3G8EA

Crystal structure of rattus norvegicus visfatin/pbef/nampt in complex with an fk866-based inhibitor
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
475
structure length
463
Chain Sequence
FNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKEVYREHFQDDVFNERGWNYILEKYDGHLPIEVKAVPEGSVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGIALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTEAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLDILGKKFPVSENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKKWSIENVSFGSGGALLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGVNVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGTFVTLEEGKGDLEEYGHDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEVRKNAQLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Transferase
source organism Rattus norvegicus
publication title Crystal structure of Rattus norvegicus Visfatin/PBEF/Nampt in complex with an FK866-based inhibitor
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
total genus 132
structure length 463
sequence length 475
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2009-02-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3g8eA02
3ZWTA 2GVJA 4DQWA 1B3OA 3GR8A 3GXNA 5DBUA 3HG5A 4UFJA 3M16A 3IEBA 1FBAA 3P61A 3FFSA 4OT7A 3G18A 4U28A 4UC5A 1H5YA 3GYEA 3ABSA 4OGZA 1IXQA 4DO6A 1SW7A 2FB2A 1KM6A 3DENA 4JX5A 1SU5A 5KZEA 1A5CA 3GXPA 5H91A 2ISVA 1LM1A 3EXSA 3TCEA 3UY7A 4AWTA 4FHAA 4IMFA 4PL2A 3HPSA 4RR4A 3T40A 2E6DA 1EA0A 3EWYA 3QC3A 3O16A 2QCLA 1WX0A 1A5BA 2DP3A 4N9CA 4HNVA 1DV7A 2WQPA 1KFJA 3CHVA 1A5SA 1JCXA 1OF6A 2E1DA 3GXTA 3PSVA 4M7SA 1JUBA 3QMTA 4ZZ9A 2G95A 3CIWA 5FF3A 1LBMA 1P4CA 1DHPA 1OYAA 4TU1A 1SO4A 3W1RA 1THFD 3UWUA 2VENA 3W7QA 4MZYA 3EX2A 4MYAA 2ABBA 4Z0JA 4GXMA 5BMXA 1XI3A 3NAVA 4MIMA 3GLCA 1QCWA 2OX1A 4JEQA 4DPPA 4RXGA 1OFOA 1X1OA 1HO1A 4OHQA 1JCJA 4IUOA 4O15A 1OF8A 2IQTA 3M44A 3PUOA 1TB3A 3N3MA 5F2GA 1TSIA 4JNMA 3PAJA 2NWRA 1EB3A 1VQTA 4CQ9A 2WNQA 3P7YA 2JGYA 4EOUA 5D2YA 1OFPA 1KLZA 1MEIA 4JTHA 5AC7A 4R34A 3G0UA 2Y63A 1OG0A 4OV4A 2GQ9A 6TIMA 4FNUA 3CTLA 5AHNA 3LCWA 3GDLA 4JTLA 4LWWA 1UUOA 5BRBA 3W1LA 4OQVA 1ME8A 1VCFA 4LRTA 3W1MA 3TW7A 1G4PA 4O1CA 4N6FA 2FTPA 3OIXA 1SFLA 1W5QA 5D30A 3TDFA 4AEOA 5K7JA 3DFOA 4DBEA 1G69A 5T26A 2JKEA 4GUHA 3VKJA 1ZAIA 4O19A 3TFXA 3BW2A 3F03K 5HNRA 2ZYFA 3EX6A 2EHHA 1H7OA 1DL3A 3LCHA 4POCA 5DCDA 3NQVA 2CLHA 3Q37A 2AGKA 3HGRA 4N4PA 1ZENA 2W0UA 1DKWA 2YSWA 2ZFAA 5F4SA 4GRSA 3ZS4A 2QCDB 5EL1A 2EF9A 2OZ0A 1GOXA 4WY0B 1A50A 3NQCA 4M6VA 4FNPA 4A2RA 3EWZA 2P1FA 3KRUA 4NJGA 2PE4A 3NZRA 1IXPA 2J88A 3L66A 1CI1A 3TUUA 1F2JA 4GUGA 2PC4A 1SSGA 4IXXA 3ABQA 3LHWA 3CPRA 3W7LA 4JTEA 1EIXA 1GEQA 4LOCA 1T0OA 4JD4A 2V82A 2A5HA 1PVNA 2J24A 1YTKA 3M5VA 4CNPA 2JKAA 3R12A 5A8GA 3VCRA 3E49A 1KM5A 3L68A 3NL5A 4ICNA 4A29A 5CSRA 1ZJIA 2BXVA 3NQEA 4JTIA 1W37A 3N2MA 4BK9A 3S5YA 3A23A 3DI1A 1PCKA 3UWQA 1KBJA 1TPVA 1GJPA 1OFRA 2ZZ6A 4R33A 1YDVA 1SZFA 1XBYA 4Y96A 4JICA 1FWWA 1ONRA 1UB3A 4RJEA 3JR2A 1WOBA 3RK8A 1LCOA 1S5VA 3QW3A 2JKPA 4UTWA 3WJZA 3IVTA 4K38A 1XUZA 5CZTA 4CQAA 2Y88A 2CFFA 2VFHA 3USBA 2Z2UA 1JCLA 1VYPX 2LLEA 5J5DA 1O95A 1OFEA 1GPWA 1Q6RA 3BV4A 3N19B 2VEPA 5CPOA 4LU0A 3MMTA 3TJLA 4LRSA 1BWKA 4MJMA 1TCDA 5KZMA 2Z6JA 1HUVA 4A3UA 4XTDA 1KW1A 4MYXA 1RZMA 3I6RA 2R94A 2ISSA 3M7WA 2R14A 4FNRA 3E12A 5I3JA 2UV8G 3DHFA 3G0SA 5G1TA 3B0PA 3F4NA 1LBLA 2FPYA 4RLIA 4UTJA 1GWJA 2HSAA 3FEMA 4BWLA 2OJPA 3FKKA 4LT9A 2PURA 1QO5A 3LTYA 3GIYA 5E93A 4N9BA 3N2XA 1SO6A 4UFMA 4EF9A 2CLIA 3W7RA 3UZJA 1TQJA 1YXCA 3AO0A 4PEKA 1XKYA 2YR1A 5L6UA 3LDVA 4UCGA 3SSJA 3STCA 2R91A 3GNDA 3UXAA 4BI7A 3PSWA 3W86A 5F2LA 2ATSA 3B05A 2ZZ3A 1VLWA 3H55A 5C55A 1I2RA 2YW4A 2RH9A 5HWNA 3M43A 4I7VA 5CGQA 3VI2A 1Q6QA 1OFAA 1OYBA 3EX4A 4MUZA 5G1YA 4ALDA 5LGZA 3M5ZA 3W83A 3LRMA 4KFNA 1AW1A 1M7OA 5CKSA 1D9EA 4BI6A 2CU0A 3TXZA 1IXNA 3TFCA 1P0KA 4A22A 2VEIA 1RD5A 2A7RA 4Y6GA 3GZ3A 1B4EA 4RK8A 4O1BA 4XTIA 5LKYA 3CEUA 1FXQA 2JGQA 2E6YA 3GDTA 4A2SA 3GDKA 3DAQA 1KM0A 1I2PA 5F2MA 4WQ6A 3UWYA 2FPTA 3G1YA 1ADOA 3N34A 2ATMA 1MEHA 3LCFA 4UTTA 1K03A 4UUIA 4MZ8A 3IIZA 5D05A 4NZJA 3BW4A 4O1DA 2J6XA 3T78A 3BPWA 3BLFA 1H63A 3R5EA 4I7WA 2WSQA 1SQ7A 5I3KA 4AHQA 1ZAJA 1C8VA 1TQXA 3CT7A 2D73A 1LZOA 1SO3A 2DJLA 5U7SA 1TTIA 3MHUA 2WKJA 2OT0A 2VEKA 3MUXA 5L9FA 2H3DA 5HQEA 4ZL1A 3N9SA 1KFEA 5DLCA 1SSDA 1WXJA 5D33A 1G4TA 4EF8A 1VCGA 3G22A 3W7EA 5G2IA 4Y90A 3SJ3A 1MO0A 4UTUA 4ORIA 3GVGA 4MLRA 2J9XA 3FYPA 3HG2A 3QRHA 2NX1A 3T55A 3G1FA 3W23A 5FEPA 4JTJA 1FWSA 1W8SA 2E77A 1VH7A 1XBZA 3WJWA 4NT0A 4PFMA 3T7VA 5AB3A 4NJIA 2QEZA 2QJGA 2B0MA 2C16A 4R7JA 4O4WA 4K7VA 3W1AA 4L4LA 4Z0SA 3HG3A 3UY8A 3HQ1A 4NJKA 1XM3A 3G1DA 4N2YA 4HNNA 3MJYA 1OFBA 3DH7A 3LHYA 1FXPA 1O4UA 2C0AA 2G5WA 1L2UA 4CQ8A 3G3DA 4MKNA 3TH6A 5HR7A 4LC6A 1KV8A 2HTMA 4OWGA 3N73A 4N6EA 1FCBA 4XKYB 1IIHA 2YDAA 2H90A 3H53A 3MHGA 3WK1A 2EPHA 1UASA 4JIPA 3CU2A 1YADA 5IBXC 3TIMA 2TRSA 2WPBA 2G96A 4M19A 1TMHA 1EP2A 3LRLA 1G4EA 3ZWSA 4JTSA 2WOQA 1A53A 4XBKA 1GTHA 2B7NA 2E09A 3MYPA 4WXZA 4ZMGA 4FXSA 3THQA 2E5CA 4IX0A 3LHTA 5LSMA 2Y85A 3W73A 2VFGA 3C8FA 2ALDA 4MZ1A 3UWVA 1RQBA 5TIMA 4ADSA 4JDBA 5H2ZA 4AH7A 2GJNA 1GG1A 3PR2A 4UTIA 3DKLA 4QJ1A 4K8EA 1F74A 1K8XA 5BNKA 1R2TA 4O52A 3CLMA 5AYXA 3SI9A 3QYQA 1N8FA 3OHIA 4HNTA 3UD6A 5LGXA 1AL7A 3FKRA 3WJXA 1UBSA 3SFKA 2FPVA 5HUPA 5K4ZA 1SZGA 1X1ZA 2H6RA 3WK0A 3OVQA 4Q32A 3QFEA 4HSNA 3NDOA 4IPJA 4FX8A 4RX0A 1QO2A 1VYSX 3MW7A 1YXDA 2QCGA 3W7CA 1YTDA 2ZA1A 1TRIA 4E2BA 3KXQA 1RVGA 2GJLA 1P0NA 1R47A 5GVJA 5LNWA 4H4IA 4RZ4A 2NWSA 1C9DA 4HIBA 2ZTKA 4NQ1A 2HMCA 1TPC1 3NNTA 1KBIA 1YYAA 3TAOA 4RV8A 3BGGA 3QMSA 4O57A 5K9CA 2NUXA 4ML9A 3GKAA 1VYRA 2ZRXA 2YYTA 4PC8A 4DELA 4EIVA 5LNRA 1F5ZA 3PVFA 3PY2A 5D2VA 3CWNA 2QAPA 3NL3A 3DBPA 3MI3A 1I2NA 4FX6M 3WJSA 2JBMA 5I3GA 4IXHA 1BTMA 1Z41A 3QPZA 1H1ZA 3NQMA 4Z08A 1QMLA 2ZZ5A 3C52A 2PCQA 3M9YA 2ZZ2A 1GVOA 3UQNA 1QPQA 3B0UX 1W3TA 4BFAA 4DF2A 1T96A 3WK3A 4Z1BA 4LUIA 2TSYA 3R2GA 4O54A 2C19A 1JUEA 1OX4B 3W7DA 1L6WA 4NXKA 4ADUA 5U4NA 3IVSA 3UZ5A 5C6MA 3W7JA 4UTHA 4QNWA 4LS1A 1QWGA 4L4MA 1SZNA 5IM51 2Y89A 1MSSA 3S5ZA 3THAA 3F1QA 3C0JA 2QUVA 5D04C 3UWWA 4Q33A 1AMKA 2QDGA 3E02A 3MP4A 1TPDA 3DFQA 4O18A 5HMSA 3LLFA 4LS0A 4JGDA 2TPSA 2DZVA 2YW3A 1AG1O 4JR5A 3S42A 1LOQA 4NNCA 3O8AA 4HPJA 1FWRA 1FCUA 3LV5A 5BMWA 3M6YA 3TK7A 2PRLA 3R8RA 4DO5A 3S5NA 2QCMA 4BR1A 4AF0A 5K9XA 1F6PA 4IOTA 2GOUA 1ME9A 4DPQA 2DZSA 3CC1A 4O10A 4PA8A 3L0KA 2GQ8A 3W1QA 2V2CA 1XL9A 1ZCOA 3Q2DA 4MY1A 3P5ZA 3HPZA 4AAJA 1K8ZA 4FF7A 4GC4A 1V5XA 1K7EA 3INPA 4PCFA 3C4UA 4AB4A 1EPXA 2QUTA 4DBDA 2X2GA 1L6SA 4FB7A 3NPXA 4UNKA 4AVFA 1O60A 3LX9A 1W0MA 2FLIA 3L21A 1ALDA 3NQFA 3U6WA 3W7OA 4CCCA 4XBSA 3W88A 3SGZA 4LC8A 1FWNA 3P8IA 1JQVA 4TIMA 1H50A 1P1XA 5AC8A 3NGJA 3UPWA 1G7VA 3GAYA 1OK4A 3CEPA 4O17A 4M6QA 1YLVA 1FCVA 1XBXA 3HGSA 1JCMP 4NVTA 5ABTA 1K7XA 3DFSA 1YPFA 3HPXA 1B9BA 4E0CA 4CLMA 1JR1A 5FESA 2YZRA 2ZZ1A 4CCEA 2BSLA 4PODA 2JK2A 4ONVA 1V7YA 1T8XA 3W7KA 4NJHA 3MP5A 3LBCA 3G1XA 5EYWA 4KWWA 1DOSA 1KM2A 1EUNA 5K4XA 1KLYA 3G1HA 3IIOA 3V75A 3O63A 1TPWA 3BLIA 3KFTA 1C29A 5HWMA 1O5XA 3FLUA 3JS3A 3P5YA 4QISA 3B4UA 3I68A 5DELA 2FFCA 4NNBA 2VOMA 2XFWA 4IMCA 3RLUA 1J5TA 2AQWA 3PB0A 3O15A 1SW3A 5EBUA 4IMDA 4DEFA 4YWIA 3KVKA 4C1KA 1I4NA 2E68A 3VNDA 2DZWA 1H7WA 1KFKA 2C14A 1G4SA 4WX2A 2FB3A 1DORA 1OABA 3C2FA 1X8FA 3TMLA 1TV8A 1VLIA 4FEZA 3I65A 2GQAA 3G1SA 4BWLC 2WNNA 1L9WA 1KM4A 1U83A 3C61A 2ZQ0A 1OJXA 3TMQA 3OG3A 3P62A 2QUUA 1B57A 1NF0A 3FIGA 4GE8A 4KFPA 3QZEA 3LGEA 4WY0F 2RFGA 2P0OA 5K3VA 3SIZA 7TIMA 3HIJA 3N14A 3YPIA 1F73A 3MO7A 4WJEA 1LRNA 2ZA2A 3EWUA 1ZAHA 5D37A 2Y7GA 4M6PA 4JIQA 3U8GA 3FJ6A 3O07A 3DFNA 5DN1A 3BVJA 2WV8A 1VPXA 2CW6A 1P5BA 1Q6OA 2XN1A 3EWXA 4JYEA 2PRMA 4HNUA 3L5AA 4GFSA 2BTMA 4LVGA 3TNOA 3C2VA 4AXKA 4RCXA 3O06A 4H3DA 4CNOA 4LV9A 1G67A 2B7OA 1EP1A 2V81A 1OVDA 3QPYA 1FDZA 4YMZA 3M5YA 1RQHA 3NO5A 1LOSA 2WSYA 5DBTA 3T44A 3RLVA 2G97A 1UCWA 4IJBA 1XDLA 1YDNA 3NPVA 4IQLA 4NJJA 1KV5A 3W2NA 1A5AA 1W56A 3K30A 3PULA 1EWDA 4WOQA 2F84A 1KM3A 3DFPA 2QCDA 4MPQA 4GUJA 4WY0A 2YFOA 3NM3A 4NNAA 1F76A 4QIUA 3NQ2A 4O0KA 1Q45A 1ZY9A 3GKFA 3NQ6A 3EKLA 5C54A 3W07A 3G1VA 2WJZA 5CSSA 4JTTA 5F4WA 1LP6A 3SECA 5AYYA 1WDWA 4HKPA 2ZRWA 2BZNA 3ANYA 3HG4A 1G7UA 3S6DA 3OVRA 3LRKA 4IMGA 1AL8A 1PIIA 1LBFA 1S5TA 1HTIA 1ICSA 3NQDA 1ZALA 4QITA 3PBUA 1TJRA 4JS3A 3TROA 3P82A 4UFLA 2EAWA 5LNUA 3QEZA 4JX6A 3FYOA 2CWNA 5AOUA 4UNLA 5I3IA 1Z42A 3W71A 3MYOA 1R2SA 1H61A 3DXIA 3GX9A 3VFLA 3W7NA 5FEWA 2TMDA 1LRTA 2VC6A 5EPDA 5LHEA 3W6YA 3C56A 1TYGA 4S2BA 3NM1A 4EWND 3C2RA 2QAFA 3CQ0A 3ATYA 1SZEA 5HJLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3SCP A;  2ZRW A;  3ANY A;  4HU3 A;  3UGR A;  3N6H A;  4E6M A;  1AL8 A;  5E0C A;  1ICS A;  3NQD A;  1ZAL A;  3P82 A;  2YB1 A;  2EAW A;  5LNU A;  5AOU A;  4NAE A;  4UNL A;  4W7W A;  3MYO A;  3KBN A;  2GUB A;  3DXI A;  4CD6 A;  3VFL A;  3EMC A;  5FEW A;  1AQM A;  1LRT A;  2O92 A;  1CEN A;  1HGY A;  2WC7 A;  4EAM A;  4Q4O A;  2IPF A;  1W8G A;  4YCO A;  3UWZ A;  3AHV A;  4Q4R A;  3UER A;  3IIV A;  5CPQ A;  1FDJ A;  3S9Y A;  4GQQ A;  2CZD A;  1JIB A;  3KTC A;  2GUU A;  2O9P A;  4HSH A;  1QPK A;  1XIM A;  4X2P A;  1AOD A;  2YB4 A;  4H41 A;  1V0K A;  1PZ0 A;  1LWI A;  4F0L A;  3LCG A;  1CYG A;  4UR8 A;  4DWS D;  2C91 A;  1IEI A;  2J27 A;  3QY6 A;  3C2O A;  1E6S M;  4KWS A;  1TVN A;  1V02 E;  3D3A A;  2DGA A;  1RR2 A;  3W2K A;  2YGY A;  1VFS A;  2GJX A;  3WD4 A;  2Q01 A;  3KAO A;  5HAN A;  1QHP A;  3CWO X;  2D24 A;  4YXG A;  3STG A;  4NF7 A;  3GG7 A;  1PHW A;  4EX4 A;  3KVJ A;  2X1T A;  3VD7 A;  3PBY A;  5H8U A;  2NXI A;  4HT3 A;  1TE1 A;  3W3O A;  4D6C A;  2ZC1 A;  3HMJ G;  4L1X A;  3SCQ A;  2QJI A; 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