3MI2A

Crystal structure of human orotidine-5'-monophosphate decarboxylase complexed with pyrazofurin monophosphate
Total Genus 95
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
95
sequence length
257
structure length
256
Chain Sequence
KELSFGARAELPRIHPVASKLLRLMQKKETNLCLSADVSLARELLQLADALGPSICMLKTHVDILNDFTLDVMKELITLAKHEFLIFEDRKFADIGNTVKKQYEGGIFKIASWADLVNAHVVPGSGVVKGLQEVGLPLHRGCLLIAEMSSTGSLATGDYTRAAVRMAEEHSEFVVGFISGSRVSMKPEFLHLTPGVQLEAGGDNLGQQYNSPQEVIGKRGSDIIIVGRGIISAADRLEAAEMYRKAAWEAYLSRLG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Homo sapiens
publication title Structural determinants for the inhibitory ligands of orotidine-5'-monophosphate decarboxylase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Uridine 5'-monophosphate synthase
total genus 95
structure length 256
sequence length 257
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2010-04-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3mi2A00
3NZ1A 1OF8A 3GKFA 2DJXA 1JCYA 3LHTA 3P61A 4UCGA 3TX9A 4O12A 2ZZ5A 3EWBX 2ZZ6A 4BI7A 2CLHA 1YYAA 4YMZA 3R2GA 1F74A 1A50A 1KFKA 1F6KA 4NZJA 2B7OA 3E96A 4IPJA 3DBPA 2F84A 1VCVA 3PUDA 3PULA 2QUUA 1B3OA 2CLEA 3A21A 1WBHA 2ZRYA 4X22A 1TIMA 3UPBA 1ZAHA 1TPEA 5F1UA 4UTTC 1XUUA 2QJGA 3VNDA 2JKPA 1LBMA 3W1QA 2RH9A 3QJAA 3N34A 2EPHA 3USBA 1UUOA 3W07A 2YFNA 3C0JA 3SZ8A 3P60A 4O17A 4R33A 1WQ5A 2C15A 2QR6A 1SW7A 1P1XA 1F5ZA 1ZAJA 1SQ7A 3KVMA 3HBLA 3FLUA 1OYCA 2H90A 1JCJA 4BR1A 3LCLA 5CPOA 3AO0A 1L6WA 2R14A 3IGUA 5L9FA 2Y62A 4R7JA 1SO5A 4CLMA 3KHJA 1VCFA 2FB3A 3O6DA 1H1YA 2V81A 5BOOA 3CEPA 5HULA 1VLWA 4ORIA 1QPOA 1DKWA 5DBTA 1AG1O 3UWQA 4MY8A 4LVBA 3F03K 4NJJA 2VFGA 1KM0A 3P80A 4S2BA 3NPWA 3MBDA 2FDSA 5KSWA 3QPZA 1QPNA 3G3MA 4W9TA 5D2YA 2ZRUA 1J4EA 3W1MA 5CZ0A 4PEKA 2OCZA 3TC6A 4UTUA 4AWSA 4O8RA 1R46A 3PB0A 4O16A 4UXDA 4AEOA 2P0OA 4TR9A 3W7JA 5FEWA 4M7SA 4UMAA 3DI0A 4QITA 1W5NA 3NGJA 5K7JA 4UFJA 4OU1A 1M7OA 4HIBA 4UNLA 2ISWA 5BMXA 1GQNA 3G0SA 4WX2A 3E0IA 3B8DA 3T78A 4I7VA 4R34A 4GUHA 3UNDA 2J24A 3EWYA 3W7MA 3S6DA 3MP3A 1JUEA 2Z1BA 5HWMA 1IF2A 3UZJA 2GQ8A 4JTSA 4JGDA 5IBXA 4IMDA 3NDOA 3O05A 3LHUA 2PE4A 4K38A 3NR0A 3PC0A 2VEIA 3LHWA 3B0PA 4QNEA 3YPIA 1XM3A 4PA8A 3L9CA 4EF8A 2WJZA 1LRQA 3DFQA 1E51A 3L66A 4UFLA 1K02A 3TSDA 3DFOA 4NX5A 1LLWA 4ZQCA 2EHHA 3G1FA 1V7YA 1YTDA 1H1ZA 3F1QA 4TO8A 4FEZA 5AC6A 1XL9A 2C1HA 1TQXA 3W7EA 3S1UA 4XZ9A 1RQBA 5FF7A 3PG8A 3QC3A 3LI0A 4AB4A 3KVLA 5KINA 3IGXA 3W7PA 5C54A 4IUOA 2BZNA 3CU2A 3GX9A 3O06A 5I3FA 4O1BA 2NWSA 3OVPA 3GAKA 4PC8A 3E9AA 4UTWC 1D9EA 3GK0A 1TJRA 1TPB1 4UTIA 1ICPA 3ATZA 3B04A 4FNSA 4JTFA 4NJHA 3UY7A 2I1OA 3NQ8A 3L0KA 2V8ZA 3T44A 4FXSA 1TQJA 3HJZA 5LNUA 4C1LA 4S2CA 4O0ZA 4MFDA 3RNDA 2QCEA 1TPFA 3TNOA 2QCHA 3LRKA 5E1QA 5EKYA 3A5VA 3QF0A 4BF9A 1XDLA 4DF2A 3PAJA 5AC8A 4RKAA 2J6XA 3I7QA 3N9SA 1KM1A 4K7YA 2QF7A 2R8WA 2V2HA 1B9BA 5EY5A 1H7PA 4OQVA 4JIQA 3W7RA 1A5AA 1HTIA 3N19B 2QCMA 4YXGA 3BW2A 3WK0A 3RMJA 3C4UA 3MO7A 5D2XA 1THFD 1WXJA 1S5WA 3ABOA 3KX6A 3S5NA 4FO4A 4Z1DA 4S1FA 3M5YA 3LRLA 2BSLA 1OFDA 1FWWA 3NQFA 4GJ1A 1FCBA 2I14A 1GVFA 4QJ1A 2B7PA 2WV8A 1WYIA 4LUIA 1HO4A 3TKFA 5FESA 3JS3A 3L21A 3CEUA 5I3IA 2E6FA 3TMLA 1SSDA 3P5YA 4G1KA 4FX7A 4XKYB 4A2RA 2Y6ZA 1O60A 1QR7A 2VFFA 1JVNA 1ME9A 1OX6A 4QSHA 3NL2A 3QSTA 1OJXA 1XCFA 5C55A 3HG4A 3W1NA 4DELA 3NQEA 1OK6A 1TPWA 2FTPA 5DBUA 3KRUA 4OHQA 3SGUA 1ICQA 1YDNA 2VENA 3P74A 1DJQA 1AL8A 5HJLA 3W6YA 1XBZA 1W8SA 3GR8A 3LDVA 4BWLA 5CKSA 1Q6RA 2Y89A 1HO1A 2OX1A 5DCBA 4RZ4A 3EWWA 4AHPA 2CWNA 1FWSA 2RDWA 4JTTA 5HWJA 5I3KA 2Y88A 1TMHA 3G1YA 3TAKA 3TC7A 4O1CA 3G0UA 4RX0A 4MVAA 5CZSA 3FEMA 5D02A 2AAMA 3LHYA 1TCDA 1LLZA 2QCCA 2YX0A 1L6YA 3C2RA 3NL3A 4O1DA 4MZ8A 3NPVA 4BFAA 1W3TA 2BX7A 4YCOA 1O5KA 1BTMA 2AQWA 5KZDA 1LOSA 4M6QA 4AH7A 1W5MA 5DY2A 3M43A 5AOUA 2ZZ1A 3HB9A 5T26A 4KFPA 3EKZA 4WJEA 3GAYA 3W1LA 4X3ZA 2E09A 4AMAA 2YR1A 5CPNA 1DVJA 2P1FA 1VCGA 4H3DA 3PY2A 5KITA 4A29A 3ABRA 4L4LA 4I9AA 5CPMA 3ABSA 4HNVA 4NZFA 3B0UX 2VFDA 3QYQA 3TUUA 4IQLA 1LOQA 4JDYA 1C8VA 4LUJA 3GDKA 5K9CA 3PBUA 2LLEA 1XBVA 3PF3A 4ZQMA 3A22A 1PS9A 3LHZA 3TFCA 2CLMA 2V0TA 2GQ9A 2C16A 1KW1A 5I3GA 5DN1A 2WSRA 3IEBA 1Q6QA 2PC4A 1UB3A 2V2CA 4EVZA 1B4KA 1VQTA 2RDTA 3HPZA 2YCEA 3THQA 4NNAA 3GYEA 5F2GA 4XQ6A 2ALDA 4K6AA 2ZTKA 1EIXA 1LYXA 2C6QA 4JD4A 5AHIA 3FA5A 1EEPA 1G7VA 1NVMA 4DF1A 3LV6A 1FDYA 1FWNA 2QJIA 3WFAA 1SUXA 2DZXA 2WSQA 3H53A 5HUOA 1QPRA 1KFBA 2CFFA 2JK2A 4U4MA 2Q8ZA 1H51A 2FPTA 4XBKA 3NG3A 4R53A 2FFCA 4ZZ9A 4UTTA 1R2RA 3PBWA 5LZLA 2JBMA 1R2TA 3N9RA 3S9YA 2CZ5A 5EMUA 1Z42A 1VC4A 4XUGA 3KVJA 3BARA 4ZQPA 1YTEA 3G0XA 3N2MA 1KV5A 1L6SA 1TYGA 3GIYA 5D33A 1O4UA 3BW4A 4MY1A 4NT0A 1Q45A 1GVRA 4FNRA 1A5BA 2B7NA 3LXCA 3C8FA 1PVNA 2A4AA 1KTCA 3OBKA 2FPVA 2QCLA 4HHPA 1M7PA 2ISSA 1X1ZA 2HS8A 1CI1A 1QDSA 3S0CA 3MYPA 3MI2A 2E68A 1TJPA 2X1UA 3RLVA 3EXRA 2OT1A 2C19A 1MEWA 2X2GA 3H54A 3W7IA 3IIOA 4K7VA 4WXYA 4JTJA 5EYWA 5HNRA 3KRZA 1K7FA 1RQEA 1RZMA 2ZYFA 5FF2A 1SPQA 4WZHA 4JICA 1IIGA 2ZFAA 3W7KA 2B4GA 2H6RA 4CQ8A 1JQXA 1SO4A 3W2NA 1NF0A 3GLCA 5CPLA 4DO4A 2FQIA 3LBCA 3F4WA 2I9EA 3GR7A 3HGJA 1OVDA 1PCKA 4MOZA 3HGSA 1VYSX 4RXFA 3C2OA 4KFNA 1XBYA 3G1VA 3NQ2A 1KM2A 1GYNA 2CU0A 4E0CA 2A7NA 2QJHA 4DBDA 3TQKA 4ADTA 1XI3A 2W0UA 4EIVA 1FWTA 1WA3A 1DQWA 1SSGA 2JGQA 3QPYA 3A9IA 4UFKA 3W71A 4TIMA 3HGRA 1BWLA 4A21A 3HOJA 4DPPA 3EWZA 4YWIA 2ZRXA 4LS0A 3CC1A 3DKJA 3U2OA 1DOSA 1TPH1 4NJIA 4PODA 3NQMA 3SSJA 5DCEA 3W73A 1FDJA 4O4VA 3BO9A 2DZWA 4FNQA 1U83A 2TSYA 4Y96A 2E77A 4IJBA 4OV4A 4UTMA 4UMCA 3EX1A 4TU1A 4HPXA 3W7HA 2QKFA 4JTKA 1J2WA 5D38A 1FXPA 1VS1A 3CTLA 2PURA 1QO2A 1L2UA 2CZDA 1LM1A 1T8XA 4UTWA 4YL2A 3W3OA 5K9DA 1EP2A 1OX5A 2ZA1A 4RV8A 2Y63A 3GDTA 3CB8A 3TW7A 1GEQA 4DO6A 2O7QA 3EWXA 1EB3A 4ADSA 2V2DA 2V30A 5EA9A 3W2LA 3TV8A 1WX0A 4KKXA 3TQVA 3L68A 4TMBA 1F2JA 4LY8A 3LCIA 3MYOA 1ALDA 3KRSA 4NXSA 1WOAA 4IWWA 1GVOA 4AWTA 5J5RA 3S5YA 3IVUA 3W70A 1SFJA 3STGA 3SR7A 4Z08A 4LTSA 1VHCA 3MHUA 1EWEA 2NXHA 1EPXA 2VEMA 3NQDA 4IMGA 2NXIA 1TV8A 3UY8A 1QCWA 4KWVA 1NSJA 1FDZA 1XKYA 3QFEA 4IXXA 1OYBA 3JR2A 1KFEA 1IIHA 5LGXA 2B0MA 3TW6A 4O10A 4GC4A 3NNTA 4PFMA 4IPIA 2QCDA 2VEPA 3DFSA 5HUPA 3CWNA 3HPSA 3QQ1A 1XUZA 3LCWA 3NPUA 4PH6A 4GBUA 1OFAA 2CZEA 1G4SA 3W85A 1OFEA 3G1SA 3L5MA 4RJEA 5H91A 1ZALA 2WO5A 3WJZA 1YPIA 3K30A 3C2EA 3DKLA 3LTSA 5BRBA 4RK8A 1MO0A 1X6UA 3MMTA 3M47A 1EP3A 2D73A 1G4PA 2VC6A 3GB6A 3NQAA 5D2WA 5LNSA 3VFLA 2J27A 1ZY9A 2HSAA 5FF0A 1G4TA 5D30A 2E5DA 5CSRA 1FCVA 4OWGA 2ZRWA 1T96A 2Z6IA 1XXXA 3FKRA 3PVFA 4WUIA 5U4NA 1OABA 1TPC1 1I2QA 3SGZA 3W72A 4EOUA 3M6YA 2ZZ3A 3N14A 4M19A 4M6PA 5DLCA 2XN1A 2Y7EA 2WQPA 4XKYA 3TA6A 2ZQ0A 4CNPA 1LDCA 3BV4A 1TPVA 3PM6A 3LBMA 5LHEA 1C9DA 1ONRA 3W2UA 1TTQA 4E2BA 5AFDA 1DORA 4BI5A 3DU0A 3P7YA 2CLFA 4RXGA 2Y7FA 3CQ0A 1YADA 5F2MA 5HWNA 2ZZ7A 3VE7A 4MPQA 1GVQA 4JIPA 4ZQOA 3L65A 1I2PA 5G1TA 1A5CA 2FLIA 3RU6A 2DZTA 2WNNA 3LHVA 1PL9A 4ORMA 2C0AA 4OBTA 3BGJA 4QIUA 3F4NA 4ML9A 2ZDRA 4K36A 5F4SA 1ZAIA 2WNQA 2TRSA 4N2YA 1SZGA 3O6CA 2YDAA 3TJLA 1UBSA 3DHDA 5FF3A 3GDLA 3EKLA 1IXPA 3C61A 3MUXA 4N02A 3T4CA 4HPJA 1O94A 5HMSA 3E12A 3W7LA 1LRNA 1LBFA 3STCA 2QCDB 5CG7A 2QAFA 3W7NA 4CNNA 4NJKA 1QWGA 4N9BA 3EWUA 1TV5A 2G95A 3LM7A 3O8AA 4UFHA 1HFBA 3TSMA 3N2XA 5D32A 1TREA 4ZL1A 2ABAA 1ADOA 3VI2A 1G7UA 4IGHA 4O15A 2EAWA 1U5JA 1MEIA 2VEKA 3SY5A 5ABTA 1K03A 3UD6A 2RFGA 4LRSA 1TRIA 1S5VA 3PB2A 3W9ZA 3L2IA 4WD0A 3SJ3A 4O4WA 5K2ZA 1LZOA 2HMCA 5C6MA 1UJPA 2H8ZA 1XFBA 2A2IA 2CLLA 2A1YA 1O95A 2B7QA 1OFBA 4IMCA 1H60A 3NEVA 3GZ3A 5DCDA 2HS6A 3UWUA 4DQWA 1TSIA 3MBFA 1KM6A 4IX2A 3TAOA 4N9EA 2JGYA 2Z0IA 1I8JA 4O28A 1MXSA 1ZFJA 1JCLA 1OG0A 1GT8A 1Z41A 1ZHAA 4DBEA 1EX5A 3HGOA 3G24A 3L5LA 3RFAA 1XC4A 5LHFA 3TXZA 5EPDA 1BKSA 1G67A 3QQ0A 2G5WA 2QUTA 1F7BA 1L9WA 1F73A 3TROA 1FXQA 3LGEA 1KFCA 1P5BA 1RQHA 3WJSA 1SW3A 3UZ5A 4HKPA 3TH6A 1GG1A 3W87A 1MEHA 1UUMA 3EXTA 3O1NA 2GVLA 4FNTA 3G22A 3FJ6A 4MJZA 3WK2A 1FUYA 1CW2A 4AHQA 1OFRA 1PCWA 2NUYA 2FJKA 4LT9A 2OT0A 1Q6LA 4WOQA 5HQEA 1X7FA 3WJWA 4H4IA 3BW3A 3WK3A 3SFKA 1AW5A 1TO3A 4LNYA 3HG5A 3GKAA 2BXVA 4JX5A 5AC7A 3KXQA 4O0KA 2GJLA 2X1SA 4ICNA 3S42A 3UXAA 3LXBA 3W1XA 3PS7A 4O19A 1NAL1 3W1TA 3TSBA 4AWUA 1I45A 3W1PA 1DQXA 3UQNA 4FX6M 3W1AA 3MP5A 3C2VA 3D0CA 1W5PA 3T55A 1I2OA 4UR8A 4AVFA 1QMLA 4JTGA 3EX2A 2BTMA 4JR5A 5C2XA 1GTEA 4OE7A 2EGZA 3PUOA 1GWJA 3QRHA 3BLEA 3KFTA 3CM4A 3G18A 2J9XA 3NO5A 4A3UA 1LRTA 1ZENA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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