3CQ0A

Crystal structure of tal2_yeast
Total Genus 134
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
134
sequence length
328
structure length
325
Chain Sequence
ATSSLEQLKKAGTHVVADSGDFEAISKYEPQDSTTNPSLILAASKLEKYARFIDAAVEYGRKHGKTDHEKIENAMDKILVEFGTQILKVVPGRVSTEVDARLSFDKKATVKKALHIIKLYKDAGVPKERVLIKIASTWEGIQAARELEVKHGIHCNMTLLFSFTQAVACAEANVTLISPFVGRIMDFYKALDYTAETDPGVLSVKKIYSYYKRHGYATEVMAASFRNLDELKALAGIDNMTLPLNLLEQLYESTDPIENKLNSESAKEEGVEKVSFINDEPHFRYVLNEDQMATEKLSDGIRKFSADIEALYKLVEEKMLEHHHH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase
source organism Saccharomyces cerevisiae
publication title The crystal structure and identification of NQM1/YGR043C, a transaldolase from Saccharomyces cerevisiae
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative transaldolase YGR043C
total genus 134
structure length 325
sequence length 328
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.2.1.2: Transaldolase.
pdb deposition date 2008-04-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00923 TAL_FSA Transaldolase/Fructose-6-phosphate aldolase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3cq0A00
3WK2A 4BF9A 4IOTA 1H7OA 1GVOA 3HGJA 1H7PA 1FCVA 4O52A 2QJHA 3S1WA 3S5YA 3HG5A 3C2VA 3I7QA 2ZQ0A 4QNEA 4IQLA 2I1OA 1VYRA 3MBFA 1EWEA 2NUWA 2V2DA 1KM4A 4TMCA 3S42A 1K8YA 4MY9A 4FX7A 4GRSA 3JS3A 1PL9A 4JDBA 4MIMA 4OE7A 2NV2A 2ZRZA 5G5IA 1KFBA 3LRKA 5MHBA 3IIPA 3TR2A 1YDVA 1I2RA 3W1XA 2P10A 3SGZA 3L67A 5D30A 3W88A 1M6JA 4O11A 3RU6A 2PRMA 2VEIA 4LVBA 4PA8A 4UTHA 4A21A 2C16A 3UXDA 3NG3A 3L0NA 2C3ZA 2Y7FA 5DCDA 3DKLA 8TIMA 2YFOA 1QAPA 4O19A 2BXVA 2ZCGA 4QM1A 3W9ZA 3P7YA 3DKJA 3HMJG 3EB2A 2PRLA 4GFSA 2G97A 2YXGA 4LC6A 2FB3A 1OJXA 2E09A 2W79A 2WOQA 1W5OA 3GR8A 4JTFA 2JKPA 2WSYA 3NEVA 3FJLA 3NPVA 2B0MA 4WD0A 1SZGA 4MLJA 3N14A 2ZRWA 1RVGA 5AOUA 2WNQA 4BI5A 4PC8A 3W2KA 3LHZA 4X22A 5FI8A 1ADOA 1ZHAA 3W22A 1LRTA 2QJGA 1SU5A 3LV5A 4TR9A 3QFEA 1JUEA 2E5CA 3TSMA 3A24A 3LHTA 4NJIA 3N3MA 3U6WA 1A5BA 4XZ9A 4UMBA 2FLIA 3WFAA 3RF9A 1G7UA 1LYXA 4FIQA 5AHLA 3G8RA 1LOSA 4NJKA 3C8FA 3PF3A 3UNDA 3BK0A 3W1UA 1EEPA 3UXAA 3BLIA 5LHEA 3O1NA 3QQ0A 3N34A 1Q6RA 1LBLA 1QPNA 1T96A 1ONRA 5G4WA 3G1AA 3V1PA 4YCOA 4JY8A 1W31A 4ZQCA 3M16A 5D33A 3PG8A 4L4MA 2NV1A 5DXYA 3A22A 1FDJA 4WZHA 4JN6A 1KA9F 2QKFA 4B5NA 5H2ZA 1H51A 4DQWA 3TCEA 3KXQA 2CLFA 4LTSA 2DU2A 1SW0A 4JX5A 1OFBA 4A22A 4Y96A 2KZHA 5FEXA 3CU2A 1TJPA 4XTIA 1OX4B 4E0CA 1VHNA 3L21A 1ALDA 2Q3OA 1JRCA 4WY0A 4JX6A 1L6WA 1P5BA 4JTSA 1KFCA 3NL3A 1CI1A 1UCWA 4U4MA 3HPXA 1YLVA 3GYEA 2X1UA 4A2SA 2E68A 3GXPA 3F4NA 4MFEA 1DVJA 5GVJA 3F1QA 2RDUA 4CQAA 4NT0A 4AXKA 4JY9A 5AYYA 1G67A 2E77A 3UY8A 2ZDRA 2PC4A 3DI0A 1XBVA 1OVDA 3VCRA 5D2YA 4NJJA 5CPNA 2F84A 2A21A 3LCFA 5G2IA 1H7RA 3O6DA 1VQTA 3TKFA 1U5JA 2QEZA 1FQ0A 5D2VA 1P0KA 4PH6A 2ZZ7A 3L9CA 4KWVA 1OX5A 4HNTA 1FCQA 1C9DA 4IPJA 3A23A 2NLIA 3PBWA 1G4PA 5KMYA 1SW3A 4UTTA 1SZEA 3P84A 3SECA 3BPWA 2JGQA 3DFSA 4N9DA 4MVAA 3LM7A 1LORA 3NPWA 3P61A 2EAWA 1VYSX 4MZYA 3TQKA 1DV7A 3NOEA 1K02A 1ME7A 4DO4A 3OBKA 3LHWA 1TJRA 2BTMA 3ATYA 4OGZA 1SO5A 3OEXA 1IIHA 3B4UA 1ZY9A 2Y88A 3O6YX 1FWTA 4UFMA 2C13A 3PR2A 4G1KA 3G0SA 5DCBA 1FXQA 1JCNA 3NPUA 1YXCA 2OX1A 4JTKA 3W2MA 3Q2DA 4ADTA 3Q37A 3NZRA 3S5NA 2AAMA 2E6AA 3EXSA 3ATZA 4ZMGA 2J88A 3IGXA 3WK0A 2FFCA 3NNTA 3M44A 5G4EA 3UQNA 2GPTA 2DP3A 1H61A 3UWQA 1KFKA 4LC8A 1B9BA 1H1YA 3WJWA 1W5PA 1S5VA 1TTIA 4GXMA 4O1CA 4Z1DA 3HPSA 3KRSA 4LVDA 4UIOA 2FDSA 3ZS4A 5F4WA 4AB4A 3TW6A 3M5ZA 3K30A 4IJBA 4O4WA 1W0MA 5CPMA 1OF8A 1N7KA 3W1PA 3BG3A 3MUXA 2Y63A 3GDTA 4Y90A 2Z2UA 3EWUA 2NWSA 3EWXA 5G1TA 4UTKA 3NQ6A 3TMQA 3HPZA 1ZFJA 2WNNA 4UXDA 3P5ZA 2V81A 1K8XA 3BARA 3KVMA 1SPQA 2TSYA 3W1TA 2RHGA 4UTWA 5EKYA 1EA0A 2VFGA 4XUGA 1LLWA 1FDZA 1N55A 3FA5A 3M1ZA 6TIMA 1QFEA 3THQA 2ZZ5A 3T55A 1W3NA 5I3IA 2V0TA 3H55A 3W1RA 1H63A 4JX4A 3OVRA 4UNLA 4POCA 3W83A 2VFFA 1H7XA 5U4NA 4ZVJA 4JTJA 2PE4A 1TQXA 4TU1A 1LZOA 3W1LA 2X2GA 4RLIA 3P67A 3LHUA 5FEWA 1Q6LA 5AHNA 2YYUA 5KZDA 4DBEA 3W86A 4O15A 1O94A 1TV8A 2EPHA 4HHPA 3SW6A 3TK7A 1KFLA 1K3UA 3A9IA 1TPVA 3NQDA 4PODA 3QMTA 1XBZA 2CZFA 2NXIA 4XBSA 1KFJA 1WOBA 4RCXA 3C2FA 4HSNA 4WOQA 4KKXA 3MI3A 2ZBTA 3P82A 3A5VA 3W1QA 1M7PA 3BLFA 3NAVA 3G0UA 1R47A 2E5BA 5HWMA 4I7UA 2VFIA 4LVGA 1JCJA 1M5WA 4ADSA 5D05A 4O4VA 4K37A 3SR7A 4XQ6A 4MPQA 2V2CA 4K38A 5BNKA 2ZZ1A 1J4EA 3LHYA 2P1FA 2B4GA 1T0OA 5BMWA 4TX9A 3O8AA 4BI7A 4O17A 4JTGA 3TDFA 1KM1A 2Z1BA 3M47A 1MEHA 3NQMA 1JCMP 3UWVA 2QCDA 1TPH1 1N8FA 1DHPA 1ME9A 1KTNA 3FOKA 3I7RA 4PL2A 1TRDA 1THFD 3AJXA 3DFTA 4CCDA 4RX0A 3DFNA 2G5WA 4GUIA 1LBFA 1DORA 2A6LA 5AFDA 4LV9A 1J5TA 4JTTA 3QRHA 3AO0A 4LRTA 4LS1A 2GQAA 2A5HA 1RQBA 4WY0B 1YYAA 1AW5A 4MLRA 4NXKA 5CSSA 2DZXA 3W71A 1ZAIA 4RV8A 3T44A 1TTPA 2CU0A 3CLMA 3DFPA 1D9EA 1IXOA 3NM3A 3O07A 4WXZA 4CNNA 1G4SA 1L6YA 3DH7A 4IPIA 3O6CA 3TX9A 5K7JA 3NR0A 1XFBA 3FEMA 1BEUA 1JCXA 1VCGA 3IIZA 2JGYA 2F7FA 5KZEA 3IVSA 2CZ5A 3MI6A 5EPDA 1GZGA 2H6RA 2DJXA 3MW7A 4CNPA 3L65A 2QUVA 2RKXA 2QAFA 1KM6A 1HFBA 1F7BA 2VEPA 1G6CA 4I9AA 3E02A 4I7VA 1TRIA 2I9EA 5HJLA 1HUVA 4DBDA 2Z0IA 1GJPA 3IVTA 5D32A 3LCLA 4GBUA 1ZAJA 4FX6M 5E93A 3CWNA 4ORIA 4MYAA 2WJZA 3W84A 3W7JA 1KLYA 4GWEA 1GVSA 1W37A 1IXNA 1K8ZA 3C6CA 2C18A 3ELFA 4H4IA 3HO8A 2X1SA 3EWYA 1VR6A 1EPXA 4JNMA 5KINA 1C29A 2Y62A 3LTPA 1W5QA 3S5OA 3N9SA 4M7SA 4GC4A 3BW2A 2J9XA 1VC4A 2X16A 1TQJA 4FF7A 4RZ5A 2NZLA 3LBMA 1SSGA 4FX8A 3PC0A 3FKRA 1EIXA 5K4ZA 1KM0A 3P62A 3G22A 5AHMA 4OV9A 5CZSA 4Z1CA 4IMDA 1YXYA 1R2SA 1XBYA 4BWLC 4ALDA 4K8HA 3VNDA 1AL7A 3I65A 1QOQA 3LV6A 1OFPA 4Y9AA 4PTNA 2B7OA 1BWKA 1LM1A 4JTHA 3W75A 1LRNA 4HN4A 4ZZ9A 2Y89A 3EWWA 3EEGA 2GQ9A 3TQVA 1IIGA 3HF3A 3L0GA 1WYIA 3JR2A 2CWNA 4NNCA 1GWJA 2E1DA 4NX5A 4UCGA 2EHHA 3QYQA 4CQ9A 3S5ZA 1KV5A 4IUOA 4YXGA 3MHFA 4NUWA 5FF7A 4CCCA 3FFSA 2HTMA 2VOMA 3SIZA 3FIGA 3HGOA 2NUXA 1EB3A 3LXCA 5DY2A 5ABTA 3KHJA 5DXXA 1GEQA 1XUZA 1IGSA 4JICA 1UUOA 1YDNA 3S1UA 5H91A 4DF1A 5FF2A 3KVJA 5LHFA 5HINA 3SY5A 4EWND 3B04A 2VFHA 3G3MA 2Q8LA 1OYBA 4MYXA 2Z6JA 4JYFA 4GE8A 4WJEA 1D3HA 3VE9A 3IRDA 3LBCA 4OWGA 2RDWA 2PCQA 3C3NA 4JR5A 3GAKA 1LTDA 4RR4A 1BKSA 3TJXA 3W1AA 5KITA 2X1TA 1YXDA 2CW6A 2A2IA 2TYSA 3U2OA 3PUDA 1Z41A 5IM51 1H60A 5FESA 4UR7A 1O5XA 4MOZA 1U83A 3MHUA 4D2JA 4UUIA 5K9CA 1PCWA 1O5KA 4UC5A 4UFJA 2J27A 4IX2A 4IX0A 4ONVA 1YADA 4NX0A 1PV8A 1TPFA 3QQ1A 4O1BA 3EKLA 5CPOA 4FO4A 4LVAA 1ML1A 1R46A 3BGGA 4NNBA 5HULA 4DEFA 3O16A 3CIXA 4O57A 2ZA1A 1QDSA 4Y8FA 4JTUA 3RFAA 1KV8A 3B03A 2OCZA 4GNJA 3W85A 2QCEA 3LCHA 4OU1A 3GXTA 5HQEA 1W3TA 3W72A 5I3FA 2LLEA 3HGSA 1XBXA 3HOJA 3NL2A 4FHAA 1IXPA 3EX1A 3TW7A 1ICQA 2QUTA 4JYEA 1DL3A 3G1VA 3GXNA 2QCDB 2QDGA 5DCEA 3PBUA 1SFJA 4O1AA 1AL8A 1L2UA 1VS1A 1OG0A 4O0KA 3S9YA 3C2OA 2GOUA 2XN1A 4Z0JA 3QM3A 4O50A 5K9XA 3P8IA 1C8VA 4LT9A 1D3GA 1OABA 1PE1A 2UV8G 2CFFA 1HG3A 4BR1A 4MUZA 3LCIA 4MKNA 4FNSA 4AHOA 1JVNA 1BTMA 4M6VA 1TPUA 3H54A 5HR6A 4WXYA 3T4CA 2WSRA 3SI9A 5C54A 4WQ6A 1A5CA 4A3UA 2BWGA 3B0PA 3CT7A 4K39A 4MY1A 3W7NA 4UFHA 1GTEA 4Z08A 3EX3A 4M7TA 3DBPA 1XI3A 2J24A 5EBUA 3TMLA 1B4KA 3M41A 4WUIA 1UASA 3UD6A 3KOFA 3PB0A 1AK5A 2W0UA 2ABBA 2CLLA 2GVLA 4FXSA 1CX9A 1Q3NA 3BO9A 4MZ8A 4UFLA 3NL6A 2YZRA 1ZALA 2BZNA 3KX6A 3ZR4A 4S2CA 5EMUA 2QCCA 1AW1A 1SZNA 1ZENA 3R2GA 4NVTA 1R2RA 4BI6A 1VRDA 1SFLA 3CWOX 3Q58A 3LXAA 1ZCOA 3GR7A 3W7QA 3S6DA 1FY6A 4RKAA 4CQ8A 2FQIA 1G7VA 1OF6A 1HTIA 2VEKA 3KFTA 3NO5A 1VCFA 5D03A 3MBDA 3GX9A 3FYOA 1NFBA 2E5DA 3PULA 3G1HA 1JR1A 1A53A 4FNUA 3LLFA 4HPJA 3TV8A 4GUHA 3THAA 1GVRA 4DELA 1UUMA 3MYPA 2CLEA 2FPTA 5E0KA 5C6MA 2O7QA 4AHPA 2YSWA 4JYDA 4QJ1A 3GDLA 3R89A 2NWRA 5BRBA 1G69A 4UTUA 4S1FA 1Q6OA 1QO2A 1V7YA 1Z42A 5AC7A 3MP4A 3W7DA 3WJYA 3FKKA 2FPYA 2O7SA 3L68A 3TIMA 3DFQA 4PEKA 4LWWA 4E38A 3E49A 1Z48A 4FEZA 3N2MA 5C5YA 3DHDA 5TBOA 3GLCA 1SW7A 1OFAA 2IQTA 4FNTA 2FPVA 4XKYA 2B7NA 4R34A 1OK6A 3L5AA 4UTMA 1SO6A 1O95A 1LOQA 4K7VA 5D37A 5CZTA 3M6YA 3W7CA 2R8WA 3WK1A 3EWZA 2VC6A 1YTEA 2C15A 3TE9A 3G3DA 4Q4KA 2V2HA 3PS7A 1B57A 2CLIA 1O4UA 3M7WA 3CC1A 2QAPA 1NVMA 4EF9A 4RZ6A 2X1RA 2Y7EA 3FS2A 3GNDA 3MWAA 4FB7A 4AF0A 4HNNA 3W7MA 3C2RA 3CTLA 5AC6A 3QMSA 3OA3A 2YX0A 1HO1A 4DF2A 5I3HA 1SR9A 1VJIA 3PAJA 2GJNA 4LUIA 1P1XA 2C19A 1VCVA 5AYXA 1V5XA 5U7SA 1KLZA 4GJ1A 3LDVA 2Y6ZA 2CLKA 2QCHA 1GYLA 4PFMA 1TTJA 3USBA 5K2ZA 3TQ0A 5F4SA 2Y70A 5KSWA 2RH9A 3ZWTA 4LS0A 5CPLA 3GDMA 3DHFA 4UNKA 3I7SA 1KTBA 2GJLA 1DOSA 5IBXA 3DU0A 4UTIA 5KTLA 2GUUA 3LI0A 5C2XA 5G2HA 5I3GA 3PSVA 1SO3A 3PY2A 4N6EA 1DJQA 2H3BA 1DKWA 1IXQA 1EP3A 4NJHA 3TC6A 1VZWA 2ZRXA 1I8JA 3M5XA 3MMTA 4IMFA 3TAOA 3NQGA 3STGA 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 1GTH A;  1K7F A;  1LRQ A;  3NQF A;  2CZD A;  1FDY A;  4MZ1 A;  1WQ5 A;  2C1H A;  3IEB A;  4NU7 A;  2V5B A;  2VFE A;  1Y0E A;  3P60 A;  5K9D A;  3M0Z A;  5IBX C;  1TPC 1;  4UFK A;  4A29 A;  4RK8 A;  3W2U A;  3OVQ A;  1FBA A;  1Q45 A;  3LTY A;  4OV4 A;  1QWG A;  2NXG A;  1F6P A;  3W07 A;  4BK9 A;  4W9T A;  2OT0 A;  2JK2 A;  5L6U A;  5AN7 A;  3FJ6 A;  3ABS A;  1UB3 A;  3TUU A;  1ZJI A;  4NJG A;  1K03 A;  4JTI A;  4LVF A;  1KM3 A;  3TSD A;  1LDC A;  2ABA A;  3C52 A;  2JKE A;  2QCL A;  5TIM A;  3W73 A;  1I45 A;  4OQV A;  4WOZ A;  4MJM A;  3BGJ A;  1OFQ A;  4O1D A;  2A7N A;  4JXC A;  4NQ1 A;  2P0O A;  3I6R A;  1MO0 A;  2WO5 A;  1EUA A;  3BLE A;  3VI2 A;  2GQ8 A;  1QPO A;  1EX5 A;  3IIO A;  4U28 A;  1YDO A;  4XKY B;  3Q94 A;  1QOP A;  4QQ3 A;  3NDO A;  3B05 A;  3DZ1 A;  6ALD A;  4DO5 A;  3QH2 A;  1QCW A;  2WV8 A;  3QZE A;  3NGJ A;  2DZV A;  2Y61 A;  3S0C A;  3NL5 A;  4ZQN A;  5C55 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 3GBE A;  4D6G A;  3KOW A;  2R6O A;  4M8U A;  1GVO A;  1CEC A;  1H7P A;  3GH7 A;  1FCV A;  1J0J A;  2XII A;  3S1W A;  1K4G A;  4PSP A;  3BV7 A;  5CPS A;  2I1O A;  1VYR A;  2FTW A;  3KBN A;  3EPM A;  1EWE A;  3PWG A;  4P7O A;  3F5L A;  1K8Y A;  3S2J A;  3W29 A;  4A35 A;  3VD9 A;  3WNO A;  4FI4 A;  5I7G A;  3N2T A;  1GOR A;  1KFB A;  2P88 A;  5MHB A;  3IIP A;  2I56 A;  3HJE A;  1E1E A;  2P10 A;  2FGB A;  2VX4 A;  5MKG A;  4O11 A;  4QDP A;  2PRM A;  3C0S A;  2FMN A;  5BU9 A;  4GC3 A;  1UH2 A;  5M1T A;  8TIM A;  1NDY A;  2Y5E A;  2ZCG A;  4QM1 A;  4B15 A;  4D9P A;  4S3K A;  3P7Y A;  3M4H A;  3HMJ G;  3M0K A;  3EB2 A;  2YXG A;  3WLL A;  3S1G A;  2FB3 A;  4C1N A;  3WNL A;  1OJX A;  4FAM A;  2WCS A;  2GSE A;  3GR8 A;  4JTF A;  4ERA A;  1JZ8 A;  1EX1 A;  2B0M A;  6XIA A;  1IT7 A;  1H3G A;  4XAP A;  1WUE A;  5AOU A;  2WNQ A;  2HPM A;  4BQ2 A;  4UBP C;  4LUT A;  1ZHA A;  3MO4 A;  4AZH A;  3R10 A;  1XYM A;  1LRT A;  2HBV A;  4MB5 A;  2PGW A;  1SU5 A;  2QJG A;  3WEN A;  3BCF A;  4D8Z A;  3TSM A;  5ABF A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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