3W2MA

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with mii-3-183
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
313
structure length
313
Chain Sequence
MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-3-183.
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus 106
structure length 313
sequence length 313
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2012-11-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w2mA02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w2mA01
1TTJA 4LS0A 3C8FA 4MLRA 3HG3A 3PC0A 2DJLA 2I1OA 4IMCA 5C6MA 3C2OA 1AL8A 1KFLA 2C6QA 2YZRA 3PBUA 1F05A 1PHQA 1KFJA 3RLUA 4UFMA 4GXMA 1NAL1 2QJIA 4IXHA 3W1MA 3E9AA 3LB0A 3HB9A 1XKYA 1W3IA 4LVFA 2RFGA 1SU5A 4GJ1A 2Y89A 2NUYA 5LNSA 1J5TA 3BLEA 3UWWA 1UBSA 3N73A 3ZWTA 1YPFA 3TAOA 3B03A 5AYYA 4S2CA 4C1KA 1DKWA 3USBA 3W6YA 1EB3A 2NX1A 1XC4A 3MYPA 4YWIA 1QOQA 1YDNA 1OYCA 2X1TA 3N9RA 3HG4A 1VPXA 3LTSA 4ONVA 4Y8FA 3DFOA 1RQBA 1K8YA 3NQ7A 5E1QA 1VLIA 2NV1A 3SFKA 3M7WA 2PRHA 5DY2A 5LGZA 5F4SA 3CC1A 3M44A 1N8FA 1VC4A 5C55A 2YR1A 4O18A 3LI0A 3PB2A 3WJYA 1B4KA 1EPXA 3IV3A 4UFJA 1PS9A 1VYRA 3L0NA 4ZQCA 4KFNA 1KM4A 4UTHA 3GDLA 3NPXA 3DFNA 1MEHA 1H7RA 4KWVA 4M7TA 4UTTC 3NO5A 4HSOA 3KVMA 3GDRA 3EB2A 2QCCA 4RZ4A 1QNVA 1OX4B 2JKEA 3QC3A 4ZQNA 2J24A 2QCHA 4WJEA 4X9SA 3SECA 2GPTA 3G1AA 3ZWSA 4LW7A 5EL1A 3PULA 3W70A 3LI1A 3QYQA 4MJZA 3ABRA 4ZMGA 2HMCA 1QPNA 1T99A 3GKAA 4I7VA 4NX5A 3L67A 2PRLA 1I2NA 4GUJA 5IBXA 4K37A 4AB4A 5EKYA 3S0CA 4CNNA 4CNOA 3HPZA 1DQWA 4IPJA 3MP4A 3LTPA 1XXXA 1OYBA 4LT9A 3BO9A 3FJ6A 4NU7A 1ICPA 3TIMA 3ZR4A 2C0AA 3GR8A 4NNBA 2J27A 1G4SA 2YCEA 3IIVA 1R46A 4WX2A 6ALDA 1I2QA 1YDOA 1C29A 3UQNA 5LHEA 1JRBA 3OA3A 4GUGA 4QAIA 4S2BA 3RLVA 4UTMA 4JX5A 3IEBA 3LX9A 5LKYA 3D0CA 1TPEA 2BZNA 4WXYA 1N7KA 3BW4A 5DXYA 1H7NA 1FY6A 1KFBA 1LM1A 4ORIA 2EHHA 3EWWA 4JYFA 3DGRA 1DQXA 3ABOA 1H62A 2GUUA 1TPUA 4QNEA 3W76A 3F4NA 3PUEA 6TIMA 2H90A 4RX0A 4CNPA 2O7SA 3C56A 3M5XA 1H50A 3M47A 1D3HA 2YDAA 2OT0A 4WD0A 5U4NA 1W1ZA 2ZRYA 7TIMA 3NM3A 5I3HA 3KRUA 1IXNA 1KV5A 4E2BA 4N9CA 3PG8A 2BX7A 3KX6A 5D30A 3EX3A 4AWTA 5DCEA 3W1LA 5KZMA 3BLIA 5J5DA 5HR7A 5K3VA 1KM3A 1YADA 3IGSA 3EX4A 1G67A 1XCFA 2ZZ2A 1F5ZA 4JTKA 3G3MA 3O8AA 3NQEA 1FWWA 3THAA 2Z0IA 4FNRA 4PH6A 3LCXA 2A21A 4IMGA 5G1YA 1P0KA 2YGYA 3MBFA 2DORA 3STGA 3OEXA 4QITA 4MFEA 1TTQA 4OWGA 1OK4A 2WSRA 4UTWC 4M19A 1UUOA 3MHUA 1ZHAA 4JICA 4O1BA 3IGUA 2AQWA 2NX3A 4POCA 4R53A 3SZ8A 1QR7A 2H6RA 1KA9F 3HQ1A 1HO4A 2YYUA 3QMSA 2J9XA 4IMEA 1OX5A 4EVZA 3LHWA 1XBZA 2WNQA 3W2MA 2NWSA 2CLOA 3W84A 3W85A 2P10A 1OFBA 3M0ZA 3Q2DA 3R13A 2KZHA 1OFOA 4PL1A 4O52A 3U8GA 4LVDA 3TSMA 2NXIA 3UWYA 1Z44A 5AHEA 3PG9A 4Z08A 3Q94A 1LBLA 1OFDA 4UNLA 2B7QA 5I3IA 1JULA 3VNDA 2XN2A 3KRZA 4LUIA 4N2YA 4XQ6A 3DFPA 1TPFA 2GJLA 1OABA 4I7WA 3GDKA 3BV4A 4JTFA 1SZEA 5CPNA 1Y0EA 1SZGA 3W88A 1GWJA 3QH2A 4QSHA 2ISVA 3BW2A 1OVDA 1HL2A 3UWUA 5H91A 5EBUA 3HGSA 3TNOA 4K36A 2ZBTA 1ME8A 3GAKA 3W83A 1SPQA 3UWQA 4QM1A 3VKJA 5K7JA 2NV2A 3OIXA 3TMQA 4E0CA 1HG3A 3BG9A 3T7VA 2PC4A 1MEWA 1OG0A 3QF0A 1TO3A 4O8RA 1JCJA 1O95A 3Q37A 2Q3OA 4CQ8A 3E02A 1KM0A 4UFIA 1FCVA 4MY8A 2VEPA 2R8WA 4UMBA 4KFOA 3LXBA 2RKXA 5CSSA 3LV5A 4WOQA 1D9EA 3L5MA 1U5JA 3FEMA 1KM2A 4JYEA 2GVJA 2YW3A 4ZVJA 5DBTA 1BEUA 5AC7A 2GVGA 2H3BA 4JTSA 2OMAA 3IGXA 3G18A 5HNRA 1YXDA 3GB6A 3DFQA 4NNCA 2ZZ5A 4UUIA 3LLFA 5LNUA 4O15A 5BNKA 3NA8A 2DP3A 4HNUA 1DVJA 4LY8A 4PTNA 4RJEA 1GT8A 4IJBA 3L0GA 5KZEA 3B8DA 3G3DA 2Y61A 4P61A 1R2TA 3G0UA 4JTTA 2QDHA 1JQVA 3T55A 1AW2A 4K6AA 1VR6A 3TA6A 1TPVA 2GQ8A 3DBPA 2NZLA 5FEPA 1TREA 1GOXA 1RPXA 3TW6A 1O4UA 3TUUA 3IIZA 1KM6A 3YPIA 5FF2A 4LNYA 3BARA 4B5NA 1LORA 4JDBA 1W31A 1QO2A 3S1VA 1DOSA 3PWAA 2QJGA 1ME7A 3P81A 3IRDA 4A3UA 4BI6A 1KM5A 2G97A 4LC8A 2ZA3A 4WXZA 5KSWA 2BXVA 3W75A 3W2NA 3L21A 3PBYA 4FNUA 1Q6QA 2ALDA 5I3GA 3MI3A 2A4AA 4M6VA 4N6FA 3WJSA 2TMDA 3BVJA 3GXTA 4A2RA 1YTKA 4DELA 4DPQA 3QW3A 3NQ6A 4EWND 4NJHA 4X3ZA 1DHPA 2RDWA 1RZMA 2QUTA 3P62A 1K02A 1FDJA 2H3DA 2Q3RA 3UWVA 3MWAA 4A29A 3MMTA 4MZYA 1VZWA 1I2PA 3NQMA 4H4IA 2QAPA 1LOSA 4OV4A 3P82A 2E6AA 3EKLA 4MYAA 2HTMA 3L0KA 1S5WA 4O54A 5LNVA 3W2JA 1W56A 5CKSA 2A7RA 1Z42A 2ATSA 4DBEA 3NVTA 3MP5A 1WX0A 2JKAA 1R30A 2ZFAA 4K7VA 3RK8A 2YX0A 3ZS4A 1TPH1 4HPJA 1TV8A 1LBMA 2R14A 3C6CA 3KFTA 2QF7A 5HWJA 3R2GA 5AC6A 2Y6ZA 1SFJA 4MY9A 3SIZA 4AF0A 4NZFA 3LRLA 4Q33A 3DHFA 1IF2A 1RV8A 1OFRA 2Q8ZA 1RD5A 2CWNA 4L4MA 5DY3A 4LTSA 4Z0JA 1BTMA 1NSJA 2QCGA 2WNNA 3WK2A 3TAKA 1NFBA 4X2RA 2RH9A 4M6PA 4WY0B 4ZL1A 4JY8A 4K8EA 1SW0A 1Q6RA 2QCDB 4WY0F 1W5NA 3LOTA 1D3GA 1Z48A 5CSRA 2I14A 2FLIA 3W1RA 1LP6A 4K38A 1KFEA 1YXYA 4TIMA 1GYNA 3O16A 3HG2A 3O6DA 4AMAA 3L9CA 3LXAA 3SGZA 1G4TA 3M43A 3QMTA 1Q3NA 3LHYA 1GVOA 4XTDA 5BW6A 3GYEA 4N9DA 1SSDA 1TPB1 5DCBA 5DXXA 3STEA 2JKPA 3NL2A 1ZAJA 1TIMA 4PODA 5G4WA 4E2DA 3E96A 4ZQPA 4UMAA 3MJYA 4QJ1A 4RZ5A 2VOMA 2NXGA 3O15A 3DFTA 4RXFA 3MHFA 4JXCA 1VS1A 1W5QA 2CLMA 3W1AA 3NQAA 4GWEA 4O28A 1EP2A 3WK3A 1UCWA 1XL9A 1F76A 3T4CA 2O7QA 4JTHA 2BWGA 4FNPA 3R5EA 2VELA 1GPWA 3TXVA 3I65A 3LXCA 3RFAA 1JJKA 1SZNA 2D73A 2ZDRA 4DO4A 2QCNA 4IGHA 5CZSA 1XUZA 2V2DA 5CGQA 3SGUA 3HO8A 3M5VA 1RQHA 4KFPA 2E6YA 3OHIA 3P8JA 1L6YA 4FO4A 5LGXA 2CZ5A 2ZTKA 4M7SA 2A6LA 3C2EA 1AL7A 3N2MA 3E12A 3PUOA 4OV9A 2A85A 3I6RA 5K2ZA 2QJHA 3LCWA 4NJGA 4LWWA 3LHUA 4L4LA 3EX6A 3M9YA 3TFCA 3LTYA 3PAJA 5HJLA 3HG5A 1FWTA 3G22A 3C2RA 2WJZA 3DI0A 3R89A 3W1NA 2GJNA 4NX0A 3TV8A 1JUBA 3NL6A 3FKKA 5HULA 4DPPA 2G95A 3W86A 2QR6A 3NQDA 3F4WA 5FEXA 2Y7DA 3TH6A 4LVAA 5FESA 3W73A 3TSBA 3THQA 1M7PA 1ZENA 1R2SA 1HFBA 3N3MA 3L66A 2FFCA 4OQVA 2J6XA 2FPYA 3MYOA 3W2KA 5J5RA 3P74A 1AK5A 1R2RA 4ZQRA 3QFEA 1SW7A 4FNQA 5D2YA 4O12A 3RF9A 1TJRA 3BPWA 3PB0A 3HBLA 1HTIA 1XDLA 4UR7A 4X22A 2FJKA 3ELFA 4A21A 4IQLA 1P5BA 5HINA 4MPQA 3DENA 1QCWA 1IXQA 3KHJA 5F4XA 5D33A 4AAJA 3W1PA 4JR5A 2WNZA 3NGJA 1MO0A 4AHPA 4D2JA 3W9ZA 1F6KA 1IXOA 2UV8G 1GVQA 3NG3A 5G4EA 3W2LA 5A5WA 4BWLC 1P4CA 3EWZA 3NDOA 2E77A 1THFD 2EF9A 3N2XA 3TC6A 1AG1O 3B06A 3C0JA 3MBDA 2OJPA 4BK9A 2A2IA 2JGQA 3N9SA 3V75A 1FUYA 3SR7A 5D04C 5MHBA 3NZRA 1FXPA 2QCFA 4HNNA 3TKFA 3SSJA 4R33A 3KXQA 4Z1BA 1WBHA 4DO5A 1P0NA 2WQPA 4QIUA 5D2VA 4IOTA 3S5ZA 2OX1A 1XBYA 1XM3A 3IVSA 4IMDA 3LERA 1H7OA 3GNNA 3LDVA 1QFEA 3W87A 3L68A 1OX6A 3W1XA 3RMJA 4RZ6A 1KLYA 2NUWA 3M5ZA 2EGZA 3LCLA 3QZEA 2WV8A 3GIYA 1KTNA 5A8GA 4CCCA 3V1PA 3OVPA 4DQWA 1ICSA 4O53A 3UY7A 4UR8A 4UCGA 3S6DA 3U2OA 2F7FA 1ZAHA 3LM7A 2FDSA 1A5BA 1GQNA 1GVRA 3EWBX 5DCDA 1JUEA 1YDVA 1KTBA 5F1VA 4Y90A 2BLEA 3KVLA 3HJZA 1LYXA 1S3HA 1YPIA 4ALDA 3B4UA 4GRSA 2GQAA 3GDTA 4PCFA 1H60A 2Z1BA 1JRCA 2ZTJA 1H7WA 4C1LA 1WOBA 4RXGA 3OVQA 3A5VA 1TPC1 1OJXA 2TYSA 1FDYA 5AB3A 3NPVA 3TROA 2JK2A 5I3FA 3TC7A 1FCBA 2Y62A 4A22A 1X7FA 1SUXA 3TFXA 1X8FA 2ZZ3A 3NQFA 3FYPA 3P5ZA 2BTMA 3TSDA 2QUUA 1I8JA 4PL2A 4O1DA 3R8RA 2C16A 4ORMA 4RKAA 4FB7A 3G24A 1F73A 4TX9A 3DXIA 3F1QA 3NL5A 4MKNA 2YPIA 2FTPA 1MZHA 1HO1A 2C14A 2QCMA 1FCQA 2CLHA 1X6UA 2HSAA 5D2TA 2FIQA 1WOAA 3S8HA 1MXSA 3W23A 1K7XA 2QCEA 3EKZA 3KVKA 4JTIA 1H7PA 1SO4A 3BK0A 2V5LA 1TB3A 1S5TA 3K30A 1K7FA 1ME9A 4M5PA 4LVBA 3WFAA 3S5YA 2ZRZA 5BRBA 2NX9A 4XKYA 3C2VA 4FX7A 4YMZA 1EA0A 5EMUA 1VHCA 1JCYA 2C3ZA 3T78A 1DBTA 1EEPA 2A6NA 1QO5A 3NXFA 1SZFA 1B57A 3BG5A 4JNMA 3TR2A 4RLIA 4NZJA 1SO5A 1XBXA 3TQKA 1J2WA 4O50A 4KKXA 1NF7A 4O11A 4S1FA 2QKFA 5EPDA 3UZJA 2FQIA 1OYAA 1PL9A 3U6WA 4DBDA 4RK8A 4UXDA 5I3JA 3NAVA 4WQ6A 1VLWA 4N4PA 1ZFJA 3WK0A 3G1FA 3ATZA 4FF7A 2V0TA 3GNDA 1YTDA 3BGGA 3W7KA 3W7NA 1T0OA 2Y70A 1BWKA 3CEUA 4JX6A 2E5CA 1XDMA 3QSRA 1B4EA 2V9DA 1TMHA 4Z0SA 2X1UA 3GXNA 1OK6A 1KBJA 4O4VA 2LLEA 1O94A 1IGSA 2NXHA 2OZ0A 4MYXA 4O14A 2Q8LA 2E1DA 2RDUA 4NUWA 1JUKA 1G4PA 3GZ3A 2C15A 3N14A 1JCNA 1LRNA 4HPXA 4LOCA 5IBXC 4AHQA 2W0UA 1SO3A 1G4EA 3GR7A 5HWMA 3NEVA 5G2IA 3GKFA 2V81A 4WZHA 1ALDA 3HIJA 4MJMA 1IXPA 4TMBA 3QJAA 3R12A 4MOZA 3QSTA 5CPLA 4AWUA 1AMKA 5F2IA 1G6CA 1M7OA 4XBSA 5T26A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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