3R8RA

Transaldolase from bacillus subtilis
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
sequence length
212
structure length
212
Chain Sequence
MLFFVDTANIDEIREANELGILAGVTTNPSLVAKEANVSFHDRLREITDVVKGSVSAEVISLKAEEMIEEGKELAKIAPNITVKIPMTSDGLKAVRALTDLGIKTNVTLIFNANQALLAARAGATYVSPFLGRLDDIGHNGLDLISEVKQIFDIHGLDTQIIAASIRHPQHVTEAALRGAHIGTMPLKVIHALTKHPLTDKGIEQFLADWNK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase
molecule keywords Transaldolase
publication title Conservation of structure and mechanism within the transaldolase enzyme family.
pubmed doi rcsb
source organism Bacillus subtilis
total genus 75
structure length 212
sequence length 212
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J, K, L, M, N, P, R, T, U, V, W
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2011-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3r8rA00
1B3OA 3MHGA 3NO5A 4Y8FA 2F7FA 1PCKA 4E2BA 4LW7A 4OGZA 3R13A 4FX6M 2ZYFA 4M5PA 3HPSA 2VELA 4CNPA 1FDZA 1UCWA 1OFEA 3I68A 5CZSA 2C16A 1WXJA 3DH7A 1S3HA 4LTSA 1A5CA 3GXPA 3M43A 4RXGA 4O4WA 3W7EA 2V2HA 1E51A 3SGUA 5MHBA 3DI1A 3FKRA 2QJGA 3MJYA 2NXGA 3W22A 5D33A 3LCHA 1XDMA 1XL9A 5G4EA 3CC1A 3TNOA 2GUUA 5HMSA 4NZJA 2YW4A 3HBLA 8TIMA 4JTFA 4MVAA 1B4EA 3USBA 3LBCA 2FB2A 4JIQA 3W1XA 3PUOA 1OYAA 5D2WA 5HJLA 3GKAA 1VRDA 5F2GA 3RU6A 2Y61A 2RKXA 3RLVA 1XBVA 4OU1A 1YPIA 1VPXA 3DFQA 1I4NA 4UTMA 4BWLC 4FEZA 1ONRA 4R33A 3TMLA 4ML9A 1IXOA 4EVZA 2QCLA 3JS3A 1ZAIA 2QCGA 2J24A 2RDUA 1SZGA 3GNNA 1OX4A 1QPOA 4QNEA 3NAVA 3MI2A 4WUIA 4O0KA 4LRSA 4N9EA 2A7RA 3TV8A 1EP3A 1KFJA 2BZNA 1H7NA 4Q33A 2J88A 5LNWA 5EMUA 3PS7A 1YTEA 3WK3A 1SZNA 2V5BA 5FEWA 1WBHA 3L9CA 3NQCA 4UTUA 2J27A 4NQ1A 1N7KA 3U6WA 1YXDA 1EP2A 4NXSA 4I9AA 2G96A 2Y63A 2WNNA 1VR6A 2VFFA 1TQXA 1OFPA 1PVNA 4RK8A 3Q2DA 2ZTJA 3SECA 5KZEA 3NA8A 1KM0A 2C19A 1LROA 3TAOA 1TPEA 1Q6QA 3M47A 4PFMA 1EEPA 1FCBA 3NZRA 1AK5A 5K9DA 3DZ1A 1G67A 2YYTA 3MHFA 2YX0A 2ZA2A 2A6NA 3BV4A 4CCDA 1W1ZA 4QITA 4DPPA 2ISWA 4N6EA 3TC6A 1K8ZA 2V82A 3LTPA 3LTYA 3O63A 1LDCA 1F05A 5C2XA 3C61A 3E96A 4MOZA 5T26A 3SW6A 3F4NA 3W71A 3W7CA 1UBSA 1EWDA 2RDWA 3O6DA 5DBTA 3CTLA 2Y6ZA 3OVPA 3MUXA 1DL3A 4L4LA 2TRSA 2R8WA 3LDVA 1QNVA 3C3NA 4NNBA 3TQ0A 2NX1A 4WOZA 2JKEA 3C52A 1OYCA 3PB0A 4TU1A 4WQ6A 3UWYA 3BW3A 4IX0A 2RHGA 2HMCA 3N19B 4JX5A 1HO4A 4O14A 1U5JA 1ME7A 2ZRZA 4MZYA 1RQHA 3S8HA 2ZBTA 5DCDA 4O4VA 1Q3NA 1F6PA 3SSJA 3NPUA 1Z41A 3W2LA 4NNAA 2C14A 3UWUA 3LCXA 1ALDA 3NQ2A 5A8GA 3L66A 3UNDA 3GYEA 1VCFA 2F84A 4O53A 4UTIA 1DORA 3QW3A 2ISSA 3QFEA 2CLEA 3EXRA 3S1VA 4AF0A 5DBUA 2KZHA 3TR2A 2FIQA 5A5WA 5CPOA 3NEVA 3V75A 3S1UA 3PSWA 1AG1O 3RNDA 3HG2A 3UWWA 3D0CA 1ZCOA 2QUUA 4ZQRA 4MIMA 5KITA 3IIZA 4L4MA 2YCEA 5E1QA 2RDTA 1LP6A 3L21A 2GQAA 1DQWA 3CIWA 1G4EA 3STEA 4UTJA 6ALDA 1GWJA 1PS9A 1WQ5A 3A22A 3W2KA 3KX6A 4ALDA 3QSTA 2FJKA 1PIIA 2QF7A 1TRIA 1WA3A 4CNOA 3W7JA 4LT9A 1QPNA 1OHLA 1GPWA 3LB0A 3R2GA 4K37A 3CIXA 1K3UA 3A21A 3P82A 3TU9A 5HQEA 3TCEA 4ORMA 3NQDA 4OWGA 3P81A 2YR1A 1NFBA 2FDSA 4Z1CA 1OF6A 4DF1A 5K4ZA 3WK0A 4MLRA 3CPRA 3OIXA 1J2WA 1DOSA 1DV7A 1Z48A 1LRNA 1KV5A 2CZDA 4UMAA 1JUBA 2QDGA 1H5YA 3TC7A 3R5EA 4BI6A 4MFDA 2QCDA 3QM3A 4A22A 3VE9A 1K7XA 2P10A 4LS0A 4X3ZA 1PV8A 3MO7A 3GB6A 3WJSA 1G69A 5D05A 3FLUA 4U28A 4K39A 5LHEA 1ML1A 3LHUA 4IJBA 4N2YA 4A21A 3IVTA 4K7YA 1ZJIA 2Q3OA 5D2YA 3E12A 1K03A 4R53A 1QO2A 3LCIA 4Q32A 4GUHA 4DO5A 2R14A 1JUEA 2J9XA 1GTEA 3MWAA 1CW2A 2B4GA 4A2SA 4LVGA 2A7PA 4C1LA 2ZZ5A 1LTDA 3C0JA 3TQVA 1MXSA 2CZ5A 3OBKA 3PSVA 3W7DA 2ZQ0A 1AW5A 1XFBA 4CLMA 3P61A 3JRKA 2Z6JA 3PULA 4NX5A 5F2LA 3TFXA 3LI1A 1BWKA 4NU7A 2QCMA 2EPHA 1KW1A 3F03K 3NM1A 2V5LA 3FOKA 4IPIA 2ZZ7A 2J9ZA 3E0IA 2Q3RA 3LXBA 1SR9A 2GVGA 4MKNA 5IBXA 5G2IA 1G4PA 1FWNA 2A4AA 1X1OA 3QC3A 3EX1A 3TROA 5LHFA 4MY8A 3IVSA 3HJZA 2Y7EA 2ATMA 2PRLA 1YTDA 5HULA 3UD6A 3DFTA 1O5KA 4LC8A 1I2OA 3JR2A 5BMXA 4FHAA 2HSAA 3IRDA 3UPBA 3HO8A 4UFKA 5J5RA 1P0NA 3I6RA 5AYXA 5F2MA 2JK2A 3LCLA 1FWWA 2JGYA 2Y70A 3GZ3A 3NG3A 5SWUA 1TV5A 1X6UA 2V2CA 2WSRA 3PY2A 1W37A 3MMTA 3PG9A 1NF7A 2Q8LA 1TPH1 4GBUA 3NGJA 3ANYA 4QSHA 3M5ZA 3WJWA 3F1QA 4O17A 4EF8A 4O0ZA 3HIJA 3MP5A 4PH6A 1SW0A 4QQ3A 4PL2A 4HNNA 1TPUA 1J4EA 4HNTA 3O06A 1GVFA 4NJJA 3LOTA 3S0CA 4TX9A 4H3DA 3STFA 3NL3A 4MYXA 3EXTA 3UXAA 2HTMA 1VLWA 4JTGA 1RR2A 5I3HA 1UB3A 3BGJA 5G1YA 3O15A 4J9JA 1W3IA 1P0KA 4JY9A 3KVKA 1L6YA 1SPQA 4AEOA 1YLVA 3SY5A 5F4WA 1QWGA 4D2JA 2C3ZA 2TSYA 3T44A 1QR7A 3HGRA 1KFLA 5LNRA 3ZFHA 2VXNA 2NWRA 3DFNA 4WY0F 1UUMA 1YDVA 1JUKA 2NV1A 3ABOA 4LNYA 4UFHA 3EWXA 3T78A 3MP3A 1X8FA 3DFOA 1VLIA 2QCEA 4CCCA 4NJIA 3W2NA 3OVRA 3NOEA 3LCWA 1PHQA 4JGDA 5FF0A 4A3UA 1W5OA 4GRSA 4JR5A 1QPQA 4IUOA 4GUFA 4K7VA 4WXYA 1RQBA 1TPVA 2Y89A 1G7UA 1F2JA 4GUGA 3TUUA 3IGSA 3R12A 3W70A 1X7FA 4R7JA 1EX5A 2ZTKA 5EBUA 1ICPA 4DEFA 2NV2A 4AH7A 3DHDA 5D03A 5K2ZA 4TMBA 3UWQA 3EWBX 3SJ3A 5EA9A 4JD4A 4AHQA 4O19A 2DZVA 4LS2A 3MYPA 1SFLA 1WYIA 2XN1A 4K36A 1XDLA 4JTEA 2UV8G 3C2OA 4AXKA 2XN0A 4TIMA 3HF3A 2JKPA 4NX0A 3B05A 3G1VA 1PHWA 3BG9A 3SIZA 2C18A 3O8AA 3ABSA 1P1XA 3LX9A 1W3NA 4EWND 5HINA 2G97A 4Y90A 1EUNA 4FIRA 3HGSA 2PE4A 3QYQA 2YSWA 3NQAA 3UZJA 3BG5A 4UTKA 1FCQA 4BFAA 4HNUA 2VEIA 1VS1A 5HWJA 1KM4A 1SW7A 1IXNA 1DQXA 1FWSA 3KXQA 3EX6A 1IF2A 1KFKA 3G18A 2DORA 3BLIA 5DXXA 1VCGA 3W72A 4JEQA 4ADTA 2B7PA 3NQMA 3PM6A 1FY6A 3QPZA 5TQLA 3WJXA 4Z1AA 2X1UA 1YXYA 1WOBA 4O8RA 4UTLA 1RV8A 4FXSA 1LCOA 2IQTA 1JCMP 1JCLA 3TMQA 1TSIA 1UUOA 1QMLA 1TJRA 4RXFA 1QCWA 3S6DA 4GFSA 2CWNA 4WD0A 1O5XA 1LBFA 3DENA 5E0KA 3Q37A 4IPJA 5LNVA 4MY9A 2A6LA 4FNRA 1OFOA 4JN6A 4FB7A 3P67A 3W7IA 4LV9A 2JGQA 2CW6A 3CWNA 1GQNA 3VFLA 1OFRA 3W2JA 4Y96A 2A2IA 4HPJA 2C0AA 2YPIA 4O50A 4X9SA 3W6YA 2E6FA 4MY1A 1A53A 4ZZ9A 4HSNA 5AC6A 2FFCA 3N3MA 3SR7A 1H61A 5F4SA 1M5WA 3IIPA 1Z44A 1X1ZA 2NLIA 2QEZA 2GJNA 1OX5A 1R46A 3W1AA 3DHFA 4AWSA 3WJZA 5DELA 4B5NA 3LXAA 4PTNA 4BR1A 4N9DA 4ZQOA 2ALDA 1KTNA 2VFEA 3EWYA 1O60A 3G1HA 1Q6OA 4JTKA 2I9EA 3G3MA 2WJZA 3GXTA 1XXXA 4A2RA 5IM51 4RCXA 1TMHA 3GAKA 1EWEA 1GG1A 4DBEA 2PRMA 4O18A 5H2ZA 4X22A 4DQWA 2A5HA 3HG5A 1ZALA 4JDBA 3N9SA 3G1YA 4MLJA 5LNSA 4GNJA 3NPWA 3GDRA 4OT7A 3GDKA 5I3GA 2B0MA 2OJPA 2NUYA 5GVJA 2CZFA 1ICQA 3LM7A 2A7NA 5HWNA 3TXVA 3SZ8A 5D2TA 1JRBA 4JY8A 3GR7A 4EF9A 4AMAA 2X1RA 1AW2A 4JDYA 3R89A 5HR7A 5AHFA 2GQ9A 3CU2A 3BK0A 3STGA 2E6YA 3DAQA 4DO4A 1GOXA 1L6WA 4AF0B 2R91A 1H62A 4MPQA 1AW1A 4GC4A 3PB2A 3TX9A 4IXXA 1XBZA 3ZWSA 3L5AA 1LRTA 4CQAA 3PUDA 3C8FA 4QAIA 1D3GA 5J5DA 1O94A 3F4WA 2Y85A 2QUTA 1W5PA 1LLWA 1GYNA 3W1QA 3LLDA 2ISVA 2EHHA 1KV8A 2V2DA 3GR8A 5IBXC 3TJLA 3R8RA 4N9BA 1Y0EA 1JR1A 4IGHA 4MZ8A 1F6KA 5C54A 3PAJA 2DJXA 4YCOA 2QAFA 5CSRA 2Y62A 3FS2A 3UQNA 3W7MA 5CPLA 4JTIA 7TIMA 4JICA 4PA8A 1GZGA 3B04A 2WQPA 3EKZA 2W0UA 2E6DA 4FNPA 2WSQA 3A9IA 3KRSA 4LUIA 2I14A 1H1ZA 2XFWA 4LV4A 5G1TA 3W85A 1JCXA 3G1XA 4N02A 2Y7FA 4IMFA 1H60A 3ZR4A 4XTDA 3NQ8A 5AN7A 1XC4A 1H7OA 1I2QA 2GOUA 3PVFA 1W5NA 4UFIA 1I2NA 5FI8A 2DJLA 3QMSA 3NQVA 2VEPA 2EGZA 3BG3A 4O1BA 4MFEA 1JCNA 1C9DA 1LOSA 3EX2A 4K8HA 2EKCA 3HPXA 3MYOA 4Q4KA 3W1MA 1KFBA 4LVDA 2E1DA 5I3IA 1MEIA 5CG7A 4WX2A 3LERA 5DXYA 1F5ZA 2VENA 4AWTA 5CGQA 3NL5A 3UY8A 2LLEA 1DKWA 5ABTA 1K7FA 3GIYA 3LV6A 3M1ZA 5D38A 4E2DA 3DXIA 1AL7A 4QJ1A 3W7NA 3LHYA 3QPYA 1LLZA 1Q6LA 3G1AA 1ZAJA 2PCQA 4Z0SA 3H53A 3VI2A 5EPDA 1YDNA 5FF3A 1DJQA 5AHLA 4S2BA 1GTHA 4W9TA 1JCYA 2YGYA 3OA3A 4KFNA 3QMRA 3TE9A 1VHCA 3W2UA 3OG3A 4ORIA 4DPQA 3DFSA 4H4IA 5BMWA 1H7PA 1M6JA 3FIGA 1IGSA 1GVQA 1OFAA 4P61A 3RF9A 4RKAA 4DELA 5I3FA 1VCVA 2XN2A 2VFDA 1KLZA 5HNRA 5I3JA 4DF2A 1XUZA 3W86A 3B03A 3QEZA 1YYAA 3OEXA 4ZQCA 1HL2A 4JS3A 2ZRXA 4LUJA 3UYCA 1T99A 1LBLA 4CQ9A 1IXPA 2X1TA 1GG0A 1HTIA 3V1PA 4NJGA 4GE8A 3Q58A 4N4PA 4DBDA 3CLMA 3RLUA 3W7PA 2Y7GA 2O7SA 4XBKA 3G8EA 3HPZA 4O10A 4KWVA 1H63A 2A0NA 4JYEA 1RD5A 2BTMA 1UJPA 1TREA 2RH9A 4HT3A 3B0PA 2VEKA 3NL6A 3CEPA 1KM5A 2GJLA 5AOUA 3G8RA 3LRLA 4NJKA 3NXFA 3O6YX 4NZFA 1TO3A 3TXZA 3W23A 4WJEA 4JIPA 3LHTA 5CKSA 1NF0A 3ATZA 1HO1A 3LCFA 1EP1A 1OYBA 2FTPA 3NQGA 5FEZA 4NUWA 3BW2A 5EL1A 1QFEA 1VGAA 3ABQA 1L2UA 2E5BA 2BX7A 1TPDA 4KFOA 2YFNA 2E77A 5H91A 2QJHA 2YXGA 3TW7A 1G4SA 4AVFA 1FX6A 3MBDA 4AHOA 1VZWA 4K38A 5C55A 2X2GA 2GQ8A 3N9RA 4M19A 2DZUA 3C2FA 1G4TA 1SUXA 1TPWA 5KMYA 2E09A 4XBSA 3G0SA 3S1WA 1M7PA 3LRMA 1OX6A 1ZFJA 3AO0A 4E0CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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