSIA 4NU7A 5G5IA 3TU9A 4LT9A 3W9ZA 4N6FA 4EVZA 3L68A 4ZVJA 2A5HA 1C8VA 2OT1A 1FCVA 4BI5A 2ISWA 4WD0A 4BWLA 2B7OA 1H7OA 1LOQA 4FXSA 5D2WA 1QO2A 5EPDA 1OYBA 4E0CA 3QW4B 3S0CA 2V5BA 3RF9A 3L65A 3TW7A 1F2JA 4JX4A 4FNRA 1TPC1 4RZ5A 1X1OA 1QNVA 3W2NA 5DCDA 4UNKA 1TTQA 2BLEA 5FEPA 2ZRXA 1KM0A 2VXNA 3B4UA 2QCNA 4AAJA 2D73A 3LCIA 3A5VA 3QRHA 3P61A 2Y62A 3DFTA 3G0XA 2YR1A 5KZDA 2H8ZA 2PCQA 3GR7A 2ZDRA 1BEUA 4JICA 2XN1A 3T55A 4FIQA 1TTPA 4DF0A 3TA6A 4LY8A 4GWEA 3BK0A 3EX6A 1B4KA 3EWUA 2NUWA 1F6KA 4DPPA 3D0CA 2X1SA 5AHFA 4AVFA 1FDJA 3HMJG 4C1LA 1VHNA 2GQ9A 2ZRYA 1JUEA 3QPZA 3NDOA 1G4SA 1DBTA 1TPVA 4M5PA 2J27A 3HG3A 4UTLA 3GAYA 1ME8A 1GTHA 3QYQA 4N9CA 4NXSA 2ZA2A 1QPQA 2CLLA 1S5VA 1VCVA 3GNNA 1IIHA 1FWWA 3U8GA 4AHQA 1KFEA 3G22A 3C2RA 2J6XA 3LCFA 1KFJA 3GXPA 5G2IA 2WNNA 3NQ7A 2B4GA 3LI0A 3FEMA 3GXTA 3KFTA 3A5FA 4IMGA 3TQ0A 1SO3A 2ZYFA 4TMBA 1ME9A 3TKFA 1P5BA 4RXGA 4PTNA 3W7DA 5HULA 1ADOA 4IX0A 2QCDA 3UXDA 5K2ZA 1SUXA 3HJZA 3PS7A 3ZS4A 4FHAA 3ANYA 2QCCA 3EX3A 1D3GA 3WK0A 4UNLA 3SJ3A 2A7PA 2Q8ZA 2Y70A 4HN4A 1IIGA 1F74A 4JN6A 4BI6A 2JGQA 4H6KA 5F2IA 5DN1A 4DQWA 2VFDA 3C61A 1WQ5A 4IMFA 2OCZA 4LTSA 4DEFA 1K7FA 4BI7A 2LLEA 4QITA 4CQAA 4HNVA 4MZ1A 2ZCGA 3CEUA 1O60A 3PVFA 3PG9A 2V30A 1L9WA 5BOOA 1ZNNA 2C14A 3Q37A 1WOAA 1E51A 3A24A 2EAWA 5AHNA 1OFAA 5AOUA 2CLOA 3PBWA 2RDTA 3AJXA 3MYOA 2YW3A 1FQ0A 5AYZA 4RK8A 5EYWA 2P10A 4TMCA 3DKJA 4IWWA 3MWAA 1O4UA 3PULA 4UMCA 1ML1A 2ZQ0A 3GDMA 3O6YX 3G1FA 1FWNA 1TQJA 3HGOA 1L6SA 3LLDA 2NUYA 2I14A 4ZQNA 3IIPA 3W88A 4FNSA 1X7FA 5CZTA 1W56A 1F76A 3TXZA 4CCEA 3A9IA 3GYEA 4WJEA 4HSOA 3QM3A 1SFLA 1N8FA 4FX8A 3M5VA 3FKRA 4JTLA 2VEMA 3LCXA 1VCFA 2V0TA 3C0JA 2J88A 1T96A 3G24A 3CC1A 1KFLA 3QPYA 1GJPA 3PF3A 5BMXA 3ABQA 4LU0A 2CLIA 4TIMA 3PB0A 3Q94A 2Y7EA 1H61A 2X30A 4O17A 4UMAA 2P0OA 1ONRA 3TK7A 3LCHA 3L0GA 5DXYA 5I3IA 2HS6A 3GXNA 4O28A 1M7PA 3BW3A 1YTEA 3PUDA 4O57A 1NFBA 5LNWA 3GR8A 1L2UA 3M7WA 1JCXA 3E96A 3TV8A 4QJ1A 1H7PA 3FLUA 3G1AA 2DU2A 1RZMA 1FX6A 2NXIA 3LERA 1Q3NA 2PE4A 2ISVA 2ZZ4A 3P84A 3GDRA 4D2JA 4N02A 1EUAA 5E0KA 1LCOA 3FIGA 2DJXA 1R46A 1NF0A 4UTJA 3IVUA 3LXBA 3BG9A 3DH7A 3M5ZA 3ABOA 3B0VC 2ISSA 3G18A 4DO4A 4MKNA 3ATZA 4ADSA 1OX5A 1KTNA 4ZMGA 3W7CA 3USBA 5D02A 2CLMA 4GUFA 2VENA 2KZHA 3TC6A 2GVGA 2GVLA 4FB7A 3W70A 1W5PA 1M6JA 1A5CA 2OJPA 1W5OA 2YCEA 4XBKA 3UPWA 3IRDA 3DENA 1QOQA 2WOQA 1VLIA 2RFGA 1KLYA 8TIMA 4MPQA 3S1VA 2FLIA 5KSWA 3OEXA 3L5AA 3LLFA 3QMTA 4WZHA 3PC0A 3SSJA 1F73A 3NVTA 4DO5A 5LKYA 3LHYA 3NPWA 2FIQA 3WJSA 1VC4A 2VC6A 3LRLA 1IXPA 4GC4A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4XAF A;  3CL7 A;  4GIR A;  3AS2 A;  4PYS A;  2ZXA A;  2J4G A;  4ZQO A;  4LAU A;  2XSA A;  1NAR A;  1ME7 A;  3TTY A;  3WL0 A;  5B7Z A;  3QZE A;  2G41 A;  3T4C A;  4YYC A;  3VCR A;  4LAZ A;  3N2M A;  1KM3 A;  3WBX A;  3VOH A;  2CYG A;  5CSU A;  4S3E A;  1UR3 M;  1TO3 A;  3LSB A;  4UMB A;  3FA5 A;  1WA3 A;  4FEZ A;  4HCD A;  3IIX A;  2PUR A;  2QCG A;  1F61 A;  1WE5 A;  3WMB A;  4LCS A;  3UJS A;  3SCN A;  2W92 A;  5BXR A;  5F7U A;  2XFR A;  3DFO A;  2GSE A;  5EMU A;  1LT7 A;  4JIP A;  2WCA A;  1GTE A;  4YVX A;  1JD7 A;  3W01 A;  4RDW A;  3WLH A;  2GGE A;  5C9W A;  1LG2 A;  1ICQ A;  1M5W A;  1UZ1 A;  5T91 A;  4TV5 A;  1X38 A;  4NVT A;  1PSC A;  1DED A;  3W26 A;  4JPG A;  5H8M A;  4B3L A;  2O7S A;  2ABA A;  4W85 A;  3S3G A;  4YJ5 A;  1UBP C;  1NP2 A;  1CCW B;  5HMS A;  3AXX A;  3W1P A;  2PDY A;  4YHG A;  2QDH A;  1YYA A;  5DEL A;  3UF9 A;  1E6S M;  3GFX A;  3TTE A;  4S23 A;  4GXP A;  2C91 A;  4HT3 A;  4CN1 A;  1NOF A;  5TBO A;  3AOF A;  4H8U A;  2FDM A;  1IXO A;  3A3W A;  2QV4 A;  3K1D A;  5C9Z A; 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