1JQX | Genus

Total Genus 113

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	113
sequence length	311
structure length	311
Chain Sequence	MLNTTFANAKFANPFMNASGVHCMTIEDLEELKASQAGAYITKSSTLEKREGNPLPAYVDLELGSINSMGLPNLGFDYYLDYVLKNQKENAQEGPIFFSIAGMSAAENIAMLKKIQESDFSGITELNLSCPNVPGKPQLAYDFEATEKLLKEVFTFFTKPLGVKLPPYFDLVHFDIMAEILNQFPLTYVNSVNSIGNGLFIDPEAESVVIKPKDGFGGIGGAYIKPTALANVRAFYTRLKPEIQIIGTGGIETGQDAFEHLLCGATMLQIGTALHKEGPAIFDRIIKELEEIMNQKGYQSIADFHGKLKSL

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function pubmed doi rcsb
molecule keywords	dihydroorotate dehydrogenase A
molecule tags	Oxidoreductase
source organism	Lactococcus lactis
total genus	113
structure length	311
sequence length	311
chains with identical sequence	B
ec nomenclature	ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date	2001-08-09

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF01180	DHO_dh	Dihydroorotate dehydrogenase

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
2.30.26.10	Mainly Beta	Roll	Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2	Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2	1jqxA02
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	1jqxA01

2J9ZA 3W1LA 3QW4B 2YR1A 3OEXA 3I7SA 1A50A 1SZFA 2NV1A 3OG3A 3WJZA 2FLIA 1FDJA 3W75A 1W54A 2A2IA 2EKCA 1S5VA 3W2KA 4DF2A 3SW6A 1KBIA 3R5EA 1JCNA 1W5NA 5T26A 2ZZ6A 1H5YA 2VFHA 1VQTA 4DF0A 3DU0A 3KXQA 5C2XA 2X1UA 3OVRA 4OWGA 3IIPA 1CX9A 3RMJA 5CZJA 1IXPA 5BMWA 4IMEA 4BWLA 4N4PA 4IUOA 4UIOA 4TR9A 1ZAJA 4UMAA 3HQ1A 1MEHA 4Z1AA 3NQ7A 3S5ZA 3TKFA 4JTSA 3NR0A 5CZTA 1U5JA 1OK6A 4NXSA 4TMBA 5HWNA 1GVOA 4O53A 4EIVA 3TAOA 3KHJA 2B7OA 5BMXA 2ZZ4A 1ICQA 4G1KA 1SO3A 3N2XA 2RH9A 2Y88A 2G95A 4PTNA 2QCDA 2VOMA 1YPFA 4HT3A 2ZRUA 1LOLA 4OHQA 4M5PA 4UFKA 2V2CA 3N3MA 3TJXA 4DELA 4X2RA 3DGRA 5HWMA 2FFCA 4FNRA 2FDSA 4Q4KA 1P4CA 3OBKA 2OCZA 2Q3OA 3CM4A 1G4PA 3EX1A 4RV8A 1JUBA 2P1FA 2YW4A 3UNDA 3KFTA 3BLEA 4XBSA 1ZENA 4L4MA 5AHIA 2PCQA 4S2CA 2R14A 1KW1A 3L0GA 1LOSA 2GJLA 2YSWA 1FWRA 1JRBA 4R53A 5L6UA 3E02A 4UTMA 3KRSA 3QM3A 2WSQA 4R34A 5GVJA 3USBA 4E2DA 4M6PA 2QCLA 3FIGA 3ELFA 4W9TA 1J5TA 2W0UA 2CLMA 2XN1A 1XFBA 4MLRA 2ZTJA 5C54A 4FIQA 1R47A 4FNPA 1DVJA 2A85A 1LBFA 1XDLA 1MZHA 1QPNA 5KITA 1T99A 3Q94A 1OYCA 5HUOA 5A5WA 4I7UA 3I68A 3QMRA 4YL2A 1AK5A 4LS0A 1JJKA 1W8SA 4X3ZA 3LX9A 2E6DA 1AW1A 3FYOA 2QEZA 3NQAA 4E2BA 1ZALA 3W7HA 4HNUA 4XBKA 3TSDA 5H2ZA 1HFBA 3S1WA 2AQWA 3ABSA 3P8JA 3HPXA 4DPQA 2ATMA 1F05A 2FJKA 5CG7A 3TU9A 3M43A 1MEIA 5LNRA 4HNTA 2FPYA 2HSAA 3T7VA 3W1AA 3W1RA 1XCFA 1LTDA 2GPTA 2TMDA 4KFPA 4JX4A 2UV8G 2TPSA 3DBPA 1SW3A 4O54A 3G1YA 3EXTA 2ZTKA 1OJXA 1R2SA 1VS1A 1PL9A 1LRTA 2CFFA 1P0NA 1NF0A 4JY9A 1KBJA 3UZJA 3GDTA 4MY8A 3NO5A 4JGDA 4NUWA 4JTJA 3EWZA 4UFHA 5D05A 5CSSA 2GQ8A 3LXBA 5AHLA 2Y85A 1TJRA 2I14A 3NG3A 2NZLA 3THQA 1BWLA 2C13A 5IBXA 3U2OA 2A6LA 3CPRA 3NXFA 2A7PA 3JS3A 1W5QA 3FEMA 1TPWA 3L0NA 3GZ3A 4JXCA 3NQ6A 3TCEA 4A21A 2JGYA 7TIMA 2WPBA 2VEIA 4S1FA 2J6XA 3ZFHA 2VC6A 3FYPA 2XFWA 1D3GA 2G96A 1W5OA 4LNYA 3CHVA 1KM0A 3W7IA 4IXHA 2BZNA 3NNTA 2E5DA 1J4EA 1LORA 3K30A 1DOSA 1Q6LA 2WNNA 2JKEA 3NQCA 5LKYA 1A5BA 2P10A 1Z48A 3NL6A 2NUYA 3TDFA 3I65A 3UPWA 2EPHA 4BI6A 2HS8A 1XI3A 3W76A 2CLOA 1W3TA 1ZCOA 4MOZA 3BG3A 4O13A 1F73A 3F1QA 3DI0A 3LERA 1DKWA 2VFDA 3N14A 4RKAA 4Z1DA 4UTTA 4RZ4A 3N9RA 3BARA 3TC6A 4O17A 1ML1A 3EX4A 3A24A 3LHZA 4JD4A 2F7FA 4JNMA 1I45A 4GXMA 2YXGA 2F84A 1YDOA 4NNAA 3MYOA 2Y6ZA 1YTEA 4HKPA 3QF0A 3G3MA 3NL5A 3HOJA 4JIQA 4TX9A 2E1DA 3AO0A 1LP6A 3T4CA 2V2HA 5CPMA 3L2IA 1TQJA 4XKYB 1O60A 3GVGA 4ADUA 2FB3A 3W7MA 3M7WA 3EEGA 5KINA 3C8FA 3DAQA 2CZ5A 1QWGA 2IQTA 2GQ9A 4UXDA 2QJGA 4N9CA 5HWJA 1C9DA 3S6DA 2VEPA 4GJ1A 1KV8A 1H7OA 5HINA 2DP3A 2RDUA 1TIMA 4LUIA 4HIBA 3OVQA 3N9SA 1O94A 3P5ZA 4GBUA 5I3JA 1OK4A 1SFJA 4O11A 2J9YA 4XQ6A 2O7QA 1QAPA 1KLZA 3SY5A 2WO5A 2V2DA 4RK8A 1RQHA 2DZVA 4UUIA 3PUEA 3L5MA 2CLFA 3W87A 1Q6OA 4QITA 4A3UA 3W73A 4JIPA 3TXZA 4RLIA 1B9BA 1GT8A 3F03K 3MHUA 2EAWA 4N6EA 5SWUA 3UPBA 4NX0A 1KM5A 2WV8A 2YFNA 1BWKA 3EX3A 1WAUA 3TFCA 1OFOA 4K7YA 2ZZ1A 2FPVA 3VFLA 4DO4A 2OMAA 5AOUA 1X1OA 3T44A 4ZQOA 3Q2DA 2RKXA 1DQXA 1LROA 3EXRA 3NOEA 2ZA2A 1HUVA 2CU0A 2Q8ZA 4OGZA 1JQXA 1ZNNA 2V8ZA 3W1UA 4P61A 3DHFA 4GFSA 4OV4A 1L9WA 1XBZA 3UWYA 3PB2A 4JICA 5TBOA 4N9DA 5DBTA 1YXCA 4DBEA 4WY0F 5F1VA 1SZNA 5DXXA 1AG1O 4GUFA 3TQVA 5FF0A 5FF7A 1J2WA 3SJ3A 2YDAA 1TRIA 4K38A 2NXIA 1SO6A 2ZZ2A 1AMKA 3TJLA 3SECA 2D73A 3NQ2A 2HMCA 1A53A 3HG4A 3W2NA 3HF3A 2JKPA 4FHAA 1LM1A 5DN1A 2Y62A 3C4UA 3WK2A 4WXZA 1AL7A 3IIVA 3ABQA 2A7RA 5FEZA 3W9ZA 4ZQNA 4UFLA 3HPZA 5DXYA 1H51A 1XL9A 3O6CA 1PVNA 3IVTA 2B0MA 2ISSA 5F2IA 4A29A 2J27A 2C19A 1H63A 4N6FA 4JS3A 4ML9A 2QJIA 4OBTA 4QSHA 2FPTA 1VCGA 1X8FA 3KX6A 1PHWA 4N9EA 4O1AA 5D2TA 2QAPA 2WNZA 1IF2A 4OT7A 4MZ1A 1H1YA 3C3NA 1ADOA 1YXYA 2A7NA 3IGXA 1F7BA 3BO9A 5FF4A 5CPLA 1EIXA 4EF9A 2QCHA 2J9XA 4XKYA 3IGSA 2H90A 2QDHA 3P60A 1I2RA 4ORMA 2H3DA 4ONVA 1G69A 2P0OA 4TMCA 1GTHA 3NZ1A 4O10A 3C0JA 4ZQPA 3IGUA 2WSYA 4AAJA 1P1XA 3PSVA 3VE9A 2ZBTA 4C1KA 3TUUA 2VFEA 1W3NA 1WQ5A 3BW4A 2B7QA 2JK2A 3E0IA 5AHMA 3KVLA 4N9BA 3NEVA 1YYAA 3BGJA 1QPRA 3PAJA 5HULA 1UBSA 2ZQ0A 4NT0A 2H3BA 2WOQA 3VE7A 1OYBA 3LTPA 1JULA 4HNNA 3WK3A 4MPQA 4NX5A 2Y89A 3LCWA 2TYSA 1QPOA 5I3FA 2WQPA 3DFSA 4JEQA 1RQBA 1TPVA 3R89A 4ALDA 1VCFA 4CNNA 3B0UX 1XUZA 3NVTA 1LOQA 5TQLA 3L21A 5D33A 1F2JA 2VXNA 3SI9A 4NJKA 3NQVA 1N8FA 1ONRA 5K4XA 1FWTA 3SFKA 1D3HA 1XBYA 4DO5A 1KM6A 1M7OA 2CLLA 1KFCA 4XZ9A 1TYGA 3B06A 1PHQA 4FF7A 5BNKA 4RXGA 1KFLA 2E09A 4CLMA 2Z0IA 1W3IA 2ISVA 4LVBA 3N73A 3W86A 1TCDA 4GRSA 5KSWA 4AHPA 1KLYA 3LOTA 2Z2UA 4AF0B 4ICNA 3W2JA 2O7SA 1IGSA 2JBMA 5L9FA 3O05A 3NPUA 4KFOA 4O1BA 3TE9A 3O06A 3PBVA 4LC8A 3V1PA 2EGZA 4LV9A 2Y7FA 1OF8A 3TW7A 4JTHA 2CZEA 3W3OA 3NPVA 3UQNA 3H53A 3WJYA 3I7QA 3N34A 1SU5A 4WOZA 1SPQA 4NJIA 4LTSA 4UTHA 3UWUA 1AW2A 4O1CA 1H1ZA 2X16A 2QCNA 3QQ1A 1ZY9A 1GPWA 3GDKA 4QISA 1KFBA 4X22A 3F4NA 4AVFA 3P82A 4X9SA 3W88A 1TB3A 3G8EA 3H54A 5EY5A 3TH6A 4K36A 5D2VA 4PFMA 1JCMP 2DZTA 2ZZ3A 3W1XA 2QUVA 4UTJA 5F2LA 4AWTA 5J5RA 3LM7A 3ABRA 2YFOA 2V5BA 2QCCA 4BWLC 4QNWA 1VHCA 4TO8A 2ZZ5A 5C55A 4CCDA 3W2UA 4D2JA 1DJQA 3LCIA 3NQGA 4GNJA 4O8RA 3U8GA 3M47A 1Y0EA 1SR9A 1LRNA 4QAIA 4O15A 5KMYA 1XDMA 3RK8A 1WXJA 4IJBA 3P84A 4ADSA 2GVGA 1G7VA 5I3GA 1K3UA 3GLCA 4O1DA 3TIMA 3M5VA 5G4EA 5KZMA 4NNBA 4JY8A 1L6YA 2PC4A 2QCFA 1JR1A 2YCEA 4ZQRA 5EMUA 1FXPA 3HO8A 3STCA 5K7JA 1X7FA 3LTSA 4WD0A 1YXDA 2DU2A 3W07A 4O4VA 3BV4A 3FFSA 1XC4A 2ALDA 2HS6A 3ATZA 4JTLA 1EEPA 4O0KA 4LS1A 4GUJA 1KFEA 1EA0A 1THFD 2OZ0A 3UXDA 1LBLA 2Y70A 1I2QA 3PG9A 3R2GA 3QYQA 4O28A 1M7PA 1I8JA 3PWAA 5D32A 5AC6A 1G4SA 4QJ1A 1LRQA 5D30A 2Y61A 3W7EA 4S2BA 2VFIA 1NAL1 4IQLA 5BRBA 2Z6JA 4NJJA 1L6SA 3L9CA 3MJYA 3LBMA 4IOTA 2DORA 5HJLA 3NQEA 1YPIA 1R30A 3U6WA 1IXNA 3G1VA 3S42A 4AHOA 1KTNA 4O14A 4GE8A 3PVFA 5LNWA 4N2YA 3O8AA 3E49A 4GC4A 4PEKA 5AC8A 5CPNA 1BTMA 4AF0A 1TPDA 3MI2A 1S5WA 1K03A 3LHUA 4I7VA 1EWDA 4PCFA 1UB3A 3B4UA 3QPZA 3VCRA 5C6MA 1QDSA 1P0KA 2VEMA 1OFEA 1NVMA 4NJGA 5G2WA 1K8ZA 3SSJA 5KZDA 2G97A 5EA9A 2GUUA 3RU6A 2GVJA 1YDNA 3EWYA 5G5IA 5AC7A 5EYWA 1WOBA 3CU2A 5FEXA 4EWND 1YDVA 1DHPA 4CQ9A 1WV2A 3C61A 1KV5A 1TPC1 3LCFA 3E96A 1P5BA 3MP4A 4FXRA 1H7RA 3CIWA 3M1ZA 1L6WA 5U7SA 3FA5A 4JDYA 1OFDA 1QPQA 5D2YA 4MVAA 3GXTA 1ME7A 1YTDA 1QOQA 3TFXA 1OVDA 4YLWA 1VZWA 3TX9A 1RV8A 3HG5A 4B5NA 3R12A 3VNDA 2DZSA 4IMFA 1KFJA 3N2MA 5F2GA 3PC0A 3W7CA 3WK1A 4FX7A 3IIOA 1FUYA 1G4EA 5BOOA 5AFDA 1OX4B 1SO4A 4WQ6A 2VKZG 3P62A 2C3ZA 1VPXA 4UTKA 1GJPA 3GAYA 2AAMA 3P7YA 2QKFA 3L68A 2CZDA 4JYFA 4WY0B 3LXCA 3O6DA 2ZDRA 3GDRA 4MIMA 4I9AA 3LHTA 5IM51 3WJSA 1HO4A 2V9DA 3MWAA 5LNSA 3EWBX 1OF6A 2ABAA 3O63A 3NGJA 3QEZA 1T8XA 1OYAA 2R91A 2E77A 2FTPA 3BK0A 3IVSA 4RR4A 4LT9A 3W1PA 1KM1A 1T96A 4JR5A 4UTTC 5A8GA 5CKSA 3HPSA 4AHQA 3W70A 3PS7A 4L4LA 3MMTA 3CEUA 3DENA 2VFGA 5CZ0A 4OE7A 2C14A 1FWSA 4UR8A 5HQEA 3LHVA 1ME8A 3L5AA 1QO5A 4OU1A 1GVQA 2ZRVA 3STFA 2VENA 3TQ0A 4U4MA 3CLMA 3UD6A 1F76A 3D0CA 1WA3A 1OFBA 6ALDA 4NZFA 4Z0JA 6TIMA 3P5YA 5LGZA 3G1SA 3G1FA 3JRKA 3PUOA 4ADTA 3HGSA 2NWRA 2ZRZA 3HBLA 1LLZA 1FDZA 2B4GA 1IXQA 2YW3A 4LVGA 3M0ZA 3UYCA 4BI7A 5FEWA 4LC6A 3LI1A 4FEZA 4M7TA 1FY6A 2NV2A 1LCOA 2PE4A 3G3DA 3DFQA 2GOUA 1EWEA 3EWWA 4LVDA 4K37A 1GWJA 1RQEA 3NQ8A 1WBJA 2QJHA 3S1VA 2YX0A 1MEWA 5DCDA 1I2NA 3O16A 2A0NA 1H7XA 4I7WA 2PRMA 2NX3A 3G22A 4OV9A 1E51A 3FS2A 4QIUA 1NSJA 3LDVA 2CLHA 5AB3A 3S1UA 5KTLA 4RZ5A 3OIXA 4EF8A 3NPXA 2YZRA 3PULA 5AYZA 2ZA3A 3NQMA 1QR7A 1K7EA 4WZHA 2Z6IA 4Z0SA 1FWWA 2XN2A 3DZ1A 4JTFA 4O19A 1LYXA 1O95A 4R33A 3QMSA 2V5LA 5D03A 3G18A 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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1JQXA

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