5CZSA

Neisseria meningitidis 3 dexy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase glu98ala variant regulated
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
346
structure length
344
Chain Sequence
HYPTDDIKIKEVKELLPPIAHLYELPISKEASGLVHRTRQEISDLVHGRDKRLLVIIGPCSIHDPKAALEYAERLLKLRKQYENELLIVMRVYFAKPRVGWKGLINDPHLDGTFDINFGLRQARSLLLSLNNMGMPASTEFLDMITPQYYADLISWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGNLKIAIDAIGAASHSHHFLSVTKAGHSAIVHTGGNPDCHVILRGGKEPNYDAEHVSEAAEQLRAAGVTDKLMIDCSHANSRKDYTRQMEVAQDIAAQLEQDGGNIMGVMVESHLVEGRQDKPEVYGKSITDACIGWGATEELLALLAGANKKRMAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Neisseria meningitidis 3 dexy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase Glu98Ala variant at 2.42 Angstroms resolution
rcsb
molecule tags Transferase
source organism Neisseria meningitidis serogroup b (strain mc58)
molecule keywords Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase
total genus 127
structure length 344
sequence length 346
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2015-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5czsA00
2VC6A 1XBXA 3QMRA 1UB3A 2B7PA 4UMBA 2GUUA 3P8JA 1B4KA 3GYEA 1AMKA 3ABRA 1VH7A 4DQWA 4UTTA 3DH7A 5F2IA 1WXJA 3W1QA 1FWNA 1QWGA 2NV2A 1JUKA 3ABQA 4DBDA 1TREA 3G1YA 3PR2A 2V2CA 3G0XA 3EX2A 3OVQA 4HHPA 4O19A 3UQNA 3IVSA 1YYAA 3BLFA 5FF3A 1SO5A 4RZ5A 1TPUA 1OYCA 3RF9A 5FF7A 3NQVA 1VCGA 2TPSA 3HG5A 3GXPA 4K6AA 3SECA 3GDLA 4B5NA 4UNKA 3DFTA 3W1NA 3ZR4A 2FTPA 3NDOA 2DZUA 1OK6A 1TV8A 1FDYA 3CPRA 1ME7A 4YL2A 3FJLA 5I3IA 1S3HA 2CLLA 1XBZA 4NVTA 7TIMA 3FIGA 2WKJA 3VE7A 1K02A 4LW7A 1HO1A 5J5RA 3LCFA 2QUVA 1DVJA 3WK2A 4J9JA 4QIUA 5I3KA 2NWRA 1UUOA 3FKKA 4XQ6A 5BMWA 3SGUA 5GVJA 2V5BA 4CNOA 3UPBA 2CU0A 1KA9F 4K38A 2QCNA 4UTLA 4GUFA 5AN7A 4IMCA 2Y61A 2ALDA 1VQTA 4YLWA 1JUBA 2Y7EA 3VKJA 4WX2A 4RKAA 1O4UA 4KWVA 1OYAA 1PHWA 5TIMA 2FJKA 2C1HA 1GTHA 4RR4A 3LHYA 3G0SA 1WDWA 3RLVA 3N3MA 1YTEA 1N8FA 3HGSA 4BR1A 2Q8ZA 3ATZA 3W2LA 5I3HA 1LP6A 4LTSA 2EF9A 4EWND 5D2YA 3W23A 3WJWA 3DFNA 3CC1A 3C2OA 3HIJA 1H63A 3P5ZA 1W37A 1TPFA 1GQNA 2G95A 3IIOA 3LCXA 2P10A 1TTJA 3W7EA 3OHIA 1EIXA 1FCUA 5DCDA 5CPNA 3E02A 4IX0A 3SSJA 3TC7A 1TPB1 4UTJA 3LXAA 5BRBA 2OCZA 5HR7A 5FEZA 3PVFA 2VFDA 3Q58A 4R7JA 4W9TA 4JYFA 2QEZA 3E96A 3KVLA 3P81A 2ZFAA 3IIXA 2JGYA 2CZFA 1PV8A 1EEPA 5G5IA 2YCEA 1DJQA 1FXPA 3M5VA 3S0CA 2H3DA 3O1NA 3W1UA 3B05A 4Z1BA 1W5PA 1G4SA 3M0ZA 5KZEA 2NUWA 3VI2A 1ZAJA 3RNDA 3W1PA 3INPA 4N02A 1QO5A 4ZQCA 3NO5A 1NVMA 3DHFA 4JN6A 4TU1A 2ZQ0A 3UPWA 3M44A 2Y89A 3W7PA 1BEUA 2A6LA 4QAIA 4OV9A 3EWBX 1QCWA 4GBUA 2V2DA 2QUTA 3KX6A 3UZ5A 4DF2A 3G24A 4BI5A 1KBJA 2TRSA 5D2WA 3NYZA 3G8EA 2GJLA 4MLJA 3QC3A 4O1AA 1R46A 1F05A 4GXMA 3HPZA 5G4EA 4NXSA 3RU6A 4YCOA 4IMEA 3W1MA 4JX5A 1HTIA 2HMCA 5FF4A 1B9BA 1OFBA 4IMFA 4JS3A 2BWGA 4TIMA 1KV5A 2PRLA 1QFEA 3IGSA 3PUDA 3GZ3A 3QSTA 3W2JA 4JTTA 4H4IA 1RVGA 2NXGA 3QPZA 1BKSA 1G69A 3MI6A 3GLCA 4FNRA 4WY0F 4X22A 5LNRA 3W07A 3HG3A 1MEIA 4CQ8A 4XKYA 4DPPA 1R2RA 2C15A 3DKJA 4JNMA 3SJ3A 5LHFA 3STFA 3L66A 1TQXA 2FPTA 5TBOA 1JCLA 1TPEA 1W3IA 3C8FA 4M6VA 1FQ0A 1NAL1 3FYPA 4L4MA 4RK8A 2QR6A 3YPIA 1K7EA 2JKAA 2CLEA 1LLWA 3C4UA 3O06A 1DHPA 1V5XA 1LBMA 3NL2A 3O15A 3PBWA 2YDAA 1I8JA 1WBJA 2OT0A 4AWTA 3FLUA 1SSGA 3QQ1A 4ML9A 4JTUA 1QPOA 3LTSA 1OX5A 6ALDA 2I1OA 3P80A 2A7PA 4RZ6A 3TJLA 3NM3A 3TSBA 4S1FA 5A8GA 3C56A 4BFAA 1ZFJA 2CLFA 1JCNA 1S5VA 2RHGA 4KKXA 4FX6M 5K2ZA 3QRHA 2B7OA 4O4WA 4UTTC 1W31A 4UTMA 4JTHA 3C0JA 4O50A 3A23A 5AYXA 3PULA 4JIPA 5FEXA 1H7PA 3NQ6A 3CQ0A 4O17A 3TDFA 4O8RA 4ZQMA 3VCRA 4I7WA 3NZ1A 1B3OA 4O12A 5K9XA 4UTKA 1TQJA 4YWIA 3W3OA 3KVJA 4N4QA 3PF3A 3ZWSA 1P0KA 2O7SA 2WNZA 5IM51 3P67A 2OX1A 3NPUA 4GC4A 1H51A 1OK4A 2F7FA 1RD5A 4JYEA 4UTWA 2C0AA 2H8ZA 1RQHA 2PURA 4MPQA 1QOPA 3NOEA 3UY8A 3W7KA 2CLKA 2J24A 2E6DA 1ZAHA 4LVGA 1F6PA 2FB2A 3LX9A 5FEWA 5I3JA 1TTPA 2E68A 3FOKA 3OIXA 1GVQA 1YDNA 4AMAA 4BI6A 4Z0JA 3NQMA 3JR2A 1AL7A 3BW2A 4O15A 5G1TA 4XBKA 3NPXA 3CU2A 4K8EA 5F2MA 4DEFA 2Y62A 4EF8A 4O11A 1XC4A 3VFLA 3EX6A 3QEZA 3F4WA 3TIMA 2ZRUA 5U4NA 2E5CA 5HULA 4N4PA 3GDTA 3LCLA 3LHWA 3R89A 1K8XA 4ZVJA 1MXSA 3LB0A 3DGRA 5F1UA 1GWJA 3GXTA 4HNVA 2CWNA 3BVJA 1KTNA 1H7OA 1SW7A 1VGAA 2X30A 2JKEA 3L65A 5C2XA 1KM6A 1S5TA 1GPWA 4AHOA 1FWTA 3SW6A 3KXQA 3QPYA 4FXRA 1NFBA 2A6NA 4AEOA 1F7BA 1C9DA 4CLMA 1VPXA 2NXIA 3SIZA 3MBDA 3BG9A 2C19A 4XKYB 5K9DA 4IMDA 3TFCA 3B04A 3M9YA 1JR1A 3G1DA 3DI0A 1THFD 2J9XA 3MYOA 2ZA2A 1GOXA 1I2PA 1QPRA 2VFHA 1MO0A 4YCPA 1TB3A 1W5OA 5K7JA 4LVBA 3QF0A 1GYLA 2CLHA 4A29A 4AVFA 2OZ0A 3NM1A 5G2IA 1XBYA 3BW3A 4AAJA 3G0UA 1H1YA 4IJBA 4FHAA 3PBYA 3I7SA 2Y7FA 2RDTA 2DORA 3PB2A 4NJKA 6TIMA 4JX6A 5HMSA 1SZGA 4E38A 4N9DA 4EF9A 1A5SA 2YXGA 4LV4A 2E77A 3LLFA 3KRSA 4KFOA 1K7XA 3W87A 3S6DA 4OU1A 5D38A 4RLIA 3MP3A 3T44A 2C13A 3L21A 3TJXA 3R8RA 1DQWA 5U7SA 3ELFA 1JRBA 3O6CA 3L0KA 2NUXA 1OX6A 1V7YA 5E0KA 3TNOA 1D9EA 2GJNA 2JK2A 4FNSA 1LZOA 5DELA 3LHZA 3BPWA 4GJ1A 3A9IA 1EWEA 3NAVA 4IQLA 4ADSA 4LOCA 3F03K 3QFEA 1W0MA 3B4UA 3P74A 4IPIA 3U2OA 2O7QA 5G1YA 1IIGA 1IGSA 2NLIA 1W54A 4IPJA 4UTIA 1KLYA 5G2WA 1HG3A 1Z41A 2YGYA 1Q6QA 4FNTA 4UTHA 4PL2A 1X8FA 1K8YA 1AK5A 3UWQA 1R2TA 4EOUA 1U83A 3WJXA 3C3NA 2A4AA 3LDVA 3H54A 3LGEA 2ZZ6A 3GB6A 4HSOA 2C6QA 2P1FA 3W7CA 3DAQA 3HPSA 3PB0A 5G4WA 1G4EA 1ICPA 4LS2A 3NQDA 2Q3OA 4LWWA 1Q6LA 5CZSA 4LY8A 3TFXA 5CPOA 3KVKA 4TO8A 3NNTA 3TK7A 4IGHA 1GTEA 4MZYA 5DCBA 1IF2A 2YFOA 4K37A 4MY8A 3CB8A 2WV8A 1AL8A 1KM2A 1MZHA 5D05A 3W2KA 3CIXA 5F2GA 5LGXA 1C8VA 1H60A 4CQAA 1OX4A 1VJIA 3HG4A 3LBCA 3EKZA 4QM1A 5HR6A 2QCEA 1YPFA 3HGOA 4ZZ9A 1KFCA 1QMLA 2A0NA 2FFCA 1I45A 2DZTA 3IRDA 3A5FA 4M19A 1ADOA 1P0NA 5AFDA 1AG1O 1KM1A 3BGJA 5CZJA 3MWAA 5DLCA 3W2NA 3W7NA 1XKYA 1QPNA 5AYZA 3JS3A 5F4WA 4RX0A 3TV8A 1EP3A 1BWKA 2OMAA 3W83A 5K9CA 2ZDRA 2C3ZA 1XUUA 3GXNA 3UXDA 1FX6A 3KHJA 3SGZA 2WQPA 4UTWC 4E2BA 2ABBA 2YW4A 2YPIA 4U4MA 3W72A 1PL9A 1FCVA 2B7QA 4U28A 2WO5A 4NJIA 1H62A 1OFEA 2DJXA 3K30A 1SR9A 1UASA 1SQ7A 2QJIA 4PC8A 2H90A 1SZEA 4RXGA 5F4XA 1EPXA 1GVRA 1UJPA 4MFDA 5DBTA 1BWLA 1ICQA 1K03A 4BF9A 2ZZ5A 4HPXA 4JIQA 2FIQA 1W5NA 2YFNA 3IGUA 3TW7A 5EKYA 5I3FA 1QR7A 2VFIA 3M47A 1NF7A 4NU7A 3GR7A 1XI3A 2QCCA 5CPLA 2YX0A 4C1LA 1PHQA 5LNWA 1KTBA 5C55A 3M6YA 4IMGA 3V75A 3TQKA 4JEQA 1CI1A 1VZWA 1R47A 3HGJA 3B0VC 3MBFA 4NT0A 2VFGA 3LBMA 4WY0B 2V0TA 4DO6A 5BNKA 3G1XA 3FA5A 4UTUA 1Z44A 3MJYA 1JQXA 2I14A 4ZMGA 4KFNA 1SZFA 4X9SA 2Z6JA 3GNNA 2VENA 2FQIA 4JD4A 3H55A 3I7RA 3NPWA 1GYNA 3P7YA 4FNQA 2V5LA 1KM5A 3Q94A 3F4NA 2V8ZA 3NQGA 4Y96A 5EA9A 3I65A 4A21A 3WJYA 4OHQA 3VE9A 1MSSA 3HGRA 1W3NA 8TIMA 3W7IA 4QJ1A 3A24A 3E12A 2C16A 5DBUA 1SSDA 2QCDA 1LOSA 3NL6A 4S2BA 2A5HA 3WJZA 4DXVA 5HNRA 1H7WA 5CPMA 3V1PA 1QAPA 3P60A 4R34A 4K39A 4RXFA 4EVZA 1QO2A 4JX4A 1EWDA 1SPQA 3TMLA 2H3BA 3MHUA 1XBVA 1KFJA 5DY2A 1FWRA 3MW7A 3OBKA 3R13A 1JULA 1W8SA 4X3ZA 5HINA 4JTKA 4LT9A 3IVUA 1TYGA 5LHEA 2QJGA 2CLOA 2Y7DA 3DBPA 3FS2A 3W7MA 3W7GA 2VEMA 4PA8A 4O57A 5LZLA 2V9DA 1B57A 1XUZA 5EBUA 3SY5A 1DORA 4MJMA 1OX4B 1TPC1 1MEHA 2A21A 3LRLA 4H3DA 4UFHA 4OT7A 4P2VA 4UXDA 3PG8A 2HSAA 5LNVA 1EB3A 2AGKA 4O0KA 4WD0A 1SO3A 4FO4A 3VNDA 4ZQNA 4OBTA 1GT8A 1I4NA 3W84A 3PS7A 3THAA 2VFEA 2Z2UA 3IIVA 5D04C 3W7DA 4IXHA 2WNNA 4HKPA 3G1FA 4X2RA 1W5QA 4UR8A 4IX2A 3MHFA 1F74A 3TH6A 3WK0A 3RK8A 1EP2A 4NNBA 1VCFA 1VYRA 1KM0A 1ME8A 3NEVA 3O8AA 1TPDA 2E1DA 5D09A 1EA0A 1N7KA 1M5WA 1TRIA 1LORA 4O16A 4JY9A 1F76A 3L5LA 1TCDA 4NZFA 3W74A 4E2DA 2ZA1A 4TMBA 3CLMA 3L67A 3S5NA 3UWYA 3SFKA 4LVDA 5KINA 1ZALA 1XDMA 5HUOA 3T7VA 5FF0A 4Z1DA 2I9EA 1XCFA 3A21A 3G22A 5CSSA 3FYOA 4ZL1A 4E0CA 3SI9A 2RDWA 5MHBA 1MEWA 2YYUA 3PSVA 5FESA 2VKZG 1C29A 1AW2A 2QCFA 3QJAA 4O54A 4H6KA 1KBIA 3W1TA 2ZZ1A 5K4ZA 4M7SA 1R2SA 4Y9AA 3LCHA 3T4CA 4MY1A 1O5XA 3S5YA 5AHIA 2ISWA 1TIMA 1M7OA 3C2EA 1TSIA 2ZTKA 2VEKA 1EUNA 3W7JA 4FX7A 4DF1A 2E09A 4LU0A 1OF6A 4NJGA 3C6CA 4WZHA 1ONRA 1GG0A 3L5AA 3Q2DA 1SZNA 3WK1A 2JBMA 3HF3A 3NXFA 1GZGA 1T96A 3TC6A 5AYYA 2A7RA 4JTFA 4XZ9A 3ZFHA 4FEZA 2QAPA 1WV2A 1X7FA 3U6WA 1JUEA 4ADTA 2QCDB 4DPQA 4UNLA 1KW1A 3FJ6A 3MYPA 1SW0A 2ZZ2A 4UMAA 2QDHA 5E93A 3TAKA 3S9YA 2QCLA 1HUVA 4P61A 2TSYA 4GFSA 1A5CA 4ZQRA 5LSMA 4JDBA 4Q32A 1DL3A 4AWSA 5J5DA 3EKLA 4UUIA 3S42A 3P61A 1W3TA 4OQVA 2RDUA 1DJNA 2VFFA 4JTIA 3N9RA 3QMTA 3NR0A 4UFJA 3C2RA 5CZ0A 1F73A 4WOZA 3N19B 1JRCA 4OV4A 3NQCA 2GQ9A 1PCKA 1TV5A 5F1VA 2D73A 3PWAA 1FY6A 1VS1A 1D3HA 3IVTA 1M6JA 1SO6A 3W22A 3N2MA 1OJXA 2ZRWA 1XM3A 2CLMA 1WOBA 3W88A 1OVDA 3EWXA 3GAYA 1QOQA 3G1HA 1QPQA 1FWWA 1JCJA 1UUMA 3E9AA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3M1Z A;  1TO3 A;  4RV8 A;  1YDO A;  1PVN A;  4BWL C;  5D33 A;  3CHV A;  1Q3N A;  2C18 A;  3TR2 A;  4ORM A;  1W1Z A;  3LI0 A;  1DKW A;  2Z1B A;  3NVT A;  4OE7 A;  3UYC A;  3DHD A;  3EXS A;  3I68 A;  4LC6 A;  3M41 A;  3NQ7 A;  5DN1 A;  5D30 A;  3FEM A;  1L6S A;  1LRN A;  1VYP X;  2ZTJ A;  3RMJ A;  1YXD A;  5CGQ A;  3LCW A;  2FDS A;  1I2O A;  3SZ8 A;  1J2W A;  3QSR A;  3W6Y A;  1ZAI A;  2R14 A;  3PY2 A;  1NEY A;  3NPV A;  2OJP A;  3EWW A;  4TX9 A;  1XXX A;  3G3M A;  2B4G A;  1U5J A;  3W9Z A;  1VYS X;  2H8X A;  3S1U A;  4K7Y A;  2P0O A;  4N6E A;  1X6U A;  2WJZ A;  2DJL A;  4IXX A;  4MYA A;  2X1T A;  2ZRX A;  3W75 A;  3LI1 A;  3BW4 A;  4NJH A;  4Q4K A;  3TUU A;  4HIB A;  3G18 A;  4FF7 A;  1JCY A;  1KLZ A;  1HFB A;  3PUE A;  1VHN A;  3CWN A;  1VCV A;  4MZ8 A;  1H50 A;  2HS6 A;  1H5Y A;  4XWU A;  5AHN A;  4YMZ A;  1RPX A;  1JCX A;  2W0U A;  4FNP A;  1XDL A;  3LV6 A;  4RZ4 A;  5EYW A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1VPQ A;  3NWR A;  1XBX A;  4LBS A;  2FJU B;  4UMB A;  3THD A;  3WMB A;  4ERA A;  3SUW A;  3TTY A;  5ECV A;  1QWG A;  2NV2 A;  4FR1 A;  3ABQ A;  1WDQ A;  4MAV A;  3CIV A;  3G1Y A;  4KT2 A;  3TWB A;  1FWH C;  2PFH A;  3EX2 A;  3K2G A;  1F4A A;  3KCJ A;  2D23 A;  4LAL A;  1OBA A;  3NQV A;  4FR6 A;  2PLC A;  4B5N A;  4HK7 A;  2FTP A;  3NDO A;  2DZU A;  1OK6 A;  3UR8 A;  3CPR A;  1KBK A;  1ME7 A;  3W82 A;  1SJD A;  2J79 A;  7TIM A;  3FIG A;  4CCZ A;  4G9P A;  4LW7 A;  5J5R A;  3VKC A;  1YW1 A;  2QUV A;  3AI0 A;  1DVJ A;  1YNQ A;  4IPN B;  3CHD A;  5I3K A;  2NWR A;  4K2S A;  4AIS A;  1XCW A;  3FKK A;  6TAA A;  1MRA A;  1VFL A;  2DT0 A;  4ZB0 A;  4YLW A;  2ZX7 A;  1JD7 A;  4GD0 A;  1EGV A;  1HKW A;  1O4U A;  3PAN A;  4Z2L A;  1A3W A;  1RLD A;  1GTH A;  2VJX A;  4O8A A;  2XWD A;  3WQD A;  2WC4 A;  1N8F A;  5ABF B;  4KWS A;  1BYD A;  1XX1 A;  3F5K A;  1JG9 A;  3OW1 A;  4LTS A;  3KTC A;  3HIJ A;  1H41 A;  4WSJ A;  2G4F A;  3WQO A;  1UKT A;  3IIO A;  4L64 A;  1RP9 A;  1EIX A;  1TJ1 A;  1FCU A;  5DCD A; 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