2W0UA

Crystal structure of human glycolate oxidase in complex with the inhibitor 5-[(4-chlorophenyl)sulfanyl]- 1,2,3-thiadiazole-4-carboxylate.
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
359
structure length
334
Chain Sequence
LICINDYEQHAKSVLPKSIYDYYRSGANDEETLADNIAAFSRWKLYPRMLRNVAETDLSTSVLGQRVSMPICVGATAMQRMAHVDGELATVRACQSLGTGMMLSSWATSSIEEVAEAGPEALRWLQLYIYKDREVTKKLVRQAEKMGYKAIFVTVDTPYLGNRLDDVRNRFKLPGLAAYVAKAIDPSISWEDIKWLRRLTSLPIVAKGILRGDDAREAVKHGLNGILVSNHGARQLDGVPATIDVLPEIVEAVEGKVEVFLDGGVRKGTDVLKALALGAKAVFVGRPIVWGLAFQGEKGVQDVLEILKEEFRLAMALSGCQNVKVIDKTLVRKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Structure of Human Glycolate Oxidase in Complex with the Inhibitor 4-Carboxy-5-[(4-Chlorophenyl)Sulfanyl]-1,2,3-Thiadiazole.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROXYACID OXIDASE 1
total genus 120
structure length 334
sequence length 359
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.1.3.15: (S)-2-hydroxy-acid oxidase.
pdb deposition date 2008-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01070 FMN_dh FMN-dependent dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2w0uA00
1RZMA 1K8ZA 4UFLA 4CNPA 3NL3A 1SPQA 2CFFA 1FCBA 1XDLA 3G1HA 1IXQA 4XKYB 4A21A 2E68A 1G4TA 2NUXA 3CQ0A 3GDKA 7TIMA 3UWYA 1ZAJA 3IIPA 3NGJA 1EUNA 4X3ZA 1MO0A 2W79A 2FIQA 3QQ0A 3NYZA 5D2TA 3LX9A 3LBMA 3R12A 1KFCA 3WK2A 3CC1A 4I9AA 3I7SA 3CB8A 2ZFAA 4NVTA 2GQAA 4O18A 4O52A 3IGXA 3M9YA 1JUEA 3MYOA 4QJ1A 5HR6A 3ANYA 5I3FA 3T4CA 3DFNA 3NQ7A 1BTMA 2VXNA 1TO3A 2AQWA 3DFQA 1Y0EA 3HG5A 3WJWA 4RJEA 4UFIA 3OG3A 2B7QA 1KM0A 1ME7A 2ZDRA 4A29A 2QCHA 1KBJA 2DZXA 2B0MA 3GDLA 5DCBA 3W74A 4DF2A 3VNDA 2DJLA 1ZY9A 5AHLA 1JULA 3W7PA 5AHFA 3TNOA 5C5YA 5TBOA 5K4XA 1TRIA 4YCPA 4MZ1A 1YTKA 3GDMA 1RQEA 3S1VA 1Q3NA 4O1DA 1X1OA 3Q58A 3I65A 4PL1A 1SSGA 4MYAA 3O6YX 2EGZA 4JTJA 1O95A 2Z1BA 3IRDA 5F2IA 2X16A 3N2MA 4KFPA 5GVJA 4IPJA 4LW7A 4IOTA 1PHQA 1JCLA 4GUFA 3GVGA 1HG3A 3LHVA 1JCJA 3G22A 2WQPA 1XXXA 3UYCA 1P0NA 5AN7A 3A24A 3NL2A 3B4UA 3QW4B 4FXRA 1LOLA 4IXXA 3P74A 5AHIA 1OJXA 1LZOA 1LBFA 3W7DA 3W83A 4OHQA 5FEXA 3A5VA 3QJAA 3W23A 3HG4A 1VZWA 1ZCOA 5KZMA 1MSSA 5A5WA 1TPUA 4EOUA 4IX0A 4HNTA 3LTSA 4JX6A 3ZS4A 2CLEA 1PL9A 4A2SA 2JKAA 3UZ5A 1DQWA 4NJKA 1KV5A 2YCEA 1YADA 1OYBA 5F1VA 4LVGA 2NWSA 5DN1A 4ICNA 2Y7GA 4Q4KA 4YLWA 3PVFA 4NNCA 4ML9A 5DCDA 3HGOA 2QCMA 1LROA 1TJPA 1OFEA 3L67A 4NXSA 1QFEA 5F2MA 3NZRA 4N9BA 1Q6RA 1XKYA 4XBSA 2JKEA 4JGDA 1LLWA 1X6UA 2ZRYA 1W3TA 3S0CA 4Z1CA 4EF8A 3W7RA 1H1YA 1QO5A 1TPC1 1WBHA 1LRNA 3L5MA 2W6RA 5DCEA 1X8FA 3STGA 1O60A 2QCDA 2V9DA 4AMAA 5D30A 3LM7A 3LCFA 5CGQA 1T8XA 3GKAA 1TTPA 5SWUA 1TTIA 5G2HA 1L9WA 3TROA 3W2LA 4PEKA 4IMFA 3M1ZA 1QCWA 2ZZ3A 5DELA 2QJIA 1ZALA 2I1OA 2CU0A 5CSSA 3QH2A 3QYQA 1DL3A 4WXZA 1G69A 4TX9A 2FPYA 2J6XA 1XL9A 4HPJA 1KM1A 2UV8G 4KKXA 5D2VA 3QPYA 1JCYA 2BWGA 4HT3A 2OT0A 3QSTA 5EYWA 4R33A 4MKNA 2CLOA 3AO0A 3EXSA 3FLUA 1VCGA 3TUUA 1R2SA 3L5AA 4LRTA 3DI0A 1SO5A 1EIXA 3C61A 2QCLA 3PSWA 4XTIA 1VH7A 3CWOX 2Q8LA 3W73A 2VEMA 1TV8A 1EEPA 3LV6A 3I7QA 3CU2A 5KINA 1I45A 1PE1A 3GNNA 5AYXA 1LYXA 3NVTA 3TIMA 4JTHA 1LRQA 3G1XA 1YDOA 3ABQA 1AL7A 3M5XA 5K3VA 1SZFA 1I2RA 1K03A 2VC6A 3FJ6A 2A85A 3TSBA 3ZWTA 2Y6ZA 1TPEA 2H8ZA 2WSYA 4DBEA 2RFGA 1K02A 1F76A 3O6DA 1IIHA 4FNRA 1PHWA 4IMCA 3HPSA 2R94A 4NUWA 4O15A 3BG3A 3STFA 1KFJA 2RHGA 4WZHA 4JN6A 1GG0A 1XCFA 2NXIA 4K7YA 4KWVA 3W3OA 4Z0SA 3A21A 3HIJA 1YTEA 1E51A 4M19A 5F4XA 3UWWA 2J24A 4RZ6A 1OFAA 2OCZA 2QAPA 4OGZA 1ZENA 2QCNA 3U2OA 3R89A 4OWGA 1O94A 3RMJA 4PH6A 3QM3A 3L0KA 3SGUA 3W22A 3TU9A 3MWAA 1OFOA 3T55A 4UTTC 4CNNA 1XBVA 1TPH1 1EP2A 3NPXA 2ZZ1A 3HG3A 2PCQA 3N9RA 1NVMA 3PAJA 1YDVA 4PL2A 4QSHA 2G97A 1ADOA 2GVJA 3KFTA 3R5EA 4UFJA 4RK8A 2RKXA 4UUIA 5J5RA 5CG7A 5D2WA 2YZRA 4GRSA 3HGSA 4UTTA 1KM2A 3HF3A 3PBYA 2HMCA 1AG1O 4YL2A 1U5JA 4PA8A 5CZSA 3DH7A 2GOUA 3NPVA 2DP3A 4MZYA 5AHNA 1NF0A 3GXNA 1SO6A 1HO4A 3MI6A 1EWEA 4HNUA 3F4WA 4L4LA 3DKLA 1PCWA 4MY9A 4AAJA 5FEWA 5LSMA 3G1AA 4DBDA 4AHOA 1RR2A 4GUGA 2BLEA 1B3OA 5CKSA 4OQVA 1R47A 4CCCA 2PC4A 3W2KA 4AHQA 2X1TA 5U7SA 3EWUA 3DHDA 4RXGA 1KM5A 2CZEA 5K2ZA 3WJXA 5T26A 1K7FA 3GIYA 4HSNA 2C3ZA 3TJLA 4ZQOA 3KX6A 4MFEA 1G7UA 3EX1A 4O53A 2BX7A 4E2BA 1OABA 5D33A 1AL8A 3TK7A 4Z0JA 3SZ8A 3E9AA 3M47A 2BXVA 4JIPA 3HPZA 1K3UA 2VELA 1OX5A 3FKKA 2ZRUA 4EF9A 3MP5A 3FEMA 3NM1A 2ZA1A 5D32A 3W1QA 1IGSA 4R7JA 4NJHA 4LC6A 3RK8A 3JS3A 4U28A 3O07A 2NV2A 3QMSA 5FI8A 2QUUA 3C56A 3ZWSA 4XBKA 4JTIA 4HIBA 5DY3A 3UXDA 3RFAA 1TQJA 5FF3A 1PCKA 1IXNA 1S5TA 3TH6A 2A1YA 1VHCA 3IIOA 2DZUA 1F05A 3CPRA 4HSOA 2H3DA 3DGRA 2E5DA 1WYIA 2OT1A 2WNQA 3UWQA 3WK3A 2J9ZA 5K9DA 3NL5A 2C0AA 1CI1A 2VEIA 5HNRA 1EUAA 2ZRWA 2Y7FA 4GNJA 1DJQA 5FF0A 3B0PA 5CZJA 3RF9A 3HQ1A 1VYRA 4N9EA 1GZGA 4JYFA 2X1RA 3SECA 1KLYA 3CM4A 3FS2A 1HL2A 3W72A 4HN4A 4TU1A 3WK1A 3TKFA 3CTLA 3SJ3A 3OHIA 3VI2A 1WXJA 1ZNNA 3GR8A 2QUTA 1L6YA 3P8IA 3KVKA 4MY8A 5L6UA 1TRDA 3GAYA 1DOSA 2GQ8A 1GVRA 4UFMA 3G18A 4K8EA 5J5DA 5G2WA 4N02A 1VYPX 1ZAHA 3LCHA 2WSQA 3NQGA 1TV5A 1VGAA 3C6CA 2CZFA 3N34A 4FX6M 1FCQA 1DQXA 4M6VA 4ALDA 2QJGA 3DBPA 3LRKA 4LVFA 4N4QA 3DFTA 3M5VA 3ATYA 1YPIA 5FESA 3DZ1A 1OVDA 5IM51 2QKFA 4O16A 4UFHA 4KFNA 2ZZ4A 4CCEA 1LM1A 2C19A 1G7VA 1MEIA 1K7XA 2ZTJA 3G0UA 2EF9A 6ALDA 4GBUA 1ML1A 2V82A 2KZHA 1TJRA 5D38A 2A21A 2QF7A 4K37A 1J5TA 4QITA 5CPLA 3QW3A 4G1KA 4XZ9A 2NUYA 3UWZA 1ICPA 3L68A 1B9BA 2Y85A 4LNYA 1KFLA 2DZSA 2TRSA 4E0CA 4RXFA 3U6WA 3TQVA 4CQAA 4OE7A 3T7VA 4E38A 3EXRA 1DVJA 3NM3A 4MLRA 2Y88A 2V2HA 3CLMA 2Y63A 2Z6JA 3R13A 4NNBA 4HKPA 2V5LA 3W70A 3W71A 2GUUA 4UIOA 3TSDA 3I7RA 4QNEA 1BWKA 1UUOA 5DY2A 3B05A 1W31A 5FEZA 4HNVA 2C15A 3NQVA 4O11A 4JS3A 4ORMA 2QR6A 2V0TA 1O4UA 2C18A 3O8AA 3V75A 4IMDA 4ZQPA 2ZQ0A 1IIGA 1ME8A 3CEPA 4GE8A 2PRLA 5LNUA 4DQWA 2B7NA 1SO4A 3PR2A 3P84A 3LRMA 4QNWA 2Z2UA 4IXHA 3B03A 2VEPA 1QMLA 3W9ZA 4AWSA 2Y7EA 4IWWA 3U8GA 4ZVJA 3NG3A 3S9YA 4O10A 1OF8A 1TTJA 3MP3A 3W2NA 4GUHA 4NJIA 4POCA 4GFSA 4B5NA 3N3MA 4O57A 4ZQNA 3RLUA 4UXDA 1YXDA 3EX3A 1LOQA 3LHUA 3NDOA 3ABSA 2YX0A 1FDJA 5HWMA 1W3NA 1AW5A 4WJEA 3E12A 2QEZA 4UTJA 4WX2A 3O16A 1H62A 3MBFA 1MEHA 4QQ3A 3MP4A 4JTFA 4JDYA 3FYOA 3TQ0A 4ZZ9A 4Z1AA 5DBUA 1VC4A 4UTKA 1U83A 1FQ0A 3W1LA 2E77A 1R2TA 3T78A 2WJZA 1DHPA 4BF9A 4O4VA 1G67A 3B0UX 2CLLA 3KHJA 1D3HA 3NL6A 1GYLA 5H2ZA 5BMWA 4NQ1A 1EWDA 1GVFA 3BK0A 4CLMA 4LU0A 1VJIA 2TPSA 2IQTA 1ZHAA 3IIZA 3ZR4A 3B8DA 1GWJA 3GXPA 5ABTA 3MHFA 1VR6A 5TIMA 1N8FA 1H7WA 4ADSA 3E02A 3BW3A 3EX4A 1W37A 1WOAA 2YFOA 4AWTA 4NZFA 4HHPA 5I3KA 4S1FA 1TSIA 4JX5A 1RQBA 1ZJIA 5FF4A 3G1YA 3CHVA 1SR9A 4S2CA 4A22A 5DBTA 1SFLA 1S5VA 1KM3A 3GDRA 2GVLA 2CWNA 2ZTKA 5AHMA 1Z44A 2A0NA 2A7RA 3GAKA 2CZ5A 1KFEA 5HR7A 1QPRA 3THQA 1F2JA 3HMJG 3JR2A 1HUVA 4GJ1A 2PRMA 4UTWA 4WOQA 4ZQRA 4DELA 1UASA 4CQ9A 3TFXA 3DFSA 1VCFA 3TFCA 2P1FA 3MI3A 3KVLA 3CWNA 3L65A 5H91A 1W5MA 3R8RA 4YXGA 4QM1A 1B4KA 1M5WA 3W1UA 4WOZA 2NZLA 2YDAA 2JK2A 3LB0A 3QMRA 2QAFA 3TJXA 5KMYA 4Z1BA 3DFPA 3P61A 1H7PA 5AOUA 1X7FA 1TPFA 3STEA 2A5HA 2QDHA 3LGEA 3LRLA 3DKJA 1XUUA 4BWLA 3B06A 3MBDA 4MZ8A 4IMEA 2R14A 3HPXA 2J88A 3HGRA 3NQMA 3PWAA 4BI7A 2EPHA 3GK0A 4WY0A 3W1TA 1SW7A 3LCWA 3M5ZA 4I7WA 1KLZA 3QF0A 4UMBA 4C1KA 5E1QA 1YYAA 3PSVA 2G95A 3W2JA 1H51A 4Y9AA 1W5NA 2YGYA 3QFEA 3WJSA 3H55A 2CLKA 3LDVA 1XUZA 3LHWA 2HS6A 1ZAIA 3PM6A 2RDTA 1SZEA 4NT0A 3PB2A 5KZEA 3E0IA 3ABOA 1FWNA 1NF7A 1NSJA 3L21A 1JVNA 3O1NA 2WO5A 3HJZA 2EAWA 4TMBA 2ZA2A 3UXAA 1OX4A 3A9IA 4H3DA 3C2EA 2NWRA 4JTKA 3G3MA 3O6CA 1I2QA 1NAL1 5FF7A 4PC8A 3PG8A 1W8SA 3RNDA 1AW2A 3BVJA 3W7CA 2ZZ7A 4YWIA 5U4NA 1H5YA 2CLFA 2RH9A 1LORA 5CZTA 3NZ1A 2AAMA 1DORA 3TX9A 2XN1A 2E6AA 4QAIA 2C16A 1QDSA 4JTTA 3W88A 3P80A 1ONRA 4RV8A 1XC4A 1TMHA 3M16A 2FPTA 4K6AA 1QO2A 4K36A 3S5OA 4JD4A 2BZNA 6TIMA 2FQIA 3IIXA 1TB3A 2XN0A 5FF2A 3B0VC 4NU7A 2PE4A 2NXGA 3PS7A 2ISWA 3GZ3A 3AJXA 2ZRVA 4ZL1A 1A5CA 4JY8A 2A6NA 5EPDA 4KWWA 5LNRA 4E2DA 4M6PA 1WDWA 4OBTA 4JR5A 3W1MA 1WQ5A 3IVUA 3BARA 2FPVA 1XI3A 1QPQA 5E0KA 4JDBA 3IVTA 2NX1A 3FKRA 3VFLA 4MY1A 4FNUA 4FEZA 1RVGA 1F74A 4XKYA 3CIXA 4FIRA 3W7QA 4UTIA 3W76A 1F73A 2QCGA 3KAOA 3W7EA 1XFBA 3EWYA 1QPNA 4K38A 1GG1A 3P82A 3Q2DA 3VE7A 1DBTA 4K7VA 4JY9A 1GTHA 4LVDA 4Z1DA 3WJZA 1LRTA 1TREA 2R91A 1WX0A 3S1WA 2YW4A 3QMTA 3THAA 3TDFA 2E5BA 1MZHA 2H3BA 1N55A 3L2IA 1AMKA 4NX5A 1SQ7A 3GYEA 3DAQA 2NX3A 4MYXA 5K7JA 4ONVA 4O0ZA 5CPOA 3FIGA 3DXIA 5HJLA 2NV1A 3F4NA 2V5BA 2B7PA 3FA5A 1W1ZA 1WV2A 1PS9A 1MEWA 5EBUA 3TQKA 3C2OA 2NX9A 4DF0A 1UJPA 5G4EA 3HG2A 3VCRA 1RPXA 1UB3A 1KFBA 3H53A 1GVOA 4R34A 4P2VA 2VOMA 2ZYFA 3PBVA 4IMGA 5AC6A 3P5YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4LSB A;  5ABE A;  2ZVI A;  3NL3 A;  3T1G A;  3KBN A;  3AIV A;  4PGL A;  1FCB A;  4QCF A;  3G1H A;  2QQ6 A;  4YTQ A;  4XKY B;  3LY0 A;  3OOD A;  3VNK A;  2NUX A;  1ZZM A;  2WMF A;  3GDK A;  2PWD A;  7TIM A;  1DWI M;  1ZAJ A;  2DV0 A;  4H01 A;  1EUN A;  4X3Z A;  4W8A A;  1XV8 A;  3D5H A;  2W79 A;  3QQ0 A;  1H11 A;  2R1P A;  5D2T A;  3LBM A;  4H41 A;  1KFC A;  4I9A A;  4R7W A;  3AAL A;  4NVT A;  1XIS A;  1FHD A;  4O52 A;  1N2V A;  2VWS A;  3M9Y A;  4GIR A;  3G1R A;  1RCQ A;  5A3H A;  3MYO A;  4QJ1 A;  2WM1 A;  2VL4 A;  1TO3 A;  2GWN A;  1R9Y A;  1Y0E A;  1ENU A;  3WJW A;  4QS6 A;  4WSJ A;  2Y1H A;  4C6I A;  1KM0 A;  1ME7 A;  4XZI A;  2FKP A;  1RVK A;  4CU7 A;  2B0M A;  3H26 A;  5DCB A;  3T0D A;  4GO9 A;  3ARP A;  3SIM A;  2CXG A;  2QW5 A;  3EA3 A;  3WZ0 E;  1EX1 A;  3WX7 A;  1PZ2 A;  2CBJ A;  4S39 A;  4A8I A;  4MJ2 A;  4DZA A;  1CCW B;  4JQ2 A;  2WJF A;  3NDY A;  4XIS A;  3I65 A;  2D20 A;  2QNE A;  1RCO B;  4MYA A;  4HHL A;  1ZUA X;  4KCU A;  4L6O A;  5HAN A;  2GFT A;  4GBD A;  2ZX7 A;  2X16 A; 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