1OF8A

Double complex of the tyrosine sensitive dahp synthase from s. cerevisiae with co2+, pep and the e4p analogoue g3p
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
346
structure length
339
Chain Sequence
VRILGYDPLASPALLQVQIPATPTSLETAKRGRREAIDIITGKDDRVLVIVGPCSIHDLEAAQEYALRLKKLSDELKGDLSIIMRAYLEKPRTTVGWKGLINDPDVNNTFNINKGLQSARQLFVNLTNIGLPIGSEMLDTISPQYLADLVSFGAIGARTTESQLHRELASGLSFPVGFKNGTDGTLNVAVDACQAAAHSHHFMGVTKHGVAAITTTKGNEHCFVILRGGKKGTNYDAKSVAEAKAQLPAGSNGLMIDYSHGNSNKDFRNQPKVNDVVCEQIANGENAITGVMIESNINEGNQGILKYGVSITDACIGWETTEDVLRKLAAAVRQRREVN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title Substrate and Metal Complexes of 3-Deoxy-D-Arabino-Heptulosonate-7-Phosphate Synthase from Saccharomyces Cerevisiae Provide New Insights Into the Catalytic Mechanism
pubmed doi rcsb
molecule keywords PHOSPHO-2-DEHYDRO-3-DEOXYHEPTONATE ALDOLASE, TYROSINE-INHIBI
total genus 132
structure length 339
sequence length 346
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.54: 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase.
pdb deposition date 2003-04-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00793 DAHP_synth_1 DAHP synthetase I family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1of8A00
1TPB1 1XM3A 3G22A 4OWGA 1BKSA 3G0UA 3S9YA 3VNDA 2PRMA 4UFHA 2GPTA 2R8WA 3FKRA 3TMLA 5F2GA 4JYEA 1IXPA 1GVSA 5AHMA 3MO7A 1G4PA 1VGAA 1Q6LA 2E6DA 1LYXA 3M1ZA 1ALDA 2A1YA 3VCRA 2RH9A 3BG5A 4ZQCA 5CPLA 3TH6A 3W2KA 3W1NA 5DCEA 2FLIA 3TXVA 3Q2DA 1BWLA 4JYDA 5HNRA 1F73A 1TPH1 3G1DA 4Q33A 5E0KA 2E77A 1QPQA 3PS7A 4JTTA 1KW1A 2UV8G 4O10A 4BK9A 4JS3A 1ZAJA 3W1XA 4UUIA 2PC4A 4Q4KA 3QPYA 1XDMA 3SY5A 1W5NA 1QPNA 1SW7A 2QCDA 1JCXA 5AN7A 3W1MA 2CW6A 1QO2A 5L6UA 1KBIA 4LVDA 3QH2A 4UTIA 5CZSA 2V5LA 3MUXA 4Y96A 4DO5A 4K8HA 1RV8A 2VEMA 1FX6A 1H7WA 4O54A 5CSRA 2H8XA 1EWDA 2ABAA 2AAMA 3M41A 4TMBA 5D02A 1C8VA 1BTMA 1LORA 3M5XA 1YXDA 5D37A 4PCFA 4RR4A 4NT0A 3LXAA 3O8AA 2CLLA 3LHZA 5D32A 3HPXA 4DPQA 4PTNA 3EEGA 2QCNA 2BSLA 2FIQA 2ZRZA 4JTIA 4CQAA 2YCEA 3TE9A 3W7GA 3LTYA 1GOXA 3NM1A 2WSQA 4FNRA 1THFD 4MZ1A 2LLEA 4WX2A 3BVJA 3U2OA 1S5WA 2HSAA 3EWZA 4WOQA 1G6CA 3DFNA 3LTPA 2Y88A 1QO5A 3DHFA 4JNMA 3QF0A 4LC8A 1KM5A 2A5HA 1AL8A 3GNDA 1JRBA 3LI1A 3Q58A 1GVOA 3HOJA 5EY5A 1VCGA 2AGKA 1F6PA 2VFFA 3L0KA 4WZHA 3W9ZA 3W85A 3PY2A 4MYAA 4OBTA 4Y8FA 2A21A 5G4WA 3LM7A 4UNKA 4N6EA 4XTIA 5KMYA 1K7EA 2ZZ7A 1F6KA 2VXNA 4NJGA 2QDGA 1VJIA 1DL3A 3CTLA 3IVSA 3PC0A 3W7CA 2G96A 1O95A 2YX0A 2V8ZA 3S42A 3LXBA 2YFNA 1EUAA 1A53A 2QAPA 1QR7A 1QWGA 4EIVA 3BW3A 1H7OA 2EKCA 3FIGA 1XBZA 1OF6A 4LW7A 3LXCA 1YADA 4JTUA 2QJHA 2ZA2A 2DZPA 2QKFA 1KM1A 1W5QA 5BMXA 3GKFA 1KTCA 5I3KA 3LLFA 4XUGA 3H54A 1PCWA 1I2PA 5HWJA 5K9XA 1NF0A 2J9YA 3RFAA 4BR1A 4RZ6A 1FDZA 3MHUA 2YDAA 3AJXA 3O07A 2DZWA 3O16A 4HHPA 3INPA 3QFEA 3HGOA 4O1AA 1SUXA 3HO8A 4O8RA 5TBOA 5DCBA 3D0CA 3G1AA 3NQAA 3EKZA 5G2HA 3E49A 4N9EA 3W1UA 1VYSX 3GAYA 4LUJA 1DORA 4ALDA 3DH7A 3F4WA 4AWTA 3BG3A 4O11A 3QQ1A 4GWEA 2G97A 2V82A 3CPRA 1H7NA 1PE1A 3LHVA 3R89A 4Z1AA 1KLYA 1KM6A 3W86A 3IGXA 5LZLA 3IIXA 3W07A 3I68A 1I45A 5LNSA 3N2XA 3DKLA 1ZAIA 4A29A 2Z1BA 1WXJA 2KZHA 3AO0A 4O16A 3N34A 1FY6A 3JS3A 4UTWA 4UTHA 1QNVA 1SZNA 3PBYA 2QCGA 1D9EA 2EAWA 3GAKA 1KFEA 3GXTA 2E1DA 3M9YA 1F5ZA 3UWQA 5BOOA 3DGRA 5HR6A 4JTJA 1VH7A 1MO0A 1I2OA 3BV4A 3TDFA 3IEBA 1TPUA 1JCMP 4N4QA 1DVJA 5I3JA 1PCKA 2ZRUA 4DO4A 3IVTA 3B8DA 5G1TA 3HG3A 1KFCA 3BLFA 5LNVA 3QMSA 1TTJA 1JJKA 3LHWA 1EWEA 1MEWA 2VKZG 1G4EA 3ABQA 3QMRA 5CKSA 2GJLA 3KRUA 3MBFA 1L2UA 1VLIA 4O0ZA 3QM3A 3P61A 1A50A 1OYBA 3T44A 3KVMA 3DU0A 2Y63A 3IV3A 5FF3A 1IGSA 4R53A 4KWWA 5D30A 4FX6M 4O19A 4AMAA 3B0UX 3A21A 4YXGA 4UTKA 1ME8A 2E5CA 1S5VA 3FJ6A 5CPOA 1RQBA 1GTEA 5FF7A 2WJZA 2V5BA 4A3UA 1I4NA 1U5JA 1B4KA 5A8GA 1ML1A 2NXHA 3SZ8A 5AHFA 1X8FA 1AG1O 4UTTA 3I7SA 3IRDA 3PUOA 5E93A 3EB2A 4MZ8A 4IPJA 4LU0A 4HSOA 4HNVA 1N8FA 2Y7DA 1T99A 4U4MA 2ZZ1A 3E12A 1W8SA 4UMBA 1ICPA 2ZTJA 5FI8A 4JTKA 2NX9A 4RXGA 1VHNA 3P84A 3F03K 3NQ6A 2WQPA 2CZDA 1KM2A 4JTSA 5D05A 3SGZA 4JX4A 3GZ3A 1RZMA 5F2LA 5K4XA 4KWVA 4P2VA 5FF0A 1A5SA 1K7FA 3KFTA 1SFJA 4ZVJA 1K8ZA 3EXTA 2CLKA 4FNSA 4JXCA 2QCLA 4GBUA 5F2MA 1OABA 2VFIA 3UWYA 3VI2A 4EVZA 2Q3RA 1XFBA 2PRLA 3TCEA 1DOSA 1ZFJA 3G1SA 3TKFA 2GVGA 4YWIA 1TQXA 3ATYA 4DF0A 3WK1A 2V2HA 3ATZA 1SO6A 2V81A 3G1VA 5I3GA 2CWNA 3G1XA 4WXYA 4L4LA 2VEKA 2TMDA 2VFGA 3S6DA 4IUOA 3NQVA 1F05A 1YPIA 2QUTA 1GQNA 3B04A 1JCNA 2EPHA 1O4UA 3TFCA 1VLWA 2C14A 2FDSA 1LTDA 4O0KA 5GVJA 4O52A 5K9DA 4WY0B 4LC6A 3UZ5A 1JQVA 3S5OA 1LRNA 3NQ2A 4OV9A 3JR2A 4ZQNA 3HB9A 4X22A 1H50A 1H1YA 3ZWTA 1EEPA 1OK4A 3O06A 3CQ0A 1OFAA 7TIMA 2A6LA 4O28A 4EF8A 1ZJIA 3CWOX 2ZA1A 1TPVA 2FJKA 3NL2A 1NFBA 2DZSA 3P81A 3ZS4A 3WK0A 1F74A 2WPBA 1OJXA 2F84A 1R47A 1NAL1 4O1DA 2VFEA 3W7OA 1QOPA 4JD4A 4M6PA 3STEA 5CSSA 3FFSA 3UWVA 2X1RA 1RPXA 2ZRWA 3LHTA 3G3MA 4MUZA 5EMUA 1NF7A 1TV5A 1HO4A 4OU1A 3O6YX 1W5PA 4LVAA 3QZEA 4UR7A 3W2LA 1GPWA 4DBEA 4BFAA 3SFKA 2ISVA 3NZRA 2C15A 1ICQA 1JR1A 4NX0A 2JK2A 3CT7A 1J5TA 3EXSA 3L65A 2RKXA 3N2MA 3CU2A 4IOTA 2QJGA 2X30A 4M5PA 5DELA 1IF2A 2NZLA 2J9XA 2JBMA 1XBYA 1TV7A 3LX9A 3O63A 1GVQA 4POCA 6TIMA 3W70A 1G69A 5I3HA 3I7QA 3NL3A 4JTLA 4ADUA 3NDOA 3P62A 2BX7A 5DXYA 2CLHA 3P7YA 3TNOA 5HULA 4N2YA 4E2DA 2P1FA 3A22A 4IPIA 5D04C 5F1UA 4IX0A 4R7JA 1GG0A 4Z1DA 4UFLA 3NZ1A 4A2SA 4AHQA 3QW4B 3L67A 4XZ9A 1XC4A 3W7RA 3E9AA 2C1HA 4Z0SA 3B03A 5I3IA 5J5DA 3LCIA 4UFKA 1R2SA 3BGGA 4AAJA 1TQJA 1YLVA 3TSMA 5LGXA 5T26A 2TPSA 2YZRA 2FPYA 2WNZA 5ABTA 2PURA 2P0OA 4HN4A 2RHGA 4O17A 2CZFA 1SZGA 1OFBA 3S1UA 5D2YA 4JIQA 4NVTA 1LOQA 2DJXA 4Z0JA 4M7SA 1TTQA 1Z41A 4S1FA 4YMZA 2CLOA 1GG1A 2GVJA 2ZRYA 3V75A 4RXFA 3HGSA 3CEPA 5KTLA 3O6CA 3L5LA 3H53A 1TRIA 2ISWA 3B4UA 3R5EA 3NPUA 3PBVA 1OFPA 4C1KA 1JCJA 2J88A 2CLEA 4OHQA 4M6VA 1P1XA 2OMAA 1I2RA 3UQNA 1GTHA 2W6RA 2V2DA 4AB4A 3FKKA 5BMWA 1ZAHA 4OE7A 4WQ6A 1QAPA 2XN2A 1ONRA 3TR2A 1JUEA 1IXOA 3W84A 3RLUA 2ZRVA 3PWAA 2NUWA 3GVGA 1G4SA 4MIMA 2QCFA 4MKNA 3L0GA 3UXAA 3C2VA 4NXKA 2WSYA 2OCZA 2WNNA 2X1UA 1EB3A 1FBAA 1LRQA 2E6FA 1A5BA 4N6FA 3TC7A 4NX5A 3G1FA 1OYCA 3B0VC 1DQXA 3BARA 4NZJA 4K39A 4NNCA 1Q6RA 4HT3A 3W7LA 3GDTA 2DZVA 4LWWA 4X2RA 3L0NA 3PVFA 1WAUA 1TIMA 2WV8A 1X1OA 1DKWA 1MSSA 1XBXA 4K7VA 5LNWA 4I7UA 1WX0A 4HKPA 2QEZA 2QCEA 1Z42A 4O15A 4GNJA 2YGYA 3EXRA 4LOCA 1AW2A 3W1LA 4WY0A 3QJAA 4NJKA 1H7RA 2ISSA 4O13A 1SR9A 4M7TA 4UIOA 2DU2A 4UFJA 5DCDA 3W7PA 2NLIA 4MLRA 3N3MA 4N9CA 1WOBA 1WOAA 1TPC1 2ZZ6A 4DF1A 1YDVA 2YR1A 2VEPA 3HG2A 1NSJA 3FEMA 3IIPA 1SO3A 1GEQA 3W75A 3EWXA 1L6SA 4UR8A 1QPRA 3U8GA 1HUVA 1B4EA 3HGJA 3BW4A 3P82A 4CCEA 2OX1A 2ZZ3A 2NX1A 3L66A 3PM6A 4DF2A 4FEZA 4QNEA 2R91A 1SO5A 2NV1A 3C2FA 4UTMA 5I3FA 1RD5A 2NV2A 2E5DA 3TX9A 4UFMA 4O12A 4S2BA 4LVGA 3IGUA 1SQ7A 3C3NA 4X9SA 3W7QA 2Z0IA 5D2TA 2CLIA 1UUMA 2H6RA 4IXXA 1DBTA 1FWTA 3NNTA 1TTIA 4K8EA 1Z44A 1KLZA 3RNDA 3NGJA 2OT0A 3NAVA 2FB2A 2A7NA 2ZRXA 4ORMA 5EBUA 2V9DA 1WA3A 3OVRA 4WY0F 1SU5A 2I9EA 3M5YA 2E6AA 3PBWA 1G7VA 4AWUA 4DXVA 4PL1A 1WBJA 5G2IA 3DAQA 3DKJA 1MZHA 3NQEA 3UWWA 2O7SA 5FESA 3ZR4A 3UY7A 4NJIA 1OX4B 3QQ0A 1O94A 2WNQA 4K7YA 3UZJA 1MEIA 3W73A 5CZJA 3UPBA 4LUIA 3BG9A 5BRBA 5BNKA 4M19A 4IWWA 2B7PA 1RQEA 1H1ZA 4FIQA 5D2XA 2RDTA 3SR7A 1VCFA 2D73A 1PVNA 2NX3A 2NUYA 2X16A 3VKJA 1M6JA 1UJPA 4JN6A 4IMFA 2C6QA 5D2VA 3RF9A 2EHHA 4WOZA 1A5CA 1JULA 1CI1A 1C29A 1ME7A 1SSGA 4FNTA 4CNPA 4CNOA 3STFA 5BW6A 4MZYA 3C61A 4PL2A 1IIGA 2BWGA 5CGQA 3TSBA 1R2TA 5DN1A 2C19A 4GRSA 4TU1A 3M47A 2GVLA 1VYRA 4JX5A 2Z2UA 2C3ZA 2C18A 4J9JA 3A5FA 5G2WA 3TC6A 1VQTA 3KRZA 2CZEA 3HF3A 4JR5A 3DI0A 3T7VA 3TQ0A 1QCWA 1N7KA 3LOTA 3KX6A 5FEPA 3C2EA 3NQMA 3EX1A 1H7PA 3QSTA 5HQEA 1IXNA 3EX4A 4UC5A 1YTKA 3LRMA 3HG4A 4ADTA 4MVAA 4FHAA 3L2IA 1SSDA 4DEFA 1OVDA 1RQHA 1EP2A 2ZBTA 1W3NA 3F4NA 3SGUA 4IJBA 2QUVA 1C9DA 2ATMA 1OYAA 4HNTA 1IXQA 5K4ZA 4GUGA 1AW1A 5HWMA 3STGA 1ZNNA 3C2RA 3LHUA 1VZWA 2E6YA 4WJEA 3NQDA 1WV2A 1VPXA 3BPWA 4MY8A 5AC8A 4I7WA 2B4GA 4R33A 3MBDA 2ALDA 5AOUA 3USBA 1H60A 3W83A 1OFRA 3HIJA 3DENA 3R2GA 4HPXA 1J2WA 4GJ1A 2TSYA 4RLIA 3S1VA 3W76A 4DQWA 3W2NA 1T0OA 2QR6A 3O05A 5H2ZA 5LNRA 3TUUA 4XKYB 3CWNA 3G18A 3STCA 5AC6A 3TQKA 2YW4A 1KFBA 5D03A 3T4CA 1M7OA 1W3TA 4FNQA 1OFEA 5CPMA 1ME9A 3DFQA 3NM3A 3CC1A 1SPQA 1LRTA 1UCWA 2QJIA 4ICNA 1FCBA 4XBSA 3N9SA 4RZ4A 3NL6A 3DFOA 4IQLA 1XUUA 5D38A 1D3GA 1W5MA 3M0ZA 4GUJA 4YL2A 3W23A 2H3DA 1DHPA 1S3HA 1EPXA 4FNPA 1LBLA 3WJSA 4MFDA 4DBDA 1OF8A 2ZDRA 3F1QA 1JRCA 3CIWA 3CB8A 4ZQOA 3CIXA 1EX5A 1Z48A 1BWKA 4QITA 3MYOA 3KVKA 4LY8A 2CFFA 4LV9A 3SSJA 4H3DA 1L6YA 5FF4A 1MXSA 3CLMA 3G0XA 1WYIA 4MY9A 2Y7FA 2YYUA 4AVFA 3ZFHA 3T55A 4TIMA 4CNNA 1UBSA 4IMEA 4RZ5A 3MP4A 4LS1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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