4UTMA

Xena - reduced - y183f variant in complex with 8-hydroxycoumarin
Total Genus 128
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
128
sequence length
360
structure length
360
Chain Sequence
SALFEPYTLKDVTLRNRIAIPPMCQYMAEDGMINDWHHVHLAGLARGGAGLLVVEATAVAPEGRITPGCAGIWSDAHAQAFVPVVQAIKAAGSVPGIQIAHAGRKASANRPWEGDDHIAADDTRGWETIAPSAIAFGAHLPKVPREMTLDDIARVKQDFVDAARRARDAGFEWIELHFAHGFLGQSFFSEHSNKRTDAYGGSFDNRSRFLLETLAAVREVWPENLPLTARFGVLEYDGRDEQTLEESIELARRFKAGGLDLLSVSVGFTIPDTNIPWGPAFMGPIAERVRREAKLPVTSAWGFGTPQLAEAALQANQLDLVSVGRAHLADPHWAYFAAKELGVEKASWTLPAPYAHWLER
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Redox-dependent substrate-cofactor interactions in the Michaelis-complex of a flavin-dependent oxidoreductase
doi rcsb
molecule keywords XENOBIOTIC REDUCTASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas putida
total genus 128
structure length 360
sequence length 360
ec nomenclature ec 1.6.99.1: NADPH dehydrogenase.
pdb deposition date 2014-07-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4utmA00
1VYSX 1HO4A 3NM1A 2CZ5A 3LRLA 1R30A 3MMTA 5AYXA 4Z1AA 4P2VA 1KFLA 1JCNA 4Q33A 2AQWA 4IGHA 5DY2A 3LLDA 1GVRA 1FX6A 1FXPA 2GUUA 5FF0A 1VCFA 3QW3A 3W88A 4GUHA 2FQIA 3OEXA 3W7QA 3USBA 1QOQA 5LSMA 4DF1A 4LV4A 2H8ZA 4Y90A 2G96A 3U2OA 5D2VA 2FIQA 3NM3A 1HL2A 3W70A 4NX5A 3LBCA 1AW5A 1ZALA 1WQ5A 3UXAA 3BG9A 1S5TA 2NX3A 5D03A 1GYLA 1QPNA 3UY8A 3C4UA 2JKPA 3KVJA 1YTEA 3W76A 3TDFA 2X1SA 1G7VA 4ZQCA 3L9CA 4N9BA 3TC7A 2ZA2A 1VC4A 1SZNA 4FNUA 5EMUA 3Q2DA 4UFKA 1ALDA 1OX6A 4R34A 5G2HA 2ZRUA 4MZ1A 4TO8A 2QCCA 4TX9A 4OGZA 1VH7A 2VFIA 4XZ9A 5FEWA 3E49A 3EKZA 1VYRA 2YYUA 4UXDA 5I3IA 3LX9A 4NU7A 4JTJA 1X1OA 4N02A 3E0IA 4TMBA 1JUKA 3CIWA 1A53A 1KFJA 2DZUA 3O6YX 1VLIA 3W7PA 1O4UA 3G0UA 3JRKA 1O60A 4UTUA 2R14A 3DGRA 3PB0A 5G2WA 1WXJA 4J9JA 4ORIA 1BWLA 1N7KA 4IPIA 3B0VC 2GVJA 4JY9A 2NXHA 3S5NA 4MPQA 1LM1A 1OFEA 1WOAA 1TTQA 4AB4A 3W1TA 3VFLA 4XTDA 5L9FA 4H6KA 1DKWA 4U4MA 4UFJA 2RDUA 4LS0A 4BK9A 3MHFA 3EWUA 4UTMA 1O94A 3L5LA 3LXCA 3TQ0A 4O19A 3BK0A 1YDOA 4N4QA 1RV8A 1PCKA 1YTKA 3LRMA 4JIQA 4NNCA 1TSIA 1RQBA 4K37A 2E5CA 1F76A 1Q6OA 5CPNA 1OVDA 3VCRA 5G4WA 3PF3A 2TSYA 4U28A 4O17A 4O10A 1NVMA 2NUXA 1P5BA 3ABSA 1KTBA 3UWQA 1W3NA 5HR7A 3PG8A 3ZWSA 1TTPA 1WOBA 5BW6A 1GQNA 3HGJA 3RK8A 3UQNA 3Q94A 3OVRA 4O57A 2G5WA 3MBDA 4AWSA 4JTSA 3P80A 3C2VA 3LGEA 2WSQA 3MYPA 3NQ8A 5CZSA 3ELFA 1YYAA 2R91A 3P5YA 2NV1A 4K8EA 2ZDRA 2ZCGA 3JR2A 4FNQA 4BI5A 3PVFA 3N34A 5K7JA 3QF0A 3UWVA 2ZRWA 2BZNA 2FDSA 2YXGA 5AN7A 3DI1A 3CLMA 4HNTA 1LOSA 4QQ3A 5CZJA 3MHUA 2A2IA 5I3GA 4UTKA 1KTNA 1V7YA 2PE4A 3DHDA 4AF0B 2A21A 5BRBA 4UTWA 2QJIA 2HTMA 3C56A 4IX0A 3LDVA 3NQEA 1FQ0A 5K3VA 3I7SA 3BPWA 3BV4A 2I9EA 1K3UA 2WSYA 5CKSA 3W74A 4Z1BA 4DPPA 2FFCA 1LYXA 1B3OA 2WJZA 4LC6A 1XKYA 3ANYA 3QPZA 4WD0A 1FDZA 3KAOA 1VCVA 4UMBA 1G69A 3L66A 3EX4A 4XBSA 2QDHA 3O07A 4M7TA 3VKJA 1R46A 4WOQA 3TQVA 5CPOA 3TFXA 1VQTA 4O14A 4JYEA 1EP2A 3LTPA 2W6RA 3NQVA 4UTJA 2J88A 1FWNA 3OA3A 3KRZA 3W1LA 4K7YA 1SO5A 5D32A 3S1UA 2B7NA 4O28A 3S8HA 1HG3A 2J9YA 2FB2A 3G1YA 3LI0A 2A85A 2IQTA 4GFSA 4MIMA 4O8RA 1YXCA 3HOJA 4LVDA 3WJWA 1ZAIA 1SZFA 4B5NA 1C29A 1VGAA 1XDMA 3CPRA 2DZWA 3HPZA 2V2HA 1ZAJA 4PH6A 2DU2A 4AF0A 4O1BA 2H3BA 3A5FA 3M6YA 4IWWA 1BWKA 1H50A 1RQHA 1JCJA 3S42A 4UIOA 2CWNA 5HUPA 4BF9A 1KM6A 1VR6A 3IVUA 4MY8A 1OYAA 2RH9A 4RLIA 5AC8A 3W7HA 1T96A 4TR9A 2WNQA 2YZRA 4ZL1A 2HSAA 3C6CA 4KFOA 1FWWA 1KM3A 2NLIA 1H7RA 2P10A 2ZZ2A 1M6JA 1KTCA 3THQA 2CLIA 3P60A 3BW3A 5DCBA 3W2KA 1SFLA 2V8ZA 1BKSA 3W75A 2CLMA 2CLEA 4RJEA 4BR1A 3TKFA 4N6FA 1I2RA 1O5XA 3NQ6A 7TIMA 3I6RA 3NZRA 5AYZA 3WJZA 2PRMA 1OK4A 1VPXA 1IIGA 3CU2A 3NXFA 2V5BA 3QJAA 2E1DA 3W2UA 3Q37A 1ICPA 5D04C 1WYIA 1W54A 5K2ZA 3M9YA 5J5DA 4O11A 5K4ZA 4IOTA 4H4IA 4JD4A 1JCMP 2NX1A 5FF7A 4K39A 4HSOA 3NGJA 5LGZA 1R2SA 2CW6A 4LT9A 1MEHA 4X3ZA 4DF2A 3IGXA 4M6VA 4M19A 3N73A 5D33A 3LHUA 1Y0EA 1VHNA 1T99A 1JQXA 2E6FA 3MP3A 3BLFA 1OK6A 3G22A 1SUXA 1K03A 1VLWA 4PC8A 4E2BA 2NZLA 5EPDA 1SQ7A 4NJJA 2XN2A 3A9IA 3W2NA 3IIPA 5DY3A 4Y9AA 3AJXA 2GVGA 3SW6A 2FTPA 2JGQA 4GNJA 3TR2A 3L0KA 3CEPA 4FX8A 4NQ1A 2QCNA 1T8XA 2OT0A 4R7JA 1W5OA 4DBDA 1TQJA 2A4AA 1RZMA 2ZRZA 1QCWA 3W07A 3N9SA 5G1TA 1TV7A 4UNLA 1IIHA 4D2JA 3G18A 4K36A 2QDGA 3PY2A 3TSBA 1F6PA 3UNDA 4A2SA 4MZYA 4ZQRA 5F2MA 4ZQNA 3SIZA 1QPOA 3GAYA 3STCA 4ZQOA 2ZZ4A 4Q4KA 3CEUA 3ZFHA 2YDAA 2ZRYA 4A29A 3M5YA 4MY9A 3NPXA 4GWEA 5TBOA 1MZHA 2KZHA 3NQAA 4NZJA 1OYBA 3GNDA 1TJPA 3EXRA 3MYOA 1TPFA 1GVSA 4O54A 1OHLA 3NVTA 2WKJA 3N3MA 3CWNA 1RQEA 2YFNA 5F2IA 1XDLA 3E12A 3G8RA 3PM6A 5E93A 3W7KA 4UFMA 5HWNA 1LLWA 3DFNA 3ZS4A 1KV5A 2HS8A 5HMSA 3C2EA 3S1VA 6ALDA 2QCMA 2A0NA 5D2TA 5C55A 1JCYA 3SECA 4YCPA 4S1FA 1LOLA 4I7WA 3C52A 3EB2A 5I3JA 3WJXA 4MVAA 1LP6A 4JIPA 4KFPA 5AHEA 3EXTA 1TV8A 4R33A 4UNKA 4EF9A 4ICNA 4FXSA 3DAQA 2ZRXA 1TPDA 3R89A 3SZ8A 5U7SA 5G1YA 5AC6A 2Y62A 3NO5A 3KRSA 4HKPA 5D2YA 3BVJA 3GR7A 3U6WA 2DJLA 3NQGA 2C3ZA 2Y7DA 4UC5A 3TSMA 3UYCA 1EP3A 3P74A 4AHOA 1ZFJA 1UASA 5I3FA 4LNYA 4LTSA 1A5SA 3LXAA 4IQLA 6TIMA 1ME9A 2J27A 1R2RA 3EWXA 4TIMA 1TTJA 4A22A 5E1QA 2C0AA 5C6MA 3NQFA 4L4MA 3HGSA 1D3GA 1H60A 4CNOA 2E68A 5KSWA 2FJKA 4AMAA 4AH7A 4AXKA 5F4XA 5LZLA 4O0KA 1J4EA 4X22A 1KFBA 1EEPA 1ZNNA 3TW6A 4E0CA 1D9EA 3UZ5A 1Q6LA 3O05A 5EY5A 2E6YA 3LCXA 4N4PA 3GXNA 3O16A 3NG3A 4PL1A 4EIVA 3UPWA 1JUEA 3HJZA 1EUAA 5HWJA 3T44A 2NXGA 4IXHA 4JTHA 4G1KA 3W6YA 3QH2A 1SPQA 1M7PA 4E38A 2WOQA 1WBHA 2ABAA 3TCEA 1LOQA 1EWDA 4A3UA 2R8WA 1ZENA 3QMTA 2Y7FA 3UXDA 4JX5A 4DELA 2ISVA 4N9DA 2NWRA 3N2MA 2BWGA 3NOEA 1VRDA 2OT1A 3GDKA 4JTFA 5EL1A 2ZA3A 2Q3RA 3RNDA 3NPUA 2YSWA 1KM1A 3MBFA 3M43A 3OG3A 1LTDA 2FPVA 1OYCA 2GOUA 2OJPA 1PV8A 4S2BA 3VE7A 1X7FA 4JICA 4PA8A 3UZJA 3G1FA 3W1UA 4AHQA 2JKAA 5J5RA 1MEIA 5GVJA 3LHZA 1TB3A 4DF0A 5FF4A 4WXZA 3PAJA 3P82A 2CFFA 4UTWC 1HFBA 1VCGA 3P8JA 4FIRA 1OG0A 3L2IA 3PSWA 2QUTA 5KINA 3RFAA 2R94A 1AL8A 5KZEA 2ZZ1A 1TPEA 3TMLA 5AHLA 2NX9A 2Z0IA 1GVQA 2ZFAA 3I7RA 3NL5A 3R12A 4M5PA 4O1AA 4ADSA 5DLCA 4RR4A 2BX7A 2C13A 3JS3A 4X9SA 5AHFA 3A24A 2C16A 3ZWTA 2TYSA 5HJLA 3PWAA 2E77A 1LRTA 3L21A 1LDCA 3L0NA 4LC8A 3R13A 1NEYA 2VFFA 4EOUA 3W7DA 2H90A 1XXXA 3TAOA 1XBXA 3OVQA 5KTLA 4HSNA 3W1QA 3A22A 5E0KA 3QPYA 5MHBA 1EA0A 1DVJA 2GJLA 1I2PA 3DBPA 2QCDB 2C15A 4POCA 4C1LA 5CSRA 3KHJA 1AW1A 2WV8A 5FI8A 1KLYA 3TJXA 3LTYA 1W3TA 4FX6M 5KZDA 4OWGA 2CZEA 3O8AA 2HS6A 3B03A 4YL2A 4WOZA 1EB3A 4EF8A 1XL9A 3LXBA 1YDVA 4QISA 5H91A 4RZ4A 5DCDA 3G1AA 2ZA1A 2EF9A 4O4WA 1LCOA 2C1HA 3DI0A 1LBFA 1IXOA 1W31A 5D02A 4WY0F 4BI6A 1TIMA 5D09A 4JYDA 1OF8A 2A7PA 4UFLA 1MSSA 2YW3A 3QMSA 4JTUA 4CNNA 3GDLA 5CPLA 2QKFA 1XUUA 3SI9A 2Y88A 1F2JA 3CQ0A 1TREA 1TTIA 4M7SA 4XKYB 1KLZA 1OFDA 1O95A 3GNNA 3O06A 1B4KA 4XQ6A 1QFEA 3BO9A 4JGDA 3T4CA 1I45A 4LY8A 3Q58A 4Z0JA 5I3HA 3M7WA 1DQXA 2QCDA 4QNEA 1SZGA 1WX0A 4CCDA 1DQWA 4LUIA 3W1RA 4AWUA 3F4NA 4JEQA 5K9XA 2J9XA 5G2IA 4ZQPA 2VKZG 4GUGA 2NUWA 3PC0A 1XBVA 2RFGA 3STFA 1C9DA 3EXSA 4CCCA 1KV8A 2CLFA 3B0UX 3G0SA 2V9DA 1QPQA 2EPHA 1P4CA 5H2ZA 4Z1CA 3O15A 1K8ZA 1ME8A 2ZZ6A 1R2TA 1RPXA 3KVLA 1KW1A 2QJGA 1VJIA 3MI3A 5AOUA 1FWRA 5BNKA 4IMCA 3QYQA 3THAA 1J5TA 3IGSA 1H51A 1YPFA 3HG3A 4GUJA 4XKYA 1AK5A 2BTMA 2VC6A 4DO5A 3WK2A 5C5YA 2Y89A 2RDWA 3T40A 2VFDA 3EWBX 2Y85A 2H6RA 3W1AA 3HQ1A 3H54A 3BG5A 5DCEA 3HO8A 2BLEA 2JBMA 1ADOA 4UFHA 1LLZA 5LHFA 5L6UA 4QAIA 4FNRA 3P7YA 3KX6A 1X6UA 1Q45A 2VFEA 4JTTA 1OFQA 1P0KA 5DBTA 1GTEA 2DZVA 2WPBA 3DU0A 3IIOA 3P61A 2P1FA 1SSGA 3GX9A 1OFPA 3G8EA 1SSDA 4JN6A 2HMCA 3FYOA 4MJMA 1R47A 4FEZA 3L67A 1QPRA 1IF2A 4Y96A 3C3NA 3BG3A 1LRNA 2TPSA 4QSHA 3W22A 2YFOA 4GJ1A 4L4LA 4DQWA 3LHWA 4UMCA 5AHIA 1W0MA 4JY8A 5KMYA 4MLJA 3MP5A 2WNNA 2Z6IA 2C6QA 1W3IA 3FKKA 5AFDA 1TPWA 3RLVA 1H7XA 1DHPA 3MI2A 5LNVA 3DZ1A 1SO4A 3DFTA 5EA9A 3I65A 4CQAA 3UY7A 3QMRA 4LV9A 2E5DA 1UJPA 2QUVA 3KXQA 3DFPA 1Q6RA 3IIXA 3PBWA 4YXGA 2QCLA 2X1RA 1FCUA 5F1UA 2VENA 2A6LA 2OX1A 4O50A 3NL2A 4ALDA 5A5WA 3M1ZA 3SFKA 5CSSA 3B8DA 4OV4A 4O13A 3W7GA 4PEKA 4FNPA 5FESA 3SSJA 5K4XA 4JTKA 4UCGA 3P5ZA 4OT7A 3O1NA 4O53A 1PE1A 5AYYA 2Z6JA 1SFJA 1GOXA 3HG5A 2VEIA 2QEZA 5CG7A 3PBVA 1SR9A 3NPWA 2PRLA 3C0JA 3HPXA 3MO7A 1RR2A 2FPYA 1IGSA 1K02A 3LHVA 2NUYA 3SGZA 3W1NA 3W72A 4MYAA 3W2JA 3NL6A 2Y61A 2QF7A 3STEA 4NNAA 5AHNA 3W86A 1UB3A 3E9AA 3GXPA 2XN0A 2AGKA 3W3OA 1HUVA 2WSRA 3M41A 4N9EA 1SW3A 4QJ1A 3PSVA 3BGJA 3PB2A 1V5XA 3W2MA 2B4GA 4OU1A 1F74A 3QSTA 2X1TA 3TK7A 5I3KA 3MJYA 3EWWA 5K9DA 1VZWA 3NZ1A 1FCVA 1FUYA 1G6CA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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