1W31A

Yeast 5-aminolaevulinic acid dehydratase 5-hydroxylaevulinic acid complex
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
340
structure length
340
Chain Sequence
MHTAEFLETEPTEISSVLAGGYNHPLLRQWQSERQLTKNMLIFPLFISDNPDDFTEIDSLPNINRIGVNRLKDYLKPLVAKGLRSVILFGVPLIPGTKDPVGTAADDPAGPVIQGIKFIREYFPELYIICDVCLCEYTSHGHCGVLYDDGTINRERSVSRLAAVAVNYAKAGAHCVAPSDMIDGRIRDIKRGLINANLAHKTFVLSYAAKFSGNLYGPFRDAACSAPSNGDRKCYQLPPAGRGLARRALERDMSEGADGIIVKPSTFYLDIMRDASEICKDLPICAYHVSGEYAMLHAAAEKGVVDLKTIAFESHQGFLRAGARLIITYLAPEFLDWLDE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Structure of Yeast 5-Aminolaevulinic Acid Dehydratase Complexed with the Inhibitor 5-Hydroxylaevulinic Acid
pubmed doi rcsb
molecule keywords DELTA-AMINOLEVULINIC ACID DEHYDRATASE
total genus 113
structure length 340
sequence length 340
ec nomenclature ec 4.2.1.24: Porphobilinogen synthase.
pdb deposition date 2004-07-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00490 ALAD Delta-aminolevulinic acid dehydratase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1w31A00
4IGHA 2AQWA 4MUZA 3TXZA 3W7NA 5J5DA 2E6YA 3CWNA 3SFKA 1YYAA 1OFPA 3CB8A 4AAJA 1P1XA 4MZYA 4WUIA 3T78A 5CZ0A 3C52A 4LW7A 2E77A 1RQEA 3QC3A 4DBDA 3QPYA 3LCFA 4TU1A 3NAVA 4QQ3A 4JYFA 3W1XA 3HPXA 4DELA 3LERA 3OG3A 3ZS4A 3CU2A 1FY6A 1QDSA 2DZWA 2RFGA 4NXSA 3W2KA 4LWWA 1QPOA 1FCVA 4HNVA 1YPIA 3LCHA 3EWYA 3DU0A 2CWNA 4RV8A 1OVDA 1GYNA 1G7UA 4NJJA 3W7QA 4DPPA 1WAUA 2B7NA 4J9JA 4JTGA 3CLMA 2VEKA 3GDRA 2EF9A 3G3DA 4O57A 4WD0A 4GXMA 5G2IA 5I3HA 1DHPA 4EF9A 2ATMA 2EGZA 4ONVA 3DFQA 4O1BA 5G5IA 1DQWA 4OQVA 5I3JA 3GDLA 3LBCA 1TPH1 5EYWA 3LXCA 5D32A 5CZTA 5C54A 1JCMP 4BWLC 1XKYA 4O14A 4AH7A 5KMYA 2QDHA 3L65A 4S1FA 1X6UA 3UY7A 3EX3A 4FEZA 3GR7A 3NNTA 2YGYA 2J27A 3BLFA 3CWOX 5F2LA 3GXNA 2O7SA 2J9YA 3D0CA 3Q94A 2QCEA 2NX9A 2E6DA 1ZJIA 1NF7A 1XFBA 4PTNA 4AF0A 1FWRA 2FLIA 3QH2A 3IRDA 4QISA 2YR1A 2XFWA 1FXQA 3HGOA 4MVAA 3LHTA 1K7FA 4TO8A 2JBMA 4K38A 1R47A 1D3HA 3UWUA 4EF8A 3N14A 4PFMA 4TMBA 4IX2A 1TPVA 3R13A 3HMJG 3TKFA 5BOOA 5FF7A 4H3DA 4IPIA 1I2PA 2X16A 1WYIA 3RNDA 4K8HA 3Q58A 1W3TA 3R8RA 3NPXA 3A23A 4WZHA 2YFNA 4PL2A 2NWSA 4M7TA 2A4AA 1TJRA 3NA8A 2ALDA 4RX0A 1BKSA 2F7FA 3A5FA 1XCFA 1LLZA 2VOMA 1ZY9A 5LGZA 1QOQA 2H3DA 4UTWC 4K8EA 1I45A 5LNUA 4OWGA 3CEUA 3LHWA 3F1QA 2ZA1A 3NL5A 1F6KA 1Q3NA 3E96A 2ZRZA 1W31A 3LB0A 1IIGA 4IMEA 2TYSA 2GPTA 4JDBA 2YCEA 3UWWA 2QUUA 3PSWA 3G1YA 4Q4KA 4MY9A 2ZZ3A 2W0UA 3MBFA 4LRSA 1SZGA 1L6SA 2OMAA 5HWNA 3WJYA 4JTEA 3W1MA 2QCLA 2P0OA 1KV8A 2A6LA 2TMDA 1OG0A 3TU9A 5CGQA 1KLZA 2A5HA 3P60A 3CHVA 1V5XA 3TNOA 1EX5A 3W84A 1W3NA 4X2RA 4LV4A 5U4NA 2VENA 4O13A 1PHWA 1GZGA 3K30A 5DCEA 4ZMGA 4JNMA 3CIWA 2NV1A 2XN2A 2GJLA 4JY8A 1QPQA 2HS6A 4NXKA 1SO6A 1K7XA 3HG3A 1JRBA 3M47A 3W74A 1XI3A 3PB2A 1BWLA 4DBEA 2HMCA 4EWND 1DORA 3DENA 4JYEA 1I4NA 5HQEA 3O05A 1TTQA 4PL1A 1EP3A 1TTPA 1G4PA 3IVUA 1EP1A 4LRTA 3IGUA 5DXYA 4X22A 2OZ0A 1FCQA 1ZALA 1KM3A 3DH7A 4ZQNA 1VYRA 1XXXA 3L0NA 1K7EA 4GUHA 4IMDA 3W2MA 3R5EA 4LS1A 3EB2A 2R94A 3GDKA 3PR2A 1WA3A 3C2OA 3I7RA 1CW2A 3CT7A 4K7VA 3WJXA 2AAMA 3PY2A 2B7OA 4BI6A 3QQ0A 5ABTA 3LHZA 3GXTA 4R34A 1GQNA 3MUXA 4FB7A 3SIZA 4PA8A 4O4VA 5AB3A 3VFLA 2X30A 1TPDA 3R89A 3S1UA 2ZDRA 3GNNA 5A5WA 2WNNA 1OK6A 2X1RA 4FF7A 4IOTA 2Y7DA 5F4XA 4QIUA 3TQKA 5AFDA 3HOJA 2DZXA 5DBTA 5AHLA 5EMUA 2BWGA 2C1HA 1G4EA 2V82A 4AMAA 1R2RA 3W1RA 3G18A 3TK7A 5D09A 1LBMA 2DORA 3KVMA 3GKFA 5D33A 4M6PA 3OIXA 5FEPA 1VH7A 2FDSA 3S5NA 3NZ1A 5LNVA 1TCDA 2V30A 4FXSA 3F4NA 1TRIA 1TREA 2V2DA 2VEMA 3A5VA 1VRDA 2CZ5A 3LBMA 2GVLA 4HPXA 5LNRA 2ZZ7A 1WV2A 1WXJA 1SZEA 3B03A 3V75A 1H7XA 1J4EA 2QKFA 1JRCA 1ZENA 5L9FA 4N9BA 3BPWA 3UYCA 1DKWA 3E9AA 3EWXA 1AW2A 2C13A 4JTUA 1H7NA 4QITA 2FPYA 3VE9A 1QFEA 4UMAA 3W3OA 4UC5A 5D04C 1R46A 5K7JA 3B4UA 4RK8A 2C14A 3BLEA 2DP3A 4O1CA 2DZPA 3GDTA 5HWJA 3EWZA 5FEWA 1ONRA 3QW4B 4ORIA 2C15A 3BLIA 4JTKA 1EUAA 5FI8A 2HTMA 1AW5A 1UJPA 3LXBA 2CLEA 2VKZG 2H6RA 1H7WA 2Y62A 3LLFA 4LU0A 4TX9A 2BXVA 4JTHA 2ZZ1A 2NLIA 1F76A 5CPMA 2NUWA 3GB6A 4S2CA 3TIMA 4OT7A 1NFBA 4N2YA 3SSJA 1IXNA 2QUTA 4MPQA 3PBVA 5U7SA 4U28A 3RFAA 2ZZ4A 2A7PA 1LTDA 4PC8A 2E5BA 3NQEA 5E1QA 3LTPA 4MKNA 1IIHA 5H2ZA 3HG2A 3IIXA 4OV4A 4UFLA 4DO5A 4O10A 4DEFA 4RJEA 4IXXA 4O16A 3GXPA 3BGGA 2YPIA 1F2JA 2J9ZA 1P0NA 4I9AA 3G1HA 2GOUA 3MJYA 2XN0A 3C3NA 1O94A 1G4TA 3S42A 4LS0A 2VFIA 3KHJA 2EAWA 1EPXA 1AMKA 2NWRA 3TV8A 3STGA 4FNRA 4WY0B 3ELFA 3GNDA 1RQBA 1QWGA 4JR5A 1IGSA 4UTJA 2GVGA 4ADSA 2X1TA 2A1YA 4NJHA 1EIXA 1NSJA 3PUEA 4IUOA 1LOQA 3NQFA 4JTJA 1AW1A 5AYXA 3T4CA 5I3FA 4DF2A 4FNSA 1RQHA 3P80A 5L6UA 3U2OA 4Q32A 3NM1A 4BI7A 1VCFA 4HKPA 3BG9A 1FCBA 2ISWA 3PAJA 2FQIA 4XBKA 3W7LA 5F2GA 1H51A 2Y85A 3QM3A 3P81A 5G2HA 3IIVA 3OA3A 1M7OA 3STCA 1Q6QA 3W1TA 3HPSA 1TV8A 1TIMA 2V2HA 4BI5A 1AL7A 3NQCA 2NUXA 3NQ7A 1W5OA 1G67A 4L4LA 4PEKA 3NO5A 3B0PA 4WOZA 3TC6A 1NVMA 1DQXA 1RV8A 4YXGA 4MY8A 5DN1A 3DKJA 5LSMA 2RDUA 1F7BA 2Z2UA 4K7YA 2FPVA 1EEPA 1W8SA 1LBLA 3FLUA 1TTJA 2JKEA 2CLIA 4R53A 1VCGA 5EL1A 5HJLA 4I7UA 1W54A 3W7RA 3T44A 4XWUA 1FDJA 4O19A 4O53A 1H61A 1LZOA 4Z1BA 4RXGA 5DBUA 3W7KA 1OX6A 4LC6A 2ZRXA 2C16A 1OF8A 1BTMA 4A3UA 1QPRA 1B57A 1BWKA 1OK4A 1QO5A 3MWAA 4UTTA 3OBKA 2WO5A 3TAKA 2J9XA 5EY5A 2ZA2A 2WNZA 1Y0EA 1KM2A 3S6DA 1XUUA 3SZ8A 3W9ZA 3O15A 5K2ZA 4Y96A 4PH6A 2FFCA 3QMSA 5IBXC 3ZWSA 3PUOA 1YDVA 4P61A 3QMTA 3QFEA 3G1VA 4IWWA 1DL3A 2ZZ5A 3DI0A 1GVOA 5C55A 2VFFA 3QSRA 4ADTA 4EVZA 4N9DA 4NT0A 5HULA 4O4WA 4LVBA 4TR9A 2E5DA 3C8FA 1B3OA 5AC8A 1OX5A 2G96A 3PG9A 3NDOA 4MOZA 3T55A 1P5BA 2DZUA 2R8WA 4O0KA 1OFDA 2YX0A 5CZJA 2B7PA 3HJZA 3NQDA 1VYPX 4K37A 1GTHA 1B4EA 3LGEA 2QEZA 3FOKA 3QZEA 3M5YA 3S0CA 4NNAA 3P82A 4JTFA 3HBLA 3MHUA 3L2IA 4JTTA 4CCEA 1A5AA 3UZJA 3BK0A 1LOSA 1SFJA 1SQ7A 1ZAHA 3W7DA 5DY3A 4DO4A 3B0UX 2C0AA 5HR7A 2QAFA 3VE7A 1PS9A 3HGSA 1XBYA 2FTPA 3BGJA 4RZ5A 2YSWA 3EX2A 5D05A 1SSDA 2Y7GA 2GVJA 5TIMA 1ICSA 5D2VA 3I68A 1JQVA 3G3MA 1Z42A 2YZRA 2GJNA 1F6PA 3C4UA 3B8DA 2FB3A 3LOTA 3M41A 3OVPA 4HHPA 3FJ6A 1SW0A 1TPUA 2ZRUA 3MI6A 3DI1A 1YTEA 2WSRA 3C0JA 2DU2A 3LTSA 1MSSA 3ZFHA 3NL2A 5AHEA 1Q6RA 3LCIA 5DY2A 3N9SA 5AOUA 2ATSA 1OYCA 3DXIA 5CKSA 1QR7A 3M1ZA 1VLIA 4IMCA 1K02A 4DQWA 3V1PA 3W72A 3QRHA 1HL2A 1H1YA 2G95A 2ZYFA 5F1VA 5FESA 1FWTA 3FKRA 2CFFA 3TAOA 3MW7A 1R2TA 4A2SA 5KITA 2YW3A 1LROA 1OFRA 1I2RA 2YFOA 1HUVA 3M5XA 3PWAA 5CG7A 1G4SA 4TMCA 1GVRA 1GT8A 2P1FA 3LHUA 1EUNA 2PC4A 1KBIA 4N6EA 1YPFA 1GG0A 1JCNA 1UASA 3LRMA 3M5ZA 4NZJA 4PCFA 3VI2A 3A21A 4Y6GA 1QNVA 1SFLA 4FNUA 1YXYA 1XBXA 4XKYB 1H7PA 3KVLA 3WJSA 1G6CA 4MZ8A 3S8HA 2WPBA 1KFCA 3SJ3A 5K9DA 3G1FA 1PE1A 5K4XA 2DZSA 4FNPA 3UD6A 5D02A 1SW7A 1KTBA 1N8FA 3TFXA 3RK8A 3FA5A 1KTNA 1YXDA 3W1QA 3W1LA 3LV6A 5HUOA 1SZFA 4PODA 2BSLA 2OX1A 4O12A 1EP2A 3W76A 1DJNA 1JUEA 1LOLA 3QYQA 3WJWA 3TSBA 3A9IA 4O54A 5I3IA 3W70A 1H1ZA 1YLVA 2ISVA 3CQ0A 1QO2A 3S5OA 3S1WA 3KVJA 4OU1A 4WOQA 2Y7FA 3TSDA 3TQ0A 2W79A 3W23A 2X1SA 5TBOA 5MHBA 4ZQMA 3G24A 4NJGA 1AL8A 1L2UA 1JJKA 3W7JA 4Y9AA 3TW7A 1LRNA 2PE4A 3PM6A 2TRSA 2VFDA 3EX1A 4FX8A 3W7IA 3EXSA 5FF2A 1BEUA 2WOQA 1GEQA 2QJIA 1PCKA 3TX9A 1S3HA 7TIMA 1V7YA 1T0OA 3UXDA 1S5WA 3I7QA 4ML9A 3S1XA 4RZ6A 4UTTC 1R30A 4UTHA 4CNOA 4LVAA 1EWDA 4XQ6A 1KTCA 2F84A 1VPXA 2AGKA 3SGUA 1H50A 4MFEA 1W5PA 3LXAA 3U6WA 5K9CA 3NQVA 1SO5A 4XUGA 2QJGA 3W71A 5KZMA 3DGRA 1Z41A 2HS8A 4C1KA 3EWUA 3P8IA 1XC4A 3DHDA 4S2BA 1KBJA 1H5YA 1SZNA 5EPDA 1EB3A 5LGXA 5D38A 2RH9A 4GWEA 5SWUA 3M0ZA 3MO7A 3TH6A 2QDGA 3GDMA 3S9YA 4H6KA 3HO8A 4GUIA 4ZQOA 3TCEA 1KM4A 3PBUA 1FWSA 4BFAA 4CCCA 5I3GA 4GUGA 1TQXA 4LS2A 2ZTJA 2Y63A 2JKAA 2QCHA 1C8VA 4E0CA 4DXVA 1TSIA 3SECA 2ZRVA 1J5TA 3ABQA 3M7WA 3UPBA 3UNDA 4DF1A 3L9CA 1IXPA 1MEWA 2NXHA 1I8JA 3OVQA 5H91A 3UWQA 2CU0A 3LRKA 4IMFA 5LNWA 2CLFA 4NNBA 4MJMA 4UR8A 3GX9A 3MMTA 3NQAA 1PL9A 3ABOA 4CLMA 4B5NA 1YTDA 3HGJA 3OHIA 3W7GA 3G8RA 3E0IA 4O17A 4Z1AA 3QMRA 2BLEA 3NOEA 2XN1A 3CEPA 1ZCOA 2Z6JA 2RKXA 4A2RA 1TMHA 3NQ8A 4JX5A 3OEXA 4AWTA 3NQMA 1O60A 1RR2A 4UTMA 1VGAA 3LCGA 3KOFA 5D30A 1TPC1 3GR8A 3SW6A 1XM3A 4GUFA 4IMGA 1FCUA 3MYPA 4AHQA 4GJ1A 1KV5A 3O16A 2A6NA 3AJXA 2IQTA 1D9EA 1A50A 4HPJA 3W1AA 1FUYA 1I2NA 3E49A 4O28A 5HR6A 1FX6A 3UY8A 2GUUA 5E0KA 3VKJA 5DLCA 2DJXA 1S5TA 3NG3A 4MY1A 4KFPA 2QCDB 3PSVA 1XBVA 4LC8A 3U8GA 1F5ZA 1NAL1 1IXOA 3FKKA 1G7VA 3W86A 5EKYA 4O11A 1O5XA 1GVSA 2VEPA 5BMWA 1LDCA 3EWBX 1UUMA 1GVFA 2C3ZA 1B4KA 2J88A 4HT3A 2Q8LA 3W85A 4GRSA 3VNDA 1KM5A 3NVTA 4RKAA 1X1OA 3TE9A 4N02A 3O63A 2PRLA 4M7SA 1VHNA 4N9EA 1RD5A 4UUIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4IGH A;  4Y9P A;  3TXZ A;  1XLI A;  2DT3 A;  3VKD A;  1J6P A;  3BSM A;  2ADA A;  2WC4 A;  4MZY A;  4WUI A;  2E77 A;  2WM1 A;  4A8I A;  1VPY A;  3QC3 A;  3QPY A;  4TU1 A;  2ZWZ A;  3NAV A;  3POH A;  4H6R A;  4JKK A;  1OZM A;  2RFG A;  3MQT A;  3ABZ A;  1QPO A;  1TG7 A;  4HNV A;  2FGB A;  4HZ8 A;  3L7R A;  4QRO A;  2WLZ A;  4RV8 A;  2OSX A;  4WVX A;  4HU0 A;  1GYN A;  3MJM A;  3MSY A;  1G7U A;  3W7Q A;  1WDS A;  4DPP A;  1KC7 A;  4I3G A;  1J2B A;  3AIU A;  1MQR A;  3IUD A;  5ABH A;  2Z4G A;  4EF9 A;  2ATM A;  5G5I A;  1R3Y A;  1RP9 A;  4OQV A;  3GDL A;  1TPH 1;  3KCL A;  5D32 A;  4CD7 A;  4E8C A;  5C54 A;  1JCM P;  2BOG X;  4Z2J A;  3NO1 A;  5KMY A;  1X6U A;  1M1B A;  3EX3 A;  3VMO A;  3NNT A;  2J27 A;  5F2L A;  3VVG A;  3GXN A;  2ASH A;  1L2Q A;  2NX9 A;  2PU1 A;  4RUB A;  1XFB A;  1ZPT A;  3OA5 A;  3QH2 A;  2WM0 A;  2YR1 A;  3QXB A;  3VAB A;  1GNX A;  1FXQ A;  1CLV A;  1K6W A;  4D1I A;  5H6H A;  2QV5 A;  2VVN A;  3APY A;  3BC9 A;  4DJD A;  3LHT A;  1K7F A;  1TZ9 A;  3E0W A;  3R7M A;  1V4Y A; 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