1W3LA

Endoglucanase cel5a from bacillus agaradhaerens in complex with cellotri derived-tetrahydrooxazine
Total Genus 121
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
121
sequence length
300
structure length
300
Chain Sequence
SVVEEHGQLSISNGELVNERGEQVQLKGMSSHGLQWYGQFVNYESMKWLRDDWGINVFRAAMYTSSGGYIDDPSVKEKVKEAVEAAIDLDIYVIIDWHILSDNDPNIYKEEAKDFFDEMSELYGDYPNVIYEIANEPNGSDVTWGNQIKPYAEEVIPIIRNNDPNNIIIVGTGTWSQDVHHAADNQLADPNVMYAFHFYAGTHGQNLRDQVDYALDQGAAIFVSEWGTSAATGDGGVFLDEAQVWIDFMDERNLSWANWSLTHKDESSAALMPGANPTGGWTEAELSPSGTFVREKIRES
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Bacillus agaradhaerens
publication title Structural, Thermodynamic, and Kinetic Analyses of Tetrahydrooxazine-Derived Inhibitors Bound to {Beta}-Glucosidases
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDOGLUCANASE 5A
total genus 121
structure length 300
sequence length 300
ec nomenclature ec 3.2.1.4: Cellulase.
pdb deposition date 2004-07-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1w3lA00
2WHMA 1QBBA 1B1YA 1KWGA 4NI3A 1FHLA 1GORA 4PN2A 3UG5A 2V38A 3FXYA 4PMUA 4LPCA 2BXZA 3WH8A 4J28A 4UZSA 1CGVA 1CYGA 1UQZA 1EA9C 1QI2A 1HKIA 1F4HA 4QLJA 2CERA 2Q8XA 1W1VA 4OOZA 4WKFA 1UWIA 2WKLA 2BY1A 1E3ZA 1PAMA 4D71A 1TE1A 4UFMA 4HZ7A 1QPKA 3T2OA 4W8BA 4B15A 3AIRA 4CKQA 3ALFA 2VVNA 1N82A 3N15A 4UFIA 3BAYA 3RJYA 2NSXA 3U5YA 3OLGA 3T09A 4EKJA 3GM8A 2CXGA 1W3JA 3ARWA 3AIBA 4UQEA 1B3WA 1GOIA 3K1DA 1TMQA 4L4OA 9CGTA 1WO2A 3TTOA 4CN1A 3WMCA 4GQRA 2WXDM 1E70M 3E1F1 1W3KA 3W29A 2GJRA 3CBWA 3ZR5A 2DGAA 5FCZA 1A3HA 5HBFA 1QI3A 4UFLA 2OSXA 5BCAA 3AHTA 4PCTA 4E8CA 5CXPA 3MUZ1 1ZBWA 5ABHA 1UD6A 4W85A 5EFFA 4DM1A 2ZX5A 1UUQA 1I75A 2WSKA 1M01A 4J3TA 3K46A 2VOTA 4PSRA 4J3WA 2YOCA 1Q6FA 4QCFA 3AZTA 5HXMA 2GK1A 3CZEA 2VURA 5JIWA 3AS0A 1C92A 2FGLA 1IZKA 3DYMA 2YL8A 5BYWA 1WDQA 4CUCA 3WUFA 4PMOA 2VZUA 2XFRA 1BF2A 1C7SA 3MV11 3SCOA 4JCLA 3CMGA 1EH9A 1NOUA 1G94A 2DQXA 4JL2A 1CWYA 2WBGA 3VO0A 4LXFA 5D8WA 4HOZA 1X6LA 1UR8A 4W86A 4MNMA 3CGTA 2DH2A 2VT0A 5A6AA 2J7EA 1E3XA 3VGHA 1ISWA 1HXJA 2OWXA 1LG1A 1VEOA 4AMCA 1D3CA 3GZAA 3VUPA 4JFUA 3IANA 1KXVA 3AI0A 2YLAA 1Y7VA 5I23A 4GI8A 3A3HA 4W8AA 1IV8A 1KQZA 5AC4A 1LWJA 5BROA 2DT0A 3L4WA 4MB3A 3VNYA 3WQVA 1KWKA 4N42A 1G1YA 1JZ2A 4P7LA 5AYIA 2W63A 4MADA 4W87A 1XH0A 3RM4A 1K9FA 3AYRA 3DECA 2ESCA 4ATWA 5CZKA 3N11A 3VIKA 5CSUA 3RIKA 4TVCA 2J7GA 2QF8A 4QP0A 4KRTA 5DMYA 4LYPA 3I3EA 1BGAA 5FIPA 3O2LA 4PBGA 1Q6DA 1RD6A 5CLWA 2BVDA 5IHSA 3SCWA 1CXKA 4NF7A 1P6WA 1UKQA 1QVBA 3CZKA 3RDKA 2QMKA 4ZENA 5I77A 1S46A 3PZOA 5CPTA 3VGGA 3II1A 3N17A 3CHFA 1GQKA 1GOOA 2XG9A 4X0VA 2G3JA 3NDZA 1E0VA 2X1IA 3PZMA 3B9DA 1EHAA 2EPKX 4H8UA 2J8GA 5DF0A 1TVNA 2OYMA 3DC0A 5E0CA 1EHNA 2D22A 1J0ZA 2WZEA 2C8NA 1W9DM 1OT1A 3W38A 3CLWA 2IUZA 2V3FA 5FD0A 3RO8A 1OIMA 4HU0A 1KCKA 1NP2A 4CD4A 3AZSA 3WDIA 2WWDA 3OLDA 2Y5EA 4OIFA 3PTKA 3PZIA 4HMDA 2HISA 3K8KA 3WF2A 1FH8A 4UQ9A 2BY2A 3WNMA 1PBGA 4TUFA 2CYGA 5E70A 2WMKA 4DUXA 2BFGA 1UWSA 2ZX7A 3KZSA 5D4YA 3ZR6A 4XX6A 2W4XA 2VRQA 1UKTA 4AD0A 1UWRA 2JE8A 4Z2KA 4R5EA 2ZXDA 2FHFA 4F66A 1VIWA 2PF0A 4BF7A 1E0XA 5AY7A 1CGWA 3W6LA 3SUWA 3CUFA 1UR4A 1TA3A 4C7GA 4W88A 3EDEA 2VZSA 1D7FA 3UETA 1BHGA 1BFNA 1VAHA 1W91A 1GVYA 1UA7A 4PMZA 3WNLA 4HPGA 1GQJA 2QPSA 4HP5A 1E6SM 3SCNA 4AZ7A 4MTVA 3VTRA 1HVXA 2WNWA 1GUVA 4OBRA 1JZ5A 1DWAM 2ZE0A 4DWSD 1VJSA 4GO8A 2BVTA 4ACYA 1L0PA 3AMGA 3AOFA 1G01A 1O6IA 1YQ2A 1BLIA 4ZEPA 5ABFA 3TTQA 3BSHA 5M5DA 1US3A 3WFLA 3SUUA 4UQDA 2WPGA 1U30A 3MUIA 2X0YA 3AYSA 1BG9A 3GH7A 3T0DA 1UWTA 2FHCA 2DSVA 1BVZA 2PBGA 2QMJA 3W4RA 1L8NA 4Z2HA 1H11A 1TFVA 4CCEA 1WKYA 4OKDA 1B3YA 2VX4A 3TA9A 2A3EA 2WLZA 4JHOA 1WDSA 4CD8A 4ATLA 3KWXA 1ZB5A 5A6KA 5A6MA 2VZTA 4QLLA 3NSNA 3VDHA 1G5AA 4BA0A 4TXEA 3U7BA 1Z32X 3MSDA 4WLCA 2J74A 3QHNA 4U33A 5I78A 2E8ZA 1ISXA 4MNLA 1Q6GA 2J4GA 2Z1KA 1JYNA 3IJ7A 1E9LA 1HL9A 3HU7A 4KH2A 1ZBCA 2E9LA 3ZMRA 1JYXA 4MB4A 1KR1A 1CTNA 2W66A 4P8WA 1XGZA 1UKPA 3F5KA 3VU2A 2J7CA 5FKYA 2J7FA 1AQHA 3VINA 3BGAA 1QHPA 3RCNA 3WD1A 4GXPA 3WNOA 1QI5A 2YDRA 3N04A 1CZ1A 1NOWA 1CLXA 1BG4A 3ECQA 3WH5A 1UR2A 3BAIA 3WEZA 1V6YA 3ARUA 3THCA 2Y2WA 4D6GA 2BS9A 4J7RA 1WAWA 2BNJA 3WF1A 5ABEA 3L2MA 3ARRA 5ABFB 1R8LA 4XZWA 2NT1A 4M80A 3WDJA 2UWFA 1H0GA 2XVKA 1WCGA 3WMBA 3ARVA 1LL7A 1J0HA 2XSBA 4V2XA 5JBDA 1JDDA 5A6BA 2DT2A 3W24A 4UNIA 1GNXA 2EQDA 1CBGA 5A2BA 1E71M 3G6LA 1VFUA 4UOZA 1CXIA 1JGIA 1R87A 1QBAA 4H8VA 4JCMA 5JUVA 2EPLX 2CKSA 3MUY1 1VEMA 4AEFA 2X0HA 1FHDA 2VO5A 5IFPA 3L4TA 4GZIA 1OIFA 1NH6A 2PWFA 1XSKA 1VEPA 5I5RA 1QI0A 4KMQA 4MAVA 1IZJA 5D8ZA 1OGBA 3W6MA 1MFUA 8A3HA 1NWSA 3WBAA 4HZ8A 4UCFA 3VMPA 4ATDA 3TP4A 1UH4A 2GJPA 2B31A 1J12A 3GDBA 4CN4A 3ARQA 1OSEA 1W9BM 1XSIA 1ODUA 1MW3A 3L4ZA 3VPLA 3L4YA 3NSXA 4CVWA 4QDMA 3VDBA 4CD5A 3AFBA 3WNKA 3ZT5A 3L4XA 1HJWA 2CPUA 4Z2IA 7CGTA 1UD2A 2FH8A 4W5ZA 5F7UA 1UD4A 1UZ1A 4OUEA 1EQCA 3EDFA 3ALGA 4OBSA 1SR0A 5DT7A 1C93A 3WSUA 1OGGA 2WCSA 5DO8A 1A47A 1EXPA 2E3ZA 3CHEA 1W9VA 3BAKA 1AVAA 1E5NA 1VBUA 1AMYA 3N18A 4CU7A 3ZJ6A 4GI9A 3DHUA 4NZCA 1NM9A 1PX3A 2A3HA 4LYRA 4NSBA 2J79A 3MO4A 3WDRA 2XM1A 1V3JA 5M3WA 3FW6A 5CQ1A 3EMCA 4CVUA 3BAJA 4U2ZA 3VGBA 3F5JA 2WM0A 5E09A 3FAXA 2QHAA 1XC6A 3VIPA 1EIBA 2D1ZA 1MYRA 4U2YA 1XCXA 3HJEA 4Z2JA 3VIHA 3WFZA 3MV01 4U3AA 3PBGA 3WEOA 5M17A 2WANA 5KZ6A 1VFMA 4RE2A 1J0YA 1UH2A 2X2YA 3A4XA 2DEPA 2CHOA 2Y4SA 1DP0A 4MAZA 1DTUA 7A3HA 4TTGA 1KB3A 4RL3A 1RH9A 1E56A 4HOXA 4RE4A 2OWWA 1W9UA 5HDRA 2QV4A 1W32A 1IT0A 2AOSA 2CETA 3OGVA 1QNOA 2BHYA 1JF6A 1J9YA 4PUEA 1JI2A 2WMGA 1JAKA 3L4UA 5BXRA 1GVIA 4UFKA 6CGTA 3WF4A 2QPUA 1XD0A 4AD5A 3T2QA 1QHOA 4F9JA 3AMLA 4PMQA 1M04A 1WDPA 1SFSA 2VTFA 1JFXA 2VVSA 4GKLA 1XYFA 2E8YA 3ARPA 1ESWA 1U2YA 4D6DA 1UD8A 1HJUA 1BTCA 1JNDA 4W89A 2DH3A 1H1NA 3BAWA 3MS8A 2CBUA 5A94A 2XVNA 2ZXAA 2YKKA 3ZJKA 1H0IA 2CBJA 2NT0A 1QNSA 1UA3A 3SCUA 1XH2A 4AWEA 4FMVA 1H49A 5KEZA 2XJ7A 1H4PA 1JYVA 3B9EA 3PZ9A 4GZJA 4UQCA 1E1FA 1TVPA 1JDCA 4CD6A 2O9PA 3JUGA 1KFWA 3CZ8A 3POCA 4J3XA 2DSWA 1VF8A 1W1YA 1CIUA 4IPNB 3PZUA 1HNYA 1TCMA 1VENA 3AHXA 2X8RA 4JFSA 3WQ6A 2DSZA 4AD3A 3O9NA 1F4AA 5BRPA 4PCSA 1M03A 3LPFA 3I3DA 5TD4A 3VVGA 1Q6EA 1NOFA 3M6DA 2YL5A 4HMCA 5ABGA 2YA0A 3QR3A 1NQ6A 3W82A 4U3CA 4JFTA 4J3SA 2G4FA 3LMYA 1WZAA 4XUYA 1CECA 3ARSA 3AIQA 4UOJA 4QCEA 4TVDA 2BY0A 2UY2A 3VDCA 1C3FA 2W92A 4XZBA 1E4IA 2VCBA 3NUKA 4JKMA 3FAWA 2CITA 5IHRA 4A3YA 1BAGA 5HOSA 1XYZA 1VFOA 2W67A 4GPNA 1GJUA 3NDYA 4WSJA 1V08A 1E6RA 2FGZA 4WIWA 2WC3A 4IPLA 5IDIA 2VR4A 4GI6A 4M56A 4FK9A 1JIBA 1JD9A 1UR0A 3BC9A 1CXEA 2EEXA 4JL1A 4CCDA 2CBVA 2G41A 1E40A 2UY4A 2WSPA 2BY3A 1WZLA 4UFHA 1GOQA 3QGVA 4PTVA 1R86A 4PTWA 3WL0A 1UG6A 2XFYA 4UTFA 4M1RA 1H5VA 1FFQA 4IISA 4J3VA 4DUVA 5A6LA 3CZJA 2XUCA 3WL1A 1DWIM 3SCRA 3W26A 3D3AA 5BXPA 4D6JA 2VUYA 1X1NA 3S6TA 1BSIA 3M7SA 1NP0A 4CGTA 1ZL1A 1MXDA 2OLHA 3VIOA 2J62A 2XGIA 3CUGA 2W91A 3AXHA 4BQ3A 2GFTA 1ODZA 1BYCA 1FH7A 2WMFA 2ZUMA 2FDMA 1H09A 1B3XA 3M46A 3SCSA 4H7VA 5JBFA 4WJXA 3AS2A 5DEZA 2WYSA 4AZIA 1QNRA 3AMCA 4MB1A 1CNVA 1BYBA 1OBAA 2WLYA 2WBKA 4PMVA 1E4NA 5D9OA 4D1JA 2DT3A 3POHA 3GBEA 3SUSA 2WVUA 4AIOA 3WY1A 2WCGA 4M8UA 1YHTA 2F2HA 2WMIB 3VM5A 1TZ7A 5JIPA 3IJ8A 3BMVA 1K6AA 1VJZA 3ZIZA 3EDJA 3SCTA 2PWGA 2WK2A 1K9DA 3RMEA 3A47A 4Z2LA 1ISZA 4PMRA 1B0IA 2YJQA 3DYPA 3BCFA 3W81A 1LF1A 1QNPA 3SUVA 4C7DA 3NSMA 4B3KA 4D6EA 2ZX9A 5LA2A 1E15A 1WDRA 4D6HA 4V28A 1NWTA 4MDOA 4B3LA 2WMHA 2YA1A 5HPCA 1PX8A 4D1IA 2JFEX 3QHOA 4EANA 4AZ6A 1HJQA 3AZRA 3OBAA 2WB5A 4W84A 1H41A 5I2UA 4TOQA 4DWSB 1LLOA 3WUEA 2JEPA 3GBDA 2G3NA 2MANA 2IXUA 4FLSA 2CKRA 1UR1A 1EOKA 1E6QM 3ZJ7A 4EAMA 3CUJA 2GVYA 5I0DA 5A8OA 3NCOA 3EDKA 1V02A 3PZVA 4H41A 2J7DA 2A3CA 4JAWA 5E6ZA 3WDPP 1CPUA 1JZ7A 1UZ4A 3MSGA 3UESA 2O9OA 3ARTA 1KBKA 4FLQA 1TG7A 2VZOA 2PC8A 3NJ3A 4X9YA 1LJYA 1J11A 1BVNP 1XH1A 3W28A 1R85A 2DT1A 3DHPA 3WDQA 4F9DA 1LL4A 2XVLA 1EO7A 2FHBA 1E6ZA 3CZGA 2GJXB 4D6IA 1WZKA 4CU6A 1KBBA 3PN8A 2CHNA 4B9ZA 1JYWA 4U31A 1KGWA 3QOKA 5GNZA 4JKLA 1DWGM 3AXIA 3L2LA 3WBEA 4PMYA 3VIMA 3SEPA 4V27A 2V3EA 3SURA 3VKKA 1FP8A 3KL5A 3VDAA 1FH9A 1JFHA 4AISA 3AMKA 1XSJA 3UR8A 4P7NA 5C8BB 2V5DA 3WELA 4HA1A 5AC5A 1HKJA 1J0JA 1GOWA 2YDQA 3ARXA 2BXYA 3WNPA 3IAPA 3WENA 1GONA 5GQBA 1MFVA 3T0AA 1SYTA 3WD0A 5BRQA 2E40A 4PUDA 1UOKA 1HIZA 3VILA 2BHUA 6A3HA 2JF6A 4TTUA 2J47A 1EOMA 4W7UA 3W27A 1JD7A 5C71A 2RGLA 2VQUA 1EO5A 1E1EA 2WVTA 4F79A 1W1PA 2PWHA 2ZWYA 3VNZA 2EO7A 2JEQA 1UYQA 2PB1A 5I3DA 3AIUA 4W7WA 2CIPA 5AYBA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2WHM A;  1QBB A;  1B1Y A;  1KWG A;  4NI3 A;  1FHL A;  1GOR A;  4PN2 A;  3UG5 A;  2V38 A;  3FXY A;  4PMU A;  4LPC A;  2BXZ A;  3WH8 A;  4J28 A;  4UZS A;  1CGV A;  1CYG A;  1UQZ A;  1EA9 C;  1QI2 A;  1HKI A;  1F4H A;  4QLJ A;  2CER A;  2Q8X A;  1W1V A;  4OOZ A;  4WKF A;  1UWI A;  2WKL A;  2BY1 A;  1E3Z A;  1PAM A;  4D71 A;  1TE1 A;  4UFM A;  4HZ7 A;  1QPK A;  3T2O A;  4W8B A;  4B15 A;  3AIR A;  4CKQ A;  3ALF A;  2VVN A;  1N82 A;  3N15 A;  4UFI A;  3BAY A;  3RJY A;  2NSX A;  3U5Y A;  3OLG A;  3T09 A;  4EKJ A;  3GM8 A;  2CXG A;  1W3J A;  3ARW A;  3AIB A;  4UQE A;  1B3W A;  1GOI A;  3K1D A;  1TMQ A;  4L4O A;  9CGT A;  1WO2 A;  3TTO A;  4CN1 A;  3WMC A;  4GQR A;  2WXD M;  1E70 M;  3E1F 1;  1W3K A;  3W29 A;  2GJR A;  3CBW A;  3ZR5 A;  2DGA A;  5FCZ A;  1A3H A;  5HBF A;  1QI3 A;  4UFL A;  2OSX A;  5BCA A;  3AHT A;  4PCT A;  4E8C A;  5CXP A;  3MUZ 1;  1ZBW A;  5ABH A;  1UD6 A;  4W85 A;  5EFF A;  4DM1 A;  2ZX5 A;  1UUQ A;  1I75 A;  2WSK A;  1M01 A;  4J3T A;  3K46 A;  2VOT A;  4PSR A;  4J3W A;  2YOC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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