3WFLA

Crtstal structure of glycoside hydrolase family 5 beta-mannanase from talaromyces trachyspermus
Total Genus 131
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
131
sequence length
341
structure length
341
Chain Sequence
TFPGTNGLDFTIDGTAGYFAGSNAYWLAFLTNNDDVDKVLGDAESSGLRIMRVWGFNDVNTVPSSGTVYFQLLQDGTATINTGSDGLERLDYVVSSAEQHNVKLIINFVNNWSDYGGIPAYVNAFGGSTTSWYTDEASQAAYRNYIKTVVSRYIDSPAVFAWELANEPRCHGCDTSVIYNWVAATSSFIKSIDSQHLVCIGDEGLGLDIDSDGSYPYSYYEGTNFTLNLGVDTIDFGTFHLYPSSWGVSNSFGSPWVTAHGAACAAAGKPCLFEEYGVTSDKCSVEGGWQQTALDTRGIGADSFWQFGDTLSTGQSPNDGYTIYYGTDDYTCLVTDRVASI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Purification, cloning, functional expression, structure, and characterization of a thermostable beta-mannanase from Talaromyces trachyspermus and its efficiency in production of mannooligosaccharides from coffee wastes
rcsb
molecule keywords beta-mannanase
total genus 131
structure length 341
sequence length 341
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 2013-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 3wflA00
3AMCA 4W87A 3AXIA 4U2YA 3WH6A 1B2YA 3CO4A 1D2KA 2WVVB 4R27A 1W2PA 5E0CA 5HBFA 3QR3A 4AZHA 1C3FA 1E55A 5A2BA 5C70A 1GONA 2BV9A 1G5AA 1K6AA 4FLRA 3DHPA 3W6LA 3S2CA 2EO7A 5I79A 4YHEA 2RGLA 3KWXA 4UFLA 1X6LA 4GZIA 1O7AA 4AC1X 1UR8A 1V6XA 3NSXA 3VX1A 3T0BA 3B9AA 1KWKA 4UFHA 4X0VA 3RO8A 1C90A 1ECEA 3SCUA 4HMEA 1BG9A 1FHDA 3PHAA 2VT0A 4HZ6A 5I78A 4BQ3A 2WVSA 3QHOA 2ESCA 3VIKA 3SURA 1QHZA 5JBDA 4LX4A 2VURA 3MUZ1 4M82A 3AMLA 3U7VA 5FD0A 1H4PA 3NDZA 2ZICA 4J3VA 4K68A 3VMNA 3RPMA 4J3SA 5D9MA 2ZXDA 4W7UA 1E0XA 1OGSA 1GOIA 5I6SA 4ZXOA 3ZQ9A 1GUVA 2ZXAA 3NJ3A 3WNPA 1W9UA 4P8XA 3L4WA 1B3VA 4ZE5A 1YQ2A 5JBEA 1AQ0A 2VQTA 2VCCA 3VIJA 3WEZA 1DWIM 3WF4A 2DSVA 2UY3A 1ZS2A 4TXEA 4Z2LA 4HA4A 5LA1A 2W67A 1CDGA 1KGUA 1G01A 5CGTA 4AEEA 1E3XA 1JL8A 3FY1A 1C7SA 4XB3A 1KFWA 3ARTA 4GQRA 2GSJA 2ZX9A 2J25A 3VILA 5IHSA 1UOKA 2J47A 2YL8A 4KH2A 3WENA 3OLGA 1W9VA 1V0MA 4W85A 1OT1A 2XJ7A 2BHUA 1TCMA 1NWUA 1E4IA 5GNZA 4HA3A 3VGGA 1D3CA 1WZLA 1BTCA 3VD5A 3T2PA 3AIQA 3DHUA 2QMJA 4D71A 3AIUA 3PN8A 3W81A 5ABFB 1GJUA 1PZ2A 2V3FA 4UFJA 2J7BA 5M03A 1BGAA 1NP2A 3GTNA 2VUYA 4J3TA 2E3ZA 1Q6CA 1J0ZA 4PUEA 2BY3A 1NWSA 5I23A 4TVCA 1W9XA 2PWGA 4L4PA 2YA1A 3WH9A 1OINA 3ALGA 5HPCA 2OWWA 1QOXA 3BXWA 2WMHA 5ABEA 4QP0A 2W62A 3ARZA 1QNPA 5CG0A 4LYRA 1C8YA 2VI0A 4M1RA 4MTVA 1CXHA 1LG1A 3AHZA 2WAGA 2J7HA 4TX8A 1HVXA 4PMVA 3M46A 5BRQA 5HOSA 3RJYA 1H09A 2PWEA 5KZ6A 2GVYA 3PTQA 2WLZA 4JHOA 4ATLA 4E2OA 1LLOA 3PZMA 3GXFA 1J12A 1SYTA 3PZNA 1HX0A 2WBGA 4MB4A 5IDIA 2F8QA 1W3LA 2OYKA 3AI0A 3UG3A 2FGZA 4GZEA 4ZENA 3MO4A 4PTXA 2VCBA 1PZ3A 4F66A 3MMDA 5A6SA 3VNZA 2WVUA 1EDTA 2UY4A 5D8ZA 4XUYA 4EKJA 3S6TA 3BAXA 3WQWA 1CGVA 3AMKA 5CPTA 3WDPP 1ISXA 3WUEA 4ZEPA 3T2QA 2VC9A 3GXDA 2YDQA 5IXEA 3B8SA 1RD6A 1V3JA 3AIWA 3GNPA 3TTSA 1Q6GA 1E56A 4IM4A 1WDPA 3ZT7A 1VIWA 1UKSA 2WHJA 4JHZA 3POHA 2OYMA 3LPFA 4LXFA 1M03A 4AD0A 4OUEA 2VX7A 4GI8A 4OZOA 2XG9A 4J7RA 1E1FA 4KMQA 4P7LA 3U5YA 1ITCA 2WLYA 1JD9A 2CXGA 3BMVA 4AXNA 3AHXA 1WCGA 2YDRA 3M07A 4CD6A 5DFAA 2WANA 1JYNA 3WH8A 1J0HA 4D72A 5CPSA 1OWQA 2Z1SA 4WKFA 1OM0A 2BXZA 3WNNA 2FHCA 4MJ2A 2GDVA 2DT2A 2BY0A 2BY1A 4D6DA 3AIBA 5A8NA 2OSWA 3L4VA 1D7FA 1VBRA 2OLHA 3ALFA 3WFLA 3TA9A 4Z2HA 1JNDA 3MV11 3ARXA 2WMIB 4CU7A 5I2UA 3L4TA 3CLWA 1UHVA 3WN6A 3APGA 5A95A 2W4XA 4MDPA 4WJXA 3O9NA 2CKSA 3BLPX 2CETA 4WKAA 3N15A 5F7UA 2FHFA 3AZRA 5ABHA 5CZKA 1BQCA 3M7SA 3W82A 1PX4A 4D1IA 1KCKA 5A8OA 3EMZA 2XVPA 2EPOA 2GUYA 1SR0A 2CBJA 3VIFA 3WF3A 4M56A 1GJWA 4CU6A 1BHGA 3AROA 3WELA 3T0AA 3KL0A 1GNXA 2RGMA 3BMWA 4AZCB 3WKZA 3BSGA 4Q22A 8A3HA 1AMYA 5I24A 1XC6A 3O6AA 4S3JA 2QPUA 1VEMA 2VCAA 3WY1A 2GJRA 2DSKA 2WHKA 3WH7A 3BC9A 1A3HA 4Z2KA 2G4FA 2ZX6A 4HA1A 1UKQA 1EO5A 1OGBA 4FLSA 2BNJA 2GK1A 4ATDA 5HXMA 3BAKA 4UOZA 2CBUA 4JFVA 5A8PA 1UA7A 1B3WA 2J7EA 1XSKA 1VEOA 1HJSA 1V3LA 3SEPA 1UZ1A 3OLDA 4U33A 1H5VA 2O9RA 3EDDA 1E4MM 2ZUMA 5A69A 3AHYA 2V5CA 3VDBA 4XV0A 1B1YA 3EMCA 3WQ8A 2DSUA 3F5LA 3T09A 2MANA 2WW5A 1GOKA 4JKMA 2WVVA 2J8GA 5FL1A 2EPLX 3WF2A 3QHMA 3IJ7A 2PWFA 3HMCA 1IZJA 3THDA 4PMYA 3NUKA 1JDDA 3PTKA 4PCTA 1TMQA 2OWCA 1XHGA 3ZJ7A 3WMCA 1ZJBA 2O9OA 3RDKA 4JAWA 2DSWA 4ML4A 1FHLA 4WSKA 4WKHA 1K9FA 4JIEA 4KGJA 2Y24A 2ZUNA 4AZBA 1CXLA 5DEZA 1QNOA 2XTKA 1DEDA 5I5RA 5EFFA 1N82A 4HMDA 3UERA 1QBAA 1JZ4A 1ITXA 2BS9A 3ARWA 1NQ6A 3TOPA 3FAWA 1QW9A 4W7VA 1VBUA 1PX3A 1ODZA 4GQQA 1HKKA 3CTTA 1K9DA 3THCA 1BAGA 4PMQA 2W66A 1VF8A 4D6IA 3OLEA 3VDCA 3L2MA 4W8BA 1LWJA 4AY1A 2WPGA 2DDXA 2E0PA 5FKYA 4CVWA 3LPPA 5M5DA 1CGYA 3CZ8A 3OB8A 3MMWA 3ZSSA 2XGIA 4M24A 4FLQA 4UQDA 2WHMA 4FLOA 1HJUA 1HJVA 3GBDA 3K8LA 4IPNB 1MW2A 1S46A 4P8VA 4AZIA 1H41A 3VPLA 2W63A 3SCOA 1E6XM 3W25A 4P7RA 1OBAA 4NI3A 3SCPA 4HTYA 3WMSA 5I3DA 1J0YA 2XHYA 1C8XA 3NDYA 1NARA 3UESA 5I0DA 4CCEA 4F9JA 4X9YA 3WUBA 1GHSA 1W9BM 2B31A 3WQ4A 4U2ZA 3HJEA 1KWGA 4UQAA 5A6JA 1V0LA 4P7QA 5ECUA 4GXPA 2VVNA 2IXUA 3GZAA 1OT2A 1NOUA 5FCZA 4H04A 3N1AA 4CGTA 4RL3A 5E70A 1CLVA 3BAIA 2WWCA 1E15A 2YBUA 4B3KA 1HP5A 1U30A 4D6JA 2QPSA 5E6ZA 3FXYA 2XIBA 3POCA 1UR2A 1BGGA 4AISA 3TTQA 2PWHA 6A3HA 4BZYA 1MFUA 1M53A 3WD4A 2XSAA 2ZX7A 4OJYA 3MSGA 4A4AA 2EPMX 3AQUA 2XUCA 2YJQA 5IFTA 2W92A 1XV8A 4H8HA 5D4YA 2WZIA 3W38A 1HN1A 1MW1A 1CECA 1JFHA 4CN1A 1UKOA 1M04A 1LQ0A 3IK2A 1NOFA 3CGTA 4AD1A 3CMJA 1UWUA 2ZX8A 3SUTA 2PBOA 5A6MA 3GYCA 3RM9A 2WVTA 1R87A 3K8MA 3GH4A 2WSKA 1J01A 3AMDA 4HU0A 4DWSB 5BXRA 4D1JA 2VVSA 1V6UA 3ZOAA 4NF7A 5DO8A 1JYXA 2X0HA 2WMFA 2YBTA 2A3HA 2ZXBA 4LPCA 1CTNA 1V3MA 4GPNA 1W3KA 5A6BD 4Z2JA 1H3GA 1E71M 7A3HA 1WE5A 2GFTA 2O9PA 2D23A 2JEQA 2YIHA 3N18A 4FMVA 3GBEA 2VTFA 3ECQA 5LYRA 1KCLA 1ISWA 1EGZA 3VMOA 2VZUA 3CHCA 4MJ4A 2G3JA 2VZOA 3WDQA 2BHYA 3FAXA 1F4AA 3VGFA 3IJ9A 2WSPA 1NOWA 1UWTA 1VFUA 1HJXA 1M01A 4UOJA 1XH2A 3BAJA 1NH6A 4C7GA 1SFSA 5E0FA 4H7VA 1E6ZA 3WD1A 3RIKA 2XVNA 4PTMA 1BSIA 4ZE4A 1BVZA 2BHZA 2WC7A 1FP8A 1JFXA 4HPGA 2CIPA 4PMOA 1U33A 4QFUA 4FF5A 1ESWA 2VRQA 4OOUA 1QW8A 4UZUA 4TVDA 3WF1A 3VGEA 1DWAM 3CBWA 2JE8A 1HKMA 3ARPA 3OGRA 3L4UA 3CUFA 4A3HA 1ZBKA 3AS0A 1G94A 2Q8XA 2XFYA 1FOBA 3PTMA 3U7BA 4F8XA 5HPOA 2J7DA 1JZ7A 4YN5A 1E73M 5CJ5A 1NWRA 1F4HA 1V3IA 1L8NA 4HZ7A 3B9EA 4PSRA 1LF1A 3WUFA 3WUGA 1CGUA 4CKQA 3CUHA 5GPRA 1BPLB 1HJQA 1BYAA 1Q4NX 3RILA 2E40A 1XD1A 2Y5EA 3DECA 3UR8A 1UWIA 1E3ZA 2G41A 1R7AA 1I1WA 3N13A 4WLCA 3EMQA 1E6SM 4QCFA 4MDOA 2CKRA 1KR0A 2EPNA 5AY7A 3SCQA 3AHVA 2CEQA 1XRVA 4AZCA 1VJZA 1HP4A 5KEZA 4B3LA 1OD0A 2NT1A 1O6IA 1QPKA 1GQJA 2FGLA 1J9YA 3W53A 1EQPA 2O9TA 4U5KA 3TTOA 3SUSA 2X0YA 2VZVA 4GO9A 5GNXA 2VNCA 1VAHA 3VD9A 4PMNA 1OD8A 3ZSTA 4AW7A 3ARUA 3K4DA 3TP4A 2WNWA 2ZUWA 1GZJA 1QI2A 1OB0A 4PSPA 5EFDA 4TTGA 1Q6DA 3K46A 1JF5A 3FN9A 2A3CA 2C0HA 2O92A 1J0JA 3AIVA 3CUGA 3WH5A 1C7TA 2D0HA 1JAEA 5AYIA 1DP0A 1C93A 1JDCA 1Z32X 2GJXA 4M8UA 1EOKA 1B3XA 2CERA 5AC5A 5BROA 1B3YA 4DUXA 1JZ5A 1I75A 1OSEA 3WBAA 3MMUA 4UNIA 3IJ8A 4GI9A 4BCEA 3I3EA 1CBGA 4V27A 3ZJKA 3LMYA 4B9ZA 4B16A 2DH3A 4TUFA 3WQ5A 4DWSD 4DM1A 5BWFA 2CHNA 1HJWA 2D20A 2WKLA 1B30A 2J7FA 3VM7A 4GINA 3U57A 2OSYA 4HPHA 1EDQA 4HP5A 1Y7VA 1KR1A 4H41A 1E1EA 1ZB5A 3AYSA 2DT0A 1EH9A 1HF6A 3OA5A 4WSJA 1CXKA 1W1TA 3EDFA 4GZJA 1M7XA 1J18A 1NP0A 2CHOA 1GORA 4AD4A 5BXPA 4JL2A 3QHNA 2E8ZA 2XGBA 3FHQA 2AMGA 4ZFMA 1JNEA 1V02E 2CYGA 3WFZA 4OBRA 3QOMA 5BXTA 2BVTA 2FH8A 4JFTA 1UH3A 1UKTA 2VX5A 4M29A 3W0KA 1Q6FA 4EE9A 3UG4A 1CIUA 4GKLA 4ATWA 3AICA 1JIBA 4UQEA 3EYPA 4CD7A 2PI6A 2WHLA 1XCXA 4PMDA 3PZTA 3IAQA 3VX0A 4NRRA 3N04A 1UG6A 3ARVA 4LYQA 4W5UA 4BS0A 4KWUA 1CXFA 3AS1A 4IUGA 4V2XA 4HU8A 4AZ6A 4TVUA 2X2YA 4CVUA 3WQ6A 3UR7A 4ACYA 2OWXA 2FH6A 2VO5A 4QLLA 3VMPA 2YLAA 1QNSA 3WNOA 4HOWA 4AYSA 1MFVA 2FDMA 2D3NA 3UG5A 3L4XA 3EDJA 1HIZA 4H2CA 4NSBA 4AEFA 3T0DA 1KQYA 1E5JA 5M3WA 1ZJAA 3AXHA 1V3HA 3OZPA 3HU7A 1W3JA 4LQ1A 2JFEX 4HZ8A 4MNLA 1TA3B 5E6YA 3K4AA 4UR9A 1WB0A 3EDKA 4W84A 1AVAA 3AYRA 1HL9A 4P7OA 4PTWA 2WZEA 4P7NA 2G8ZA 4OIFA 3CZGA 1DHKA 2BXYA 1GQLA 3ARRA 1UYQA 3WL1A 5CGMA 3N11A 2YA0A 4DWSC 1DWGM 3J7HA 3WD3A 3MS8A 1A47A 3MANA 3A3HA 1W1PA 2BVYA 4U3CA 1QI0A 2J77A 4UFIA 3KE0A 4CD4A 3NYDA 3DYOA 1UQYA 1JI1A 3ARSA 1CXIA 2WWDA 1V02A 3AXXA 2WKGA 5I77A 2VZTA 2ZXQA 2DT1A 3TONA 2VQUA 6CGTA 3ZT6A 1CNVA 1WZMA 1EXPA 3BCDA 3WEMA 2VRKA 4DUWA 1JYVA 1JI2A 2V3DA 2DSZA 4YPJA 1V08A 4H8UA 2VX6A 1EDGA 2GJPA 3E1F1 1KGXA 4BQ2A 2Y4SA 1DWHM 3VIIA 1UUQA 2NSXA 2D0FA 3VIMA 2W61A 2ZIDA 4W8AA 4CU8A 2BFGA 3I3DA 1VFOA 3VIOA 2IUZA 4QCEA 3VIPA 3GNRA 1E0WA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3AMC A;  4W87 A;  3AXI A;  4U2Y A;  3WH6 A;  1B2Y A;  3CO4 A;  1D2K A;  2WVV B;  4R27 A;  1W2P A;  5E0C A;  5HBF A;  3QR3 A;  4AZH A;  1C3F A;  1E55 A;  5A2B A;  5C70 A;  1GON A;  2BV9 A;  1G5A A;  1K6A A;  4FLR A;  3DHP A;  3W6L A;  3S2C A;  2EO7 A;  5I79 A;  4YHE A;  2RGL A;  3KWX A;  4UFL A;  1X6L A;  4GZI A;  1O7A A;  4AC1 X;  1UR8 A;  1V6X A;  3NSX A;  3VX1 A;  3T0B A;  3B9A A;  1KWK A;  4UFH A;  4X0V A;  3RO8 A;  1C90 A;  1ECE A;  3SCU A;  4HME A;  1BG9 A;  1FHD A;  3PHA A;  2VT0 A;  4HZ6 A;  5I78 A;  4BQ3 A;  2WVS A;  3QHO A;  2ESC A;  3VIK A;  3SUR A;  1QHZ A;  5JBD A;  4LX4 A;  2VUR A;  3MUZ 1;  4M82 A;  3AML A;  3U7V A;  5FD0 A;  1H4P A;  3NDZ A;  2ZIC A;  4J3V A;  4K68 A;  3VMN A;  3RPM A;  4J3S A;  5D9M A;  2ZXD A;  4W7U A;  1E0X A;  1OGS A;  1GOI A;  5I6S A;  4ZXO A;  3ZQ9 A;  1GUV A;  2ZXA A;  3NJ3 A;  3WNP A;  1W9U A;  4P8X A;  3L4W A;  1B3V A;  4ZE5 A;  1YQ2 A;  5JBE A;  1AQ0 A;  2VQT A;  2VCC A;  3VIJ A;  3WEZ A;  1DWI M;  3WF4 A;  2DSV A;  2UY3 A;  1ZS2 A;  4TXE A;  4Z2L A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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