3QW3A

Structure of leishmania donovani omp decarboxylase
Total Genus 94
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
94
sequence length
255
structure length
250
Chain Sequence
MSFFDLLNERAKRSLLCVGLDPRAKTAAAAVEECKRLIEQTHEYAAAYKPNAAFFEFFGAEGWAALSEVIRAVPAGIPVVLDAKRGDIADTADAYATSAFKHLNAHAITASPYMGSDSLQPFMRYPDKAVFVLCKTSNKGSNDLQCLRVGDRYLYEAVAERAEGPWNVNGNVGLVVGATDPVALARVRARAPTLWFLVPGISLKASLDAGLRADGSGMLINVSRGLARAADPRAAAKELCEEINAIRFAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Transferase, lyase
source organism Leishmania infantum
publication title The Leishmania donovani UMP synthase is essential for promastigote viability and has an unusual tetrameric structure that exhibits substrate-controlled oligomerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Orotidine-5-phosphate decarboxylase/orotate phosphoribosyltr
total genus 94
structure length 250
sequence length 255
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.4.2.10: Orotate phosphoribosyltransferase.
pdb deposition date 2011-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00215 OMPdecase Orotidine 5'-phosphate decarboxylase / HUMPS family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3qw3A01
3YPIA 5G2WA 4L4MA 1EPXA 4DXVA 5LNWA 2H3DA 3EWBX 4UTUA 3CB8A 3TNOA 1G7VA 1B9BA 2J9YA 3CTLA 3DI0A 5BW6A 1WOBA 3S1UA 2E6AA 3QJAA 4FNQA 5LNSA 1VQTA 3AJXA 3HG4A 1K8XA 3SSJA 2YDAA 1RPXA 4EF8A 2EGZA 3CPRA 4NJGA 1B3OA 4LV4A 1EWEA 3NEVA 4HIBA 3EX6A 1JCJA 4JTEA 3HG3A 2R91A 4BWLA 3H54A 4UUIA 1TIMA 3L0KA 2DJXA 5AYYA 2GQAA 3W1LA 2ZZ4A 3EXSA 3A21A 4M5PA 4YMZA 2A2IA 5AHIA 5AYXA 3LDVA 3M44A 3B8DA 3M5VA 4O50A 3W73A 2D73A 1HFBA 2DZXA 3HG2A 5F2MA 2QEZA 1H1YA 1AW2A 1FWNA 4QSHA 5TIMA 5FF3A 3PM6A 3MP5A 5CGQA 3TXZA 1IXOA 1UUOA 4N9EA 1H61A 1VHCA 4BI5A 1IIHA 2E6YA 2ZBTA 4LY8A 2FTPA 2AAMA 3SI9A 3GVGA 3U6WA 3PS7A 1LBMA 3S9YA 4XZ9A 4FIRA 3NPVA 5F4XA 3ABRA 5IM51 4GUGA 1EP1A 2ISSA 3NGJA 1UCWA 3IVUA 3I7RA 2ZRZA 2XN2A 4N9BA 3N73A 1GZGA 3LCGA 2H8ZA 1L9WA 2BWGA 3TW6A 3WJWA 2Y7EA 4OWGA 1W5NA 3S5ZA 1Y0EA 5F1VA 3TIMA 1NEYA 2ATMA 1QPOA 4KWVA 2E1DA 3D0CA 1W5MA 3EWZA 4HNNA 2DZUA 1ZENA 2GVLA 4BK9A 1JQVA 1SZNA 3TUUA 3LXBA 1GWJA 5DY2A 3TU9A 1GT8A 3JR2A 1ZAIA 1XXXA 4QNWA 1F76A 2CLMA 2E77A 3S5OA 3WK2A 4XTDA 1XDMA 4LU0A 1NSJA 4JTLA 3QM3A 2A4AA 1TV7A 1GYLA 3G1YA 6TIMA 5FI8A 5IBXA 1C8VA 5DLCA 4UTJA 2NXHA 5FEWA 2JK2A 1M6JA 1EEPA 1WBJA 1THFD 2AQWA 5TQLA 1H7OA 4JX4A 3T78A 4WY0F 2C14A 3CWOX 3GZ3A 4A2SA 1JR1A 1OYBA 1YXCA 3LRKA 1A5SA 3IV3A 3FS2A 1FCQA 4DO5A 3F4WA 2VFIA 3TSBA 5D33A 1XDLA 4X22A 2YW4A 3I7SA 3W85A 5MHBA 2WQPA 4FNTA 3GK0A 1G4EA 2P0OA 2V2HA 3L67A 3C52A 3LHYA 4I9AA 5G2IA 1S5TA 1LLWA 3W1PA 1OF6A 4EF9A 3BGGA 4IGHA 4GWEA 3NQ2A 4DELA 2YR1A 2HMCA 4CCEA 4UFHA 2V82A 4JDYA 2ZRWA 3STGA 3W2JA 3GKAA 3VE7A 3MHFA 1O94A 3QF0A 2NXIA 3HPSA 3IGXA 2DZSA 4ADTA 3L0NA 4WOZA 2RH9A 4JIPA 1ME9A 4AAJA 1OYCA 4FHAA 1Q45A 1SQ7A 2X16A 3KAOA 3TH6A 1FQ0A 1OYAA 2PRLA 3N3MA 2H90A 2QJGA 3C2VA 4UMAA 3MJYA 2NZLA 2Y89A 1ML1A 5CPMA 5HMSA 4ORIA 3S6DA 4O0KA 1W56A 1FX6A 1TTIA 2WSRA 3G1XA 1YDNA 4NQ1A 2YPIA 2ABBA 5D32A 5BMWA 3SFKA 2W0UA 4ORMA 2TPSA 2R94A 3EX3A 4RKAA 1UASA 4RJEA 1W0MA 4R34A 3HF3A 3LXCA 5D38A 2OJPA 2A7PA 4O4WA 3UWYA 3F03K 4E2DA 3TJXA 3O1NA 5I3FA 2GOUA 4DPPA 2X30A 4TMCA 1ZJIA 1SZEA 4NVTA 2CZFA 1MEIA 4O1BA 4PFMA 1FDJA 5BMXA 3G22A 1JCMP 1KTNA 4A29A 1AL7A 2NXGA 3K30A 5AHEA 1FWWA 2QAFA 5F4SA 4FB7A 5J5DA 4O15A 4WX2A 5I3HA 5DN1A 4N02A 1TJPA 4GUIA 1RV8A 3PSVA 4M6QA 1QNVA 2QCHA 2NX9A 3KRSA 2JKEA 3OEXA 1WQ5A 3O63A 3SY5A 4DBEA 2FIQA 2A1YA 2C3ZA 3SECA 3V75A 4MZ1A 4KFOA 1TTPA 4OGZA 3TV8A 4FEZA 3Q58A 3PBWA 3VKJA 1FWTA 4OHQA 1J4EA 4RZ4A 1JCXA 4JTJA 2VKZG 4E38A 3EWYA 2H3BA 3W7OA 3HJZA 2ATSA 2DJLA 2Y85A 4JX5A 2TMDA 3GDTA 2TRSA 1K7EA 3C6CA 1H1ZA 3GDKA 4Y96A 1AG1O 4Z0JA 4CNNA 3FJ6A 2XN0A 3W7IA 4AH7A 4HSNA 5DCEA 2BZNA 3GXTA 2ZRXA 5KZMA 2NUYA 4Q33A 3B06A 3VCRA 4CCCA 5KZEA 3C2OA 2WSYA 4GXMA 3M16A 3DBPA 3T40A 3Q37A 1O95A 5AHNA 2EPHA 3UXAA 3NOEA 4CQ9A 3P7YA 2JGYA 2V30A 2NV1A 4M6PA 3W1TA 3ZR4A 2GPTA 3C2EA 5E1QA 3IVTA 5CSSA 2CU0A 3ABSA 1RD5A 3LHWA 3TC7A 2H8XA 3M47A 5LNRA 3QYQA 4TR9A 4D2JA 2JKPA 1GVOA 2QCGA 3PULA 3PBYA 2Y7FA 2A21A 2CFFA 1TMHA 2QJHA 3FKKA 3H53A 4U28A 3S5YA 2Y70A 3OBKA 3G3DA 1XBZA 1HO4A 1RR2A 1CI1A 1YTDA 1EWDA 3PWAA 4L4LA 4CNPA 5D2XA 2G5WA 1S5VA 3BG9A 1J5TA 2FJKA 3S1VA 1R2TA 4NXSA 1XM3A 1Q6RA 3PSWA 1LRQA 2Q3RA 3I65A 3GXPA 3NO5A 4LUJA 1ALDA 4QIUA 3DFTA 4I7VA 2Y7DA 4E2BA 1T96A 4JX6A 3UXDA 2IQTA 1Z48A 3W7CA 3L5LA 3GAKA 1XFBA 3PAJA 4IMGA 4K38A 4UTIA 1T99A 2V5LA 4H3DA 4I7WA 3W74A 1C9DA 4GBUA 1QMLA 3MI3A 4C1KA 4O10A 4UMCA 2WO5A 2R8WA 3KVKA 4OV4A 2QCCA 3W86A 1NVMA 5KITA 1FBAA 3HBLA 5D04C 1QFEA 1TQXA 3BK0A 3LRLA 2Z6JA 3EWWA 5AC7A 2GUUA 1XI3A 4LS2A 4MYXA 2ZA3A 5H2ZA 4QQ3A 3RLUA 2RFGA 3P67A 1ZY9A 4QISA 4DQWA 1SW0A 1X7FA 4N9DA 3W7JA 1OVDA 4RXFA 3BGJA 5T26A 4P61A 1QPQA 3DFOA 3HPXA 3IGUA 1S5WA 2F7FA 4J9JA 4FXSA 3NL6A 1H62A 2WOQA 4Z0SA 4K37A 2CLHA 2DU2A 5EA9A 3BLIA 3C61A 2HS6A 1G69A 1KV5A 2GVJA 4KWWA 5J5RA 4ZQPA 5HWNA 1Q6LA 5CZSA 3V1PA 4BF9A 3MP3A 1Q6QA 1OFRA 4X3ZA 5D2VA 5AHLA 1N7KA 3TSMA 3DHFA 2Q3OA 4TX9A 3OHIA 2B7NA 2VENA 3CHVA 1GG1A 3CM4A 3KRUA 2FB3A 4FNRA 2YYTA 1LYXA 2X1TA 3SIZA 3TAOA 2LLEA 5F2IA 4AWUA 1K03A 3G1VA 1HO1A 1JUEA 5LKYA 4WQ6A 4MIMA 3G24A 5LNUA 4XWUA 4WY0A 5SWUA 4XQ6A 4IQLA 1KM0A 3TMQA 2WKJA 4M7TA 3UNDA 3EX2A 4IMEA 4HN4A 5F1UA 2B7PA 4O4VA 4Y6GA 2PC4A 2WNZA 5D03A 1SR9A 2GQ9A 1TO3A 3TDFA 1O5XA 3WK0A 1M7OA 1UUMA 4O17A 3W87A 3NM3A 2VC6A 2UV8G 5AHFA 5FF0A 1F74A 3W2MA 3W7DA 1FXQA 4O1CA 5DXYA 3W7EA 3HGRA 4FF7A 1K3UA 4NJJA 1EP3A 4EWND 4WUIA 3S1XA 1ME7A 4IJBA 1WBHA 1YLVA 1SZFA 4PL1A 1YYAA 1GEQA 1IF2A 1I2QA 4LVAA 3ANYA 5K4ZA 4LNYA 2ISVA 2PE4A 2AGKA 3HMJG 1ZAJA 4RCXA 3NQFA 3TXVA 3KFTA 1W5QA 2QF7A 3CIWA 2NUXA 3C2FA 3M43A 3NQVA 3PY2A 1LZOA 2JGQA 1J2WA 2X1RA 3QFEA 3L2IA 2VEMA 4UR8A 3THQA 3BVJA 4QM1A 1BWLA 3NZ1A 5FF7A 2E5BA 4ZZ9A 3ABOA 3TJLA 3DFSA 5H91A 2NWRA 2DP3A 1UB3A 3KVJA 2C0AA 3SGZA 2V9DA 3W6YA 3NQMA 1AW1A 3R89A 5FEXA 1PVNA 3G18A 3LERA 3W7LA 2FPYA 1GVFA 1KM6A 5CPLA 3KXQA 4OU1A 3GXNA 3L5AA 4ZVJA 4NJHA 4MFDA 4AF0B 5HULA 3CT7A 3MP4A 3NVTA 1KLYA 3M5XA 3HB9A 5FESA 1S3HA 4ML9A 5AN7A 1FWRA 4GC4A 1OFAA 3OVPA 5LHFA 3WFAA 3A5FA 4GUJA 1G67A 4RX0A 5K9DA 5D09A 1YDVA 4JTSA 4X2RA 2E68A 4ALDA 3RNDA 3STFA 1RQHA 3LCFA 1LBFA 4WY0B 5L6UA 3TCEA 2QUVA 4NUWA 5G5IA 1DORA 5CSRA 3C4UA 3B05A 1DL3A 1TREA 4LRSA 3P8IA 1OHLA 2A0NA 3OA3A 3W1QA 1SO6A 4IMFA 2BLEA 2CLFA 3S42A 3FYOA 1X8FA 1DHPA 1OF8A 1ZNNA 3LV5A 1L2UA 4CQAA 1H7RA 4MYAA 4IXHA 5GVJA 4AVFA 4NZJA 2JKAA 3PC0A 5EYWA 3LCWA 5EBUA 3KX6A 3W88A 1OK4A 4DO4A 1Q3NA 1VHNA 2R14A 1WYIA 5DELA 1XUZA 3UPWA 2J27A 4WXZA 2DZWA 5D37A 1OX5A 2QKFA 1PCWA 4JYEA 3Q2DA 3GYEA 2RHGA 4Q32A 3DENA 4TO8A 4M7SA 5C55A 1G7UA 4ZQNA 3T7VA 2A5HA 1W5OA 2V5BA 1TPC1 3THAA 3O6CA 4LVBA 3QRHA 1LDCA 3PUDA 2ZZ5A 3A22A 1ZFJA 1DQWA 4UFJA 3B0VC 3T4CA 3NR0A 1ICSA 4I7UA 1K02A 2BXVA 4LT9A 3W7RA 4PTNA 4O28A 2V0TA 4LRTA 3BW3A 4YCPA 5G2HA 3KVMA 1D9EA 3LCIA 3ATZA 3DGRA 3UY7A 3GB6A 2QUTA 4JTUA 4C1LA 5K9CA 1LM1A 3LXAA 1KFJA 3W7PA 4FX8A 3NZRA 1LLZA 1TSIA 2CZDA 1OFOA 4JY8A 4K7YA 3RMJA 5CKSA 1F73A 3FIGA 3A9IA 5DBTA 3W2KA 5DBUA 3BW4A 5D30A 1IXNA 1KM2A 1SO4A 1R2RA 1LRNA 3VNDA 3MHUA 2CW6A 2RDUA 3W7KA 4QJ1A 3M1ZA 4JTKA 3LRMA 4HKPA 4KFPA 1YTEA 3LHUA 4UMBA 5K9XA 4O18A 3QQ0A 2QJIA 4KKXA 1XUUA 3QMTA 4A2RA 1H7XA 3DXIA 4HPJA 3MBDA 3A24A 3JRKA 1RVGA 8TIMA 3TMLA 3Q94A 5K7JA 1OK6A 4MY1A 3ELFA 4TU1A 1G4TA 2C6QA 1OFBA 2E5DA 4YLWA 5F4WA 1FDZA 1WDWA 3U2OA 3UWZA 3LTYA 4N6FA 1GTEA 1JJKA 2YCEA 2C19A 3DAQA 3FLUA 1JQXA 3NYZA 2WNNA 3W71A 1LOLA 3VFLA 3N34A 4IPIA 3TC6A 1VCFA 3RLVA 5TBOA 5LNVA 2VXNA 2NUWA 2PRHA 5C2XA 1GTHA 1LRTA 1GYNA 1FUYA 2PURA 1JVNA 1DV7A 1PS9A 3E12A 3PUOA 3O15A 3HPZA 3TSDA 3G1DA 2G96A 2Y62A 3NDOA 3R13A 1OJXA 4DEFA 1G4SA 3P82A 3BG5A 3PVFA 1H7NA 5DY3A 1L6WA 3QPYA 3TAKA 3IEBA 2YFOA 1H51A 3W70A 1P0NA 1KV8A 2TYSA 5LGXA 2Z0IA 4HNUA 2CLEA 1BKSA 1RQEA 1CW2A 4WXYA 1EB3A 4N4QA 3MI2A 4ADUA 5CZJA 1I45A 1BWKA 3R8RA 3ZWTA 3NA8A 1BTMA 1WOAA 4CQ8A 3EWUA 2A7NA 5K2ZA 2X2GA 2GVGA 3A23A 4ZL1A 4OBTA 3UD6A 3BPWA 2J6XA 2HSAA 4Z1AA 1DJNA 1H50A 2ISWA 4FO4A 1TV8A 4MUZA 1VRDA 1A50A 3MW7A 3NG3A 4AWTA 3EB2A 1Z41A 1TPB1 3TX9A 1LOQA 4B5NA 4HPXA 1D3HA 4Z1DA 4H6KA 5FF4A 3WJZA 4AMAA 2QCMA 2O7QA 2W79A 2YGYA 5AHMA 3IIPA 2RKXA 1XBYA 5G1TA 3P74A 3CEPA 1WX0A 3RU6A 4UTWC 3O6DA 2Y88A 2CLOA 4UCGA 4HHPA 2J24A 2Y61A 2ZTJA 3UZJA 1FY6A 1F6PA 4GJ1A 4ONVA 1F6KA 1MZHA 3EX4A 3P5ZA 2VOMA 4GUHA 2CLLA 3BV4A 2JBMA 2QCLA 3TA6A 3G8EA 2VFHA 4WD0A 1ICQA 2BX7A 2CLIA 3ZWSA 2P1FA 2NV2A 5CZ0A 2Q8LA 3QC3A 3HOJA 3BW2A 3DZ1A 1A5BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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