2B81A

Crystal structure of the luciferase-like monooxygenase from bacillus cereus
Total Genus 106
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
106
sequence length
317
structure length
317
Chain Sequence
MEKFANHFGYNRMFAKDQLTLGVHIPIENYQFHAPTMEKQVELVQKAEQYGFTGVWLRDVLLQDPDFGDPATGQIYDMMIYLTYLASKTEKIAFGTSATVLSLRHPLRVAKEIATLDQLFPERIMLGVSSGDRRADFKALGVSHETRGEKFREAFAYLEEILYKNFPSIQSTLGEVHGANLVPKPSKRVPTFITGFSQQNMEWFAEHGDGWMYYPRSPVHQAGAIGQWRELVEDYHPDVFKPFIQPMHLDLSEDPNERPTPIRLGYRTGRKALIELLDIYKSIGVNHLFLALFDGQRPADEVLDELGEEVLPHFPAL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of the Luciferase-like Monooxygenase from Bacillus cereus
rcsb
molecule keywords Luciferase-like monooxygenase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Bacillus cereus
total genus 106
structure length 317
sequence length 317
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.-.-:
pdb deposition date 2005-10-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00296 Bac_luciferase Luciferase-like monooxygenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.30 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Luciferase-like domain 2b81A00
1NQKA 3RAOA 4J2PA 3B4YA 1M41A 1XKJA 1TVLA 2B81A 1F07A 3B9NA 5AECA 1RHCA 1EZWA 1BRLB 1BRLA 1YW1A 1NFPA 4US5D 1FVPA 3SDOA 3B9OA 2I7GA 5LXEA 1LUCB 1LUCA 3C8NA 5DQPA 1BSLA 4UWMA 3FGCB 3FGCA 1Z69A 4US5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UT0A 1GEHA 5T26A 2PDLA 4MZ8A 2HPMA 4UNIA 3H21A 4H7CA 3NO5A 3GW0A 2W61A 3T44A 4BZYA 5HJXA 2FVLA 2HPIA 1Q6CA 5BU9A 3RM8A 2AKMA 2C3ZA 1E3XA 4PMOA 1V6WA 4ZXLA 3JRKA 1S3TC 4LNYA 1OC6A 4QHRA 3UF9A 4BEUA 3G6MA 3FYPA 3NGFA 4IMGA 2UZ9A 1KFWA 3ES7A 2G8ZA 2WHKA 1AH0A 1TCMA 1BQGA 4IISA 2A1YA 4Y8FA 4YMZA 4DUXA 1AL8A 4C5YA 5E9XA 5D30A 4H9YA 1HJQA 3KFTA 4J9JA 3THDA 3BZJA 3ZJKA 3W86A 4DHGA 5A8OA 5AC7A 1TV3A 4UQEA 3IAQA 3F7JA 4ENLA 2OU4A 1O4UA 3SAZA 3G8EA 3FVMA 1TPC1 1QI4A 3M5ZA 4QFUA 3PWAA 3OBKA 2OSYA 2WMJA 3K1GA 5AC4A 1EHNA 2W5FA 4ZTYA 5I79A 4HHMA 2J78A 4YNGA 3W37A 4WY0A 4XZ9A 3CAVA 3ABOA 2PDWA 4OFCA 3BSGA 3FDGA 1XYBA 4TR9A 1R47A 4XD4A 2XIBA 4Y8EA 1QNQA 2I17A 4WKHA 3GC5A 4NXSA 4HMNA 4CVWA 1XYFA 1KGUA 2CLKA 3W9ZA 1J11A 2Z6IA 1BTCA 1B3YA 4MB4A 5CSSA 2WQPA 3T8QA 1V3IA 1NDWA 4LF2A 1O7AA 4W9TA 2CBIA 1AUSL 3N73A 3RN6A 2WKJA 3GUGA 3C2OA 3HM7A 5HA7A 1FVPA 3OZYA 1X38A 3QY8A 4M81A 5MHBA 4YS1A 5FJJA 3I6TA 4JL2A 4X3ZA 3RF9A 2WVTA 1C3FA 4LY8A 1SZFA 3DOPA 1T8QA 2QHAA 1VYRA 4M51A 1ZGDA 3UY7A 4B3ZA 1U2YA 1DHPA 3KCOA 3GTHA 1D7KA 2GDQA 3QR1A 4J3ZA 3M6DA 4GJ1A 3OPSA 2VGFA 1ODUA 1VPXA 4ZZ9A 5L9FA 3EDJA 3E49A 3NXLA 1IGSA 1KCXA 1S2VA 4NI3A 3TYUA 4AEEA 1UWSA 3LK6A 1XICA 2GZXA 1WCGA 1NIUA 3C2EA 1JCJA 3DENA 5F4XA 1JJKA 1XBZA 3R89A 3B9OA 4H7ZA 2CLLA 1OY0A 3A22A 4J3UA 4TX6A 3M5VA 2FHBA 3B8UA 3MWCA 4D1IA 4Z2HA 3A23A 1V03A 3CMJA 3H55A 3TC6A 1FCUA 2IXUA 3W7HA 2RFGA 3SRFA 3HPAA 1X8FA 2DH2A 2FFIA 3CO8A 1JFXA 4X60A 4PC8A 3W2LA 1G4PA 5DT5A 1G5AA 3EX6A 4IUOA 4RE3A 4CD5A 1VBJA 1B9ZA 3VZZA 3S1WA 4LS2A 4JXCA 4GH3A 3GVQA 1FHUA 3C52A 4J3VA 1SFTA 5CZTA 1UQYA 4NT0A 5F2LA 4KH2A 4WKFA 3EMCA 1NF7A 1JRBA 3ZLGA 3IACA 1V93A 4NJGA 3MSYA 4EP8C 5DX7A 2Y2WA 4CEUC 1OGGA 6A3HA 3B8DA 3VNKA 1FWWA 2V2CA 3PPFA 2XTKA 3PY2A 2NW0A 3SCSA 3MP4A 4AF0B 3RCYA 3C2YA 2FFCA 3EAUA 1HKKA 1MW1A 4PULA 1LBLA 1F3EA 2NVAA 3PN8A 1SO3A 3N9KA 5I3HA 4PTNA 1R9YA 2R82A 3WLLA 4ILSA 3A4JA 5JIWA 4ZQPA 3ARWA 4N9EA 4AW7A 3GC2A 3MCNA 4PTMA 2J74A 3HQNA 3SGGA 2PWDA 1IT7A 2B31A 3UVIA 3MKVA 1I6NA 5B7ZA 5ABFB 1JZ5A 3BV4A 1XFCA 4PTWA 5EY5A 2ISSA 3W3OA 3U7VA 4KFOA 3V4BA 4AIOA 2PZNA 2ESCA 3WLOA 3GVVA 4LANA 5DY3A 5FACA 3NCOA 4GMEA 3P8IA 3I7RA 1V51A 3GAYA 3G5EA 3AU2A 4HCHA 3V7PA 2FPTA 4C6PA 3M16A 2WSYA 3L4YA 1G9HA 1ESWA 5BXSA 4NYYA 3MDUA 3L23A 4RDZA 2DZPA 2OQHA 4JTSA 2Y70A 4WJXA 4XAFA 3CUXA 3OLIA 5C2XA 2EXOA 2E28A 3MB9A 5TAOA 3OA3A 3QV7A 4TU1A 1UIPA 3MBDA 3BAIA 5CGQA 1NP0A 1M7PA 4A8RA 1UR9A 4DWSC 1PUDA 2O9RA 4JAWA 1LWJA 1M65A 1TUXA 3LN3A 3OGRA 1DTUA 2WLZA 1R87A 1H09A 2X7WA 3KHDA 2WZEA 2HVOA 1W3IA 1ZHAA 3AMCA 4J28A 1HF6A 1MEHA 2Y6ZA 3H23A 3IRSA 3B3DA 2CYGA 4UWMA 1HIZA 1XS2A 4C6CA 1W0MA 1QI5A 3G1SA 3SY1A 1LL4A 3CPUA 1NFGA 5EU9A 1FHLA 5CGTA 1F73A 3FJ4A 2W66A 1QOQA 2G95A 2XGZA 8A3HA 4DJFA 1W3TA 3IJDA 5K7JA 4TVUA 3NQCA 3VKAA 3VE9A 1KM0A 4EPDC 4PUKA 1IEQA 2HRWA 3BLLA 3OVRA 1VFUA 2XSBA 3W7CA 4DJFD 2PDJA 2X05A 5I02A 4BQ4A 4LBUA 4LUSB 2YCEA 3IUHA 5AYIA 2JGQA 1L8PA 3W6MA 3H4WA 2E0PA 2ZRWA 4UFIA 3CL7A 1E72M 1XLBA 2OODA 4N42A 5A2AA 1EKOA 3WDQA 2RDXA 4HK5A 5KZEA 2EQDA 1UHVA 5TBOA 2BLEA 3EDFA 1MWOA 4CU8A 4TX9A 5FF4A 1LQ0A 1CIUA 3BPWA 1R3SA 3RR4A 4HNCA 2V67A 3LGGA 1XDLA 1IZJA 4JTKA 4GYPA 3S5YA 3B0PA 5D2YA 1BHGA 2PC4A 2YDQA 1QK2A 4AZCA 3PZQA 3LPFA 1R30A 1UW9A 3UGRA 4ZO6A 3BAWA 6CGTA 1GVEA 1KLYA 2C19A 4GH1A 1F9CA 3DYPA 5I0DA 3S0CA 4JBRA 2BODX 3S2NA 1WXJA 2VEPA 1E6RA 2XJ7A 3STEA 2ZA1A 1D8CA 2WNQA 4MKVA 3B0XA 3V0TA 1AD1A 5HJYA 3QC3A 1XJBA 4GUGA 3UJEA 1CB2A 2YDAA 3URBA 2PTYA 3LYEA 1VCVA 4O57A 3HGRA 5I78A 2NV9A 3VMOA 1BD0A 3GG8A 3K8LA 4BI7A 2CCRA 1SJCA 1VHCA 5FJIA 1ZNNA 2QCHA 4LWWA 4WKAA 1MNSA 1H0GA 2VGIA 1W9PA 1TIWA 1XIJA 3NZ1A 5IBXA 1B90A 4D6DA 3R5EA 1GOKA 1GOWA 1EJSC 2XIQA 3W26A 3ATYA 3QQ0A 1JRCA 1US0A 4M6VA 1Z3NA 1QATA 1NWUA 4IICA 1HUVA 4XVEA 3SGZA 3PZNA 1GOIA 2WNWA 3RGTA 1KC7A 3SRKA 1W1ZA 3SRDA 3LHZA 1TPEA 4C6IA 3AMKA 2AMXA 2OGJA 5IFTA 1FWDC 2J4GA 3E2VA 4DX3A 3DFTA 4DNMA 2JIEA 3F5LA 5CH9A 5FF3A 3B97A 4WY0B 3G1HA 2D0FA 1F8MA 3TQPA 2V0TA 2DUZA 1PHWA 3N3TA 1RK5A 3U57A 3UBPC 3LV5A 2JEQA 1VFTA 7PTDA 3P14A 2R6OA 1HGWA 3L4UA 1B0IA 3RXZA 3D5HA 5A2BA 2EG8A 1UC4A 2PRMA 4UFMA 1HKIA 1SYTA 1EJXC 3C0JA 3UA3A 4OTKA 2VFDA 1VIZA 4G1NA 2XVNA 1YXYA 2V9DA 3GKFA 5HWMA 4ERAA 3N15A 1P43A 1BYDA 4A2SA 1XINA 3PF3A 1EP1A 3GBEA 3L0NA 4M82A 3SFWA 4BKNA 1W5OA 4MPQA 4PTXA 1A5LC 1QUMA 2WMHA 4JTAA 3SSZA 1QCWA 1YPXA 1GVIA 1VGAA 4UUIA 4GFIA 3KS6A 4GZJA 1RVGA 3N11A 2TYSA 1MDRA 5BXRA 3SJNA 1DWIM 3ZIZA 2PLKA 4S1FA 4LW7A 4L9ZA 5D04C 1WUEA 1W2VA 3FS2A 1W37A 4OKDA 1D8WA 4J3TA 2ZDSA 4NY2A 1DHKA 3GW3A 2WPBA 3N18A 3WG6A 1H3GA 3VUPA 4E6MA 4AMCA 1V4YA 3W2MA 1TR1A 2CESA 3T4CA 1IF2A 4B15A 4ZB2A 2CIPA 3G6LA 3GFYA 3LCXA 2IKJA 1EP2A 5CSRA 3VFCA 1F6PA 4JHMA 3G8RA 1TVNA 4B2DD 3U4FA 3CH9A 4QLJA 1T96A 1EBHA 4LVFA 1K9FA 2VNCA 2A3BA 3NOYA 4HU0A 1H1ZA 1SZNA 4W86A 1OSEA 3FFSA 1EJRC 2YB4A 3TN4A 2CLIA 2WSPA 1K9DA 3KBVA 3EXSA 1Q7MA 1DQUA 2PLJA 5IBXC 3W7LA 1HJWA 4AZIA 1XL9A 3EX3A 3NG3A 4NYUA 2WW5A 4YWSA 4Y9AA 3O6CA 2ZWYA 2XSXA 4UTKA 1CW2A 5AY7A 2GUUA 2VX6A 5IHRA 1JNEA 3JU2A 2MNRA 1ZUAX 1R3QA 5LNVA 1US3A 2HTMA 1W2PA 2YCKX 4IFOA 5HMDA 4DLFA 3B8VA 1XM3A 2HDJA 3W1RA 3W1MA 3UXDA 4RZ4A 2XHYA 4OUIA 1HX0A 1VCGA 2D2JA 1DP0A 1S39A 2PWEA 1WDDA 3NVTA 1K77A 1L6SA 4DB7A 3HGOA 3ECQA 1JUEA 1TZ7A 4QSHA 3W23A 4AVOA 4NAEB 4HYRA 3L5MA 5LNSA 4MUZA 1ZS2A 5BMXA 3A9IA 2C0HA 2R1PA 2ZA3A 4WX2A 4HA0A 2QCCA 1OT2A 4DBSA 3WDRA 2R1MA 1CB7B 3L67A 1GKQA 3UZZA 3UP8A 1HN1A 1VKFA 3AQUA 4XZHA 4QCEA 3AYSA 4WUIA 4QJ3B 1T8XA 5IRPA 5J8LA 4ZEPA 4QTGA 3LGDA 3TFCA 3M64A 1KRAC 4ZQNA 1JGIA 1UZ1A 3SUWA 5D05A 3BE7A 2V30A 4GX9A 3WFLA 4V1YA 3UPMA 3WLRA 4IGSA 4S3FA 1GW9A 4NZ3A 1KFEA 1L6YA 2H9AA 1OFQA 2DIKA 1KM6A 3M5YA 1H1YA 4O50A 2I5GA 1I8JA 3EOSA 2H3BA 1VR6A 1YYAA 1XF0A 3EWBX 3FJ6A 1OCNA 2WMKA 1WYIA 1EFZA 4E38A 1I0BA 3ZSTA 2X42A 3CU2A 3AIEA 5G4EA 1E4MM 2DSWA 3CQIA 4K8EA 1XIFA 3SSJA 1TV5A 2TMDA 2O7QA 4UR9A 1VP5A 3CUZA 3W2JA 3W1AA 1ONWA 3TNBA 4AY1A 3IVTA 3FLUA 3QR3A 1S2UA 2WSQA 1XBVA 3ISIX 3BICA 2X16A 2Z1SA 1RHCA 3G1RA 4OOZA 3SECA 3D47A 1Q5MA 1OVDA 2G0WA 4KT2A 4JDBA 1X7IA 2W27A 3WFAA 3MTWA 1K6AA 3BOFA 3N6JA 1TJRA 2VEIA 3UXAA 2VDGA 4B5NA 3PWIA 3B9AA 3TQKA 4FX6M 3E0VA 1SO6A 5HNUA 3E12A 1BRLA 1ZJAA 1T41A 2REQA 1UPPA 3K4DA 2DZUA 4C65A 4RW5A 4XBSA 1E9IA 4B5XA 1O66A 3NQVA 1FDYA 2DSZA 3ABZA 4V1XA 4QS5A 2BGQA 3VZXA 1GYMA 3O05A 1ICPA 2QUMA 1E0WA 3GM8A 2WC4A 2VGBA 3OVPA 4FOJA 5G1MA 2NSOA 1G0CA 3BG9A 3KE0A 4XD5A 2PRHA 3TC7A 4XVDA 2HS8A 3EPOA 2TAAA 2J8FA 2O9TA 3I3BA 2YL8A 1HJXA 3LZ3A 4ONVA 5CPTA 3NPVA 4UR7A 2NT0A 2DSKA 4RZ5A 2Q8XA 2F6KA 2PDFA 3LERA 2NXGA 4PEEA 4UTWA 3HQOA 1YX1A 2PFHA 1L0PA 4HOWA 1KCKA 1PX3A 5E70A 1PZ1A 3U48A 4U33A 1DJNA 2FTYA 1R3YA 4JNYA 4QG6A 1KBKA 3ABRA 2HV5A 3T78A 4AB4A 4AZCB 3GVGA 4ZE5A 3NR0A 4Z08A 3FJLA 4EXAA 1TTJA 3M7SA 4FXJA 3QXBA 2ISFA 4F2BA 3WMBA 1U5HA 4GBDA 4AYGA 3RRXA 5FEXA 5MKGA 1JCTA 1VYSX 3BAKA 3OQEA 4LVDA 1FWCC 4Z2JA 2FGBA 4NJIA 1P6WA 1A53A 5G1YA 5G2IA 4N9CA 3HBLA 4KRUA 3WQOA 1WUFA 3H2EA 3ZOAA 4JS3A 3KAOA 2CZVA 1QPKA 1LBMA 4HJWA 4XIAA 4GY7A 4FNTA 2I5QA 2XFYA 3THCA 3KTSA 3LRKA 5GVJA 3PZTA 4LX4A 2E3ZA 4OWGA 3LMYA 3WMLA 4MB1A 4H00A 1AVAA 1DEDA 4CUCA 4ZOBA 1RUSA 1E1EA 1W9DM 4XQ6A 3IAPA 4JOMA 3BAJA 2RDTA 5HANA 2BP1A 2NWSA 3MV11 4W5ZA 4ATDA 1C8VA 2QKFA 3A9BA 3RRAA 4L9XA 3EWWA 3MI3A 1UWQA 1EC8A 4B91A 5HBFA 4EPEC 3VD9A 1K8XA 3PJXA 1UUOA 3N19B 1Q4NX 1U1HA 3TVAA 4AZBA 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