4OOZA

Crystal structure of beta-1,4-d-mannanase from cryptopygus antarcticus in complex with mannopentaose
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
SEFLKASGSNFYYGGQKVFLSGVNFAWRSYGSDFGNGQYASNGPALKDWINKVKASGGNTARVWVHVEGQVSPAFDSHGFVTSTDSKKTLINDLSDLLDYANGQNVFLILVLFNGALQNNSNVQNLFWDESKLNSYINNALTPMVNALKSKPSLAAWEVLNEPEGTLQPGSDQNSCYDTSTLAAQGAGWGGKKFPMKQILKTINWISSAIHNADSKALVTVGSWSELTQTDSFGYRNHYKDSCLTGAGGKSNGIINFYQMHTYSHSGKWNQNAPFKVNRWAYNVNDKPLLIGEFASVCSQNEGIQNLYKYAYNNGYNGALTWQFNSGGDCSDTYSNQMYGMQALKGQNDQSGGKGGMVSVNINHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure-based investigation into the functional roles of the extended loop and substrate-recognition sites in an endo-beta-1,4-d-mannanase from the Antarctic springtail, Cryptopygus antarcticus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-1,4-mannanase
molecule tags Hydrolase
source organism Cryptopygus antarcticus
total genus 131
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2014-02-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4oozA00
2VZVA 2ZUUA 1JG9A 3VIHA 5D9PA 5LYRA 3AQUA 4LXFA 3WDQA 1JDCA 5JUVA 2O92A 5A8OA 1JFXA 1QBAA 5GNXA 3JUGA 4UR9A 3L4WA 3PZMA 1ITCA 1H0GA 3WDIA 3VIIA 4UCFA 1HKJA 4J28A 2Y24A 2X8RA 4HZ8A 3OA5A 4X0NA 1XRVA 3VMPA 5CLTA 1JI1A 1FP9A 1GUVA 3WEZA 3WNPA 1RH9A 3SCPA 4ATDA 1KR1A 1BYBA 4WKAA 2GFTA 2A3EA 3BLPX 2ZX5A 2VR5A 3WIJA 3L4UA 2XVLA 1RP9A 3F4VA 3K8KA 1JZ5A 3WSUA 3I3EA 4C7DA 3WQ8A 3FN9A 2MANA 4DM1A 2CNCA 4D6IA 5BCAA 3PZIA 4NRRA 2O9RA 2E0PA 3NIYA 3WNLA 5A6BD 3WF4A 1K6AA 2XM1A 2VX5A 2HISA 2ZUVA 5HNNA 4WSJA 4H7VA 3BAIA 2WSKA 2CXGA 3T08A 2ZUMA 3TA9A 5ABEA 3K46A 3VTRA 2WKLA 4JFVA 1UG6A 1WB0A 5BRQA 3BCFA 3WF1A 3PTKA 4M80A 3AHYA 4JHZA 1BHGA 1QHOA 3SUWA 1BSIA 3WKZA 3ZSSA 4XB3A 1E70M 1BYAA 1E9LA 1H3GA 2O9PA 4AZ6A 5GNYA 4FLQA 1KGUA 3UR7A 3ARRA 5E70A 1UR8A 7A3HA 4P7RA 4AIUA 2QF8A 2VT0A 2VVNA 4LYPA 3I3BA 1IV8A 4TVCA 1GNXA 3RM9A 3WNMA 3NSXA 1EOMA 1XYFA 1ZJBA 2ZUNA 2A3AA 3W26A 3VM5A 3AXIA 3CBWA 4P8XA 5M5DA 1AQHA 4UZSA 1E1FA 4WKHA 3O2LA 4IPLA 4GQRA 1QHPA 1SMDA 5AY7A 1EGZA 1KXTA 5CPTA 2ZX9A 4Z2KA 2J79A 2PC8A 3MUAA 1ZBVA 3DYPA 4PMDA 3UCQA 2CBIA 5D8WA 1H5VA 3WEOA 5KZ6A 4D6GA 2WVUA 1R87A 1HP5A 3IANA 1K9TA 4HZ6A 3NDYA 5A69A 3WUFA 3PZVA 3GM8A 4MAVA 2Z1SA 3SUTA 3W4RA 3WFZA 4J3WA 4W7UA 1JDAA 4YPJA 1JNEA 2DEPA 1MWOA 2G8ZA 3APGA 3LMYA 4GIAA 3ZT6A 5IHRA 1QNRA 1JI2A 5IFTA 1JXKA 2JEQA 3NUKA 5C71A 3WD0A 4RE4A 3KL0A 1TCMA 3TTYA 1CGVA 4NF7A 1OGSA 5AYIA 3L4YA 5F7UA 2E9MA 4P7NA 4TOQA 3VX1A 4TUFA 1ISYA 3ZMRA 2EPMX 1UA3A 1DWAM 3UG5A 1ZL1A 3BC9A 3MV01 3SUSA 1UWTA 3AHXA 3AMLA 3GNOA 4J3XA 1CECA 2XGBA 3BSHA 2DPEA 4AEFA 2BHUA 1G5AA 4BQ2A 1E5NA 1LG1A 1VBRA 2ZWYA 1K9EA 2WB5A 3GXFA 3VINA 4AZGA 4DWSA 3GBEA 2UY4A 2GJXB 1W2PA 5CG0A 1CXKA 2VX7A 1W9XA 3WNNA 1HVQA 2WCGA 2PWGA 3T0AA 4W93A 5JIWA 3GTNA 2V3EA 2OWCA 3OLDA 2JEPA 2D0HA 4HA3A 4XUYA 5CXPA 2OYLA 3ZQ9A 1EOKA 1FFQA 1Q6FA 4UQDA 3SCRA 3DC0A 4HA4A 5A6MA 5FCZA 3QGVA 2YLLA 4AISA 4JFUA 1O6IA 4U3AA 1XSIA 1C7TA 1UKSA 5HBFA 1E73M 3EDDA 4C7GA 1PZ3A 2XWEA 2D0GA 1B3VA 4HTYA 3ALGA 3IAPA 2JIEA 5GQBA 3HMCA 3MV11 4MTVA 4AXNA 4F66A 2NT1A 2VJXA 1LF1A 1PJ9A 2WWCA 3CUJA 1MW3A 4KGLA 4H04A 1YQ2A 2ZXQA 1JYXA 4WJXA 4WIWA 1W2VA 4PMOA 4J3VA 1KQZA 1I1XA 3VMNA 3HN3A 2ZUWA 1CZ1A 1GOOA 1HJQA 4OBRA 1OINA 1J0JA 1V6VA 5E6ZA 3WMCA 3VOCA 1ISWA 4JCMA 4IISA 3MSDA 4MJ4A 2V5DA 5A6AA 1FA2A 1QHZA 3II1A 3E1F1 5A95A 5AC5A 1IZJA 1TG7A 4ZEPA 3VD9A 5CGMA 2XFYA 1JAKA 1C8XA 4UQAA 5KEZA 1MYRA 3EMCA 1JF6A 1J18A 1UWQA 2WWDA 4H41A 4CCCA 3CH9A 4A3HA 1UD4A 3AS1A 1JZ8A 4IPNB 2DSZA 1WDQA 2J7DA 2OYKA 4JCLA 3WMSA 4NSBA 3QHOA 3RPMA 4WF7A 5DT5A 4D72A 3VIKA 3KL3A 3KEHA 4OUEA 4PCSA 3VNYA 2XVNA 4UQ9A 3SUVA 1QI3A 5ABHA 4KH2A 2W5FA 2PBGA 1HN1A 4MDOA 3WDHA 3GNPA 3WNKA 1JZ3A 2VRQA 2WMGA 3WH9A 3PZUA 2OWWA 1UWRA 3NSNA 1JF5A 1VRXA 2BY1A 1ZB5A 1OIFA 3UG3A 1VFOA 2CPUA 2WMKA 4UOJA 4ZXOA 1K9FA 3UETA 3GH5A 1UQZA 1A3HA 1WP6A 3CZJA 4AZHA 5LA0A 2C7FA 3KWXA 3L2LA 3F5LA 5A1AA 1PIFA 3BGAA 1DHKA 2E3ZA 1PX3A 3N18A 2FHCA 3MKKA 1UHVA 3AMCA 8A3HA 2RGLA 1C91A 1W1YA 4D6FA 1WZAA 1QVBA 3GYCA 1B0IA 4HU0A 2BY0A 2B31A 1W1PA 3KL5A 1JFHA 1UKQA 2VC9A 4UNIA 5GNZA 1HT6A 2EPKX 4MAZA 4LX4A 3WD4A 1E4NA 1DWFM 2YDQA 2ZUSA 4J3UA 2YL6A 3RCNA 1WZMA 3A6OA 1HJXA 1WDSA 4FF5A 1EHAA 5DO8A 2DGAA 4IM4A 1LWJA 3RMEA 1U30A 6CGTA 4D6DA 2VNCA 4ZE4A 1QNOA 3TTOA 5JBFA 4JIEA 2D24A 1B90A 3A4WA 3L4XA 5ABFB 5A6LA 1WNOA 3IJ8A 4NZCA 2YKKA 2EQDA 1EO7A 1LL4A 5GPRA 1CGWA 2ZICA 4N42A 3W29A 3VNZA 1BYCA 2NSXA 1TA3B 5D9NA 1EH9A 3WNOA 3VGFA 1UD6A 2J7FA 2YA0A 2V3DA 1GQJA 3M7SA 4PSRA 1UH3A 1V3JA 1PZ2A 2XGIA 3WBAA 1EA9C 2JE8A 3SCTA 2D22A 5FD0A 1GQLA 3BAYA 3UG4A 1KWKA 2ZX8A 1CWYA 1V6UA 5I2UA 4TVUA 4PMUA 1KFWA 1RP8A 5DT7A 3W37A 1QNSA 1EDQA 4P7QA 4PUDA 3BMVA 1M01A 2F8QA 3RDKA 3VIOA 4DM2A 2Y8KA 1J0YA 5CJ5A 4JFWA 2V5CA 3CZGA 4XZWA 1V3LA 5I23A 4UZUA 2YBUA 1WDRA 1VENA 1KWGA 5IHSA 1UD3A 1GONA 4CD6A 3M6DA 1CXFA 1VEPA 2E40A 1ZBKA 3OGRA 3AIUA 4OKDA 1C90A 1BGGA 1C92A 3HU7A 3VGHA 2OSWA 2WC3A 5IDIA 1J11A 4FLRA 3S2CA 3VGEA 2W91A 4AEEA 3PZQA 1G0CA 3GNRA 2XFRA 4J27A 2W92A 4U33A 1XYZA 4D6EA 4M82A 1G9HA 1Y7VA 4CKQA 2PWEA 3DYMA 8CGTA 4BQ4A 2YLAA 5IFPA 2O9OA 1RPKA 1E6XM 4PTXA 3CMGA 2VO5A 3EDFA 2D20A 5I0DA 5BXTA 1NH6A 5CQ1A 1E3ZA 4AZCA 2WHKA 1EIBA 1OD8A 2BXYA 3VDHA 3AYRA 2FGZA 3SCNA 1KGWA 3OGSA 4F9JA 2VTFA 3CUGA 4UFIA 3F5KA 2QHAA 2GSJA 3K8MA 4W5ZA 2E9BA 5D4YA 3U7VA 4Z2JA 1JZ6A 3ZOAA 1F4AA 4UFKA 3WD2A 4S3JA 1J0KA 3TTSA 1JYWA 1UKTA 3WUEA 1V0NA 4QP0A 1UZ1A 2CBUA 1UKPA 4AZ5A 2GDUA 3MUIA 2G4FA 1YHTA 2CERA 1W3KA 2BFGA 5D9OA 1DWJM 4L4PA 1HJVA 2WHJA 4S3KA 1E1EA 4J3TA 3VIJA 2WVTA 1H1NA 1W3JA 1E6PA 4QCEA 2TAAA 4B9ZA 1JD9A 1ZBCA 4W8AA 3MSGA 1J12A 1LQ0A 1J0HA 1J01A 3THCA 4OIFA 5I3DA 3OLIA 1RD6A 1L8NA 4M8UA 2ZUTA 1CGYA 3NCOA 1MVYA 3WL0A 4PN2A 1W3LA 3ZT7A 1LL6A 3T0DA 1NARA 1W9PA 2DT0A 3OLEA 1DEDA 5E0FA 4CCDA 1EO5A 3IK2A 1U33A 2W67A 3OZOA 2Y5EA 2WMFA 4M81A 2VCCA 1Z32X 5A8PA 1TE1A 4W89A 1EDGA 3AI0A 2DH3A 3ARWA 1MXDA 1E6ZA 3I3DA 1G01A 1GHSA 2Z1KA 2XG9A 4FK9A 1OCQA 1XSKA 4V27A 3PTMA 3FAXA 2XSAA 2GK1A 2YJQA 1ODZA 4D6HA 4TTUA 1B30A 3AYSA 1CXEA 5JBDA 3O6AA 5IXEA 2WVVA 5A8MA 3TONA 3VUPA 2YIHA 1ZS2A 1E5JA 1LG2A 1CLVA 1GQIA 3W38A 2ZX7A 3IJ7A 1W9BM 2VZUA 4XZBA 5FL0A 4RE3A 2J8GA 1UUQA 1TUXA 2CHNA 2WNWA 1OGBA 3AIQA 1QNQA 3EDEA 2D0FA 5CSUA 2EO7A 2WC7A 4HOWA 5HPCA 2WC4A 4PMVA 2WLYA 1MW2A 6TAAA 3OB8A 1KXQA 1UZ4A 3LPGA 3MU7A 1XHGA 1HJUA 4OJYA 2BHYA 4XX6A 3QHMA 1MW0A 2V38A 1CXHA 3EYPA 4URIA 3AISA 1E6NA 1HIZA 1Q6DA 2Q8XA 4WSKA 1X6NA 2NW0A 2XVPA 3CZ8A 4FMVA 3N04A 2AOSA 1Q4NX 1UH2A 4PYSA 3ZR6A 2ZOXA 2PF0A 5CPQA 1GOMA 1C8YA 1HF6A 1WZKA 3ECQA 2C0HA 2W66A 1NM9A 1CGXA 3AXHA 4TX6A 1XCWA 1TZ7A 3AZSA 2YOCA 4W7VA 2YL9A 3W53A 2J47A 4H8HA 2DDXA 3M46A 5BROA 1E40A 4GZJA 2QMKA 1ECEA 3AICA 5HXMA 3LPPA 3MO4A 4YN5A 1N82A 1GJUA 3THDA 3T2PA 1US2A 2WK2A 3AMGA 4JKLA 4GI6A 2J78A 3ARSA 1CENA 4JFTA 2BY2A 1GOQA 2YL8A 3AMDA 4NRSA 1JD7A 4MADA 3A4XA 3W24A 3WFLA 3T09A 3T0BA 1QI5A 1HX0A 5HDRA 1AVAA 3CLWA 1VB9A 2WMHA 1ZJAA 4ACZA 1CGUA 3CPUA 3PN8A 4DUWA 1SR0A 1H09A 3B8SA 3AZTA 2W62A 3ARTA 4C7FA 3FNDA 1FH8A 2XPKA 1G94A 1KBKA 2VQUA 4W87A 1ISXA 4UFJA 4AC1X 5A2BA 1E55A 3F5JA 2WMIA 2ZXAA 1ITXA 1NP0A 4BCEA 1W9VA 1VEOA 5FKYA 3OGVA 1V3HA 4X0VA 1JNDA 4KWUA 3QOMA 1E0VA 3AHZA 2PWDA 1UYQA 3AFBA 1B3WA 5BXRA 3VD3A 5CGTA 3ZJ6A 1QPKA 5EFFA 1UR2A 4J3SA 1LJYA 2E8ZA 2G3NA 3G6LA 3PZNA 1R8LA 3KE0A 3ZM8A 2F61A 4AWEA 1JZ4A 1MW1A 4K68A 4RE2A 2VX4A 3T2OA 2X0HA 4CN6A 3FW6A 3AMKA 1V02A 3DECA 1SYTA 4Z2GA 1OT1A 3GZAA 1XC6A 4W85A 4GQQA 4ZFMA 3UEQA 4DWSD 1ESWA 1HKMA 1OSEA 4PUEA 3A3HA 3CIVA 3AIBA 4L4OA 4YHGA 3NSMA 1GZJA 3VD4A 5DF0A 2V3FA 2WBGA 1EXPA 2WXDM 1R85A 1QI4A 1JGIA 4CU8A 2BVTA 1PX4A 1X6LA 3RM8A 5LA1A 2WMJA 2CETA 3VMOA 2DSWA 3WD3A 1FH9A 3O9NA 2CHOA 2VOTA 3KZSA 1OBAA 4TXEA 3VGDA 5HPOA 1E4IA 1VFUA 1W9UA 2DSUA 2WKGA 4U2YA 2V3GA 3VDAA 1BFNA 3WQ5A 4JL2A 1B2YA 4FLSA 3MMWA 4AD1A 2GVYA 3SCVA 2BVDA 1TMQA 4EANA 2X0YA 3MMDA 3SEPA 4MNMA 4OOZA 3PZGA 4PMQA 1TVPA 1CLXA 4MB1A 1O7AA 4ATWA 1ISVA 3N9KA 3WELA 3NYDA 4CN1A 1BLIA 3GH7A 4ZENA 1PBGA 2WW5A 2CBVA 1WZLA 1KXHA 2DSVA 2IXUA 3N15A 1DWIM 1E0XA 1ODUA 1MFVA 2VMFA 2XIIA 4AD5A 3SURA 3LPFA 1E6SM 2VZOA 4QLLA 1H41A 4F9DA 4B3LA 4F79A 2VX6A 1GJWA 5A6SA 3TP4A 4BS0A 2W61A 1QI0A 4QAWA 3ARYA 1QI2A 3PZ9A 1EQPA 1FP8A 5I24A 4D6JA 2XM2A 1C7SA 5BXSA 2OYMA 4Q22A 1E6QM 4TX8A 2CIPA 3WDPP 1XV8A 3U57A 1XCXA 3WF2A 1GPFA 3ALFA 3CUIA 1AQMA 4UOQA 4U5KA 2DH2A 1J0ZA 3TTQA 4QCFA 4HOXA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VZV A;  2ZUU A;  1JG9 A;  3VIH A;  5D9P A;  5LYR A;  3AQU A;  4LXF A;  3WDQ A;  1JDC A;  5JUV A;  2O92 A;  5A8O A;  1JFX A;  1QBA A;  5GNX A;  3JUG A;  4UR9 A;  3L4W A;  3PZM A;  1ITC A;  1H0G A;  3WDI A;  3VII A;  4UCF A;  1HKJ A;  4J28 A;  2Y24 A;  2X8R A;  4HZ8 A;  3OA5 A;  4X0N A;  1XRV A;  3VMP A;  5CLT A;  1JI1 A;  1FP9 A;  1GUV A;  3WEZ A;  3WNP A;  1RH9 A;  3SCP A;  4ATD A;  1KR1 A;  1BYB A;  4WKA A;  2GFT A;  2A3E A;  3BLP X;  2ZX5 A;  2VR5 A;  3WIJ A;  3L4U A;  2XVL A;  1RP9 A;  3F4V A;  3K8K A;  1JZ5 A;  3WSU A;  3I3E A;  4C7D A;  3WQ8 A;  3FN9 A;  2MAN A;  4DM1 A;  2CNC A;  4D6I A;  5BCA A;  3PZI A;  4NRR A;  2O9R A;  2E0P A;  3NIY A;  3WNL A;  5A6B D;  3WF4 A;  1K6A A;  2XM1 A;  2VX5 A;  2HIS A;  2ZUV A;  5HNN A;  4WSJ A;  4H7V A;  3BAI A;  2WSK A;  2CXG A;  3T08 A;  2ZUM A;  3TA9 A;  5ABE A;  3K46 A;  3VTR A;  2WKL A;  4JFV A;  1UG6 A;  1WB0 A;  5BRQ A;  3BCF A;  3WF1 A;  3PTK A;  4M80 A;  3AHY A;  4JHZ A;  1BHG A;  1QHO A;  3SUW A;  1BSI A;  3WKZ A;  3ZSS A;  4XB3 A;  1E70 M; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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