3O2L | Genus

Total Genus 118

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	118
sequence length	306
structure length	306
Chain Sequence	AEAAQSVDQLIKARGKVYFGVMTDQNRLTTGKNAAIIQADFGQVTPMNSMKWDATEPSQGNFNFAGADYLVNWAQQNGKLIRGHTLVGHFYLPSWVSSITDKNTLTNVMKNHITTLMTRYKGKIRAWDVVNEAFNEDGSLRQTVFLNVIGEDYIPIAFQTARAADPNAKLYINDYNLDSASYPKTQAIVNRVKQWRAAGVPIDGIGSQTHLSAGQGAGVLQALPLLASAGTPEVAITELNVAGASPTDYVNVVNACLNVQSCVGITVAGVADPDSWRASTTPLLFDGNFNPKPAYNAIVQDLQQGS

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Hydrolase
source organism	Thermoascus aurantiacus
publication title	Iterative approach to computational enzyme design. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Endo-1,4-beta-xylanase
total genus	118
structure length	306
sequence length	306
ec nomenclature	ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date	2010-07-22

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00331	Glyco_hydro_10	Glycosyl hydrolase family 10

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.80	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Glycosidases	3o2lA00

1WPCA 4MADA 2WCAA 4H8UA 4XUYA 1LL6A 2G4FA 2FHCA 4P8XA 3WEMA 4EANA 4BF7A 3L4UA 1R86A 2UWFA 2PWEA 2JALA 3CZEA 4JKKA 3OZOA 1BLIA 3AMKA 4CU7A 3OBAA 2BVDA 1UWTA 4ZXLA 5A8MA 3M6DA 1E4NA 3WH6A 4AZHA 5A6AA 5E6ZA 1G5AA 2VO5A 3AZSA 1LF1A 1QW8A 3VM7A 4S3KA 1XSIA 3KZSA 1RD6A 2J74A 1I1WA 3RO8A 4DM1A 2VRKA 4E8DA 3AS2A 5A6KA 3I3EA 2V3FA 3MUIA 1GORA 1UA3A 3DHUA 1KXVA 1C92A 3EDDA 2WC4A 4ZE5A 3WDIA 1WZAA 1WDPA 4HZ8A 2WMIA 1ZU8A 4DWSC 2D3LA 2WC7A 1JDDA 2J79A 4P8VA 3QOMA 4ATDA 3NSNA 1R7OA 3ARRA 1ODUA 3RCNA 3AHXA 4HMCA 1RP8A 2ZX7A 5LYRA 3GM8A 5HPCA 4MAZA 3W24A 3FHAA 3VD3A 1QI4A 2GJPA 1UR9A 4CN4A 4UQBA 3MMDA 4P7RA 4NF7A 1C93A 1S46A 1J01A 4WSJA 5E09A 3VU2A 4XZWA 5BROA 2Y8KA 4UFIA 4MJ2A 2WVUA 3A47A 3ZMRA 4KWUA 2CKRA 1QNRA 5E0CA 2QV4A 4OBSA 3W27A 2J62A 4D6CA 2PC8A 1C8YA 2X05A 2JFEX 1E6QM 1GVIA 3VO0A 5IXEA 4BA0A 4MPKA 5DT5A 2EO7A 1XH2A 1W1PA 4CN1A 4XV0A 3AS3A 4UFJA 3A3HA 3WUFA 1E3XA 2J25A 1VEOA 4JL2A 2UY4A 1VENA 3WUGA 1EHAA 2VR4A 3A6OA 4P8UA 3L4XA 4MNKA 3MUZ1 4GO9A 3VGEA 1ZS2A 2WB5A 1E9LA 1B9ZA 2BFGA 4AEFA 1HP5A 5JIPA 1LWHA 3AHZA 5FIPA 1M01A 2EPMX 4NSBA 1UD8A 1FP8A 3QHMA 3MSDA 1QNOA 5LA1A 4AZ5A 2GDUA 3AMGA 3CZKA 2VQUA 2Y4SA 1GQJA 1HNYA 1ISXA 1JYNA 1XYZA 1J18A 1JI2A 4H2CA 5CPSA 3L2LA 4A3YA 4JL1A 3W4RA 1J0HA 2VNCA 2C0HA 1Q6CA 2WAGA 4U31A 1YHTA 1MYRA 1I1XA 4B15A 1JAKA 1W9PA 1GOKA 4J3XA 3G6MA 3WF0A 3SCTA 4PBGA 2J4GA 4WIWA 1XRVA 3ZT7A 1PAMA 3DHPA 3WIJA 4QAWA 3WD4A 2QPSA 4HA4A 1UD6A 3DYPA 4CU6A 3WQ4A 1OT1A 1B3YA 4F66A 4PMYA 3GXMA 3AMLA 1LG1A 3ALFA 1DWHM 2ZIDA 5CG0A 1V6VA 3WD2A 2VRQA 4AC1X 3WQVA 1LG2A 1R8LA 3MS8A 3NSMA 1BAGA 1V02A 4RE2A 1EGZA 1GW1A 3LMYA 3ALGA 3RIKA 1IZKA 2JEPA 4J27A 4EK7A 2VCAA 5HBFA 3TTSA 3OIHA 3OLIA 1VFUA 4P7NA 4BCEA 2FDMA 4JFVA 2XHYA 1CGYA 3D5HA 1HN1A 1JZ8A 3NSXA 2IUZA 4DUXA 5AYBA 4J3WA 1UWIA 3VGDA 5I24A 2V3DA 3N9KA 2WCGA 3WH5A 4GZEA 3TTQA 2E9MA 1EXPA 3B9DA 3GBDA 1PZ3A 2BS9A 1E6ZA 1VEPA 4D6JA 4JKMA 1V0NA 3EDEA 2DQXA 3RDKA 4MB5A 2DH3A 2J75A 3GBEA 5DMYA 1HVQA 2VVSA 3W6MA 3CZ8A 1ZB5A 1OIMA 3WUEA 3PTKA 1AQHA 3BMVA 1DWAM 3VNZA 1J11A 2OYMA 1UA7A 1QNPA 3EMZA 4J3UA 1QW9A 1GOIA 3W28A 2WMKA 3VOCA 1EDGA 2Y2WA 4D6EA 1E70M 4GXPA 4EE9A 2NW0A 5JUVA 4WKAA 3GXIA 2YA2A 4H8HA 4ZXOA 3ZQ9A 5A6BA 5M5DA 3PZUA 4MB1A 3WNNA 1V3JA 1MWOA 2WHKA 2JF6A 1HKIA 3VNYA 1NWTA 3BAJA 3VIJA 4S3JA 3PZVA 1CGVA 4CD8A 4AYSA 4DWSA 3AHYA 5ABHA 2WNWA 2J7DA 3VIFA 4B3KA 5A6JA 4W8BA 3SCQA 1E0WA 2EEXA 2YLLA 2WZIA 4P7LA 3WMSA 1NOFA 4TTUA 2WVTA 1K9FA 3IAPA 2Y5EA 1DEDA 1GOQA 2G8ZA 2FHBA 3PTMA 1X1NA 3QHNA 2D0FA 3VX0A 1E3ZA 2EQDA 2VZTA 3DC0A 2YDSA 3W82A 1JDAA 1NP0A 2XM2A 1Q6FA 2F8QA 4MB3A 1NWUA 5I79A 3AXXA 1GQKA 5E9AA 3VUPA 4BQ4A 3AIQA 5DFAA 1DWFM 2A3EA 5ABFA 4PUDA 3CIVA 5KEZA 1JIBA 4ATWA 1BYCA 1JAEA 2VI0A 4J3TA 4U3AA 1H11A 2OYLA 1UHVA 2XFRA 1TVPA 4HA1A 1KQYA 1U33A 2W4XA 5IDIA 2CHNA 3MMUA 4KRTA 1U2YA 4PMOA 1E0XA 1E6NA 3GNRA 3WNPA 1KBBA 2QLYA 3VIGA 5JIWA 6TAAA 1X6LA 1OT2A 2J77A 2X8RA 2MANA 2YDRA 3CMGA 4U3CA 1B1YA 5EFFA 4CD4A 1KCLA 3F5JA 1UKOA 3GH5A 1NOUA 1M03A 4RL3A 4WK9A 4PRWA 4IM4A 4MDOA 5CPQA 3T09A 2NT0A 2C7FA 1UKPA 1H2JA 2DPEA 2F61A 1GPFA 3ZJ8A 4OIFA 3W53A 3NDZA 3T2PA 1K6AA 1LL7A 3CHCA 3FN9A 1ITXA 4PUEA 2RGLA 1FP9A 3U57A 2C8NA 3MUY1 4PMVA 2VX5A 1R85A 4Z2LA 1XSKA 2UY2A 2D24A 2WHJA 3VD5A 4UQEA 5C71A 3WELA 3F5LA 1N82A 3VIKA 3T0BA 1IT0A 1U30A 3VM5A 4B16A 4GQQA 3WMCA 5A6LA 3WDPP 2WM0A 2XM1A 5AC4A 5A69A 1EO5A 1VIWA 1BFNA 2Y24A 4PTXA 4DM2A 3WQ8A 5E0FA 2E8YA 3POCA 1KFWA 2XTKA 4KH2A 1E5JA 1TCMA 4FF5A 5CJ5A 3MU7A 4YHEA 4QP0A 1WNOA 1SMDA 3L4WA 2YDQA 7TAAA 4M82A 4HOXA 4AZIA 1KXHA 2WLZA 2WHLA 2ZXBA 4AZCB 1GHSA 3II1A 2XVKA 2DH2A 3HN3A 5EB8A 2WHMA 1W9DM 4AXNA 5CZKA 4M56A 3SCWA 2UY5A 1HF6A 1L0PA 1E72M 4Z2HA 1HKJA 2J7FA 3I3DA 1HL8A 1ZBWA 3RM9A 3BAXA 2YL5A 3UERA 1V3LA 3OA5A 2VJXA 2YIHA 2V38A 2WBGA 1EO7A 1VJZA 2PWHA 3NCOA 3W0KA 1GUVA 1ISYA 4PMRA 3KE0A 4UFMA 3ARYA 1QI3A 1HJSA 3VDCA 4TVUA 1BGAA 4PMXA 1JG9A 2DSUA 4A4AA 1F4HA 2DGAA 3VINA 3UG4A 2WZHA 2W63A 1WZMA 2VX6A 5EBAA 1HXJA 2HISA 5GNXA 2ZE0A 2YL6A 1HX0A 1QI0A 4B3LA 1JF6A 2YL9A 3JUGA 3PZIA 2GJXB 2F2HA 2YBUA 3GDBA 1GOMA 5CPTA 1HJWA 3MO4A 3MANA 3SURA 3QOKA 2FGLA 5JBFA 2J47A 4GZIA 2VCBA 1ISZA 1JYWA 4AD2A 1CXKA 4UFLA 4D6HA 4QCEA 3IJ7A 4W7WA 4E2OA 4P8WA 3WNKA 1TVNA 3WDJA 1KB3A 5LA0A 3OG2A 1K9TA 1BTCA 3WENA 2EPKX 1ZJBA 5HOSA 3WNOA 1CDGA 1W9XA 5BYWA 4PTVA 4Z2IA 2J7BA 2CETA 3WL0A 4ACZB 5HDRA 5C70A 3SCUA 2YA0A 3VIIA 4AD1A 1L8NA 3D3AA 5GNYA 4UQAA 1H0IA 4TXEA 1B90A 4CVWA 1JF5A 3N04A 4UNIA 1DWJM 2AMGA 2DSVA 2GJRA 4U5KA 2CNCA 4OOUA 2PB1A 3SUTA 1M04A 1JD9A 1BPLB 1JXJA 4MTVA 1KQZA 3PZ9A 4PMNA 4AISA 2RGMA 5BXRA 1FA2A 1MW2A 3AXIA 2XGIA 3OLEA 4L4PA 7CGTA 3K8LA 3I3BA 4IISA 3K1DA 4AEEA 3VMPA 4BQ3A 5I0DA 1CXLA 3WF1A 1V6UA 2CBVA 1AQMA 2DIEA 1CGWA 1NQ6A 5FL1A 5IHRA 1E6RA 3UG3A 3BAYA 4HZ6A 1W9UA 3WDQA 1X6NA 2E4TA 2J7CA 1ODZA 4CD5A 1H41A 2BHZA 3GNPA 1UKQA 1QPKA 5I6SA 1TA3B 3CUGA 4OBRA 1OD0A 3WEZA 1E6PA 1JFHA 1HJXA 3EMCA 1E73M 4PMUA 4EAMA 2PBGA 3B9AA 2D23A 2WPGA 1BYDA 3AYSA 3AS0A 3O6AA 2XWEA 1B0IA 2DSKA 2JIEA 1HKKA 2V3EA 4U33A 5D9PA 3MUAA 5D9OA 3ARUA 3K8MA 1B31A 1H3GA 1UR1A 3HMCA 1WDSA 5AY7A 1UQZA 4CKQA 5IFTA 3GNOA 4JFWA 3F4VA 1D7FA 3THCA 1C3FA 2YA1A 3RJYA 3BCFA 2JF7A 1OIFA 3UEQA 4GZJA 4AD5A 4DUWA 3VIHA 1UKSA 2XVGA 4ACYA 3ARPA 2VZSA 2X09A 1TR1A 4W85A 4FLRA 2FH8A 1J0ZA 3VGBA 2E8ZA 2ZX6A 3VPLA 2G3MA 5BRQA 4U2YA 1UZ1A 3PZQA 3K4AA 3NJ3A 4EKJA 3MSGA 3EMQA 1BHGA 1IZJA 1W1TA 3S6TA 4ZFMA 2DSWA 1XH0A 4W5UA 5E70A 4L4OA 2DT0A 4CCCA 3UETA 3SUVA 3WNLA 2WANA 2GK1A 1OSEA 1V3KA 1SMAA 4GQRA 4QLKA 3VD9A 2EBNA 1Z32X 3DYMA 2OLHA 2WWDA 5CLWA 2OSWA 5A1AA 4R27A 4Z2KA 3E1F1 1B3ZA 5EFDA 1V6XA 2G3NA 1H09A 1ZBKA 3CBWA 2WMIB 1BVNP 3NUKA 2JEQA 3L2MA 1E4LA 4HU0A 2O92A 4OJYA 1HP4A 1E1FA 4F79A 1LWJA 1M53A 3OZPA 3VIPA 3HJEA 2WMHA 1DHKA 1W3HA 3IJ8A 4TVDA 3TONA 3GH7A 1FOBA 4TX8A 1CLXA 1XV8A 3ARZA 1UD3A 1AQ0A 1W3JA 1NOWA 1FHLA 4XX6A 1BYBA 1G1YA 2WMJA 3AMCA 2PWFA 5ABEA 5M17A 3WUBA 1J10A 2OYKA 3L4TA 1BSIA 1NM9A 5BXPA 1V3HA 2NSXA 3TP4A 5I3DA 2WVSA 2XSBA 4FLSA 2VRJA 3W6LA 1SYTA 1FH8A 2WSPA 3LPOA 2HVMA 4X9YA 1MW1A 4JZ5A 1J0JA 5A6SA 2VR5A 4H8VA 3BAIA 3SUSA 1V0KA 1WB0A 2WWCA 4D6GA 4CGTA 3VDHA 4LGXA 1JZ7A 2ZUMA 1MFUA 4PTMA 1QNSA 2XVNA 1TE1A 1E56A 2IXVA 1OINA 2BVYA 3U7BA 1FFQA 1VF8A 4W88A 3W26A 1BYAA 3SCNA 2ESCA 2G41A 2GFTA 1V03A 2ZUTA 3AOFA 4UR9A 4YPJA 1KGWA 1AMYA 1JZ5A 4W84A 2D20A 1BG9A 1MQPA 3T2QA 4AD3A 3AQUA 2BHUA 1CECA 4CD7A 2O9TA 2VZOA 4H41A 4PCSA 3BLKA 4CCDA 5I77A 2WMGA 1PJ9A 2XVPA 3AIVA 4IPNB 1UUQA 1VRXA 5A8PA 3T08A 1CXIA 4FLOA 1VFOA 2VL4A 2VZVA 3B9EA 1UG6A 3N11A 4M1RA 5BXTA 1JZ4A 4UQDA 1HJUA 3KL0A 1BGGA 2D2OA 1MW0A 4GKLA 3AISA 3WMBA 5ECUA 1CXHA 2OWXA 2VC9A 1H0GA 2BHYA 1FFRA 3KL3A 4J3VA 2JIWA 1G9HA 4HZ7A 5A8OA 5FCZA 3BSHA 5DEZA 3T0AA 1XHGA 4JCLA 1V0LA 1W32A 2VCCA 1K9DA 2ZUSA 3TTOA 4D1IA 1JXKA 1VFMA 3EDKA 4NRRA 3VX1A 2XGBA 4HP5A 3AS1A 5ABGA 1WKYA 4D71A 3QHOA 2ZX8A 3MV11 1A47A 1VBUA 1SR0A 3CUIA 3T2OA 4ATLA 2V5DA 5CSYA 4AZBA 5FOOA 1C8QA 3EDFA 4FMVA 1B3VA 3CHDA 2D22A 1KXTA 3VVGA 4LX4A 4P7QA 1UD5A 3RPMA 2BY3A 5D9NA 4X0VA 1JNEA 3AZTA 5GNZA 5GPRA 2CEQA 1OM0A 3WF2A 4C7FA 1CENA 1EH9A 4MB4A 3M07A 4YHGA 1CXEA 1MFVA 2CERA 1J12A 2YBTA 4UQCA 1CTNA 1EOMA 3RMEA 2FGZA 3ARVA 3WN6A 1JGIA 3WQWA 3BAKA 3IK2A 4D6IA 4DUVA 4UOZA 5C8BB 1MQQA 1CBGA 1OB0A 1GCYA 4FLQA 1TZ7A 1G94A 1DTUA 1W2PA 4QLLA 2JE8A 1WCGA 4DWSB 2QF8A 1VBRA 2ZOXA 4F9JA 3SUUA 5CGTA 4UOQA 1QVBA 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4HPHA 2W61A 4HTYA 1PX4A 3RM8A 3U7VA 1UR8A 5BCAA 1WAWA 2PI6A 5JBEA 1J0YA 3KWXA 3W38A 3VGHA 1ECEA 3THDA 5A6MA 3UR7A 4OKDA 1TUXA 2CCRA 3AROA 1NH6A 1W9BM 2GSJA 3UESA 2DEPA 4LXFA 1V6YA 4LYRA 5A8QA 3APGA 1PPIA 4WF7A 1BG4A 3FAXA 2EPLX 1PZ2A 4AY1A 1R7AA 1BVZA 4V28A 3WDRA 2E3ZA 3AIBA 6A3HA 2AAAA 3CUHA 3GXFA 1GOOA 4C7DA 3SCRA 3POHA 5CSUA 4HU8A 5HXMA 1DP0A 1JI1A 5HNNA 1KWGA 2CESA 3ZSTA 4Q7NA 3L4ZA 5F7UA 5JBDA 3O9NA 4TOQA 3BH4A 1KBKA 1XGZA 3K4DA 2PF0A 3PTQA 1YQ2A 4HOZA 1ISVA 1MXGA 4W8AA 1F4AA 4OOZA 2BY2A 1UYQA 4CUCA 2G3IA 1E6XM 1PBGA 4UOJA 1DWGM 1QHOA 2WYSA 1VEMA 4A3HA 3WFZA 2D0GA 4WJXA 5D8WA 2QMKA 1WZKA 2X0YA 2VT0A 5I5RA 3CZLA 1UQYA 3VKKA 1C90A 4D6FA 5A8NA 4R5EA 1LL4A 3AI0A 3AFBA 5FL0A 3NDYA 1ESWA 4UZUA 3AXHA 1PX3A 1V0MA 4JKLA 1EHNA 2WBKA 4LYQA 1HIZA 4M29A 3BC9A 1UD2A 1SFSA 1ZBVA 2O9RA 3UG5A 1HL9A 5CLTA 3BGAA 8CGTA 1DWIM 2XVLA 1WE5A 3SEPA 3CMJA 2GVYA 2W62A 3ZT5A 3W37A 3ZJ6A 2OSXA 3S2CA 3VILA 2J7HA 3MMWA 1UKTA 1JZ3A 3W81A 1E5NA 2IXUA 3CUFA 3AIEA 3ECQA 2VX7A 3A4WA 1VFFA 2UY3A 3GH4A 3VTRA 4BQ2A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2AOS A;  2EJ1 A;  4BS0 A;  5A3H A;  1UZ4 A;  3CLW A;  3FW6 A;  3K8K A;  2VMF A;  4WSK A;  2ZX5 A;  3LPP A;  2XIB A;  4PYS A;  1HJV A;  3A4X A;  3BSG A;  4W87 A;  3WQ5 A;  3WBE A;  5D8Z A;  3ZT6 A;  1W1V A;  1QBB A;  2QHA A;  1UWS A;  4H04 A;  2Q8X A;  1UWR A;  3NYD A;  1QHP A;  2XJ7 A;  1V02 E;  3MV0 1;  4AZ7 A;  2CKS A;  2BVT A;  2ZUV A;  4GO8 A;  2ZX9 A;  2YJQ A;  4LPC A;  2XG9 A;  5E6Y A;  1JL8 A;  1TA3 A;  2ZUN A;  3CZG A;  2E40 A;  3N12 A;  3ZR6 A;  1JND A;  1O7A A;  4GI6 A;  5CGM A;  4GIN A;  3CO4 A;  4PSP A;  4CCE A;  2VTF A;  4M81 A;  4QDM A;  9CGT A;  2ZUW A;  4XB3 A;  1TFV A;  4X0N A;  3BCD A;  1OCQ A;  4KMQ A;  2ZIC A;  3SCP A;  1W3K A;  3AIU A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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3O2LA

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Chain Sequence

Structure visualization

Chord Diagram

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