3HV9A

Crystal structure of fimx eal domain from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
261
structure length
261
Chain Sequence
NPAEELAAAAQRGDVIAILQQALETNSFRLLFQPVISLRGDSHENYEVLLRLLNPQGQEVPPAEFLHAAKEAGLAEKIDRWVILNSIKLLAEHRAKGHQTKLFVHLSSASLQDPGLLPWLGVALKAARLPPESLVFQISEADATSYLKQAKQLTQGLATLHCQAAISQFGCSLNPFNALKHLTVQFIKIDGSFVQDLNQVENQEILKGLIAELHEQQKLSIVPFVESASVLATLWQAGATYIQGYYLQGPSQAMDYDFSSG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural analysis of the GGDEF-EAL domain-containing c-di-GMP receptor FimX.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Protein FimX
molecule tags Hydrolase
source organism Pseudomonas aeruginosa pao1
total genus 92
structure length 261
sequence length 261
ec nomenclature ec 3.1.4.52: Cyclic-guanylate-specific phosphodiesterase.
pdb deposition date 2009-06-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00563 EAL EAL domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.450 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel EAL domain 3hv9A00
3S83A 3PJUA 3PJTA 4FOUA 4ES4A 3GFXA 4HJFA 4Y9PA 4F3HA 5MF5A 4Q6JA 4HU4A 2R6OA 3GFYA 3HV8A 4RNJA 3N3TA 4LYKA 4Y9OA 3GFZA 4LJ3A 3GG1A 4Y8EA 4KIEA 4Y9MA 5M1TA 5MKGB 2BASA 4J40A 4RNHA 3HV9A 3U2EA 4AG0A 3GG0A 4Y9NA 2W27A 4F48A 3TLQA 4RNIA 3PFMA 4FOJA 3PJXA 3SY8A 4RNFA 3KZPA 4HU3A 4AFYA 5MKGA 4FOKA 3PJWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KRUA 1O66A 5KINA 4GLEA 3WK2A 1H4PA 1FXQA 1XYFA 3SADA 3L0NA 1OCJA 3KP1A 1UD2A 3B8UA 1XL9A 3SW6A 4EPKA 5BZAA 4PBGA 3Q58A 1E4LA 1BSLA 4UQCA 3GR8A 1Q6QA 1E1CA 3HG4A 3S1WA 4IFOA 1YDVA 1EEXA 1ONWA 3V35A 2EPNA 4R88A 1GVIA 4NAEB 1ZJBA 2IQ0A 1TUFA 2G41A 2ZC8A 5DELA 1XGDA 3VCRA 4GQQA 3N4AA 3HPSA 4QDWA 1FOBA 2ZE0A 3DAQA 4OECA 3WFAA 2NSOA 2EQDA 2OOGA 1OABA 4CNNA 4OWGA 1IIGA 3UR7A 4F48A 4H6EA 2F84A 2X8RA 3BANA 1X39A 4PGLA 3BV7A 1JZ7A 1H11A 3TCSA 2XFRA 3TH6A 4PUKA 5DT5A 2Q6ZA 3G1XA 1JUEA 3W02A 4EIVA 3MMDA 2WNWA 1WCGA 5AYIA 1M53A 4MWAE 3OPSA 4E0CA 4F2BA 1XG4A 3H12A 2YCEA 3BCFA 1LQ2A 3MP5A 2IPFA 2CZEA 1C90A 2O55A 1WOBA 2VDHA 5FEZA 4O1FA 3CV2A 1NFBA 4X0NA 3S8HA 3RLUA 3P8IA 4DBWA 2PLMA 4E3VA 4WDTA 3S0CA 3E0VA 3E12A 2ZX6A 2V3FA 4B5NA 1WO2A 4EX4A 1SMDA 4N7QA 2BOEX 1JFXA 2W63A 2D2OA 3GC2A 4J3TA 4CUCA 1CYGA 3UZ5A 4KBXA 1SW3A 3GU2A 5F4WA 2P8CA 4GH3A 1NP0A 3S83A 3GFXA 4XSMA 1C7SA 4W9TA 3H7RA 1S39A 2P50A 3ARXA 5IM51 2HBXA 1CCWB 2TYSA 3AISA 3GW0A 3W74A 4XVEA 1UH3A 3LOTA 3PZNA 2NV9A 3EDEA 4AMCA 1TMLA 1PKMA 3MJYA 1WKEA 2AGKA 3GIYA 2QV5A 3R8GA 3VNLA 2GQ9A 1EH9A 3W1AA 3URAA 2W9MA 3GXTA 4RDVA 4A3QA 1KWKA 3K2GA 5H8PA 3W7PA 2VXNA 4H9TA 1GJWA 3VGEA 3BGJA 4GK8A 4KERA 3IV8A 4UZSA 1PX8A 2BHYA 2ZDSA 5KEZA 2FDMA 1IR1A 2G5WA 4RK8A 3BSGA 4GQGA 3RLGA 2PTZA 4ATDA 4M82A 4Q8QA 4ZVJA 3BE7A 3H7VA 3CNYA 3FCPA 1W3KA 5CPTA 3MZNA 4ZSUA 4O17A 3QR1A 1GYNA 4NAFA 3MMTA 1KQYA 3K4DA 4GA8A 2FMNA 1R5YA 4XD4A 2WCSA 3WF2A 3FA4A 4WVXA 1Q8JA 2DJXA 2G3NA 1PV8A 1OB0A 3VFCA 4LTSA 5AHIA 3BURA 5FD0A 5BW6A 3A3WA 4C1KA 4Z2KA 1FDJA 1YW1A 2DZVA 3OQEA 3QBUA 1HKJA 2XDFA 1UZDA 2XH2A 1W1YA 5LA2A 1LOSA 1CXIA 3E96A 2GGEA 2AQOA 1CZ1A 4TTUA 3L9CA 4IP5A 3EYPA 1XIBA 3H70A 1J18A 2PMQA 3NQFA 1TZ9A 4O18A 1QI2A 1QPQA 4S3AA 2OO0A 1W17A 3W7EA 2JIEA 3UGRA 4AISA 4M6UA 3STFA 1BQGA 3T0TA 4BQ4A 5HR6A 1W1PA 2RFGA 4LEQA 4WGHA 2GL5A 2ACUA 4HGXA 2YCLB 4A2SA 3NOYA 3A9IA 3LZ5A 1UWSA 3B0XA 3LHWA 5DCDA 3ZWTA 4ACYA 2ZOXA 1VFUA 5HMFA 1GJPA 4K39A 3WD3A 3P67A 3QYSA 4Q33A 3K13A 3W22A 4DZAA 4RV3A 3A9BA 3WQWA 1QTWA 5LXEA 4GC4A 4WCJA 5CGMA 4AUBA 2V68A 4LB4A 4YIWA 3G2GA 4PCTA 2EPHA 2WMKA 1KB3A 2FVLA 1GVQA 2WMHA 2YL5A 1RR2A 1QPRA 2NLYA 4J3VA 4N9EA 2X09A 1G69A 1LQ0A 2WO5A 1FDZA 4L9XA 1YX1A 1QHOA 2BSLA 4AIUA 4D72A 4JNYA 1FWTA 2VEMA 2B7PA 1YNYA 3TYUA 5CJNA 3LSCA 1UOKA 1LLOA 2QEZA 1QNOA 2P1FA 3EB3A 4ALDA 1XIJA 1QO2A 5ECUA 3UA3A 3WQPA 1OT1A 2DT0A 3RX3A 1E5JA 3R13A 3THAA 4LGXA 2CYGA 2CPUA 2ABAA 2G0WA 1S1RA 4IMDA 1W3NA 3NL6A 1WPCA 5HWNA 2YB4A 1MRQA 1KO0A 3D3AA 4MWAD 5I79A 3P81A 3GD6A 3W1RA 1K6AA 5HNNA 3CUJA 1KQZA 4LUSA 3LZ3A 3NNTA 2F6KA 3RX4A 1L8NA 1K9TA 3P74A 3KBMA 1JR1A 4N2YA 3GNDA 3QMTA 1QHPA 4Z1YA 4IGSA 1X7FA 5EA9A 4EPDC 3R8HA 2HPIA 2WVVA 3M7SA 3T81A 1C8VA 2ZA1A 2ZE3A 4HYWA 2JGYA 3ZR5A 1A0CA 2QCDB 3UJFA 3BLFA 1UC4A 2OO6A 3VKJA 4L1XA 3WQEA 4H9XA 3O7UA 4HNNA 2Y24A 1HXJA 3ARSA 1R47A 3MWCA 4H00A 3EX2A 2OB3A 2WKJA 4NG3A 1ZP4A 1ML1A 1F8MA 2J6VA 3BW3A 5DRIA 1A5CA 4KEVA 1MVYA 3L66A 2V5DA 1EB3A 1OHLA 4TU1A 4MLJA 2WK2A 1QAPA 1O5QA 3O05A 2MUCA 2EEXA 2GVEA 2J78A 3EOSA 4H83A 3EA2A 3ABQA 3O16A 3Q67A 4IG2B 1CT5A 1RY8A 2VD8A 1J11A 3RG6A 4IFRA 3GDMA 1D3GA 3M5VA 3SN0A 2IKIA 2QAFA 3AXHA 5J5RA 4PBEA 2PA6A 1E43A 1JZ8A 4LS2A 1IR2A 2Y85A 3R89A 1K9FA 1CXFA 2QF8A 1ME7A 3T55A 1HNYA 1DJHA 1NDWA 2F7FA 2IQTA 1JDFA 4HJWA 3VO0A 4IPIA 4DJDA 3OZMA 2I1OA 4ERGA 3PNZA 4KCTA 4DJDC 1VPQA 4GY7A 1JRBA 1C7TA 3FYYA 1C8YA 3QZEA 1I1XA 1QI0A 1GQNA 3TR9A 2BFGA 1XH1A 1EP2A 3DECA 5FAGA 4ZFMA 3TTYA 2DT1A 3GXNA 1OC6A 1W5PA 4UTIA 1KM3A 4LB3A 3MCOA 1XC4A 1IXNA 4DWSD 1TG7A 1LL4A 4IIHA 4Z2JA 4ZENA 3RITA 1OFPA 1VIWA 4U3AA 1H1ZA 2V38A 4YYFA 1PX4A 1K7FA 3WO8A 1G9HA 1A3XA 1KM0A 3EX3A 1OX5A 3V4BA 1L8PA 3BLDA 4GFSA 1V3HA 2J8FA 1N7KA 3O6CA 3GTIA 4ADTA 3L2MA 3HMCA 3NG3A 4MY1A 3SQLA 2WWCA 5A2BA 3ZSSA 3CHFA 5EYWA 3MSRA 4AZ6A 2L5HA 1VF8A 3W7JA 1ENUA 4KFOA 3LLDA 2EGZA 2JKPA 6TIMA 3LNPA 1PIIA 1Z42A 5A6SA 4NSBA 2ZZ1A 4JTTA 4A3YA 3IGUA 3IRSA 4AHOA 3MUAA 3IJ7A 2OSYA 4FR1A 3NQBA 3BW4A 3M6YA 1DTUA 2ACQA 3TEVA 4GI9A 4ZB5A 3KW3A 1P4CA 3CV1A 4FEZA 3UQNA 3F5KA 3BPWA 5F2MA 1S2TA 3LHZA 2PF8A 3ARRA 4RJEA 2RJHA 3WELA 4J3XA 3HFYA 1FRBA 3DYPA 1KCXA 3WK0A 3KVMA 3S6OA 4XISA 4HK5A 4MYXA 4Y2WA 3SCWA 4MFDA 2OMAA 1WQ5A 3HTWA 1F4HA 1V6UA 1W9UA 1O4UA 4MNKA 4ZXLA 2XGZA 4XAFA 5C9ZA 3LDVA 4PUEA 4QLJA 3A3HA 3BC9A 1IXPA 2BY1A 3IGSA 2WJZA 5CAHA 2ZIDA 1BTMA 1JI1A 1V6XA 3W71A 1BRLA 2O9OA 4IMAA 5DF0A 1G94A 5I6SA 4HN8A 3GH4A 1SU5A 4E3TA 3RRAA 1E72M 1AL7A 5C2GA 2A6LA 1DJIA 1W6TA 1UR1A 3TONA 4DYKA 3SGZA 1X6LA 2E8ZA 3BSHA 4PUUA 1RH9A 3NCOA 5E6ZA 3LBCA 4YVPA 1VAHA 4O16A 4FHAA 1BWKA 4EXQA 2HMCA 3AJ7A 3DFYA 5D09A 3TNBA 1E6PA 3CIVA 4CU8A 5A1AA 2ON3A 3EX6A 1NF0A 3T2OA 3PFRA 3VIPA 1SJAA 3TTSA 2NX9A 1M7JA 1JYXA 4LUTA 4DM1A 5AHLA 4LF2A 4EXBA 2WQPA 3LERA 3C2RA 2X7VA 2KZHA 3W83A 4BFAA 5E09A 3WCZA 3E6EA 5FI8A 1ISWA 3VD4A 3T78A 4JQ2A 2WHLA 3RM4A 1L9WA 2UBPC 1EFZA 4GCXA 1K70A 3R2GA 3WJSA 3TA9A 3TMQA 3GXPA 4HK7A 4J28A 5DXXA 1WDPA 4WDXA 3QHMA 3C8NA 4RZ5A 2GK1A 2AAAA 4LT9A 1XLLA 3QW3A 4ENLA 3W1QA 3ABOA 4URIA 3C8FA 7XIMA 1GG1A 1H7NA 2VFGA 3TX9A 2WJDA 4C6LA 1J12A 1TR9A 1UJPA 3H23A 1TE6A 3C2FA 4FLSA 5DN1A 4TUFA 1MNZA 3VGDA 1W9PA 3LRMA 3NQ2A 3TP4A 2Y6ZA 4I9AA 3W37A 1LBFA 1ZAHA 2WBGA 1OX4B 4D6GA 3E0IA 4HYVA 4AC1X 1US3A 4TXEA 1D2KA 2WXDM 2J66A 1RCXB 2RAGA 4GUJA 7ODCA 2VI0A 5JU6A 1EBHA 1G4PA 1KBLA 2CBJA 4PFHA 1F5ZA 4DPPA 2HZGA 3MV01 4LANA 1T41A 5D30A 2RDWA 4JNMA 1OADA 3TJ4A 2ZUTA 4XIMA 3DC8A 3WYZA 4IMCA 4KW2A 3STEA 3NQGA 1TR1A 3MTWA 2WCAA 4L9YA 1DJXA 2PGRA 2WJEA 4NKCA 3NPVA 2XIOA 4EK7A 6REQB 3T0CA 4GXPA 1CEOA 4Q32A 3QZAA 3CBWA 4JBRA 3DKLA 1KFBA 5FA5A 2YDSA 3LTYA 3P80A 3PANA 1EXPA 3S2JA 5BXSA 5DXYA 4XO7A 2WMJA 2VVSA 5LNRA 1XYMA 3IJLA 1JCXA 3AHZA 3GR7A 3W70A 1OCNA 1UBSA 1VKFA 2C1IA 3IJ6A 2OZTA 1NELA 3WF0A 1R3TA 4JEQA 3HPAA 1NVMA 2HTMA 1I2OA 3W87A 3T4WA 3FSTA 3MU7A 2V67A 1HL2A 3QKZA 3CK5A 3B8SA 2DZWA 2AQWA 4M5PA 3IIXA 4PMVA 4E4PA 1Y8BA 4RV8A 1E0WA 1UWRA 4MUZA 3DFSA 3NOEA 4H2HA 3CWNA 4JIRA 1I4NA 4WLCA 2YL9A 4Z2HA 3BQ6A 3NPXA 3C52A 3UWVA 3UERA 2WJFA 5ABTA 3HJZA 1K7XA 1H63A 4KEZA 2ZA2A 2OKOA 3WLOA 1E1CB 2NZLA 3V16A 4LBRA 1CLKA 2ATMA 4G9PA 3S46A 1IEWA 2P8BA 2ISFA 4LQ1A 4CQBA 5CSYA 4P8UA 4JFVA 2WKLA 4F40A 3W2UA 3B9NA 4IJCA 1WP6A 2FDSA 2PDWA 1XLKA 4HJFA 4IX2A 1WDSA 4C6CA 1I6NA 3A64A 2A4AA 1VIZA 2FTPA 3WLMA 3HQNA 3N73A 1A4LA 1VQTA 2WANA 3DYMA 4IIBA 2PRLA 1UZHA 4X61A 1MRAA 2IQDA 3U4FA 2DSUA 2XFWA 2E5BA 1UUOA 2DUXA 4BI7A 3QQ1A 4KKXA 2VFFA 5CGQA 1TMQA 3ENLA 3O0KA 4X3ZA 3LTSA 1L2UA 5TQLA 5E5CA 2ZC1A 1K6WA 4KESA 4NX0A 3M0KA 3TFXA 3I3BA 4UCFA 1OSEA 5FESA 1AJZA 4QIUA 1IE7C 2ZQ0A 1UZ1A 4JQ3A 3N2XA 1MFVA 4J3ZA 3SCRA 2DH2A 2B7NA 3I7RA 3MQTA 4UMBA 1KRCC 1I2PA 4AIBA 3EDKA 2TSYA 3U57A 3A3XA 3HBLA 2YIHA 3K4WA 1BXCA 1M65A 3PWIA 4Q6JA 4R7JA 5J8LA 1H0IA 2E3ZA 2W79A 3A47A 1RXOB 3MHFA 2DSVA 2RJGA 5G4EA 4AY7A 3K8KA 3DFOA 1G4SA 1JYWA 2Y61A 2D0GA 3GDKA 2GQ8A 3QW4B 1WUEA 1X6NA 5CGTA 4DM2A 1LWIA 3S5SA 1E0TA 1ITXA 2ZZ2A 4LY4A 5DY3A 5C2CA 3TQPA 1J8VA 3R6IA 3H2AA 1F3XA 1NJJA 4LF1A 4UFHA 4MNJA 2EJ1A 2D2GA 3GC5A 4QG6A 4PMRA 4QP0A 5I3DA 3MY9A 2FTYA 4GACA 2XVGA 4IL2A 2IKHA 3BLKA 3DHPA 1UUMA 3NQAA 1PEZA 3VDGA 5A69A 3AMLA 4B5XA 3UJRA 1G4EA 3WNNA 2BGSA 4GIEA 3AQUA 2HISA 4OIFA 2QLYA 3CZKA 4E2BA 4ATLA 4QITA 4YU1A 3GG8A 4R34A 4NAFB 3H2MA 1SW7A 3GKAA 1B3WA 3NDOA 1T8QA 5GNXA 4GQ0A 3PZOA 5CXPA 1XKYA 4OKDA 3QY7A 4B5SA 2D73A 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