1CNV | Genus

Total Genus 93

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	93
sequence length	283
structure length	283
Chain Sequence	DISSTEIAVYWGQREDGLLRDTCKTNNYKIVFISFLDKFGCEIRKPELELEGVCGPSVGNPCSFLESQIKECQRMGVKVFLALGGPKGTYSACSADYAKDLAEYLHTYFLSERREGPLGKVALDGIHFDIQKPVDELNWDNLLEELYQIKDVYQSTFLLSAAPGCLSPDEYLDNAIQTRHFDYIFVRFYNDRSCQYSTGNIQRIRNAWLSWTKSVYPRDKNLFLELPASQATAPGGGYIPPSALIGQVLPYLPDLQTRYAGIALWNRQADKETGYSTNIIRYL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Seed protein
publication title	Crystal structure of concanavalin B at 1.65 A resolution. An "inactivated" chitinase from seeds of Canavalia ensiformis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	CONCANAVALIN B
total genus	93
structure length	283
sequence length	283
ec nomenclature
pdb deposition date	1995-02-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00704	Glyco_hydro_18	Glycosyl hydrolases family 18

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1cnvA00

1G0CA 1XCXA 3CZGA 3SCVA 2JALA 3ZJ8A 3AIEA 3RJYA 1XYZA 5EMYA 1W91A 4L4OA 4CKQA 2E0PA 4GPNA 2QMJA 1V0NA 2F8QA 1V3MA 4W5ZA 2J4GA 4M1RA 1E1FA 3CIVA 5FL1A 2DIJA 2G8ZA 2BHUA 4HTYA 4BQ5A 2CIPA 3MV01 1UWIA 2DGAA 3VMOA 3EBVA 2BY1A 1BF2A 4PYSA 6A3HA 1G9HA 3S2CA 3BAXA 1IT0A 4WKHA 5A95A 3VKKA 1UR9A 3CBWA 4LYQA 4JKLA 1E5NA 2CHNA 4AMCA 2VCCA 1E9LA 1LG1A 4IUGA 4TVCA 4W93A 3WDHA 1QVBA 1JDCA 4A3HA 1P6WA 1RP8A 3VGHA 3BCFA 1B3YA 1UH3A 1DWGM 3ZSTA 3AISA 2O9PA 1H3GA 1GQJA 1MFUA 1BG4A 4UNIA 1UKOA 3MMWA 4ACYA 2X0YA 1TZ7A 2WVVB 3LPFA 4IPLA 3VIOA 1XHGA 2VCAA 4GI6A 5I79A 3WQ8A 2VVSA 4TUFA 4RE3A 3AS0A 2W67A 1F4AA 4TTUA 4CN4A 2DH2A 2X0HA 1NM9A 3KZSA 2WMGA 2VX6A 2OWCA 5E0FA 2WZEA 3AJ7A 1H1NA 1VFUA 1WP6A 2WHKA 2GK1B 3MANA 3GYCA 1BGAA 1KCKA 4HA1A 1V02A 2PC8A 4CN1A 4E4PA 4FLRA 1M01A 3MSGA 4M29A 1EOKA 2A3EA 5LYRA 3ARUA 1E55A 3KL0A 3K8KA 2NT0A 1F4HA 1N82A 2A3BA 3T2PA 3W29A 4PMOA 5E0CA 4JFTA 2G3NA 2UY4A 3T09A 1GQLA 2HISA 1JZ8A 1GOQA 4TXEA 4Z2HA 3WFLA 1JZ5A 5FL0A 1J18A 4M80A 1UKSA 3ZJKA 3VNYA 8A3HA 3MUAA 5E09A 4QLJA 1UYQA 4U5KA 1W9BM 1V08A 3NIYA 2YDSA 4LYPA 4WJXA 5D9NA 3T2QA 4PUDA 3GXIA 3RMEA 1J0ZA 3N9KA 3GH7A 4DWSC 4UFIA 1QI3A 4UQBA 2B31A 1QBBA 4TOQA 1CGXA 4XUYA 3AHZA 5IDIA 3WQ4A 4XB3A 2DSKA 1WZKA 1SR0A 3M6DA 2ZUSA 1V3KA 4NI3A 1CGUA 1H5VA 1OWQA 4E8CA 2J8FA 5CSUA 3ZIZA 2YBUA 2BHYA 2XFFA 2WHLA 2J79A 1FHLA 2OYLA 4RE2A 3PZVA 3RJXA 1BSIA 4HOWA 1MQPA 3AS2A 1WDRA 5D8WA 1XSIA 3PZMA 1TR1A 2VVNA 1CPUA 1W9UA 4OBSA 2VTFA 4MADA 4DWSB 1KQZA 2PWHA 2VR4A 4W85A 2VR5A 1GOMA 4YN5A 1MW3A 4GI9A 3WD2A 2PB1A 3B9AA 4H04A 3ARWA 1CNVA 3UR7A 1A47A 3KE0A 2D24A 4AW7A 2CYGA 5ABEA 3PTKA 4H8HA 1AQ0A 1VFMA 4KH2A 4TTGA 1IZKA 2CITA 1JDAA 2WKGA 4AZCA 1H49A 4JFUA 4AZ5A 1UR0A 5I3DA 3S6TA 3L4VA 4BQ2A 1US3A 3TP4A 3CUFA 1HJWA 3G6LA 5CGTA 3UESA 4JKMA 2CBIA 5BXRA 1CZ1A 1JYXA 1H11A 4PMQA 3TTQA 3VUPA 1TA3A 5BROA 3IJ9A 1DWHM 2WCGA 1XH0A 1DWJM 4NF7A 4OOUA 4Y7EA 3IK2A 3TOPA 1GJWA 3PTQA 2YIHA 7CGTA 3WQ5A 4BCEA 4QLKA 1KB3A 3WH6A 3NSMA 3AMDA 3PZ9A 3VX1A 4UQAA 4CVUA 3OLEA 2DPEA 1VIWA 3WDIA 3PTMA 3A3HA 5AYIA 1UD2A 1VFFA 3ZQ9A 1C92A 4MAVA 2ZUTA 3VD5A 5A6AA 2GJXB 1G94A 4PMDA 2VZVA 1PAMA 2MANA 1M04A 4X0NA 1OD0A 3N17A 4H8UA 2ZX6A 1PZ3A 4PTWA 5A6MA 2D1ZA 3AXXA 2DQXA 2XVKA 3CTTA 2G41A 1Q6FA 4PUEA 3ECQA 5A2CA 5HPOA 2XWDA 2XJ7A 2IUZA 1OD8A 4Z2GA 2W63A 4XZBA 1HT6A 4U5IA 1GOWA 3TTOA 3GH5A 1NH6A 2V5CA 6CGTA 1XRVA 5C8BB 4DWSD 2EQDA 2ZUNA 5F7UA 5I2UA 3AYRA 3FNDA 3APGA 1ZBKA 3VIGA 2G3IA 1J0IA 2AOSA 2GSJA 1CBGA 5DF0A 2J7FA 1KCLA 4P7NA 1V03A 3CZ8A 2OSWA 2WHJA 1Q4NX 1TUXA 2V5DA 4C7GA 1OIMA 5A94A 4MNMA 2WCSA 4D6JA 1E6NA 3M7SA 1V0LA 1XGZA 1DTUA 1FOBA 5A1AA 5BXTA 4MNJA 1HL8A 4KWUA 1VAHA 2VT0A 2YDQA 1HL9A 5I24A 3SUVA 1W1YA 1LG2A 2BHZA 3QHNA 4A3YA 2OSXA 4J3UA 4QFUA 1I1WA 2CPUA 4LQ1A 1PEZA 1UH4A 3WD3A 2OSYA 1VFOA 3CMGA 3MO4A 3WBEA 3HMCA 1AQMA 1NWTA 1EQCA 3WBAA 4OJYA 1GVIA 3HU7A 2WC4A 5CQ1A 2UWFA 1KGUA 2Y24A 3EDFA 1H2JA 2J7GA 1HIZA 1CGYA 3ZSSA 3WD0A 4S3JA 1DEDA 3AOFA 1NARA 4FF5A 4WIWA 3ZT6A 1YHTA 3VGFA 4AC1X 4B16A 5M5DA 3AS3A 4MJ2A 4M24A 4HMDA 1GHSA 5GNZA 5FKYA 7TAAA 3WY1A 1K6AA 4WSKA 1G1YA 1MXDA 5BXPA 4J3VA 1JAKA 4CGTA 1C7TA 3O9NA 3KL3A 2Y8KA 1KXTA 1VJSA 4J3XA 4S3KA 5FCZA 3CH9A 2CHOA 2UY3A 1KXHA 5E70A 3OG2A 3ZJ7A 1UR8A 2WKLA 2WWCA 3TA9A 3W27A 1GW1A 1XCWA 3EDEA 3AMCA 1LWHA 2WBGA 4FLQA 4W89A 3WMCA 4DUVA 2CKRA 2BY2A 1VBUA 4D71A 1J0KA 1E15A 3BAYA 3VINA 3L4UA 1E6PA 1CYGA 2BVYA 3SCNA 4CU6A 3J7HA 2X8RA 2D0GA 4P7LA 3MS8A 2W5FA 2CBVA 2D3NA 4UFLA 3VMNA 3VDHA 1LL7A 3NUKA 5GQBA 3W26A 2CCRA 4K68A 2WVSA 3NYDA 1QW9A 3CUJA 2PWGA 1OT1A 4JHOA 3AIRA 4GO8A 1HNYA 1MW1A 2DEPA 1YQ2A 1HVXA 1X6LA 1OM0A 3F5LA 1UD8A 1JYWA 4FLSA 2WM0A 2WSPA 1JZ7A 4OZOA 5M3WA 2W4XA 4LYRA 1W1VA 2DIEA 3MUIA 3WDRA 1TFVA 4JZ5A 5A8MA 5C71A 4UQ9A 2E9BA 3FN9A 1E3ZA 4H8VA 4QCEA 1QI5A 3W6MA 2CEQA 3EMZA 5HNNA 1KFWA 1E6RA 4MB5A 1KR1A 2DT3A 1JZ4A 4XX6A 3PZTA 4W8BA 2VRQA 4AZ6A 3DHPA 2JE8A 2W66A 4EAMA 5A6LA 1OCQA 3ZO9A 4R27A 5JBFA 5CPQA 3ZJ6A 4TX8A 1ZJAA 4L4PA 5D4YA 3VIIA 1E6QM 1ZJBA 5GNXA 2ZXQA 2PI6A 4KGLA 1QPKA 2BXZA 1UQZA 2RGLA 1CXIA 4KRTA 4AXNA 4X0VA 1TVPA 2E40A 1UR2A 4WLCA 1BLIA 4GI8A 1B2YA 5CLTA 2WZIA 4OKDA 4D1JA 3F4VA 3L4ZA 2X05A 3AHYA 2YL8A 1X6NA 1DWAM 5CSYA 4JHZA 3W0KA 1JXJA 3T08A 4N0RA 1Q6GA 1B9ZA 3W82A 4H7VA 1J11A 4PTMA 3AZSA 1NP0A 3AS1A 3PZOA 2GFTA 1FP8A 4FLOA 3RO8A 1UWTA 1WO2A 1CECA 3K8MA 2DT1A 3FHAA 4CVWA 2VZTA 4GQRA 2WCAA 3A4AA 5JIPA 3CO4A 4D6CA 4KRUA 2XYLA 4D72A 2TAAA 2BNJA 4U31A 1JYVA 3DC0A 4MPKA 1WNOA 2J47A 3T0AA 2Y4SA 4AZCB 4AIEA 4UZUA 1O6IA 3A6OA 3RM9A 4EE9A 4BF7A 5AYBA 1JAEA 1QI4A 2IXUA 1BPLB 1WZAA 1TVNA 3AIVA 1E40A 4W7WA 2BVTA 3MKKA 3SEPA 4MAZA 1QI0A 3CHCA 4CD8A 1IZJA 2J78A 1TA3B 1W32A 3SIMA 4ACZA 3WH8A 4IM4A 3U57A 2QF8A 3WNNA 1W3JA 1JZ6A 3KEHA 1EQPA 1LJYA 2YKKA 3AIUA 1GZJA 1XV8A 2XVNA 2A3HA 3DECA 2A3AA 2XIIA 1E4IA 2PBGA 4P7OA 4P8XA 4PEEA 4QCFA 1PZ2A 1W3KA 1JFXA 4V28A 5HOSA 3CPUA 1CIUA 1JF6A 2OWXA 1ZBVA 2JFEX 1UKPA 1FH7A 1NWUA 1QNSA 4JFSA 2E9LA 2W62A 4HOZA 1M7XA 2BS9A 3WH9A 4BQ3A 1E71M 1ZL1A 4AZGA 1TCMA 1QHPA 3VIMA 4HU8A 1KXQA 1WDQA 1JNDA 3WDPP 4AZBA 3VIFA 2XIBA 4PMVA 3WELA 2WSKA 1UA3A 2DSUA 3RPMA 4HZ7A 3PZNA 2RGMA 3K4AA 1I1XA 3L4TA 3QR3A 1B90A 2V3DA 1HJUA 5AC4A 3O6AA 5BCAA 2VI0A 1CXKA 4DUXA 4AY1A 1TMQA 2WMFA 2J7DA 2OYKA 3ZM8A 2EPMX 3NCOA 3UCQA 2J7EA 5A8PA 3WUFA 1OINA 1BYAA 4F66A 1W2VA 2QV4A 5DT7A 1JG9A 3WQVA 5JUVA 1ZS2A 2YLLA 2VURA 2FH6A 3VOCA 4PMNA 3G6MA 2VQTA 1W9DM 1JZ2A 1JD9A 5KEZA 2JIWA 1WB0A 4E2OA 4HPHA 4WKFA 5CG0A 1LL4A 2EPLX 4MDOA 1EDGA 3WEMA 1V3LA 2X1IA 2PWEA 1LL6A 3UERA 4ZEPA 2VQUA 4B9YA 3WNPA 1GCYA 2EPNA 4HMEA 3ZR6A 4NZCA 1HKIA 1B3WA 5A8NA 3L2MA 4QAWA 2E4TA 3BAJA 5HXMA 3GH4A 1QNPA 1CGTA 3SCPA 1UG6A 1GNXA 3L4WA 1WKYA 1HJSA 5LA1A 4BZYA 3FW6A 1HP4A 1ODZA 1E6ZA 3HJEA 5AC5A 3OBAA 5DEZA 4Z2KA 5C70A 2DT0A 1GUVA 3FAXA 3MV11 1C93A 4QP0A 4ZFMA 3K8LA 5BWFA 4V2XA 5IFTA 1MFVA 2XSAA 2FHCA 1KGXA 4AZIA 5D9MA 4C7FA 2BY0A 2YLAA 2WK2A 4HOXA 1KXVA 3OGRA 2WXDM 4M82A 4W8LA 1UWUA 1UQYA 4F9JA 1DP0A 2EBNA 1ESWA 1ZU8A 1ZBWA 1E4MM 2C0HA 2XGBA 4W87A 4AIOA 4PSPA 3AZTA 3UG4A 1VRXA 3I3BA 1DHKA 3ARSA 4UTFA 4A4AA 4CUCA 4UQCA 3SCQA 4M56A 2GJPA 2WHMA 1AVAA 1Q6DA 2WBKA 3T2OA 3TONA 5A8QA 4LGXA 1OSEA 2EJ1A 2ZX5A 1DWIM 1CXLA 3QOMA 1VENA 1J12A 3WL1A 1KWGA 3CUHA 1WCGA 2W92A 3N11A 3PN8A 3WMSA 4IPNB 1BYCA 4PCTA 3ARQA 3WF3A 4JFVA 4UQDA 1CXEA 3GDBA 4OUEA 1J0YA 1V02E 4AEEA 3IJ8A 2WLZA 1TE1A 1B3XA 6TAAA 4UOQA 4Q7NA 4QLLA 3WD4A 5ABGA 1EOMA 1RH9A 3QGVA 3PZGA 5D8ZA 2DSZA 1JF5A 3W38A 2ZIDA 2BY3A 4IISA 4D6FA 4CCDA 4U3CA 5I0DA 5E9AA 4D6GA 2W91A 2Y5EA 5EFFA 3SUUA 2J25A 2CERA 1QOXA 2BV9A 4J3WA 4CCCA 1UWRA 1NWSA 2EPKX 4UFHA 4PMZA 1UH2A 3VO0A 3EDDA 3W6LA 2XVGA 2DSVA 5ABFA 2WZHA 1WAWA 4W7UA 1MWOA 2D0HA 3POHA 1GQIA 3GBEA 1E5JA 4J7RA 3OB8A 4PMRA 1MQRA 3LPPA 1HX0A 4ATWA 5BRPA 4D6EA 5I78A 1FA2A 2D23A 4W8AA 1H4PA 1EGZA 3RM4A 1XSKA 1VF8A 4UFKA 5EB8A 1H0GA 2YBTA 1PPIA 2XTKA 4PN2A 3ZT7A 2ZX9A 4GZIA 2WMIA 3JUGA 1OGBA 2EEXA 4OBRA 1BG9A 4B9ZA 2NSXA 3L2LA 1GJUA 2J62A 2D3LA 5HDRA 1RPKA 4UOZA 2VZSA 5A6BD 4B3LA 4PMXA 3KWXA 2O9RA 1ODUA 1M03A 1B0IA 3POCA 4HP5A 3OLDA 1O7AA 1V3JA 4W84A 1VEMA 3CMJA 5HBFA 1US2A 1JXKA 4JL1A 1XYFA 2ZE0A 2VRKA 4WSJA 3WUEA 1V3HA 4OOZA 4R5EA 3SCUA 3DYOA 2QMKA 4HZ6A 4F9DA 3F5KA 4CN6A 2FH8A 1J9YA 2QHAA 1CLXA 4AD3A 5IHRA 2C8NA 1AQHA 1L8NA 4OIFA 4ATLA 1E73M 4GZJA 5BRQA 5FOOA 1QHOA 3PBGA 2EO7A 1HKKA 1M53A 4JKKA 3VDAA 1UD6A 1JNEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VIK A;  4ZXO A;  2JF7 A;  5GNY A;  2O9O A;  3ARP A;  1ISV A;  3AMK A;  1JDD A;  2VJX A;  1ISZ A;  3TTS A;  1UD4 A;  2XSB A;  4M81 A;  4CD6 A;  1RD6 A;  5IXE A;  3PHA A;  2Z1K A;  1GON A;  2FDM A;  5EFD A;  2NW0 A;  1W1T A;  2D22 A;  1VEO A;  2YA0 A;  2HVM A;  3SCW A;  3K46 A;  4BA0 A;  2Q8X A;  3WEZ A;  2ZXD A;  2CBU A;  2WC7 A;  1OIF A;  4D6H A;  1W9X A;  3EDJ A;  2VUY A;  3F5J A;  1WZM A;  2ZWZ A;  3VU2 A;  3IJ7 A;  4AWE A;  3VD7 A;  5CJ5 A;  2WC3 A;  1KBK A;  4PRW A;  3WQ6 A;  3A47 A;  1E6S M;  2VX7 A;  3SUR A;  1D7F A;  3BC9 A;  5A6K A;  1CXF A;  1MW0 A;  2WMH A;  1FFR A;  1X1N A;  3K1D A;  3UET A;  3T0B A;  5EBA A;  2EXO A;  5CPT A;  3WF0 A;  2DSW A;  4ZEN A;  1H0I A;  5DFA A;  2O92 A;  3K4D A;  5M17 A;  3SUS A;  4P7Q A;  1U2Y A;  4TVD A;  3CZK A;  2VX4 A;  2YJQ A;  3RDK A;  1H41 A;  1H09 A;  2FHB A;  3LMY A;  1JIB A;  4W7V A;  4AD5 A;  4FMV A;  2WMK A;  1BYD A;  1SMD A;  1A3H A;  3OGS A;  2XFR A;  1SYT A;  2JEQ A;  4MB3 A;  2XHY A;  3BCD A;  3NSX A;  5FD0 A;  3NDZ A;  1JI1 A;  1UD3 A; 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 2QLY A;  1CGV A;  1JYN A;  1MYR A;  2V3F A;  1CDG A;  2VZO A;  2GJX A;  5E6Z A;  5GPR A;  5A6B A;  5IFP A;  4MNL A;  2FGL A;  5D9O A;  1SMA A;  1ITC A;  1AMY A;  1NWR A;  2JF6 A;  1BAG A;  5M03 A;  1EHA A;  3UG5 A;  4Z2L A;  1GQK A;  1GHR A;  3VM5 A;  1EHN A;  3W81 A;  2NT1 A;  4PTV A;  1S46 A;  4H2C A;  3HN3 A;  4URI A;  4MB4 A;  2YA1 A;  1UA7 A;  1PIG A;  2XPK A;  2ZUM A;  2ZWY A;  4LXF A;  1OBA A;  4CU7 A;  4JIE A;  1JD7 A;  4GZE A;  2PBO A;  2WNW A;  1JFH A;  3ALF A;  5BXS A;  4PTX A;  2ZOX A;  2AAA A;  1E56 A;  4WKA A;  2J7H A;  2ZXB A;  2J7C A;  5LA0 A;  4M8U A;  1V6X A;  1BTC A;  1ISY A;  1ECE A;  3QOK A;  3FHQ A;  3IAN A;  3BAI A;  1ISW A;  5ABH A;  2WLY A;  1G01 A;  1JI2 A;  1MW2 A;  3I3D A;  3MMD A;  3VX0 A;  3GNR A;  1E4N A;  2VOT A;  1TG7 A;  3WN6 A;  3DYM A;  3BXW A;  2WPG A;  1U30 A;  3SCR A;  3VD4 A;  2UY2 A;  3FXY A;  3SCO A;  3AQU A;  4AD0 A;  5DT5 A;  3ARV A;  4B3K A;  1EIB A;  3ZT5 A;  4Z2I A;  5KZ6 A;  2XWE A;  1GOI A;  2C7F A;  1PX8 A;  2J75 A;  3A4W A;  4NSB A;  4JAW A;  3BSG A;  1E43 A;  3L4X A;  3VD3 A;  1NOU A;  3CUI A;  1CEN A;  3CZE A;  1CEO A;  3GXM A;  1KWK A;  9CGT A;  3WF2 A;  1E0V A;  2GDV A;  1W3H A;  3DYP A;  1UKT A;  3AXI A;  4U33 A;  4F79 A;  3E1F 1;  1OB0 A;  3VPL A;  3AFB A;  5A69 A;  1UZ4 A;  2F61 A;  2Y2W A;  1BHG A;  2GVY A;  4HMC A;  2GDU A;  3WNO A;  4UFJ A;  4J3T A;  1LQ0 A;  1Q6E A;  3B8S A;  3SUT A;  3ZMR A;  2JIE A;  1GOO A;  1OGS A;  3BLK A;  4H41 A;  4XZW A;  1FFQ A;  1HJQ A;  1I75 A;  1BFN A;  2XM2 A;  3GBD A;  2EPO A;  1EO5 A;  4JL2 A;  3O2L A;  2O9T A;  2OLH A;  1R86 A;  4PCS A;  1KQY A;  1EA9 C;  1VJZ A;  3BGA A;  1W3L A;  5A3H A;  4PSR A;  1JZ3 A;  4KMQ A;  2V3G A;  3OZO A;  3II1 A;  1ITX A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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Chord Diagram

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