4HZ6A

Crystal structure of bglb
Total Genus 176
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
176
sequence length
441
structure length
441
Chain Sequence
KKFPEGFLWGAATSSYQIEGAWNEDGKGESIWDRFTRIPGKIKNGDSGDVACDHYHRYEQDLDLMRQLGLKTYRFSIAWARIQPDSSRQINQRGLDFYRRLVEGLHKRDILPMATLYHWDLPQWVEDEGGWLSRESASRFAEYTHALVAALGDQIPLWVTHNEPMVTVWAGYHMGLFAPGLKDPTLGGRVAHHLLLSHGQALQAFRALSPAGSQMGITLNFNTIYPVSAEPADVEAARRMHSFQNELFLEPLIRGQYNQATLMAYPNLPEFIAPEDMQTISAPIDFLGVNYYNPMRVKSSPQPPGIEVVQVESPVTAMGWEIAPEGLYDLLMGITRTYGKLPIYITENGAAFDDQPDQSGQVNDPQRVGYFQGHIGAARRALADGVDLRGYYAWSLLDNFEWAEGYSKRFGIIYVDFETQQRTLKQSAQWYRDVIANNGLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural insights into the substrate recognition properties of beta-glucosidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Beta-glucosidase
molecule tags Hydrolase
source organism Uncultured bacterium
total genus 176
structure length 441
sequence length 441
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00232 Glyco_hydro_1 Glycosyl hydrolase family 1
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4hz6A00
2VZSA 1E0VA 2B31A 3VMPA 3TTSA 3WH7A 2J7DA 4QLJA 2DGAA 3CLWA 4BQ5A 2Y2WA 3A4XA 4YHGA 5LA0A 1MQRA 5EBAA 4H04A 4MADA 2GK1B 3VIFA 3BLPX 3WDHA 1PX3A 1CECA 1GQIA 3TTOA 3OIHA 4W5ZA 3I3BA 4UZSA 1ZS2A 1WZKA 1H0GA 3L2LA 2VRKA 1EOKA 3ARUA 1HJVA 4AZ6A 1NH6A 3VD9A 3WD4A 1ODUA 4LQ1A 2IXVA 2FH6A 4H7VA 1UH2A 2DH3A 3CMGA 1W32A 1VRXA 3SCWA 4JKKA 3F5KA 5HPCA 2EQDA 1G5AA 3W53A 4D1JA 4D6DA 1H11A 1SMDA 1D7FA 1DEDA 1MXGA 5A6BD 3PZOA 2CBVA 2WWCA 5HBFA 2XG9A 1E1FA 1EQCA 1QOXA 1W9DM 3VIMA 4B3KA 2CITA 2J7BA 5BXSA 1R85A 1LG2A 3VOCA 2BY3A 3AMCA 5E6YA 3FAXA 1X6LA 2ZIDA 4PN2A 1E56A 4MAVA 4F9JA 3BXWA 4TTGA 3RM4A 1M04A 5A8NA 4ZE5A 5CJ5A 1GOWA 5CSYA 3F4VA 5LA2A 1UR4A 1VENA 1J0YA 1PEZA 2WAGA 1XH0A 3AIWA 3PZVA 4GKLA 1KR1A 4K68A 3BC9A 2Y5EA 4U5KA 1E6SM 3EDKA 1CXHA 5HDRA 3MUIA 4WF7A 2J7FA 2NT0A 1MW2A 1JAKA 1U30A 1VF8A 2WXDM 2VCBA 4AZ5A 4M81A 2ZX8A 2YKKA 5DO8A 1K9FA 5LYRA 2A3BA 4W88A 3ZJKA 1ZB5A 2XSBA 4URIA 2J62A 1E4MM 1OSEA 2ZOXA 3AMDA 3WMCA 3THCA 1OT1A 4S3KA 4JCMA 1B3XA 1Q6DA 1V3HA 1JNDA 3VGDA 3WEOA 2XJ7A 1CGWA 4CUCA 2EPNA 1HKMA 3UESA 3MMDA 1FH7A 5D9NA 1H1NA 1UG6A 1E6RA 1V0MA 1V08A 2PBOA 1GQKA 1GW1A 5ECUA 3OZOA 4HZ6A 1C8XA 4UR9A 5KEZA 1HKJA 2E9MA 3SCSA 1CBGA 1EIBA 1NP2A 4NF7A 2WVVA 4DWSB 4PSPA 3CZEA 2PI6A 1HJSA 2PWFA 1JGIA 1MQQA 1R86A 2WMJA 1A47A 2WMIA 1AVAA 1J18A 5E09A 1J11A 1B90A 1W3KA 2PBGA 2J75A 5JIPA 2WVSA 2X05A 3AHZA 3WN6A 4D6HA 4RE4A 4PMZA 3CTTA 1Q6FA 2W5FA 1MXDA 1CGTA 3CPUA 2X0YA 2V5DA 3QOMA 1TFVA 5I79A 2QPSA 1GORA 2J79A 3AIQA 4D6EA 1W1YA 5D9MA 3SUTA 3WF3A 3N18A 3EDJA 3CHFA 4M1RA 2WBKA 1UKSA 3PZ9A 1QNRA 1JI2A 3M6DA 4Z2HA 2ZUVA 3ARSA 4AZCA 1KWKA 2UY3A 4UFMA 1Y7VA 1VBUA 2V3GA 4CCCA 3NIYA 3OLIA 4JKMA 4PTWA 4N42A 1VEPA 2WMKA 3SCTA 2VO5A 2DSKA 4OOZA 3W6MA 1XD1A 4E8DA 2VQUA 2YBTA 1UD3A 2JF7A 1B3VA 3QHNA 3WFZA 1H5VA 5A6JA 1KXVA 1HT6A 3RPMA 2ZXBA 2C7FA 2J78A 1UQZA 2FGLA 3WMBA 3DYPA 1PZ2A 3ARTA 3VD4A 2OYMA 4QFUA 4J3WA 4MJ2A 5BRQA 3S2CA 4XUYA 4Z2LA 1L8NA 1OBAA 1CEOA 2VOTA 2JIEA 1M53A 1GOKA 2YA2A 3WBEA 2VRQA 1XCXA 2EBNA 3ZR5A 5AC4A 5I5RA 4UFIA 3WDRA 2VMFA 3ZT7A 1CWYA 1VIWA 3A47A 5AYBA 1E70M 1E6ZA 1BVNP 3WIJA 2OSXA 5DT5A 1UKTA 2YL8A 1C3FA 5D8ZA 1CGUA 5A6MA 4AEEA 3PZNA 1AQHA 1PBGA 5BXRA 3W28A 2W91A 2XGBA 3W4RA 1WZMA 3G6MA 2G3NA 4MNLA 3KL3A 4W8BA 1OIFA 2GJRA 5A8PA 1V3KA 3CMJA 4DUVA 4J3VA 3VGEA 3B9EA 3OLDA 3EMZA 4H2CA 3AXIA 4OOUA 4ZXLA 4MAZA 5I6SA 3GH5A 4AD3A 2FH8A 3L2MA 4W5UA 4IUGA 5ABHA 3WNMA 3QHOA 3CHEA 1CTNA 1WCGA 4JFSA 1XC6A 1J01A 1B3ZA 1IV8A 2A3CA 4A3YA 5IXEA 3WUBA 3CHDA 1VFOA 5ABFA 5CG0A 5A6AA 3TOPA 5IDIA 3BGAA 4NSBA 1C7TA 2QPUA 4FK9A 1UKQA 2D22A 4UQCA 1DWGM 5IHRA 3HJEA 1UYQA 4D6IA 5E6ZA 1FH9A 1UWUA 2VJXA 3K4AA 4UQ9A 1EDGA 3GXIA 2CHNA 1CIUA 4ATLA 2W4XA 1HP4A 1QI0A 4KRUA 5BWFA 4GINA 4M80A 3EMQA 3VGFA 4N0RA 3RJYA 4XB3A 1K9TA 4QAWA 4ATDA 1EQPA 1K9DA 1TVNA 1ISXA 2OWCA 4HA3A 2NT1A 4P7OA 2VX7A 3AZSA 2CCRA 3AS2A 4M24A 3FHAA 1W9VA 5C8BB 1N82A 1YHTA 1GJWA 3MV01 4XZBA 2VC9A 3CUIA 4AC1X 3VMOA 2X1IA 3PTQA 3TTQA 4W84A 4AZGA 1RP8A 5GNXA 5CPTA 1UZ1A 1ZBWA 3HU7A 2HVMA 2ZXDA 1H3GA 2EEXA 5GNZA 1QI4A 1UD5A 3WNPA 3GH4A 1E4NA 1BYCA 4WIWA 1ESWA 2G8ZA 3NSMA 3CUHA 4OKDA 4ZXOA 3WQ6A 1V0LA 3D5HA 2X2YA 3L4XA 3WD1A 1W91A 4NI3A 4PUEA 4KRTA 1HX0A 4LXFA 4MB3A 3ZQ9A 3U7BA 3WQ5A 1VJSA 3N15A 2J8GA 3BAXA 1IZKA 5HOSA 3BAWA 5JIWA 2VR5A 3WH8A 1EXPA 3ARZA 3T2QA 1W9PA 4NRSA 1GPFA 3ARWA 3ARQA 1QBBA 1BGAA 1LL4A 1UD6A 3VMNA 3OGVA 3EDDA 1J0ZA 2X09A 3HMCA 3RIKA 3VPLA 2WNWA 2D23A 4CD6A 2Y8KA 4A4AA 4W8AA 1V03A 3VO0A 3WDQA 1E3XA 1RD6A 1KXTA 2UWFA 1DWHM 2ZX7A 5CPQA 4AXNA 4CGTA 1TZ7A 1FHDA 1M01A 2XVGA 1U2YA 2D0FA 4PMUA 4HTYA 3PTMA 3WY1A 3APGA 1E15A 4UTFA 2WM0A 4QP0A 4M56A 4EKJA 4Z2GA 4IM4A 2IUZA 4WSKA 3VGHA 3UETA 1HJXA 1C8QA 3VNYA 5DFAA 4D6GA 1OT2A 2XVPA 2WHLA 1DWAM 4LYQA 3BAYA 3MUAA 1F4HA 1QI2A 1BPLB 4XV0A 1NM9A 1UA3A 4GZIA 5CPSA 3W25A 4D1IA 1B3WA 2VL4A 1QPKA 5FD0A 3CBWA 2JFEX 4U3CA 1W9XA 2O9OA 4WK9A 1ZBCA 4CN6A 2PWHA 2VZTA 1PIFA 1P6WA 4BZYA 1BTCA 1E9LA 2QV4A 2DEPA 2BS9A 1ZJAA 4LGXA 1KR0A 3JUGA 1KBKA 4MNJA 1LG1A 3THDA 3ZOAA 1GNXA 2VVNA 4JIEA 1KCKA 3VIPA 1GOMA 3ARXA 3FAWA 1BYDA 2BFGA 3L4YA 2YJQA 3ZJ6A 3II1A 1E73M 4TUFA 1HVQA 3WL1A 1MW0A 3U7VA 1W3LA 1LJYA 3GNPA 5IFPA 1VFUA 2CESA 1JI1A 5A6BA 1G9HA 4M82A 1E71M 4ACYA 3M7SA 4Y7EA 1H2JA 3AFBA 7CGTA 2V5CA 3PZQA 3T2OA 1UR2A 3UG4A 2QMKA 1HKKA 2FHBA 4HOXA 2G3JA 1KGUA 1EDTA 1W3JA 4PTVA 1NWRA 2W61A 3SCPA 3SUWA 3WQ8A 4E8CA 1JAEA 1TCMA 2PWDA 3VX0A 1LWJA 1XRVA 3M07A 1NWSA 1XV8A 1ITXA 1UKPA 5I0DA 3EDFA 3POHA 2GJXA 3NJ3A 3VIOA 4Z2KA 1LWHA 1HN1A 3ZMRA 2VVSA 2AAAA 1X6NA 1V02E 3SCRA 4AD0A 4AZHA 1JZ6A 1KWGA 5C71A 4J3UA 4PCTA 4P7QA 8A3HA 1IZJA 1MVYA 4CU6A 1Q6EA 3SUUA 1PIGA 5F7UA 3K1DA 4JFTA 4B16A 1XD0A 1XHGA 1EGZA 3K8KA 3NCOA 1J0JA 1VBRA 2UY5A 4J3SA 3TTYA 2OWWA 4EANA 2WB5A 5CGMA 4QCFA 3CH9A 2W92A 2WLZA 5D8WA 3GNOA 1TMQA 5GPRA 4HA1A 3BAKA 1HF6A 2J25A 1J0HA 2C0HA 2DSWA 1H09A 1FOBA 1J0IA 3MO4A 3K46A 4TX8A 1E72M 3AS3A 2BV9A 2XYLA 3VDBA 1ISZA 4JFWA 1R7AA 3ZSTA 5GQBA 3NSXA 3WNKA 1ISYA 3SIMA 1E0XA 3WEZA 3AIVA 4HZ7A 2BY2A 4RE2A 4CCEA 2BNJA 5EFFA 4UFHA 5M3WA 2VTFA 3EYPA 1ITCA 1VAHA 1LQ0A 5A95A 1Q4NX 1UWTA 1FHLA 2X8RA 4IPNB 4JL1A 1J9YA 2AOSA 3VIIA 3CZLA 5I77A 4AY1A 1BF2A 5D9PA 3WDIA 4CD8A 3CZJA 1JZ3A 1BVZA 1ZJBA 1F4AA 4PMYA 2X0HA 3MU7A 3AZRA 5I24A 3BSGA 5EFDA 1W1TA 5HNNA 1CXLA 3AHXA 4L4OA 5CLWA 1UOKA 4IISA 1XSIA 1FP9A 4JCLA 5A6LA 3W38A 4PSRA 1UD2A 2W63A 3VILA 2DT1A 4W87A 3MS8A 3VIKA 1GOOA 3A3HA 3SCOA 2WHJA 4FLRA 4OUEA 3AMGA 4JHZA 3N11A 1B30A 1GQJA 1WDSA 1GOIA 2VCAA 3F5LA 4B9ZA 1KXQA 9CGTA 4PCSA 2VT0A 3EMCA 3KL5A 4P8VA 1CXFA 1OIMA 2OSWA 1JXKA 2WANA 1HL9A 4HU8A 2ZUWA 2F2HA 2XPKA 1JFHA 3IANA 4XZWA 4C7DA 4GXPA 1BGGA 4DWSD 5IHSA 3GDBA 4TX6A 1ECEA 1C92A 3WBAA 1NOUA 5FKYA 4JKLA 1TG7A 3CHCA 4HMEA 1I75A 2DT2A 2XFRA 1Z32X 1UH4A 1RH9A 2YL5A 3OB8A 4GIAA 4AD1A 3WELA 1L0PA 4TOQA 1JIBA 5FCZA 3E1F1 5E0CA 3BCDA 2WVVB 3CO4A 4HPHA 3PZTA 1JDAA 4P8WA 1WDRA 1CGYA 3ARVA 1M03A 3ZJ7A 1E4IA 2OWXA 3RCNA 4AYSA 2ZWYA 2WMIB 2WMFA 4UQAA 1QI5A 3IJ7A 2VQTA 2G41A 4C7GA 1DHKA 4J27A 1ODZA 2V3EA 1DWJM 1C93A 3WH5A 2CKRA 4UOQA 5CSUA 3IAPA 4PMNA 2OSYA 1JZ4A 1PPIA 2J7GA 1C7SA 3OGSA 2YL9A 1GZJA 4CCDA 3N17A 3QOKA 2XHYA 4PMXA 4WKFA 1HKIA 3VGBA 1H0IA 2WSPA 2DPEA 4LPCA 3W0KA 4QCEA 1V6WA 3L4TA 4W7VA 4CU8A 3N04A 2QHAA 4AZCB 4J3XA 3DC0A 1DTUA 4PMOA 2E9LA 1OB0A 3QR3A 4S3JA 1WB0A 4FF5A 3GM8A 3ALFA 4KGLA 3A6OA 4UFLA 3WF4A 1KGXA 3F5JA 1UR9A 3T2PA 2D0GA 5DEZA 4BQ2A 3SUVA 4GQRA 1HJQA 2VI0A 4IPLA 4GQQA 2ZUSA 1OM0A 5BROA 3WF2A 2EJ1A 2J4GA 4ACZA 1G0CA 2CXGA 2DIJA 5A2BA 1E1EA 2F8QA 5JBFA 2JALA 2WC7A 1ZBKA 1C90A 1UZ4A 4V28A 1JYNA 2JIWA 1LL7A 1E40A 1V3IA 1WPCA 4JHOA 4DUWA 6A3HA 2CPUA 3GBDA 2GUYA 2WYSA 4CD4A 1UQYA 3LPGA 4BF7A 2WZIA 4AZIA 2F61A 1W1VA 1J0KA 4HU0A 3RMEA 1PX8A 1R87A 1V6YA 3WKZA 1ZU8A 4PEEA 3SCVA 4FMVA 4AIUA 2XVKA 4PMVA 4GI8A 4MB5A 5CQ1A 2DDXA 1HXJA 1OINA 1BG4A 1WP6A 2XGIA 2OYKA 2WCGA 1V02A 4DUXA 3PBGA 4CD5A 1KXHA 3ZT6A 1GVYA 3T09A 2CERA 5CLTA 1NOWA 2FDMA 1FP8A 3BAIA 3W81A 1UUQA 2O9TA 1TA3A 2XFYA 2WVTA 2CHOA 1H41A 1U33A 1UD8A 4HMCA 1B2YA 1QNQA 2GVYA 3RM8A 2VX4A 2DH2A 3OA5A 4PTXA 1ZBVA 1MWOA 1CDGA 4CVUA 5I2UA 1HP5A 2EO7A 2YLLA 3K8MA 4AW7A 2J77A 3VM5A 1UWIA 4H8HA 4JZ5A 3WF0A 4DWSC 3GZAA 4FLOA 5EMYA 1JXJA 1XCWA 3UG3A 2E9BA 3AIUA 3MSDA 3AMLA 4H8UA 4NRRA 3AHVA 1LL6A 5M5DA 5ABFB 2BVTA 2ZXAA 4P8UA 2XUCA 5A3HA 2WZHA 7TAAA 2CBUA 1UWSA 1NWTA 1GVIA 5A94A 5E70A 4PRWA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2VZS A;  1E0V A;  2B31 A;  3VMP A;  3TTS A;  3WH7 A;  2J7D A;  4QLJ A;  2DGA A;  3CLW A;  4BQ5 A;  2Y2W A;  3A4X A;  4YHG A;  5LA0 A;  1MQR A;  5EBA A;  4H04 A;  4MAD A;  2GK1 B;  3VIF A;  3BLP X;  3WDH A;  1PX3 A;  1CEC A;  1GQI A;  3TTO A;  3OIH A;  4W5Z A;  3I3B A;  4UZS A;  1ZS2 A;  1WZK A;  1H0G A;  3L2L A;  2VRK A;  1EOK A;  3ARU A;  1HJV A;  4AZ6 A;  1NH6 A;  3VD9 A;  3WD4 A;  1ODU A;  4LQ1 A;  2IXV A;  2FH6 A;  4H7V A;  1UH2 A;  2DH3 A;  3CMG A;  1W32 A;  1VRX A;  3SCW A;  4JKK A;  3F5K A;  5HPC A;  2EQD A;  1G5A A;  3W53 A;  4D1J A;  4D6D A;  1H11 A;  1SMD A;  1D7F A;  1DED A;  1MXG A;  5A6B D;  3PZO A;  2CBV A;  2WWC A;  5HBF A;  2XG9 A;  1E1F A;  1EQC A;  1QOX A;  1W9D M;  3VIM A;  4B3K A;  2CIT A;  2J7B A;  5BXS A;  1R85 A;  1LG2 A;  3VOC A;  2BY3 A;  3AMC A;  5E6Y A;  3FAX A;  1X6L A;  2ZID A;  4PN2 A;  1E56 A;  4MAV A;  4F9J A;  3BXW A;  4TTG A;  3RM4 A;  1M04 A;  5A8N A;  4ZE5 A;  5CJ5 A;  1GOW A;  5CSY A;  3F4V A;  5LA2 A;  1UR4 A;  1VEN A;  1J0Y A;  1PEZ A;  2WAG A;  1XH0 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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