4W9T | Genus

Total Genus 88

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	88
sequence length	240
structure length	235
Chain Sequence	NKLELLPAVDVRDGQAVRLVHGVSGSETSYGSPLEAALAWQASGAEWLHLVDLDAAFGTGDNRALVAEITGAMDIKVELSGGIRDDASLAAALATGCTRVNLGTAALETPEWAAKAIAEHGDRIAVGLDVRGTTLKGRGGDLYETLARLDSEGCARYVVTDIGKDGTLTGPNLELLKNVCAATDRPVVASGGISSLEDLRALAALVPQGVEGAIVGKALYAKAFTLEEALKVVSA

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

molecule tags	Isomerase
source organism	Streptomyces sp. mg1
publication title	Co-occurrence of analogous enzymes determines evolution of a novel ( beta alpha )8-isomerase sub-family after non-conserved mutations in flexible loop. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Phosphoribosyl isomerase A
total genus	88
structure length	235
sequence length	240
ec nomenclature
pdb deposition date	2014-08-27

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00977	His_biosynth	Histidine biosynthesis protein

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	4w9tA00

1SSGA 5D2TA 4RV8A 3DI1A 1A50A 1FCUA 3HPZA 3G1AA 4O28A 3G3MA 1T99A 3QQ1A 2ISSA 1B9BA 3F1QA 4R7JA 1SO5A 2P10A 1PIIA 1FDYA 4MZYA 1FQ0A 2BZNA 5D2VA 4MOZA 2WOQA 3A24A 1S5VA 4JICA 1JQVA 3UZ5A 1GTHA 1FXPA 3CU2A 1HO1A 2Y6ZA 4FNTA 1FCVA 3E12A 2DZSA 1O4UA 4DF1A 1J4EA 3QMTA 4FEZA 4NU7A 1KFKA 3WJZA 1WYIA 4LVDA 2OJPA 5F2LA 1WXJA 2PRHA 2ZA1A 3CIWA 1JUKA 4IMGA 5LNRA 2JBMA 3QPYA 2B7OA 5I3IA 1GZGA 3GDTA 2V0TA 3L65A 3LCLA 1QAPA 3SJ3A 2KZHA 5DCDA 4FO4A 4KFPA 3CB8A 3M5ZA 4Q32A 4LVBA 5IM51 3NPWA 4UUIA 2EHHA 1W8SA 3I7SA 2CLLA 4GRSA 1OHLA 3WK2A 3UWVA 4O1BA 2V2CA 3FS2A 4UTJA 1YXDA 1L6YA 6TIMA 2PRMA 4O8RA 4ZQMA 1TPFA 4QQ3A 4S2CA 5A8GA 1SU5A 1FBAA 3G0UA 1SFLA 3O1NA 3ABOA 1LM1A 2ATSA 3PS7A 1H50A 1VR6A 2VFEA 3KX6A 2QCFA 4DO5A 1TTJA 4WOQA 1G7VA 2IQTA 2QKFA 3BARA 1P4CA 3OHIA 1J5TA 1OYCA 2E77A 2YFOA 3PB2A 4N4PA 2PC4A 1OX4A 1SFJA 4BFAA 1SR9A 4JS3A 3B8DA 2ZZ1A 3BPWA 3L5AA 1KTCA 3DFOA 2CLHA 5BW6A 3QW3A 2X1TA 5G1TA 1YTDA 3KHJA 3G8EA 4NT0A 1MEWA 2Y7DA 4WZHA 4MFEA 3W22A 4AH7A 3RNDA 1LOSA 5F1UA 1H1YA 1Q3NA 3ELFA 5D02A 3SGUA 1QCWA 4O54A 2GVGA 3B04A 3TFCA 3DBPA 2I1OA 5SWUA 1X1ZA 4FHAA 4MIMA 1DL3A 4ZMGA 3PB0A 3S1UA 2AQWA 3CLMA 2CZFA 5CZSA 5LHFA 4FF7A 3NDOA 1ME9A 5BMXA 5AYYA 5D30A 1W3NA 1W3TA 5IBXA 3CT7A 3A5FA 4Z1DA 3GKFA 2V30A 1TPEA 1XC4A 1ME8A 2WNNA 3INPA 4UTKA 3LOTA 1W56A 2Q8LA 2RHGA 1IXQA 3LRKA 1KFCA 3TNOA 4WX2A 3NM1A 4CNOA 3IIPA 1L9WA 3FKRA 5AYXA 2V81A 5LSMA 1UB3A 4U4MA 3EWBX 1G4EA 3P81A 3R13A 1QO5A 5EA9A 5H2ZA 4JR5A 3GVGA 2YYTA 5LZLA 3L66A 1TTQA 1SO6A 4HIBA 4JD4A 3PAJA 4RXFA 3SECA 1OFBA 1W1ZA 3FIGA 3P5YA 1ZENA 2QJIA 2AGKA 3W7HA 1M7PA 3WK3A 1AL8A 5LNUA 1VYSX 4E2DA 1VYRA 3MP5A 3S5OA 3DXIA 1XDLA 1TPDA 3STGA 3R5EA 4ZQCA 1TREA 1AMKA 1VHCA 4YCOA 1RZMA 4LRSA 2X30A 3H53A 3O05A 1RPXA 1I2NA 2ZRWA 4GWEA 3T4CA 1LLWA 2WJZA 1TJPA 3NQVA 2YGYA 1NAL1 4FNQA 3MBDA 1JCXA 4JTGA 3C52A 3PWAA 5HQEA 5K4ZA 3SZ8A 4K7YA 5I3KA 3ANYA 3LLDA 2Y62A 4M7TA 3DGRA 4GXMA 1GVOA 1EWEA 4UTUA 4I7VA 4NJGA 4PA8A 1KW1A 1WBHA 4MVAA 1A5BA 2OZ0A 5CPOA 4A21A 3NA8A 1OFAA 1X1OA 2Y70A 5U7SA 2BLEA 2WNZA 1DV7A 1TYGA 2GOUA 4UTWA 3EX3A 1TTPA 4C1LA 4O19A 1KLZA 3QC3A 2FIQA 1F74A 1OK6A 4FXSA 4DPPA 3DFQA 4KKXA 2OT0A 1Z41A 1OFRA 1LP6A 2V2DA 4UFIA 4LC8A 1LRTA 2CLKA 3P74A 3P7YA 4JY8A 5G2WA 3ZWSA 3LHZA 1BWLA 3G22A 4KFNA 1MSSA 1JCYA 4S2BA 3V1PA 1F7BA 4RCXA 4MYAA 1ZALA 5G1YA 3FYPA 3KAOA 3NAVA 3M44A 4O17A 1WV2A 4K7VA 4KFOA 4YL2A 4UXDA 3HPXA 4MZ1A 1TRDA 3F4NA 3PSVA 1GVFA 1W5OA 5C6MA 2QR6A 4GUJA 2UV8G 1TPH1 3RF9A 3MUXA 2GQAA 3U8GA 2DZPA 4YMZA 3FOKA 2Q8ZA 3CWOX 4JXCA 4UFHA 3L21A 4N9DA 1FWTA 1IXOA 3NL2A 4GJ1A 4O15A 3L68A 3M16A 3LBCA 1HUVA 4H3DA 5I3GA 3ZS4A 4R53A 3W23A 4N9EA 2A6LA 3V75A 2WO5A 3WK1A 2YXGA 4O53A 4CCEA 4XBSA 1LRQA 2X16A 4Y90A 2X1SA 3BV4A 3NQ7A 3P8JA 3HBLA 4O1DA 4IMCA 5C5YA 1LBFA 4OQVA 4UIOA 1NVMA 4W9TA 2ISWA 4G1KA 4OHQA 4OU1A 2E68A 3BG9A 3PF3A 2JKEA 3LCHA 3N34A 3IVTA 2QCGA 1F6PA 1HO4A 1YADA 2DORA 2QAFA 3L0GA 5EBUA 4XTDA 1IXPA 3W7CA 1OG0A 1JVNA 2Y63A 3N73A 3P82A 3NGJA 4UR8A 4JX4A 4UMAA 3BK0A 3L5LA 3W1LA 2R94A 4O10A 3GDKA 3CWNA 1TPC1 2VFHA 3TCEA 2JGYA 1QWGA 4AEOA 2JK2A 4AAJA 2VFFA 2YDAA 3GDMA 3IIOA 2VEPA 2Y7GA 5EYWA 4GBUA 3FEMA 2HS6A 2QUVA 1A5SA 1SO3A 4FNRA 1H62A 5CSSA 1QMLA 1JUEA 5FEPA 2ZA2A 2A7RA 2V2HA 3N2MA 3LGEA 3KRSA 2QUUA 3W7OA 3TJXA 1VS1A 4QIUA 3TK7A 1R2SA 1GQNA 4IX0A 3TC6A 3MI3A 4PL2A 4WD0A 3O8AA 4XTIA 5HWMA 3PBUA 5AHMA 1GTEA 2A5HA 3L2IA 4Y9AA 4X3ZA 4CCCA 3W85A 3LBMA 4NVTA 4K8EA 3DENA 4HPXA 3DZ1A 3TH6A 3G1VA 4JTFA 1Q6LA 1AK5A 4N2YA 4DEFA 4IQLA 4YLWA 3W1TA 4EF8A 2NWSA 3FLUA 4BWLA 1ZAJA 5BNKA 1VQTA 3EWWA 1XM3A 5KMYA 3TROA 2C15A 5F2IA 2OT1A 1AG1O 1FY6A 1NFBA 3IVUA 3W84A 4WY0B 1KBIA 5D2WA 5L6UA 2DZUA 5F2GA 4YCPA 1LDCA 1N8FA 3UWWA 2A1YA 2CLFA 2HSAA 2BX7A 1FWWA 2QJHA 1T96A 2RFGA 4WOZA 5AOUA 5J5RA 4O11A 1KFLA 2FFCA 1HTIA 4LWWA 3IV3A 3S8HA 3SI9A 1KM2A 4MYXA 6ALDA 4NJIA 5CZ0A 1OFPA 4XWUA 2YPIA 1KM4A 2EKCA 1XUUA 2H3DA 4IUOA 4HT3A 1TPWA 4QSHA 1TO3A 5BMWA 1H7RA 1JQXA 5D04C 1WOBA 1H51A 4QISA 3U2OA 1Z48A 5FF2A 2VFDA 5DCEA 3TAOA 3CC1A 4NXKA 5FEWA 3M9YA 3ATZA 3QFEA 3M0ZA 4O12A 1O60A 2QDGA 3W7MA 2J27A 2NXGA 2ZRVA 1CW2A 4AB4A 1Q6RA 1ICPA 1PS9A 3W2MA 3GAKA 1B4EA 4MFDA 2TMDA 3HGRA 1KM1A 5D38A 3B4UA 3HG4A 5AHIA 4IMDA 1QPNA 5KTLA 4WXZA 2TRSA 3HOJA 1Q6QA 1D3GA 4LS2A 3N2XA 2QEZA 2FPYA 3LCXA 3OBKA 3KVLA 3TW7A 5G4EA 4IXXA 4AXKA 3S0CA 3RLUA 4CQAA 2TPSA 1I2OA 4PH6A 3R89A 2LLEA 4ZZ9A 2P0OA 2J24A 4O16A 2J9XA 4I7WA 4ONVA 1SPQA 2I9EA 3TQKA 3NR0A 1HG3A 2GUUA 2YYUA 1UCWA 3G1HA 2PCQA 3C2OA 1BKSA 4LVFA 3NZ1A 4PCFA 1FWNA 3IRDA 1XFBA 2VFIA 3LXCA 3QSRA 1QPOA 1KA9F 1XL9A 1KTNA 1X7FA 4NXSA 5F4XA 3THAA 1KFEA 4JTTA 3HPSA 4FNUA 4P2VA 2VEIA 5HJLA 2TYSA 4TU1A 1W5QA 1JCJA 3G1SA 1YTKA 2EGZA 2ALDA 2VELA 1DQWA 3NYZA 4EF9A 1ZJIA 3O63A 3W7QA 2DZXA 4O57A 1OJXA 4CCDA 3W1PA 3GNNA 2QCHA 3QEZA 4FX6M 3WJSA 3O6CA 4FB7A 3NVTA 2X2GA 1GG0A 1GVSA 2Y89A 4AHQA 3B0PA 5CGQA 5FF7A 2FQIA 3DHFA 3NXFA 5K3VA 2BSLA 5MHBA 2B0MA 2Y61A 3IGUA 4LY8A 1RVGA 1F2JA 1PE1A 3C8FA 4RXGA 4N6EA 4JGDA 1Q45A 1OFQA 2ZRUA 2XN0A 3I65A 3C56A 3C0JA 3TUUA 3E49A 1G4TA 3DFPA 1QFEA 3ABQA 3USBA 1SSDA 3TMQA 1OK4A 3OVQA 4E38A 3NQDA 3B06A 4MY9A 3FJLA 5HWJA 1DJQA 1U5JA 4Y8FA 3EKZA 4L4MA 4UFLA 3W2LA 2W0UA 3DKJA 1H7OA 3TR2A 4R34A 4ZQPA 1ZY9A 3STEA 4EIVA 3OA3A 1CX9A 3GAYA 4M6QA 3SIZA 1IIGA 1A53A 3PUDA 2NX9A 4A2SA 4DPQA 3G1XA 4ADSA 3B05A 2ABAA 3OVRA 4IXHA 3LCIA 2NXHA 3W71A 1WOAA 3C61A 3W88A 1GEQA 3UYCA 4UTMA 2C19A 3O06A 2GJNA 4PL1A 1VPXA 4ICNA 1EPXA 3W3OA 3W7KA 4FNPA 1XBXA 3TFXA 3UPWA 2VC6A 1YPFA 3NQAA 2H8ZA 2H6RA 1U83A 4CNNA 5LNWA 4O4VA 3LRLA 1G67A 2CZDA 5BOOA 2OX1A 3TJLA 2YW4A 5LKYA 3KRZA 1H7NA 3LLFA 2CLOA 3NG3A 2JKPA 2OMAA 2QCDA 4OE7A 2QCEA 1TTIA 4IX2A 4NJHA 4NJKA 3TW6A 2QDHA 3FYOA 2DJXA 5HR6A 3RFAA 4UMBA 4NZFA 3W2UA 5CPLA 5DBTA 3T7VA 2GPTA 1L2UA 2ZZ2A 3MW7A 1WDWA 3ABSA 3EX6A 3LX9A 2R14A 2NZLA 3MYPA 1W31A 2XFWA 4JEQA 1EP1A 1IGSA 3W72A 4LTSA 3TIMA 3A9IA 1QDSA 1UUMA 3HQ1A 1B4KA 3R8RA 1IF2A 2E5CA 2H8XA 3TXVA 4Z1AA 1R30A 3S1XA 3W74A 1I8JA 3KRUA 2ZZ3A 3UWYA 4BI7A 2FB2A 3PC0A 1VHNA 3E0IA 4NZJA 4X9SA 5FF3A 1G4SA 3G1FA 2VEMA 2CLIA 3P62A 5FESA 4GNJA 3LXBA 2E6DA 1QO2A 4XZ9A 3UWZA 2OCZA 5AN7A 2RDTA 4L4LA 5AHLA 5LNVA 1ZCOA 4M6PA 2NLIA 4O18A 4XBKA 5G4WA 4OV9A 1KM0A 4UCGA 3HJZA 3MO7A 4J9JA 4Z0SA 3W1QA 2VOMA 2C0AA 3RLVA 3VE7A 1YDOA 4HN4A 2QCDB 4BF9A 1EUNA 2DZWA 1KV8A 3YPIA 3W73A 3LTPA 1RD5A 1GG1A 2V5LA 2Y85A 2QCNA 3PM6A 3W1UA 1D9EA 2AAMA 4N02A 5HR7A 3HGSA 3K30A 5KZEA 3TSDA 4A22A 5EPDA 4CNPA 2CZ5A 3KFTA 1WQ5A 3LV5A 3NQMA 1ICSA 1VLIA 2W79A 3JS3A 1EP3A 3SGZA 3NNTA 4Z1BA 3PBYA 3QSTA 4GFSA 3JR2A 3W1RA 2VEKA 1W54A 1QPQA 1YLVA 4RX0A 3PBWA 4NNCA 3LDVA 3TE9A 4XUGA 1IXNA 4CLMA 4EVZA 1QR7A 1H7XA 5G2HA 1OFEA 2V5BA 3MHGA 4RKAA 3W7RA 4GE8A 4LV4A 1O94A 3KOFA 3L0KA 3G24A 4LRTA 4O0KA 3W1NA 3Q58A 1S5TA 1SZEA 3VE9A 1GWJA 1DOSA 3M5VA 1RQBA 2WNQA 3GR7A 3IVSA 3BW2A 1I45A 4O13A 1EWDA 1G7UA 4JDBA 1EX5A 3SSJA 3S1WA 5I3JA 4UR7A 1H61A 3NL5A 4A3UA 1D3HA 3M5YA 3H54A 7TIMA 2Y7FA 1TJRA 2JKAA 4UC5A 3BGGA 4IMEA 3FA5A 2A2IA 1G69A 3QQ0A 4AHOA 3MI6A 3TQVA 3P61A 4XKYA 4A29A 3G0SA 1TPB1 1L6SA 1TB3A 3QH2A 4QITA 3DFNA 3UD6A 4LU0A 3W2JA 3ATYA 3F03K 4WUIA 3CTLA 4PTNA 3NQGA 1SZNA 4R33A 4K39A 1XXXA 1DBTA 3HB9A 3W07A 3TC7A 5AC6A 4WY0A 5I3HA 4U28A 1I2RA 3UQNA 5CPNA 3LRMA 5AHNA 1KTBA 1LBMA 3I6RA 1THFD 2EAWA 1K7EA 5G5IA 3DKLA 4JTJA 3W7GA 1R47A 1MXSA 1GT8A 3A22A 3SR7A 2ZZ4A 4AWTA 4IWWA 4FXRA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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4W9TA

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