1UP2A

Structure of the endoglucanase cel6 from mycobacterium tuberculosis in complex with glucose-isofagomine at 1.9 angstrom
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
293
structure length
291
Chain Sequence
ANPLAGKPFYVDPASAAVAARNANPPNAELTSVANTPQSYWLDQAFPPATVGGTVARYTGAAQAAGAMPVLTLYGIPHRDCGSYASGGFATGTDYRGWIDAVASGLGSSPATIIVEPDALAADCLSPDQRQERFDLVRYAVDTLTRDPAAAVYVDAGHSRWLSAEAMAARLNDVGVGRARGFSLNVSNFYTTDEEIGYGEAISGLTNGSHYVIDTSRNGAGPAPDAPLNWCNPSGRALGAPPTTATAGAHADAYLWIKRPGESDGTCGRGEPQAGRFVSQYAIDLAHNAGQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords CELA1 PROTEIN
publication title Mycobacterium Tuberculosis Strains Possess Functional Cellulases.
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 108
structure length 291
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01341 Glyco_hydro_6 Glycosyl hydrolases family 6
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.40 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel 1, 4-beta cellobiohydrolase 1up2A00
3VOHA 4I5RA 1TMLA 2BOEX 4A05A 4AX7A 3ABXA 3RU8X 2BOGX 1HGWA 3VOFA 3VOJA 2BODX 1CB2A 3RPTA 1OC7A 1UOZA 2BVWA 1OC6A 1HGYA 1QJWA 3VOGA 4B4HA 1GZ1A 4AX6A 4AU0A 1OCJA 4AVOA 4B4FA 1BVWA 1UP0A 1QK0A 1OCBA 1DYSA 3A64A 1OC5A 1QK2A 4AVNA 3A9BA 2BOFX 1OCNA 1UP2A 4I5UA 1UP3A 3VOIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O1DA 3KOYA 1IZJA 3AALA 3CMFA 4HN4A 4Q8NA 5DXYA 2ZRWA 3STCA 3G1SA 3CQIA 4XD4A 2PDWA 5BMWA 3PJUA 1YMYA 4H6QA 1SFTA 3SRDA 5KZMA 1OFRA 5AZ1A 2J7EA 3LCLA 5AC4A 5I24A 1XL9A 4TR9A 3KUMA 3QGVA 1GUVA 4GI4A 4XZMX 3EEZA 4DY1A 2C1GA 5AC6A 4HK5A 3NSMA 1F3WA 1QPQA 2DY3A 2VC9A 3GDKA 4N9BA 2GLKA 2P0IA 5CJ5A 4NYUA 5EMYA 1JPDX 2NX1A 5ECVA 3DU0A 4FXFA 3FNDA 1GVIA 1F76A 4JBRA 1JZ5A 2E6DA 2X0YA 4QAWA 4EP8C 4GABA 1XDMA 2IKJA 4HBKA 2Q3RA 3E0FA 5JIWA 3VKAA 1P0DA 3W71A 1OEPA 1LL6A 1B57A 3FAXA 3WF3A 5F2LA 3R13A 1L6WA 5CSYA 1XG3A 1TV8A 3PHAA 1IZCA 1AH3A 3SCOA 3ALGA 4WY0A 4A22A 3OZMA 1QUMA 1TRIA 4RPPA 4XSMA 1Q45A 5EPDA 5AECA 1IYXA 3AS3A 3HPFA 2XFRA 4LUSA 4PSRA 5MF5A 1FCUA 5HUOA 3LGDA 1CXLA 1T40A 2CIPA 4W8LA 3KP1A 1KKRA 3VIPA 3ITCA 2P76A 4NZ1A 4GZEA 1FUYA 4GUFA 1TG7A 2DUAA 3BLEA 1E56A 5C55A 4LTSA 4M7SA 3ZR6A 3AICA 3P0WA 4PB3A 4YTTA 4UTMA 2ZE0A 2YA2A 1OK4A 1GVYA 1UR4A 4H19A 1KFLA 5E0FA 1R2TA 3W88A 3EA2A 5JBDA 1G4PA 3I3DA 1NM9A 2Y8VA 3T6CA 4QR6A 2B81A 2PDNA 1JCLA 4M1BA 5H1WA 2WKLA 2DSWA 1I2NA 4UC5A 4XKYA 4YYFA 2A21A 2FZ9A 2CLEA 3ONBA 2OWWA 4E8GA 4DYEA 1A3HA 4GYKA 4AZ6A 3RLUA 1FWAC 1Q8JA 2G41A 1XLCA 5E6ZA 4K38A 4W84A 3UWWA 4C5YA 2PDCA 4TTGA 4O1BA 2V9DA 1XPYA 1IQ8A 3A3XA 4WKHA 1EFZA 3NPUA 3QSRA 4AD1A 3EWUA 5DMLA 1FQ0A 1XR2A 4Q6XA 1CGXA 2YXOA 5C9RA 2OO6A 2PBGA 2WWCA 4JL2A 2R1KA 4Y9OA 3W23A 1GVSA 1SZRA 4NT0A 4X0VA 4UNKA 4ZE4A 3V18A 3NURA 6PTDA 3OBEA 1YBQA 1UKSA 2PD9A 1XLFA 4W88A 1GJPA 1H09A 2VP8A 1TV4A 4BS0A 5KEZA 4OECA 3PZUA 4X22A 1R38A 5FI8A 2F6KA 2WVTA 4JTJA 2FZDA 3KP0A 1J11A 4WVXA 3ITVA 3UEQA 1I2RA 1E6PA 3VZYA 3WLKX 2ZKMX 1SW3A 3Q2DA 4GIEA 3GO2A 3ABRA 1Y5WA 3TEVA 1EZWA 1XYCA 3IGSA 5KZEA 2OZ8A 1EDTA 2XJ7A 1ITQA 3LNPA 5CGTA 3BJSA 5K9CA 4WK9A 5I23A 4GFIA 2ZRXA 3WH6A 4A21A 2D23A 3R43A 3U5UA 3C0JA 4N6EA 2NT1A 1TWSA 4JIPA 5DF0A 3EMZA 1BWLA 3QGKC 5DT7A 1WO2A 4HT3A 4JIEA 4ROQA 3HQPA 3S3GA 2FKPA 2EQDA 2P88A 2QEZA 1K8ZA 1FP9A 2PDGA 4R3UA 2P50A 2JEPA 1TFVA 1YNPA 5EY5A 3E3HA 2D0FA 3QC3A 2VENA 4F79A 5K4XA 5I3GA 4JD4A 1ZY9A 1ZBCA 3U2CA 4Q7BA 1JYNA 3QY8A 3CM4A 3S2LA 4MY8A 2JKEA 2AMXA 3RLHA 2Z24A 1YPXA 2V2HA 1A0DA 3KDNA 1GNXA 3W1TA 4QIUA 3FA4A 4CU7A 3T08A 2VX7A 3CZ8A 1TVPA 4GIYA 3GNXA 3T09A 1MFUA 3LPOA 4UZUA 1NOWA 1GOWA 2VOTA 3VVGA 5A2BA 4IPJA 1W1TA 3VKBA 2OX4A 2XVPA 3AIEA 5CZKA 2RAGA 1DHPA 2HQAA 4AZIA 1B31A 4F0RA 1MDRA 1A5NC 4D8ZA 2XGBA 2O4MA 1Z41A 4LGXA 3AU6A 5I00A 1V77A 4DX3A 3P8JA 5D9NA 4JIHA 3GB6A 2X1RA 3G77A 3WDRA 3T81A 1OFEA 2J77A 3EOEA 2W4XA 4AWTA 4HOXA 1XM3A 3TZNA 3E38A 4G1NA 1M7XA 1B3ZA 3R89A 3C86A 2YPIA 2C15A 3VCCA 1MW2A 3KVJA 3O7UA 1GEHA 3GK0A 4IQJA 3MKKA 5I2UA 2OX1A 4FXJA 4DQWA 3IUDA 1HKWA 1QPRA 5JMUA 4NZ4A 1LWJA 1P4CA 3MBDA 2PURA 4M6QA 5J5DA 5EU9A 1P6WA 4Y9NA 1IR1A 1U1UA 1XCWA 4BF7A 5LYRA 2XFWA 1W17A 3PTQA 3ZZ1A 4EK7A 3WQWA 1CGUA 4LW7A 3ZM8A 2FZMA 4XVEA 5CGQA 2G3MA 5DY3A 3W1UA 2I57A 5GNZA 1JFXA 3W76A 3W2KA 2I9EA 4PMZA 3DGRA 2E8YA 2VQTA 3RXZA 3WQ6A 3GZ3A 1JD7A 1QCWA 2YW3A 4UQ9A 1QATA 4LH8A 3DCPA 1XLHA 2I16A 4I9JA 1KC7A 3KVMA 4PRRA 1S2AA 4C6PA 3HPXA 1B3VA 4Q8MA 3B05A 1GK8A 4CU8A 4GISA 1RLCL 4ICNA 2Y4SA 1UWTA 4AIEA 1HUVA 3UZYA 4XBKA 3WX7A 1IEWA 3V1HA 4EPBC 4UTTC 2R8WA 3R12A 2EKCA 4PYSA 2V82A 4RE4A 4L4LA 1TJPA 4ZOBA 5K4ZA 3REQB 3MO4A 4U5IA 5HJYA 2YB1A 3FY1A 1X8CA 2FTWA 2DW6A 3W01A 1S3HA 3QW4B 8RUCA 3P82A 1JCTA 4K37A 2XVGA 2PGEA 2DZWA 1W8GA 1QPNA 1RR2A 1QI5A 2ZRUA 3MTWA 3R1ZA 4J1OA 1YDOA 3ABZA 3GLCA 1JYVA 3F5KA 2CW6A 4MNKA 3Q67A 1EP1A 2VR4A 3EPMA 1A5KC 2WBKA 3QTPA 5CBBA 5DN1A 3MI6A 4LVFA 3EX3A 3SY5A 3G8RA 1KLYA 3EPNA 1WOAA 1KBIA 1E4NA 4MMWA 2PC4A 4WSHA 2RJGA 4LY8A 1DP0A 3A4AA 3AC0A 3K4AA 4GFSA 4HPHA 4Q8VA 3GAKA 3PFMA 1JNEA 2PC8A 2WM0A 4UQEA 2WZHA 4H4IA 3I7RA 1TUFA 2NX3A 1V6WA 4QRNA 1JAEA 4RXGA 4ILSA 5U4NA 3O0KA 2NXHA 4CD5A 3V1PA 2ZZ3A 1PWMA 8XIAA 7REQB 3GKFA 3WLSA 3IEBA 2A3HA 1E71M 3GXNA 4RDWA 1OFBA 1W1PA 4MJ2A 2IXVA 1TB3A 4PUNA 2ZXQA 4ZR8A 3SDOA 3K13A 5F2MA 5EB8A 3W72A 3U4AA 1YADA 4HHLA 1JI1A 2XU2A 3PTKA 4DO5A 2DUXA 4Q4QA 1G01A 3FJ6A 1KWKA 3EDDA 1CLVA 1NWUA 4LRSA 4PH6A 3THAA 3QHMA 3IIZA 1AD1A 1Z9AA 3SO7A 1GQIA 2VC7A 1KRAC 3W1XA 1BVWA 3NQ8A 4KMQA 3OG2A 1FWWA 3N9KA 1QR7A 3QC0A 1DIDA 2YXGA 4F2TA 4HSOA 3KBWA 4S3AA 4LSBA 1GVFA 4XWUA 3TH6A 1EB3A 1P6CA 3WK0A 3I6EA 3TQKA 2QT3A 3NXLA 2VUNA 1MYRA 2I5QA 1XJBA 2BVDA 3NIYA 4HU4A 2WC3A 3E9AA 1PZ0A 3L0NA 4HPNA 5D8ZA 2E77A 1KQYA 1QNRA 1FWDC 1BG4A 5I77A 4IGHA 1I0DA 3UR8A 3ITGA 1S5MA 1JL8A 1AD4A 2OR2A 4JQ4A 3DFTA 2VVNA 3OQ8A 3DX5A 3FGCB 1XCXA 1P43A 2CZ5A 4CQ8A 3PF3A 3T4WA 1J0JA 4NJKA 5HWJA 4Z1BA 4F3HA 5KETA 4NRSA 1YRRA 3DEQA 1E43A 4M1RA 1UP0A 2PDFA 2PDUA 2BGNE 2PD5A 4UB9A 4LAOA 3UW6A 2VC6A 3WYZA 1GCYA 3AISA 3LBCA 1AZ2A 2CCRA 1I6NA 5U7SA 3BGJA 3W84A 3URBA 2PBOA 2UY5A 3CUFA 4UTUA 3DG6A 3LI1A 1A5SA 2IPGA 2ZXDA 3O1NA 1XSIA 3WLMA 4GC4A 3PWIA 3HPAA 2YKKA 1KW1A 4AF0A 1QHZA 3HMCA 4XUGA 3MO7A 1L6SA 2NT0A 1H11A 3KXQA 2ZX7A 4EPDC 1YDNA 1VPQA 2EKGA 3GH4A 3CAKA 1EO5A 4U10A 3STFA 1JZ7A 1SO3A 5CPNA 2X8RA 4W93A 4M6PA 4H9VA 5D2YA 5ABEA 3UYCA 1XLEA 3BG9A 5C9UA 4K1WA 2EG6A 2H8XA 3GDLA 2BLEA 1R30A 4QLLA 2FVMA 3CL7A 1RSCA 4KWOA 2J4GA 1X6NA 3CYJA 1W3TA 3PPHA 1HZYA 1NDYA 4PZVA 5CJMA 5A6MA 1QT1A 2CETA 4AY8A 2PWDA 3DHUA 4PUJA 1GG1A 4HU0A 8A3HA 3C5QA 2O9RA 4IPIA 4HJWA 4NU7A 3R11A 1ZALA 2GJXB 2QQ6A 3W7EA 3TCSA 3FFSA 4LYPA 3RM8A 3NQVA 1EC9A 3W1AA 2OLSA 4MNJA 1YPFA 3N2TA 3SRFA 3IJDA 4F9JA 1WUEA 4MZYA 5FJOA 4JIRA 5G2WA 2CZEA 3PWAA 4DAFA 2QJGA 3LCWA 2DIEA 1W56A 3U6WA 1R7OA 5BNKA 4WY0F 1A50A 4B5WA 1VGAA 1UIOA 2GGJA 4ZEPA 4JQAA 2Y0FA 1GQJA 2NWSA 2JIEA 3PBVA 1VFLA 3CUIA 3N18A 3V5OA 1EKOA 1T8XA 3SECA 3VKDA 2O7SA 4P7RA 1Q6GA 4HP5A 4U3AA 4C6OA 1VS1A 2OQLA 2WJEA 3WEMA 2QPSA 5JU6A 1RV8A 3ZMRA 5IRPA 3GY1A 4YS1A 3SM0A 3WD0A 5C71A 2BOEX 3SSZA 3WDQA 4XAPA 3RU8X 3QH2A 1XINA 2V8ZA 3BE7A 3HV9A 4O1AA 1VFUA 3MMWA 1JDCA 4QE5A 1SFLA 4KEVA 3W1NA 3WDJA 4YLWA 4ZOEA 1JJKA 3I6TA 1FWCC 2PCQA 1P1MA 1KXTA 2W63A 3LCFA 5KZ6A 3H2MA 4M3PA 4QJ3B 2V5LA 3P60A 1D3GA 2NZLA 3G3MA 2D3LA 3UPMA 3T7VA 2E5DA 3TKFA 4GXWA 2DVTA 3LLXA 4CQBA 4PUEA 3TR9A 3FYPA 1HGYA 2A3EA 1KM5A 3WO8A 1JF5A 3C52A 3H4XA 3KVLA 2Y8KA 3OB8A 1GPWA 4ZQNA 1A47A 2BTMA 4FR1A 3UWUA 5IDZA 1R47A 1PIGA 2ZBTA 5A1AA 2QPXA 1K8CA 3TAOA 2C91A 4KWVA 1ICQA 4AC1X 1YNYA 2J25A 1RA5A 1EPXA 3PM6A 4CD7A 2OFJA 4E6MA 1ZRQA 4YIWA 4Z1AA 3PPFA 3L0GA 2NVDA 3RCMA 2C19A 1LT8A 1XLMA 2W92A 2A7NA 4C6MA 1XBVA 4FZIA 1T6MA 3OVRA 4DBDA 4M29A 3CNYA 1O66A 2YDQA 3MPGA 4F66A 4OT7A 3T44A 4JZ5A 3AHYA 2RDUA 3TN4A 4MOZA 3ABQA 4J27A 1XGZA 2TRSA 3L4YA 5L6UA 4MB1A 3IGXA 1TPVA 4GUIA 2ZFAA 4BI5A 3LERA 1V08A 4O11A 4HMCA 3NQ6A 4BWLA 2O56A 3BMWA 2WCGA 3MDWA 4FNSA 5TNVA 4WSKA 3N29A 2CWXA 2DT0A 2WPGA 1P7TB 2CC0A 5A3HA 4UNIA 1J93A 1R3SA 2DIJA 5KINA 3N2XA 2NLYA 3GRIA 4U2YA 3N15A 3BWWA 2ZQ0A 4XIMA 4F8XA 5D2VA 1ICPA 4YWIA 2VR5A 1EGZA 1XIDA 4FOKA 4XV0A 2WMIA 3GU2A 3ARVA 4EIVA 2WMKA 4AD0A 1OFDA 3ISIX 2WSRA 3WZ0E 1B3OA 3PPGA 1ICSA 3D3AA 1J10A 2WSPA 5G5IA 3WLOA 5LKYA 1Q7QA 2BODX 4O8RA 3G6LA 4IT1A 1W9VA 1YX1A 2J74A 4RE3A 3WMSA 2I14A 3ZVIA 4RW5A 1LP6A 4F2UA 3DC8A 4DI9A 1LOQA 3RF9A 4N42A 3VPLA 5FAGA 3WELA 4DUOA 4YHEA 3I4KA 3TA9A 1E0XA 5A6KA 2YBVA 3EKGA 3OIXA 4JKLA 3WH9A 4D1IA 1E6ZA 3TU9A 2PDBA 3NSXA 1HN1A 2PP3A 2EHHA 2H6RA 4GGHA 6TAAA 3OHMB 4C6QA 4FIRA 3N04A 1UR3M 3WBEA 1UH3A 4ZOCA 3EXRA 4JX5A 3UZ5A 1TPB1 3M6DA 4HHHA 3MS8A 3BPWA 2H3BA 4CVWA 2XDFA 1WYIA 1MW1A 3TC6A 1QXLA 3ATZA 4B4FA 2OLHA 2VKZG 3OQEA 2D0GA 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3VOHA 4I5RA 1TMLA 2BOEX 4A05A 4AX7A 3ABXA 3RU8X 2BOGX 1HGWA 3VOFA 3VOJA 2BODX 1CB2A 3RPTA 1OC7A 1UOZA 2BVWA 1OC6A 1HGYA 1QJWA 3VOGA 4B4HA 1GZ1A 4AX6A 4AU0A 1OCJA 4AVOA 4B4FA 1BVWA 1UP0A 1QK0A 1OCBA 1DYSA 3A64A 1OC5A 1QK2A 4AVNA 3A9BA 2BOFX 1OCNA 1UP2A 4I5UA 1UP3A 3VOIA
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 3VOH A;  4I5R A;  1TML A;  2BOE X;  4A05 A;  4AX7 A;  3ABX A;  3RU8 X;  2BOG X;  1HGW A;  3VOF A;  3VOJ A;  2BOD X;  1CB2 A;  3RPT A;  1OC7 A;  1UOZ A;  2BVW A;  1OC6 A;  1HGY A;  1QJW A;  3VOG A;  4B4H A;  1GZ1 A;  4AX6 A;  4AU0 A;  1OCJ A;  4AVO A;  4B4F A;  1BVW A;  1UP0 A;  1QK0 A;  1OCB A;  1DYS A;  3A64 A;  1OC5 A;  1QK2 A;  4AVN A;  3A9B A;  2BOF X;  1OCN A;  1UP2 A;  4I5U A;  1UP3 A;  3VOI A; 
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