4W84 | Genus

Total Genus 143

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	143
sequence length	340
structure length	340
Chain Sequence	DRSRVFDILSNINIGWNLGNTLDATGGGNSVNAETSWGNPKTTQEIVDTVNDRGFNAIRIPVTFANHLGPAPEYTISADWLARVKEVVDYAVNDGMYIILDTHHETNYWLKTDPNNEAALCEELAAIWKQLAEAFKDYDEKLMFEGMNEPRMAGSAKEWSGGTPAERKLINAMNKAFIDAVRATGGNNADRVLIICTYGHNSDEPTLKDLEIPSDPNIAVALHTYTPYFFTYVADGSYSVWNGSKKNDITWQYNNIKKYLIDKGIPVVITETGAQFKENTEDIVRWIGDYVGTLDQDGVKCFIWDNNIYHGNGEKFGLLNRSLLKWYNDDIVDAYVNHAA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Uncultured bacterium
publication title	Structural Basis for Xyloglucan Specificity and alpha-d-Xylp(1 6)-d-Glcp Recognition at the -1 Subsite within the GH5 Family. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase
total genus	143
structure length	340
sequence length	340
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 3.2.1.151: Xyloglucan-specific endo-beta-1,4-glucanase.
pdb deposition date	2014-08-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00150	Cellulase	Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	4w84A00

4HMDA 2XUCA 2IXVA 1V08A 1M53A 2DSZA 4ML4A 2XVGA 1JDDA 2FGZA 3KZSA 3VILA 3ZT6A 1Q6CA 4V2XA 4PSRA 3L2LA 4IPLA 3SCTA 4FLOA 3T0AA 3RPMA 2GJPA 1NWTA 5IDIA 3AIUA 3L2MA 3O2LA 1HKMA 1WO2A 4OJYA 1CXEA 1HJVA 3AMCA 4HU0A 4UCFA 3EDFA 5IFPA 4CU6A 2BY0A 4OBSA 2NT1A 1HNYA 5DFAA 1US2A 3VNYA 3VVGA 1D7FA 5HOSA 2Y2WA 2CCRA 2XTKA 2CETA 5C8BB 3T2OA 3NDZA 4JFWA 2X0YA 4AIOA 5JBEA 2JF7A 3GBDA 2QMKA 1GCYA 2Z1SA 2O9OA 3SCNA 4DUVA 5EFDA 4B9ZA 5GNYA 1CXLA 3WF3A 4TVUA 5JIWA 4UFLA 3PTMA 1P6WA 2C8NA 3NSMA 4WIWA 2VO5A 5CLWA 1R8LA 2XFRA 5LA1A 3L4XA 5JBDA 5DO8A 1V3LA 1VEMA 2A3HA 3POHA 4U5KA 4Z2IA 3CUIA 5A6LA 1J11A 2X1IA 2ZWZA 3KL5A 1YHTA 1OIMA 2J7CA 1BHGA 4NRSA 1F4AA 1UR0A 3LPFA 5ECUA 1B9ZA 2PC8A 1QNOA 4F9DA 2GDUA 3HMCA 5C71A 1W2VA 1UWTA 1RP8A 4A3YA 4UFKA 3CZEA 2VR4A 4GXPA 2G3JA 2EPLX 3MKKA 3PTKA 5I0DA 1G0CA 2Y5EA 1GQLA 1IT0A 4M80A 4P7OA 2PWFA 1ISZA 1KWGA 4R27A 3THCA 3WFLA 1J18A 2YDRA 3AHTA 5A6BA 4MB4A 1ODUA 1RH9A 1JF5A 3UESA 1XRVA 5HXMA 4GZIA 3VGHA 2JIEA 1OD8A 3WDPP 3OB8A 1KCKA 1B3YA 1G01A 3WSUA 3RJYA 1MFVA 3AZSA 2ZUMA 5FL0A 4TX6A 3M07A 1PIFA 4IM4A 2FH6A 3VIOA 1QHZA 2WXDM 4LYRA 4MJ2A 3NIYA 4PMRA 1OWQA 4AY1A 3VIJA 1DWGM 2QPUA 4MJ4A 4NRRA 3WNMA 1HVQA 2ZXDA 1LL6A 1K9DA 4S3KA 3WUGA 4H2CA 2AAAA 2RGMA 4H7VA 2G8ZA 2Y8KA 4CGTA 4CUCA 4AXNA 1E15A 3VD5A 4A3HA 2XSAA 3PZGA 4U3CA 1KFWA 4UZUA 3TTOA 3VGFA 5IHRA 4H41A 1GOIA 3GXMA 3GM8A 2CBIA 4U2YA 1K9EA 1E3ZA 1JG9A 3VMPA 1WDPA 1M03A 1V0MA 2DSWA 1B2YA 4X0NA 3WD1A 3WKZA 1LQ0A 2VT0A 4AD3A 9CGTA 3EDKA 2C0HA 2O9PA 4ZENA 3D5HA 1GJUA 2D1ZA 1BTCA 1V0KA 1PZ3A 1R7AA 1CXFA 4X9YA 4C7GA 1QI5A 1XH2A 1UKOA 1XYZA 3MO4A 3LPGA 3BGAA 1B30A 3QOKA 2X0HA 3ZMRA 4CD7A 2CIPA 4AD5A 1NQ6A 2WANA 3WELA 5DT7A 1BPLB 2V3FA 2X09A 2WZEA 3SEPA 1TMQA 2WBKA 3EMQA 2JIWA 4AD2A 1Q6GA 1ZU8A 1MVYA 2VTFA 1FH7A 4E8CA 3VNZA 1E1FA 4AIUA 3A4XA 2BY3A 3AI0A 4KH2A 1CGXA 2J79A 4MNJA 1E6RA 3PZVA 1GOMA 2WZHA 5A95A 3HJEA 2GJXA 3W25A 2A3BA 4W88A 4WLCA 4AZ6A 1KWKA 4KRUA 5E6ZA 1Q4NX 1CDGA 3BAJA 2VX4A 4TVDA 1CPUA 2GSJA 3IJ9A 4M81A 1V0NA 2VNCA 1JGIA 1DTUA 1QI4A 1BVZA 1WCGA 1ZBCA 2DIJA 1JD7A 1ODZA 1HX0A 2EPMX 4LPCA 1CENA 3SCWA 1EDQA 3WDJA 2YOCA 4Z2JA 2YA2A 1I75A 5BYWA 3IAQA 1CGUA 1HIZA 5A6KA 3SCQA 4U2ZA 1H0IA 3WNKA 4KWUA 3WMCA 1BAGA 3W27A 4QLLA 1C7TA 1JNEA 3B9EA 3AMLA 3WQ5A 1E71M 1PJ9A 2BVYA 1CGTA 1ZJAA 3K4AA 3N12A 1GJWA 1SFSA 5AC4A 4U33A 2DSKA 2WHMA 3ARQA 1JXJA 4PMDA 1V3JA 3UR7A 1CIUA 2WC7A 2WCAA 4JKLA 3ZJ7A 3VOCA 1D3CA 1FHDA 3KL0A 5E09A 1KGUA 2ZE0A 4OOZA 3T08A 5M5DA 2W92A 1JZ8A 1VB9A 1FFRA 3W6MA 4FF5A 2WSPA 1TCMA 3OG2A 4P8WA 1JIBA 2ZX8A 2EO7A 5BROA 3W26A 2CHNA 3VINA 5CPTA 1QPKA 4BQ5A 3UG5A 3SCUA 2XFYA 3VMNA 2XSBA 5I79A 1K6AA 2DGAA 4GIAA 1W9UA 2YLAA 2DEPA 4DWSB 4BCEA 2EPOA 1AQMA 3AYSA 4D6FA 1ZBVA 2VQUA 4W89A 1JDCA 2WK2A 4OUEA 1HJSA 2CITA 3MMDA 5AY7A 4PUDA 3WMBA 4CU7A 2Y4SA 3IANA 6CGTA 3ARZA 1VRXA 1VJZA 1E5JA 4XUYA 3WEOA 1SMDA 1D2KA 4W85A 4AZBA 1EQPA 3F5LA 3KE0A 1UR9A 3OLIA 4P7LA 5F7UA 4M56A 4X0VA 2WMJA 2XPKA 4V27A 1VEPA 2VMFA 2NW0A 3GNRA 1KB3A 2EPNA 2CKRA 3WQWA 3VDBA 3S6TA 2Y24A 3DC0A 3L4VA 1V3IA 3BH4A 4PTMA 4MDPA 2FDMA 3SCVA 3SCSA 3MSGA 1LG2A 3PZOA 1V6UA 3ARSA 1KGWA 5HDRA 1C92A 1WZLA 2WAGA 1W1VA 2WM0A 1R87A 1B90A 4HZ8A 4M29A 1EHAA 3GNOA 2PWDA 3AS0A 4WK9A 4JAWA 3VTRA 2W63A 1EDGA 1EOMA 3MUY1 1V3HA 4BF7A 3SUSA 4UFIA 1CLXA 2CBVA 1B3XA 5FL1A 5D9OA 4H8HA 1W9XA 1FFQA 1C7SA 1XGZA 3M6DA 4KGLA 4LYPA 3RM4A 2EXOA 3CLWA 1CLVA 2YDQA 4UQAA 3PN8A 2UY5A 5AYIA 2UWFA 2VZOA 2DH3A 4MAVA 3TTQA 3KWXA 2PB1A 4DUXA 1NWSA 3GXDA 3MUIA 3WNPA 4HA4A 1OGBA 1R7OA 1UHVA 1CGVA 4BQ3A 3FW6A 3QHNA 3M7SA 1GORA 2XGIA 3T2QA 6TAAA 1J0JA 4PMXA 2GK1B 1OBAA 2D3LA 1GNXA 4HPGA 3WQ4A 3SUVA 1W32A 2Y8VA 3AIEA 1VENA 2DDXA 3AISA 1OM0A 1BVNP 1OSEA 1KBKA 4Q7NA 5LA2A 2VX7A 1V6YA 1TG7A 2V5CA 2EJ1A 1HN1A 2PWEA 4P8XA 2XFFA 1SR0A 3ZT5A 2XIIA 4ACZB 1SYTA 2WMIB 5D8ZA 5I78A 2WMFA 5CSYA 4BZYA 1E6XM 2OSWA 3WD0A 4AZ7A 4WKAA 2YIHA 1TE1A 5I77A 4Y7EA 1O7AA 3W82A 3ALGA 3DHPA 4GI9A 1XD1A 5A69A 2OLHA 4UQDA 4DM1A 4HMCA 3II1A 2CYGA 2GDVA 5A8QA 2YL6A 2QMJA 2A3CA 1CGYA 4QFUA 4UTFA 4JCMA 1PAMA 4B3KA 4AD1A 4TOQA 4V28A 5GNXA 4J3TA 2CESA 2J78A 5A1AA 3FNDA 3BLKA 5DT5A 1E0WA 1OCQA 1H09A 1V02A 3GH4A 1XD0A 3AS2A 3N11A 4LGXA 3ZR5A 2HISA 3ZSTA 2CHOA 1NP0A 1L8NA 1VAHA 2G3MA 3VD3A 5M17A 2JF6A 2WSKA 1W3KA 1AVAA 4PMUA 5AC5A 4MTVA 4W5ZA 1M04A 1EQCA 1UD6A 4NI3A 1XCXA 1JFXA 2E40A 3AICA 3MANA 3WDRA 1N82A 2E9BA 5BXRA 1BG4A 3B9AA 5E70A 3F5KA 4Q22A 2CBUA 4PMVA 3A3HA 1NOWA 1FH9A 1F4HA 2Q8XA 4QAWA 4JZ5A 3JUGA 2UY4A 3AXHA 2DQXA 3A47A 2B31A 3AS1A 4MADA 4XZBA 1M7XA 4DWSD 1XSIA 3AXXA 3MU7A 2PWHA 3A4AA 3WUFA 3N15A 4GO8A 3NDYA 5TD4A 2WKGA 3CUHA 2VVNA 3WFZA 4EANA 4UQBA 5C70A 3GBEA 3VD9A 3VPLA 1WPCA 2VC9A 2E8YA 3AHYA 3CPUA 4MAZA 3WD3A 1CEOA 1FP8A 2ZUNA 2ZUWA 1MW1A 2YA0A 1BFNA 5I5RA 1E72M 2XVLA 1V3KA 2VL4A 4MNLA 3CHFA 5ABFA 3ALFA 4JHZA 1HT6A 3VIPA 2J75A 2J7HA 1E56A 1QW9A 2VZSA 1UQZA 5CJ5A 4JL2A 2X05A 2WLYA 4MNKA 4CN6A 3OZOA 3T2PA 5I2UA 3ARYA 3W4RA 3VM7A 7CGTA 3W28A 2WMGA 2CBJA 1UR4A 1OB0A 1GVYA 1BF2A 4W8AA 3WNLA 4PMYA 1V6WA 2VR5A 3UG4A 1E6ZA 3UETA 3SCOA 1WDQA 2VI0A 3SUWA 1GQKA 4M8UA 4P8UA 5CSUA 2JEPA 3PZUA 4HA3A 3RM9A 3EDDA 5CZKA 4CN1A 1HP4A 2OSYA 3RDKA 1UOKA 2D23A 2ZICA 4TUFA 4KMQA 2DPEA 1HP5A 1KQYA 2WZIA 4K68A 5CGTA 3K4DA 1J0YA 1J0IA 4XX6A 1XHGA 2VCCA 4C7DA 4AZGA 2J7FA 1EH9A 2WMKA 3ECQA 3CZKA 2ZXQA 3L4ZA 1PX8A 1QBAA 5A6MA 4KRTA 3VGBA 1MQRA 3WBEA 2DH2A 5A3HA 4CN4A 4LQ1A 1H41A 2W67A 3APGA 1NWRA 3U5UA 1QBBA 3L4WA 4J3SA 3TP4A 1OGSA 3W38A 1YQ2A 1GHSA 1MXGA 3VIIA 3MS8A 3PZQA 1ISXA 3VIMA 4HMEA 1JZ5A 1BSIA 2YL9A 1EO5A 3RM8A 1QW8A 1J0HA 2BVTA 4F8XA 4PMZA 4AC1X 1C8XA 4E4PA 1E43A 2JE8A 1V0LA 3IAPA 3NJ3A 4ZE4A 3WDHA 3ZJ8A 3UEQA 1TVPA 1JI1A 1VJSA 4W7VA 3WF2A 3VO0A 4JFUA 2GVYA 4FLSA 2ZX5A 1BQCA 2DIEA 4DWSC 3W37A 2YBTA 3WQ8A 5BXPA 3NCOA 3VM5A 2JFEX 4J27A 3WN6A 3SCRA 3N04A 2WBGA 1H4PA 2CKSA 4GI8A 1UUQA 3AMKA 2VZTA 1U30A 3SIMA 4QLKA 4LX4A 2GFTA 4XB3A 3PZTA 3OIHA 5JBFA 3WF0A 2ZIDA 4MB3A 4ACYA 3AFBA 2BV9A 2BY2A 3EMCA 3CUFA 1QVBA 3MSDA 1W1YA 2VCAA 2WWDA 1OGGA 3QHMA 3WF1A 1E6QM 2WWCA 4LYQA 1ZJBA 1TVNA 2XIBA 2E4TA 4F66A 3A6OA 2XVPA 1V02E 1NP2A 3PZNA 2PWGA 4C7FA 5HPCA 4AZIA 2WVVA 3OGRA 5HNNA 3VIKA 5E0FA 4AIEA 3WD2A 4HOZA 1JZ7A 1G9HA 1H11A 2OSXA 1VBUA 3N17A 3WEMA 1ZB5A 5EBAA 3PZIA 3A4WA 3FHQA 3F5JA 3PBGA 2DT0A 1E73M 3FHAA 4L4OA 4J3VA 2E9MA 3W81A 1BG9A 1GQJA 5BXSA 2QPSA 4HZ7A 3ZIZA 4FLRA 2ZWYA 3N1AA 2GJRA 2CPUA 2WKLA 4F9JA 2NSXA 4D6IA 5JIPA 3BLPX 5D9PA 1OD0A 4GKLA 1FHLA 4J3WA 5E9AA 2ZUSA 1H1NA 2J74A 3ZR6A 2VJXA 3VMOA 2WHKA 3ARVA 4D6HA 2F2HA 1HJWA 2EEXA 1TZ7A 2G4FA 3NSNA 1J10A 3W6LA 4YHGA 3AROA 4UOJA 2E3ZA 5CQ1A 1QI2A 3AIBA 5DF0A 2CXGA 3WL0A 3RMEA 1JXKA 4PUEA 4ATDA 2WNWA 3AHXA 4M24A 4B16A 1WDRA 3BCFA 3W0KA 3CUGA 3CZLA 4PSPA 3O9NA 1G5AA 2D2OA 5A2BA 5A6SA 2ZUUA 5IFTA 1JNDA 2VX5A 1W9PA 1EIBA 4NSBA 3CHDA 1E6NA 3HU7A 3FN9A 3VUPA 3S2CA 2J7GA 4TXEA 3BC9A 1PBGA 5IXEA 1UD2A 1UWIA 1GOWA 3CZJA 5D9NA 1OIFA 3K8MA 3WEZA 3CTTA 1AMYA 2WVTA 3WH8A 1UA7A 3SCPA 5I23A 3WUEA 1XH0A 3TTSA 3DYMA 3QHOA 2BY1A 2UY3A 1TA3A 3BAWA 1W3HA 3U5YA 3WUBA 4IISA 5I24A 3WQ6A 3IK2A 4W8BA 3MV01 5BXTA 5I3DA 5A8NA 4PMOA 1JZ3A 4W87A 2PBGA 3U7BA 1B3WA 1NM9A 1WZAA 5A8OA 3OA5A 3AIRA 4L4PA 4YPJA 3VDHA 4D6CA 4EKJA 2VZUA 2BHYA 4BQ4A 1GUVA 1ZS2A 1ISWA 1WZKA 3W53A 4CD5A 3T09A 2FGLA 1KBBA 3U57A 3FXYA 5HBFA 1XV8A 5CG0A 1EO7A 2ESCA 3SUUA 3AS3A 4PN2A 5D9MA 3SUTA 1AQHA 4AEFA 4GZEA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1KQZ A;  3DYO A;  4AYS A;  4RL3 A;  2VVS A;  2J7B A;  1JZ6 A;  1JAE A;  1VFU A;  5A8M A;  4FK9 A;  4PYS A;  1NOF A;  3UCQ A;  3WNO A;  2BHZ A;  2EBN A;  4J3U A;  1ISV A;  1NWU A;  4U5I A;  3K8L A;  1ZL1 A;  2X8R A;  2BXZ A;  3TTY A;  1QNS A;  4OZO A;  3TOP A;  1E1E A;  3GZA A;  3VKK A;  3T0B A;  1HF6 A;  2V3G A;  2WVV B;  1GOK A;  4NZC A;  1DWF M;  2IXU A;  2FHF A;  2A3E A;  1IZJ A;  1E3X A;  1E6P A;  3B8S A;  4HP5 A;  1UWS A;  3GH5 A;  3LMY A;  3ZO9 A;  1JAK A;  1IV8 A;  3CGT A;  3OGV A;  1LF1 A;  1MYR A;  2XVN A;  1V6V A;  4Z2G A;  4QLJ A;  2YKK A;  4URI A;  1JI2 A;  5HPO A;  2D0H A;  1WP6 A;  4JL1 A;  4J7R A;  4S3J A;  1V6X A;  2OWW A;  4CKQ A;  1CWY A;  2F8Q A;  3FY1 A;  2OYL A;  4PRW A;  1E40 A;  4YHE A;  1MFU A;  3AHV A;  1QOX A;  1HXJ A;  1OT2 A;  4GI6 A;  1PPI A;  1MQQ A;  3VIF A;  1BGA A;  1GZJ A;  1U33 A;  2O92 A;  4OKD A;  2V3E A;  3UER A;  2UY2 A;  1K9T A;  1UWQ A;  3AIW A;  1DP0 A;  1MXD A;  4YN5 A;  4PCT A;  4B15 A;  1JYV A;  1NOU A;  4U3A A;  2WC3 A;  4GO9 A;  3WNN A;  2DT3 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4W84A

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Chain Sequence

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Chord Diagram

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