1E72M

Myrosinase from sinapis alba with bound gluco-hydroximolactam and sulfate or ascorbate
Total Genus 199
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
199
sequence length
499
structure length
499
Chain Sequence
EITCQENLPFTCGNTDALNSSSFSSDFIFGVASSAYQIEGTIGRGLNIWDGFTHRYPNKSGPDHGNGDTTCDSFSYWQKDIDVLDELNATGYRFSIAWSRIIPRGKRSRGVNEKGIDYYHGLISGLIKKGITPFVTLFHWDLPQTLQDEYEGFLDPQIIDDFKDYADLCFEEFGDSVKYWLTINQLYSVPTRGYGSALDAPGRCSPTVDPSCYAGNSSTEPYIVAHHQLLAHAKVVDLYRKNYTHQGGKIGPTMITRWFLPYNDTDRHSIAATERMKEFFLGWFMGPLTNGTYPQIMIDTVGERLPSFSPEESNLVKGSYDFLGLNYYFTQYAQPSPNPVNSTNHTAMMDAGAKLTYINASGHYIGPLFEKDKADSTDNIYYYPKGIYSVMDYFKNKYYNPLIYVTENGISTPGDENRNQSMLDYTRIDYLCSHLCFLNKVIKEKDVNVKGYLAWALGDNYEFNKGFTVRFGLSYIDWNNVTDRDLKKSGQWYQSFISP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
publication title High resolution X-ray crystallography shows that ascorbate is a cofactor for myrosinase and substitutes for the function of the catalytic base.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MYROSINASE MA1
total genus 199
structure length 499
sequence length 499
ec nomenclature ec 3.2.1.147: Thioglucosidase.
pdb deposition date 2000-08-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
M PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1e72M00
2J8GA 3OGVA 1E0VA 4BZYA 5D4YA 1US3A 1MQPA 4PEEA 3T0DA 2UY3A 1CEOA 1OT2A 2JALA 4W84A 1C7SA 4PSRA 3BLPX 3WQWA 3GXMA 1E43A 4J3TA 5JBDA 5A94A 4B3KA 3AICA 4OZOA 2J4GA 3SCNA 1J01A 5M03A 1U33A 1VRXA 5BRPA 4LYQA 4UQCA 3VMOA 2VL4A 1OM0A 4FLOA 1TA3B 4AEFA 5CQ1A 2VVSA 5C8BB 4J3WA 4B15A 4AZHA 1KWKA 1BG4A 3ZQ9A 4M82A 1WDRA 1JYVA 4N0RA 5JUVA 1OIFA 1UWUA 2Z1SA 2WCGA 1WDQA 5BXPA 3OZPA 3KZSA 3BMWA 1CWYA 1EO7A 2VVNA 1WZLA 1D3CA 3GBDA 2JE8A 3LPFA 4HMCA 1KQYA 5E9AA 4B16A 4MAVA 2CYGA 3POCA 3OA5A 1M7XA 4JFVA 1MYRA 1UZ4A 3OZOA 3W24A 1NARA 2XGBA 3BAIA 1SR0A 1ZJAA 1V0NA 3PZMA 1WDSA 5ABEA 3DECA 1DWJM 4GKLA 5A1AA 1JZ4A 1IZKA 3AHVA 1CGUA 4CU6A 1EOMA 3MUAA 4QLLA 1KCKA 3A47A 3ZT6A 2GK1A 5E6ZA 1OD0A 1MW0A 1GHRA 4TUFA 3OLDA 4LGXA 3VD3A 1UQZA 2DSVA 5ECUA 3DHPA 3ARWA 3AIBA 1XH1A 2WANA 1CXLA 1UKTA 2GJXB 1HL8A 2VZVA 5IFPA 1CXEA 3RJXA 1UR4A 1H1NA 1ISZA 5A69A 3A4XA 2ZIDA 1E0XA 5I5RA 4M81A 1C3FA 4U2YA 4MB1A 1CGYA 4Z2HA 3WKZA 4MDPA 4JHZA 4P7OA 3U7VA 1JXJA 1WP6A 1NM9A 4PMDA 4PUDA 4UQDA 3AMDA 4D6FA 1E6RA 5HXMA 2WVVB 3ZR5A 3PZVA 2BVYA 1CPUA 1V0KA 3VIFA 3AIEA 1GQIA 1NWRA 1CBGA 4H41A 2DSWA 3TA9A 5IDIA 1WPCA 2OYLA 2WKLA 1E3XA 4UTFA 2XIIA 3TTYA 4BQ4A 2WSPA 4JKLA 1TVPA 3SCPA 2VCCA 5EFFA 1HL9A 2E9LA 3MUY1 3WNLA 5CXPA 2EPOA 3RM4A 1UUQA 1V3HA 4FLQA 2PWGA 1CENA 1BYCA 5HDRA 2BFGA 3RM9A 5DEZA 1WO2A 1Z32X 3T2OA 3MV11 1HP4A 5I2UA 3TTQA 3TOPA 1DTUA 4D6HA 3I3BA 3OGSA 2XVKA 3K8MA 1GVYA 4E4PA 2VI0A 4HP5A 1E5JA 2DGAA 3MUZ1 4N42A 4W8AA 1HJVA 4NRSA 3F5KA 1V6WA 4AEEA 2O92A 1EDGA 2FHBA 3WF2A 4R27A 4TX8A 2VZOA 3KL3A 1KXQA 4MTVA 2J47A 1XH2A 3OLIA 4AIOA 4MB3A 2DDXA 1CYGA 2NT1A 2CITA 2X0YA 3CTTA 1BVNP 1E9LA 4PTMA 2J7EA 2G8ZA 2E3ZA 1FHLA 1UKOA 2O9PA 4DM2A 1W9UA 1ZJBA 3TTOA 3MUIA 1Q6FA 3WNPA 2ZUVA 5BCAA 1E70M 3W38A 1GZJA 8CGTA 2G3JA 3VDAA 2G3NA 3DYMA 1BYDA 4AD1A 5BROA 4BCEA 2W61A 3VM5A 4HA1A 3K46A 1ITXA 3W25A 3GBEA 5CGMA 1AVAA 3FAXA 1G94A 3PHAA 3VNZA 1JZ7A 3AHYA 1UD3A 1CDGA 3QGVA 3CZKA 3VINA 3CMGA 8A3HA 5DT7A 5E6YA 4R5EA 1CXIA 2BV9A 1GHSA 4CD6A 1JYXA 4CGTA 5A2BA 4CN1A 4JL1A 3AS0A 2X8RA 1GOOA 4EAMA 2VX7A 1OGSA 1UR0A 4GI8A 1AMYA 5A6KA 1BF2A 1NQ6A 4IISA 3T09A 5A8NA 2XYLA 4FMVA 2YDQA 3GXFA 3LPOA 4Z2JA 4B3LA 4AD4A 2YA0A 4JFUA 3L4UA 3AROA 3RIKA 4RE3A 1TG7A 4JIEA 4PTVA 3ZSSA 2JF7A 1JF5A 1E73M 3CUIA 1W32A 2WCSA 1R87A 5D9PA 1C93A 3AMCA 3WD0A 4D6DA 4WSKA 5BXSA 1VB9A 3PZOA 4WLCA 4K68A 5I78A 1E72M 3N12A 4B9YA 4D1IA 5GNXA 1BSIA 2XVGA 2WBGA 3CHDA 4W5ZA 3EMZA 5FL0A 3TTSA 3L4VA 3VGBA 5DMYA 4MB5A 4MAZA 3IJ9A 1C91A 1R8LA 3N11A 3RJYA 1UH2A 4UNIA 1J0IA 1B3WA 1CGXA 3W27A 1K6AA 1W9DM 4JHOA 1QHPA 3NUKA 3RCNA 4D6IA 2DT0A 4HA3A 3VDBA 1V3IA 3GH7A 2OLHA 5I3DA 5D9OA 5M17A 4NF7A 3M6DA 4IPNB 1PPIA 3GXDA 5D9MA 1RPKA 2VCAA 2WLZA 5LA1A 3SCTA 2HISA 2VOTA 3KL0A 3M46A 4WIWA 3U5YA 5HBFA 1R86A 2X09A 1BQCA 1MQQA 4C7DA 4RL3A 2ZUSA 2XVNA 3EMCA 2W91A 2DT3A 2EXOA 3WENA 1BG9A 3VD5A 4AZCB 2V38A 1I1XA 4E2OA 1ZS2A 1JAKA 1GNXA 2ESCA 3BAWA 3MMWA 5CPQA 2Y8KA 3SCRA 4P8VA 4W85A 4J7RA 1JZ2A 2VCBA 4GZEA 2OWCA 3NSMA 4CD7A 1BYAA 1MVYA 4GI6A 4J28A 5D8ZA 4UFJA 1UA7A 1H09A 3EDEA 3UR7A 1HVQA 3ARTA 4M80A 2YA2A 1KBBA 3UG5A 3ARSA 4HU8A 1LLOA 4HOXA 3IAPA 1D7FA 3OLGA 1LG1A 2XFYA 5GQBA 3SCVA 2J7HA 1KR0A 5E70A 3NYDA 1UWTA 1UQYA 4GQRA 2CEQA 5I24A 1NP2A 1HJUA 2VC9A 1QNQA 1BYBA 1JZ5A 1UR8A 2BVTA 4AIEA 1E1FA 1GOKA 3CHFA 2A3BA 4GO9A 4TTGA 1Q6CA 2OWXA 1OT1A 3ARUA 4GXPA 1M53A 3WF0A 3CLWA 2WHMA 3U5UA 3VIGA 3GYCA 1HJQA 3DC0A 1KGWA 4UZSA 4EE9A 4AD0A 1CLXA 3CZGA 2OYKA 1CECA 1XHGA 2EPNA 2W67A 2A3CA 3QOMA 2YBUA 1U2YA 1C8XA 1JGIA 1W9XA 1FHDA 5EMYA 2CKSA 2YL6A 3ZOAA 4ZENA 2XJ7A 4PUEA 1HJWA 1PIFA 4QAWA 1I1WA 3WFLA 1B30A 1Q6DA 3JUGA 2ZX9A 1BVZA 2VJXA 4TXEA 4P7LA 1ITCA 4QCFA 2VZSA 1KQZA 2Y5EA 3AISA 3CIVA 3EDFA 4U5IA 1UWSA 2VZTA 3PZ9A 1PJ9A 4AW7A 3VDCA 4OUEA 3W26A 3L4TA 2RGMA 1JFXA 3CO4A 3KL5A 2WWCA 3L4ZA 2CERA 1D2KA 1LG2A 2WSKA 4CCEA 2WB5A 1QBBA 1JI2A 3AHTA 2DPEA 1JAEA 4ML4A 2UY4A 4KWUA 1E56A 2BHUA 2WM0A 3U57A 1JL8A 4PMQA 4EK7A 4CD8A 3NDYA 1H11A 3ARPA 2QF8A 2Y4SA 4M1RA 4D71A 1U30A 2XSBA 4AZ5A 3U7BA 2XPKA 3WDQA 1UOKA 5M3WA 1GOQA 3I3DA 1E1EA 1Q4NX 2W4XA 3RDKA 3WL1A 4NZCA 3WD2A 1UHVA 4MNMA 4A3HA 4BF7A 5ABFB 2EPLX 1X6LA 1V08A 4CKQA 3E1F1 4HMEA 5EFDA 1SMDA 2IXUA 3ZM8A 2VX6A 4M29A 3WQ4A 3ZR6A 1XSKA 1MW2A 1J0HA 1IV8A 2O9OA 4J3UA 5A95A 3THCA 2CBJA 1EA9C 3VIJA 4AC1X 1UYQA 3RPMA 1EHNA 1W3JA 2DT2A 3K4DA 1EIBA 1YHTA 3BC9A 3GXIA 4M8UA 1TVNA 3WMBA 1J11A 4ATWA 4L4PA 3OBAA 5LYRA 1WZMA 7A3HA 2YIHA 2O9TA 3WF1A 1UD4A 4DWSC 3HJEA 3WDHA 2JF6A 2VR4A 4WF7A 2O9RA 3ARYA 2PF0A 1M03A 2WMIA 4GZJA 4P8UA 3WUFA 3SUSA 4WKHA 3SCSA 2QMKA 3POHA 1A47A 1W3LA 1NOUA 3BMVA 2QV4A 4ACZA 2VRQA 3BCDA 3DYOA 4GPNA 1HF6A 1PX4A 1GJUA 4CN4A 3AMGA 1E6NA 3W53A 2XWEA 1E6XM 3WUEA 4ZE4A 2J7BA 5GNZA 1E5NA 3UEQA 5BXRA 1GQJA 2WZEA 4AD5A 1NWSA 3VIHA 1CXHA 3VTRA 5A6LA 1R85A 5FKYA 3W37A 3N13A 3WDJA 1KXVA 5EB8A 3AS2A 1C90A 1VEPA 3CUGA 3BAYA 3CUHA 1PIGA 1I75A 1B3ZA 2BVDA 2PWHA 4U5KA 1H41A 5JIPA 2JIEA 3ZT7A 3W28A 1DWIM 2D2OA 4F9DA 1JG9A 2D20A 5EBAA 2PB1A 3BSGA 4GIAA 2ZUWA 3PZUA 2PBOA 1K9DA 3VIPA 1FP8A 3F5LA 1XCWA 2QHAA 5CJ5A 1DP0A 1QI0A 2X1IA 4AISA 2YBTA 4LQ1A 2JEPA 4W93A 3VNYA 3VX0A 1BAGA 3N18A 2V3EA 4W7WA 4IUGA 1QW9A 2OSYA 3UR8A 4BQ5A 1JZ8A 1Y7VA 3A4WA 3BXWA 3KE0A 4UQBA 5DF0A 4XUYA 4FK9A 3IK2A 2PWFA 2VT0A 2CXGA 5C70A 1KCLA 1S46A 1E71M 3B9DA 1B3YA 4RE4A 1G01A 2YA1A 5AC5A 3MU7A 1VFOA 1BPLB 5JBFA 3BAKA 5CPSA 1EHAA 5FL1A 1UWIA 2WMKA 4MJ4A 2FDMA 2WVTA 2YDRA 1QHOA 5BXTA 3WNOA 3ZMRA 2YLAA 3ARXA 4ZFMA 4A3YA 3CZ8A 1E6SM 6TAAA 2ZXQA 4PSPA 1AQMA 3TONA 4HTYA 4UR9A 1ZBWA 3NDZA 1V3KA 4NI3A 1V6UA 1E55A 4P8WA 1XH0A 2D1ZA 5GNYA 2WMFA 3WEZA 2PI6A 2VQUA 1UKQA 3N04A 3WELA 2WHJA 4TVCA 3TP4A 4UFKA 1MXGA 1J12A 2XFFA 3UERA 3EDDA 4DWSA 2OYMA 4OKDA 2QPSA 3AMKA 1IT0A 3W82A 4UQEA 1ISXA 2GSJA 5FIPA 4PMZA 2CHOA 5A6MA 2QLYA 1KBKA 3HU7A 4HPHA 3IJ7A 3B9EA 1UH4A 1PX3A 3PTKA 4PTWA 4W5UA 2DSKA 2CIPA 1ECEA 2W92A 4UFMA 3M07A 1W1VA 4HA4A 1VBRA 2D24A 1PZ3A 1UD8A 4CU8A 4DUWA 3CZEA 1W2VA 2YL8A 1RH9A 3PTMA 3W6MA 1A3HA 1QNSA 3VOCA 3K8LA 2WMHA 3BLKA 3WD3A 4ACYA 1QNOA 4TVUA 2WYSA 3AXXA 2D23A 3VGFA 1R7AA 4KRUA 1PAMA 3WUBA 2WCAA 2WC3A 1DEDA 2J7FA 3HMCA 5A6BA 3M7SA 3BAJA 2VURA 3AZRA 1XV8A 3MSDA 1CXFA 3B9AA 3SURA 4H8UA 5AC4A 4XX6A 3FNDA 1B3VA 4X9YA 1JNEA 4CUCA 4P7NA 1WKYA 3GTNA 1DWHM 3VM7A 3SUTA 1XYZA 2VUYA 1ISVA 2J8FA 5HOSA 1E6QM 2GJPA 6CGTA 2WHKA 1BFNA 1N82A 2YJQA 3VILA 1FA2A 1US2A 3WQVA 3K4AA 3MO4A 1JNDA 1GORA 3NSNA 2ZOXA 2G3IA 3G6MA 4PMNA 1H0IA 2V5DA 4X0NA 3AIVA 1HXJA 1XSJA 5C71A 1ZBCA 1G1YA 3UG4A 3WBEA 1E4MM 2AAAA 4ATDA 2GK1B 2HVMA 2AOSA 4W86A 6A3HA 2A3HA 1PEZA 3W6LA 1WNOA 5I6SA 1ISYA 1OGGA 4GINA 3VMPA 1CIUA 5A2CA 5CPTA 4YN5A 1TFVA 1W2PA 4U33A 1ODUA 3ZJ7A 1GUVA 3AYSA 1B31A 1OD8A 1JDCA 2ZWYA 2XTKA 2VRKA 3HN3A 1J0YA 4PCSA 1UWRA 3K1DA 1VFMA 2CBVA 1ZBVA 4TOQA 2ZE0A 3A6OA 5ABGA 5CSYA 4V27A 3GNRA 3VU2A 4AWEA 3WF4A 2YLLA 3ECQA 5JIWA 5IFTA 4MB4A 2VX5A 4QLKA 1NWTA 3OLEA 3OB8A 1JD9A 3FHQA 1UKSA 3NIYA 2WZHA 1J10A 4ZEPA 1HVXA 4P8XA 5A2AA 2Y2WA 3VVGA 1KXTA 4CD5A 1LQ0A 2BXYA 5HPOA 1V6VA 1WZKA 5M5DA 1QBAA 3WUGA 4W88A 3QHOA 3SUWA 3NJ3A 1KB3A 4U3CA 2CHNA 4HZ8A 4B9ZA 4F8XA 2W62A 1LJYA 4U2ZA 4PMOA 1J0ZA 1EQPA 1G0CA 4PN2A 1B1YA 1B2YA 1XC6A 4XZWA 1CZ1A 1SMAA 2WC7A 3ARQA 3AZSA 3ALGA 1GQLA 4FLSA 3WDPP 3T0AA 1CNVA 2J7DA 3AXHA 1QI2A 2Z1KA 1VBUA 3AHXA 1ZU8A 1QW8A 2WMGA 3MV01 3ZSTA 2BY2A 3ARRA 1V03A 1LF1A 4HU0A 3UG3A 1GOMA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2J8G A;  3OGV A;  1E0V A;  4BZY A;  5D4Y A;  1US3 A;  1MQP A;  4PEE A;  3T0D A;  2UY3 A;  1CEO A;  1OT2 A;  2JAL A;  4W84 A;  1C7S A;  4PSR A;  3BLP X;  3WQW A;  3GXM A;  1E43 A;  4J3T A;  5JBD A;  5A94 A;  4B3K A;  3AIC A;  4OZO A;  2J4G A;  3SCN A;  1J01 A;  5M03 A;  1U33 A;  1VRX A;  5BRP A;  4LYQ A;  4UQC A;  3VMO A;  2VL4 A;  1OM0 A;  4FLO A;  1TA3 B;  4AEF A;  5CQ1 A;  2VVS A;  5C8B B;  4J3W A;  4B15 A;  4AZH A;  1KWK A;  1BG4 A;  3ZQ9 A;  4M82 A;  1WDR A;  1JYV A;  4N0R A;  5JUV A;  1OIF A;  1UWU A;  2Z1S A;  2WCG A;  1WDQ A;  5BXP A;  3OZP A;  3KZS A;  3BMW A;  1CWY A;  1EO7 A;  2VVN A;  1WZL A;  1D3C A;  3GBD A;  2JE8 A;  3LPF A;  4HMC A;  1KQY A;  5E9A A;  4B16 A;  4MAV A;  2CYG A;  3POC A;  3OA5 A;  1M7X A;  4JFV A;  1MYR A;  1UZ4 A;  3OZO A;  3W24 A;  1NAR A;  2XGB A;  3BAI A;  1SR0 A;  1ZJA A;  1V0N A;  3PZM A;  1WDS A;  5ABE A;  3DEC A;  1DWJ M;  4GKL A;  5A1A A;  1JZ4 A;  1IZK A;  3AHV A;  1CGU A;  4CU6 A;  1EOM A;  3MUA A;  4QLL A;  1KCK A;  3A47 A;  3ZT6 A;  2GK1 A;  5E6Z A;  1OD0 A;  1MW0 A;  1GHR A;  4TUF A;  3OLD A;  4LGX A;  3VD3 A;  1UQZ A;  2DSV A;  5ECU A;  3DHP A;  3ARW A;  3AIB A;  1XH1 A;  2WAN A;  1CXL A;  1UKT A;  2GJX B;  1HL8 A;  2VZV A;  5IFP A;  1CXE A;  3RJX A;  1UR4 A;  1H1N A;  1ISZ A;  5A69 A;  3A4X A;  2ZID A;  1E0X A;  5I5R A;  4M81 A;  1C3F A;  4U2Y A;  4MB1 A;  1CGY A;  4Z2H A;  3WKZ A;  4MDP A;  4JHZ A;  4P7O A;  3U7V A;  1JXJ A;  1WP6 A;  1NM9 A;  4PMD A;  4PUD A;  4UQD A;  3AMD A;  4D6F A;  1E6R A;  5HXM A;  2WVV B;  3ZR5 A;  3PZV A;  2BVY A;  1CPU A;  1V0K A;  3VIF A;  3AIE A;  1GQI A;  1NWR A;  1CBG A;  4H41 A;  2DSW A;  3TA9 A;  5IDI A;  1WPC A;  2OYL A;  2WKL A;  1E3X A;  4UTF A;  2XII A;  3TTY A;  4BQ4 A;  2WSP A;  4JKL A;  1TVP A;  3SCP A;  2VCC A;  5EFF A;  1HL9 A;  2E9L A;  3MUY 1;  3WNL A;  5CXP A;  2EPO A;  3RM4 A;  1UUQ A;  1V3H A;  4FLQ A;  2PWG A;  1CEN A;  1BYC A;  5HDR A;  2BFG A;  3RM9 A;  5DEZ A;  1WO2 A;  1Z32 X;  3T2O A;  3MV1 1;  1HP4 A;  5I2U A;  3TTQ A;  3TOP A;  1DTU A;  4D6H A;  3I3B A;  3OGS A;  2XVK A;  3K8M A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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