4E2DA

Structure of the old yellow enzyme from trypanosoma cruzi
Total Genus 137
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
137
sequence length
377
structure length
377
Chain Sequence
ATFPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDGHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSDAQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQPKSDQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVPEELTDDEVRNGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDAVGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEEADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQHDWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPTYN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title High resolution crystal structure and in solution studies of the Old Yellow Enzyme from Trypanosoma cruzi: Insights into oligomerization, enzyme dynamics and specificity
rcsb
molecule keywords Old Yellow Protein
total genus 137
structure length 377
sequence length 377
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4e2dA00
1GG0A 1JQVA 1OHLA 2QCNA 3RNDA 1HTIA 3G1XA 5AHMA 4GFSA 3WK3A 2B4GA 2HS6A 3NQVA 3HQ1A 1Z41A 4DELA 2ZZ1A 1B57A 4A22A 2Q8ZA 3P80A 1DHPA 1TPB1 2O7QA 4LRSA 3KOFA 5J5DA 1FXPA 1WV2A 1KFLA 4Y9AA 4N9CA 2WKJA 3TAKA 1GVOA 1TV8A 4ZQPA 3GDKA 1OFEA 2OT1A 1WXJA 2ZA3A 3TX9A 5D09A 4FXSA 1O4UA 5FESA 1VS1A 2CLOA 1AW2A 1ZJIA 3BW3A 2WSRA 3QSTA 4FX8A 4HT3A 3FS2A 1B4KA 1ALDA 3LTPA 3RF9A 1JVNA 3CB8A 4O12A 1K3UA 4PH6A 4UCGA 1OFRA 3KRUA 2D73A 4UTTC 4M6VA 4UTTA 4O1AA 2PRLA 2V5BA 3MHUA 1OFAA 2E1DA 3MO7A 3SSJA 4HNTA 1FX6A 5HWMA 3G8EA 4W9TA 3K30A 4ZQNA 2H90A 4MY8A 4CLMA 3QZEA 4EVZA 3QRHA 3NPWA 4H3DA 2F84A 1HFBA 5KZEA 1W1ZA 1TTPA 3PG9A 1K02A 4RJEA 2BSLA 1QPNA 3PWAA 4RXGA 2OX1A 4IXHA 1SW7A 3NQ2A 4TO8A 3W7NA 1LCOA 2WNNA 4O0ZA 4IMFA 3GXNA 1YXYA 3C6CA 1UASA 1G4TA 4UMCA 2ISVA 3CIXA 3P5ZA 2FFCA 1DOSA 4YCPA 1TPFA 2QUUA 3EB2A 3MBDA 5CSSA 4TMCA 5K9CA 2QCMA 4JIQA 3UWWA 1QCWA 4PL2A 3LHVA 3NQAA 2RFGA 1XBYA 4LVDA 2I1OA 2A2IA 5AN7A 1EP3A 1W5MA 3GAYA 1RQHA 4LV4A 4DPPA 4O15A 1R2RA 3I7QA 5AB3A 2CLFA 2QJHA 4RK8A 3QEZA 1LP6A 4EWND 4ICNA 4UR7A 4M6PA 1W5QA 1Q6LA 3WJSA 5I3FA 1KM2A 1QR7A 4UR8A 1Q45A 2FJKA 1W3NA 3S1XA 3P7YA 3DGRA 1SFLA 3TFXA 5K2ZA 1TIMA 1D3HA 2BX7A 1TRDA 3B0VC 5CZTA 3EXTA 3GXPA 2A0NA 1DORA 4X2RA 4FXRA 1VLWA 1I2RA 2CZEA 3OIXA 3W1LA 4EIVA 5C55A 4N9DA 4GWEA 4E2BA 1SR9A 2NX1A 5DXXA 3B03A 1SW3A 2BXVA 3L65A 5CPLA 2FPTA 4N02A 4MYAA 2ZA2A 2ABBA 1LOLA 3B05A 2P10A 1TV7A 3BG5A 3GX9A 3IV3A 2J6XA 1KFEA 3NL3A 1TV5A 2XN2A 1H7XA 1H7OA 1IIGA 4QIUA 3M5VA 4BWLC 3W6YA 4BWLA 3I68A 3W73A 2FB2A 3UWVA 1A53A 3PBVA 6TIMA 3W1AA 1R30A 5ABTA 4WOZA 2Y7DA 4UNKA 3IGSA 3W1TA 5EMUA 3W7MA 4Z1AA 3G0XA 2E68A 1FCUA 1DBTA 3PG8A 1PL9A 3LM7A 3QW3A 3TK7A 1T99A 1FWWA 2ATMA 5KZDA 3W85A 2UV8G 4FX6M 4O13A 2WQPA 1Q3NA 2RDTA 4IMDA 4NNAA 2C16A 5EA9A 3R13A 3U6WA 3CEUA 3SECA 3TNOA 2DZSA 4D2JA 1VYPX 3A21A 1NAL1 3O6CA 1XFBA 5K9XA 1OABA 4O16A 4JXCA 4UFJA 5TBOA 1TPWA 1TTIA 5G1TA 2CLMA 5LGXA 3ABRA 4HSNA 5F2IA 3QF0A 1F7BA 2ZBTA 4TX9A 3LTSA 3EWUA 3CIWA 3L66A 1OFOA 3HPSA 1PCWA 3L21A 3MJYA 1SZFA 5CPMA 1LRNA 5E93A 3CM4A 1M7PA 2Z2UA 3JS3A 3EWZA 3FKRA 4KWVA 4DBEA 3PM6A 1VGAA 3O06A 4O10A 1VR6A 2QAPA 3S5OA 4XQ6A 1LLZA 3W86A 4JTJA 1GTHA 1FQ0A 5SWUA 3HBLA 4NXKA 1H51A 4LC8A 1J2WA 1P0NA 2A7PA 5F2GA 1WYIA 5CSRA 1ZHAA 3LHUA 1TSIA 1F6KA 1EUNA 3LCHA 3MYPA 4JYFA 1KM6A 2GVJA 2NX9A 1FCBA 1KM1A 2JKPA 5LGZA 1RR2A 3TFCA 4NJGA 4POCA 3NGJA 2W79A 3TXZA 4O8RA 3DI0A 1U5JA 1QPQA 1ZY9A 1SQ7A 2XN1A 2C3ZA 4LUJA 1FCQA 3BARA 5KMYA 5F4XA 4OV4A 4RKAA 2G95A 1X7FA 4NJJA 4G1KA 3NO5A 1JRBA 2JK2A 2ZRYA 3A24A 3C56A 4RR4A 2WV8A 3HF3A 3NAVA 1GWJA 1A5SA 1Z42A 3S1UA 1TPVA 2ZDRA 4M19A 1MXSA 3PB2A 4QAIA 3LGEA 3P61A 4NT0A 5H91A 4IGHA 2QR6A 5HMSA 3HJZA 1W5NA 1JCLA 5LNWA 4JR5A 2EKCA 1GYNA 3P8JA 4K8HA 1V7YA 5K3VA 3M44A 1QO2A 3LTYA 1CW2A 3V1PA 3M5XA 3W23A 4IX2A 5U7SA 5DLCA 1OX5A 3LRLA 4BI6A 4O18A 4HIBA 5BOOA 1TJPA 4Q4KA 1VH7A 2CZ5A 3EX2A 3NQDA 5AHNA 5K4ZA 1IXNA 4FF7A 3EX4A 3EWWA 2VOMA 1P1XA 2ZFAA 1G7UA 2QUTA 3LOTA 1AW5A 1J5TA 4MIMA 5DBUA 1JRCA 3C2OA 4KWWA 3S5YA 4O17A 3VCRA 3W7QA 1OF8A 4O14A 1OF6A 3VFLA 2GVLA 4PL1A 3W70A 3QH2A 1U83A 1GVSA 3KVMA 1LORA 4N9EA 3TDFA 3WJXA 2YFOA 3PF3A 4PODA 4UMAA 5D03A 3CWNA 3Q58A 3O8AA 3EWBX 4IQLA 5I3HA 1W56A 3KRSA 3GIYA 1XUZA 4OV9A 3BGGA 3O15A 2DZUA 2V82A 4LVGA 1TTJA 2YFNA 3RFAA 3DZ1A 1DKWA 3B0PA 3FA5A 5D32A 3RLVA 3FYOA 3G1VA 1N55A 2Y61A 3LBCA 5D02A 1ICSA 3GDTA 1HO1A 1EX5A 1H1ZA 4QJ1A 2FLIA 4JD4A 2YSWA 2GQAA 3VI2A 4JDBA 1SZGA 1Z44A 3HOJA 1VZWA 2VELA 1W31A 2P1FA 3PBUA 1ZFJA 3THQA 3D0CA 3UWQA 2QCHA 3MP3A 4E2DA 4DQWA 4O1DA 3R8RA 1O95A 3PUEA 1QNVA 3STCA 3W3OA 3O07A 4DPQA 1K03A 1GPWA 3I7SA 1WA3A 3LV5A 3P62A 3UQNA 2Y85A 3W83A 3SZ8A 4OU1A 5K4XA 2ABAA 1JCNA 3FLUA 4MVAA 4X9SA 3W1NA 1JJKA 2QJIA 2C13A 4OWGA 3W7RA 2YYTA 4MFDA 5BMWA 4J9JA 4GNJA 2C6QA 1VJIA 2ZZ7A 4TR9A 3UWUA 1W0MA 2ZZ6A 4MLRA 5TQLA 3Q37A 5L9FA 3GDLA 4CQ9A 3L0NA 1YXCA 3L5LA 1I2NA 4UTMA 1ZCOA 1GJPA 3UPBA 5F2LA 2VFGA 3QM3A 1YPIA 2ZA1A 3N2MA 2DJLA 3C61A 4WD0A 4DF1A 3G1AA 2ISSA 4JX4A 1Q6RA 2E6FA 5FEXA 4IXXA 3NQ8A 2PRMA 3TMLA 4ZZ9A 1SO5A 3GKFA 1LRTA 3M1ZA 4X3ZA 5FEWA 4UTIA 1IXOA 3GKAA 4UTUA 2VEMA 2ZZ5A 1JCYA 2Q3RA 3G18A 2BWGA 3CT7A 1TPH1 4LS2A 2NXGA 3S42A 3T44A 4IUOA 2TMDA 5EY5A 4JTFA 3W7DA 1H50A 4JTIA 4LV9A 3DBPA 1JCMP 2DZWA 1GG1A 1DQXA 1VC4A 3PBWA 3T7VA 4U28A 2FDSA 3MP5A 5F4WA 2DZTA 3PSVA 1VCVA 3O05A 3N73A 4XBSA 4MLJA 4MJZA 1S3HA 4NXSA 2GQ9A 1VQTA 2FQIA 4DO6A 3ATYA 4IWWA 3M7WA 3JRKA 3ANYA 3L0GA 2NWRA 2OCZA 4L4LA 2CLKA 2NUYA 3E02A 5U4NA 1EIXA 1HUVA 2QJGA 3UZJA 1XC4A 3NQEA 4PA8A 3W7CA 1L9WA 1MSSA 2RDWA 3JR2A 3B0UX 2H3BA 4Q32A 2CLLA 1KLYA 4KFNA 4HNVA 4MJMA 3LLDA 2QUVA 2QDGA 1NVMA 4AHPA 4QM1A 2G5WA 4YCOA 2A1YA 3THAA 1NEYA 4NVTA 1RV8A 2J9XA 4JTTA 4JNMA 1TPDA 2OZ0A 3NA8A 4IJBA 3HB9A 1OK4A 1PS9A 5HNRA 2Z0IA 1JQXA 2B0MA 2CLHA 2VENA 1G4PA 2Y89A 1H62A 4PCFA 5LNVA 4CQAA 1SSGA 4Y96A 1QFEA 3B4UA 3ZR4A 3W7KA 1F2JA 1X1ZA 3KFTA 3LI0A 5E1QA 2VEPA 4DO5A 4M7TA 2OMAA 2R91A 2GUUA 2NXHA 3LHYA 1AK5A 2QCDB 2CWNA 2E6AA 4HN4A 3N9SA 1QPRA 1ZAHA 2AAMA 4O4VA 2G97A 1ZNNA 3CPRA 1H1YA 1M6JA 1OYCA 1F74A 2RH9A 3R12A 3TIMA 1Q6OA 2ZRXA 4EOUA 3F4WA 1V5XA 4KKXA 1PV8A 1TPEA 1HO4A 4JYEA 4AF0B 1WX0A 1YXDA 1SO6A 4S1FA 2E5BA 2PE4A 3TMQA 3OBKA 3WK0A 2VFFA 2JKAA 4RV8A 1O60A 2GJNA 1RD5A 3NL5A 3E0IA 3S5NA 5CZJA 1WAUA 2J9YA 5CGQA 5FEZA 2A6LA 1R47A 1I2PA 3FJ6A 1VRDA 1RPXA 1WDWA 1JR1A 4QNWA 3QQ1A 5K9DA 5A8GA 2VEIA 1H5YA 4LC6A 4QSHA 1I2QA 3SFKA 4NX5A 1ZAJA 3IGUA 3KAOA 1HG3A 1W37A 4JTLA 3TSMA 3PUDA 1N7KA 2A85A 3W7LA 4O28A 3WK1A 3QC3A 4FIQA 5DXYA 2ISWA 4HNUA 3CU2A 2RKXA 5AYZA 3BW4A 2ZYFA 1KV8A 1K7XA 1EB3A 4NX0A 4RCXA 1FCVA 1VCGA 3E96A 3FYPA 4I7WA 4FNQA 4RZ4A 5HUPA 3HGSA 3ZWSA 1RQEA 1YDVA 3OVRA 3FFSA 3LHTA 5HULA 1W54A 1UCWA 1OFBA 3HO8A 3GZ3A 3HG4A 1JUKA 1TCDA 1XL9A 5T26A 3WK2A 4JTUA 4L4MA 4WOQA 4ORIA 3EX3A 4YL2A 3SGZA 1SPQA 3VE7A 3C8FA 1OFPA 2CFFA 2V8ZA 5DBTA 5D2XA 5HJLA 5I3KA 4R34A 1W5OA 3PVFA 3G24A 3W71A 1K7FA 4AWSA 3QMSA 2H8XA 1YTEA 2X1SA 1DVJA 3O6YX 1KFJA 2RHGA 2V30A 3PULA 2X30A 3NQFA 3HIJA 2WO5A 3C0JA 4MY9A 2NX3A 4OQVA 2DJXA 3GVGA 4Y6GA 1WOBA 3DFSA 1KFCA 4C1KA 3DI1A 3O6DA 3W1PA 3G0UA 2VFDA 3O63A 2DP3A 1W3IA 5LKYA 1O5KA 1KTCA 1T96A 3LCIA 3STGA 4Z1BA 1YDNA 5TIMA 1JCJA 3QSRA 3LCXA 1DV7A 4I7UA 5KINA 3O16A 1A5CA 1B9BA 3VKJA 2J24A 4NNBA 5DELA 4O1BA 3M5ZA 4MZ8A 3SJ3A 2PCQA 1IXQA 1Z48A 4ZQMA 1ML1A 2PC4A 2ZRUA 3FJLA 1ICPA 5I3IA 3W7JA 5KZMA 3PR2A 2ALDA 4AHOA 2YZRA 2X2GA 1JUBA 1JULA 1OX6A 5FEPA 3UXAA 3TQKA 1EWEA 5F1UA 2C15A 1OX4B 3TUUA 1XUUA 3B8DA 3KX6A 2XN0A 4ALDA 1KM4A 3CC1A 5HR7A 1RVGA 4EF8A 4NJHA 3DHDA 2CW6A 3ELFA 1TREA 4BK9A 2EHHA 5HR6A 4UFIA 3S0CA 3OG3A 2ATSA 3W1XA 4GXMA 2QCEA 3WJZA 3I65A 1VLIA 1L6SA 1I4NA 1TPUA 2W0UA 4H4IA 3BLEA 3IVSA 4OT7A 4JTEA 3MHGA 1KV5A 4WXYA 1LZOA 3KRZA 5C2XA 1NFBA 5HUOA 3P74A 1FY6A 3DENA 3SI9A 4MYXA 1ME7A 1G67A 3N2XA 1UB3A 5BW6A 1SUXA 2YYUA 1MEWA 2ZRWA 3LI1A 4N6EA 3U8GA 4OE7A 3W2UA 5C6MA 3BV4A 1HL2A 4O4WA 1LOSA 4IMGA 2J88A 2V2DA 4LVAA 3W7GA 4BI7A 4JICA 5DCEA 1TTQA 4N4QA 3I7RA 4XKYB 1RQBA 1GEQA 3LBMA 1DL3A 4NQ1A 1FDYA 1FWRA 1H7NA 3TJLA 4FO4A 4UTLA 4X22A 5IM51 1W5PA 3Q2DA 3W2LA 3QJAA 1FXQA 3G1YA 5EKYA 3EKLA 1YTKA 3T40A 3W72A 3CHVA 3GYEA 3CLMA 3G3MA 4P61A 4RZ6A 1JCXA 3N19B 3P5YA 4UXDA 1WBJA 3L68A 1F73A 2OT0A 4XTIA 3MUXA 1TPC1 4N2YA 3DKJA 4YLWA 3USBA 3GB6A 2YXGA 3IVUA 4WQ6A 3TSDA 2EGZA 1VCFA 3H55A 5IBXC 2ZRVA 3EXRA 4UFKA 5IBXA 5LHFA 2E5CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1GG0 A;  1GVE A;  1OHL A;  2OX4 A;  2QCN A;  1HTI A;  3H7U A;  4OBS A;  3WK3 A;  4PUM A;  1JXJ A;  1B57 A;  2Q8Z A;  3P80 A;  1TPB 1;  4LRS A;  3KOF A;  1FXP A;  4V27 A;  5EB8 A;  4N9C A;  2WKJ A;  1GVO A;  1LL7 A;  2NQH A;  4W8B A;  1Q7M A;  2ZA3 A;  3ARQ A;  1OZQ A;  4AZH A;  4FXS A;  3O6A A;  3LPG A;  3DEC A;  4JPG A;  1KXV A;  1ZJI A;  4NG3 A;  3GU9 A;  1B4K A;  1S2T A;  3FHQ A;  3RF9 A;  3WQW A;  3CB8 A;  4QTG A;  2DY3 A;  4UCG A;  3T2P A;  3KRU A;  4NAS A;  3KS6 A;  3GRI A;  3WDH A;  2PRL A;  4KER A;  2OQH A;  3V18 A;  1FX6 A;  3G8E A;  4W9T A;  4F3H A;  2H90 A;  4CLM A;  1BYD A;  3VD3 A;  3WQO A;  3ZJ6 A;  5D9M A;  1K02 A;  4KGL A;  1SR0 A;  4I5X A;  1CGY A;  4JNY A;  2WMF A;  1UQZ A;  4ZOD A;  4XSM A;  1XHG A;  3W7N A;  5HAO A;  4O0Z A;  1YXY A;  4FLS A;  1AJZ A;  5CSS A;  2QUU A;  4IFK B;  4EPE C;  4JIQ A;  4MNM A;  4CD8 A;  3LSC A;  3LHV A;  3NDY A;  5I2U A;  1PKN A;  1XBY A;  3BC9 A;  3BSG A;  1KC7 A;  1RHC A;  1IEV A;  4F4R A;  1RQH A;  2P50 A;  2QDD A;  4HME A;  3OBE A;  4O15 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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