3HIJ | Genus

Total Genus 111

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	111
sequence length	292
structure length	291
Chain Sequence	MIDFGTIATAMVTPFDINGNIDFAKTTKLVNYLIDNGTTAIVVGGTTGESPTLTSEEKVALYRHVVSVVDKRVPVIAGTGSNNTHASIDLTKKATEVGVDAVMLVAPYYNKPSQEGMYQHFKAIAESTPLPVMLYNVPGRSIVQISVDTVVRLSEIENIVAIDAGGDVLTMTEIIEKTADDFAVYSGDDGLTLPAMAVGAKGIVSVASHVIGNEMQEMIAAFQAGEFKKAQKLHQLLVRVTDSLFMAPSPTPVKTALQMVGLDVGSVRLPLLPLTEEERVTLQSVMQSIPR

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Substrate-mediated Stabilization of a Tetrameric Drug Target Reveals Achilles Heel in Anthrax. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Dihydrodipicolinate synthase
molecule tags	Lyase
source organism	Bacillus anthracis
total genus	111
structure length	291
sequence length	292
chains with identical sequence	B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date	2009-05-20

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00701	DHDPS	Dihydrodipicolinate synthetase family

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.20.20.70	Alpha Beta	Alpha-Beta Barrel	TIM Barrel	Aldolase class I	3hijA00

4RX0A 3HBLA 3DHDA 4O4VA 1RQEA 1H7OA 4AF0B 1CI1A 3EXRA 4IMEA 3O6DA 4UCGA 1J2WA 3W2UA 3D0CA 4O50A 1N8FA 4JNMA 4NZFA 1K8XA 6TIMA 4MLJA 3LERA 4RV8A 1OFOA 2NXIA 4YWIA 5AHIA 4B5NA 1O94A 2OX1A 4JEQA 1H1YA 2A0NA 2PC4A 3QM3A 2X1RA 3R12A 4OE7A 1XBYA 2NXHA 4DBEA 3LGEA 3DFPA 5G1YA 2VOMA 2YCEA 1EP3A 3UXAA 3WJXA 4UTMA 3W1TA 3BGJA 1LLZA 5C5YA 3I7SA 3S5YA 3TXZA 1DJQA 1IXOA 4A21A 3GXTA 2YPIA 4LW7A 6ALDA 3MBFA 4HSOA 1OHLA 1NF7A 3PY2A 3QSTA 4ADUA 1JULA 2FB2A 1IGSA 5AYXA 2ISSA 4WOQA 1VYRA 1LBLA 5EPDA 2C16A 3QQ0A 4POCA 2P10A 1IIHA 2ALDA 5D37A 3TIMA 1X7FA 4NXSA 3G1YA 1CX9A 4JYEA 2J9ZA 2ZRWA 2ISWA 3S6DA 1YXDA 3W2KA 4HHPA 1OFDA 1G67A 3CPRA 4LV4A 1H61A 4RLIA 2WQPA 3N14A 1GTEA 3DAQA 2WKJA 1X1OA 1LZOA 1YDVA 5DY3A 3W2JA 4AWUA 2WOQA 3BW2A 1H5YA 1H7PA 4EF9A 4UTTA 3G8RA 3T40A 2QCCA 1OYAA 5L9FA 1G69A 1G4TA 4UMBA 1NAL1 1VH7A 3OEXA 4IMDA 1GYNA 5CPOA 5DELA 1QFEA 3EXSA 2GQAA 4N4QA 1QMLA 3FJ6A 4X22A 3C0JA 2EF9A 4FNPA 3LCIA 3S42A 3E49A 4TO8A 3PSVA 1WOAA 4M6VA 2F7FA 2VELA 4GE8A 3TQVA 3PS7A 4PC8A 1PE1A 1XBXA 1QWGA 3LCLA 2B7NA 4GRSA 1OFAA 1F6KA 3B06A 4U28A 3EEGA 3L5AA 5AHEA 3QPYA 3DH7A 2WSQA 4YLWA 4FB7A 3IVUA 3HOJA 1LM1A 3W1PA 5MHBA 2P1FA 1TV5A 1EP1A 1TPWA 3TFCA 2R91A 1PHQA 2DORA 1H1ZA 1LBFA 1AK5A 4IXHA 4JDBA 4QQ3A 2Z1BA 4JDYA 2C0AA 4NX0A 1SFLA 4UUIA 5AYYA 2H3DA 5HR7A 3O1NA 3VCRA 5HWNA 3S5ZA 3DXIA 1QPRA 1TQJA 2CLFA 3DKLA 2FDSA 3NL2A 1VCFA 4MJZA 1TREA 1C29A 4WX2A 3BG5A 3U2OA 1TRIA 4IX2A 3O6YX 2YW3A 4O19A 2A1YA 3MJYA 4DPQA 3H53A 4UFIA 2ZZ4A 1FUYA 3P81A 5CZ0A 5E93A 3W7KA 4FXRA 5D38A 1GVQA 3DFNA 1R2TA 4GWEA 1M6JA 5CG7A 2B7QA 4ZQNA 4J9JA 2OT1A 3G8EA 1O4UA 5U4NA 2Y7GA 4C1LA 2OMAA 1GEQA 3CIXA 3GNDA 1MO0A 4IMFA 5EBUA 5CPLA 5HWJA 4O54A 3HMJG 4FF7A 2BLEA 5D02A 1GVRA 2ZRXA 1G4PA 4O1BA 1SW0A 1RV8A 1NEYA 3LLFA 4E38A 4RK8A 3S1VA 1EEPA 4Y6GA 3I68A 3W7EA 3KAOA 4C1KA 2VFHA 1SQ7A 1DV7A 2B7OA 1ML1A 3VKJA 1W5MA 4O0ZA 1B9BA 2G96A 2V82A 1X1ZA 4X2RA 3PB0A 3S5NA 4QNEA 1W0MA 3GDTA 4NX5A 1OK4A 3FIGA 5FF4A 4JTSA 3CC1A 3M47A 3I7QA 3IV3A 2NZLA 3HGRA 2PRHA 2QJGA 2YGYA 3EX2A 3RLVA 5C2XA 3LCFA 1AL8A 4LRSA 4M7SA 3QSRA 3IIZA 3GZ3A 4CNOA 3SW6A 5I3GA 1Z42A 5DCBA 3CTLA 1T99A 3G0UA 4OGZA 1EWDA 3W74A 1LBMA 3M9YA 4O4WA 3C8FA 2JKEA 1THFD 2J88A 5I3KA 2RFGA 5KITA 3STCA 1UASA 1DHPA 5HWMA 5K2ZA 3JR2A 2E68A 4ICNA 5LNSA 3E96A 3KFTA 4JYDA 3B03A 1H63A 3W70A 4JX6A 1I2OA 4OHQA 4RKAA 3GXNA 2YXGA 3C2OA 1KLZA 3W7JA 2QJIA 3P8IA 4N9DA 2I14A 4WOZA 3T44A 2NWSA 3W23A 4PL2A 2CW6A 3CQ0A 4O57A 1QNVA 4NNBA 4R34A 1JCJA 1XKYA 1ZY9A 2C6QA 4JTIA 3TSDA 3JS3A 1F2JA 3NEVA 1LROA 3BW4A 1VPXA 3WK1A 3NQ6A 3F03K 2ZZ6A 3GR8A 3C4UA 1W3TA 1W54A 2QCHA 1FY6A 5D32A 3B0PA 3SGZA 3W6YA 3DU0A 3M5VA 3EB2A 4UTWA 5CKSA 2JK2A 3HG2A 3DFSA 4NT0A 1VYPX 2VFFA 3TCEA 4ORIA 1W5QA 2XN1A 1IXNA 1V7YA 1SUXA 3W7OA 4ZQPA 3LB0A 1VQTA 1OG0A 1W5NA 2ZRYA 3PUOA 4O11A 4N4PA 1F76A 1TPDA 4OV4A 3LI1A 4I7VA 3NQEA 1T96A 3NGJA 4OT7A 1SO3A 2ZA1A 3F4WA 4MLRA 1W3NA 1SSDA 3CEPA 4IUOA 3OVRA 3U6WA 4O1AA 5D03A 3M6YA 4N6EA 4Q32A 2H8ZA 3UWQA 1C8VA 1VC4A 3MI2A 2QDGA 1EWEA 5LSMA 4EIVA 1EP2A 2Z2UA 3L9CA 4BI5A 2QCMA 4YCPA 2QCGA 2C18A 1SR9A 1KTBA 4KFPA 1W1ZA 1DJNA 3CM4A 1XCFA 3GR7A 4LV9A 3NPWA 2QCEA 5EL1A 4DF0A 3BVJA 3LTPA 3O6CA 3S1UA 4DPPA 4BWLC 3EWWA 4MYAA 1MXSA 3WK2A 4MZYA 1TYGA 4GC4A 4HNNA 4QM1A 5H2ZA 3YPIA 3BLIA 2Y7FA 4FNRA 1G7VA 5LNRA 2V2DA 1P1XA 4UFKA 3DKJA 3LDVA 2WNNA 2EGZA 1NVMA 3TJXA 2BTMA 2CZDA 4BI6A 2C1HA 3SGUA 4N9EA 5DCEA 2WSRA 4HNUA 5FEPA 1GVSA 2GVGA 4WXYA 2HS6A 3W7PA 4QSHA 2F84A 3G18A 3PC0A 3EKZA 4E0CA 5IBXA 1CW2A 5I3FA 1H50A 4K8EA 2YFOA 1EB3A 3T7VA 2ZTKA 4YCOA 2OCZA 5K7JA 5DXYA 5D30A 1FWTA 2Q8LA 4O12A 1L9WA 2CLMA 4ZL1A 2YYTA 5D2TA 5LHFA 4LS2A 2ZZ2A 3W7QA 3GX9A 4WY0A 4D2JA 5CGQA 3GKAA 2G95A 1JUEA 2V8ZA 3NVTA 3R5EA 5KMYA 4MY1A 3E02A 1YPFA 2C15A 3IIXA 5A5WA 4DF1A 3RFAA 3PBVA 2YSWA 3L5LA 3NXFA 1TJRA 3P82A 3UPWA 3NPXA 1HFBA 2X30A 3F1QA 1G6CA 3W87A 2JGYA 1ZAHA 3MP5A 4MZ1A 3M7WA 1TV8A 2CLIA 3NNTA 1A5AA 4O17A 2VXNA 4OWGA 2NX1A 3G3MA 1Q3NA 5G2HA 3NAVA 3P60A 4XZ9A 1D9EA 4BR1A 3KRZA 3P5ZA 1TIMA 1OFEA 2VENA 2DU2A 3MHGA 3MW7A 3UWZA 2ZQ0A 1R30A 1YTEA 1KFEA 1F74A 3Q58A 3G1DA 3PWAA 3P5YA 2ZCGA 3TV8A 1WXJA 2YW4A 5F2MA 4R7JA 2IQTA 1KM1A 3O15A 1DQXA 2E5DA 4K7YA 4S2BA 5AB3A 5AHFA 3B0UX 1R2SA 4Q33A 4BFAA 1BWLA 3ELFA 4AVFA 2R14A 1YYAA 1PV8A 1HO4A 3EWBX 4EWND 3HPZA 3MHUA 4TX9A 1NSJA 2D73A 3L0KA 3UZ5A 4AAJA 4CCCA 3TQKA 4DF2A 1K8YA 3LRKA 5AHNA 3W73A 2ZDRA 3CLMA 3N3MA 3GDKA 3B4UA 4HN4A 1JRCA 4N9CA 3EWYA 2H3BA 4QIUA 4ML9A 5H91A 3BPWA 1GVOA 1C9DA 3PUDA 2Q3OA 4NJHA 3TUUA 2CLOA 4UR7A 3MBDA 2FB3A 3M41A 2ZZ3A 4Z1BA 3L21A 2DP3A 1TSIA 3DENA 5G4WA 3TW7A 1OX4A 4NVTA 4KWWA 3DGRA 1XDMA 1RPXA 3OIXA 4IOTA 3B04A 4XBKA 2GVJA 2QDHA 2P0OA 5T26A 3PUEA 5LNWA 1WYIA 1YTKA 4E2DA 4UTWC 4R33A 4JGDA 4TMBA 4FNTA 2GQ8A 3ATYA 1FWWA 1LYXA 5J5RA 4GUJA 3LCGA 1BTMA 1SW7A 1TPVA 1KM4A 3W1UA 1N7KA 3PVFA 4Z1DA 4HNTA 1LTDA 3EWUA 4X9SA 3M44A 3P67A 3A22A 4O1DA 1G4EA 1IF2A 2QKFA 3Q2DA 3QMSA 3DFOA 4MUZA 2Z0IA 5HULA 3NG3A 4RR4A 1VR6A 1O5XA 3TX9A 3KRSA 4XQ6A 3W1MA 1TRDA 3LRMA 4MY9A 1JR1A 1GT8A 2I9EA 3E9AA 3W1QA 5FEXA 3P84A 5HUPA 2VKZG 2J24A 3KVKA 5LGXA 3G1SA 4XTDA 5FF3A 5BNKA 1PVNA 3E0IA 3BG3A 3N73A 1VLIA 1FXPA 2Y63A 3EKLA 3KX6A 4NXKA 4PA8A 3LBMA 5K4ZA 2HSAA 4DEFA 3BGGA 1RQBA 2FLIA 4JY8A 3MP3A 1LDCA 3EWZA 1OFQA 3I6RA 2V5LA 1OYBA 4WZHA 3ZFHA 2UV8G 2CLLA 1FBAA 1FX6A 2CLHA 3IGUA 1FWSA 3H54A 4JX4A 1SW3A 2YFNA 4UNKA 3GB6A 3BLFA 1EPXA 5C55A 1JJKA 3FFSA 3RU6A 4LVGA 2XN0A 4BWLA 2BX7A 3C61A 1K03A 3DI0A 3W1LA 3MYOA 4LTSA 3UWYA 4FNUA 2ZZ1A 1AMKA 4UXDA 4Z1CA 5K9CA 1JCLA 2EHHA 2PRLA 5IBXC 3NO5A 1FDZA 3W1AA 4FX6M 5DBTA 2Y6ZA 1T8XA 1OF6A 2WJZA 4HIBA 1K7FA 1ZALA 1Q6QA 3QF0A 3B8DA 3G3DA 4HKPA 3N34A 4BF9A 5D04C 3UD6A 4UTHA 3ATZA 4QJ1A 2OT0A 2ZFAA 4IPIA 4W9TA 1AW2A 1YDOA 1JUBA 3NQDA 4JD4A 4IPJA 1HL2A 4UR8A 4PFMA 3HF3A 1PS9A 1XI3A 1VRDA 4MZ8A 1EUAA 3TK7A 2A2IA 3LHVA 4HPJA 4DELA 1B4KA 1KLYA 1S5TA 1X6UA 2RDTA 3P8JA 4FNQA 1AG1O 4ORMA 1B57A 4ADTA 1H51A 4P2VA 3FLUA 1F05A 1TO3A 1FWNA 3E12A 4JN6A 1H7XA 4QNWA 3W7NA 4LC6A 1Z41A 4EVZA 4JR5A 1DL3A 1R47A 3KXQA 1X8FA 4N02A 4AEOA 1TPFA 2TPSA 1EIXA 3W76A 3G1XA 1JCMP 3P62A 3HPSA 4PL1A 3NOEA 3B0VC 4O14A 3NPUA 3G1HA 4FEZA 2X1SA 3ANYA 4IGHA 4JTGA 3W1RA 1TTIA 3VNDA 5FESA 3MMTA 3N19B 3M1ZA 1ME8A 4M6QA 5CZSA 3STEA 1TTPA 5GVJA 5I3JA 4K39A 3PG8A 3GIYA 3DI1A 1Y0EA 4QAIA 2QR6A 1GTHA 2RKXA 4CLMA 3FA5A 3GDMA 1A5CA 2Y7DA 3IGXA 3C2RA 5FEWA 3BW3A 1TCDA 3PB2A 3LHUA 5HQEA 3OG3A 4OBTA 4GFSA 4MFEA 4IX0A 1F5ZA 1KW1A 3A5VA 1GYLA 1A5SA 2CWNA 3C2EA 3NM3A 4H3DA 3W86A 4CCDA 8TIMA 3W3OA 1DOSA 2NUWA 1JCYA 3NZ1A 3P80A 1OX6A 3LHZA 2DZXA 2TMDA 2GOUA 1TV7A 1SU5A 3KHJA 3SZ8A 1P5BA 2V30A 5LNUA 3NQCA 3I65A 2R8WA 3L0GA 3WJSA 1W3IA 4UTLA 5G1TA 2E77A 4O52A 5BW6A 5G2IA 4FO4A 4RZ4A 2YX0A 4RXFA 3S1XA 3HGOA 3G0XA 5FF2A 5KSWA 3QMRA 3MP4A 3PBWA 3BG9A 2VFGA 1JQVA 3AO0A 3UWWA 4WD0A 2QEZA 4DO6A 3B05A 1AW1A 3W1NA 1Z44A 1JCXA 4YMZA 2XN2A 1KBJA 5TQLA 1QOQA 4BI7A 3SECA 3C2FA 4L4MA 2BSLA 3PF3A 1HUVA 2A4AA 3FYOA 2QUUA 1UJPA 1JQXA 2Y85A 4TU1A 5I3HA 5K4XA 1JVNA 4AXKA 3W84A 3QYQA 3LV6A 2A6NA 3C6CA 3G24A 1NF0A 3R89A 5CPMA 3QW4B 3PSWA 4FX8A 4M5PA 4O0KA 2J27A 2DZUA 1ICQA 3M0ZA 3PULA 4MY8A 1AW5A 3LI0A 2DJLA 3GVGA 4AHPA 1LOQA 3L5MA 1WOBA 4PTNA 2X1UA 3O07A 2ZRZA 3M43A 1P0NA 1SFJA 1WDWA 3BV4A 3M16A 3QC3A 2LLEA 4DXVA 4N2YA 1RVGA 2GVLA 5HNRA 2Z6IA 4A2RA 1BKSA 4UTKA 4GXMA 3LHYA 3ZWSA 1N55A 5CPNA 2CLEA 1YTDA 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2QCLA 1IXQA 1SZFA 1KV5A 1WAUA 2QUTA 2VEKA 2NUXA 2YYUA 5AC6A 1I2PA 4GBUA 3H55A 1SSGA 5IM51 3HPXA 1QO5A 1LLWA 1K7XA 5LZLA 1UB3A 4UTIA 1ALDA 4TR9A 1B4EA 3O06A 1XBVA 3C52A 3G0SA 3IIPA 4LY8A 3ABQA 1TQXA 1GPWA 1ZJIA 1YXCA 4ZMGA 4LVFA 4O18A 4HNVA 1V5XA 2EKCA 4UTUA 1FQ0A 3RMJA 2CZFA 1XBZA 3N2MA 4UMAA 4G1KA 2JKAA 2QF7A 4LS1A 1PL9A 4FNSA 1ZENA 4EF8A 4MYXA 2E6AA 1SO6A 1VS1A 5BRBA 3LXCA 3TMLA 4NZJA 3W2LA 4JYFA 1ZFJA 1PIIA 1ZAIA 4Y90A 4BK9A 1WA3A 4XBSA 4MJMA 4LUJA 4RCXA 1OVDA 1PCKA 2WNQA 4MOZA 3CU2A 2V81A 1OFRA 5FF0A 4YL2A 2TYSA 1FWRA 4NJJA 2V2HA 1QPNA 2NV2A 3NR0A 3A23A 5G5IA 3TE9A 3TH6A 1O95A 3W85A 2GJLA 3GXPA 3NQ2A 4ZZ9A 1LRQA 4KWVA 3VI2A 3HJZA 1MEWA 2DZSA 3W22A 2VEPA 5EKYA 2RDUA 1UUOA 1MEHA 1DVJA 1GG1A 5E1QA 1TPUA 4MVAA 1F73A 2DZWA 4JTFA 4I9AA 4Z0JA 4WY0B 2Y61A 3UYCA 2PE4A 2E5CA 4M19A 3WJYA 4RXGA 1MEIA 2NX3A 3FJLA 3SR7A 1VJIA 4JXCA 3NQ7A 4A29A 4GNJA 2QUVA 4JS3A 3R8RA 3DBPA 4LC8A 2AGKA 3TSBA 2TSYA 3LRLA 4CCEA 4Y8FA 3N2XA 1AL7A 1XUUA 1XFBA 3LBCA 4TIMA 3W72A 1I8JA 1S5WA 1OX5A 2H6RA 1FXQA 5AHLA 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chains in the Genus database with same CATH topology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3HIJA

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