1B3Y | Genus

Total Genus 127

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	127
sequence length	302
structure length	302
Chain Sequence	EASVSIDAKFKAHGKKYLGTIGDQYTLTKNTKNPAIIKADFGQLTPENSMKWDATEPNRGQFTFSGSDYLVNFAQSNGKLIRGHTLVWHSQLPGWVSSITDKNTLISVLKNHITTVMTRYKGKIYAWDVLNEIFNEDGSLRNSVFYNVIGEDYVRIAFETARSVDPNAKLYINDYNLDSAGYSKVNGMVSHVKKWLAAGIPIDGIGSQTHLGAGAGSAVAGALNALASAGTKEIAITELDIAGASSTDYVNVVNACLNQAKCVGITVWGVADPDSWRSSSSPLLFDGNYNPKAAYNAIANAL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Family 10 xylanase
publication title	Xylan binding subsite mapping in the xylanase from Penicillium simplicissimum using xylooligosaccharides as cryo-protectant. pubmed doi rcsb
molecule keywords	PROTEIN (XYLANASE)
total genus	127
structure length	302
sequence length	302
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	1998-12-15

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1b3yA00

2BV9A 5M17A 2J7HA 2ZX8A 2XVLA 3QOMA 1LWJA 4BQ2A 2W62A 4P7QA 3KE0A 1U30A 1Z32X 2YIHA 1E5JA 4D71A 1JZ2A 4KWUA 4E4PA 1E6SM 4HA4A 4JFVA 3AS3A 1K9DA 2IXVA 5ABEA 3AMCA 4OJYA 3HU7A 2WSPA 3A47A 1TMQA 1QBAA 2EXOA 2VX4A 3FXYA 3NJ3A 2FHFA 3IJ8A 4YHEA 3PZGA 4RE3A 2VZUA 1H1NA 2B31A 1CECA 2CKRA 2WMGA 3GM8A 3NSMA 3ZJ6A 3B9AA 1JXJA 3DYMA 4CCEA 4DUWA 1L8NA 2D23A 4BA0A 4OBSA 1JD9A 3RCNA 2X1IA 4JFWA 2YDRA 5IFPA 3EMZA 4EKJA 1E1FA 1KB3A 2XVKA 1E3ZA 5A6MA 4JHOA 2IUZA 4M24A 2FGLA 3VNYA 2EBNA 2YLLA 4FMVA 3EYPA 3BMVA 2VRQA 4J3XA 2ZUTA 4BQ3A 3PZ9A 1HJVA 1V6VA 1CXEA 3WH5A 3SCTA 5BRQA 1H3GA 3VMPA 2WCSA 4WIWA 1J11A 3TTYA 5BXTA 1RD6A 3AISA 4CU6A 4GKLA 1B30A 1E4NA 1V02A 4OUEA 4LGXA 1CXKA 3WH9A 4HZ7A 3AHVA 5TD4A 2CESA 4W7VA 3UG4A 1QW9A 4J7RA 1JDDA 1RPKA 3TTQA 1EO7A 3MU7A 4S3KA 3VD4A 3WFZA 1B1YA 5E6YA 1PEZA 3MMDA 4NI3A 3AROA 3ARVA 3BLPX 5GNZA 4C7FA 1H41A 1HVXA 3TTOA 1XH0A 1GOIA 3VDHA 4MNJA 4GQQA 4D6CA 3S2CA 1V3HA 3BAWA 5I0DA 4PMRA 4UCFA 5HPOA 4AD5A 3FY1A 4M56A 2DQXA 1W2PA 4F8XA 3FHAA 2A3CA 2ZICA 3CZJA 4QLLA 3AYSA 1CTNA 5A6LA 5CQ1A 1MFUA 3ZM8A 2GDVA 1B31A 4JCMA 1B2YA 2ZUSA 3QGVA 1A3HA 1E73M 1UOKA 4Z2HA 2G3NA 3WD4A 4UOZA 1F4HA 4TTUA 2DIJA 4AW7A 3ZO9A 1GCYA 2VT0A 3IJ7A 1BYBA 1CIUA 1ZBKA 4WLCA 3SCUA 1GPFA 3RM8A 1HJXA 3VDAA 1EQCA 2QPSA 5F7UA 3BH4A 3WD3A 1EGZA 4ZFMA 1OSEA 1UHVA 4J3VA 2G41A 4OIFA 5A8OA 3PZTA 4RE2A 1CGXA 3OA5A 1UG6A 1C8XA 2EPLX 2Y4SA 5M3WA 3CZKA 2GK1A 4JFUA 1W9BM 1WZMA 2X09A 3L4VA 2WK2A 2J62A 3WQ6A 2J8GA 1R7AA 1BQCA 4AZBA 4JZ5A 3PZQA 2WW5A 4MPKA 2PWFA 2WVSA 1JGIA 4Z2KA 1E71M 1XYZA 4DUVA 1C8QA 3RJXA 1ISXA 1PAMA 4UFJA 2DSVA 1B0IA 2OSWA 3MS8A 5EMYA 3CHFA 2YDQA 1HJWA 5D9NA 4QDMA 5I6SA 4J3TA 2J25A 5E0CA 1XSIA 4QP0A 4MNMA 5CLTA 5BXRA 2BY3A 3THDA 3CH9A 1QNRA 3EDKA 4PTMA 2GVYA 3WMBA 1HKMA 4MAZA 3K46A 1LL7A 4AIUA 1J0IA 3L4UA 1FFRA 2XG9A 1GHRA 2F2HA 3M7SA 3WMSA 2BY2A 3RIKA 1JZ5A 2E3ZA 1CLVA 2YJQA 3TOPA 1K9FA 4D6IA 3GXIA 3B8SA 5BWFA 7TAAA 1E55A 1E15A 2ZUVA 5HPCA 2QF8A 1DWIM 3ZJ8A 3WF3A 3RILA 3AHTA 2V3GA 2DSZA 3WBAA 1XYFA 1JDCA 3M07A 2ZX9A 4X0VA 4OBRA 4GIAA 1WB0A 2VRJA 3MANA 3W28A 3NYDA 2VL4A 1B3YA 1HKIA 1UD2A 3K8MA 2OWWA 4XV0A 2X0YA 2WC4A 1J18A 1CDGA 4W87A 1U33A 3PZOA 1EA9C 2JEPA 3POHA 4RL3A 2VRKA 2XVNA 1GQKA 1AQ0A 2D24A 2W4XA 2OYLA 3CHEA 4TVCA 2YBTA 1C3FA 3AXXA 3GBDA 4LXFA 1V0MA 3DYOA 2D22A 3O2LA 3HMCA 1BVNP 3SCRA 2W63A 4GPNA 2XVGA 4WKHA 5A1AA 3QR3A 4Q7NA 3VIGA 1V6YA 5CLWA 1DEDA 1WE5A 5JBFA 2ZUNA 4M81A 1QI5A 1BG4A 5LYRA 1VF8A 3PZIA 3WBEA 3K4AA 1NP0A 3ZSSA 3WD2A 2XM1A 5E70A 5KEZA 4MNLA 2CKSA 3L4WA 1GVIA 3ARXA 1CWYA 2XM2A 1PPIA 1VBRA 3IAPA 1XD0A 1XHGA 4PTXA 4DWSB 4MJ4A 1Q6CA 3K4DA 4GZEA 3VIMA 1PX3A 3WF2A 3LPOA 4FLSA 3VMNA 2YL5A 1SMDA 2XSBA 3SUTA 2YA2A 4M80A 3NIYA 3N9KA 1VFOA 2XIBA 3TONA 1I75A 1JFHA 2ZUUA 1UQZA 3GZAA 1X1NA 2V5CA 2WHMA 3CO4A 5FD0A 2D3NA 1E4LA 2UY5A 2ZXQA 3OIHA 5IDIA 2MANA 5E09A 2OWXA 4ATDA 1QNSA 3N13A 2W67A 2Q8XA 2YDSA 1V03A 4UFIA 1QI0A 4UFHA 1VIWA 3FHQA 4UR9A 4GXPA 1K6AA 2CBVA 1W9PA 3EMCA 4J3WA 1OWQA 1QW8A 2Y8VA 3CLWA 1JF5A 1GONA 3RO8A 1VJZA 2O92A 4PMXA 5I79A 3CUFA 5D9OA 3CZ8A 2Z1KA 1HL9A 3PTKA 3VIIA 3W0KA 4AIEA 1E9LA 4KGJA 1WNOA 2A3EA 5JBEA 1E72M 5GPRA 1X6LA 4ZE4A 5EFFA 5CPTA 4BCEA 1NOWA 1OINA 3KZSA 1MQPA 4HA3A 3VGDA 1QHZA 4P7RA 3II1A 1JZ6A 3BLKA 1WAWA 1GUVA 4UQAA 4KMQA 3K1DA 5DEZA 1DHKA 1JAKA 2VQTA 1JI1A 3NDZA 3IAQA 2E9MA 3MMWA 3W29A 5HXMA 2CHNA 1KCLA 1JG9A 1E40A 1OGGA 3BAIA 4GO9A 3W38A 3CUHA 1E4MM 3VIOA 2YL8A 1AMYA 4ZENA 1E43A 3AZTA 1UWUA 3KL3A 4CUCA 2WHKA 1PJ9A 2J7CA 5JUVA 1CGVA 3ZJ7A 2WLYA 1UKQA 1VEPA 4JFTA 3VIKA 1MWOA 3KL5A 3EDFA 3FN9A 2GFTA 1ITXA 2FHBA 2V38A 3N15A 4HZ6A 3M46A 4WF7A 2UWFA 5DMYA 4OZOA 3MUIA 4AC1X 1V6WA 2WWDA 3VVGA 4OOZA 4U33A 1PZ3A 2F61A 1V3MA 3VKKA 4LQ1A 3W27A 2CEQA 2QV4A 4XB3A 3A6OA 3D5HA 4A4AA 1SYTA 3ARTA 2WKLA 3N1AA 3ZR5A 1C93A 4JKMA 4H7VA 3W81A 3FAXA 5A8QA 3A4WA 1UR2A 5A94A 1MW1A 4J27A 2VNCA 4FLRA 3CHCA 1TR1A 1IT0A 1B3WA 1XSKA 5LA0A 1HJQA 1CPUA 4HA1A 3EBVA 1US3A 3VD7A 2WKGA 2J47A 1BYCA 3A4XA 4BS0A 2QPUA 4Z2GA 4XUYA 3FW6A 1WDRA 4M8UA 1Q6GA 5M03A 1A47A 1R8LA 4GI9A 5ABFB 3WQ8A 2VURA 3EDDA 2XYLA 1EDGA 2CITA 4HU0A 1V0LA 2PWHA 4P7OA 4B16A 2BY0A 4AD2A 1KXHA 1E6ZA 1QBBA 2XGIA 3AJ7A 1VFUA 2JF7A 4W85A 3W4RA 4MTVA 2E8YA 4MNKA 1OBAA 2VTFA 4JKKA 1XD1A 3ECQA 3NUKA 4BF7A 1PX4A 3CUJA 5CJ5A 3O9NA 4F9JA 2J7DA 4AEFA 3VPLA 3VTRA 2XUCA 1HJUA 5CXPA 5BYWA 1HL8A 4CVWA 3B9EA 3D3AA 1UH3A 2YOCA 5I78A 3OZPA 3HJEA 4PMUA 1BVZA 1TVNA 1V0NA 1VJSA 2V3FA 3VGGA 5IHRA 1V6XA 2CHOA 3SUWA 3UR8A 2WC7A 1E1EA 1JFXA 5D4YA 1W1TA 8A3HA 3EDEA 4HOZA 3MV11 4H2CA 3WF4A 3AYRA 1BGAA 1FH8A 4EANA 4B15A 3AIRA 5LA2A 3VU2A 5ABHA 1GOKA 3WDPP 3BCFA 1UWIA 4PMDA 3ARRA 4WSJA 4FF5A 3WH7A 2G8ZA 3OLIA 3S6TA 1D7FA 1W91A 4UZUA 3CPUA 2O9TA 2TAAA 4CD7A 1HXJA 3WNPA 4IISA 4JL2A 5JIPA 2D20A 5CSYA 3W25A 4CD8A 2ZXBA 3W37A 1UD4A 2J7FA 3CIVA 3L4XA 4RE4A 2XWEA 2YBUA 1UR0A 3U57A 3QHMA 5CSUA 4DWSA 2JEQA 3VNZA 1G1YA 4U3AA 1ISWA 1ZBWA 5DO8A 5HOSA 3WNLA 2QLYA 3WNOA 1QHOA 1EOMA 1V0KA 1US2A 2W92A 4WJXA 3MUAA 1UWRA 3I3BA 1S46A 2FHCA 4B9YA 1HJSA 1OGSA 3OGSA 2WZEA 1BYDA 2W66A 1L0PA 4MDPA 2PBOA 3AIWA 1G94A 3VD5A 3CZEA 2PB1A 3AIUA 1VFMA 2QMJA 4PN2A 3AMGA 2GJXA 4S3JA 1OGBA 2YKKA 4JAWA 5IXEA 2JIWA 2PC8A 1E6QM 2WVVB 4U31A 1YQ2A 2VCAA 1CXFA 3GNPA 4PCSA 4TUFA 2CPUA 3ZT6A 4K68A 1JIBA 1VB9A 4IUGA 2GSJA 1MW3A 4AYSA 5CG0A 1SMAA 4D6EA 5A6JA 1KWKA 3WEZA 2BNJA 4JCLA 3OGVA 1DWJM 3WEMA 1H11A 3T2QA 2UY3A 2D0HA 1BHGA 2Y8KA 1UA3A 3U7VA 4CU7A 1NM9A 3OLDA 1JI2A 1I1XA 1KR0A 4DM1A 2C7FA 4URIA 5JIWA 1MXGA 4R27A 1D2KA 1W2VA 3GXMA 4PCTA 1EH9A 2AMGA 5LA1A 1UKSA 3POCA 1TG7A 5CPQA 5EFDA 4E8CA 1OB0A 4AMCA 5AY7A 2EPMX 5AYBA 1DWHM 2FDMA 4NF7A 1SR0A 1VENA 2WCGA 1TE1A 3WD1A 2VX6A 3AIVA 1RH9A 1JYVA 4BQ5A 4P8UA 1V3IA 3AIBA 2A3AA 1BTCA 1CXIA 5IHSA 1HP5A 2UY4A 3WF0A 1UR8A 3AIQA 2QHAA 2GUYA 1VFFA 2VR4A 2CBIA 4PMQA 2NW0A 4W7UA 3N17A 4Z2JA 1V3LA 2ZOXA 4IPLA 3WL1A 3SCQA 4D72A 2WVUA 4Q22A 2ZWZA 1KFWA 3BSGA 1MQQA 1UYQA 1MYRA 4MAVA 1E0XA 1GOMA 3BC9A 3VD3A 4MADA 1E0VA 3RM9A 3ARSA 3VX0A 1LJYA 1GHSA 2CBJA 1MW2A 3ZSTA 1HVQA 1Q6EA 4W89A 3ARUA 3WDIA 4HMEA 1ZL1A 3WN6A 2C0HA 1GZJA 3KWXA 4ZXOA 1UD3A 1ODUA 4UQEA 3ARQA 2DT1A 1UR9A 1XRVA 1CLXA 2DPEA 3GXFA 2VUYA 2XHYA 5A6BD 4GI6A 2WLZA 3SCPA 3RDKA 2BY1A 1JL8A 4KH2A 1XGZA 3U7BA 4AD0A 4DWSC 4HPGA 3DYPA 2E0PA 4PBGA 1BG9A 4EE9A 1W3KA 2GDUA 3ZOAA 3WKZA 2J79A 4JFSA 2BFGA 5C70A 1W1VA 1NWSA 4CKQA 4HMDA 1LQ0A 2DT0A 5FOOA 3CTTA 1GOOA 3WENA 4MDOA 5A2AA 1QNPA 3SURA 2WYSA 4HZ8A 5ABFA 3T2OA 1EIBA 4AD1A 3K8KA 3RJYA 1UH2A 3UERA 2VCCA 1KGWA 2PWDA 2YL6A 1WZLA 1UR4A 3L2MA 1ZB5A 2VZTA 1TA3B 1CENA 3BAYA 1JYXA 4MB5A 1FFQA 3G6LA 5KZ6A 2ZXAA 2BS9A 3UG5A 4DUXA 1B90A 1NWRA 4Z2IA 1CBGA 1OM0A 1J10A 3WH6A 1UA7A 3ARWA 3CMJA 3VIFA 1OIFA 4PSPA 1OT2A 4MJ2A 1LF1A 3W82A 3SCNA 3CZGA 1HF6A 4U2ZA 1VEOA 1G01A 1C91A 3SCWA 4QAWA 1UD5A 2J74A 3GBEA 2DH3A 2WXDM 2ZX6A 3BMWA 4ATLA 1J0JA 1NOUA 2BXYA 3SUVA 5I2UA 2G4FA 1IZKA 2WB5A 3DC0A 3OZOA 4LX4A 1XV8A 2XSAA 4U5IA 1E70M 3JUGA 4UFLA 1E6RA 1NH6A 4EAMA 1KGXA 2J8FA 3EMQA 4QFUA 3WQWA 1QPKA 1ZJBA 3G6MA 1EDTA 2WC3A 2JE8A 3L4TA 1EDQA 1W3HA 4L4OA 2PF0A 1MVYA 4TX8A 1HKKA 2A3HA 4AZHA 4P8VA 1BLIA 4OOUA 4H8VA 4MB3A 3TTSA 1X6NA 1HKJA 4WK9A 4B9ZA 2GJXB 1G0CA 3UR7A 3WQ4A 3WUEA 2VX5A 1KCKA 3PHAA 1VAHA 3EDJA 2Z1SA 1FP9A 1ISZA 1NWTA 3AXHA 3VGFA 2WAGA 2VZSA 1UKOA 1W9UA 1Y7VA 2DGAA 1JZ3A 1KXQA 2Y24A 2EJ1A 3VMOA 2XFYA 1E56A 2A3BA 3OB8A 3OG2A 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4AD3A 1OD0A 3VILA 3W6LA 1UWTA 2DSWA 1MQRA 2OSYA 2J78A 1OIMA 2CCRA 3WQVA 3AICA 3CGTA 4QLJA 2CYGA 3N04A 2NSXA 3GH5A 4LYRA 3PZUA 5GQBA 1BSIA 1E0WA 4V28A 2WWCA 1FH7A 2PWGA 1GQJA 8CGTA 1WKYA 3AQUA 5ABGA 2FH8A 1W32A 3AZSA 4AY1A 3OLGA 4Z2LA 2G3IA 3MSDA 5CGMA 2DSKA 1UZ4A 3NDYA 2D0GA 3N12A 4GI8A 3WDJA 2E9BA 4PMOA 3THCA 5DF0A 3MO4A 5A6AA 1DWAM 3WIJA 1JYWA 3WDRA 1SFSA 2E40A 2BHUA 1B3XA 3BXWA 2WANA 1LG1A 4H04A 1AVAA 4LYPA 1ZBVA 1DP0A 3T0BA 1OCQA 3AHZA 1Q4NX 1G9HA 3IK2A 4H41A 4CVUA 3NCOA 1NOFA 1TA3A 3LMYA 2J75A 1CGUA 3GNRA 1PIGA 3VOCA 1UKTA 5JBDA 2DSUA 4F79A 2E4TA 3BGAA 4JKLA 4HU8A 1J0ZA 2WZIA 3ZT7A 5A69A 2XFRA 5GNXA 1KR1A 2VCBA 3UG3A 1J0HA 3CMGA 5EBAA 2WPGA 1HX0A 6CGTA 4AZCB 1NARA 1J12A 4XZBA 5D8ZA 4ZEPA 2ESCA 2O9OA 1CGWA 2JFEX 1W9DM 1M53A 4GQRA 2X8RA 2ZE0A 3N11A 4AD4A 1FHDA 4E2OA 3WDQA 4N0RA 2XGBA 4XZWA 4AXNA 3WH8A 1HT6A 3ARPA 1CXHA 3A3HA 4AZ6A 3FNDA 1D3CA 1W1YA 4PMVA 1N82A 2ZWYA 1XC6A 3OGRA 4Y7EA 3WY1A 3PZVA 5FCZA 1ESWA 1W1PA 4PSRA 2EPKX 5BXPA 1TUXA 1CEOA 1EHNA 2WMHA 4V27A 3T0AA 4LYQA 1QNOA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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1B3YA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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