2C6QA

Crystal structure of human guanosine monophosphate reductase 2 gmpr2 in complex with imp and nadph
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
328
structure length
328
Chain Sequence
SLDFKDVLLRPKRSTLKSRSEVDLTRSFSFRNSKQTYSGVPIIAANMDTVGTFEMAKVLCKFSLFTAVHKHYSLVQWQEFAGQNPDCLEHLAASSGTGSSDFEQLEQILEAIPQVKYICLDVANGYSEHFVEFVKDVRKRFPQHTIMAGNVVTGEMVEELILSGADIIKVGIGPGSVCTTRKKTGVGYPQLSAVMECADAAHGLKGHIISDGGCSCPGDVAKAFGAGADFVMLGGMLAGHSESGGELIERDGKKYKLFYGMSSEMAMKKYAGGVAEYRASEGKTVEVPFKGDVEHTIRDILGGIRSTCTYVGAAKLKELSRRTTFIRV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Cofactor Mobility Determines Reaction Outcome in the Impdh and Gmpr (Beta-Alpha)(8) Barrel Enzymes.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GMP REDUCTASE 2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 115
structure length 328
sequence length 328
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.7.1.7: GMP reductase.
pdb deposition date 2005-11-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00478 IMPDH IMP dehydrogenase / GMP reductase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2c6qA00
4O1AA 1JRCA 3W07A 4DPQA 2FPYA 3LCXA 1CW2A 3EEGA 4UTTC 5H2ZA 2EHHA 3GKAA 5GVJA 3NQFA 3UD6A 5D2VA 3P5ZA 3DKLA 5CZJA 3TAOA 1XUZA 3TNOA 1P4CA 4HNNA 5K7JA 2ZCGA 1G4TA 3R13A 3VE9A 4PFMA 3WK3A 1TRIA 1SZGA 2QCHA 3N2XA 3LBMA 1S5VA 4R7JA 3YPIA 2Z6IA 2BWGA 1YPFA 4NQ1A 3DFPA 3PC0A 1KBJA 5J5DA 4M19A 4O14A 4BWLC 4IGHA 3IV3A 3EX3A 1UUMA 4POCA 1JCJA 5D33A 1OYBA 1TREA 4ZQNA 5HWJA 3LBCA 1EWDA 3RNDA 1F7BA 1V5XA 3W2UA 5LSMA 1GG1A 4N9EA 1JRBA 4L4LA 1ZNNA 3W7MA 4GFSA 3LB0A 3W7OA 2WNQA 5SWUA 4B5NA 2V82A 3A24A 3WJYA 1TO3A 1O60A 3TJLA 1ALDA 4O11A 4IX0A 3F4WA 3HBLA 4WY0F 4WZHA 4C1KA 1UBSA 1KTNA 3GX9A 3WJSA 3H53A 2YX0A 1VCFA 3P7YA 4GUGA 4AF0B 1JULA 4EF9A 1B4EA 3LLDA 3D0CA 5EPDA 1QR7A 4NJKA 3E0IA 1X6UA 4UR7A 4RZ5A 3DFQA 3ABOA 3SFKA 5HR6A 4FNRA 1XDMA 4FIQA 4UFKA 4YCPA 1H61A 2CLFA 1KFJA 5G5IA 4NJJA 4ADTA 1H7RA 1KM2A 4LS2A 2X30A 2A5HA 1FCUA 3CU2A 4OV9A 4RXGA 2Y61A 3KOFA 3NQ7A 4AH7A 3FA5A 4UTWA 3G24A 4MJZA 4Z0SA 1HG3A 1NVMA 4OGZA 4IMEA 1R30A 4OT7A 2OMAA 1H7OA 1YDNA 1OHLA 2V9DA 1G4PA 4M6PA 3NZRA 2Z0IA 2GQAA 2CLEA 4UTMA 5IBXC 1VLIA 3GIYA 4M6VA 5EL1A 3FFSA 3SSJA 1QNVA 3OEXA 1LRQA 1BWKA 1TMHA 4IQLA 4JTSA 5L9FA 2J88A 4UFJA 3E9AA 4JR5A 3PG8A 3QFEA 3SGUA 2P0OA 4O12A 3GKFA 2VFDA 2VOMA 4ZMGA 2H90A 1W8SA 3W71A 4NZFA 5HMSA 1PCWA 4M5PA 2E5CA 1GWJA 4XQ6A 3V75A 1XM3A 2EPHA 3UQNA 3DFTA 1H7XA 4XTIA 1JUKA 1K7XA 4LC6A 1ZCOA 3GR7A 3NOEA 2QCFA 4NVTA 3A5FA 4N9CA 2WQPA 3NVTA 3LTSA 2J9XA 3NQMA 3ABRA 3FEMA 2C6QA 1LYXA 2C14A 2GJLA 4KWVA 1L2UA 2DZTA 1T8XA 1YADA 4O53A 4YXGA 1NF7A 3CQ0A 4QISA 3B03A 3O8AA 2NV2A 1JQXA 3LV6A 1FWSA 3EXRA 4QSHA 1KM6A 2E6FA 2JK2A 2NUXA 2QUVA 4X2RA 1PL9A 1AL7A 2G95A 5LHFA 1VLWA 3RF9A 2O7SA 1KA9F 3NM1A 3S6DA 2BLEA 4WQ6A 1ML1A 5C2XA 4N9BA 4DO6A 1GVSA 1M6JA 3IIVA 3L5LA 1A5CA 4JXCA 3PUDA 3NQVA 3UWYA 2QCCA 1LORA 3GDRA 4XTDA 4O18A 2Y88A 1TPWA 5DELA 3M5ZA 4LTSA 1KLZA 2QJIA 4AWTA 1I2QA 4N6FA 3ZR4A 1FCVA 1GZGA 3W87A 3DHFA 1SSGA 5G2WA 5K3VA 1SW7A 4RKAA 1SPQA 4M7TA 4RX0A 1DV7A 3QRHA 4K7YA 3AJXA 3A9IA 1FWNA 2WNNA 3QJAA 3TR2A 5IM51 1T96A 3OVPA 3GK0A 3IVSA 1LROA 3A21A 3W1XA 5HNRA 3M44A 4AB4A 4DF0A 3PG9A 3OBKA 4LUIA 1I4NA 3NXFA 3W76A 4IXXA 1ZFJA 1VJIA 4A2SA 4LS1A 4D2JA 4UTUA 1ZY9A 3TE9A 3PSVA 4A21A 3OHIA 5U7SA 5DCDA 3W1AA 3LCIA 4I7VA 2FFCA 5J5RA 3MP5A 2CZEA 4TO8A 5TBOA 5I3JA 4DO5A 4AMAA 5G1TA 3S1UA 4MY9A 2B7PA 3C2RA 3S5NA 3MHUA 3PBWA 1VHCA 4Q33A 4BFAA 5AHLA 1P0NA 3P82A 1KM1A 3G1AA 5LNSA 3BG3A 4RV8A 3LXCA 2ZZ5A 3O05A 1TCDA 1TPFA 2WV8A 5AYZA 2QDGA 2X1SA 3LX9A 3TU9A 4CNOA 5EY5A 1VYPX 3O06A 2VELA 3LHTA 3PULA 3VFLA 3BO9A 3NDOA 2PE4A 1ZJIA 1C29A 4YLWA 1U5JA 4O4VA 2FQIA 2WSRA 4E2BA 3FKRA 1KM3A 5D02A 2VEPA 3QMTA 1I2NA 3BG5A 3W1RA 1MXSA 4BI7A 1ME9A 1R2TA 2V8ZA 3GLCA 3L9CA 1Q6LA 1VQTA 2DORA 2B0MA 4O8RA 4FX7A 3T7VA 3STGA 4IX2A 1RPXA 3MYPA 3ZWSA 1QO2A 3P62A 3THQA 4MFDA 1Q6RA 3NEVA 3P80A 2JKPA 4JY8A 1YTKA 2DU2A 4O0ZA 1FDYA 5CPNA 3G3DA 2E1DA 4MUZA 1VC4A 3IGUA 4QIUA 4AHPA 4M6QA 2GQ8A 1BWLA 1QPOA 1MEIA 2J6XA 3IEBA 1A5SA 4BI5A 1F6PA 4Y9AA 5AOUA 3W2MA 3BW3A 3UWVA 1NSJA 3LERA 5AHFA 3LCWA 2R94A 3QM3A 3UZ5A 3LHVA 5E1QA 2Y63A 1KTBA 1R2RA 4K38A 4PH6A 3PUEA 2ZA3A 3JRKA 5D03A 3UY8A 3GR8A 3B8DA 2ZZ6A 1TV8A 2E09A 2PRHA 3M5VA 3TSBA 4LV9A 3RLUA 4PODA 3P8JA 2CZ5A 3PF3A 5LGZA 1R47A 1JUEA 2A0NA 2YDAA 1LLZA 1W3IA 4RK8A 4LNYA 5CGQA 1TIMA 4FNUA 2RHGA 4O50A 1MSSA 2QAFA 3W2JA 1PIIA 3BPWA 4DPPA 3C2VA 3QQ0A 4LVDA 5AC7A 5F1UA 4UNLA 1W31A 1C8VA 4FF7A 3R12A 3CWNA 1Z44A 1S5WA 2OT0A 4IPJA 2E6YA 1TQJA 3NPWA 4TU1A 1JCXA 1WQ5A 2JGYA 5DCEA 2E5BA 4UFHA 4EOUA 3W7EA 1SUXA 5TIMA 3W7KA 3IGSA 2WSYA 3CIWA 2HS8A 3P67A 4Z1DA 3GAYA 5I3IA 1H1ZA 3JS3A 2G5WA 3NPXA 1L6SA 1DJQA 4R34A 1KBIA 2E68A 4UMBA 3HF3A 3BLIA 3F1QA 1ZAHA 3O6YX 3Q2DA 1EUAA 1NAL1 2WSQA 4NNAA 2C16A 3W7HA 3HGRA 5H91A 3WK1A 3PBYA 1CX9A 3LDVA 2NXIA 1ICQA 2ISSA 3OVQA 3TA6A 1BEUA 1AW5A 3PSWA 2GOUA 1TPB1 3RK8A 1P5BA 4UTLA 1PHQA 4UUIA 3G0SA 3TW7A 5K4XA 4NNBA 3LRMA 3M7WA 4CCCA 1WOAA 4MFEA 1IIHA 3GDTA 5D37A 2C15A 1VZWA 3THAA 4CNNA 4ORMA 3GYEA 3G1SA 4NU7A 1XI3A 3MP3A 3ATZA 4ONVA 4IWWA 2Y85A 3LHUA 4EF8A 3VI2A 4YMZA 3CEUA 4O4WA 4OE7A 3DHDA 3PWAA 4LUJA 3GAKA 1UUOA 3HGOA 3UWWA 2V0TA 2V2DA 4JGDA 3W7RA 3W73A 1GVOA 3G1YA 2CWNA 3EB2A 3HGSA 2QCLA 3U6WA 1X1ZA 1PV8A 1W1ZA 5CPLA 3LXBA 4UIOA 3W75A 2WOQA 2Y7FA 4N6EA 5AC8A 3T44A 1QWGA 4Z08A 1OFEA 1VYSX 1WOBA 3HPZA 3O16A 3MHGA 3SIZA 5CZSA 3HJZA 1SZFA 3G22A 4GUFA 2ZA2A 4UTHA 1DVJA 5C55A 1SO6A 2QCNA 1QOQA 1N7KA 4CLMA 5AC6A 3TSMA 1OG0A 3RLVA 3TXZA 1AL8A 4LVFA 2DZXA 3G8EA 2PC4A 2ZDRA 5CSRA 2Z1BA 3OVRA 1O94A 4QNWA 3U8GA 4K8HA 3W7NA 1KTCA 3ZS4A 4LW7A 4UTTA 4AXKA 1FDJA 1SZNA 1XUUA 4WJEA 3KXQA 3PS7A 4K7VA 2OZ0A 3VCRA 3EX1A 5DCBA 2YGYA 3M5YA 4MLRA 3TFCA 2ZFAA 4MY1A 4JTJA 4LS0A 2QCEA 4NJIA 1TRDA 2B4GA 4N4PA 3WK2A 2BSLA 2A7NA 3CTLA 2C13A 3LI0A 3B0PA 1IXNA 5F1VA 3IGXA 3ANYA 1Y0EA 1FWTA 4NJHA 3TQKA 1NFBA 3ELFA 3I65A 3CLMA 2FPTA 3M5XA 1SQ7A 1QO5A 3GDMA 3G8RA 1O5KA 4PA8A 1VPXA 1G67A 4NX5A 3NR0A 3G18A 1ZHAA 1YPIA 2Q3OA 1VH7A 4CNPA 2J27A 1JCMP 1FUYA 3MBDA 4EVZA 2CLMA 3MJYA 2GQ9A 3CWOX 3MUXA 1W5MA 3W1NA 3C2FA 3W74A 1KV8A 1QMLA 4K37A 1TPC1 3KRUA 1FX6A 4KFPA 2BZNA 2C3ZA 4JD4A 5A8GA 3HOJA 3NQDA 3FJLA 4GWEA 1OYAA 3M9YA 3NPVA 4N2YA 4GNJA 3NQGA 2VEMA 3G1HA 2X1UA 5F4WA 2VC6A 5TQLA 2F84A 4DQWA 3C2OA 4JTFA 2VFIA 4GUIA 3KAOA 2I1OA 5EA9A 4BF9A 2Y70A 1L9WA 1YXYA 4I7UA 3GZ3A 1FWWA 3LHZA 2VFFA 3UYCA 1F6KA 3W1PA 3W83A 4RJEA 3B05A 2ZYFA 1LTDA 4UNKA 1F76A 1N8FA 3EWZA 1XBYA 5K2ZA 5CG7A 1GVQA 5DLCA 3ABSA 3SZ8A 4I7WA 5LKYA 2J9ZA 1V7YA 3I68A 1HO4A 3A22A 3W2NA 1KV5A 1EP3A 3EKZA 3STFA 2YPIA 4CQAA 3M47A 1Q3NA 1SSDA 3N19B 3W84A 4Y96A 5KTLA 2Y89A 3W85A 3EXTA 1K8XA 3Q37A 3SGZA 4UTWC 2ZTJA 1QOPA 2DJLA 4DO4A 3TDFA 3MI2A 2YZRA 4QNEA 2Y62A 3GXTA 1JVNA 5AHIA 1DJNA 4XBKA 3N9RA 4HN4A 3RMJA 3UNDA 4RLIA 3M6YA 3LOTA 4JTIA 1EX5A 1YTEA 3DFSA 4IMCA 2NX3A 2ZRXA 1FXQA 5E93A 4LT9A 3S9YA 1GTHA 1MEHA 3OG3A 3EWUA 1H7NA 1A53A 5I3KA 2WJZA 1Q6QA 1XBVA 2NX1A 3TJXA 4OU1A 3IVUA 5KZDA 4K36A 1EA0A 1TPDA 3PY2A 2XFWA 1IGSA 2CU0A 1FQ0A 4JX6A 4ADUA 1H51A 3LTPA 1XKYA 4JN6A 1YDVA 2YYUA 2PRLA 2ZBTA 1ME7A 1KFBA 1LZOA 2V81A 3WK0A 3QSTA 1TB3A 4GE8A 2XN2A 3NQAA 3CPRA 3DXIA 2E6AA 3N73A 3LCGA 2X1TA 2RDTA 3LHYA 2ZRUA 2F7FA 3G0UA 3LCLA 1EWEA 3FOKA 3MO7A 4N9DA 3L0NA 3DI0A 4ZL1A 2VENA 5F4SA 4JTTA 1FWRA 3W7IA 4UC5A 4MY8A 3MI6A 1JCYA 4AHOA 3P60A 2H6RA 5BNKA 1BKSA 1I2OA 3EKLA 1QAPA 2QUTA 4NXSA 4CCEA 3LTYA 1XC4A 2VFGA 3BK0A 4U4MA 2G97A 4P61A 1GVFA 3EX2A 2X16A 4JIQA 4JYEA 3STEA 4HSOA 5FF0A 5DXXA 5MHBA 5FF7A 4PTNA 4LY8A 2R8WA 1SO3A 4HKPA 1YXDA 4UMAA 4IMDA 4JTGA 4X22A 4HSNA 5BRBA 3VKJA 3QW3A 3GXPA 3GNDA 3NQ6A 3UZJA 3BARA 3HG5A 4H4IA 3C6CA 1OYCA 2A85A 3B4UA 3NAVA 2C0AA 4HPJA 3AO0A 2QJGA 3BG9A 3B0UX 3HQ1A 1TTIA 5D2YA 5KINA 3EX6A 1DL3A 4NNCA 2V30A 1VR6A 4DBEA 4NXKA 4WD0A 1KW1A 5DY3A 2V2HA 6TIMA 3L0GA 4ZQMA 3BVJA 3S1WA 2X2GA 4A2RA 1ZAIA 3FYOA 3W7DA 2FIQA 2DZVA 4P2VA 1X8FA 2BTMA 1B3OA 2O7QA 4UCGA 2NUYA 1LRTA 3QPYA 1VRDA 2RDWA 3NZ1A 2IQTA 4JDYA 1PCKA 4NJGA 4PL2A 1OK4A 3TQ0A 1C9DA 4FNTA 2ATSA 3TX9A 3O07A 3MI3A 1KM4A 3KRZA 3W22A 5LHEA 3F03K 3LCHA 4YCOA 1ZALA 3DFOA 4IJBA 5K4ZA 2A6LA 2VEIA 1RQHA 4JDBA 4UFLA 5BMWA 3DU0A 4JTUA 3GXNA 4FX6M 1ICPA 3L65A 4O0KA 1WA3A 4NX0A 1H63A 1Z42A 1W3TA 2Q3RA 5I3HA 4O52A 4DEFA 4Y90A 4HIBA 3PUOA 3FLUA 5CZ0A 5T26A 3T40A 5BMXA 3QF0A 5E0KA 4FIRA 4BK9A 3F4NA 3G1FA 3OA3A 1EUNA 1AK5A 8TIMA 3QQ1A 3RU6A 5FI8A 1TV7A 5AN7A 2CLKA 2YFOA 5G1YA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4O1A A;  4YTT A;  3WBA A;  4ERA A;  2FPY A;  2NVA A;  2XZ7 A;  3EEG A;  1B3X A;  4B2D A;  2EHH A;  5GVJ A;  3UD6 A;  5C8B B;  3AHX A;  3GHT A;  5C9W A;  3T0D A;  5CSU A;  1A49 A;  3TAO A;  3DHU A;  2ZCG A;  3RLG A;  3R13 A;  1BFN A;  3V4B A;  3WK3 A;  2O9O A;  1TRI A;  2P88 A;  2QCH A;  1PEZ A;  3EMC A;  2Z6I A;  4L1W A;  4NAE A;  1X98 A;  4IPL A;  4M19 A;  3ALG A;  1ECE A;  1UUM A;  8RUC A;  3S9I A;  4POC A;  2GWG A;  2I5G A;  1OYB A;  4KW2 A;  1KXT A;  4L4L A;  1E1C A;  2Q71 A;  3QPE A;  3W7M A;  2HK1 A;  4W7U A;  3VX1 A;  4C6M A;  4B5N A;  3EA1 A;  2FJU B;  3WJY A;  5A2A A;  2KX9 A;  3MZ2 A;  1F3T A;  3KZP A;  2FVM A;  4DM2 A;  3GX9 A;  1TA3 B;  3TEV A;  1KRM A;  4CVW A;  3H53 A;  2YX0 A;  4FI4 A;  3HQP A;  4GUG A;  2BOE X;  3GC5 A;  5HPO A;  4AF0 B;  2V5K A;  4C90 A;  1UWU A;  3LA4 A;  2QQ6 A;  3IAC A;  3UES A;  5I77 A;  3HUR A;  3E0I A;  4J40 A;  2VUN A;  3GHR A;  3DFQ A;  3SFK A;  4LCQ A;  7CGT A;  4V28 A;  3UPM A;  1H61 A;  1QAT A;  4HA3 A;  1KM2 A;  2GJX B;  2A5H A;  2UY3 A;  3IS4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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