4WZH | Genus

Total Genus 101

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	101
sequence length	312
structure length	304
Chain Sequence	MSLQVGILGNTFANPFMNAAGVMCSTEEELAAMTESTSGSLITKSCTPALREGNPAPRYYTLPLGSINSMGLPNKGFDFYLAYSARHHDYSRKPLFISISGFSAEENAEMCKRLAPVAAEKGVILELNLSQVAYDFDAMRRYLAAISEAYPHPFGVKMPPYFDFAHFDAAAEILNQFPKVQFITCINSIGNGLVIDVETESVVIKPKQGFGGLGGRYVFPTALANVNAFYRRCPGKLIFGCGGVYTGEDAFLHVLAGASMVQVGTALHEEGAAIFERLTAELLDVMAKKGYKALDEFRGKVKAM

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Leishmania braziliensis
publication title	Recombinant production, crystallization and crystal structure determination of dihydroorotate dehydrogenase from Leishmania (Viannia) braziliensis. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydroorotate dehydrogenase
total genus	101
structure length	304
sequence length	312
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2014-11-19

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	4wzhA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4wzhA01

4LWWA 4NVTA 3M16A 3NO5A 2CW6A 3FEMA 4IMFA 3PBVA 2QCLA 3OIXA 4BWLA 3STGA 2CLMA 1TIMA 3E96A 4DELA 3ZS4A 1UJPA 3W2KA 3TXZA 5DXYA 2JGYA 4DBDA 2ZRWA 1CX9A 2RDWA 2TMDA 1GYLA 3LHWA 3BG5A 3W7QA 3I68A 3SZ8A 3A21A 3CIWA 1YXCA 3L0GA 4JTGA 2XN1A 1HUVA 1A53A 3UY8A 3PSWA 3W1LA 3W83A 3DAQA 1VPXA 3ATZA 3PG9A 4RX0A 3TFCA 6TIMA 3NQ7A 2C16A 3KVLA 1V7YA 1ZY9A 1W5MA 3P5YA 3TNOA 3UYCA 1XXXA 1MSSA 3LHTA 5FF3A 1QPNA 4CNPA 1DBTA 3W2UA 3BPWA 5LHFA 2ATMA 2QCHA 3LBMA 4QSHA 3LCLA 2NV1A 4XQ6A 4RKAA 1FUYA 1JRCA 2TPSA 3I7QA 4IXXA 5I3JA 4AWUA 3DKLA 1JQXA 4Z1AA 1TRDA 7TIMA 1H7XA 4M6QA 5KITA 5LGXA 1GZGA 3UWZA 1H51A 4M7TA 4MY1A 4GUFA 4JTTA 1SUXA 3WK3A 1OG0A 3PF3A 4JDYA 4N4QA 1SU5A 3UNDA 3KAOA 3ZWSA 1WA3A 1OFPA 3LLDA 1Z48A 3PC0A 4MFEA 3TQ0A 4NU7A 1Q6RA 3TJLA 3L0NA 3GB6A 1GJPA 3C6CA 4O57A 3NOEA 3SGUA 2ATSA 2VENA 4MJMA 3L65A 5AHIA 3QJAA 3HG4A 1KV5A 1FDYA 2G5WA 1XL9A 1OFBA 4NJHA 1Z44A 3SW6A 4BI6A 1FXQA 1DJNA 2OJPA 3C3NA 1F5ZA 1V5XA 4LNYA 4NJGA 5I3KA 5AN7A 1NF0A 4O4WA 2C15A 2HSAA 4UC5A 2C18A 3G0UA 5I3GA 1JCLA 4HPXA 3NG3A 3W84A 4O54A 5EL1A 1CI1A 3N2MA 3CTLA 5FESA 5G2IA 4I7WA 4N9DA 2VFDA 5F4XA 5F1UA 4ICNA 2VC6A 2ZTKA 1BKSA 2A7PA 1AW5A 4MZ1A 1HTIA 4NNAA 3UPBA 4M5PA 2HS6A 4FNTA 2BLEA 3UWYA 1WQ5A 3BO9A 3OA3A 3OEXA 5F2LA 3PUDA 3RU6A 2ZRYA 3WJZA 4RV8A 3MHUA 1ADOA 3RMJA 3TJXA 3GXTA 5EKYA 3ZFHA 2BZNA 1HL2A 4K38A 5D37A 2CFFA 4XBKA 3U6WA 3W7EA 3QH2A 2CZDA 3W1AA 3TA6A 3LRLA 4W9TA 4U28A 4DF2A 1L2UA 4LOCA 3UWQA 2G95A 3ATYA 5AC7A 1BEUA 3TSDA 2YCEA 3SR7A 3GX9A 3W07A 2V81A 2R14A 3MP4A 1FCVA 2A7RA 1F05A 1N55A 1KFLA 4HIBA 4O1AA 3GR7A 2OT0A 3W7IA 2FB2A 5I3IA 5LNUA 3EX2A 4BFAA 1T8XA 2B7OA 4FXRA 2ZZ7A 4JDBA 2QCCA 3P61A 2NX9A 3IIXA 1XUUA 2A7NA 3R8RA 3I7SA 1ML1A 1KFKA 3CWOX 2DZWA 3NEVA 1IGSA 4JTEA 1R2RA 1NSJA 3DFSA 1FWTA 2JKEA 2R91A 5G2WA 5H2ZA 3G3MA 2Y61A 3PY2A 4AHPA 4N6FA 1UUOA 3QW4B 4JIPA 4Q32A 2TSYA 2Y6ZA 3G8EA 5AC8A 4A2RA 1D9EA 1OF8A 2TYSA 4YMZA 4WD0A 2ABAA 1PS9A 2ZDRA 3HGRA 1MXSA 1VRDA 1EUAA 2PC4A 4MUZA 4NJJA 1LRTA 5CGQA 4JR5A 4GNJA 3W7OA 4ZL1A 5AC6A 4R53A 5EPDA 1FCBA 1OK4A 4L4LA 5KMYA 4FX7A 4LC8A 3IIPA 4R34A 1ONRA 5HJLA 3GDMA 4AH7A 1AW1A 3KRZA 1XBXA 3M43A 5BMXA 2ISVA 3OHIA 3EX3A 3LTPA 1H63A 3MMTA 4AF0B 4FNRA 4AHQA 3PBYA 3P67A 3T4CA 2ISWA 3FKRA 1DHPA 5H91A 3LTSA 3W71A 3DHFA 2OX1A 1ZAHA 1QO5A 1KTNA 3ZWTA 3A22A 4JYFA 3TCEA 4GC4A 3MYPA 4FB7A 4MJZA 2V9DA 1OF6A 1QCWA 3EWYA 5AHFA 1KM1A 3NL3A 4DBEA 1TQXA 4TX9A 1QO2A 2C3ZA 3O6DA 1YDOA 1BWLA 1U83A 4Z0SA 3C8FA 3GK0A 5HINA 1C29A 5AHEA 4E2BA 2Z6IA 2EHHA 1FDJA 4IMDA 5C6MA 4YL2A 3ABOA 4MFDA 4PC8A 3PSVA 1DOSA 2WSYA 2QJIA 3S5YA 4EWND 3EWWA 3RNDA 2E09A 3HBLA 3M6YA 2E6FA 2P1FA 2VEKA 4XTIA 3IRDA 4UTUA 1A5AA 2ZZ5A 1EIXA 4IXHA 2V82A 4UMCA 4O11A 3TK7A 1W3TA 3PWAA 1KV8A 4UTWC 1FQ0A 1SZEA 1WV2A 2HMCA 1NEYA 5G1TA 5U7SA 1YDVA 2ZA3A 4NX5A 3QEZA 3MJYA 4HHPA 3B05A 4D2JA 3HF3A 5TBOA 3LRMA 1XKYA 2GJLA 3W72A 1VYSX 3DFQA 3NQ2A 4IGHA 2DJXA 5IBXA 2LLEA 3M47A 2DZVA 2QAPA 1RPXA 3EWZA 4OV9A 4LW7A 4HKPA 4JTHA 3LI1A 1O95A 3QPYA 4CCDA 2KZHA 2J9ZA 2C6QA 2RHGA 1JCJA 3PB0A 3CU2A 5K4XA 3WJWA 4O10A 3PUOA 3NM1A 3W9ZA 3TE9A 4NX0A 4GUHA 4O0KA 3MI3A 3W1TA 4KFOA 4AWSA 3CHVA 1FX6A 1W37A 1H7WA 5HMSA 2WSQA 1VJIA 4WOQA 1Y0EA 5DN1A 3W7GA 1EX5A 1JUBA 4MPQA 3O06A 3N2XA 4M19A 3V75A 4ORMA 3GAYA 2PRLA 4O16A 5LKYA 3H53A 4GUGA 5K7JA 4BI7A 2QDHA 4N4PA 3BGJA 3DFPA 3RFAA 4HNVA 2Y7DA 1PVNA 1H7RA 4PODA 4HSOA 4FF7A 4ZQRA 3HJZA 1OYCA 2J9YA 3S9YA 3KOFA 4QNWA 4O18A 1I2OA 4OV4A 3LDVA 3W88A 4TO8A 3CWNA 1GYNA 4YLWA 1H7NA 3USBA 3HPSA 3W1PA 2YW4A 3PAJA 4UFKA 3BLIA 1GG0A 1G6CA 1A50A 3L2IA 1D3GA 5D05A 2GVLA 1LDCA 5ABTA 1KFCA 4AAJA 1AG1O 3C61A 1Z41A 3LBCA 5G1YA 3O05A 1TTPA 4NNBA 5HUOA 2JBMA 4FNPA 4JTSA 2OT1A 1JULA 2B7PA 2WJZA 3LV5A 4MY8A 3L9CA 1TQJA 2RFGA 5D03A 3UPWA 3R89A 4MY9A 3IIVA 1KLZA 2E6DA 4UTTC 3GR8A 3WJSA 3NL6A 3W7PA 1UASA 5BMWA 5EYWA 4ZZ9A 1JCNA 2WO5A 4O17A 1WYIA 1LRQA 2J88A 4IJBA 2XN2A 2Y63A 1OFAA 4UR7A 2E68A 5J5DA 1IF2A 3LX9A 4AVFA 2BTMA 4L4MA 1ZFJA 5F1VA 4CQ8A 3QC3A 3N9SA 2OMAA 1F6KA 1G7VA 5D09A 1LBFA 3FA5A 1LM1A 3NQ6A 3QMSA 2QEZA 4A29A 4HPJA 3CEUA 1EP1A 4MIMA 1LOSA 2ZRZA 1DQXA 1SZFA 5A8GA 3N9RA 3E12A 2RH9A 5F2MA 3BW2A 2YZRA 3SGZA 4N02A 3WK1A 3LCHA 1EPXA 2QCEA 4JY8A 4PCFA 4HT3A 4R7JA 4XZ9A 2X2GA 3W1QA 3S1VA 4HNUA 4O1BA 4JYDA 2QCDB 5DCBA 3HO8A 3FS2A 3QQ1A 4OE7A 1KM4A 3NZ1A 1SO3A 4RLIA 1TPEA 3BLFA 3W7NA 1GVQA 4O1CA 3L66A 3NDOA 4LT9A 2ZZ4A 4N2YA 3Q94A 3W86A 3STFA 2GQ8A 2R94A 3HQ1A 4H3DA 2NXGA 2ZBTA 3QRHA 5HQEA 2PRHA 4UNLA 5A5WA 3MUXA 1KM2A 2Y7EA 1W5QA 3TC7A 3A23A 2BX7A 3EEGA 1PHQA 2VEPA 2ZZ1A 3A5FA 2WKJA 1YLVA 1XDLA 4DPPA 4MVAA 2H6RA 3MBDA 1QOPA 1SPQA 1K03A 1W8SA 1S5VA 3QZEA 3VFLA 2ZRXA 4WXYA 2QJHA 1I2NA 3B06A 5C5YA 4RZ6A 4WXZA 1Q6OA 1L6WA 3E0IA 3O16A 1G7UA 3VNDA 3HGJA 1X7FA 3GDKA 1GTEA 5DCEA 1OABA 1J5TA 1FXPA 4IQLA 1ALDA 4JNMA 2Q3OA 4AB4A 2E5CA 3THQA 4O53A 3DU0A 3BARA 5CPNA 2DZTA 3P82A 3IGXA 4OT7A 3PVFA 3BW4A 3CM4A 2ZQ0A 3LXBA 4FEZA 1NAL1 3G1AA 1QPQA 4MZ8A 1TV8A 4BF9A 3HOJA 4FHAA 1TSIA 4PTNA 2A5HA 3L68A 1FY6A 3SSJA 4ADSA 1W3NA 4Z08A 3W1RA 1KM5A 3G18A 3C2RA 1QPRA 4EF8A 3NL5A 5KZDA 1M7PA 2JK2A 1F6PA 2C0AA 2V2DA 5G4WA 2NWSA 4GFSA 4NNCA 1UBSA 2CU0A 1ZNNA 3EX1A 5D2VA 2QUUA 1VQTA 3IVTA 3S5ZA 3IIZA 1EWEA 3NA8A 4PL2A 3G1VA 3DI0A 3T55A 1OFQA 3IVUA 1XUZA 4JICA 3TFXA 1WDWA 3F1QA 4UTMA 3C56A 4P2VA 1ZHAA 3O07A 4O4VA 3FYOA 4RJEA 4GJ1A 3P74A 4N9EA 3TW6A 4FNQA 1YTKA 3QW3A 3GKAA 3GXNA 3PULA 2C13A 1F2JA 2J24A 2BSLA 2DJLA 3U8GA 2ZTJA 2I14A 4GUJA 3KVJA 4QIUA 3OVQA 2FIQA 4ZVJA 2PRMA 5F4SA 1AMKA 4E0CA 4ONVA 3ANYA 1G4PA 3O63A 1CW2A 2GUUA 3LHZA 3TAOA 1SR9A 2E6YA 1I2QA 4DPQA 3B8DA 2ZRVA 2J27A 2PCQA 3S6DA 4LVDA 5E93A 1QAPA 4ZQNA 3TSMA 1OFEA 3PBWA 3EWBX 3W7KA 1KFJA 2VEIA 4O0ZA 2J9XA 1VLWA 1VR6A 1VS1A 1KTBA 3G3DA 2WOQA 3DKJA 1SZGA 2FDSA 3HB9A 3TW7A 2F7FA 4LUIA 3LERA 5F4WA 1ZALA 3M1ZA 1HG3A 5K2ZA 1VCVA 5LZLA 4OQVA 2I1OA 1I8JA 1JCYA 2HTMA 3E9AA 5FF7A 2VFEA 4XTDA 3IIOA 4UMAA 4Y9AA 4RZ5A 3EX4A 4PL1A 2GPTA 1OX6A 3LTYA 3ABSA 3S5NA 4FXSA 4JX5A 2C1HA 1GVSA 2X30A 3JS3A 1PE1A 2EPHA 1XBZA 4IMEA 3NQMA 3CC1A 4POCA 1VZWA 4JTUA 4XKYA 1BWKA 3MP5A 5IM51 1LP6A 3NNTA 1PCWA 3LCWA 4HN4A 3MYOA 5D30A 1JVNA 2DORA 4X9SA 2QF7A 1OFOA 3DI1A 3S8HA 3FJLA 3NQDA 2YGYA 5FEWA 3TQVA 3N34A 4UCGA 1NF7A 2AAMA 2WNQA 4DQWA 1WOBA 1ME8A 3HPXA 4JXCA 1MZHA 4OU1A 3MWAA 3M5ZA 5CPLA 4ML9A 3F4WA 4Y8FA 2AGKA 3CT7A 1R2SA 3BG9A 3G1YA 4NXSA 4LS2A 3DHDA 5HWNA 3PM6A 2YYTA 1W1ZA 4DXVA 1R30A 4GWEA 3LRKA 3NAVA 3C2OA 1MEHA 4BI5A 4S1FA 4Z1DA 4UFIA 4YXGA 3M5XA 2QUVA 1Q45A 4N9BA 2Y85A 3MHFA 1PV8A 4LU0A 1LOLA 1YTDA 3LGEA 1UUMA 3SIZA 3MW7A 2GVGA 4EOUA 3ELFA 4CQ9A 1LBLA 1QMLA 4NUWA 4DO4A 2NZLA 1K7FA 3D0CA 5HR7A 3LHVA 4X3ZA 3NPXA 3NGJA 1GPWA 3E02A 3LCFA 5CZTA 2Y7GA 1W54A 2A6NA 3R5EA 1QR7A 4LUJA 1VCGA 1W5OA 3W7HA 3G1SA 1QPOA 1SW7A 1O4UA 3M44A 2H90A 3LLFA 1X1ZA 2VEMA 5L9FA 3NPWA 2PE4A 1P0NA 4Q33A 3GIYA 3LB0A 1LZOA 5C55A 5D02A 2B0MA 2NV2A 1YDNA 1M7OA 1A5SA 2EKCA 1NFBA 4QJ1A 4Z1CA 4JIQA 4DO5A 2H3BA 4K7VA 8TIMA 5U4NA 1LYXA 2GOUA 3TU9A 2E77A 3W6YA 3S1WA 5HNRA 3BVJA 2JKAA 3DFNA 3KRUA 3WFAA 2CZEA 2QDGA 1K02A 3NR0A 1AW2A 5SWUA 5C2XA 1FDZA 2BXVA 3C2EA 3S1UA 2ZZ3A 4JTKA 4XUGA 1ZENA 4Z1BA 1AL7A 5D2WA 1SFLA 3P80A 1VYPX 3H55A 3G22A 3EWXA 1KA9F 5CG7A 2Y62A 3NXFA 4OHQA 2NLIA 1JCMP 1EP2A 3NQVA 3P62A 4FX6M 2RKXA 2O7QA 3PBUA 3B4UA 5F2IA 2WNZA 3GKFA 5AFDA 1SO6A 1TYGA 1FCQA 1W56A 2V0TA 4Y90A 1FBAA 3ABRA 3LCGA 3B03A 1H1YA 1OK6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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4WZHA

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