4LVBA

Fragment-based identification of amides derived from trans-2-(pyridin-3-yl)cyclopropanecarboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (nampt)
Total Genus 172
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
172
sequence length
480
structure length
471
Chain Sequence
EFNILLATDSYKVTHYKQYPPNTSKVYSYFECREKKKYEETVFYGLQYILNKYLKGKVVTKEKIQEAKDVYKEHFQDDVFNEKGWNYILEKYDGHLPIEIKAVPEGFVIPRGNVLFTVENTDPECYWLTNWIETILVQSWYPITVATNSREQKKILAKYLLETSGNLDGLEYKLHDFGYRGVSSQETAGIGASAHLVNFKGTDTVAGLALIKKYYGTKDPVPGYSVPAAEHSTITAWGKDHEKDAFEHIVTQFSSVPVSVVSDSYDIYNACEKIWGEDLRHLIVSRSTQAPLIIRPDSGNPLDTVLKVLEILGKKFPVTENSKGYKLLPPYLRVIQGDGVDINTLQEIVEGMKQKMWSIENIAFGSGGGLLQKLTRDLLNCSFKCSYVVTNGLGINVFKDPVADPNKRSKKGRLSLHRTPAGNFVTLEEGKGDLEEYGQDLLHTVFKNGKVTKSYSFDEIRKNAQLNIELE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase/transferase inhibitor
molecule keywords Nicotinamide phosphoribosyltransferase
publication title Identification of amides derived from 1H-pyrazolo[3,4-b]pyridine-5-carboxylic acid as potent inhibitors of human nicotinamide phosphoribosyltransferase (NAMPT).
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 172
structure length 471
sequence length 480
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.12: Nicotinamide phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2013-07-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04095 NAPRTase Nicotinate phosphoribosyltransferase (NAPRTase) family
A PF18127 DUF5598 Domain of unknown function (DUF5598)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4lvbA02
5TBOA 3LXCA 1W0MA 4QITA 2F84A 1RD5A 1FX6A 2A6NA 3W2UA 3GDLA 3L21A 1OX6A 1QMLA 3L0NA 1RQEA 3NQ8A 4L4MA 1I2RA 1TIMA 4AB4A 4TIMA 2A2IA 3W7LA 3UPWA 3QPZA 3I7RA 3VE9A 4ML9A 4MVAA 1DJNA 1SO6A 2QCHA 4Y96A 3ATYA 3W7NA 4IMCA 3L2IA 5DY3A 4UTHA 3NQ2A 1G67A 2E6FA 3QFEA 2ZA1A 5LHEA 3TAOA 1A50A 3W7JA 4EF9A 4JTSA 4JR5A 4XUGA 5G1YA 3HJZA 3PUOA 1W5MA 4BF9A 1MZHA 4QQ3A 1B9BA 1WBHA 2IQTA 2DZTA 4XKYA 5AHIA 1QOPA 4PTNA 3C56A 2QCMA 3VKJA 2OMAA 2X1UA 1PCKA 2GJLA 3TX9A 4RR4A 3EWYA 3NOEA 3MBDA 3SR7A 3RLUA 1JCLA 1A5SA 3O8AA 3LCIA 4WOZA 1EWDA 3NXFA 3UWQA 3TR2A 1NVMA 5LNRA 1IF2A 1ONRA 4HIBA 2CU0A 1S5VA 2A0NA 3WJSA 2VENA 1OF6A 2H3DA 5DXYA 1OFDA 3N19B 3RLVA 2WNQA 3SIZA 4PL2A 4LVFA 3VFLA 4EWND 1WQ5A 1VR6A 4LUJA 3TU9A 4X3ZA 4E2DA 5MHBA 3L68A 3KRZA 3JRKA 3QEZA 3FIGA 3N9SA 1TQJA 1PIIA 3NM1A 4HNNA 4WXYA 2CLHA 1DL3A 1EEPA 1TJPA 3S1WA 3N2MA 2B7PA 2QUTA 1FWRA 2J9XA 2P1FA 4W9TA 3W2NA 4Z0SA 3W07A 2H90A 3VCRA 1HL2A 4UR8A 5F1UA 4LV4A 2CLOA 1WV2A 5C54A 4HPJA 3T4CA 1G4PA 3DI0A 3TC6A 1ICSA 3TW7A 4Z1BA 2QR6A 1X1ZA 1S3HA 1XM3A 1TB3A 3QMSA 1XBZA 4O19A 3TE9A 4N6EA 2OJPA 2QAPA 3RU6A 1PCWA 1Q3NA 5H2ZA 3Q2DA 5HJLA 2Z0IA 1VCVA 2Q8LA 7TIMA 4O8RA 2QCFA 5LNWA 3W2MA 1DORA 3N14A 1VHNA 2ISVA 4YWIA 3BV4A 3UZ5A 1XKYA 1XI3A 4E2BA 2ZCGA 3C52A 3LHUA 1E51A 3W23A 3NO5A 3GR8A 1VPXA 4AHPA 1EIXA 2FTPA 4KWWA 1JR1A 3OHIA 3ZFHA 2D73A 3G8EA 4NZFA 3SI9A 1OJXA 1QPOA 3E96A 5HWNA 5IM51 2O7SA 3L0KA 4QIUA 1OFQA 2RDUA 1OYCA 1SO4A 3UWWA 1T96A 1GG1A 1C29A 4A3UA 2R8WA 5K3VA 3L0GA 2E5DA 2Z2UA 4GUHA 3KXQA 1FDJA 1M6JA 1SQ7A 3W83A 3NQ6A 2OX1A 1EUNA 4TR9A 1KV8A 4LVDA 4HSNA 5HR7A 3CWNA 1UUMA 4K8EA 5F1VA 3F1QA 3B03A 1I2QA 4R33A 2JGYA 3LCFA 3LM7A 1K8XA 1HFBA 1KTNA 3B0PA 1F6PA 3P84A 3DHFA 3B0VC 3BLIA 3NYZA 1S5TA 3UY7A 4GFSA 2R91A 4UFLA 1H7XA 3C2VA 3FYOA 5K2ZA 1LBMA 4GC4A 3PVFA 3G1YA 1OFAA 3JR2A 5HWJA 1FWTA 5BOOA 1ADOA 3HF3A 4MY8A 3W7HA 1DKWA 3N3MA 4HNVA 1FDZA 2PRMA 1LROA 1X6UA 2GQ8A 3CHVA 5CKSA 5G1TA 4JDBA 3HGOA 2NV2A 5FESA 3FS2A 1AW1A 1EB3A 1P0KA 1MO0A 2WSYA 3PAJA 4ADTA 5FEWA 3M7WA 1I2PA 3QZEA 1TO3A 2J24A 4ADSA 1O5XA 2OT1A 5EYWA 3OEXA 5D02A 4E38A 5KZMA 4O54A 2CFFA 1LBFA 3C2FA 3R89A 2DORA 3V1PA 1XXXA 2Y88A 1YTKA 2FPTA 1YTEA 3FJ6A 3HGRA 5AHFA 3NQMA 1J4EA 5EY5A 1KM3A 4UFKA 3OVQA 3S1UA 4O1CA 2ABBA 2UV8G 2ZZ7A 1N7KA 1LM1A 4NX5A 4OE7A 3A9IA 4MY1A 1JJKA 2EHHA 3LHTA 2Y62A 4ZQPA 1DHPA 3MWAA 4O52A 1VYRA 3TFXA 3IGSA 1Z42A 1ZALA 3NPXA 4BI7A 2RH9A 3IVTA 1WYIA 3NNTA 4MOZA 1IIGA 1W37A 3NL6A 4J9JA 4LS0A 3W72A 4M19A 5IBXA 4BFAA 2V0TA 3HGSA 1UBSA 3W7DA 2EGZA 1SSGA 3DH7A 5FF7A 4RLIA 1P4CA 2P10A 1TPEA 1YDNA 4I7UA 1T0OA 4GUFA 3QYQA 2YW4A 3W1PA 3TNOA 1WX0A 1P0NA 2X16A 6ALDA 1RZMA 3SY5A 1IXNA 3L65A 3C0JA 3EXTA 3MP4A 2VEIA 4R34A 1GQNA 4GUIA 2DJXA 4G1KA 2A7RA 4IPIA 4Y8FA 1JQXA 1YPFA 1KM5A 4NUWA 3T7VA 3NEVA 1GVSA 5C2XA 3H54A 2RDTA 3TA6A 4P61A 3DFPA 1ZNNA 3BG3A 4M7SA 1VJIA 4YXGA 1DVJA 5LZLA 3CM4A 4AWUA 1P5BA 3W88A 3QMRA 4JTTA 3NL3A 4K36A 5I3FA 4ONVA 1KLZA 3HG3A 3M5VA 3HGJA 2G97A 2B7OA 5D32A 1QFEA 2PCQA 1VS1A 2CZEA 3O6CA 4P2VA 2ZQ0A 3ABQA 5D30A 2TRSA 1C9DA 4O0ZA 4UFIA 4ZL1A 4WXZA 3Q58A 1Q6QA 2RDWA 3B4UA 4WX2A 5CZJA 3C6CA 4OV4A 3CB8A 1YLVA 2R14A 4UIOA 1EX5A 5A5WA 4FO4A 1OHLA 3GZ3A 3R12A 5EKYA 2QCLA 4NJJA 4DPQA 4EF8A 4BI5A 3NL2A 1TTQA 5DCBA 1L6SA 1EUAA 4AF0B 2QUVA 2VFFA 3TKFA 4WUIA 1W31A 1C8VA 3AO0A 4O1BA 3W7KA 2BX7A 3W2KA 3WJYA 3TCEA 2J9ZA 3E0IA 4PL1A 3DZ1A 1K02A 1R2SA 4FX7A 3DGRA 3LI1A 3LHZA 1LRNA 2DZSA 2ZTJA 3NVTA 1G4SA 4O18A 4FEZA 4NX0A 3W73A 1O95A 3PBYA 4N9EA 3EXSA 2FDSA 3Q37A 3W22A 1GTHA 2J9YA 1G6CA 4LUIA 1FXPA 2QDHA 2RHGA 1UCWA 4YMZA 3CLMA 2TSYA 2WO5A 1GVFA 1OX4A 3GLCA 2C19A 1ZHAA 4PH6A 1KFEA 3MP5A 3IVUA 3GK0A 1DV7A 4JTIA 2FLIA 4WY0A 4JTLA 5K9DA 5HR6A 2CLIA 3G1XA 2J27A 4UTIA 4L4LA 3I68A 3HG2A 4RX0A 2QAFA 3LRMA 3ZR4A 1TV8A 3NM3A 3A23A 3CIWA 1JULA 2I1OA 3DI1A 1SUXA 3B06A 4CNPA 4RV8A 3GKFA 3HB9A 2YYUA 3D0CA 1SO5A 3WJWA 5H91A 1PE1A 1KFJA 1KFBA 1MEHA 2CW6A 4GUJA 1JRCA 5KINA 1K7EA 3BARA 3LRLA 4XTIA 4NXSA 3HPSA 4TU1A 3SECA 1LORA 4IMGA 1ZAIA 4CQAA 1Z48A 1SZGA 4K38A 3UY8A 5LKYA 1MEIA 1CX9A 1TJRA 4UTUA 5D2YA 1SZNA 4RZ4A 3P7YA 4NZJA 1W3NA 4ORMA 3M47A 4HKPA 2C18A 3DENA 4UTWA 2E5CA 4A21A 4DXVA 4UNKA 5CZSA 2ZDRA 3W87A 4AAJA 1ME9A 3MJYA 2NX3A 3OVPA 3DKLA 3C8FA 3KRUA 1SW7A 5BNKA 1QPQA 3F4WA 3DFOA 5D05A 1GPWA 1FCVA 2XN2A 4KWVA 1YTDA 4DBDA 3M6YA 2YDAA 3WK2A 3LCGA 4MJMA 4DEFA 3U6WA 1O94A 1TPVA 4MZYA 1VLIA 4NNCA 2E5BA 2CWNA 1PHQA 3TIMA 5DY2A 3KFTA 1LCOA 4AVFA 3DBPA 4NXKA 3GXTA 4UFMA 2FPYA 3QM3A 3IGXA 3TSMA 4DF2A 5I3HA 3NPWA 1HG3A 3L9CA 4Z1AA 4I9AA 3OIXA 3W7EA 3UWUA 3HIJA 2X1SA 4O1DA 1T8XA 2BXVA 3PBVA 1EA0A 1I4NA 1JCXA 5DELA 2QCCA 2BWGA 1OYBA 4XZ9A 4RXFA 3QRHA 2CLEA 4JTKA 4H3DA 2WOQA 1H60A 4GWEA 1G7VA 4OHQA 1IGSA 3CEUA 3T40A 4O28A 3WK1A 2VFDA 1QAPA 2ZZ3A 3LV6A 2G5WA 5FEZA 4MYXA 3M44A 4JEQA 3MI2A 2FB2A 1AL7A 5F2MA 1TCDA 3S1XA 2FPVA 1SW0A 3PBUA 4H4IA 3MI6A 3W3OA 1TSIA 3W2JA 1MSSA 1RR2A 2DU2A 5D2WA 3N34A 2ZA2A 4GXMA 5T26A 4GRSA 5AN7A 1A5BA 3HG4A 1K8YA 3GDKA 2PRLA 1LOSA 1JUEA 4JYDA 4XBKA 3P5ZA 4LVGA 4BK9A 2YPIA 1F05A 3GDMA 2B0MA 2QJHA 5SWUA 4ZMGA 3C61A 3LLFA 3T44A 3W7PA 4FNUA 2A5HA 2A6LA 3QQ1A 4N9CA 1SW3A 2WSQA 3G8RA 4NT0A 1IXQA 4U4MA 4UR7A 3TJLA 5HQEA 2VFEA 3A5VA 3A24A 1RQHA 4ZQNA 1XBVA 1JQVA 1R2TA 4LVBA 2BTMA 4M5PA 5FF0A 2P0OA 3W1XA 3EX2A 3U8GA 4JTJA 1NEYA 8TIMA 2B4GA 5AB3A 2ZBTA 1Y0EA 3INPA 3FKKA 4LWWA 4IGHA 5BMWA 5C6MA 1VYSX 3M5YA 2A7NA 5AC6A 1I2OA 3NAVA 5K9XA 1JCJA 3EWWA 3RNDA 3W7MA 1XUUA 4UTTC 4FB7A 4AXKA 1EP3A 4M6VA 3GB6A 1KV5A 3F4NA 4YCPA 1H5YA 4O4WA 1YXDA 4MYAA 1PL9A 4JTUA 1H63A 1VGAA 1W3IA 1B57A 1F73A 1H7OA 4O13A 2I14A 3TC7A 3O6DA 1QPNA 5EBUA 1WOAA 3M5XA 2Q3OA 4O15A 1FCBA 3LHYA 3IV3A 4IXXA 3TROA 3UD6A 4EIVA 2ZRXA 5CPNA 1YPIA 4ZQCA 3BK0A 3TQ0A 1H1YA 4CCCA 2W6RA 2V2HA 4LVAA 3W1MA 3MBFA 1YADA 4TMCA 1LLWA 1OF8A 1XDLA 1ALDA 4GE8A 3O16A 2ZRWA 4UFJA 4WZHA 1ZAHA 3DU0A 2C0AA 4O14A 3ANYA 2W0UA 2PC4A 5D04C 5G4WA 2Q3RA 5L9FA 3HO8A 4X2RA 3G3DA 6TIMA 2XN0A 3NGJA 4XKYB 3RFAA 4AWTA 3M43A 5I3JA 1GVQA 1LOQA 1XFBA 4FNQA 1LP6A 1X8FA 3TMLA 2DJLA 1J5TA 1Z44A 2PE4A 2YFOA 1QWGA 4A29A 4UTMA 4K8HA 1GT8A 1VZWA 3W86A 1H62A 3B04A 1XC4A 3MMTA 4BI6A 4MKNA 2JGQA 1VRDA 3G0UA 2QDGA 1ME7A 3DXIA 5AHMA 4XQ6A 4ZQRA 3IIVA 3W1NA 4I7WA 1VQTA 2AGKA 4IX0A 3T78A 1W5NA 3EB2A 5DCEA 1G4EA 4QAIA 1SSDA 1CI1A 1IXOA 1TPDA 3P82A 3EWXA 2Y63A 2ABAA 3STCA 1TRIA 1T99A 2QCNA 3IIXA 4N4QA 1KBJA 2G96A 4MZ1A 3TQKA 4BWLC 4IXHA 2Q8ZA 3YPIA 5U7SA 3P62A 1H7RA 3CWOX 3P8JA 5EA9A 4Z0JA 5U4NA 4MFEA 4ZQMA 3TDFA 4I7VA 3CC1A 1FBAA 2QCDA 3HPXA 4KFPA 1F2JA 1YXYA 2DP3A 3NZRA 2DZUA 4O11A 1ZENA 3KHJA 1I45A 4HSOA 3W1RA 2ZRUA 3KRSA 1S5WA 3MP3A 3PB2A 2V2CA 2CZ5A 3KVLA 4JS3A 3NQAA 2Y61A 3LXBA 3P81A 2ZRZA 2QCGA 4DQWA 2Z6JA 1AMKA 4OT7A 4N9DA 1KM0A 1KFKA 1ZY9A 3QW3A 1QDSA 3C2RA 2ZZ5A 2FIQA 2QEZA 3STEA 4K39A 4FHAA 1YXCA 4XTDA 1EWEA 5CG7A 5TIMA 4MPQA 2RFGA 3KAOA 4LT9A 1VH7A 2DZPA 2Z6IA 3PF3A 5DXXA 4JTFA 3DFNA 4D2JA 3LGEA 2ZTKA 3DFQA 2TPSA 3STGA 1TRDA 3USBA 2VXNA 4Y9AA 1O4UA 2DZWA 4O0KA 4WOQA 5LSMA 3C4UA 2Y7GA 1LTDA 4B5NA 4XWUA 3EX6A 4MIMA 4NJKA 2CZFA 4IPJA 3ZWTA 3W76A 3CU2A 3G1SA 4FXRA 1NFBA 3W7OA 3NPUA 3P67A 5C5YA 4POCA 4FX6M 5HULA 3QH2A 3IEBA 1R47A 1OK6A 1K03A 1VLWA 1K3UA 4JYFA 3W2LA 2EKCA 2HMCA 3S5OA 1XBXA 1BTMA 3W74A 4IX2A 4QM1A 1ZAJA 3W85A 2V9DA 3LHWA 1HTIA 3FA5A 3PG8A 5FEXA 2C1HA 2VEPA 2Z1BA 1SZFA 1K7FA 2E6DA 1WA3A 3M0ZA 2EF9A 4NQ1A 3CT7A 3GYEA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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