4OOZA

Crystal structure of beta-1,4-d-mannanase from cryptopygus antarcticus in complex with mannopentaose
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
368
structure length
368
Chain Sequence
SEFLKASGSNFYYGGQKVFLSGVNFAWRSYGSDFGNGQYASNGPALKDWINKVKASGGNTARVWVHVEGQVSPAFDSHGFVTSTDSKKTLINDLSDLLDYANGQNVFLILVLFNGALQNNSNVQNLFWDESKLNSYINNALTPMVNALKSKPSLAAWEVLNEPEGTLQPGSDQNSCYDTSTLAAQGAGWGGKKFPMKQILKTINWISSAIHNADSKALVTVGSWSELTQTDSFGYRNHYKDSCLTGAGGKSNGIINFYQMHTYSHSGKWNQNAPFKVNRWAYNVNDKPLLIGEFASVCSQNEGIQNLYKYAYNNGYNGALTWQFNSGGDCSDTYSNQMYGMQALKGQNDQSGGKGGMVSVNINHHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structure-based investigation into the functional roles of the extended loop and substrate-recognition sites in an endo-beta-1,4-d-mannanase from the Antarctic springtail, Cryptopygus antarcticus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-1,4-mannanase
molecule tags Hydrolase
source organism Cryptopygus antarcticus
total genus 131
structure length 368
sequence length 368
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2014-02-04
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4oozA00
3GZAA 3BH4A 2RGMA 1CLXA 2EXOA 4UQCA 1BPLB 1V6YA 4OIFA 2WMIB 3OA5A 3IJ7A 2WHLA 2VRJA 2VCBA 3QHMA 1ISVA 5FOOA 3RPMA 3CMGA 4NF7A 5E6YA 4IPLA 5BXPA 4AZ5A 3NSNA 2YLLA 2DEPA 4CU6A 2F8QA 2YBUA 3IAPA 1JFHA 5A6BD 2ZUVA 1RP9A 1QW8A 3WNKA 1EDQA 1OB0A 3MKKA 3W29A 5M17A 2ZOXA 4RE2A 4DWSA 3AJ7A 3FN9A 3N04A 5HOSA 5C71A 5I77A 2CBUA 3BAWA 4URIA 2ZX6A 2IXVA 2YIHA 3VGHA 4PMQA 2V5DA 1K9EA 2BY0A 3RMEA 5HBFA 1XSIA 1TVPA 1JAKA 3L2LA 3AIUA 1W2PA 3VINA 2JF7A 5I79A 1CBGA 1Y7VA 1E72M 1VB9A 2C7FA 1DWIM 2J79A 1E0XA 3GBEA 4UQ9A 4EAMA 4JKKA 1OD0A 6CGTA 1UKSA 1MFUA 2VI0A 4HZ6A 4S3KA 3WKZA 3VMNA 3MSGA 1H2JA 1WKYA 4OUEA 2J7CA 3L4WA 2WBKA 4U3AA 3OBAA 2X05A 2PWDA 4CD7A 1CPUA 1MQQA 3CUFA 1K6AA 4UZSA 1D2KA 2ZX5A 3IJ9A 4M1RA 3VGDA 4IPNB 3WD1A 3TTOA 4F8XA 3UERA 3EMZA 2WB5A 1BYCA 4UFIA 4ZEPA 1UQZA 1VENA 2DSWA 4UFJA 1W1VA 1UD5A 3DYPA 1UZ4A 3WMCA 4WKFA 1K9DA 4JFVA 5JBDA 5AYBA 2WM0A 2XG9A 2WK2A 5M03A 3S6TA 1DHKA 1FHDA 2VOTA 1W91A 4DWSD 2BVYA 1RP8A 4D1JA 3JUGA 1JF6A 4NSBA 3SUTA 1LWJA 1ISXA 1XC6A 2E4TA 3DC0A 1D7FA 1LF1A 4LQ1A 4AZBA 2OLHA 2FGLA 1NP0A 2WZHA 3N13A 1BYAA 3WL1A 3UG4A 1NOUA 3VDAA 5BRQA 3UG3A 1EDGA 2DDXA 4BQ2A 1ESWA 4LGXA 3AMKA 1SR0A 1W9BM 3VILA 4N0RA 3ALFA 3WUEA 4AD5A 2O9TA 3WH5A 1EH9A 4D6CA 1KR1A 1JGIA 2GJRA 4CU8A 1OWQA 1FP9A 1QNQA 5D9NA 3II1A 1JYXA 1ODZA 1V02E 1OT1A 4UNIA 1PZ2A 1WZKA 5A2AA 1EO7A 1QI2A 3AZTA 2X1IA 3AXIA 3W38A 3ARSA 3LPGA 3AFBA 1CGUA 3B9DA 3K4AA 1XH0A 3W28A 4HOXA 1FFRA 3QOKA 5LA1A 1BVZA 1K9TA 8CGTA 3ZSTA 4CKQA 4FF5A 2GJPA 4MB5A 4LPCA 3F5LA 2E8ZA 5IXEA 1HN1A 2W61A 4FLOA 3VU2A 3AIWA 4BF7A 3WEOA 3VOCA 3PZOA 3UR7A 4AD0A 3WDQA 4GZIA 3WEMA 2XVNA 1BLIA 2DQXA 4QFUA 1JL8A 2XWEA 1DTUA 1KCLA 4MB1A 4J27A 1ZL1A 1WAWA 3N15A 3GNOA 3BAXA 3N17A 2BXZA 1PPIA 4RL3A 3WF2A 2YDQA 3SCVA 4MJ4A 2YA2A 4QLLA 1DWFM 1UD8A 2YA1A 4NRSA 1FOBA 2VURA 2VVSA 5DT7A 2DIJA 1ZJBA 2UY4A 2OYLA 5A8OA 1JIBA 1PIGA 5AYIA 2FHFA 3WD0A 3GXDA 2WMKA 5GNYA 5JIPA 2VZTA 2DSVA 5BROA 2XIBA 4UFKA 1FA2A 1HVXA 4R27A 1G0CA 2Y5EA 4L4PA 1V3HA 3MO4A 1BHGA 2EPMX 1NWUA 3F4VA 2DSKA 1I1WA 3UEQA 3BSGA 4XB3A 2J74A 4DUWA 4HA4A 5IDIA 4CU7A 5TD4A 3VGGA 2FHCA 4RE4A 2UY2A 3CZKA 3ZO9A 1XSKA 2YA0A 1EHAA 2WAGA 3T0AA 2XSAA 3N9KA 1XYFA 1E4MM 2PC8A 2D22A 2ZXQA 1GNXA 1UG6A 1V6XA 2XIIA 4S3JA 2VX5A 1HL8A 4EK7A 3LPPA 3WSUA 1H49A 4B3LA 1TA3B 4ZFMA 1CXKA 1JD7A 2J78A 5I2UA 2NT1A 2WKLA 4J28A 4NZCA 1W3HA 1V0NA 2JEQA 1JZ4A 3PN8A 4D72A 4F66A 4KWUA 4Z2IA 3AHTA 3MUY1 3KEHA 4GQQA 3L4XA 2XFYA 7TAAA 4XUYA 5FKYA 3F5KA 1GOWA 4ACZA 3FAWA 3ZJ7A 1U30A 3N12A 2VZSA 5EFDA 1US3A 1QPKA 5HPOA 1R7AA 1X6LA 2EO7A 3AYSA 3VVGA 5A6MA 4LYPA 1W3LA 1OCQA 1WNOA 3K8KA 2WWCA 1W9UA 1XSJA 3T2OA 2WVUA 1R7OA 4GXPA 4PMNA 3VGBA 4JFTA 1KWGA 3G6LA 2E9MA 2W62A 4WK9A 1QNRA 1UR4A 3ARRA 4NI3A 3KZSA 1MYRA 1LL4A 4P7RA 1JI1A 1KQYA 3MUAA 5IHRA 4TVUA 1UR1A 1GVYA 2WC4A 4PCSA 4XZWA 4CD6A 4F9JA 2XFFA 4BQ3A 4AZIA 3T2QA 2D23A 1GJUA 1D3CA 4U5IA 1DWAM 1B1YA 3HMCA 3VTRA 1VBUA 4HPGA 1B30A 4P8XA 1J10A 2J8FA 4TX6A 3WUFA 4P7QA 1V3IA 4U3CA 3AS1A 1S46A 2Y24A 4OBSA 2WWDA 1MW3A 3W25A 2WHKA 5HXMA 3CH9A 4WSKA 3U7VA 4GIAA 4U2YA 1QHOA 4K68A 3ARXA 3SEPA 3CLWA 2VR5A 4ZENA 1OM0A 4W5UA 2D0GA 3CO4A 1GOIA 1KB3A 1JNDA 3AHZA 3LPFA 1OSEA 3CBWA 2VX6A 1YQ2A 1TUXA 1VJSA 2WPGA 2ZUTA 5HPCA 1PBGA 3WQ6A 2OSWA 1UR8A 4AD1A 5A6KA 5E09A 3N1AA 2ZXBA 3PZ9A 2EPLX 2WZEA 4HPHA 1NOFA 2ZWYA 1C7SA 2VUYA 4W84A 3DECA 3NSXA 1C3FA 5A1AA 2J25A 2FHBA 4HA3A 4D6DA 3ZOAA 3MSDA 5I23A 2J47A 3PTKA 2D20A 2BVDA 1AVAA 4W8LA 4F9DA 3VD9A 4AXNA 1MQPA 3EDJA 1W1YA 4EANA 3OLDA 4H8VA 2O9RA 3FHQA 4D71A 2PBOA 2VO5A 3CHFA 3WDJA 4UOJA 1HJQA 1R8LA 3WMBA 4HMDA 3UETA 3J7HA 1UH4A 1XCWA 3AIQA 2XM2A 2CERA 4ATWA 3L2MA 3L4TA 1XD0A 1V6UA 2MANA 3HN3A 1M53A 4MNMA 5GNXA 4WLCA 1J12A 3OZPA 2BXYA 4V2XA 2XHYA 2ZWZA 1JYWA 6A3HA 4GQRA 3AROA 2BVTA 4W7VA 1ITCA 1H0GA 5JBEA 1FFQA 1F4AA 4HOWA 1MW2A 4MB4A 1CGTA 1UH2A 1J0KA 3CUIA 2QPUA 1OGSA 1CYGA 4AZGA 2X2YA 3A4WA 4Q7NA 1GOKA 4MAVA 1UD4A 4KGJA 2DT3A 3EMQA 4J3SA 1BGAA 2CCRA 5IHSA 5ABFA 4DUXA 2JALA 5BCAA 3PBGA 5KEZA 2VCAA 4GKLA 4WF7A 1HJXA 2BS9A 2JFEX 5CPSA 1O7AA 2VRQA 1QI5A 3AZRA 4NRRA 3SUWA 2FH8A 4B16A 2QF8A 2DPEA 1QBAA 1XGZA 2VC9A 5A69A 2VTFA 1CIUA 1UWRA 4PCTA 3SCTA 4CD5A 2CBIA 1C92A 2RGLA 2BY1A 4AD3A 3TTYA 1MW0A 1V3LA 4L4OA 4AIEA 1B3YA 1JZ2A 3M46A 3AOFA 1HKJA 5A6AA 1EQPA 1RD6A 2BNJA 1Z32X 1O6IA 1B31A 3MV01 2GK1A 2WMJA 5A95A 4R5EA 1GW1A 1J0ZA 1XV8A 1E6SM 1LWHA 1UD3A 3AIEA 3WY1A 5KZ6A 5I6SA 1TCMA 4MB3A 2GSJA 3SURA 4B9YA 4AD4A 5ABGA 1N82A 3ALGA 4PSRA 3BLPX 1Q6DA 2YL8A 1E73M 4GZJA 3SUSA 4MAZA 4FK9A 1L0PA 1TMQA 1MXDA 3FHAA 4W87A 3ARWA 4J3TA 4LYQA 4EE9A 2FH6A 2OWCA 4UR9A 5A8NA 5IFPA 3U7BA 2D3NA 3OG2A 1C8XA 5CLWA 3WQVA 1UKTA 3L4VA 1B2YA 3FNDA 1W32A 1US2A 1JXKA 2EJ1A 1V3KA 3MUZ1 3GNPA 4TTGA 2EPNA 4ZE5A 3VGFA 2BHUA 2VL4A 1UWQA 1WCGA 4P8UA 3WBAA 1KXHA 1HJVA 5AY7A 4DM1A 1WPCA 5CG0A 1UR2A 1VFMA 4HZ7A 1UD2A 3SCWA 2CHNA 2WLZA 2D3LA 1J0YA 4C7FA 2G3IA 3W4RA 3K8LA 3ARTA 4JKLA 4TX8A 2E8YA 2G41A 1BG4A 4WKHA 2WHMA 1BG9A 3PZIA 1BVNP 2AAAA 1CNVA 1UOKA 2QHAA 3M7SA 1E0VA 2VZUA 4HU8A 1QI0A 2D1ZA 1HL9A 2XVPA 4PUEA 1GONA 1U33A 3B8SA 5BRPA 3BMWA 4M80A 1IZJA 3A3HA 1JG9A 3WH9A 4AWEA 3BAYA 4J3XA 5JBFA 1VEPA 5D8ZA 1JZ8A 4HOZA 1NP2A 4Y7EA 2XVGA 2UWFA 1OBAA 4AIOA 1KBBA 2GFTA 4ACYA 1WB0A 2CYGA 3NUKA 3EYPA 3WQ5A 1KGUA 1E5JA 5DT5A 3RCNA 3CTTA 2WC7A 2W67A 2GDVA 3WD4A 5CSUA 1H5VA 2VNCA 1KXQA 4UZUA 1BYBA 1BGGA 2DGAA 4D6FA 3EBVA 3VMPA 1EOKA 4J3UA 3WDRA 2CEQA 4OJYA 5EFFA 3VX1A 3WH6A 1C91A 3WMSA 3WDPP 2WVTA 1Q6GA 3CHDA 1I1XA 3QHNA 4WSJA 2WVVA 1NH6A 1J0HA 5FIPA 1E1FA 4X9YA 1WO2A 3RM8A 1JDCA 2Y8KA 3T09A 1C90A 4X0NA 1HIZA 1Q6FA 3SCQA 3PZVA 2GDUA 2XTKA 3NSMA 4WIWA 3GXIA 2YL5A 2O9PA 5D9OA 4H41A 4PMXA 4E8DA 1UR9A 4AZCA 4XX6A 3VD7A 4W7WA 3LMYA 1NM9A 1C8QA 1ZU8A 3VM7A 5CLTA 3WF4A 3CHEA 1UKQA 1GPFA 2XJ7A 3AYRA 1XH2A 3GH7A 1UQYA 3BLKA 4UQEA 1L8NA 1HJSA 4QCEA 3CGTA 4PRWA 3WNNA 3BAJA 1IV8A 2A3EA 3S2CA 1W3KA 3W6LA 2CPUA 2DT2A 4DUVA 2ESCA 4W7UA 3PZQA 1GZJA 1JFXA 3K1DA 2XVKA 5CPTA 1DP0A 3WUBA 4HMCA 2J7GA 5M5DA 5DMYA 3UCQA 1W1TA 1B90A 4A4AA 3ZT5A 2JE8A 1TG7A 4X0VA 1A47A 4UOQA 3GYCA 5BYWA 3F5JA 1HF6A 3RO8A 2WCAA 3MS8A 2FGZA 3ZSSA 2BY2A 3I3EA 2OYMA 3RILA 1QI3A 1EQCA 1XD1A 4UFHA 1RPKA 5AC5A 3SCPA 1VJZA 2CKSA 2E40A 4EKJA 3PTMA 3I3DA 1UHVA 2PBGA 3W81A 4RE3A 1TFVA 1NWTA 1ZBVA 4AYSA 1OINA 1PIFA 4W8BA 5M3WA 4PMVA 2IXUA 1ZB5A 1G1YA 3FW6A 4V28A 3GBDA 3B9AA 4KRTA 3OLGA 2V3FA 2J75A 2PI6A 2WCSA 2DH3A 4D1IA 1WDRA 1M01A 4HMEA 3VKKA 2B31A 4PTMA 3FY1A 2WSPA 2VZVA 5ABFB 3CIVA 1ISZA 1HKIA 1JAEA 1GQJA 1XHGA 3K8MA 1V0MA 3NJ3A 1UKPA 4FLQA 2WANA 3K46A 2Z1KA 2GVYA 3MMDA 3SCOA 4J3WA 4W85A 4JKMA 4Z2GA 1E70M 1WDPA 5A8MA 3ZJ8A 1PJ9A 3OGVA 3UG5A 1WDSA 1JDDA 1UKOA 3AHVA 2EPKX 4JIEA 2J8GA 1E6QM 2J7FA 2XUCA 1HT6A 2DIEA 4A3HA 3A4XA 2ZUWA 1LLOA 4PSPA 1QNSA 1WZLA 2BHYA 5IFTA 3DYMA 3VX0A 1C93A 1LG2A 2IUZA 5GPRA 4DWSB 4W88A 2VZOA 4BA0A 2GK1B 4JCMA 4CN1A 1BSIA 1H4PA 3A6OA 3WH7A 4B3KA 1E4NA 1FH9A 1TVNA 2QMJA 3T2PA 4LX4A 3RIKA 3WBEA 2WMGA 2WMFA 1BFNA 1QW9A 3NDZA 1B9ZA 1E43A 4UCFA 1LQ0A 5ABHA 5FL0A 5BXRA 3GTNA 5CGMA 2PF0A 1ECEA 4ZE4A 4JHZA 3SIMA 1V6VA 3FAXA 3WDHA 3BCDA 3AHXA 2J7EA 2W91A 3OLEA 3NCOA 2FDMA 4D6EA 2BHZA 3MV11 3IK2A 7CGTA 4JAWA 1UR0A 2XVLA 1EXPA 4E4PA 1UH3A 1XYZA 1E9LA 1M04A 3PZTA 1ODUA 4MDOA 3EDDA 5LYRA 2EEXA 2NW0A 3BAIA 2GUYA 3HJEA 1HP5A 1QHZA 3AHYA 2CKRA 1VFFA 2ZX9A 3OZOA 3CMJA 1ISWA 2W92A 1AQHA 1GHSA 4OKDA 1J9YA 3WH8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3GZA A;  3BH4 A;  2RGM A;  1CLX A;  2EXO A;  4UQC A;  1BPL B;  1V6Y A;  4OIF A;  2WMI B;  3OA5 A;  3IJ7 A;  2WHL A;  2VRJ A;  2VCB A;  3QHM A;  1ISV A;  5FOO A;  3RPM A;  3CMG A;  4NF7 A;  5E6Y A;  4IPL A;  5BXP A;  4AZ5 A;  3NSN A;  2YLL A;  2DEP A;  4CU6 A;  2F8Q A;  2YBU A;  3IAP A;  1JFH A;  5A6B D;  2ZUV A;  1RP9 A;  1QW8 A;  3WNK A;  1EDQ A;  1OB0 A;  3MKK A;  3W29 A;  5M17 A;  2ZOX A;  4RE2 A;  4DWS A;  3AJ7 A;  3FN9 A;  3N04 A;  5HOS A;  5C71 A;  5I77 A;  2CBU A;  3BAW A;  4URI A;  2ZX6 A;  2IXV A;  2YIH A;  3VGH A;  4PMQ A;  2V5D A;  1K9E A;  2BY0 A;  3RME A;  5HBF A;  1XSI A;  1TVP A;  1JAK A;  3L2L A;  3AIU A;  1W2P A;  3VIN A;  2JF7 A;  5I79 A;  1CBG A;  1Y7V A;  1E72 M;  1VB9 A;  2C7F A;  1DWI M;  2J79 A;  1E0X A;  3GBE A;  4UQ9 A;  4EAM A;  4JKK A;  1OD0 A;  6CGT A;  1UKS A;  1MFU A;  2VI0 A;  4HZ6 A;  4S3K A;  3WKZ A;  3VMN A;  3MSG A;  1H2J A;  1WKY A;  4OUE A;  2J7C A;  3L4W A;  2WBK A;  4U3A A;  3OBA A;  2X05 A;  2PWD A;  4CD7 A;  1CPU A;  1MQQ A;  3CUF A;  1K6A A;  4UZS A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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