3W7J | Genus

Total Genus 106

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	106
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-6-040 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	106
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-28

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w7jA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w7jA01

2QCDA 1SU5A 1NAL1 1DHPA 2A1YA 4WY0A 4XTDA 1FWRA 1S5TA 4S1FA 2CLOA 2GQAA 3I65A 1GQNA 3KVJA 4MY8A 5G1TA 3NVTA 1G4TA 3B05A 1YXYA 5C54A 3QSTA 1OJXA 4CQAA 1RZMA 2FIQA 1LBLA 4KFNA 2FJKA 5AC6A 2CFFA 2VEIA 3IIXA 4UTWA 2WSYA 3GDMA 3HBLA 1F73A 1GOXA 2NUYA 1QO5A 3EXTA 1FXPA 1L6WA 1Q6QA 5ABTA 3MI2A 5FEXA 4GRSA 3TROA 3UY7A 2V5LA 5I3HA 3CU2A 5D2TA 3STEA 3ZWSA 3WJWA 1FWWA 5D2XA 4PTNA 1F2JA 1FQ0A 2VEPA 5I3KA 3SGZA 5KSWA 4LUIA 1H50A 1QOQA 3F4WA 3G1AA 2DZSA 4AHOA 3HG2A 3QSRA 4GUHA 4GC4A 5DY3A 1OK4A 4R34A 4EWND 4QNWA 5AHEA 4R7JA 4CCDA 3PBYA 4UFMA 4ZQRA 2FB2A 4L4MA 4MY9A 3EXSA 4O0KA 1CX9A 1Z42A 4FIQA 3QC3A 1J5TA 1H1ZA 2E68A 2DZXA 3BG9A 5IM51 4RZ5A 1F7BA 4IGHA 1LLWA 4HKPA 1IIHA 2ISVA 5LHFA 2QAPA 3G22A 3MO7A 2RH9A 3LTYA 3O06A 1WBHA 2RHGA 1RR2A 3QM3A 5DXYA 2P1FA 1I4NA 2QCDB 3KHJA 3W84A 1FDZA 1SZEA 1RV8A 3GXTA 3R5EA 4WY0B 2VEKA 4MPQA 1S3HA 3WJYA 5G1YA 1DJQA 4MIMA 3MP4A 2YGYA 4ZMGA 4K7YA 4IQLA 4TU1A 4YWIA 1JR1A 5FEPA 2WOQA 3PF3A 1B57A 1FX6A 3O6CA 3PUOA 3QF0A 2VFEA 5G2HA 3TX9A 4JTEA 1L6YA 1UJPA 2ZRUA 5HR6A 1I2QA 1FWNA 3UY8A 1VCGA 3BVJA 3T4CA 3QQ0A 2ABBA 1XBVA 2KZHA 3HPSA 3JR2A 2Q3RA 4YCPA 1BTMA 3ATZA 2WSQA 1JJKA 4HT3A 4IMGA 3PUEA 3NQEA 1W3TA 3N9RA 3NNTA 5EYWA 1HFBA 1P5BA 3IIVA 5KZEA 1XDMA 4CNPA 3KX6A 3FIGA 2E6AA 2BLEA 2F84A 3UWVA 1SSGA 4HPXA 1RQHA 3BPWA 2R8WA 3C2FA 4PL1A 3NM1A 2YYTA 1K03A 3S6DA 1VCFA 4KKXA 3GZ3A 1I8JA 3R8RA 1IXOA 3LHUA 1XFBA 2X30A 3SJ3A 4NXSA 3QJAA 3G0SA 4LV9A 1QDSA 2WKJA 5BMWA 3WJSA 4ADTA 4JDBA 1V7YA 4AMAA 5L9FA 1J2WA 2WNZA 3W6YA 1F6PA 3W7OA 3W1XA 4AHPA 3L0KA 1M7PA 5D04C 1ZAIA 1EP1A 3UXDA 2X16A 2V2HA 2YSWA 4UFJA 2YFNA 3N34A 3QQ1A 4JX4A 4Q32A 2OT1A 2QCGA 3W74A 1WDWA 3F03K 3NQ8A 1L2UA 4BI6A 4IMCA 3P84A 3W83A 3O16A 4BFAA 1FXQA 1YPFA 1IXNA 3LV5A 1H5YA 5D2VA 2NUWA 3M1ZA 4FIRA 2ALDA 1ICQA 3GYEA 1FBAA 3A24A 3STFA 3PG9A 5K9XA 3CB8A 2FB3A 4XZ9A 4LWWA 3W7DA 2GOUA 2VFGA 5FF4A 5AHFA 3BV4A 4ZL1A 3LTSA 1X6UA 1GVRA 4ADSA 1MSSA 3GB6A 3Q37A 3LB0A 3KFTA 3PR2A 3PB0A 3PM6A 4NJKA 7TIMA 3W22A 1O95A 3NGJA 2J27A 2ZRZA 4GBUA 1TTIA 1QNVA 1SZGA 2Y7EA 2XFWA 3HPXA 4X9SA 1RVGA 2FFCA 2VFDA 3M44A 4GUGA 1ICPA 1SO5A 2QR6A 3P60A 3CM4A 3GAKA 5K2ZA 2HMCA 4XTIA 4ZQCA 2YPIA 3GK0A 2JKEA 4JIPA 3LOTA 4TR9A 2QJHA 2BWGA 4BF9A 1TPH1 5KMYA 1LRQA 3MHUA 3L66A 4H3DA 4IPJA 5FF7A 2W6RA 3W1RA 4M7SA 4Q33A 1KM2A 1VS1A 3LLDA 1H51A 3G1FA 1XDLA 2VKZG 5DCEA 3DFPA 3ABRA 3O1NA 3G0UA 3HJZA 3IGXA 2ZRXA 1T0OA 3GXNA 1GPWA 3G3MA 3O07A 4IX2A 3EX6A 1QCWA 4MFDA 1W56A 4FNSA 3THAA 2QEZA 5TIMA 3UWUA 3GAYA 4JTLA 2RFGA 1N55A 2NV2A 1OFDA 3BG5A 4FX8A 4Z1DA 2WSRA 3I7SA 1DVJA 4JX5A 4E38A 4XWUA 4N9BA 3S8HA 1TRDA 2Y7FA 1AK5A 2H8XA 3MJYA 1TPWA 2FTPA 1JRCA 1ZCOA 2Z6IA 3A5VA 2NZLA 2F7FA 3IVUA 3OVPA 3K30A 4JEQA 1OX4A 2EGZA 2J9ZA 1EA0A 1M6JA 4JD4A 2E5CA 5CPMA 4UR7A 3W1QA 4A2RA 2V8ZA 3NXFA 4LS1A 2X1RA 3TA6A 3B04A 3F4NA 1TMHA 4G1KA 3S42A 2G96A 5D32A 3TQVA 2ZTKA 1W5QA 4LC8A 3L21A 1W37A 1DOSA 4EF8A 2ZYFA 5HWMA 2YFOA 5K3VA 1B4EA 3KRUA 1GVOA 5HINA 3W2LA 2AGKA 1UB3A 2H3DA 2VFHA 4BI7A 4M5PA 1KFJA 4WQ6A 2R14A 1CW2A 1TSIA 3W2KA 4O1BA 1W5OA 2ZDRA 5BOOA 3EWUA 4R33A 1F76A 4UTJA 1DORA 1W31A 3HF3A 3W86A 6ALDA 2O7SA 4K37A 5FF3A 2C13A 3HGJA 3W7KA 4N9EA 3BW3A 1P1XA 2NXHA 2V2CA 3G0XA 4QSHA 1H61A 1QWGA 3C2OA 4JN6A 1H7WA 4NX5A 2V81A 3LM7A 4KWVA 4LW7A 2ZZ4A 4HNNA 2QKFA 4PL2A 1ZALA 2V5BA 4GUJA 3W07A 4AHQA 2I9EA 2B7NA 3MUXA 3W7HA 1OX4B 3PSWA 4QISA 4MZ1A 3WFAA 4N2YA 1A5BA 4ZVJA 4H6KA 3EEGA 1S5VA 2ZA2A 4K6AA 5CKSA 1D3HA 3VFLA 1SW7A 4KWWA 1K8YA 3W7EA 4QITA 1LBFA 3LLFA 3TSDA 3IV3A 1YXCA 1DQWA 1SPQA 3CHVA 3CLMA 4UMBA 4YMZA 5FESA 3G1VA 1VCVA 1TV8A 1TCDA 1OFEA 4ZQOA 3ABSA 3GDLA 3NYZA 2VELA 2O7QA 5BRBA 3CWNA 2W79A 1WA3A 4WX2A 3LCXA 1THFD 4FNRA 3UPBA 3G1DA 2B7PA 3IVSA 5TBOA 3PBWA 4E2BA 3W2UA 1Q6OA 1IF2A 1QOPA 3L2IA 1FCQA 4MVAA 3UWZA 3KOFA 1TPVA 2ZRYA 4QQ3A 3W1AA 1H1YA 4TMBA 1SW3A 5HR7A 1QPQA 4XKYA 4O53A 4RZ4A 1IXQA 3LHYA 2YX0A 1E51A 1A5SA 5I3IA 5T26A 1DV7A 3JS3A 2NV1A 3QZEA 3BLIA 4RXGA 3EKLA 4PODA 4ZQNA 1C9DA 1GVSA 4O15A 3GR8A 3H53A 3IGUA 4XUGA 2DJLA 1T96A 5BMXA 4FNTA 1XC4A 4JY8A 4MZ8A 4CQ8A 3W7NA 3A22A 4BR1A 4K8HA 1SFJA 3NQGA 2QJIA 3GNNA 1KFBA 3S5OA 3PY2A 3TV8A 3LTPA 4Y90A 3HO8A 4A29A 4UTKA 5KTLA 1LM1A 2C15A 3B8DA 2OJPA 4UFLA 4WJEA 2ZTJA 4UMAA 5DELA 3IIZA 4NJJA 3W2MA 1UCWA 1OK6A 3W75A 3HPZA 4TO8A 1LTDA 4UXDA 2QCCA 3R2GA 3W2NA 4IMFA 3NQMA 4P2VA 5AOUA 1AL7A 2YW4A 1TQXA 1GEQA 2QUVA 3NL3A 4LT9A 2Y6ZA 4MLJA 4UTTC 5HJLA 2A6NA 3NEVA 5D05A 1V5XA 2ZQ0A 2ZZ5A 3C2EA 4MJZA 2V30A 8TIMA 4LY8A 3C2VA 5HULA 3M6YA 5F2IA 3LXAA 4ICNA 4I9AA 4JS3A 2ZCGA 5FI8A 4FXRA 4K8EA 3DI0A 3KAOA 3MHGA 4XKYB 5D02A 1I2RA 5A8GA 4ORMA 2GPTA 4DQWA 5E1QA 3MYPA 2E1DA 1IXPA 3S5NA 4QJ1A 3W7MA 2YW3A 3UXAA 1FDYA 1JQVA 2C6QA 3L68A 1LDCA 3SFKA 2HS6A 2V2DA 4I7VA 3GLCA 1M7OA 2A7PA 1TJPA 2VFIA 3C56A 1LRNA 3EB2A 3M7WA 4NJHA 1EWDA 1TTJA 1QFEA 2ISSA 3MP3A 3LXBA 3TMQA 5EKYA 4O8RA 1VYPX 2YYUA 2NX3A 4OWGA 5G4EA 2VOMA 4UUIA 1OFRA 3KRSA 4NU7A 1YLVA 1TV5A 4LVBA 1K8XA 1OX5A 3BW4A 3MMTA 3NM3A 5KZMA 2TPSA 3TU9A 1HTIA 4CNNA 3NO5A 1DKWA 2CLLA 2DZVA 1KLYA 3HIJA 2A21A 1HL2A 1FUYA 1ICSA 3W70A 3OVQA 2RDUA 1LRTA 1EP2A 3TJLA 3NPWA 1FWSA 3DFQA 3JRKA 4IXXA 3P5YA 4KFOA 1LYXA 2OZ0A 3ZWTA 5CPNA 2ABAA 1EIXA 1XBYA 5TQLA 4ML9A 1WV2A 2OT0A 4JIQA 4KFPA 1W5MA 2A7RA 3Q94A 4WXYA 3IIPA 4LRSA 1C8VA 3T55A 3UD6A 4OT7A 1XKYA 3NQDA 4O12A 4QIUA 5AYYA 2PRHA 4YCOA 4MKNA 4LVAA 3LHWA 3DFSA 1GYLA 3VI2A 3LBCA 2WV8A 1OFAA 5FF0A 3RFAA 1TTQA 1FCUA 3L5AA 3ZS4A 4RX0A 3GIYA 4JTHA 1OFQA 4FO4A 2TRSA 1W3IA 3PUDA 3R89A 5EPDA 4LS0A 1VC4A 2UV8G 1A5AA 4JYFA 2CLKA 4GUFA 2CZ5A 1SZNA 3RK8A 2C14A 2QUTA 2P0OA 3E02A 1A53A 3USBA 5CPLA 2IQTA 3ABQA 4JGDA 5F2MA 1GVQA 4GXMA 2R94A 3TNOA 1LZOA 3TMLA 3W7GA 3C6CA 2VENA 1XI3A 3QRHA 1MXSA 4S2CA 3QFEA 1H7RA 2WO5A 4Y8FA 3S0CA 3WK2A 1GTEA 1KV5A 3TKFA 1LBMA 2C18A 4Z1CA 3VKJA 1KW1A 2Z1BA 2R91A 2EPHA 3BW2A 3UYCA 6TIMA 1MEIA 3P81A 4GWEA 5C55A 3W3OA 1AL8A 3TH6A 4TIMA 2RDWA 2QCNA 1PVNA 2Z6JA 2YCEA 1KFEA 5KZDA 1Z41A 1MEWA 4OV9A 3LRLA 3C3NA 2J24A 1KBIA 3QEZA 3TW7A 3W1UA 1B3OA 3FLUA 1ZNNA 1ONRA 1WAUA 5A5WA 3QPYA 5U4NA 3EWZA 1BWKA 1VHCA 4M6PA 2Z2UA 3FYOA 4UFHA 4MJMA 4AH7A 1VJIA 2EF9A 2VXNA 4O17A 2ATMA 4GJ1A 4DF0A 3P62A 1LOSA 3THQA 2C1HA 2A0NA 2JKPA 4O4VA 4UCGA 3LX9A 1G67A 2JGYA 3TSMA 3CEUA 1R2TA 3OVRA 5AHMA 1JCYA 1WX0A 1WOAA 4UNLA 1FWTA 3EX4A 3QYQA 3F1QA 1EWEA 3QMRA 2Q8LA 5CZJA 3LCWA 3S1XA 4LS2A 2DZWA 3U6WA 5IBXC 1I2NA 1OF8A 4DO5A 4W9TA 1PCKA 1H63A 1Q3NA 3M5VA 3SY5A 3NL6A 3RF9A 3PC0A 3SECA 1WOBA 3QH2A 2JGQA 1VZWA 1ADOA 4H4IA 1KA9F 3C8FA 4MZYA 1PIIA 1JUBA 2I1OA 5F4SA 5DBUA 1VPXA 2ZZ2A 3LI1A 4HNVA 1MEHA 4IJBA 2ZZ3A 3MYOA 3L0NA 2E6DA 3DAQA 3O05A 4M6QA 3DKJA 2DORA 1UBSA 3EX3A 1L9WA 5CG7A 1GZGA 2YR1A 3FKRA 4X2RA 1NVMA 4WUIA 4JTUA 1N7KA 3OBKA 3SI9A 3MW7A 1KTBA 3DFOA 3SZ8A 3G1YA 3NG3A 5G4WA 3W2JA 4OV4A 5CZ0A 1HO4A 3GVGA 2XN0A 1TIMA 2VC6A 1MO0A 3W7CA 1K3UA 1N8FA 1YDOA 1SO6A 4UTHA 1UUMA 3LCGA 1EX5A 4PEKA 4ZZ9A 1XL9A 3CPRA 2X1SA 4M7TA 4AXKA 5FEZA 4LRTA 5MHBA 1FCVA 5HMSA 5IBXA 3O6DA 3TIMA 3A9IA 3NL2A 4I7WA 3W7RA 3KRZA 1PV8A 3VCRA 1T99A 2WJZA 1Y0EA 4UTUA 1ME9A 2FPVA 3S9YA 4CCCA 2RDTA 4WOZA 3GKFA 1OYBA 3EWXA 1XBXA 1VLWA 3MWAA 3UWWA 1VYSX 1JUEA 1TV7A 3FFSA 3CWOX 2OMAA 3WK1A 4AF0A 1VYRA 4BWLC 4Y96A 5DLCA 3L9CA 2C0AA 3TE9A 4ZQPA 1KM4A 4U28A 5F1VA 3NQ6A 4CLMA 3DBPA 5F2GA 1AMKA 1JCJA 1LORA 4DPPA 4FEZA 1Q6LA 4NQ1A 4UR8A 2NXGA 4IXHA 3W7IA 5AYZA 3N14A 1ALDA 2H6RA 1PE1A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3W7JA

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