1EQP | Genus

Total Genus 153

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	153
sequence length	394
structure length	394
Chain Sequence	AWDYDNNVIRGVNLGGWFVLEPYMTPSLFEPFQNGNDQSGVPVDEYHWTQTLGKEAASRILQKHWSTWITEQDFKQISNLGLNFVRIPIGYWAFQLLDNDPYVQGQVQYLEKALGWARKNNIRVWIDLHGAPGSQNGFDNSGLRDSYNFQNGDNTQVTLNVLNTIFKKYGGNEYSDVVIGIELLNEPLGPVLNMDKLKQFFLDGYNSLRQTGSVTPVIIHDAFQVFGYWNNFLTVAEGQWNVVVDHHHYQVFSGGELSRNINDHISVACNWGWDAKKESHWNVAGEWSAALTDCAKWLNGVNRGARYEGAYDNAPYIGSCQPLLDISQWSDEHKTDTRRYIEAQLDAFEYTGGWVFWSWKTENAPEWSFQTLTYNGLFPQPVTDRQFPNQCGFH

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
publication title	Minor structural consequences of alternative CUG codon usage (Ser for Leu) in Candida albicans exoglucanase. pubmed doi rcsb
molecule keywords	EXO-B-(1,3)-GLUCANASE
total genus	153
structure length	394
sequence length	394
ec nomenclature	ec 3.2.1.58: Glucan 1,3-beta-glucosidase.
pdb deposition date	2000-04-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	1eqpA00

1EH9A 3G6MA 2ZX6A 3GH7A 3VIJA 4D6GA 1UA7A 3PZIA 3RILA 1TCMA 3TTSA 2ZUVA 1FP9A 4PTWA 3MS8A 1DWIM 1VRXA 3IK2A 3CUIA 1QNOA 3KWXA 2BY0A 1LJYA 1OIMA 1E0WA 1W3LA 1E3ZA 4DWSB 3WEZA 5ECUA 5D9NA 4MDOA 1Q4NX 4ZE4A 1UOKA 3WNLA 1V0KA 1EA9C 3PZTA 1WP6A 5LYRA 4K68A 4XZBA 1J9YA 1ISVA 1WZAA 5BCAA 2B31A 3EMZA 1QBAA 3A47A 2JE8A 2WPGA 2D2OA 4E8DA 2IUZA 2WHJA 3EDKA 2O9OA 2V38A 3VD5A 1Y7VA 4FLQA 2ZX5A 3WDHA 2PF0A 4UFIA 5IHSA 2YDQA 2WVTA 1GUVA 1LQ0A 1W1YA 5I77A 1WDRA 3U5UA 4AIEA 3B9DA 2CPUA 2ZOXA 4R5EA 1UD8A 2VZUA 4Q22A 4YPJA 3SCVA 3AZSA 2FGZA 5EFFA 1OT2A 2YA2A 2YA1A 1XCXA 1JZ6A 1UD5A 4FMVA 1UR8A 4E2OA 4HA4A 3WNOA 1GONA 4IPNB 4TX6A 1E5JA 3GNOA 2Y5EA 2E9BA 2GK1B 5BROA 3SCRA 3VILA 3ZIZA 3N18A 3WF0A 1V6WA 2XYLA 2WLZA 1O6IA 1VJSA 1E0VA 3ARSA 2PWFA 4UCFA 2YL6A 1WZMA 4EKJA 1JIBA 1TFVA 4F9JA 1MXGA 3BMWA 2J74A 3W27A 1DEDA 2G4FA 3T09A 4IPLA 3L2LA 4J7RA 3ZSSA 4PMNA 1JDDA 1NOUA 4BS0A 3B9EA 3SUVA 3VDBA 3GXDA 4Z2LA 2UWFA 5FD0A 3WNKA 2Z1KA 1Q6CA 3ZM8A 2DSKA 4QLLA 3MANA 2CKSA 1HN1A 1MVYA 1FOBA 1L0PA 4CKQA 1AQMA 1FFQA 1HJQA 5ABGA 3OG2A 4CVWA 1EDGA 1J0JA 1HKMA 3GYCA 2WHMA 3IJ9A 1V3JA 3RM8A 3HMCA 4PCTA 1NWTA 1ISZA 1GOKA 3U5YA 3BAJA 8CGTA 3GH4A 5LA0A 3SIMA 3CGTA 3TONA 3WNNA 1V6XA 4KGJA 1E5NA 1KXQA 2E8ZA 2CIPA 2VTFA 3W4RA 5JIPA 1HKJA 3SCPA 1UD4A 1NOFA 3IAPA 4PMVA 1UH2A 3ZMRA 5IFTA 1ESWA 1DWHM 2DT0A 1F4AA 4UOQA 5GPRA 1VEOA 4MADA 1A3HA 3GNPA 1G94A 1UD6A 1WNOA 4GI6A 1UWQA 2MANA 7TAAA 2XVNA 1G5AA 1UR1A 3AZRA 1V02A 3HN3A 2G3IA 2O9TA 1JDAA 2Q8XA 1EOMA 1EHAA 4YHEA 3GNRA 2G3NA 2C7FA 2J79A 4U2YA 4WSJA 2D3LA 1W9VA 1B3XA 1BAGA 4V2XA 3WQ5A 3THCA 1WCGA 7A3HA 3O6AA 3A6OA 2O9PA 1B9ZA 3N9KA 5HPOA 2VMFA 2XSBA 2JFEX 3BC9A 3WL1A 3SUWA 3O2LA 1C3FA 2WMIB 4TX8A 1OGBA 2X2YA 3NJ3A 3AS2A 3OLGA 3ARXA 2EO7A 5FCZA 1FH7A 4BA0A 4HMCA 1KQYA 4AISA 3W26A 3WUEA 2VJXA 4JAWA 1UKTA 3UG3A 1CWYA 4DM2A 3EYPA 4CU8A 1HXJA 1WPCA 3ARPA 4P7RA 3SCQA 1MYRA 1E73M 3UG4A 1I1WA 3VMNA 1RP9A 2VVNA 3LPGA 4FK9A 5I78A 2XM2A 3VMPA 2WC3A 1ISWA 3GDBA 3SURA 1CGUA 4CU6A 2XJ7A 4KWUA 1XSJA 4F79A 2V3EA 5EB8A 4AXNA 3OGVA 4AZ7A 3UERA 2AMGA 4OKDA 3RPMA 2DSVA 1TG7A 4QP0A 2WAGA 4AZCB 1PX8A 1OB0A 3PTMA 4Z2KA 1DP0A 4IM4A 2DT1A 1PIGA 3O9NA 1GQKA 1GOWA 5A94A 3BMVA 2CBUA 4HOZA 1UQYA 4AW7A 1UZ1A 3L4VA 2A3HA 1R7AA 4AY1A 3THDA 2F2HA 1BVZA 4P8UA 1JNEA 4AZ6A 4PBGA 3ZJ6A 1DWAM 4UFKA 3D3AA 1J0IA 2QV4A 2E9MA 2YBUA 4LPCA 1C8XA 2BHYA 2A3AA 3I3DA 3WFZA 4D6EA 3E1F1 4PRWA 1E1FA 3PN8A 3CUFA 2VZOA 5C70A 1E3XA 2WW5A 2W4XA 5GNYA 3KL3A 2YA0A 1BG4A 3PBGA 2WSKA 1XRVA 3FHAA 1L8NA 1US2A 1ZB5A 1UKPA 7CGTA 1DWJM 1R86A 2E8YA 5CZKA 3BAKA 2XWDA 4BQ3A 1QVBA 4YHGA 2WBKA 3BAXA 3VGDA 2J77A 1HL9A 1KR0A 1MQPA 2XVLA 1W9BM 4OBRA 2Y24A 4EAMA 1KWKA 1CXHA 1LL6A 2CERA 5AYBA 1GHRA 4Z2IA 3KEHA 3SUSA 4ACZA 3VX0A 1IZKA 2QHAA 2CETA 1NP0A 3IJ7A 4AMCA 4HA1A 4MNMA 2EXOA 1WAWA 4UFJA 3VIHA 5FKYA 1TVPA 6A3HA 2J47A 4V27A 3N11A 4UQEA 3AXXA 4MJ4A 2VRJA 3NYDA 4GQRA 3LPPA 4URIA 5I6SA 1VFUA 2WBGA 2W91A 3VIGA 1UKOA 4PYSA 2WVVA 1HJSA 4H41A 1JI1A 2WYSA 3WH8A 2WMHA 2XFRA 4JL2A 2EPLX 4JCLA 4MJ2A 4PUEA 1GJWA 2FHFA 3W37A 5FOOA 3CTTA 3KL0A 4MB1A 4AD5A 2PI6A 2YKKA 4HU0A 1GQJA 1XH1A 1ZS2A 3BSGA 1HKIA 3WKZA 4B9ZA 1VF8A 1SMDA 3PZMA 4D6DA 4D6JA 4JKKA 3KL5A 2J8GA 4TUFA 1RD6A 3K46A 1V03A 2JIWA 1Q6GA 2OSXA 1UWRA 5E6ZA 1BLIA 1SFSA 1JG9A 2CKRA 3U7VA 3F5LA 3ZR5A 1UWIA 3CHEA 1H49A 3N1AA 2CXGA 3I3BA 1MQRA 1BYAA 3UCQA 3UESA 1KXVA 4C7GA 4E4PA 4J3UA 2X09A 2XUCA 1M7XA 3ARVA 2DH3A 3DHUA 1CECA 3F5KA 4CVUA 5IHRA 3LPFA 3KE0A 3VDAA 1OWQA 3S2CA 5I2UA 4GIAA 3BLKA 1E1EA 5M03A 2OLHA 4OOUA 4PN2A 1OD8A 1D3CA 1GOMA 3J7HA 4RE3A 1CGXA 4CD7A 5BRPA 2YLLA 4IISA 1GJUA 3AIQA 2VZTA 1XYFA 2DSUA 4CN1A 1G01A 3RO8A 1ODUA 3CO4A 1IV8A 2CHOA 2JEQA 1CENA 4P7OA 1KBKA 4FLSA 2JEPA 5I5RA 4AYSA 1Q6FA 1KXHA 2XIBA 4WKFA 2J7HA 1KCLA 1V3HA 1SYTA 4TOQA 1PEZA 3AICA 4HU8A 4N42A 2ZUWA 3MKKA 2PBGA 2NT0A 1K9EA 4MB3A 4AEFA 1RPKA 3CHDA 2WANA 1C93A 3RIKA 4M82A 3AHZA 4MAVA 4U2ZA 4M8UA 1KGWA 2PB1A 4GQQA 4W8AA 3WUBA 3FW6A 3WF1A 2XHYA 1NH6A 1E55A 2XG9A 2OWWA 4X0VA 4D71A 3W28A 4H8VA 2WZHA 2XSAA 5ABEA 2FGLA 3CLWA 1XH0A 1VBUA 3OGRA 2ZWZA 5A3HA 4DM1A 4KGLA 3VTRA 4P7QA 4UFMA 2EJ1A 4CD5A 3AIUA 1E4MM 5A8PA 1HF6A 2X0HA 3DC0A 1M03A 1WB0A 3RM9A 1EO5A 4QLKA 1QNQA 1WE5A 4D6CA 4HOWA 2J7CA 1CZ1A 1E6XM 1FA2A 1KBBA 3APGA 5EFDA 5CSYA 2J78A 2D0GA 2DQXA 3WY1A 1QOXA 2OWCA 3AISA 5DT7A 4EK7A 1VFOA 4PUDA 1E6PA 3T0BA 5KEZA 2BY1A 3DECA 1A47A 4W87A 1MWOA 2OSWA 3DYMA 1GOIA 2XFFA 5I79A 5GNXA 3QHOA 2UY5A 1ZJBA 3VGGA 3MUY1 3ZJ8A 2PBOA 4AC1X 4H2CA 5CPTA 1KGXA 1MFUA 4A4AA 4PCSA 1UYQA 5CPSA 3A4XA 1P6WA 1HJWA 1E72M 3VGHA 2CITA 3CZJA 2FDMA 3OLEA 1EQCA 4JKLA 2J7DA 2CYGA 5ABFA 4AIOA 3WEOA 4MNLA 5CGMA 4M24A 4J27A 1J0KA 3L4XA 3WDRA 2VX6A 2J7EA 2VL4A 3CIVA 4QLJA 3VO0A 3UEQA 3A3HA 2Y2WA 1RH9A 2VZVA 1W9UA 3W6LA 2XPKA 1QI5A 1LG2A 3PZNA 2ZUMA 5GNZA 5DMYA 4CUCA 1CXIA 3DYPA 4KMQA 2VX5A 5A6BA 1MW0A 1E4IA 2E9LA 2BY3A 3SEPA 1W2VA 4P8XA 5E70A 2RGLA 1AMYA 4B15A 3CH9A 3NSXA 5A6SA 2RGMA 2WWDA 4B3LA 3AHTA 4TVDA 1G1YA 4UNIA 1NM9A 2DDXA 1OINA 4DWSA 5FL1A 3HU7A 1V3KA 4MDPA 3WMSA 1JYWA 3L4WA 2VX7A 1K9FA 1JDCA 1H4PA 1CEOA 5D8WA 3VU2A 1LWJA 1TE1A 3AMGA 2F8QA 3W24A 1FP8A 1W1PA 2VQTA 2QLYA 5HXMA 1VENA 1VFMA 2BXZA 3ZOAA 1GQLA 3WH7A 2YBTA 4CD8A 2VUYA 4D1JA 3WH6A 1DHKA 1HJVA 3BLPX 1S46A 1CTNA 2WKLA 4D6HA 2WZEA 1KB3A 1NOWA 3QHMA 3ZO9A 5JIWA 3WD1A 3TOPA 4DWSC 3AJ7A 4QCFA 2CBJA 3ARQA 1E6SM 3GTNA 2TAAA 2J4GA 4GI9A 4MAZA 2NW0A 5BXPA 3QOKA 1GVIA 3ZQ9A 2Y8KA 4NRRA 3CUJA 4UQBA 2XGBA 3EMQA 1OGGA 2EBNA 4QDMA 1MFVA 1VEMA 3NDYA 9CGTA 3AYRA 1B90A 2E0PA 2GK1A 3VOCA 1WZLA 2D3NA 1QNRA 1EDQA 2PWDA 4GO8A 4WIWA 2WZIA 5D9OA 5DT5A 3AQUA 4D6IA 3BAIA 2ZIDA 3UR8A 3N13A 1PZ2A 1TVNA 3VIIA 4N0RA 3W82A 1ITXA 2E40A 5KZ6A 1H0GA 1IZJA 4H04A 1OSEA 2DIEA 4TVCA 1V3LA 2X05A 2VCBA 2YDRA 3RDKA 2A3BA 3TP4A 2BY2A 4AD0A 4RL3A 2W61A 4J28A 1TMQA 4JHOA 1TUXA 2GSJA 3QOMA 4WKAA 1KXTA 3OIHA 5C8BB 1X1NA 2X8RA 4Q7NA 4B9YA 4JCMA 3CZLA 2NT1A 3K4AA 1EXPA 1BGAA 3DHPA 2YDSA 1ZBCA 2BHUA 3K8KA 3VNZA 4W84A 2OYKA 1E43A 2VC9A 3PZUA 3FY1A 4W88A 3WH9A 4AZGA 2GFTA 4U5IA 4MB5A 2D20A 4JFWA 4OOZA 4PTVA 3WF2A 3NDZA 1US3A 2ZX8A 5BRQA 3SCWA 3HJEA 1PAMA 4GPNA 4Z2HA 3WDQA 1HNYA 2BXYA 4HZ8A 1E4NA 1UWSA 1HJXA 1K9TA 4JL1A 1J10A 1BG9A 3TTYA 1NQ6A 5A2AA 3UETA 4WK9A 1W2PA 5GQBA 1GVYA 1TA3B 2Y4SA 3AXHA 4OBSA 5A8MA 1BVNP 3ZT6A 1GW1A 1JL8A 3EDFA 4GXPA 3VUPA 1JAEA 4LGXA 1JGIA 3BGAA 4UOJA 1QHZA 4JZ5A 1H11A 1D7FA 4W7VA 1B0IA 1HP4A 4MPKA 3WBEA 1IT0A 2DSZA 1H0IA 4FF5A 2W5FA 2WSPA 2GJPA 1XC6A 2VOTA 3OB8A 3GBDA 4PTMA 1KGUA 3LPOA 3AZTA 3GXIA 5CGTA 3NSNA 2WNWA 1BYDA 3ZT5A 1ZL1A 4UFHA 4EANA 2FH8A 1UKSA 1Q6EA 1E6ZA 4WJXA 4JIEA 4W5UA 2VVSA 2GDVA 1DTUA 4JFSA 4DUXA 1FFRA 1OT1A 1VJZA 2CHNA 2WMIA 4PEEA 3B9AA 1H2JA 1E71M 1BSIA 3L4TA 2BHZA 4M1RA 2W92A 4RE2A 1UQZA 1PIFA 1Z32X 5BXRA 4HTYA 1UWTA 5TD4A 2XFYA 1QW8A 2WC4A 4PSRA 3AS1A 5I0DA 5FL0A 1W91A 1EHNA 1CXFA 3CZKA 3K8LA 3U57A 2C8NA 1NWRA 3WD3A 2VCAA 4HMEA 5F7UA 2F61A 3PZVA 4BQ5A 4JFVA 1EGZA 4WKHA 1EDTA 1BTCA 2X1IA 2ZXBA 3IAQA 1V08A 1VAHA 2WM0A 3WUFA 5A6LA 4CN4A 2ZX7A 1JI2A 2YJQA 2FHBA 1DWGM 5AC5A 3MV11 3CHFA 4W5ZA 5CXPA 3FXYA 4ZXOA 1NWSA 4A3YA 5JBFA 1NARA 2WHLA 3EMCA 3SCNA 2DT3A 3ZJKA 1NWUA 3K4DA 4ATDA 3OZPA 2J25A 2ZXQA 5A6KA 1ZJAA 1BPLB 2NSXA 1UA3A 2G3MA 1D2KA 2BV9A 4KRTA 3SCUA 1C92A 2D0FA 5E09A 3UR7A 3OLIA 1UD3A 1M04A 2BVTA 2DEPA 1R85A 3BH4A 4JFUA 3GXFA 1H3GA 3AXIA 1XH2A 3AI0A 3GBEA 1W3HA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1TWW A;  3L21 A;  2XYL A;  1VJS A;  1A5A A;  1GKP A;  5AZ1 A;  2YL6 A;  3FGC A;  1JIB A;  1MXG A;  1N8W A;  1R2T A;  3W27 A;  1DED A;  5G2H A;  3G1R A;  3L2L A;  2TOD A;  4D9P A;  5I03 A;  1VFS A;  1X97 A;  3ZSS A;  4Y8E A;  1XIG A;  2OZ3 A;  1NOU A;  1FWR A;  1W31 A;  3B9E A;  2YCL A;  4HNV A;  1Q6C A;  1WOB A;  1Q13 A;  1U22 A;  1V5X A;  1FOB A;  3TC3 A;  1KCX A;  2PP3 A;  3C86 A;  3B0P A;  2WHM A;  3IGH X;  1BEU A;  1XRF A;  3IJ9 A;  5T9C E;  3RM8 A;  2WPB A;  3IWP A;  4PCT A;  2R1L A;  1NWT A;  5EU9 A;  4HYV A;  1P0B A;  2GQ9 A;  3SIM A;  4JDY A;  1M65 A;  3WNN A;  2GUU A;  1KXQ A;  2CIP A;  2VTF A;  1HKJ A;  4L9Y A;  2IQD A;  1RLD A;  3NUR A;  3C8F A;  1DWH M;  1F4A A;  1WKF A;  2F2K A;  3W1A A;  1S2V A;  4Z0S A;  1F6Y A;  1G94 A;  5J5D A;  5IOB A;  1A4M A;  3NG3 A;  1NDY A;  4GI6 A;  1UWQ A;  1D8C A;  1G5A A;  1AFS A;  1UR1 A;  5DX7 A;  1NSJ A;  3W1Q A;  4YCO A;  4IPI A;  1F07 A;  4L65 A;  2C19 A;  4UTK A;  3F4N A;  3I4E A;  1FQ0 A;  3THC A;  3ONC A;  3L0N A;  3A6O A;  3KZP A;  2O9P A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1EQPA

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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