3UWWA

Crystal structure of staphylococcus aureus triosephosphate isomerase complexed with 3-phosphoglyceric acid
Total Genus 88
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
88
sequence length
254
structure length
254
Chain Sequence
SMRTPIIAGNWKMNKTVQEAKDFVNALPTLPDSKEVESVICAPAIQLDALTTAVKEGKAQGLEIGAQNTYFEDNGAFTGETSPVALADLGVKYVVIGHSERRELFHETDEEINKKAHAIFKHGMTPIICVGETDEERESGKANDVVGEQVKKAVAGLSEDQLKSVVIAYEPIWAIGTGKSSTSEDANEMCAFVRQTIADLSSKEVSEATRIQYGGSVKPNNIKEYMAQTDIDGALVGGASLKVEDFVQLLEGAK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Isomerase
source organism Staphylococcus aureus
publication title Crystal structures of triosephosphate isomerase from methicillin resistant Staphylococcus aureus MRSA252 provide structural insights into novel modes of ligand binding and unique conformations of catalytic loop
pubmed doi rcsb
molecule keywords Triosephosphate isomerase
total genus 88
structure length 254
sequence length 254
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 5.3.1.1: Triose-phosphate isomerase.
pdb deposition date 2011-12-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00121 TIM Triosephosphate isomerase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3uwwA00
1IIHA 3L5LA 2Q3OA 4E38A 3PUEA 3NQEA 1KLYA 3GKAA 1QFEA 2B7NA 3B03A 4JTJA 3W7PA 3GXNA 2A7RA 5AOUA 1A50A 3HJZA 5E1QA 3O15A 3ABOA 5AC6A 5DY2A 2DORA 4B5NA 4UTWA 2X16A 3SSJA 3M44A 5I3IA 1SW3A 4O1AA 3G3MA 1DJNA 1AW2A 1JQXA 4JTFA 5AB3A 4XTDA 3QEZA 4IMEA 4TIMA 2DZXA 4FF7A 4O28A 3TFCA 4JIPA 1LOQA 1W5NA 3WJYA 3A5VA 2XN2A 1TRIA 2DZTA 3G8EA 1QPNA 1OFAA 2EPHA 3THQA 5K4XA 1PCKA 2I9EA 1N55A 2NXGA 4ORIA 4HHPA 4TR9A 4YXGA 3UY8A 3SI9A 3W6YA 1KTCA 3ABSA 1NSJA 3SJ3A 3W07A 1TB3A 3KFTA 5A8GA 4N6FA 1S3HA 2J6XA 3EWWA 1TQXA 2XN0A 2E6FA 1G4PA 2V82A 3GVGA 1LZOA 2P0OA 4UTMA 1YYAA 1QAPA 3O6YX 2ZRYA 4FHAA 3ATYA 1GYNA 5CG7A 4PA8A 3TH6A 5D37A 3FIGA 2G97A 1SPQA 4HPJA 3NDOA 2QF7A 1TCDA 3IGXA 5ABTA 2H3BA 4GUIA 3S5ZA 4MZ1A 4XBKA 1OK4A 4UUIA 4DPQA 1PE1A 2NWSA 3IV3A 3CWOX 3M43A 1MXSA 4HNVA 3MO7A 4AVFA 5FESA 2V0TA 3V75A 1MSSA 1TPWA 4C1KA 4LC8A 1JVNA 1ZAIA 4H3DA 3UXDA 5EYWA 1YTEA 2AAMA 5KTLA 3VCRA 4H6KA 3GDTA 2EKCA 1F7BA 4NNAA 2WSQA 4XUGA 2B4GA 3EKLA 2YXGA 2NV1A 3TC6A 4DF2A 2Y7FA 3C2VA 3HG3A 1GEQA 2C3ZA 3G0UA 3C56A 3HOJA 3P5ZA 4FXRA 5AYXA 2FLIA 4RX0A 5G1TA 3S8HA 1BKSA 1ICQA 3UPBA 4A22A 4O1DA 4LV9A 1QOQA 3TSBA 3THAA 3G0XA 3RMJA 5EBUA 1TYGA 4LNYA 1DVJA 4LW7A 3H55A 4ZQCA 1ME7A 2C15A 2QEZA 1K8YA 4Z1BA 1T0OA 2PURA 3MP3A 2DU2A 4P2VA 3GK0A 4NNCA 3GAKA 1VLIA 3W73A 3VI2A 2V2DA 4M7SA 1P4CA 2WOQA 1GVOA 4S2BA 2V2CA 3NZRA 4WOQA 4HNNA 4ALDA 1TPEA 2EAWA 1M5WA 4CQ9A 2PC4A 1ZNNA 4YMZA 4OBTA 4O10A 3LBCA 2DZWA 4JR5A 1JCLA 3LLFA 4EIVA 1KFLA 4WY0A 1KFBA 5FF7A 4QAIA 4DF0A 1SUXA 3GDLA 4AWTA 1S5VA 1G4TA 1DHPA 3EWZA 5KSWA 5FF0A 1RQHA 1OG0A 3P81A 4RXGA 1T8XA 2A4AA 3DGRA 1PVNA 4NJJA 1LRNA 4N02A 3W7NA 2JGQA 2B0MA 3EWBX 2X1TA 4UFMA 3NO5A 3C0JA 4G1KA 3PBYA 1Q6OA 4E0CA 3MBDA 3MP5A 3AJXA 3NEVA 1F73A 4Q32A 4NVTA 3RLUA 1EWEA 3GLCA 5K9CA 3GB6A 4PH6A 5EKYA 4O19A 2R8WA 3W2UA 1KM3A 3W71A 2BZNA 3Q94A 5AHNA 4HN4A 1XC4A 1YDVA 2JKPA 1G7UA 1OF6A 2PRLA 2FDSA 2H6RA 3P5YA 3QQ0A 2VEMA 3NVTA 5D30A 4PTNA 1QO5A 1S5WA 1SZGA 2OX1A 1XL9A 3W7IA 3ZWSA 3GDKA 5A5WA 2A85A 4TX9A 1RV8A 1TV5A 4RLIA 4O52A 3G1VA 4NU7A 2NXHA 1WOBA 3IVUA 1JQVA 2Z1BA 3B4UA 2LLEA 4FEZA 2Z6JA 3W22A 1SSGA 4NT0A 4BWLC 1PV8A 1VHNA 3NA8A 3PG8A 2V9DA 4GUHA 1VJIA 4HSOA 1HG3A 3EXTA 1OX6A 1KTNA 1Q6LA 3E12A 5KITA 3NYZA 2E77A 1PHWA 4AF0A 2J88A 2P10A 4GUJA 3YPIA 3LCIA 4Y90A 1YLVA 2Y7DA 3DU0A 4K7VA 2NUXA 3GX9A 3RU6A 1W1ZA 3M16A 2V30A 4NZJA 4IXXA 1MO0A 4AB4A 4K8HA 3ABQA 2ZTJA 2DZVA 1GZGA 3L65A 1DJQA 3UPWA 1Z42A 2ZZ4A 1QMLA 1KFCA 2Y61A 3QJAA 1L6WA 2OT0A 3ZR4A 3ZS4A 2HTMA 4N9EA 4KFPA 5HWMA 2E5DA 1VLWA 2TRSA 3EX3A 2ZZ2A 3QW3A 3H54A 1XM3A 3P67A 1X8FA 4UMCA 2RHGA 3L5AA 1WA3A 4LS2A 4AWSA 1GTEA 5CZ0A 3HBLA 4TU1A 1NF0A 4I7WA 3KRUA 1Q6QA 1D9EA 6TIMA 4NXSA 4WQ6A 4RR4A 5H91A 3T78A 4JTLA 1XCFA 2A2IA 2ZZ1A 3NQCA 4HSNA 3L0GA 1RR2A 4XTIA 4JTKA 4FIQA 3BGGA 2YSWA 3DBPA 1OABA 3HGSA 4A2RA 3O8AA 4FB7A 1VH7A 3WFAA 3NR0A 2D73A 4Q33A 1PS9A 4Y96A 2GVGA 3B8DA 5DCEA 3SY5A 4QNWA 3CU2A 2RDTA 4JTGA 3WJZA 1BWKA 4XKYB 5EA9A 5AHMA 3BLFA 3N34A 1QOPA 4JN6A 3VKJA 4DO6A 1GTHA 4GFSA 5L6UA 4YCPA 3CPRA 2RDUA 3SR7A 1TPVA 4JEQA 1J2WA 3DHFA 3STGA 1FX6A 1D3HA 1LORA 4R7JA 3N9RA 3QZEA 3LCLA 1JCYA 2GUUA 3CIWA 4DBEA 2ATSA 4Y8FA 3QM3A 1XBVA 1H1YA 3GDMA 3LHZA 1Z44A 3KVKA 2HS6A 4LOCA 3LXBA 1TPUA 1A5CA 3NQ8A 4O12A 4ML9A 5EY5A 2CU0A 1SW0A 1TPFA 2TYSA 1GVSA 3LRKA 4UTJA 3U8GA 2GPTA 3I68A 3G1DA 1C9DA 1L6YA 3O6CA 3SIZA 3W7OA 1H51A 1KV8A 4GUFA 3NAVA 3W2MA 5I3FA 4JX4A 1K7XA 4PODA 3LHUA 4RZ5A 3CWNA 1OFRA 4ZQPA 3TQKA 3M1ZA 5AYYA 3TQVA 3W83A 1B4EA 4O11A 5FEWA 1X1ZA 4DQWA 1FWWA 4LRTA 2ZA3A 3W1UA 4IX0A 1XI3A 1GOXA 5F4WA 1YXDA 5CPOA 4N9DA 4M7TA 3R13A 5HUPA 1LLWA 3W72A 3ANYA 5AHLA 2GOUA 1KBJA 1GYLA 1IXQA 4JD4A 2E6DA 3DI1A 3HQ1A 3W86A 1U5JA 3O6DA 3M5XA 1HTIA 1PCWA 3IIZA 1ICPA 1JCXA 1R2SA 2ZQ0A 3C3NA 3PULA 3WJSA 1RQEA 2J27A 3DZ1A 3NM1A 3BK0A 5BMXA 5HR7A 1X7FA 1DKWA 3S5YA 3BG5A 4JXCA 4N4QA 3LXCA 3LCFA 3P74A 1QPOA 1KM2A 2C19A 4Z1AA 3MI3A 1TRDA 5AYZA 2H90A 2YW4A 4ZQRA 3T7VA 2XFWA 4I7UA 1DBTA 2VENA 1SQ7A 3OVQA 4XQ6A 1EX5A 1NFBA 1XXXA 1OYCA 3EX4A 4JTSA 3TSMA 2VFDA 3W23A 3W85A 4M6PA 4Y9AA 5LNVA 3DKLA 4DEFA 3R5EA 3QRHA 4FO4A 3EXSA 3GR8A 4WX2A 3MP4A 3MJYA 3P7YA 4YWIA 3IIXA 3NQAA 1EB3A 5AN7A 3P82A 4S2CA 1WQ5A 5KZEA 4LVFA 2A1YA 1M6JA 4LC6A 2C1HA 3HG2A 4GWEA 4EWND 3PR2A 3UQNA 1VCVA 3W2JA 1LYXA 3ATZA 4X2RA 3LTYA 3G1YA 1FY6A 4Z1CA 3G1XA 2CLIA 3FJLA 2AQWA 5DN1A 2WSYA 2ZZ6A 2A6NA 1SO6A 3LERA 5HWJA 1WX0A 3B0VC 2Y85A 1KFKA 3NG3A 2X1SA 3B05A 1T99A 3RK8A 1DOSA 1VC4A 1GVRA 3LHTA 2NUWA 3QYQA 1SO4A 4WY0F 3F4WA 3N3MA 3V1PA 1UASA 1OFOA 1B4KA 2QCCA 2A7PA 4MKNA 4LVBA 1DV7A 1VYSX 3IIVA 5K4ZA 3LOTA 4IMFA 1Q45A 1W3NA 3PAJA 1LRTA 5F2MA 3CHVA 5BW6A 1QO2A 1IIGA 1RQBA 2VELA 1H63A 1OHLA 1W8SA 4MIMA 4JIQA 3T40A 3PS7A 2CW6A 1JRBA 4QNEA 4Z1DA 3GR7A 2RKXA 3TNOA 3N9SA 2B7OA 3KX6A 3STEA 2NX3A 3WK2A 3R12A 3JR2A 2ISWA 3NM3A 1HL2A 3FA5A 3LLDA 4AH7A 1LRQA 4CNNA 1YPFA 1K8ZA 3HGOA 3DI0A 3W74A 3CTLA 4D2JA 1H50A 5DCBA 1VR6A 3QF0A 5F4SA 2YR1A 1SR9A 3W7LA 4LS1A 2CWNA 1ALDA 4GJ1A 2V5LA 4KWVA 4K38A 5D2WA 1V5XA 5G5IA 2VXNA 5CGQA 1YDNA 1W0MA 4JICA 3QSRA 4N9BA 1GG1A 3A22A 1NF7A 1GQNA 2GJNA 3WJXA 1W3IA 3TKFA 2QCDB 2CLMA 1K02A 4WXZA 4W9TA 1PIIA 4PC8A 1WBJA 4UNLA 1TO3A 5U4NA 4IPIA 5FEXA 1GT8A 2B7QA 4AAJA 1LBFA 4QSHA 2EHHA 3WK0A 4JTIA 3LRMA 1OYAA 3EXRA 1TPC1 4FNRA 3TSDA 3L66A 1G67A 1X6UA 2OT1A 3PBWA 1XUZA 2OMAA 1KBIA 3QFEA 4WD0A 3LRLA 4UTTC 5D2YA 3VNDA 3CB8A 3NL2A 4WXYA 3UD6A 4CQ8A 3FYOA 3NQ2A 1IF2A 3OG3A 4KKXA 4HPXA 2IQTA 4ADSA 1W56A 3W3OA 3W7QA 1LDCA 1F76A 5G1YA 3NQDA 4UFLA 2GVLA 1OVDA 4OGZA 4I9AA 1FXPA 4OT7A 1NAL1 4BWLA 3LDVA 3PM6A 1I2OA 4UTHA 1KM1A 1VCGA 3PSVA 4R34A 5DLCA 4HNUA 3MMTA 4GC4A 3PF3A 3PY2A 1OFDA 5EMUA 1AL8A 2JK2A 4O50A 2YZRA 2FIQA 1TIMA 4IGHA 1SFLA 3FKRA 3W1TA 4O0KA 5AC8A 1GVFA 1LOLA 1QPRA 1TPDA 3NPUA 2PRMA 4IJBA 4JTEA 4E2BA 1ZCOA 4JX6A 2VFGA 4OV4A 3GAYA 4O13A 2O7QA 1K7EA 3FYPA 5KMYA 3B06A 3NPVA 1L6SA 4I7VA 4AHPA 4UCGA 2CLOA 5C6MA 3QW4B 4LT9A 5E93A 5HUOA 1JCJA 3KVLA 3RLVA 5CPLA 2DJLA 3CEUA 3C52A 2C14A 3NOEA 5EL1A 1AG1O 1WAUA 3STCA 3LHYA 1C8VA 1YXYA 3L2IA 3DAQA 3R2GA 3HG4A 3INPA 1QDSA 1E51A 4IMDA 5FI8A 2Y89A 5CSRA 2BSLA 4TO8A 3S0CA 1FDZA 3RNDA 4O14A 2VFEA 5AC7A 4ZQMA 4MZ8A 3L21A 1DORA 4Z0JA 5FF2A 3PUOA 3L5MA 3PBUA 2DP3A 4L4LA 4FX8A 6ALDA 5LNWA 1BEUA 3BW2A 4LUJA 1K7FA 3NL5A 1X1OA 3NL6A 5LHFA 1XUUA 2CLLA 4JYEA 2GQAA 3AO0A 1OFPA 5TIMA 3BV4A 4P61A 2C0AA 1CX9A 2FPYA 2ZA1A 5AHEA 1YTDA 2HMCA 3OVPA 4FNSA 2VOMA 1VGAA 1VPXA 1F74A 1UB3A 3TDFA 1YXCA 4Q4KA 3STFA 3GDRA 2H3DA 4NUWA 2FQIA 4JTHA 3PWAA 3TMLA 3NXFA 4XWUA 4O53A 1W5MA 3LCWA 2BTMA 2QJGA 4M5PA 5HQEA 2E68A 4E2DA 2ATMA 4WZHA 1R46A 5U7SA 4JYFA 5HNRA 4A21A 3HPSA 4MLRA 3NQFA 4ZZ9A 4EVZA 3TQ0A 2Y63A 1ZALA 3NPXA 3FLUA 3O06A 3U6WA 5KZDA 1OX5A 2W0UA 2J9ZA 2BWGA 2RDWA 4JS3A 3DFSA 4C1LA 2V8ZA 1I2QA 3QPZA 4TMCA 2YYTA 3P80A 2YDAA 2GVJA 3CT7A 4MY9A 2QCLA 1P5BA 4NQ1A 4Z0SA 1OX4B 2Q3RA 2C18A 3QQ1A 4GE8A 3BW4A 5F2GA 1DQWA 4X22A 3TR2A 1WDWA 3EB2A 1LBLA 3DH7A 4DO4A 3QMRA 4UMAA 1OF8A 4OE7A 5J5RA 3H53A 2H8ZA 3W7GA 5L9FA 1ZJIA 3O63A 3PUDA 3LCGA 3P8IA 5G2WA 2QJIA 4ZMGA 4MVAA 2A5HA 5I3KA 3LHVA 2GQ8A 1A53A 5HULA 5G2HA 1M7PA 5DXYA 2WO5A 1TSIA 4POCA 2V2HA 5D32A 4UNKA 3EWYA 3A21A 3TW7A 4FIRA 2C6QA 3W87A 4MYAA 1DL3A 3G1HA 3NQGA 2ZZ3A 4J9JA 1UCWA 4ADTA 2NZLA 3W7DA 1FBAA 4JY9A 1FXQA 5AHFA 5G2IA 1RD5A 4NJKA 4PEKA 2O7SA 1HUVA 4UFKA 3UNDA 2VEIA 3GXPA 5CPMA 1IXOA 4RJEA 3UZ5A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1XYL A;  2Q3O A;  1RP8 A;  2OEK A;  1M04 A;  3NQE A;  4C7G A;  4UWM A;  3GKA A;  5A2C A;  4US5 A;  5A6L A;  3W7P A;  1GPF A;  4D8Z A;  5DO8 A;  4LYK A;  5AOU A;  3HJZ A;  3O15 A;  1S38 A;  2NLY A;  5DY2 A;  4M1B A;  3PHA A;  5I3I A;  1EZ2 A;  4CN6 A;  3V1H A;  2D22 A;  1DJN A;  3IPW A;  4JTF A;  3VOG A;  5AB3 A;  4CU6 A;  4F79 A;  3T09 A;  2XIM A;  3IRS A;  4IME A;  2WJF A;  4Z2K A;  1LOQ A;  2XN2 A;  1TRI A;  2DH3 A;  1QPN A;  1XIS A;  3THQ A;  1WZK A;  4PB5 A;  1EA9 C;  1PCK A;  2NXG A;  1XYA A;  2FH6 A;  1QNQ A;  3KOW A;  3SI9 A;  1E6Q M;  4JIE A;  3ABS A;  1NSJ A;  3SJ3 A;  3W07 A;  1TB3 A;  4PTM A;  1RCQ A;  2BOD X;  1UP2 A;  1X6N A;  2E6F A;  1H0G A;  2XIB A;  5D9P A;  1SFS A;  3CXO A;  4IID A;  3UG4 A;  4RZB A;  1CXH A;  3S9Z A;  3AZS A;  3W6M A;  3U5U A;  4MPK A;  5JBF A;  4ES4 A;  3WML A;  3AIR A;  2WQD A;  4MZ1 A;  4XBK A;  1KKR A;  1EC7 A;  4ZCW A;  1PE1 A;  2NWS A;  3CWO X;  2J75 A;  4PUL A;  1TV3 A;  4CVW A;  3NZP A;  3V75 A;  3AJ7 A;  4GZI A;  1TPW A;  1ZAI A;  4DZA A;  5EYW A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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