4LVB | Genus

Total Genus 172

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	172
sequence length	480
structure length	471
Chain Sequence	EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

publication title	Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT). pubmed doi rcsb
molecule keywords	Nicotinamide phosphoribosyltransferase
molecule tags	Transferase/transferase inhibitor
source organism	Homo sapiens
total genus	172
structure length	471
sequence length	480
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date	2013-07-26

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF04095	NAPRTase	Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A	PF18127	DUF5598	Domain of unknown function (DUF5598)

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4lvbA02

3DENA 1H1ZA 4HNTA 1I2NA 1G69A 3OVQA 2VC6A 1Z42A 1ME7A 3IEBA 3PF3A 4UTMA 3G24A 1SR9A 2I9EA 2FB3A 3N34A 3N73A 2JKPA 3P81A 1DVJA 3A22A 3HG5A 4NZJA 4TIMA 1W31A 3OVRA 1VCFA 1L2UA 3UXDA 3WJXA 1B9BA 5LHEA 2ZZ1A 1JUKA 3BVJA 3GXTA 3LXBA 4N9CA 5D2WA 3HPSA 3GR8A 1TJRA 3I65A 1K03A 3FA5A 3M41A 1TB3A 4A29A 2V81A 4KFOA 5DCEA 1F74A 2YX0A 3B06A 3LTYA 1W56A 3KVMA 1FY6A 1ADOA 3W3OA 3IVTA 3DFQA 1F76A 1GJPA 3RK8A 1RV8A 1W5NA 3NYZA 3G1YA 3BW3A 4M7TA 1EWDA 4AEOA 4K36A 1AG1O 1VHNA 4AWSA 3HG2A 3QW4B 3EX2A 1PIIA 5KITA 2C14A 4UTWA 3Q58A 3QMTA 1LTDA 2TSYA 3PBWA 4E2DA 1O5XA 4JTTA 1ML1A 3CB8A 3NQ7A 2JKAA 4AHQA 4WXZA 3QQ1A 1WXJA 3QPYA 4O1DA 3W7CA 1ICQA 2E6YA 1VPXA 5FF3A 3EX1A 1QOQA 3EEGA 3K30A 1DQXA 3LI1A 4FIQA 3WK3A 1KM4A 1GTEA 3C6CA 2NX3A 1W37A 2WNNA 3TMLA 3DI1A 3NPXA 1H51A 5I3IA 3I7SA 4RCXA 1ME9A 1LZOA 2QJHA 2VKZG 3QMRA 3HMJG 2J9YA 3FJ6A 4HNUA 5E1QA 1VYSX 3QM3A 2GQ9A 2A4AA 2CLKA 3TC7A 5FEPA 1TPC1 2DZXA 3UPWA 1X7FA 4PEKA 3S0CA 1KM0A 1G7VA 3TUUA 2FPTA 3LHYA 1QDSA 1JQVA 1KM3A 4N4QA 2A0NA 4O0ZA 2GVGA 3B4UA 3S1XA 2GJLA 4N6FA 5DBTA 4P61A 1KLZA 5G5IA 2WO5A 3DXIA 3H53A 3GDLA 1O95A 1R47A 5FF4A 1T8XA 2JGYA 2Z0IA 3KFTA 4GFSA 3TE9A 3NG3A 2ABBA 5F2IA 5F2MA 2CZDA 4MKNA 5CPMA 4IMDA 1TTIA 4LUJA 3EWWA 4S2BA 1FCQA 5HQEA 5HMSA 2G95A 3W87A 2Y7DA 4CCDA 4LWWA 3W7EA 3LCFA 3DI0A 3TR2A 4RK8A 5KZMA 2UV8G 3LHZA 1OK4A 2ISVA 3W23A 4Z0JA 5K2ZA 2CZ5A 1O5KA 4XUGA 3S1VA 3G3MA 1SFLA 4LV9A 4JTKA 1JUBA 2GVLA 2PRHA 3TXVA 4DELA 3ABRA 3L9CA 3QW3A 4PCFA 1XBVA 2C6QA 2QCFA 1XBYA 2A7PA 4WUIA 3SZ8A 4LVDA 3UD6A 4ALDA 4R7JA 4RXFA 3R13A 1H61A 3EXRA 4MLJA 1JRCA 3TROA 3P8IA 1ZHAA 2R14A 3W07A 4LS0A 1OK6A 3W73A 1K7EA 3NEVA 1GTHA 1JCMP 4IX2A 5DY3A 1UASA 4JTHA 3L0KA 4MY8A 3LB0A 1RD5A 3UWQA 1RPXA 3LXAA 4BK9A 2VFIA 4Y9AA 4JR5A 1C29A 1JQXA 4OGZA 3UQNA 4CQ8A 3B03A 3O16A 3THAA 2P10A 2BWGA 3NQVA 3WK1A 1LRNA 4AXKA 4O0KA 4ADSA 2FDSA 3BW2A 3PSWA 5TBOA 3B04A 3RLUA 3TIMA 1F05A 1AL7A 3YPIA 3ABOA 2TRSA 2E6DA 2LLEA 2QJGA 3N9SA 3SFKA 1YPIA 3R89A 4DF0A 4XZ9A 4O8RA 3LRKA 3FJLA 3SIZA 5LNUA 2CLOA 3O6YX 4UTHA 1H1YA 4WX2A 1U83A 4ZQRA 3M5VA 5IM51 1NF0A 3NXFA 3BK0A 4IMCA 2X30A 4LRSA 1QO5A 2WNQA 1G4PA 3R2GA 3W2NA 3S5NA 5AOUA 5G4EA 4DBEA 3PR2A 2OZ0A 2ZBTA 3RF9A 1QPRA 4K8HA 4ZQMA 2XN0A 4QQ3A 5G1TA 4BFAA 3CEPA 1PE1A 1O94A 4RJEA 3QSTA 3S5OA 2VENA 4RZ5A 1TQJA 2B7OA 1QR7A 2YFNA 1OX4B 3CEUA 3I7QA 3N2XA 4G1KA 5C54A 1KLYA 4JTIA 1YXYA 3LM7A 4ZQOA 1J2WA 5HUOA 4BI5A 1GWJA 2ZTKA 4NVTA 4KFNA 1QPQA 2YZRA 1G7UA 5A5WA 3S6DA 3S8HA 1OF6A 2ZZ4A 4LC8A 4IXXA 4O4WA 1A5SA 4HHPA 5LNRA 1ZAIA 1IGSA 1PHQA 1JR1A 3GR7A 2OT1A 1KA9F 3QRHA 2YFOA 3NO5A 1GYNA 4OQVA 1M6JA 1ZNNA 2X1RA 1OFBA 5EBUA 3TXZA 4FXRA 2ATMA 3HGJA 3P62A 4LU0A 5AHFA 1Q6RA 2FJKA 4WJEA 1DHPA 4TMCA 2H3BA 5AB3A 3LOTA 1AK5A 2RDTA 2C3ZA 1RZMA 3KX6A 2CU0A 2Y7GA 1KM2A 3UZ5A 1GVRA 4XBSA 3FKKA 4N6EA 5DXXA 3PBYA 5F2LA 2BTMA 2BXVA 5DBUA 4PTNA 1UUMA 2H3DA 3W1UA 3UYCA 2A6NA 2OCZA 4FNTA 3ZWTA 4JEQA 5T26A 1PHWA 3M47A 1HO1A 1G4SA 3ATZA 1HTIA 3VFLA 2CFFA 4UNLA 1P0KA 5LHFA 1THFD 4NJGA 3W7JA 2ZFAA 5LGXA 3GKAA 4M7SA 4LS2A 1G4TA 1HG3A 3W7NA 4JTUA 4MYAA 4XKYB 5F2GA 1MO0A 4JICA 3W7LA 1W3TA 4GUJA 3TAKA 2NV1A 5G1YA 1K7FA 5EMUA 4EIVA 1P5BA 2CLFA 1X1ZA 4MPQA 5K4ZA 2VEKA 3ZR4A 4DPQA 1JCXA 4HNNA 5AC6A 3NPUA 1EUAA 5G2WA 3NQMA 4UTTA 3W7HA 5EPDA 2Q8ZA 2ZZ5A 3EXSA 3EB2A 4S2CA 1F7BA 3LV5A 4Z1DA 5IBXA 4R53A 4Y6GA 1DJNA 3MI2A 2Y61A 4IMGA 3LLDA 3O8AA 5BW6A 1I2OA 1YDNA 4JDBA 3M5XA 1GYLA 3ELFA 1AMKA 2QUVA 3L0GA 3IGUA 1TPVA 3W9ZA 3LCWA 5U4NA 2CLIA 2QCDB 4PODA 2Z1BA 2C13A 2GQ8A 4LV4A 5EY5A 1W0MA 3VKJA 1X6UA 3S1WA 3BG3A 5K9DA 1OG0A 3HO8A 4OHQA 1MXSA 2PURA 4Z1AA 1AW2A 3TMQA 3QZEA 1EUNA 3C61A 2DZVA 4JX6A 2WQPA 4MZ1A 2GPTA 1OX6A 1VS1A 1SO6A 2ZRXA 2X1TA 3A24A 3G1DA 3M5YA 5K9XA 3NQ2A 3GAKA 4IWWA 4NNCA 1SQ7A 4S1FA 4DO6A 4UFMA 1QO2A 2P0OA 3HGRA 3STFA 2ZTJA 4JGDA 4LS1A 2ZA2A 4LT9A 5HWNA 2ABAA 4WQ6A 1IXNA 1TRDA 1KV8A 1IXOA 4UMCA 5EYWA 4JN6A 1I45A 3EWYA 5AHEA 3STCA 2VFGA 3P7YA 1QFEA 5HR7A 3DKLA 2TYSA 4FIRA 1FXQA 3BLFA 1LRQA 2KZHA 3A23A 1H62A 4JYDA 4FNQA 1X8FA 4IPIA 4RLIA 3CIWA 4HNVA 5AN7A 3MP4A 5E93A 3MUXA 1SUXA 3ZWSA 3C2RA 1FX6A 1S3HA 5D30A 3E96A 5DY2A 4WOZA 5D2XA 4TU1A 3A5VA 1JRBA 3AJXA 3TQ0A 4BWLC 3TKFA 4AF0B 3NPWA 1KFLA 2NWSA 1SO3A 1W3IA 3W1QA 3HB9A 1W1ZA 3W1AA 1RQEA 1TV7A 2JKEA 3FYPA 4QM1A 3TQVA 4GUHA 1M5WA 5LKYA 3B0UX 4NJKA 3TCEA 5AYYA 4LNYA 1PCWA 1XFBA 1LLWA 2BLEA 1G6CA 5CSSA 2E5DA 3CTLA 2NZLA 3V75A 3W84A 3G22A 3CIXA 3B0VC 2QKFA 3NQAA 2DU2A 3BGJA 1FDYA 2I1OA 3C2FA 4HIBA 5D37A 3MBDA 4PFMA 4KFPA 2V2HA 2Y7FA 5AHLA 5LNVA 1W5QA 3LRMA 1HFBA 2H90A 2Q8LA 5FF2A 3TFXA 4YXGA 1LCOA 3VE7A 4JY9A 3EWBX 1XI3A 4NJHA 2E1DA 1TSIA 2X2GA 3FOKA 3MMTA 4LVFA 1P0NA 4IGHA 3PG8A 5C55A 5BMWA 3SY5A 2DZSA 3C8FA 3N9RA 2NXIA 1VRDA 3UZJA 4GJ1A 2J9ZA 3G0SA 1L6SA 3SJ3A 2ZZ3A 1TJPA 2PRLA 2WSYA 2ZA3A 3C3NA 3S1UA 1OABA 4NX0A 2ZRVA 3FS2A 3TW6A 4ADUA 2PRMA 4L4MA 1FWSA 5LNSA 3TDFA 4I9AA 1PV8A 2FQIA 2YW4A 1FQ0A 1YXCA 5AHNA 4ADTA 2DZUA 3W7GA 2NUWA 2JK2A 3G3DA 3MP5A 3ABQA 1P1XA 5G2IA 4DEFA 4FNSA 2PCQA 1HUVA 1AW5A 4WY0B 2G97A 2NLIA 3HF3A 3IVSA 4RKAA 1FDJA 4ZVJA 2V0TA 3W72A 1P4CA 2ZRWA 3C0JA 4XWUA 3BPWA 3W7DA 3GX9A 3M43A 5EL1A 3EXTA 2Y88A 2A7RA 2WJZA 3TAOA 2F7FA 3BARA 4NXSA 1D9EA 1S5VA 5I3HA 2Q3RA 3T78A 1MSSA 4RV8A 3MW7A 5HR6A 4JXCA 4C1LA 4N9BA 3C2VA 3P67A 4HN4A 4O4VA 2BX7A 4JX4A 4RX0A 3MI6A 1BTMA 4O52A 1TTPA 1SU5A 1QNVA 3P82A 4NX5A 1HO4A 1LLZA 3NQDA 1WBHA 1K8YA 2CLLA 3HG4A 4MFDA 1H7PA 5TQLA 2YYUA 4YCOA 4Y8FA 1Q45A 3IV3A 4N4PA 3GB6A 5FESA 4JYFA 1OF8A 2V8ZA 3G0UA 5AYXA 3JS3A 5CZSA 4YMZA 1DQWA 5F1VA 3W2JA 3G1VA 1AW1A 1UUOA 4HSOA 1R30A 3NQFA 1DJQA 5KZDA 3KRSA 4K6AA 3T4CA 4Z1CA 2Y62A 3W76A 1FXPA 2OX1A 4CCCA 4LUIA 5AHMA 4HPJA 1Q6OA 2C18A 1L9WA 4GUFA 1YYAA 3PUDA 4UCGA 1TV8A 3BLEA 2WOQA 1I2PA 1H50A 1DORA 1JCJA 1VCVA 2EHHA 1XL9A 1EA0A 2JBMA 4IJBA 4E0CA 3DFPA 4MUZA 4TO8A 3F03K 1WAUA 4JIPA 2I14A 1CX9A 1FWNA 1FUYA 4M19A 2NXGA 3TV8A 2Q3OA 4AHPA 5HWJA 3W1PA 3W74A 1XKYA 3MBFA 1S5WA 1FCVA 4NQ1A 1VLWA 1OFDA 1EEPA 2VFFA 4UR8A 3O15A 1T99A 2FPYA 1PVNA 4JD4A 1GVQA 2YCEA 3IIOA 1OYAA 5E0KA 1VCGA 2X16A 3DU0A 4OE7A 3UWWA 2QCDA 1YPFA 5DCDA 3DHDA 1LBFA 1OYBA 4PL2A 1QWGA 3NVTA 3W7IA 1GZGA 3CPRA 3GXNA 4MZ8A 1NAL1 2EAWA 1H7NA 2Z6IA 4Y90A 3OBKA 2X1UA 3QC3A 3DGRA 3QQ0A 2VFHA 3P5YA 4M6QA 3W70A 3TJXA 3PG9A 2WNZA 4HT3A 2HSAA 1VGAA 3WJSA 2V2CA 1XDMA 3P80A 3PUOA 2OMAA 2Y7EA 4BI7A 4UTWC 2XN2A 4H4IA 3SGUA 3GDRA 1ZJIA 1LBMA 3MO7A 4JTSA 3FEMA 4O1BA 3KHJA 2CWNA 3NQCA 4UMAA 3KRZA 3UY8A 3BGGA 3GAYA 3GNNA 4O1CA 1RQHA 2HTMA 4E2BA 1NSJA 3C4UA 4IPJA 4PA8A 2QF7A 4M6PA 5L6UA 1ZALA 3PAJA 3LI0A 4M6VA 3OIXA 1QPOA 4DF2A 3M7WA 2Y89A 4IX0A 1F6KA 2E6FA 3BO9A 5I3GA 4TMBA 1H63A 2B7NA 5D2VA 2J9XA 2NX9A 4RR4A 4MLRA 1O60A 3NL5A 4K7VA 2Y85A 4P2VA 1A5BA 1LORA 2Y6ZA 4JIQA 4A3UA 4UFHA 3T44A 2HS8A 2E5CA 2CLEA 5F4WA 1NFBA 5EA9A 2J24A 4UNKA 1FWRA 3L67A 2E68A 2EPHA 1K02A 4LOCA 4A2RA 1L6YA 4EWND 1GG0A 4ORMA 2ZZ7A 1JCLA 3G1FA 4O1AA 2RFGA 3O6DA 1FDZA 4UC5A 1GVFA 3BLIA 4J9JA 4I7WA 5BOOA 1XUUA 4AMAA 1TPEA 2ZA1A 3OEXA 2Y70A 4IMFA 4Z1BA 2Z6JA 2GVJA 4CQAA 4GE8A 1Z41A 4OU1A 4JS3A 1O4UA 1T0OA 3NDOA 3CC1A 1HL2A 1R2RA 5DLCA 1XBZA 2WSQA 3SGZA 1LBLA 2V5BA 4DXVA 3LV6A 5D09A 3DKJA 1VQTA 1SW3A 4FEZA 3IRDA 2NUYA 3E49A 5CGQA 1YXDA 3EX3A 3OVPA 3PB2A 4UUIA 1PL9A 4NNBA 4A22A 3M1ZA 3LBMA 1MEHA 4GWEA 3PB0A 1R46A 4Y96A 3VNDA 1OHLA 2QEZA 2R91A 3GZ3A 3F1QA 5D02A 3DH7A 3PM6A 3A21A 4Q32A 5FEZA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4LVBA

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