2PRHA

The structures of apo- and inhibitor bound human dihydroorotate dehydrogenase reveal conformational flexibility within the inhibitor binding site
Total Genus 135
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
135
sequence length
367
structure length
358
Chain Sequence
MATGDERFYAEHLMPTLQGLLDPESAHRLAVRFTSLGLLPRARFQDSDMLEVRVLGHKFRNPVGIAAGFDKHGEAVDGLYKMGFGFVEIGSVTPKPQEGNPRPRVFRLPEDQAVINRYGFNSHGLSVVEHRLRARQQKQAKLTEDGLPLGVNLGKNKTSVDAAEDYAEGVRVLGPLADYLVVNVSSPGKAELRRLLTKVLQERDGLRRVHRPAVLVKIAPDLTSQDKEDIASVVKELGIDGLIVTNTTVSRPAGLQGALRSETGGLSGKPLRDLSTQTIREMYALTQGRVPIIGVGGVSSGQDALEKIRAGASLVQLYTALTFWGPPVVGKVKRELEALLKEQGFGGVTDAIGADHRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title The structures of human dihydroorotate dehydrogenase with and without inhibitor reveal conformational flexibility in the inhibitor and substrate binding sites
pubmed doi rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase, mitochondrial
total genus 135
structure length 358
sequence length 367
ec nomenclature ec 1.3.5.2: Dihydroorotate dehydrogenase (quinone).
pdb deposition date 2007-05-04

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2prhA00
3TSMA 2JKAA 3DKJA 2NUXA 3T4CA 3PBVA 3PBWA 4OBTA 2NX9A 3GAKA 1H1ZA 4BI6A 2C0AA 4GUGA 1IXNA 1KTNA 4CQ8A 2E6YA 4LUJA 4NNAA 3DHFA 4O0ZA 3BG3A 1SQ7A 1VHCA 1QO2A 1GZGA 2EPHA 1VLWA 3B0VC 4TX9A 4MLJA 5K7JA 3NEVA 1XUUA 4JR5A 2Y62A 3NXFA 1LLWA 2YZRA 2YYUA 4MZYA 1A5CA 1EWDA 5DCDA 3CWOX 1T0OA 3EB2A 1JCXA 3W1LA 1O94A 3RU6A 3W1UA 5CPMA 4DBEA 5EMUA 4DF1A 3W1MA 4YXGA 2ZRUA 3W7RA 3MMTA 5AHFA 1LRQA 3PM6A 3P84A 3JR2A 2GJLA 4MJZA 1KFLA 4GXMA 1YPFA 1TPEA 1W5PA 3NPWA 5D05A 2CLHA 1K7EA 3TCEA 1QDSA 1EEPA 3ZR4A 3HGRA 1TSIA 2HSAA 3O15A 1T8XA 3TK7A 2QJGA 4Y90A 1O60A 4N4QA 3QRHA 3C52A 3GR7A 1SW0A 1SFLA 1G67A 2WSQA 5KSWA 2QR6A 5C5YA 3PSWA 1KTCA 3B05A 4Z1AA 4RK8A 3ATYA 4CQAA 3KVKA 3DI1A 1LZOA 1TJPA 1K8XA 1ZNNA 3N3MA 1P0NA 5AOUA 3C2RA 3PS7A 3UXDA 4O1AA 4N6EA 1V7YA 1QR7A 5LNSA 3G22A 1UASA 3GDKA 1VQTA 5CSSA 1J2WA 1ZAHA 3HMJG 1W56A 2V2DA 2E1DA 2ZZ7A 3CTLA 2LLEA 5FEXA 5ABTA 1X7FA 3MWAA 4LVGA 3C61A 3S6DA 3EWZA 1G4EA 4JICA 4UMCA 2A7RA 2QEZA 2G97A 2TPSA 4UTUA 2ALDA 3NQ8A 3PF3A 1XDLA 4O50A 4UMBA 5D2YA 1OFRA 5G2HA 3HOJA 1SZGA 5BMWA 3G3DA 4O14A 3LRMA 1IXPA 5CZTA 3QEZA 3RLVA 2A7PA 1QCWA 3A22A 3TMQA 2QCHA 5AB3A 1TV8A 3BLEA 3L65A 3UY7A 1B3OA 4WXYA 1AG1O 3GDRA 4EWND 3O1NA 1EUNA 1N55A 1TPUA 2VEMA 2ZZ3A 4QM1A 3G1DA 3SY5A 4HT3A 4CCDA 4X3ZA 2E6AA 2JBMA 1YLVA 1EX5A 1PHWA 5F2GA 3QMSA 3OVRA 2C16A 1LYXA 3LTPA 4FXSA 2FJKA 3TKFA 2ATMA 1NSJA 4S2BA 1FWNA 1M6JA 3IVSA 5FF0A 1C29A 1XKYA 5AHLA 1F74A 3KOFA 3TFXA 3O6YX 3K30A 5CZSA 1ME9A 2B7QA 1OYCA 5AHIA 5FF4A 4CNNA 2A6LA 4EIVA 2VELA 3G1YA 2FLIA 3HG3A 2Z2UA 4ADSA 4BWLC 3Q94A 1W3TA 1S5WA 1AL8A 3VNDA 3CQ0A 1FX6A 1OFDA 2GOUA 2Q3RA 1GOXA 2HS6A 2RDTA 3LV5A 3P80A 1TB3A 2ZQ0A 1L2UA 3LRLA 4NU7A 2ISSA 5HMSA 3ABSA 1X6UA 4Z1CA 1DJNA 2F84A 3M7WA 1EP2A 2F7FA 3C8FA 4LUIA 5CPNA 4HNVA 3BGJA 3M5VA 1O4UA 4JTIA 4LS2A 1P0KA 4D2JA 1KFJA 4DBDA 2VFDA 7TIMA 5FESA 3B8DA 2Y88A 3O16A 5EY5A 1TQXA 3GKAA 4JIPA 2ZDRA 3CC1A 3JS3A 2Z1BA 5I3FA 1I2RA 5DLCA 2YW4A 3GXTA 4RLIA 4PODA 1KFBA 2G95A 2ZRZA 4JTTA 3N19B 1TTIA 4QNWA 1ML1A 1B9BA 3QSTA 3TV8A 3NVTA 3PAJA 4QSHA 3CPRA 4PH6A 3OVPA 1GTHA 4AWSA 3NQ6A 4JX6A 5LKYA 1AL7A 1F73A 1XDMA 1YXDA 1NF7A 3P81A 3GK0A 3NPXA 3CB8A 2AGKA 4NNCA 1VCVA 4HSOA 3SJ3A 3I68A 5K4ZA 5BMXA 1LRNA 2Y7DA 3ZFHA 3HGSA 4K36A 3FS2A 3FA5A 4UR8A 2CU0A 1XXXA 2WQPA 2E68A 2CFFA 2WNQA 1JJKA 3L68A 3USBA 1IIGA 1KM3A 1M7OA 5U7SA 1F2JA 4O53A 5DXYA 2DZVA 2C14A 4BWLA 4JN6A 2TSYA 3SIZA 3MYOA 3GX9A 3TIMA 2C19A 3L2IA 4JYFA 4AMAA 4DO6A 2V0TA 3LOTA 1JRBA 3W3OA 3M5ZA 1I2PA 3UY8A 3HB9A 1H7WA 2R91A 5HUOA 2X30A 2ZZ1A 1UUMA 3G18A 3LHUA 2ZZ6A 1ICSA 1VS1A 3G8EA 3TE9A 4A2RA 5AC8A 5F2MA 4FNUA 1I45A 1M5WA 1QPQA 1A5AA 4EOUA 4UNKA 3LHTA 1YXYA 4WOQA 1SZNA 3PULA 4JNMA 4MPQA 4WD0A 3W1RA 3QQ1A 2UV8G 4FX7A 4S2CA 3QQ0A 3HIJA 1FCUA 3NA8A 1PVNA 2DP3A 1H63A 3TU9A 3DGRA 5DBTA 1SU5A 1ADOA 4OU1A 5AYYA 1OVDA 2VFHA 1RQHA 1Z42A 4JYDA 4Q32A 5BW6A 3LCIA 2VXNA 3PSVA 5HWJA 1LOLA 3U2OA 2X1RA 1G7VA 3WJZA 1AMKA 1VYRA 1YDNA 3W7CA 2ZA1A 3QJAA 5EKYA 3F4NA 2X2GA 4BK9A 3NQ2A 3O07A 3BW3A 1SZEA 1D3GA 1R2RA 3RLUA 4IXXA 5G2IA 5U4NA 3NQDA 1OHLA 2BXVA 4B5NA 1O95A 4O52A 3WK1A 4R53A 1H7OA 4AEOA 3SW6A 3NL3A 3BK0A 5HR7A 2HS8A 1HG3A 1R30A 5KZMA 1NFBA 3GNNA 4IPIA 4FNRA 2A4AA 5F1VA 3HG2A 2NXGA 1SZFA 3MI6A 3QW3A 4O4WA 1FCVA 3DH7A 3LXCA 4O11A 2GQ8A 4NNBA 1XL9A 1TPB1 4N6FA 3GLCA 3PUOA 3CU2A 4L4MA 4JDBA 1JUBA 4HHPA 1NF0A 2ZRYA 1RVGA 1RD5A 1TQJA 3B4UA 4JY9A 4NUWA 2V2HA 1I2NA 5AFDA 3VCRA 2RHGA 3CT7A 2FPYA 1TO3A 2YPIA 1DQXA 3LXAA 3MI3A 4OWGA 2QKFA 5H91A 3YPIA 4JGDA 1QOQA 4LRTA 4K7VA 2ZZ2A 1JUEA 3DFPA 1XBYA 2H3DA 2VEKA 2XN0A 1J4EA 4YCOA 3SGZA 3HO8A 4JXCA 2CZ5A 5IM51 4QAIA 2AQWA 5EBUA 1R2TA 4FB7A 2ABBA 2QF7A 3L0NA 4CQ9A 4GRSA 2HTMA 6ALDA 4A21A 2C13A 3ABRA 4RCXA 2QJIA 3LCHA 1NAL1 3M47A 3TMLA 2NWSA 3G1FA 1FCBA 3EWUA 3S1XA 3LCFA 3EWBX 4DF0A 1WA3A 4LS0A 3W22A 1H62A 3E12A 2XFWA 5HWMA 2ATSA 1D9EA 3SSJA 4BFAA 5D2TA 1GG1A 3TUUA 2FDSA 3UWVA 4QNEA 1BWLA 4M6VA 5I3JA 3MBFA 4AWTA 1KM4A 3MUXA 2CLIA 4Y8FA 4X2RA 3ANYA 1M7PA 4NJJA 4KKXA 5FEZA 1TRDA 1DORA 1FDJA 2R8WA 4FIRA 4Z08A 2Y70A 3W84A 2V2CA 5LGZA 3W6YA 3UQNA 3WFAA 1FWSA 1IGSA 1KLYA 1DKWA 4GUIA 2QCGA 1P5BA 2W79A 4ZVJA 4MOZA 4U28A 1RZMA 3O63A 1KM1A 4O1DA 3F4WA 3W1XA 1U83A 5K9DA 2ZBTA 1LORA 1Z44A 4FNSA 3BVJA 5AN7A 4MFEA 3VE7A 3THQA 1WBHA 1YTEA 3PBUA 3SI9A 4MY1A 2C18A 3S5YA 3OEXA 2PURA 2E77A 5AC6A 3A21A 3W1PA 3W74A 3DXIA 3FYPA 3W1TA 1G7UA 3W85A 1XC4A 4XBKA 3NDOA 4CNPA 3MO7A 1MO0A 4GWEA 1BKSA 2A21A 2A2IA 2ZRVA 3TC6A 1G6CA 2H6RA 2HMCA 1TPVA 4YCPA 2EF9A 2YXGA 2XN2A 2VOMA 4IX2A 2BX7A 3R12A 3PB2A 3P5ZA 2Q8ZA 1X1OA 3GXPA 1B4EA 3G0XA 5HULA 1K7FA 1HL2A 2NX3A 3W75A 3N34A 2YSWA 5D38A 4FEZA 1KM2A 1A50A 4UTMA 1I8JA 3AO0A 2D73A 3W71A 1H1YA 4IMEA 1HO1A 4N02A 2FB3A 2GVLA 3BLFA 4RR4A 1N8FA 4UFHA 3T78A 4TO8A 4UXDA 4OV4A 1OK6A 4Z1DA 1S5VA 3CWNA 4GNJA 2E09A 3TXZA 2FIQA 1LM1A 1JRCA 4I7UA 3QF0A 3M9YA 3FFSA 3O8AA 4AXKA 2PC4A 3PG8A 4XKYB 3BO9A 3SZ8A 1Z41A 5AYZA 4RKAA 1XBXA 3IV3A 1RPXA 5K9CA 2CWNA 1FWRA 4C1LA 1IXQA 2JGQA 1OFEA 4KWVA 1KFCA 1A5SA 4AF0A 1YDOA 4XTIA 3TJXA 3SECA 3UWYA 2EHHA 4UNLA 3A24A 2ZZ5A 2OZ0A 3DU0A 4HPXA 1KM6A 4NJKA 8TIMA 3LTYA 3G1XA 4X22A 1BWKA 3DFTA 4W9TA 2GUUA 1JUKA 2NXIA 1FDYA 3AJXA 3L21A 3EX2A 3EX6A 5D2VA 6TIMA 2Y6ZA 2O7QA 2CLOA 2OX1A 2EGZA 3C2FA 3M5XA 3KXQA 3NOEA 4FO4A 3W2NA 4HNUA 4K8EA 1L6YA 2GJNA 2DU2A 3STFA 1OX5A 1WOBA 3QPYA 4UFKA 1U5JA 3KVJA 3EWXA 1K03A 2OT1A 3O05A 5LNWA 3ELFA 3A9IA 3UZ5A 3LHWA 2GVJA 5E93A 4JD4A 4MY9A 5FF3A 3TAKA 4MZ8A 1H51A 4GUJA 1W37A 1DL3A 3MP4A 4UUIA 2PRMA 4GC4A 4O54A 3S5ZA 3EKLA 4YMZA 1T96A 3PY2A 1KTBA 3P8IA 3DFNA 2QAPA 5TBOA 1DQWA 4L4LA 3BW2A 2B7OA 3PC0A 3G1VA 4DO4A 4QIUA 4R34A 3QYQA 1MEIA 4QJ1A 4FXRA 2J9XA 3MHGA 3S8HA 3I7SA 3R2GA 3S1UA 1H61A 2C6QA 2QCDB 3H54A 1VLIA 4OHQA 4UTTC 1IF2A 4PFMA 5DY3A 4POCA 2ISWA 1GTEA 4ZQRA 5LNVA 1SR9A 5C55A 3LCLA 4Y96A 2A6NA 3T7VA 4LNYA 1SO4A 1DVJA 3P5YA 1R2SA 5LZLA 2WOQA 4N9CA 2CLLA 3W2JA 4X9SA 4MYAA 2R14A 3S5OA 1JCMP 3LM7A 2CZDA 2NV2A 2BTMA 3UPBA 3TDFA 3EEGA 4N9EA 3W07A 3GDTA 4FNPA 5BOOA 3LV6A 1FY6A 4K6AA 4DO5A 2A7NA 2QCEA 3W7MA 2JKPA 3SR7A 3TR2A 3OHIA 2E5CA 1QNVA 3I6RA 1C8VA 1IXOA 1LTDA 4JTSA 2FB2A 4H6KA 1KV8A 3P61A 2DZWA 1GYNA 5BNKA 3W2MA 2KZHA 5TQLA 2ZZ4A 2J6XA 3TH6A 2J9YA 3RK8A 3S5NA 2JK2A 2QCCA 3N14A 5F4XA 2Y7GA 3M44A 2FQIA 2H3BA 3QC3A 1TYGA 1R46A 2C3ZA 1LOQA 2ZRWA 1VH7A 3WK3A 3QPZA 5KINA 3LBMA 2NWRA 3HG4A 1TJRA 5DY2A 3W1QA 5L9FA 4ONVA 1GQNA 1XCFA 4HKPA 4LRSA 3W2UA 4NJGA 1TTJA 3W7DA 1JVNA 1EP3A 3O6CA 2FTPA 1TPFA 1F5ZA 1ZCOA 3HPSA 4EVZA 4ZQCA 4K7YA 4U4MA 3R5EA 3N2XA 3P82A 3L66A 4LV9A 4Y6GA 4A2SA 4WZHA 4BI7A 4UTTA 3IIXA 1GVOA 4GUHA 3VFLA 2E6FA 5H2ZA 4MJMA 5LNUA 5SWUA 1JULA 4XKYA 3LBCA 4UC5A 1O5XA 5KMYA 4O1BA 4ORIA 3W73A 5HNRA 3NQVA 1ZFJA 1PIIA 1VHNA 4HSNA 2H90A 4E0CA 3NNTA 2Q8LA 4P2VA 4WOZA 3HG5A 2VKZG 3NM3A 2NUYA 3NYZA 2W0UA 2CLFA 2WNNA 2RDWA 4KFNA 3P62A 5AHEA 5KITA 2GPTA 4UTIA 4RZ5A 1ICQA 1MSSA 4M6PA 1WOAA 4HPJA 5GVJA 4GBUA 3S9YA 4A3UA 2P10A 4XTDA 4TMCA 2QDHA 3E49A 2QUUA 3DHDA 5IBXC 1THFD 3STGA 1DV7A 3C2OA 3L0GA 2CLKA 4M7TA 2A1YA 1VJIA 3L9CA 3A23A 1GG0A 1QOPA 4JTKA 5EPDA 3FJLA 2G96A 1Q6LA 3EX4A 1N7KA 4Z0JA 2TYSA 2Y63A 5HINA 2V5BA 3G24A 3BGGA 4XBSA 4PEKA 1WQ5A 4CCEA 2ABAA 4XUGA 1H7PA 4AAJA 4E2DA 3B0UX 4FNQA 1Q3NA 3W7JA 4J9JA 5G4WA 3DI0A 3UXAA 3KRSA 1PS9A 3G8RA 1XUZA 4RZ6A 1F6PA 1OFOA 5K2ZA 3W7QA 1KBJA 3IIOA 5BRBA 5FEWA 1UBSA 1Q45A 1YTKA 4QISA 1ZAIA 4AHOA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3ARW A;  2JKA A;  3DKJ A;  1SVD A;  1BRL A;  3TN4 A;  2PCE A;  4OBT A;  4B4F A;  1NTH A;  3M0J A;  5G1M A;  1KTN A;  4B2D A;  4CQ8 A;  2E6Y A;  3AUO A;  1ZZM A;  3ZJ6 A;  4P8X A;  3DHF A;  4YTU A;  4O0Z A;  3GS6 A;  3M0V A;  5CC5 A;  2MUC A;  2OO0 A;  1SQ7 A;  2ASH A;  1VHC A;  1QO2 A;  4LY4 A;  1GZG A;  4HJF A;  3QPE A;  2OYM A;  4JZ5 A;  1TV2 A;  3BUV A;  4QFU A;  1XUU A;  4ZTY A;  4F0S A;  3OBE A;  2YZR A;  2YYU A;  1YE4 A;  4MZY A;  1A5C A;  1DWG M;  1JXK A;  1FH8 A;  1BYA A;  1JCX A;  4HQV A;  1O94 A;  3W1U A;  3HU7 A;  5CPM A;  4PB3 A;  4QDW A;  3ZYZ A;  4V28 A;  3PWG A;  3W1M A;  1E40 A;  3NO1 A;  2F2H A;  2D2O A;  2R1K A;  4KIR A;  5FJJ A;  1EDQ A;  4GXM A;  4WSH A;  5D4Y A;  1W5P A;  1AJZ A;  2CLH A;  2VX4 A;  3QV6 A;  4GIR A;  3ZR4 A;  3ITC A;  1WKY A;  2XZ7 A;  1JFX A;  1O60 A;  4IP7 A;  1XV8 A;  3C52 A;  3IAR A;  1SFL A;  2INF A;  3SCU A;  3RJY A;  1M04 A;  1HGW A;  5C9R A;  2EG6 A;  5EMY A;  4UNI A;  3P2V A;  3B05 A;  4BKN A;  4CQA A;  1EX1 A;  3KVK A;  1LZO A;  1K8X A;  1P0N A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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