5DN1 | Genus

Total Genus 91

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	91
sequence length	240
structure length	240
Chain Sequence	MSKLELLPAVDVRDGQAVRLVHGESGTETSYGSPLEAALAWQRSGAEWLHLVDLDAAFGTGDNRALIAEVAQAMDIKVELSGGIRDDDTLAAALATGCTRVNLGTAALETPEWVAKVIAEHGDKIAVGLDVRGTTLRGRGWTRDGGDLYETLDRLNKEGCARYVVTDIAKDGTLQGPNLELLKNVCAATDRPVVASGGVSSLDDLRAIAGLVPAGVEGAIVGKALYAKAFTLEEALEATS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Co-occurrence of analogous enzymes determines evolution of a novel ( beta alpha )8-isomerase sub-family after non-conserved mutations in flexible loop. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Phosphoribosyl isomerase A
molecule tags	Isomerase
source organism	Streptomyces coelicolor
total genus	91
structure length	240
sequence length	240
ec nomenclature	ec 5.3.1.16: 1-(5-phosphoribosyl)-5-
pdb deposition date	2015-09-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	5dn1A00

3CWNA 3PC0A 3W88A 4E2DA 1PHWA 2H90A 3T40A 5ABTA 1HO4A 2PRLA 3MWAA 2V5BA 3MYPA 5F4WA 5BRBA 2J88A 1LCOA 3FOKA 4CCEA 4GUFA 2ZZ2A 3G24A 2ATSA 3DI0A 3TR2A 1TMHA 4DQWA 4X2RA 5HR6A 1SZEA 4YWIA 1H7RA 3M43A 3ABSA 5DBUA 4NJJA 4ICNA 1FQ0A 1WQ5A 2NV1A 3C61A 4RV8A 3BLFA 1PIIA 3IIPA 3W74A 4HNVA 3T78A 1LOQA 4H6KA 1RV8A 1G4SA 3INPA 2RHGA 1YDOA 5TQLA 2F84A 1VZWA 5K9DA 3CTLA 3W1RA 2JKAA 1XI3A 4YLWA 3MHUA 3TW6A 1VQTA 2VFDA 2NV2A 4G1KA 1W5OA 1DORA 3N9SA 1M7PA 3QH2A 1G6CA 5D37A 2Y70A 2FPVA 3UY7A 5IM51 1SO4A 3G8RA 4FXRA 3LCIA 4IMFA 1Z41A 3W1MA 5I3HA 3DFSA 4LVBA 5CPLA 2AQWA 4DBDA 4WXYA 4AHOA 2ZCGA 3TQKA 2DP3A 5CGQA 3OBKA 1EUAA 3W6YA 1W5QA 3GKAA 4N4PA 1VYSX 4O11A 3QSRA 3Q37A 1EWEA 2FTPA 1H7WA 4WY0A 2Z0IA 4WY0B 5CZJA 3PBVA 3O8AA 4I7WA 3GLCA 1VPXA 5LNUA 1QOQA 3CT7A 4JTGA 1KFJA 3B03A 2YX0A 4JGDA 4O15A 1XBVA 2E6DA 3W7PA 3R2GA 2HSAA 1SSDA 2WO5A 2YGYA 2C1HA 3N73A 2AGKA 3W73A 1GVQA 3PSVA 3EWYA 5C2XA 3N19B 1QOPA 2ZA2A 1VCGA 1PL9A 3M5ZA 5E1QA 2CZFA 4IPJA 2OZ0A 2QJIA 1ZAIA 3SR7A 4RZ6A 1UUMA 1ICPA 1TYGA 2YSWA 5DXYA 3RU6A 3QMSA 2BZNA 3JS3A 3MP5A 1P5BA 1XFBA 1IF2A 4CCCA 3O6CA 5HULA 5FEZA 3M1ZA 3TSMA 3W1QA 4K8HA 3GR8A 4MUZA 4NX5A 5G4WA 3W1XA 4UXDA 5DN1A 2FB3A 1YTEA 3A22A 5CPNA 4TO8A 3W1PA 1EPXA 4LT9A 1SW3A 3RF9A 4N9BA 1S5WA 3MBDA 1EA0A 1SO6A 4IWWA 3UNDA 4Z1BA 4B5NA 4Y6GA 3C2RA 3W84A 5C54A 3GAYA 1G4PA 2W6RA 3F4NA 3ZS4A 5D2VA 1OFDA 4D2JA 1C29A 4IX0A 2A7PA 4IPIA 2Y7GA 3MBFA 1LBFA 2Q8ZA 2PRMA 3IVSA 3GAKA 1YADA 1XDMA 3RLUA 1L6YA 1OYBA 3P81A 2DZPA 4WZHA 2R94A 5KZMA 4K36A 4RXFA 1TJRA 3DFOA 4GUJA 3TXZA 1DQXA 1P0NA 3LHWA 3CB8A 3PS7A 4GBUA 3L21A 5BOOA 1FDYA 2YFOA 4AWUA 4QQ3A 2G96A 3W7IA 2V2HA 1T0OA 3BW2A 1JCYA 1O5XA 2I14A 4K38A 1JUBA 4QNWA 1TPWA 4N6EA 3HG4A 3L0NA 2ZZ4A 2NWRA 1TO3A 3LRKA 1AL8A 3PUEA 3QJAA 2CLFA 3QW3A 3VKJA 3MHFA 3FLUA 1VCVA 3GKFA 3LI1A 3ABOA 3UWVA 5D05A 5MHBA 2R91A 3HIJA 3NQEA 4UFMA 3SW6A 1YLVA 2BX7A 1SW7A 3CEPA 1F2JA 2CZEA 3LRMA 1WV2A 3O15A 2NX1A 1K3UA 2Q3RA 1VCFA 3S1WA 1FXQA 1W0MA 4JY9A 1HL2A 3PAJA 1R47A 4M6PA 1TRIA 4OBTA 4AMAA 4YCPA 3KHJA 1NSJA 4TU1A 3RMJA 1TSIA 4LC6A 3MW7A 2YW3A 4EIVA 5EMUA 5LSMA 3W76A 1ZCOA 4WQ6A 1PCKA 3P67A 1WXJA 5F1UA 3EX3A 4K7VA 4J9JA 3ELFA 3TDFA 3TC6A 3B8DA 4L4MA 5CZTA 4Z1AA 1OFRA 2J9YA 4HHPA 1M5WA 2CW6A 1GVRA 4NZJA 4JS3A 3G0XA 1HUVA 3M7WA 4EF9A 3U6WA 3C0JA 4Y9AA 1QO5A 3DHFA 2A0NA 5AHEA 3LBMA 1DJQA 3MMTA 1H62A 3C2VA 4N2YA 4WXZA 2A7RA 3M5VA 3MP3A 4JTFA 4X9SA 2B0MA 4FX8A 3O6DA 2E5DA 5DCBA 1Z48A 1LM1A 3BW3A 2C16A 2QCNA 3O06A 1TQJA 1MEHA 3DFPA 2W0UA 4E38A 3ATYA 5D30A 2Y7FA 1QAPA 3UWUA 3M5YA 4MZ8A 3TJLA 4GE8A 4UTJA 3UPBA 2H3BA 5BW6A 4JIPA 5DLCA 1PE1A 1OFOA 1S5TA 4OV4A 1ZAJA 1MZHA 4GFSA 5KMYA 3W7MA 3W87A 4IX2A 1WAUA 1OX4B 3CWOX 1BWKA 5L9FA 4MYAA 3NEVA 3VE7A 4A22A 3LCLA 1VRDA 1FWSA 2HS6A 3SI9A 4ZZ9A 3ZR4A 1FCVA 4NVTA 3B0UX 4O16A 1Z42A 1GYNA 2BLEA 4CQ8A 1D3HA 2B7PA 4O53A 3NPXA 1V5XA 1UUOA 1KTBA 3DKLA 3O07A 1X7FA 3DZ1A 2VFGA 1ICSA 3LHUA 2X1SA 1ZJIA 1W54A 1SU5A 3LLDA 4M19A 3OVPA 2RDUA 4UTMA 1UCWA 3CPRA 3HOJA 1KFBA 1H7NA 2IQTA 3QYQA 4A29A 4AF0B 4DF1A 1ZY9A 3N14A 3W7NA 1TPVA 2V0TA 3L9CA 5FF2A 3RK8A 1T99A 3W1UA 1YTDA 2ZA1A 3SIZA 3THQA 1QR7A 1GG0A 4LS2A 3MI6A 1VYPX 1WOAA 5FF4A 3UWYA 1ICQA 1GTEA 1LTDA 2NXHA 3FFSA 2YPIA 3FKKA 3W1LA 1B57A 4LUIA 1KM0A 5I3GA 4UR8A 3NNTA 3P7YA 5EBUA 1LOSA 3SSJA 4Z0JA 1EEPA 3W9ZA 1FWTA 3BGGA 3W1TA 2O7QA 5G2HA 2G95A 3P5YA 4MVAA 4N02A 4ML9A 5KZDA 3EEGA 1IXPA 3D0CA 5D33A 1TPFA 3V75A 1N55A 3QC3A 4RJEA 5KTLA 4OE7A 1SFJA 1TPUA 5CSRA 4EVZA 1KM5A 4LY8A 4EWND 3UZJA 5HNRA 5EL1A 3L5MA 2GQAA 4Y8FA 2QCDA 4O19A 2RKXA 4OT7A 1GWJA 4Z1CA 1LZOA 2VFFA 1F6PA 4TMBA 4IMEA 1IXNA 3WK1A 5AOUA 5CPMA 1R2SA 4LW7A 3R12A 1G7VA 5DBTA 2ZQ0A 5FESA 2H6RA 3L65A 4LU0A 1UASA 4CNNA 2FJKA 3QQ0A 3GK0A 2V9DA 5D2XA 5LNRA 4IQLA 4BI5A 4MY8A 3L2IA 3BO9A 3PBWA 1TREA 3VCRA 5H2ZA 2X16A 2CLHA 1H61A 3C52A 3G0UA 3KX6A 4QJ1A 1FUYA 3TKFA 1FWWA 1OX6A 1RQBA 2NZLA 3BARA 1W1ZA 1I4NA 2WKJA 4UTIA 3UXAA 4JYEA 4FIRA 4ZQCA 5EPDA 3L5LA 2QUVA 5HJLA 3DI1A 3STFA 1VYRA 5G1YA 2ALDA 3IEBA 3I7QA 5F2IA 1TTIA 1VLWA 3EX1A 3P61A 1T96A 3DKJA 4ZQOA 1I2PA 3QSTA 1UJPA 3C6CA 4K7YA 3AJXA 4UFIA 2Y88A 1SZFA 1TPDA 5G1TA 4FX7A 1OK4A 3GDLA 4LVDA 1TQXA 1Q45A 4PA8A 2V2CA 3OVRA 4XTDA 3WJSA 1WBHA 4MY9A 4JTJA 4NJIA 2JGYA 2DZSA 3S1UA 4P2VA 2WNNA 4JTTA 4MZ1A 3R5EA 3S5OA 2DU2A 3PG9A 4NNCA 2Y85A 3NQ7A 5EYWA 3ABQA 1HO1A 3A21A 3IGUA 4U28A 2JGQA 2D73A 2VELA 4O0KA 4O8RA 2BWGA 1CX9A 4XWUA 2TMDA 3P8JA 2AAMA 5DELA 2QUUA 3EXSA 2ZDRA 2NXIA 4IMGA 2B7QA 3E49A 4C1LA 2RFGA 2QCLA 4UR7A 1K7XA 3G1AA 4XKYB 3F1QA 3MYOA 4O52A 1C8VA 2Y61A 3LHZA 1KBIA 4BI6A 5H91A 3LXBA 4FB7A 5K7JA 4N6FA 3KVJA 5F2LA 4Z08A 2B7NA 3LM7A 4OWGA 1KTCA 1TTJA 4RZ4A 3NXFA 1DOSA 3QPYA 4JX5A 1CW2A 1FWRA 1AW1A 4Z1DA 2JK2A 1BWLA 1F74A 3A23A 5GVJA 3UZ5A 5D02A 5D03A 5I3FA 4HNUA 3STGA 1ONRA 3S5YA 4JTIA 3GDKA 1R2RA 3GXPA 2VFEA 3NL6A 3NQGA 2WOQA 2B7OA 1B3OA 3I65A 4KWVA 3G1SA 2WSYA 4IMCA 1F05A 1TV7A 2GVGA 5IBXC 4DBEA 5AHMA 2RDWA 2YFNA 4ORIA 2Q8LA 4NUWA 3G1VA 1W5MA 4O50A 3HG3A 3W7EA 2EAWA 5AFDA 3E96A 3YPIA 1KM1A 3W7RA 1S5VA 4FEZA 3TX9A 2I1OA 2ATMA 3PSWA 4LWWA 3MI2A 1M6JA 1YXYA 2JKPA 3GYEA 2A21A 4R33A 3QF0A 3P84A 2GJNA 3EKZA 3DU0A 5FI8A 5AB3A 5F4XA 3EWZA 3HGRA 5LHEA 1KFCA 1TTPA 2ZZ1A 1UBSA 3LXAA 4ZQPA 1KFKA 4Y90A 3TIMA 2CZDA 2J6XA 2C19A 3T55A 5BMWA 3GVGA 3EKLA 4UC5A 1O95A 1K02A 3RLVA 2ZZ7A 2XFWA 4NXSA 2E68A 4X3ZA 2OCZA 4JY8A 3B0PA 1JQXA 1PVNA 4E2BA 3LLFA 4QNEA 3LRLA 1JCXA 3N2XA 4UCGA 3W7OA 4KKXA 2ZRVA 1SQ7A 4GXMA 5AC7A 1VJIA 3OEXA 3NAVA 2FIQA 4AHQA 5I3IA 3W7KA 4TX9A 2QAFA 1BKSA 3N34A 3EXTA 1FCQA 1MEIA 4JIQA 3OVQA 2DZXA 3FJLA 4HNTA 3BG5A 3TROA 5HUOA 1JRCA 3N2MA 3GR7A 3VFLA 2TRSA 3BG3A 4NXKA 1HFBA 3TW7A 1R30A 2HS8A 5DY2A 3KOFA 4JTEA 4ORMA 3IIOA 2A4AA 5HQEA 3NZ1A 4WOQA 3LHYA 3S6DA 3ZWTA 1H1ZA 2J27A 1RD5A 3W23A 1NEYA 1H63A 3S5NA 1L6SA 5K4ZA 2GQ9A 3H53A 1ML1A 1WOBA 2ZRUA 4QISA 4YL2A 2UV8G 1PCWA 4EF8A 3E02A 2NXGA 1KM4A 5AYZA 3PB0A 2NWSA 2C18A 1OX5A 4JTLA 2JKEA 1D9EA 3NA8A 4UTTC 3E0IA 2ZRWA 3N9RA 5C6MA 1EX5A 5G4EA 2QJGA 1MSSA 2Z1BA 3C2FA 4NT0A 5AC8A 2TSYA 5F2MA 1LOLA 2A6LA 5T26A 1TPB1 3HPZA 2QDGA 4QIUA 1CI1A 3NQAA 4BR1A 4XBKA 1LORA 4LV4A 1QCWA 1F76A 3FS2A 2P1FA 2VOMA 1OVDA 3LXCA 4JTSA 3NQCA 1GTHA 1OHLA 2QAPA 4NU7A 3LOTA 1H7PA 2QCEA 1YYAA 4JTUA 4TIMA 1PS9A 1RZMA 5K2ZA 2QDHA 3SGUA 2FLIA 4JN6A 5LZLA 2QCGA 2VXNA 2CLKA 2PCQA 3UYCA 3LCFA 4LRSA 1GQNA 1NFBA 2DZVA 2P10A 3QPZA 1KM6A 3Q2DA 1W5PA 4JEQA 5C55A 3G3DA 4UIOA 1F7BA 2A5HA 2CFFA 1B4EA 3LTPA 3T4CA 3USBA 3DBPA 2CZ5A 2GUUA 1GVSA 3A9IA 1YDNA 4MKNA 3WK2A 1SSGA 3QZEA 2DORA 3FEMA 5LGXA 4H3DA 4QAIA 3O6YX 4OHQA 3S9YA 3C3NA 2ZFAA 4O13A 4DF0A 1FWNA 1WYIA 2DZWA 2EKCA 3P74A 5D38A 3G0SA 2PRHA 3NQDA 3TH6A 1SFLA 3MO7A 1OFAA 3LI0A 5SWUA 5AYYA 1JR1A 1N7KA 4O1DA 3KRZA 2V5LA 3EWUA 2BSLA 1EB3A 1OABA 1EUNA 1H1YA 5E93A 3HG2A 4O57A 1TTQA 3G1YA 4JICA 2VFHA 4ADTA 1H50A 1F73A 2YR1A 4LS1A 4A3UA 4PL2A 4P61A 1QO2A 1QMLA 5HINA 3C8FA 3DXIA 4GUGA 3KVLA 3TA6A 2ZYFA 1A53A 1XBZA 3FJ6A 3NR0A 3W85A 3JR2A 1OX4A 4FXSA 3MP4A 1VR6A 1LRQA 1Q3NA 1FXPA 3H54A 3QEZA 3IRDA 4FNQA 3IVUA 2Q3OA 5HWJA 2C15A 8TIMA 3UQNA 1IIGA 5LGZA 1IGSA 4FHAA 4JX6A 3W83A 4M6QA 4BI7A 1LROA 4Y96A 4KWWA 1K7EA 1DL3A 2NX9A 1A50A 1J2WA 4LTSA 1S3HA 2OT1A 4AXKA 4JR5A 3S5ZA 3UWWA 1M7OA 3W71A 4FF7A 2C0AA 3NQVA 4IOTA 3TAKA 3LERA 1Y0EA 3UY8A 3W07A 1ME9A 2FDSA 1SO3A 4XZ9A 4AF0A 2DZTA 1SPQA 1QPRA 3K30A 3TMQA 3R89A 3N3MA 3W75A 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5A5WA 4LS0A 1LLWA 3NO5A 1JULA 2YZRA 1OYAA 3LCXA 3M44A 3LBCA 1E51A 1KLYA 1KV5A 2E1DA 3KAOA 1XKYA 3EXRA 4K37A 4BF9A 1FCUA 1Q6RA 2GQ8A 2ZZ5A 6TIMA 3L5AA 3QW4B 3WFAA 2VFIA 2OMAA 3CHVA 4Z0SA 1KM3A 2WSRA 3SY5A 4RXGA 3O05A 2CLIA 4XUGA 2E6FA 3NDOA 3E9AA 3DENA 1NAL1 3U2OA 3NQMA 2X30A 5D09A 3OA3A 2J24A 4O1BA 3MJYA 4NJGA 3L67A 2LLEA 4I9AA 3DGRA 4O1AA 1BEUA 5D2TA 2YW4A 3NL3A 2E5CA 3PBUA 2V30A 2QCHA 4K8EA 3Q94A 1JQVA 1K8XA 4N9DA 2Z6JA 4XKYA 4AVFA 2WSQA 2CLMA 2V8ZA 3PM6A 1OFBA 1L6WA 2Y62A 1PV8A 5G5IA 2QEZA 3NL2A 4XQ6A 3NOEA 5AHIA 4WD0A 4AWSA 1TPC1 3O1NA 4GUIA 2H8ZA 3HGOA 2NLIA 1O60A 1FY6A 1G4EA 1TB3A 1GPWA 1WX0A 3QFEA 3KRSA 1GOXA 1W31A 3NQ8A 2GOUA 3W86A 3W3OA 3G1HA 3IIXA 1JCNA 3EWBX 1JCLA 3SZ8A 1ZAHA 2JBMA 3SFKA 3IIVA 3LX9A 1JVNA 1GVFA 4GUHA 5LNVA 4AB4A 3M47A 1QWGA 1VS1A 4X22A 4C1KA 2O7SA 1KFLA 4IGHA 5FEWA 3LHTA 1DHPA 1DVJA 3W1NA 4JYFA 1H5YA 2WNQA 3BVJA 3LTSA 3F4WA 1XDLA 4MIMA 3W2MA 4RLIA 3EB2A 2ZRYA 1G4TA 1I2OA 3LCHA 1NF0A 2VEIA 1I2NA 4PODA 4FNPA 1L9WA 5HR7A 1MXSA 4LRTA 1X8FA 3CEUA 4CCDA 4R53A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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