4LVBA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
480
structure length
471
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Homo sapiens
total genus 172
structure length 471
sequence length 480
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvbA02
4QJ1A 3FJLA 5F2LA 1BTMA 1H7XA 3GIYA 3M5XA 1W5PA 4NNCA 1XCFA 2H6RA 1O95A 2X1SA 2OJPA 5BMWA 1OFBA 4JIPA 3M9YA 4PCFA 4JTUA 1O5XA 1G4PA 4B5NA 5FF7A 1FWTA 2NX3A 1ZAIA 5HWMA 1JQVA 4QSHA 3G8EA 4KFOA 4N9DA 5LNVA 1LM1A 1TQJA 1K7EA 3C8FA 3P74A 3N73A 3PUEA 4XBSA 4FNQA 1LZOA 2VEKA 3W86A 2G5WA 3P5YA 3BLEA 2H90A 1FCUA 1MSSA 1HUVA 1TYGA 3S1UA 3OG3A 4LS2A 4PL1A 3B0UX 3B0PA 3NAVA 2CZFA 1FCBA 3QYQA 3GB6A 4JY8A 2GJNA 5D37A 3RLVA 3QSTA 5HULA 2FB3A 2NLIA 4LNYA 2ISSA 4LVFA 4UFMA 3L21A 5U7SA 2G96A 1Z48A 1EUAA 1DJQA 3CLMA 3G24A 5DCEA 1KW1A 4NX5A 2NZLA 3TCEA 3LTPA 2FPVA 3BLFA 4YCPA 2O7QA 1IIHA 5G2WA 3G0UA 3MHUA 4WUIA 3PS7A 1KM4A 1TIMA 3OVQA 1VYPX 3C4UA 4FXRA 4UFHA 1GJPA 3DKLA 4UTIA 3EWBX 4LT9A 1S5VA 1TTQA 3W7QA 4MUZA 5K2ZA 4DPQA 5T26A 5TQLA 1FDJA 3EX4A 1FBAA 3BPWA 2ZBTA 1TPVA 1TV8A 3W23A 5C55A 5DCDA 4LY8A 5FEWA 2VEPA 4GBUA 1G7UA 3DFQA 3DFOA 4N9EA 3CTLA 1EEPA 5D02A 4RLIA 2DP3A 1IXNA 3E12A 4NNAA 1DHPA 1ZENA 4XBKA 4UNKA 4ADTA 3RF9A 3G3MA 4HPJA 4AEOA 1LBMA 1X6UA 3S0CA 3KOFA 2NV1A 2GJLA 5C5YA 4S2CA 2VENA 4HT3A 1W56A 3G1XA 2QCEA 4HNUA 1TMHA 3E49A 5AYYA 1LOSA 2V2CA 2QAPA 3BV4A 3SR7A 3S8HA 1FY6A 3W1AA 1UUMA 2B4GA 3O06A 3LV6A 2RHGA 2A0NA 4WZHA 3HJZA 3CB8A 1Q6OA 1CW2A 3LHZA 3NL3A 3EWXA 4JTSA 3KRUA 1FCQA 3I7QA 1BKSA 1ZCOA 5CPMA 1LLZA 1VHCA 1XXXA 2AAMA 3N34A 1TV5A 2NUXA 1K8ZA 1RQEA 2C6QA 3QPYA 3QFEA 3NM1A 1R2SA 4O1AA 2CLLA 3RFAA 2CZ5A 1DORA 1ZFJA 3P7YA 1TREA 3QQ1A 2OZ0A 3VKJA 4JY9A 4MJMA 3TNOA 4IXXA 1OYAA 2WSRA 2ZZ5A 3HPXA 2GQAA 4JYEA 2E5CA 5K9XA 5LNWA 1KM3A 1LBLA 5G2IA 4UR8A 2A7NA 4LV4A 1LCOA 3UPWA 2WSYA 3CWNA 4RKAA 3QC3A 5F2IA 3PM6A 3LXCA 1HFBA 1OX4B 1XC4A 3W71A 3HG5A 1SQ7A 3QM3A 1W5MA 2TRSA 4A2RA 2CZDA 4JNMA 3NQCA 4RXFA 4AXKA 3THQA 2O7SA 3ABSA 2PRHA 1YDOA 2C0AA 4IMEA 2RKXA 2R14A 3L5MA 3E9AA 3C6CA 3MWAA 3T55A 1NVMA 3RK8A 3W2JA 3VE7A 1HO4A 4XKYA 5HR7A 1EWEA 3MP5A 2Z6IA 4FIQA 4O12A 1JUBA 1KFLA 5EMUA 4MOZA 4O13A 1OG0A 5TIMA 2IQTA 3PBUA 5DN1A 3KAOA 4K38A 3HG3A 2CLFA 1EP1A 1SUXA 1SW7A 2JK2A 3GNDA 1QOQA 4MZ8A 1D3HA 5AHFA 1THFD 2CZEA 3TV8A 4IQLA 3TXVA 4BI7A 1GPWA 1MEWA 5C2XA 3NQVA 1YTKA 1BWKA 3G1VA 1VGAA 1G69A 4TR9A 1WOBA 1KA9F 1OJXA 2HMCA 4N4PA 2Y85A 4UTHA 2EHHA 2Z1BA 2VFEA 3IIZA 3MUXA 4ADUA 4MKNA 1JRCA 4GC4A 2QUUA 5CSRA 4JS3A 1M7PA 4KWVA 2QDHA 1VH7A 4DO4A 1Z44A 3HG2A 3QW3A 4AF0B 3W72A 2E09A 1EB3A 1GYLA 3W73A 4NQ1A 5EKYA 1MXSA 1F05A 3GKFA 5DELA 2V2DA 3VCRA 3MBFA 1K03A 1UB3A 3LXBA 4PC8A 5CGQA 3P8JA 1GOXA 3Q94A 1GTHA 3BW2A 3O15A 3GXPA 3CIWA 5KITA 4JTFA 4AHQA 4LU0A 4O1DA 3W7OA 4UMAA 1NEYA 4QAIA 2DU2A 1UCWA 2YW4A 4QIUA 5CG7A 1GVOA 4HNVA 1JCXA 4XUGA 5F1UA 2E6AA 1K8YA 2LLEA 4O15A 4PH6A 1RD5A 3GXTA 2R91A 4N6FA 1R47A 3CT7A 3KFTA 3HOJA 2GVLA 1FX6A 4Q33A 3HO8A 3ZWTA 4M6QA 1LDCA 1KTCA 4K8HA 1DOSA 5F2GA 4NUWA 3W1LA 4ML9A 3MYPA 3F4WA 4DPPA 1H7NA 5A5WA 4IOTA 3PBWA 3MP4A 2E68A 3W7NA 4MPQA 1KM1A 4WXZA 1TJRA 3DFNA 3LDVA 3M41A 4K39A 1GWJA 3N9RA 3JS3A 2VKZG 4M7TA 3S5YA 1G4EA 5LGXA 2V0TA 4O19A 1W37A 5HQEA 1LYXA 2QCMA 3W74A 3E02A 3GDTA 3A23A 2OCZA 3W83A 2EKCA 1W8SA 5CZ0A 3KVJA 1JVNA 3NG3A 4DF0A 3IIPA 3UY8A 1R30A 5K3VA 3L2IA 1PV8A 3WK3A 1WDWA 3BG5A 5H2ZA 4JX5A 2FIQA 2XN0A 5D2YA 4A29A 4O53A 4O1BA 4N4QA 3TE9A 2CW6A 4TMCA 1C29A 2WV8A 2A6NA 3NQ7A 4UTLA 4BI6A 3I7SA 1NF7A 3UXDA 3LCLA 3NOEA 4CNNA 2YSWA 3M5YA 3W7GA 5KMYA 1OX6A 1P0KA 3D0CA 5D2XA 4NJHA 4NX0A 3VFLA 3MW7A 1MEHA 2FPTA 2W6RA 3GDKA 4GUHA 1I2OA 2GQ9A 3A24A 1G7VA 3WK0A 4Z08A 4PEKA 4DBDA 4LV9A 2OMAA 2NV2A 1ADOA 3OHIA 3A9IA 1BWLA 1KBJA 1ML1A 3I6RA 4PFMA 1OK6A 3QQ0A 1OFDA 1DBTA 1E51A 4MLJA 3S42A 1BEUA 4K7YA 5D30A 3ZS4A 1NFBA 1QR7A 3PULA 5F4SA 3H55A 1DJNA 5IM51 4TIMA 3LBCA 3LV5A 1OFOA 2NX1A 3GDRA 3W1UA 3U2OA 2GVGA 1JQXA 5LSMA 2CLEA 3GNNA 5FI8A 2X16A 2QCLA 2VFFA 3P67A 1KTBA 2FFCA 1QPRA 1SW3A 3LGEA 1X8FA 2E5DA 1SPQA 1L6WA 4JTTA 2J88A 2PCQA 1RV8A 2A7PA 1EWDA 3CWOX 3E0IA 5G1YA 4S1FA 1FQ0A 1WOAA 3IEBA 3WJWA 4ZQOA 2J9XA 4LOCA 1TQXA 4KFNA 3W7JA 1DVJA 2JGYA 3PBVA 5I3HA 4RZ5A 3EXTA 1SSDA 3G18A 3I65A 1K7XA 1J2WA 2QCNA 3KHJA 1SFJA 4Y8FA 3W7HA 2FDSA 3NR0A 1ONRA 4WY0F 4IXHA 3TAOA 4OHQA 1KFCA 3KVLA 3LRMA 3TK7A 3BGJA 3UWYA 2H3BA 3HBLA 2B7QA 2YX0A 1VJIA 1VYRA 5I3IA 3M6YA 3P8IA 4DO5A 3L66A 4HNNA 2V5BA 2ZZ2A 4R7JA 1I2RA 1EUNA 3H53A 3TAKA 1GVFA 5FF3A 3DFSA 4Z1CA 4NXKA 3HIJA 3U8GA 5CKSA 3IIXA 4OV4A 2E77A 4DEFA 2ZA2A 2J27A 4E2BA 1LOQA 4JTIA 2ZZ6A 2BX7A 5FEZA 2J6XA 2J9YA 3C2FA 2QKFA 5BW6A 3UWZA 3BG9A 2ZRVA 3ATYA 3DH7A 3NPXA 1F73A 3TKFA 1XDMA 3ZFHA 4JXCA 1H51A 2DZVA 3SFKA 4Q4KA 2JGQA 1XL9A 1FWNA 3M5ZA 4LS0A 3PUOA 4CCEA 1TPEA 3G1FA 5D04C 4M5PA 2V81A 4MZYA 1VCGA 1SU5A 5TBOA 3W1RA 2FB2A 3UYCA 3FS2A 4CNOA 4GFSA 1VZWA 4ADSA 2Q8ZA 4TMBA 1M6JA 3DI0A 1EA0A 3NNTA 3IGSA 2J9ZA 1J5TA 3FOKA 5EY5A 3M5VA 5DLCA 1WAUA 4FX7A 4JX4A 1VCFA 3TFXA 2I1OA 4UTKA 3NZ1A 4O14A 2Y88A 3G8RA 3OA3A 3NQAA 3MI2A 2YCEA 4LVBA 2CWNA 4PA8A 4GNJA 5CSSA 1VLWA 1ALDA 4FB7A 3DI1A 1W31A 3G3DA 3CM4A 4O54A 4IPIA 5MHBA 1O60A 3UQNA 1A5AA 1T96A 5SWUA 2WOQA 5I3JA 1A5BA 1YPIA 3W7RA 2ABAA 5I3GA 4TU1A 3M7WA 1ZAHA 1IXOA 3N2MA 1K02A 4O50A 4O28A 3WK1A 3GYEA 3W2NA 3B05A 4FEZA 2WNZA 2Y7EA 3W7KA 3IRDA 4Y6GA 3ABOA 3SECA 3QMRA 5F2MA 3WK2A 1GG0A 2FLIA 3NQ8A 5AYZA 4YWIA 1UUOA 2PC4A 4YCOA 1VCVA 4I9AA 2ZFAA 1I45A 3LLDA 3LCHA 1JCJA 3BO9A 2YFNA 2ZA1A 2R8WA 3UWQA 3JR2A 4HKPA 2BLEA 2X2GA 3K30A 4MIMA 1RQBA 4Z1AA 2DJXA 2A85A 5KINA 2ABBA 4TX9A 4E38A 1TPB1 1D9EA 3PR2A 2A1YA 4IWWA 3THAA 4DXVA 3S1XA 1ME9A 5AHEA 3TW6A 4JTJA 1LRTA 3P5ZA 1H7PA 4FF7A 4KFPA 5DY2A 1TPWA 4GUFA 2Y7GA 3W2KA 2ZZ4A 2E6DA 4FXSA 3EXRA 1SFLA 1UBSA 1U5JA 1O5KA 3WJZA 3LHUA 1QCWA 4FHAA 1AMKA 2EF9A 3W2MA 1H7OA 1FDYA 2ISVA 1HTIA 1T0OA 2BXVA 3STEA 1QO5A 1WQ5A 4CLMA 3RNDA 4DELA 1DV7A 1OFAA 4RXGA 4I7WA 1OX5A 1KLYA 5LHFA 3PB2A 3IIVA 1SO5A 4FNUA 2Y70A 3DBPA 4U28A 1U83A 1W3NA 2ZYFA 3WJXA 4H4IA 4E0CA 1AL8A 2Y63A 1AW2A 3M1ZA 3QJAA 1AW1A 4O17A 2QJGA 3HF3A 3DFTA 1YDVA 3LHTA 4Z0JA 3W7MA 3C2EA 3EX3A 8TIMA 4UMBA 5FEXA 1MEIA 2ZQ0A 2GQ8A 4X9SA 3TSMA 3EEGA 3LX9A 2WSQA 4NNBA 5AOUA 4RZ4A 3EX6A 2YDAA 3TC7A 1KFEA 5LNRA 1KBIA 2E6FA 3KX6A 3PY2A 4UFLA 1B4KA 3P82A 1SR9A 5G5IA 1JR1A 4A21A 2RDUA 3M44A 3STGA 1ICPA 3LHWA 1JUEA 3LTYA 5BOOA 2WPBA 1M5WA 1TPH1 1QOPA 3G1HA 2QCHA 5HUOA 4EIVA 4O11A 3EWZA 4YMZA 1TSIA 4O10A 4ONVA 3W07A 2F84A 3JRKA 1QO2A 1LOLA 3SSJA 2CFFA 4BWLA 2CU0A 3TA6A 4K7VA 5EYWA 3LB0A 2WNNA 3M16A 4IX0A 3UWUA 5U4NA 4I7UA 3B04A 1L9WA 3NQ6A 4A22A 1JCYA 4W9TA 2B7PA 3INPA 4DQWA 3TU9A 1F7BA 3R89A 1KM6A 3LRKA 3QMTA 2Z2UA 4Y96A 2H8XA 4JICA 1QWGA 3BW3A 3TFCA 4GUIA 3IV3A 4IMCA 1MO0A 1G67A 4M6PA 4IX2A 4OWGA 3P81A 3PAJA 1J4EA 1JULA 1LROA 1TRDA 1GT8A 3PSWA 2NX9A 4UTWC 1TPDA 1SZNA 5A8GA 4EVZA 1OFQA 4L4LA 3G1AA 1QNVA 3W1TA 4MLRA 1OVDA 2NUYA 2TPSA 5G1TA 3BARA 1F6KA 1FXPA 3L0GA 2QCDB 3S1WA 4ZQRA 3CEUA 3VE9A 5K9DA 2H8ZA 3FYOA 4JTLA 3TR2A 3E96A 3MHGA 2DJLA 3TSDA 3NDOA 3LXAA 3Q2DA 4XTIA 2BTMA 4RZ6A 3DKJA 2CLHA 5D2VA 3LCWA 4OV9A 4LVDA 4MYXA 3NQDA 3QH2A 4Q32A 3SZ8A 3MI3A 3STCA 2RH9A 4IMFA 1JUKA 1I2QA 4C1KA 1A53A 5CZTA 4Z1DA 3TQVA 4Y90A 4JTHA 3G0XA 1TTJA 4LRSA 3W22A 3FKKA 3FA5A 1TTPA 1PE1A 3C56A 3EWWA 3USBA 3A22A 3MYOA 2ALDA 5AC7A 4PL2A 2QUVA 3KXQA 3LHVA 4GWEA 3QPZA 1R46A 2I14A 3GK0A 2ISWA 3CQ0A 3DZ1A 3OEXA 3BW4A 1GVSA 1GVQA 1LP6A 3FYPA 2Q8LA 4N02A 3EWUA 1OYBA 4CQ9A 3HMJG 3DHDA 3VI2A 4JD4A 4D2JA 4WY0A 3DGRA 4O8RA 3ANYA 1I2PA 3IVSA 3P80A 2BSLA 3FEMA 3WFAA 4MFEA 4LUJA 3I68A 3PUDA 2QEZA 3G0SA 4RV8A 2CLKA 3TW7A 2JKPA 3S5ZA 1H1YA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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