4ATDA

Crystal structure of native raucaffricine glucosidase
Total Genus 182
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
182
sequence length
501
structure length
469
Chain Sequence
DATRISRSDFPADFIMGTGSSAYQIEGGARDGGRGPSIWDTFTHRRPDMIRGGTNGDVAVDSYHLYKEDVNILKNLGLDAYRFSISWSRVLPGGRLSGGVNKEGINYYNNLIDGLLANGIKPFVTLFHWDVPQALEDEYGGFLSPRIVDDFCEYAELCFWEFGDRVKHWMTLNEPWTFSVHGYATGLYAPGRGRTGNPGTEPYWVTHHLLLAHAAAVELYKNKFQRGQEGQIGISHATQWMEPWDENSASDVEAAARALDFMLGWFMEPITSGDYPKSMKKFVGSRLPKFSPEQSKMLKGSYDFVGLNYYTASYVTNASNFSYNTDIHVTYETDRNGVPIGPQSGSDWLLIYPEGIRKILVYTKKTYNVPLIYVTENGVDDVKNTNLTLSEARKDSMRLKYLQDHIFNVRQAMNDGVNVKGYFAWSLLDNFEWGEGYGVRFGIIHIDYNDNFARYPKDSAVWLMNSFHK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Rauvolfia serpentina
publication title High Speed X-Ray Analysis of Plant Enzymes at Room Temperature
pubmed doi rcsb
molecule keywords RAUCAFFRICINE-O-BETA-D-GLUCOSIDASE
total genus 182
structure length 469
sequence length 501
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.1.219: Vomilenine glucosyltransferase.
pdb deposition date 2012-05-05
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4atdA00
3ARVA 3LPGA 4UQBA 1AVAA 3VD7A 4D6HA 5BXTA 5C8BB 1OGGA 4UCFA 4OUEA 2CBUA 3GNRA 4AZIA 1MW3A 1XD0A 3FNDA 4IUGA 4J3VA 6TAAA 3F5KA 2BY3A 1VEMA 2GUYA 5CG0A 1UOKA 1EDTA 4E8DA 1VJZA 1D2KA 1E40A 4MB5A 1XRVA 3WFLA 4CD7A 1OWQA 3BSHA 1JG9A 1HJWA 1VIWA 4W89A 2DT3A 5CPSA 2RGLA 2QHAA 3W4RA 3OLGA 4LQ1A 4GO9A 3O2LA 3A4XA 1W32A 3BAKA 1E6RA 3FW6A 3MUIA 4XV0A 2ZXQA 3W6MA 4BA0A 5I24A 2DPEA 3VMNA 2J7CA 2WBKA 2RGMA 3PZOA 3WUFA 1TMQA 1MXGA 5KZ6A 2D0FA 4UTFA 2WZIA 5BXPA 3WSUA 2BXYA 5EFFA 1JYXA 4D6CA 2WM0A 2VURA 4PRWA 4AD3A 1GCYA 1L8NA 3WF1A 4U31A 2VRKA 2J62A 4WSKA 4CKQA 2CHNA 2VX4A 1A47A 3WF0A 1EHNA 4KH2A 2GDUA 3W0KA 3WNLA 1JZ7A 1J18A 3FAWA 4TVCA 3POCA 1C92A 5BRPA 1OD0A 3AIBA 7TAAA 1BGAA 3ZSTA 1PX3A 1QHOA 5FL1A 1ITCA 1GJWA 3WF2A 2AOSA 1JIBA 1KXTA 3F5LA 1VB9A 2Z1KA 3ZSSA 5A8OA 1QNPA 1NWTA 3WQ5A 3WL1A 2DGAA 2JEPA 1EQPA 1BYAA 4J3TA 3OGSA 5FIPA 3SCRA 2BHZA 4GZIA 1V0MA 3N12A 5CLTA 2D3LA 2VZOA 1A3HA 2W66A 1E3XA 2VTFA 2WSKA 1WZMA 1EOMA 2E9LA 1C8QA 1CLXA 5D4YA 1GQIA 5A2CA 4J3WA 3BC9A 1QI4A 5D9MA 3VD4A 1GOQA 1HIZA 4TTGA 1QW8A 1DHKA 2D2OA 5D8WA 1R8LA 3W25A 5A8QA 3VTRA 1TFVA 3MV01 1B1YA 1JD9A 1UH4A 4AC1X 5DMYA 5GQBA 1UQYA 1W9BM 3VIFA 3AZSA 2D23A 2PWHA 2XWEA 1R87A 3VU2A 5BXRA 3GTNA 1MW1A 3AHYA 2QMJA 1HT6A 3EDFA 3W38A 1G1YA 3WF3A 1BYCA 1NOFA 5I79A 2BXZA 1CGWA 3F4VA 3PZMA 1JYVA 2UY2A 3CUIA 2CNCA 4J28A 1GOWA 2EEXA 2WPGA 3MS8A 1QVBA 4JFUA 5GNXA 5E6YA 1JZ8A 1K9EA 4PMUA 3WDQA 4PTXA 1CZ1A 4AWEA 3GH5A 3OZPA 3PZVA 2DSVA 5C71A 2XM2A 5I0DA 1JAKA 2J77A 3ZOAA 3NIYA 4B15A 1ZBKA 2XVKA 2EPKX 2D3NA 2MANA 3MU7A 1CXIA 1BSIA 3NSMA 3AIUA 4OIFA 2QPUA 3WF4A 1WDRA 2WC7A 1MFVA 5M03A 3CGTA 3ZMRA 1H0GA 4P8UA 3AS3A 4MAZA 2VX5A 5JIPA 1W3KA 4AZ6A 2OWWA 1R7AA 1CNVA 4U5KA 4JFSA 3FN9A 4UZUA 4UOZA 1W1TA 3W28A 2D1ZA 1CXLA 2UY4A 1UKQA 4NRRA 4NRSA 2WVVB 5I78A 3AXHA 1ZBVA 1J0HA 2VC9A 3WNKA 1XC6A 3ARXA 2NT0A 3WD4A 4PUDA 4AISA 1RH9A 3POHA 4AD4A 1QBBA 3HJEA 5CGMA 2VMFA 3S6TA 3QR3A 1F4HA 2ZUVA 1LJYA 4HOWA 5A6JA 2ZICA 1OM0A 1SR0A 1LL7A 2A3AA 1B3XA 3WDRA 1L0PA 2WMIB 4TUFA 2WK2A 3MSDA 2CKSA 3N18A 3AJ7A 4CN6A 3L4TA 3VX0A 1NP0A 2GJPA 1TR1A 3SCPA 1EH9A 1N82A 4UQDA 1H09A 1PIGA 3NSXA 3ARZA 3MMUA 3DECA 2OWXA 2YBTA 2PWFA 3ZT5A 5EB8A 4M8UA 5A94A 1MQQA 4W85A 2V3EA 3CO4A 3N9KA 5AYIA 1JXJA 1JFHA 1VFFA 1TG7A 3SCQA 1B0IA 2WMFA 3TTQA 5HPOA 4MB4A 5A1AA 1M53A 1E1FA 3VD5A 3VVGA 1C90A 2DDXA 2DIJA 1W9XA 5CSYA 4HMDA 3K4DA 2WCGA 1WE5A 1UD3A 1BPLB 1XD1A 3WY1A 3CUGA 4QDMA 1YHTA 1RPKA 2CXGA 2IXVA 3GBEA 4ATDA 2XFYA 1WP6A 4HA3A 2E8YA 5AC5A 1CDGA 2HVMA 1Q6EA 3VINA 3RCNA 2JF6A 4F9DA 2WLYA 4LYPA 2BS9A 1FH9A 1OB0A 3VGDA 2W63A 1V3MA 3T0DA 3VPLA 4RE3A 4UQAA 1W9UA 5A8PA 1BYBA 1WDPA 2FHBA 3WEMA 5D8ZA 1OBAA 1XSJA 2G3JA 3AYSA 3AS0A 1BTCA 1BFNA 2DT2A 1J12A 3W82A 3I3EA 1XSIA 2V38A 4UFHA 1H2JA 2V5CA 3K1DA 1KFWA 1PBGA 3RMEA 3WD1A 1NP2A 3WD2A 5IHSA 3VMPA 4C7FA 2VZUA 4D6IA 1HJVA 3CMJA 1NOWA 1DP0A 3WENA 2GVYA 1UQZA 2Y2WA 4V2XA 3W81A 2JE8A 2YDQA 2JEQA 3O6AA 4JCLA 4W7WA 2FGLA 2YL6A 5ABFB 3GXMA 3SCTA 3ZO9A 2DH3A 2WWDA 4JL2A 3BSGA 1ODUA 4U5IA 1V02A 4HA4A 1OT1A 1FHDA 1LF1A 3RM8A 5LYRA 4PBGA 4QP0A 3VDHA 4D72A 1E0XA 3MMWA 4AYSA 4OKDA 4AZHA 1NM9A 2FHCA 4AMCA 1CGUA 2WWCA 1K9DA 4ML4A 4QCEA 4LPCA 4X9YA 5A6SA 3B8SA 3SCSA 4ACZB 1JI1A 4AIEA 3I3BA 1H3GA 4Z2JA 2YOCA 2XUCA 1WZLA 3UCQA 1FFRA 3WEOA 3GXFA 1HKMA 3FAXA 3KL0A 3ZJ8A 3WD0A 2X1IA 1WCGA 4KRTA 5IDIA 3EYPA 4W8LA 4AZ5A 1R7OA 3CZKA 1TUXA 3WH7A 4CCCA 2VX7A 2UY5A 4TX6A 1B3VA 1H5VA 1BAGA 1NWSA 4S3JA 4CD4A 3MUY1 4NZCA 1WPCA 3WUEA 1GHRA 3RM4A 3AHXA 3AROA 3IANA 3EMCA 1UR8A 1E56A 5TD4A 4JHOA 3T09A 4BQ2A 2EO7A 2CIPA 1ZU8A 5GNZA 5LA1A 4PSPA 3VM5A 2YL9A 3L4UA 5D9NA 1I1WA 3AZTA 4F8XA 2AMGA 1GQKA 2HISA 3RPMA 4LX4A 4PTMA 2XGIA 8CGTA 1M7XA 4D6EA 2WXDM 3CLWA 1PZ2A 1JFXA 2E9MA 4H41A 1J0KA 2ZIDA 2DEPA 1DWJM 5E09A 3PTQA 2OSXA 5CLWA 1UD2A 2VJXA 4GI8A 3S2CA 1B9ZA 1GOMA 1E4MM 2Q8XA 2CBIA 3D3AA 3CMGA 1EHAA 5A69A 5CJ5A 2XHYA 1E6XM 1SMDA 2VQTA 1B31A 5A6KA 3VM7A 5BWFA 2GDVA 2VR5A 3UG4A 3I3DA 2NSXA 2CITA 1V0KA 1UR1A 2G3IA 5A2AA 2GJXB 3CH9A 3RIKA 3LPOA 4MTVA 1JD7A 2XFRA 3A4AA 3KWXA 1WDSA 4QFUA 3VIHA 1WZKA 2ZX8A 3B9DA 1V0NA 1XSKA 4WLCA 4TVUA 3CHCA 4F79A 3J7HA 3B9EA 1JF6A 3PN8A 4W7VA 3AIRA 4U2ZA 2ESCA 3BH4A 4HZ8A 2VRQA 1CWYA 3CHFA 1RD6A 5A6MA 4X0VA 1JZ6A 4GO8A 1UH2A 3RO8A 1GQJA 1HKIA 4UQ9A 4KMQA 1GW1A 1PX4A 3IAQA 2J7HA 4XX6A 5E0CA 1XGZA 5EFDA 3T2PA 1KGUA 1QHZA 2UWFA 4QLJA 1PJ9A 3OLDA 2TAAA 4MDPA 4NF7A 3AIWA 2WHMA 2WVVA 4JL1A 2J47A 1BHGA 4Q22A 1BG4A 1JYWA 2FGZA 2WC3A 3AMDA 1J0YA 3VDAA 2XYLA 3BAJA 1CENA 3GH7A 1ZBWA 4CU6A 1DWGM 2VVSA 4ZXOA 4UQCA 1I75A 3WUBA 1EXPA 3UR7A 4UR9A 3AMCA 4AD1A 1B3ZA 2WMIA 4MJ2A 4AZ7A 2W91A 2VX6A 1CXFA 3THCA 1VF8A 4P8XA 3K8KA 3K4AA 5E9AA 2CESA 2A3HA 5ECUA 2WANA 1UZ1A 5JBDA 4GZEA 4CCDA 3T0BA 3OIHA 3G6LA 3BMWA 2XVPA 3EDJA 4D6FA 2XWDA 5DT7A 2FDMA 4WJXA 1AQHA 1QOXA 1TA3B 3ZJ7A 3GDBA 1E5NA 5A8MA 2F8QA 1B30A 2YJQA 3W53A 4BZYA 4AD0A 1C3FA 2J8GA 3SCNA 1E43A 1HF6A 3N15A 1W3LA 4QLLA 4B9YA 4W8AA 2B31A 2VUYA 3CTTA 1NOUA 2CYGA 4CN4A 1K9TA 2ZUTA 1OSEA 4TTUA 2XVLA 1HJXA 1BQCA 3NUKA 1E6PA 1XH1A 2G3NA 1MW0A 3OA5A 1XH0A 3NCOA 4KWUA 3BAXA 1SYTA 1UHVA 1OIMA 3ZJ6A 5I23A 1ZJBA 2O9TA 4WKHA 5BROA 5EMYA 3TA9A 1EDQA 1KXVA 3CPUA 1UWQA 4U3AA 4JFTA 3CUJA 2A3CA 3AMLA 3L4ZA 2WMGA 2ZUNA 4AZBA 2C0HA 2EXOA 3IAPA 2X2YA 1QI2A 5A3HA 5DT5A 1SMAA 3TTSA 3WDJA 2WSPA 5HNNA 2F2HA 1ISWA 2W62A 1FP9A 4D6DA 4Z2IA 3GXIA 1Q4NX 5EBAA 1YQ2A 1V08A 3PZIA 3VILA 1O6IA 3KL5A 3CIVA 3WDHA 3QOMA 5HBFA 4WF7A 4PMYA 1C93A 2VZTA 1HJQA 1ZL1A 4NI3A 2BY2A 3CHEA 1H4PA 4M80A 2G41A 4AZCB 1IV8A 3KEHA 8A3HA 3VGEA 3T2QA 3QHNA 4MNJA 1KXHA 1JDAA 3UETA 5I6SA 2OSWA 3WDPP 2ZWZA 4ACYA 2ZXAA 1GVIA 3RDKA 3WH5A 1GOIA 1UD8A 5JUVA 3OGVA 1TE1A 4C7GA 5ABFA 3WDIA 1M04A 3SCOA 3TP4A 3N17A 4F9JA 1E9LA 2W67A 1HJSA 2ZX6A 4LYQA 3SEPA 4ZE5A 4DWSC 4ZFMA 4EE9A 4B16A 3VIMA 3VO0A 6CGTA 5HOSA 2J4GA 1DEDA 4UFJA 3WQWA 2VQUA 4YN5A 1E6QM 4M82A 2QPSA 3WFZA 1HP4A 4MNMA 2NW0A 2VNCA 4OZOA 3IJ8A 1ISYA 1JAEA 1JNDA 4ACZA 4JKLA 2X8RA 2YL5A 4U3CA 2DSZA 5I5RA 4MB1A 1KQYA 1E3ZA 5BYWA 1M03A 3RJYA 3U5UA 1GPFA 3VKKA 2X09A 3IK2A 2EQDA 2OYKA 1ZS2A 2VO5A 1KGWA 3AI0A 4MJ4A 1VFUA 4Z2HA 4PSRA 1V6VA 4PMZA 3VD9A 1BYDA 3GZAA 4GKLA 3DYOA 4GZJA 4DUXA 5M3WA 1W3JA 4B3LA 3MUAA 1RP8A 4JZ5A 1MFUA 3AICA 4W8BA 3U5YA 1CPUA 3VIJA 4WIWA 1U33A 4MNLA 2BHUA 5A95A 2IXUA 2ZWYA 5F7UA 1TZ7A 3VX1A 2E40A 3OLEA 2VZSA 4DWSB 1PIFA 3WNMA 2X0YA 2Y8VA 2VCBA 2BVYA 3L2MA 4A3HA 3BAIA 1C8XA 2CETA 4ZXLA 3WBAA 1XCWA 2VCAA 4UFMA 4GXPA 1AQ0A 3L2LA 3M46A 3SIMA 1FOBA 1J0IA 1NH6A 3MUZ1 4AD5A 2CHOA 1HNYA 1MQRA 1W9PA 1GONA 3WUGA 1UWRA 4EK7A 2DIEA 4M56A 2CCRA 5HXMA 2XGBA 3WNPA 2GJXA 1WAWA 1VJSA 2YA1A 1J0JA 4DM2A 2E3ZA 1LL4A 1V3KA 2VT0A 3UG5A 1V3LA 4QLKA 2VL4A 3CUFA 1JXKA 4J27A 2WKGA 3VIOA 4LXFA 5M5DA 1ISXA 2JIWA 1K6AA 1C8YA 2WNWA 4P7LA 1UZ4A 4W5UA 4H2CA 3SUSA 3MANA 1QNRA 1V3IA 2WBGA 1FP8A 3WN6A 2D24A 1FH8A 1QPKA 3TTYA 1B3WA 1E71M 2FH6A 1PPIA 4L4PA 2XSBA 2DSUA 2ZOXA 1OGSA 5BRQA 1HKJA 2JF7A 3W37A 1UR9A 1CGXA 5FOOA 1E6SM 3A4WA 3B9AA 4WKFA 3W24A 1E4LA 1V3JA 2J78A 4TVDA 2E9BA 1W9VA 3EDDA 1UUQA 4CN1A 3SUTA 1HN1A 3GH4A 2WHLA 5CXPA 1MXDA 1E6NA 1CIUA 2WVUA 2EJ1A 3DHPA 3N04A 2PWDA 3EDEA 3GBDA 2XG9A 3OB8A 1KXQA 3O9NA 1UKPA 3AS2A 3ZM8A 1QI5A 1EOKA 1LWHA 3PZNA 4D6JA 1VFMA 4H8HA 3GYCA 1U30A 1AQMA 2J7GA 1KB3A 3JUGA 3OGRA 2V5DA 4GQRA 1GHSA 2WYSA 5E6ZA 3RILA 1E0VA 3FXYA 4X0NA 4PYSA 3WQ8A 2BV9A 1CXKA 1Y7VA 3A3HA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3ARV A;  3LPG A;  4UQB A;  1AVA A;  3VD7 A;  4D6H A;  5BXT A;  5C8B B;  1OGG A;  4UCF A;  4OUE A;  2CBU A;  3GNR A;  4AZI A;  1MW3 A;  1XD0 A;  3FND A;  4IUG A;  4J3V A;  6TAA A;  3F5K A;  2BY3 A;  1VEM A;  2GUY A;  5CG0 A;  1UOK A;  1EDT A;  4E8D A;  1VJZ A;  1D2K A;  1E40 A;  4MB5 A;  1XRV A;  3WFL A;  4CD7 A;  1OWQ A;  3BSH A;  1JG9 A;  1HJW A;  1VIW A;  4W89 A;  2DT3 A;  5CPS A;  2RGL A;  2QHA A;  3W4R A;  3OLG A;  4LQ1 A;  4GO9 A;  3O2L A;  3A4X A;  1W32 A;  3BAK A;  1E6R A;  3FW6 A;  3MUI A;  4XV0 A;  2ZXQ A;  3W6M A;  4BA0 A;  5I24 A;  2DPE A;  3VMN A;  2J7C A;  2WBK A;  2RGM A;  3PZO A;  3WUF A;  1TMQ A;  1MXG A;  5KZ6 A;  2D0F A;  4UTF A;  2WZI A;  5BXP A;  3WSU A;  2BXY A;  5EFF A;  1JYX A;  4D6C A;  2WM0 A;  2VUR A;  4PRW A;  4AD3 A;  1GCY A;  1L8N A;  3WF1 A;  4U31 A;  2VRK A;  2J62 A;  4WSK A;  4CKQ A;  2CHN A;  2VX4 A;  1A47 A;  3WF0 A;  1EHN A;  4KH2 A;  2GDU A;  3W0K A;  3WNL A;  1JZ7 A;  1J18 A;  3FAW A;  4TVC A;  3POC A;  1C92 A;  5BRP A;  1OD0 A;  3AIB A;  7TAA A;  1BGA A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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