3W75 | Genus

Total Genus 104

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	104
sequence length	313
structure length	313
Chain Sequence	MCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism	Trypanosoma cruzi
publication title	Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with MII-4-149 rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
total genus	104
structure length	313
sequence length	313
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2013-02-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	3w75A02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3w75A01

1PHWA 3N9RA 1SPQA 3G1FA 2VFIA 5HJLA 3W1TA 4ONVA 2H6RA 3PWAA 1O4UA 3RLVA 2ZRXA 3NR0A 1J5TA 1F7BA 3C2OA 3DFNA 2BLEA 5K3VA 1HL2A 5EBUA 3B04A 4HNNA 4LWWA 1JCLA 4LVGA 3P74A 1ZFJA 3INPA 4HN4A 4O54A 1P0NA 3HGOA 1ALDA 3QMRA 3N2XA 2A0NA 5BNKA 1KBIA 1EX5A 1YXYA 3IV3A 1P1XA 1QWGA 3PB0A 4O15A 1TPFA 2ISSA 5K2ZA 1T8XA 1VLWA 4UR7A 4GFSA 4NQ1A 3PBVA 3M16A 2B7QA 5C5YA 3QW3A 1IIGA 4EWND 2QR6A 5K9DA 1I8JA 3L5MA 5F2MA 1LLZA 4PA8A 4MPQA 3NL2A 3GX9A 2H3DA 2ATSA 1WQ5A 2TSYA 5FF0A 4UTJA 2A6NA 3ATYA 2A7PA 3IIPA 3DU0A 3QM3A 1KTBA 3NL3A 4BI7A 3W7JA 4X9SA 4FHAA 4J9JA 3TNOA 3EWUA 2V8ZA 3LTPA 5FF7A 1GQNA 2YXGA 1VRDA 3TFXA 4ZQOA 3EXRA 1H51A 2BWGA 4LS0A 1ZAHA 3EEGA 3SGZA 1QR7A 1XBZA 2WV8A 3G0UA 1RD5A 3CWNA 4FX7A 2QKFA 3SIZA 2TYSA 4K7YA 3NA8A 3MJYA 4XTIA 4RK8A 3G1HA 1KM0A 3IIZA 1OX4B 1EUAA 3M44A 1GWJA 2V2HA 1UCWA 2CLEA 3PS7A 4DF2A 1H62A 4LVFA 4DBDA 1ME7A 1TTPA 4JICA 1KM1A 1VS1A 4JTUA 4MLJA 1W5OA 1Q45A 1V7YA 2UV8G 5HWNA 3LHUA 2VELA 3W9ZA 1K03A 3O6CA 2GJNA 1W5QA 1RPXA 4RKAA 3CC1A 3QZEA 3HG4A 3PUOA 3K30A 5HNRA 3I65A 3L67A 1MEIA 6ALDA 3M5VA 2DP3A 1ICPA 4Y8FA 4MYAA 3BLEA 5D2WA 5AHFA 5CZSA 2C13A 4XKYB 1KFEA 4WUIA 5FEZA 5I3JA 3LI0A 2ZFAA 3C8FA 3RMJA 4AHPA 4WXZA 2NZLA 5AN7A 4O52A 5BW6A 2FJKA 3QQ0A 4CQAA 2CLMA 4WY0A 4PL1A 3TV8A 2QJIA 3M47A 3G3DA 2CZEA 2YZRA 5DCBA 3CHVA 2RDWA 2Z2UA 2ZZ3A 1EUNA 3GK0A 3L0KA 5H91A 4GUHA 1TPH1 3G22A 2P0OA 3QH2A 3SY5A 1GYLA 3IEBA 3EWYA 3BLIA 3LHZA 4FIRA 5AYYA 3IGSA 3MP3A 3BG3A 3TCEA 1ONRA 3ZWTA 4LNYA 2DZTA 5D04C 5AOUA 1Z41A 1ZALA 1NSJA 3Q58A 5I3GA 1H1YA 3GZ3A 3BG5A 3HMJG 3G1VA 3NGJA 4OE7A 2DZPA 4N9EA 3UPWA 4FNTA 5F4WA 1FWNA 3DGRA 1G7UA 2EHHA 1A5CA 3W2MA 3NVTA 3UWZA 1IXNA 3JS3A 2VEPA 3MMTA 1JCXA 1TV5A 4I7VA 3RU6A 4M6PA 1NAL1 2NXHA 1PHQA 3BW3A 4HSOA 5DBUA 5BOOA 3IIOA 4RLIA 1HFBA 4HNUA 3HGSA 5F1VA 3E0IA 2A7RA 5HR7A 3ELFA 3MHFA 1W54A 1QO2A 3OIXA 4M6VA 2ISVA 3DFTA 1R2TA 3C4UA 3C56A 2B7OA 5HUPA 3N9SA 1OFRA 2V9DA 1I2NA 1S5TA 5AHMA 4NUWA 3BARA 3PVFA 1LDCA 1WX0A 3ATZA 3H55A 4HHPA 1TRDA 1K8XA 2X1SA 2A85A 3IRDA 2X1RA 1CX9A 4UTWA 1WXJA 3B06A 2AGKA 3HOJA 3L0NA 2NXGA 4IMDA 2ZZ4A 1DORA 4UMBA 4LVDA 1QPRA 5KITA 3MBFA 1KFBA 3UXDA 1N8FA 3DHDA 2DORA 3TSBA 5FEPA 5K4ZA 3MW7A 3P62A 4O1CA 1YADA 4UTTC 3OVPA 4O19A 1PIIA 3ABOA 1DVJA 5G5IA 3OBKA 3W7MA 1D3GA 4TMCA 1KFCA 1W5PA 3QJAA 1KA9F 1WA3A 4IWWA 4ORMA 5D32A 1JULA 3TW7A 4JN6A 2E5CA 3GVGA 3FLUA 1WOAA 1EA0A 3E96A 3S1WA 4LUIA 2Z0IA 2YPIA 3HBLA 2Y70A 1LBFA 1FCBA 1KV8A 3PM6A 3P5ZA 3NQAA 2V5BA 4MZ8A 2ALDA 4K38A 3W74A 2NWRA 4FNUA 1NF0A 3EB2A 4CNNA 3R12A 3LX9A 2X30A 2XN0A 4CCDA 1JUKA 3O15A 1F6KA 2YYTA 3PUDA 3NQ7A 1O5XA 3MI2A 2YGYA 2EGZA 3P5YA 5LHFA 2A4AA 1FQ0A 1KFLA 4Y90A 3HPZA 4EF9A 1GG1A 1TPB1 1WDWA 2X1UA 1FBAA 1J2WA 1H50A 2PRLA 1KM4A 3EX2A 3C2EA 2VFEA 3DKLA 2OJPA 3NQ2A 2DZXA 1OYBA 4WZHA 2EF9A 4RV8A 4S2CA 2QUUA 5AHEA 2CZDA 3L0GA 1V5XA 1MXSA 2HS8A 1VGAA 1FCUA 2YW3A 1MO0A 3KRZA 4JYDA 3TMLA 3BV4A 3W83A 3GDTA 2DU2A 3KHJA 5HUOA 3I7RA 1ADOA 1YTDA 2R91A 3C52A 3C61A 3CQ0A 4WOZA 2NLIA 1HTIA 4HKPA 4E0CA 2FB3A 3UYCA 3JRKA 5DY2A 4HT3A 1FDJA 1XBXA 4IMCA 4K37A 1DV7A 2ZA1A 3MI6A 1A50A 3DZ1A 4K36A 5T26A 4MY1A 4O1BA 3CEUA 3STFA 1JQXA 1VCGA 2NX1A 4UXDA 4JTSA 3W22A 2P10A 1Q6OA 4PODA 1XKYA 4JEQA 4XWUA 1QNVA 2YDAA 4WJEA 2NX9A 3LCHA 2VFFA 4LW7A 4OQVA 4N6FA 1GTHA 5CZ0A 1YXDA 3LBMA 4OT7A 3NDOA 1J4EA 3QQ1A 4H3DA 3ZFHA 1ME8A 3NO5A 4JTLA 1DQXA 2VENA 4UUIA 4DO5A 3BGGA 1FCVA 5DN1A 2ZRWA 3ZR4A 5AHLA 1GVSA 2A7NA 2CLKA 2QCGA 3VNDA 3TU9A 3STGA 1X8FA 1F2JA 3G8RA 2QCLA 4GUGA 3CM4A 4RZ4A 3DFQA 1H1ZA 2NV1A 3LV5A 3IVSA 4QNWA 4DO6A 3BW2A 1GPWA 4FNRA 4TMBA 3L2IA 1BEUA 3S6DA 4Z1DA 3TMQA 4WY0B 2BXVA 3M5XA 4M19A 4NJKA 3PR2A 4DF0A 1FY6A 3NPUA 3BLFA 1SSGA 2X2GA 1YYAA 2RFGA 3GXNA 3MWAA 4JYEA 1W5NA 2Y85A 1WAUA 5CSSA 3NAVA 3NM1A 5G2HA 4MFEA 4S1FA 1B3OA 1I2PA 4RZ5A 2WJZA 4UMAA 2RHGA 1QCWA 3OG3A 4O17A 1VQTA 3MO7A 4XUGA 4K6AA 3HJZA 2VOMA 4DEFA 3CIXA 1M5WA 3LCWA 1I2OA 1VYPX 4ADUA 2OMAA 1CW2A 4UFMA 4WY0F 1OFPA 2VFHA 2IQTA 1SZGA 1K7XA 1A5BA 2PE4A 3GAKA 2H8ZA 3YPIA 3QF0A 5LSMA 1QFEA 5D02A 2AAMA 2C18A 2Y6ZA 3L9CA 4DO4A 3BPWA 3NQ8A 1TTQA 5C6MA 2ABBA 5DY3A 3U8GA 1XDLA 3KX6A 1TQXA 2QJHA 5D05A 3DH7A 4IMEA 3NZ1A 3QSRA 3QFEA 4QNEA 1DHPA 1JJKA 1MEHA 1VZWA 1SW7A 3LV6A 2ZZ2A 3GXPA 4X3ZA 1XCFA 2R14A 3W7KA 3RLUA 3ZWSA 5D2XA 2HTMA 3W7HA 3QYQA 3LGEA 4NJHA 4U4MA 4KFOA 2CLHA 3I6RA 3SJ3A 4ZZ9A 3NPWA 1SO3A 1W3TA 1XC4A 4QSHA 2DJXA 4PL2A 3L68A 2C6QA 4LS2A 3BG9A 2JBMA 1R2RA 5FEXA 4IX0A 2GVJA 3CU2A 1Q6LA 3UXAA 2E5DA 4H6KA 3W2NA 5AYXA 3E9AA 3LBCA 3DENA 5D38A 1LBMA 2VKZG 2Y7GA 1ME9A 1AMKA 1MSSA 3T40A 2TMDA 3WJSA 2WSRA 4JX6A 4NJIA 1XUUA 3G0XA 2QJGA 1BKSA 3GNNA 2OT1A 3VI2A 3TK7A 3HG2A 4FXSA 5F2GA 4KWWA 3W1QA 4IGHA 3S1XA 1JUEA 2XN2A 1XI3A 3W87A 5EY5A 2Z6IA 3GIYA 4WQ6A 2NXIA 1H60A 2ZYFA 4FNSA 4PFMA 1YDNA 1W31A 1LP6A 2CLIA 3B0PA 3FYOA 3W2JA 1H7WA 5D09A 3DXIA 4ZQRA 3LDVA 4UCGA 4NX5A 2E6AA 3A9IA 2DJLA 3FA5A 1IXOA 3FJ6A 3HPXA 5FF3A 3S5OA 3RK8A 4UTWC 4UFLA 4WD0A 1M7PA 3MYOA 2CFFA 1T96A 4K8EA 4BR1A 5LHEA 3E12A 3ABQA 1AL7A 1VHCA 2JGQA 3GKAA 4LC8A 1N7KA 3EWWA 3LCLA 4JTHA 3TQKA 4AHOA 3W7RA 3BGJA 4IUOA 5LNSA 1VHNA 3P84A 3S8HA 2QCFA 3W1UA 5KSWA 2QF7A 4IOTA 1KM2A 4FNPA 4N4PA 5EPDA 5CZJA 1ML1A 1N55A 5G2IA 2Q8LA 3N73A 4MLRA 3PY2A 4CCCA 3NQVA 3QPZA 3B4UA 4CQ9A 3TC6A 3W1RA 5HWJA 3KVJA 3LM7A 3W71A 1TTJA 2ZZ6A 2VEKA 1A53A 5HULA 4RZ6A 4IMFA 3S1VA 3N2MA 3WK1A 2GJLA 1OYCA 2H90A 1W3IA 3IVTA 3PBYA 3TXZA 4QAIA 3T78A 3LRLA 4HNTA 1EP3A 3CEPA 1UUOA 4N9CA 5AHNA 1TPEA 1OX5A 3C0JA 3GDRA 4NX0A 2C19A 3TC7A 3FKRA 1AG1O 1QPQA 4YLWA 5K9XA 3NL6A 4LVAA 3G0SA 3M5YA 1G67A 2F7FA 3GDMA 2E6DA 2V81A 2JK2A 3TAOA 3FKKA 2V5LA 1WV2A 1KW1A 4JTEA 3B0UX 2GVGA 1ZCOA 3UWQA 4JTJA 5BRBA 3LXCA 4GUFA 3TJLA 1FWSA 1RQBA 4JY9A 1O60A 1K7FA 3DBPA 1LROA 3QC3A 2C1HA 1KBJA 1R30A 3M9YA 5E93A 5HMSA 1OFAA 4NVTA 1P0KA 2DZVA 4LV9A 4O53A 2CU0A 4LTSA 1RQHA 4AMAA 4MJMA 5CPOA 2WKJA 2E6FA 2J9ZA 1C29A 1IGSA 1D9EA 3O07A 1SO4A 4OU1A 5DCEA 4N6EA 1M6JA 4AWSA 1I2RA 2ZZ5A 3G1YA 4UFJA 3B8DA 1E51A 3KFTA 5HWMA 2B7PA 2YSWA 4PH6A 1IIHA 1H63A 4JS3A 5I3HA 3TA6A 5TQLA 2FIQA 2ZZ1A 2J27A 4QISA 4BFAA 4MZYA 3UWUA 3C2VA 3W1MA 1EP2A 1SUXA 1TTIA 3S1UA 3FFSA 4N02A 2V30A 2VEMA 3UZJA 1F5ZA 2GUUA 1XL9A 3WJXA 3L5AA 3T4CA 4A3UA 4PEKA 3PG8A 5EL1A 1FDYA 3NQCA 1X1ZA 5KZEA 1H61A 4Y96A 4GE8A 4IMGA 4UTMA 3QPYA 3SFKA 1B57A 1W37A 2Z6JA 3LRKA 2W6RA 3W1PA 4ALDA 2EPHA 5IM51 5K9CA 5SWUA 3W7EA 2ZRUA 1OABA 5D37A 5D30A 2QDGA 4NJGA 2NV2A 4X22A 1GZGA 1XBVA 4AWUA 3LI1A 1VR6A 3WJYA 2ZCGA 4JIPA 1T99A 2YYUA 3MYPA 7TIMA 3W7LA 1ZAIA 4POCA 1XDMA 2PRHA 2CWNA 4N9DA 2OT0A 4UTIA 3G1AA 4O4WA 3C6CA 3STCA 4UIOA 2QUVA 1FWRA 2YW4A 1L6SA 4AVFA 2YFNA 4JX4A 3HGJA 3C2FA 3W76A 2A21A 2G95A 2C0AA 3TH6A 3WJZA 1LOSA 1SW3A 2R94A 3SGUA 3HF3A 3A23A 1GVOA 2ATMA 1SSDA 4IPJA 2GVLA 2O7SA 4LY8A 3WJWA 2V82A 1YPFA 1L9WA 3W84A 4CNPA 2Y62A 4A2RA 5F2LA 2QCDA 1FWTA 3PG9A 1UB3A 1W56A 3LXBA 2FPYA 3BW4A 1H7NA 1YTEA 1SZFA 4BF9A 5L9FA 5D33A 1LCOA 1UUMA 3IIXA 2QAPA 3SZ8A 1TPDA 4DPQA 2KZHA 2WPBA 5IBXA 3KOFA 2WSYA 1BWLA 3MHGA 1GVRA 2NWSA 1YXCA 5U4NA 4AF0A 2PCQA 4GBUA 3PC0A 2VFDA 3Q94A 3HG3A 2R8WA 5LGXA 4UNKA 1OFOA 3TW6A 3CLMA 3P8IA 3QW4B 4MVAA 4BWLA 4WX2A 3W86A 2D73A 3EWXA 1XXXA 1GT8A 2VXNA 2DZWA 1QOQA 1TREA 4Q32A 3GDLA 1F74A 3SR7A 1DBTA 3G8EA 3LB0A 3DI1A 1OFBA 3H53A 3F4NA 1WOBA 4OWGA 3SECA 1K02A 5KINA 4Q33A 3P60A 1YDVA 4O1DA 2WQPA 1SO5A 4JTTA 1OK4A 4Y9AA 5BMXA 3DAQA 4YWIA 1IF2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3W75A

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