1HJSA

Structure of two fungal beta-1,4-galactanases: searching for the basis for temperature and ph optimum.
Total Genus 132
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
132
sequence length
332
structure length
332
Chain Sequence
ALTYRGVDWSSVVVEERAGVSYKNTNGNAQPLENILAANGVNTVRQRVWVNPADGNYNLDYNIAIAKRAKAAGLGVYIDFHYSDTWADPAHQTMPAGWPSDIDNLSWKLYNYTLDAANKLQNAGIQPTIVSIGNEIRAGLLWPTGRTENWANIARLLHSAAWGIKDSSLSPKPKIMIHLDNGWDWGTQNWWYTNVLKQGTLELSDFDMMGVSFYPFYSSSATLSALKSSLDNMAKTWNKEIAVVETNWPISCPNPRYSFPSDVKNIPFSPEGQTTFITNVANIVSSVSRGVGLFYWEPAWIHNANLGSSCADNTMFSQSGQALSSLSVFQRI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Thielavia heterothallica
publication title Structure of Two Fungal Beta-1,4-Galactanases: Searching for the Basis for Temperature and Ph Optimum
pubmed doi rcsb
molecule keywords BETA-1,4-GALACTANASE
total genus 132
structure length 332
sequence length 332
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.89: Arabinogalactan endo-beta-1,4-galactanase.
pdb deposition date 2003-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07745 Glyco_hydro_53 Glycosyl hydrolase family 53
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1hjsA00
2D22A 4W87A 1N82A 1QNPA 1OGSA 4NZCA 1ZJBA 2A3CA 1HX0A 2JE8A 4E8CA 1E1FA 4MAVA 4S3JA 3WD4A 1DWGM 2WMIA 4MPKA 5KEZA 3WEZA 1E72M 1CXKA 1OD0A 4PTVA 2WVSA 1UWRA 4UFHA 3WD1A 3AQUA 3N15A 2NW0A 1Q6EA 1V08A 3VGHA 1VFOA 4J3SA 3W28A 1MVYA 4PMOA 8CGTA 3WF2A 3MUY1 5HBFA 1W9BM 3NIYA 1LQ0A 3ARZA 2X1IA 5JBFA 1R85A 1L0PA 1GQIA 1UOKA 1XSIA 3T0DA 1QHZA 2EPKX 1VJSA 4BZYA 2XWDA 1QPKA 5A6BD 4DUWA 2J47A 1V0LA 1W3JA 3BAJA 4AZIA 1JAEA 1W91A 1E6SM 1C8QA 4W84A 1EQCA 4HOZA 3RO8A 2AMGA 5DO8A 3VNYA 3MMDA 2WLZA 5GNZA 1X1NA 5BXRA 3AXHA 2YJQA 1TUXA 1GJUA 4PUEA 2WMFA 3KL0A 4KMQA 1V02E 2FDMA 1QI2A 3UR7A 5ABEA 1JFXA 3VIIA 4FLRA 1VFUA 2X0YA 4RE4A 3OB8A 3GXDA 1V3JA 1F4HA 1V6WA 2VRJA 3DHPA 3U5YA 3ZQ9A 3GNRA 2EQDA 2G8ZA 3CHDA 1QNRA 1Q4NX 1EOMA 4CU8A 1IZJA 2ZWYA 1KGUA 2WKLA 3VX1A 2YA1A 5A95A 1TZ7A 1C91A 2XFRA 4M56A 4ML4A 5A8NA 2EO7A 3VIKA 1O7AA 1IV8A 3WIJA 1HVXA 1FHDA 5FKYA 4D6CA 1ZBKA 3ZJ8A 4P7LA 5BRQA 3SCVA 1I1XA 3VKKA 4M80A 1TMQA 1W1VA 4EANA 1GVYA 2YL9A 3CZEA 2DH3A 1BVZA 4D6HA 3GDBA 2JF7A 1JL8A 2OLHA 1SYTA 2GJPA 4W8AA 5A2AA 2UY3A 1UR2A 3WFLA 2QMKA 2WAGA 4WLCA 2XHYA 2EBNA 3ARUA 2FH8A 3ARXA 5I24A 1MXGA 1JFHA 1PPIA 3W53A 2UWFA 4AEEA 5I3DA 1CENA 2NSXA 2VQUA 2ZUNA 3AS2A 1XCXA 4AD3A 1HIZA 2J8FA 5CZKA 1F4AA 3ECQA 1V6UA 2W67A 1WDQA 2J77A 1DHKA 1MFVA 4N42A 1JF5A 3MO4A 4FK9A 4AW7A 4XZBA 1M53A 2WYSA 1JXJA 3WSUA 4QLKA 2FHFA 4AZ7A 1D2KA 3ZIZA 4GO8A 5CGTA 4C7FA 1H41A 3GNPA 1AQ0A 3N04A 3WUFA 1NM9A 3ZR5A 2A3HA 3AMDA 1CTNA 1NWRA 4CU6A 3O2LA 3QGVA 4Y7EA 3PZIA 4QP0A 4W7WA 4TTGA 2OYMA 3F5LA 2OSYA 4HPGA 3ZM8A 2J7EA 3DYPA 1Q6CA 2J75A 1UD4A 3KZSA 4W8BA 1XC6A 4W89A 3U57A 1C3FA 1OCQA 2ZXAA 2ZX8A 1BPLB 2BHUA 2WNWA 3DYMA 1UR1A 3UG4A 3K8KA 2C0HA 3CHFA 2DEPA 4C7DA 2G3NA 1J0IA 2VZTA 3EMZA 2WCSA 1UWIA 1VF8A 4XUYA 2IUZA 4DWSB 2ZUVA 1DWHM 3LPPA 3ARWA 3T0BA 3APGA 3BSGA 1C7SA 3LPOA 2JFEX 3SCNA 2BV9A 4PTWA 3VDHA 1PBGA 2OWXA 4D6JA 1VEMA 4OIFA 2WHLA 3OGSA 4WKFA 3VDCA 4F66A 1HJVA 2VQTA 1HJSA 1FFQA 2VCAA 5GQBA 3BXWA 5D9NA 5BXPA 4AWEA 4WK9A 1ZL1A 2NT1A 4IPNB 3T2OA 2JEPA 4ZXOA 4OJYA 1GOMA 3VGFA 4J3UA 4PMZA 2V3FA 3ARQA 1JYVA 1K9TA 1QNOA 2D0FA 4HA4A 4JZ5A 4Q7NA 1J0HA 4W5ZA 3F5KA 3MUAA 2G4FA 2DT3A 3ZSSA 5D9PA 4A4AA 4P7RA 3IJ9A 4D72A 4HU8A 2IXVA 1BG4A 4QCFA 3WQ8A 5LA0A 3N17A 1GOOA 5DFAA 1GHSA 3SCRA 2D2OA 1J0KA 3KWXA 1ISWA 1UH4A 4MDOA 2RGMA 4AZCA 2WWCA 3F4VA 1QI3A 2AAAA 1B1YA 4W5UA 2XUCA 3M7SA 3UERA 1LJYA 3JUGA 4AEFA 2CBIA 3M46A 1MQPA 2J74A 2ZUUA 4N0RA 4W86A 1CXIA 5D4YA 3TONA 1U30A 1UR8A 5C71A 4AZGA 4HPHA 1H2JA 3VGBA 2W92A 1K9FA 3CPUA 4URIA 2YDSA 1VBRA 3AIRA 1HP5A 5LA1A 3N12A 3VD3A 5D9MA 2O9OA 2NT0A 1M01A 1JYXA 4AIUA 2YLAA 1WZMA 1LL7A 2BVTA 1AQHA 3LPGA 2FGLA 1U2YA 2QF8A 3AS0A 1UKPA 4Z2GA 3FHQA 1DP0A 1NWSA 1A3HA 1BYCA 3BAWA 3WF4A 1JG9A 3PTQA 1KXVA 1W1YA 3PZOA 3CUIA 1W9DM 4YPJA 4BQ3A 3I3EA 1WB0A 5EB8A 3SUUA 2B31A 3K46A 4PMXA 2CXGA 2FGZA 2PWDA 2OSWA 1D7FA 2ZXDA 1J9YA 2ZUWA 4LQ1A 4E4PA 1VEPA 3DC0A 1R87A 3VIOA 2XSAA 2WPGA 4W93A 1DWJM 1GJWA 3VM7A 1ITCA 1G1YA 2G3IA 1NARA 1JGIA 2XGBA 3NUKA 5HXMA 3WKZA 1EHAA 3OIHA 3WNPA 5JIWA 4DUXA 1M03A 3AHTA 3AHYA 4X9YA 5AYIA 1EO5A 3L4ZA 7TAAA 1QI0A 4JHOA 4MADA 1E40A 2DH2A 5CG0A 5D8WA 3GYCA 2J78A 4XV0A 5ECUA 4D6GA 4W85A 2VOTA 1BAGA 4M8UA 1ITXA 1H11A 4PUDA 2FHCA 1VFFA 3D5HA 2BXYA 1CIUA 1E3ZA 1MW3A 3SEPA 3HU7A 4D6FA 3FXYA 4KH2A 1JIBA 4F79A 3WQ6A 3ALGA 3W4RA 1PIFA 4AD1A 5I78A 1CGUA 4CU7A 5A94A 1JZ8A 4TTUA 4C7GA 4ZE4A 3WQWA 4MNKA 3CH9A 4WSJA 4JL2A 3A4WA 2DT1A 3VIGA 1ODZA 2X0HA 1ZBVA 4EKJA 3FHAA 3PZQA 4OUEA 4P8XA 2GVYA 5BRPA 1ISZA 3WDRA 1VJZA 1OINA 1QHOA 5AYBA 3L4TA 1YHTA 4L4OA 2GFTA 2HISA 2O9RA 3I3DA 2D0HA 1OT2A 2VT0A 4PMQA 3EYPA 1TA3B 2VX5A 4F9JA 1CBGA 3IAPA 5JUVA 1HKKA 3D3AA 5EFDA 1JYNA 1RPKA 2XVNA 3FNDA 2WWDA 2XTKA 2WSKA 1E73M 2QMJA 4AD4A 4RL3A 3FW6A 1CLXA 1O6IA 2WMGA 1CWYA 2VZVA 4LYRA 1JD7A 4XX6A 1MFUA 3WELA 1LWJA 4FLOA 4B9YA 2VZUA 1CXFA 5CGMA 4V28A 3A4AA 3ZSTA 4ATLA 1PZ2A 4PMRA 2W4XA 3GM8A 1BHGA 3CTTA 2WVVB 1KWKA 1H49A 1K9DA 2J7GA 3WD2A 2WVUA 1FOBA 5A8PA 4NSBA 1LL6A 1GOIA 1B30A 4B3KA 3M07A 4WSKA 3AI0A 5E0CA 4PSRA 3SUVA 2WVTA 4HMDA 2X05A 3MV01 1E6ZA 4P7NA 2QLYA 4MDPA 4JCMA 3WL0A 4J27A 1GUVA 1MQRA 1E6RA 2CBUA 3TP4A 1ISVA 3DYOA 2BY3A 3AXIA 4S3KA 2A3BA 2YOCA 1W3KA 3ARRA 2CBVA 4UCFA 4AYSA 5E09A 4RE3A 1H0IA 3S6TA 3KE0A 1CGXA 1XH1A 1UR4A 2F8QA 1CGVA 2V3DA 3MMUA 1E4LA 2W63A 1CXLA 4UZUA 3OLGA 1XV8A 2O9PA 4J3WA 2XM1A 5HPCA 3RM8A 4HMCA 3MS8A 3WMBA 3WN6A 4UOZA 3AHZA 3OGVA 1FA2A 1EIBA 4GPNA 3UG3A 1BF2A 2ZE0A 5I77A 3N9KA 1CLVA 5A6AA 4U2ZA 1KWGA 1TCMA 4OZOA 5CLWA 3UESA 1NWTA 3UCQA 5I0DA 1UZ4A 2EPOA 3T2QA 1RD6A 4CD5A 1KCLA 4P8UA 1RP8A 1EDGA 2VRQA 4H04A 1MW2A 3J7HA 2GJXB 1H5VA 3WL1A 4ACZB 5FOOA 1J0JA 3A4XA 4E2OA 4IM4A 4XZWA 5CLTA 4CD8A 3L4XA 3WDIA 3I3BA 4CD4A 4DWSA 1J11A 3NSMA 1MQQA 1JAKA 3CUFA 3CZGA 4JIEA 4JKLA 1XD0A 1S46A 1Q6FA 5JBEA 2ZOXA 4FMVA 4KRUA 9CGTA 3ZO9A 2OYLA 4PMVA 1PJ9A 2GJRA 4PTMA 3EDKA 1VEOA 1UUQA 3VGDA 2BXZA 5A6SA 4CN6A 2YDQA 2WBKA 3W0KA 3WDQA 3TOPA 3WEOA 2W91A 2GUYA 5E0FA 4GXPA 4MB4A 3RPMA 5DT7A 2Y5EA 2DT2A 4KGJA 1CZ1A 4UFJA 3RM9A 1B3XA 4MTVA 1GQKA 1GVIA 4JL1A 2WLYA 1WZAA 3SCSA 2CHNA 3POCA 2VVSA 2G3JA 4UFIA 1WZKA 1H09A 4U31A 1B3YA 3GH5A 3TTSA 1B3ZA 3GXIA 4JFUA 1E3XA 4CD6A 2J25A 4TVCA 3KL5A 4QFUA 3A3HA 3CLWA 1KB3A 1JZ6A 4AY1A 4TVDA 2UY2A 2RGLA 3K1DA 3QOMA 1OIMA 1QNQA 1B3VA 3VVGA 4JFTA 4BQ2A 5A6MA 3WENA 3BMVA 1ZJAA 1BG9A 2E8YA 2EEXA 3WEMA 4D6IA 1PX4A 5I2UA 1XYZA 1W9UA 4A3YA 4IISA 1UKSA 3N1AA 1PAMA 1JDDA 2YA2A 3THCA 4J3XA 3ZR6A 1NH6A 4HP5A 2VI0A 2DQXA 1KCKA 1UH2A 1XHGA 4UTFA 1EHNA 2F2HA 4QLLA 1HJQA 5E9AA 1OSEA 1XSKA 5IDIA 2WM0A 1V6XA 1WE5A 3QOKA 4PBGA 4TXEA 1CGYA 2AOSA 1SR0A 4F8XA 4Z2JA 2CCRA 1R7AA 2BVDA 4HOXA 1KFWA 4GZJA 3G6LA 3SUSA 3CIVA 1JXKA 3WD3A 4MNLA 1GQLA 3S2CA 1QNSA 1NP0A 1WZLA 3SCWA 3AIUA 4UNIA 4AZ5A 4HOWA 4WIWA 2C8NA 1HKMA 2X2YA 3AIQA 4UQDA 2E4TA 3CZJA 1OM0A 3U7VA 3W6LA 2OWWA 3WNOA 1K9EA 1WNOA 1W2PA 2EJ1A 4H7VA 3N18A 4J3VA 4MNMA 4Z2KA 3OA5A 2CEQA 3POHA 3WY1A 2VVNA 3FN9A 3IJ7A 2DPEA 2VUYA 3MU7A 1UYQA 3PTKA 1UWQA 3F5JA 2VCBA 2BFGA 2WZIA 1LWHA 2Z1KA 4TX8A 3WBEA 2UY4A 1C7TA 4UQAA 1L8NA 4PN2A 2WW5A 5IHSA 4YHEA 2CKSA 1KQZA 3CZ8A 3WNNA 2W66A 3O6AA 2HVMA 1SMAA 1JZ3A 5C8BB 1W2VA 1XGZA 3N11A 2ZX7A 2X8RA 2VZOA 1CDGA 1V3HA 2XWEA 3W25A 4ZEPA 1TG7A 4PTXA 1TVPA 1BTCA 3VMOA 1R7OA 1BLIA 4BF7A 5D8ZA 2ZX5A 1VIWA 3EDFA 2JEQA 3VX0A 1JZ5A 4NRRA 3SUTA 4CKQA 5HDRA 4W8LA 1LLOA 3AYRA 3AIVA 4M81A 5CPTA 2D23A 1D3CA 5FL1A 1C92A 1FP9A 1ZB5A 3OZOA 4UQCA 4MJ4A 1WCGA 2DSWA 1QOXA 1VFMA 3SIMA 3VGEA 1UQYA 3W6MA 2V3GA 4Z2LA 1TA3A 5A6LA 3KL3A 4JAWA 4OKDA 1AQMA 3VPLA 5A1AA 1A47A 1PEZA 3AMCA 4MJ2A 3L4UA 5CPSA 3ZOAA 3AS3A 4Q22A 1I75A 2VNCA 1E0XA 5TD4A 3PZNA 3RJXA 1YQ2A 3M6DA 5CQ1A 1UR9A 3KEHA 2XG9A 2XVGA 2QHAA 1CGTA 2Y2WA 4PEEA 3WBAA 1OIFA 2IXUA 5EFFA 3VO0A 1UWSA 2OWCA 1C8YA 4GI8A 5AC5A 2CBJA 3K8LA 2WVVA 1U33A 1CNVA 5ABGA 1Z32X 1UG6A 1WDSA 3RILA 3ALFA 4ZXLA 2ZUMA 1HJUA 4ACYA 3AICA 5CPQA 4CCCA 1Q6DA 2VC9A 3AIBA 3HJEA 2FH6A 3DECA 1KQYA 2JIWA 1CEOA 4EE9A 4TX6A 2OYKA 2E3ZA 4YHGA 3AFBA 4H2CA 3GBDA 1WPCA 1E5NA 3TA9A 2QV4A 3WF3A 1Y7VA 1XCWA 3WQ4A 2YBTA 2O9TA 3AS1A 1V3IA 3ZJKA 1JD9A 5JIPA 1ESWA 3HN3A 1GONA 2WC3A 1BYAA 2A3AA 3WH5A 1H3GA 1GORA 3EBVA 3WMSA 4U5IA 4HZ8A 1J12A 4GI9A 5D9OA 1J10A 4L4PA 4CCEA 2YIHA 3BMWA 4UOQA 3PBGA 3VDBA 3OBAA 1WKYA 2DSKA 4AIOA 4AIEA 1US3A 1HT6A 4CVWA 2PBOA 2Y8VA 4U33A 3WQ5A 1UHVA 4JFVA 4AXNA 2CYGA 3II1A 1RH9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2D22 A;  4W87 A;  1N82 A;  1QNP A;  1OGS A;  4NZC A;  1ZJB A;  2A3C A;  1HX0 A;  2JE8 A;  4E8C A;  1E1F A;  4MAV A;  4S3J A;  3WD4 A;  1DWG M;  2WMI A;  4MPK A;  5KEZ A;  3WEZ A;  1E72 M;  1CXK A;  1OD0 A;  4PTV A;  2WVS A;  1UWR A;  4UFH A;  3WD1 A;  3AQU A;  3N15 A;  2NW0 A;  1Q6E A;  1V08 A;  3VGH A;  1VFO A;  4J3S A;  3W28 A;  1MVY A;  4PMO A;  8CGT A;  3WF2 A;  3MUY 1;  5HBF A;  1W9B M;  3NIY A;  1LQ0 A;  3ARZ A;  2X1I A;  5JBF A;  1R85 A;  1L0P A;  1GQI A;  1UOK A;  1XSI A;  3T0D A;  1QHZ A;  2EPK X;  1VJS A;  4BZY A;  2XWD A;  1QPK A;  5A6B D;  4DUW A;  2J47 A;  1V0L A;  1W3J A;  3BAJ A;  4AZI A;  1JAE A;  1W91 A;  1E6S M;  1C8Q A;  4W84 A;  1EQC A;  4HOZ A;  3RO8 A;  2AMG A;  5DO8 A;  3VNY A;  3MMD A;  2WLZ A;  5GNZ A;  1X1N A;  5BXR A;  3AXH A;  2YJQ A;  1TUX A;  1GJU A;  4PUE A;  2WMF A;  3KL0 A;  4KMQ A;  1V02 E;  2FDM A;  1QI2 A;  3UR7 A;  5ABE A;  1JFX A;  3VII A;  4FLR A;  1VFU A;  2X0Y A;  4RE4 A;  3OB8 A;  3GXD A;  1V3J A;  1F4H A;  1V6W A;  2VRJ A;  3DHP A;  3U5Y A;  3ZQ9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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