5CZSA

Neisseria meningitidis 3 dexy-d-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase glu98ala variant regulated
Total Genus 127
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
127
sequence length
346
structure length
344
Chain Sequence
HYPTDDIKIKEVKELLPPIAHLYELPISKEASGLVHRTRQEISDLVHGRDKRLLVIIGPCSIHDPKAALEYAERLLKLRKQYENELLIVMRVYFAKPRVGWKGLINDPHLDGTFDINFGLRQARSLLLSLNNMGMPASTEFLDMITPQYYADLISWGAIGARTTESQVHRELASGLSCPVGFKNGTDGNLKIAIDAIGAASHSHHFLSVTKAGHSAIVHTGGNPDCHVILRGGKEPNYDAEHVSEAAEQLRAAGVTDKLMIDCSHANSRKDYTRQMEVAQDIAAQLEQDGGNIMGVMVESHLVEGRQDKPEVYGKSITDACIGWGATEELLALLAGANKKRMAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Neisseria meningitidis serogroup b (strain mc58)
publication title Structure of Neisseria meningitidis 3 dexy-D-arabino-heptulosonate 7-phosphate synthase Glu98Ala variant at 2.42 Angstroms resolution
rcsb
molecule keywords Phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase
total genus 127
structure length 344
sequence length 346
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2015-08-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 5czsA00
5IM51 1G6CA 1Z44A 1NVMA 1LORA 4IGHA 4NZJA 5U7SA 3DFQA 3EEGA 3MP4A 3B8DA 3BARA 2FFCA 1QMLA 1XM3A 3DFNA 1TV7A 4OBTA 3VKJA 4NNAA 2OMAA 1WBHA 2DZWA 3TNOA 5K3VA 3GAYA 3GDRA 5LHEA 4FO4A 1E51A 5AYZA 4HN4A 3Q58A 3LCFA 1KM2A 1EIXA 4Z1AA 1I45A 2EAWA 1NSJA 1ZY9A 4LV9A 3HBLA 3W83A 2CZ5A 3P84A 5I3JA 3O6CA 1XFBA 4DO5A 3TE9A 1YTKA 1D3HA 1ML1A 3NEVA 4U28A 1V7YA 4HSOA 2PCQA 1M6JA 2D73A 4CQ9A 1R2TA 3TJLA 3I68A 4DO4A 1TQXA 4NVTA 3TXZA 3TQKA 3P61A 2Y7DA 5D02A 2G5WA 5J5RA 1YXDA 5T26A 3S9YA 1F7BA 4FNRA 1XCFA 1UUMA 3NAVA 4MJZA 2W79A 4O16A 5TBOA 2XN1A 2WQPA 1P5BA 1OFDA 3L2IA 4S2CA 3HGJA 4N4PA 2ZRWA 4MYXA 3EWUA 1O5XA 4O57A 2VELA 1S3HA 1XDMA 1L6SA 2AAMA 4LWWA 2QEZA 4WX2A 2NV2A 2QCDB 3DFSA 2ZRZA 1LROA 4GJ1A 4QNEA 5FF2A 1BKSA 1S5VA 1KLZA 3SIZA 4WY0A 3S0CA 1YTEA 3V1PA 4UTWA 3W7DA 3W7KA 1JRCA 4DQWA 3EX4A 2X16A 1HO1A 3E96A 1B57A 1AK5A 3G24A 3O16A 3DU0A 3C3NA 3PR2A 4DPPA 4O12A 1O5KA 4R34A 4R33A 1VYPX 3BPWA 4M7SA 3C4UA 5AHIA 3EXRA 1T99A 2E68A 1AL8A 4EVZA 1TV5A 1FX6A 3EX6A 1QPQA 1TO3A 2R91A 1LTDA 1HFBA 1KFKA 3VE7A 2VC6A 2ISVA 5KZMA 1AW2A 2GUUA 3ZWSA 3WFAA 2VXNA 2YFNA 3CQ0A 4JY9A 3LHUA 4PCFA 1XUZA 3S1WA 4M6VA 1EP1A 1SR9A 1WAUA 5SWUA 4LRSA 1NF7A 2VEIA 3N19B 1ZAHA 3OVPA 3GYEA 3NDOA 3S5NA 2VKZG 4LS2A 1B4KA 3PF3A 2ABAA 4XBKA 1TPDA 5U4NA 2ATMA 4UMAA 5K2ZA 2OCZA 5CPLA 4EF9A 3UPBA 3A23A 3LLFA 3PBYA 3C6CA 2GVLA 3LHTA 3M5YA 4MFEA 3EWWA 1ZENA 2WPBA 2OX1A 3D0CA 1MXSA 2Q3RA 3W70A 3HF3A 1H1ZA 1OFAA 1FBAA 4FB7A 1TTIA 1H63A 1IXQA 4L4MA 3DI1A 3W7JA 3S1XA 4GNJA 1SZFA 1MSSA 4MLJA 4NXKA 3KVMA 4RZ4A 4Q33A 5G1YA 1EP2A 1T96A 3RK8A 1JCNA 3EWBX 4EOUA 4XKYA 1LRQA 2EF9A 3IIOA 3Q37A 2GQ8A 1NEYA 4AWUA 2DZTA 4HPJA 1WV2A 4LVBA 4UTTC 5K4XA 1F5ZA 1XBXA 4DXVA 2Y7FA 1LLZA 3LCHA 2DZPA 3SFKA 3FFSA 3CPRA 1I4NA 2A7NA 4TO8A 5LNSA 3LCXA 4ZQOA 1YYAA 3QQ0A 4BWLA 2O7QA 2EGZA 3SECA 3TKFA 3U6WA 5LNUA 3TCEA 1GJPA 3NYZA 3Q2DA 5I3HA 3W88A 3N2XA 2H3DA 3FJLA 5EY5A 2Y61A 2FPYA 3F1QA 3MJYA 2ZZ5A 4JYDA 2Y70A 3SR7A 4MJMA 1FY6A 4MY1A 1ZALA 1TTJA 2DJXA 4FEZA 4MZ8A 3ZR4A 2ZDRA 4KWVA 5F2MA 4O17A 3NQ6A 1SSGA 4NXSA 4H6KA 4R7JA 3W1TA 3CT7A 1F6KA 2QR6A 1QO5A 1VLWA 2CWNA 2DJLA 3LRKA 4J9JA 3E02A 3NL6A 3L0NA 3NO5A 2G96A 4OU1A 3G1VA 5F2LA 3P67A 5AHMA 1SZNA 3GDKA 5EL1A 3LHYA 3W1PA 5C2XA 1XBVA 4JX6A 3QYQA 1SPQA 3GXNA 1T0OA 1RQHA 2GOUA 3DFTA 3HGSA 3O07A 4LTSA 4O1CA 2YGYA 1GOXA 3B0PA 5EKYA 5LNWA 1IF2A 1GVSA 4Z0JA 3OG3A 1S5TA 1ME8A 5G4EA 3UWUA 4XTIA 1D3GA 4JTUA 2E09A 4AWSA 4HPXA 3TAOA 2GJNA 1GVFA 3HPSA 2A2IA 5AN7A 2H90A 2JKEA 3M7WA 4HNNA 1DJQA 2JBMA 2Q8ZA 4RXFA 1TIMA 1FXPA 2HSAA 3EWXA 1VJIA 1ICSA 3PUOA 4PA8A 5K9CA 3BG9A 1EX5A 3GDMA 4QSHA 2PRMA 2WO5A 1BEUA 1DQWA 5HMSA 3G8EA 2B4GA 5AB3A 4JN6A 4MIMA 2B7PA 2NX9A 4ZQMA 2NLIA 3TMLA 2OT0A 2YCEA 3BW2A 4MZ1A 5BMWA 3GAKA 3NG3A 3L0KA 1KM5A 4OE7A 3W1AA 3UZ5A 4O28A 3HIJA 3A22A 3NM3A 4NUWA 3LB0A 4AMAA 2C3ZA 1LBFA 4UMCA 1W56A 5D09A 1KW1A 3BV4A 1ZAIA 4DBEA 1OFQA 3GDLA 5D05A 3WK2A 4UFJA 3G1XA 1CX9A 1J2WA 4O10A 1JUEA 4DF2A 3FS2A 2B7NA 3LI0A 2C13A 3B4UA 3DGRA 5HWNA 2NWSA 3IVUA 4IJBA 3UWWA 1W5QA 3CIWA 1TQJA 1BWKA 2V2CA 3ZWTA 1JCMP 3N73A 1MZHA 3W22A 3W1UA 4GUIA 4PL1A 1TPWA 5HULA 4ALDA 1PL9A 5G2HA 5CZSA 2HS6A 2YW3A 2TYSA 3KVKA 2CW6A 1WXJA 4FIRA 5K4ZA 2Y89A 4FXRA 1Z42A 2J6XA 1PV8A 2XFWA 5FEPA 3SI9A 2J9ZA 3HGRA 4QITA 3W2JA 3IVTA 4UFIA 3EX3A 3SJ3A 3M1ZA 5F4SA 1SO5A 4BI7A 4UTHA 3MI2A 1P1XA 5D33A 3V75A 3UQNA 4NNBA 4EWND 2VEPA 4ZZ9A 4H3DA 3PBWA 2VFDA 1W37A 4O53A 3C0JA 2CLLA 4ZQCA 3FLUA 2QDGA 3NPVA 4IMDA 3FJ6A 4KWWA 1VCVA 3HOJA 1R30A 1VPXA 1UB3A 1I2QA 4GE8A 2G95A 3MI6A 3W1MA 2X30A 1GG0A 3NOEA 4UIOA 5TQLA 2QCDA 3DENA 2VENA 4CLMA 1U83A 2PURA 5F2IA 3G3DA 1B4EA 1I2NA 2QKFA 4W9TA 4RLIA 1S5WA 3TIMA 4ADTA 3M5ZA 3BLFA 5D03A 1G4SA 4HNVA 2C19A 3LTPA 1Q45A 1CW2A 2ZZ7A 1OYCA 3C2VA 1A5BA 2I14A 1ZJIA 3U2OA 4AHQA 3QMSA 3F03K 3NA8A 3N34A 4JTSA 4OV9A 3E49A 3DH7A 3H55A 5KZEA 1GTHA 3B03A 3KX6A 3IIZA 3N9SA 2WV8A 1AW1A 1QCWA 4E38A 3IV3A 4JS3A 4O18A 1ME7A 3LHVA 4N4QA 2GQ9A 4X22A 3M6YA 3NQAA 4JTEA 2X1RA 1HL2A 4UTMA 1ME9A 5F1VA 1GTEA 1RV8A 3C56A 2ZRUA 1PE1A 2ZRYA 3QFEA 2C6QA 2XN0A 3HG3A 3WJWA 3B06A 3O6DA 4Y6GA 1IIGA 3NQ2A 2VFFA 4N9BA 4WXYA 2TMDA 3TROA 3TSDA 4OQVA 1ALDA 1LBLA 5D30A 1TJRA 5CGQA 3S6DA 3G1AA 3KRUA 3KHJA 3NQDA 2CZFA 1I2RA 4GBUA 1F73A 1PCWA 2QDHA 3QH2A 2CZDA 2QUVA 1WYIA 4R53A 3PVFA 3PB0A 3W86A 2E6AA 3VNDA 4OGZA 4AWTA 2A0NA 1TYGA 5D2VA 3DHFA 3UWZA 2VFGA 3DKJA 3DAQA 1JCLA 4FNUA 2YPIA 1VZWA 1PCKA 4B5NA 4O11A 4NJKA 2AGKA 4WY0F 1HUVA 1TPVA 1KTCA 3KVLA 3LXBA 4BR1A 4FX6M 5CSSA 1X1ZA 3TC6A 4A2SA 3Q94A 1GG1A 3GR8A 5LZLA 4NJIA 3W7CA 5DCEA 4JIQA 2NUWA 5D2XA 1AW5A 2J9XA 4Y96A 4NNCA 3NNTA 4FNQA 1F74A 4RV8A 3ZS4A 4PODA 1SFJA 1IIHA 3TXVA 2NZLA 4H4IA 1VHCA 3TC7A 1DJNA 3MWAA 3UZJA 4CCCA 1O60A 2DU2A 2C18A 4UTLA 3ZFHA 1YDNA 1XC4A 1ZAJA 1A5CA 3W74A 3BG3A 5I3GA 3TX9A 1VCFA 3M5XA 3RFAA 1J4EA 3P7YA 3MHUA 5A8GA 4KFOA 1L6YA 1A53A 3LCGA 5DBUA 3ELFA 1IXNA 3DFOA 3SSJA 3HGOA 1QO2A 1WQ5A 1H7PA 4PTNA 1O95A 3BLIA 2NX1A 5A5WA 3M16A 4K8HA 4IXHA 3BW3A 4PL2A 4ZQNA 1W31A 1VCGA 3L5LA 1ONRA 4XBSA 1YDOA 1OFOA 3O15A 3QMTA 2W6RA 3PUDA 3PG9A 3PULA 1A5SA 3QC3A 4NJGA 4A3UA 1W0MA 4KFNA 5F1UA 3TDFA 4UNLA 3EWYA 4UTWC 3CU2A 1SO3A 3W1LA 5HINA 2JK2A 5C54A 4Z0SA 3FKKA 4RR4A 3W2MA 7TIMA 4ADSA 4WOZA 2DZVA 3ANYA 4BFAA 1LP6A 3TW6A 3NXFA 2Y7EA 4MVAA 4AHOA 3HG2A 4GUGA 3G22A 3G0SA 4GWEA 4KFPA 2ZZ2A 3AO0A 3EX2A 3W7LA 3BVJA 4RXGA 5LGZA 4JTTA 2RDWA 3M47A 4TX9A 5AHFA 2C15A 1K02A 1RD5A 3O05A 4NZFA 2R8WA 1GT8A 3T7VA 2VFEA 1JCYA 3L68A 4NX0A 1WDWA 5HQEA 3JRKA 1KFBA 3PSVA 3G1HA 4O15A 1VYSX 2A1YA 1C29A 5AC8A 1KA9F 1V5XA 2ZQ0A 5FEXA 3UY7A 1LRNA 1KFLA 4JTHA 3MHFA 3TH6A 2ZRVA 4RK8A 2JKAA 3W23A 3W7PA 4POCA 1F6PA 4YLWA 3QMRA 4FNTA 1GYLA 3LTYA 3QJAA 2FLIA 2CLKA 2DZXA 3FYPA 1I2PA 3T40A 4UUIA 4JXCA 2FIQA 3NPXA 2E77A 3TK7A 4O1DA 3ATYA 3QW4B 4X3ZA 1O94A 2Z2UA 1SZGA 3LV6A 1KTBA 3P8JA 1F76A 1H7OA 3RLVA 3IGSA 5E93A 1JR1A 3INPA 1VRDA 2P0OA 3SW6A 1TRDA 1JULA 1OABA 4AH7A 4HHPA 1OHLA 3ABOA 4XZ9A 2YX0A 1NAL1 3BG5A 4FNPA 3A5VA 3FEMA 4BWLC 5BW6A 4IUOA 5CPMA 4DF0A 4Y9AA 3KFTA 3DKLA 4N9CA 3W7EA 3W7RA 5CZJA 3STFA 3NM1A 3DXIA 2ZZ3A 3EWZA 3TU9A 1QR7A 3W7OA 4MZYA 2B0MA 4LRTA 1MO0A 5CSRA 4UTTA 2NUXA 3W7GA 2CLHA 2F84A 5CZ0A 2QCFA 1K7XA 3TFCA 3MP3A 1XI3A 4O0ZA 3LX9A 3OHIA 1ICQA 4Q32A 3PC0A 3WJXA 4IMGA 2WNNA 3O1NA 2CLMA 1R2RA 1Y0EA 3W87A 2QJGA 3HPZA 4IPJA 2ZZ1A 4YXGA 1CI1A 2QF7A 1OFPA 8TIMA 4WOQA 1JQXA 1XBZA 1PVNA 1QOQA 1THFD 4E0CA 4WD0A 3B0VC 5LGXA 3W2KA 2TRSA 3NQ8A 2FJKA 3P60A 1FCUA 1SO6A 3RMJA 1G7VA 1WA3A 1KM3A 1DBTA 2J27A 3G1SA 2A4AA 4XWUA 4ML9A 5I3IA 2QCNA 1W8SA 1TV8A 4CNNA 1VYRA 3LBCA 3NQ7A 1HG3A 3CIXA 4S1FA 5C6MA 3FOKA 3SZ8A 3U8GA 3HMJG 3UXDA 1FDZA 1W3IA 1AMKA 1KM1A 1XKYA 1YADA 1OX4A 3W7QA 2PC4A 2WSRA 3OA3A 2NXIA 3MYOA 4N6EA 2EHHA 5DLCA 3USBA 3R2GA 1UUOA 3N14A 2ZYFA 1NF0A 2W0UA 4LOCA 5I3FA 3W7MA 1GPWA 5HUOA 4YL2A 2J24A 4ONVA 4RX0A 1TB3A 1Q6QA 2I9EA 4CQ8A 4M7TA 3QSTA 4LVAA 4O52A 5EBUA 1K7FA 5F4XA 5L6UA 1SSDA 3DBPA 1DV7A 2HTMA 2QCHA 1EWEA 4DELA 3STCA 1QNVA 3CC1A 2WNZA 2Y7GA 1VS1A 5FF3A 1OFEA 4O8RA 3CB8A 2QJHA 4C1LA 3PB2A 1KV5A 2FPVA 1F2JA 1IXPA 4UCGA 2G97A 3PBVA 1W5OA 5D32A 5C5YA 4M19A 4NX5A 1LYXA 1I8JA 2IQTA 1G4PA 2DP3A 4MLRA 5EPDA 1TPEA 3S1VA 1P0NA 3LBMA 4JIPA 4LT9A 1YPFA 1LCOA 1OF6A 3G1DA 1KFJA 1OX6A 1GVOA 3A5FA 2NWRA 4BF9A 3OIXA 3C61A 1VR6A 1XBYA 3NQMA 3ATZA 4FX8A 3C2FA 1H7NA 3P82A 3LXCA 4GC4A 4LVGA 2V0TA 3WK0A 3H54A 1P4CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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