3W88A

Structure of trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with sh-1-200
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
314
structure length
314
Chain Sequence
SMCLKLNLLDHVFANPFMNAAGVLCSTEEDLRCMTASSSGALVSKSCTSAPRDGNPEPRYMAFPLGSINSMGLPNLGFDFYLKYASDLHDYSKKPLFLSISGLSVEENVAMVRRLAPVAQEKGVLLELNLSCPNVPGKPQVAYDFEAMRTYLQQVSLAYGLPFGVKMPPYFDIAHFDTAAAVLNEFPLVKFVTCVNSVGNGLVIDAESESVVIKPKQGFGGLGGKYILPTALANVNAFYRRCPDKLVFGCGGVYSGEDAFLHILAGASMVQVGTALQEEGPGIFTRLEDELLEIMARKGYRTLEEFRGRVKTIE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structure of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase in complex with SH-1-200
rcsb
molecule keywords Dihydroorotate dehydrogenase (fumarate)
molecule tags Oxidoreductase/oxidoreductase inhibitor
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 105
structure length 314
sequence length 314
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.3.98.1: Dihydroorotate oxidase (fumarate).
pdb deposition date 2013-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01180 DHO_dh Dihydroorotate dehydrogenase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.26.10 Mainly Beta Roll Dihydroorotate Dehydrogenase A; chain A, domain 2 Dihydroorotate Dehydrogenase A, chain A, domain 2 3w88A02
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 3w88A01
1G69A 1RVGA 5LHEA 1G67A 1FWWA 3LCGA 1TPC1 3W7PA 4UFMA 1THFD 2A6LA 4EF9A 3WK0A 5D32A 4O50A 1TV8A 5SWUA 1OYCA 3NGJA 2YXGA 1JUKA 3HB9A 3VKJA 3W07A 3STCA 2QCLA 2YW4A 2QJHA 3F4WA 5HINA 1CW2A 3THQA 1JUBA 2VELA 2JKPA 4WOQA 4M5PA 1OYAA 1TPDA 3L5LA 3C3NA 5HUPA 3BG5A 3TDFA 2GVGA 1I2NA 3NQMA 5HULA 3GDKA 1T0OA 5MHBA 3WJYA 1YPFA 3I7QA 1XBZA 1VC4A 3K30A 2FQIA 3AJXA 3HPZA 4QQ3A 1PVNA 3B05A 3WFAA 3Q2DA 2ZZ2A 4LV4A 4UTHA 3HGSA 2VEMA 1K7XA 3W1RA 1IXNA 5HR7A 3O07A 1OFRA 2YW3A 3R89A 5BW6A 3CEPA 4KFPA 4AVFA 5D02A 3HGJA 3PC0A 2G96A 3E96A 4IPIA 4K37A 4DF2A 1FQ0A 2O7SA 5LGZA 4JTEA 3W1XA 2QAPA 1ICSA 2HS6A 3EXRA 3VFLA 1FCVA 5K9XA 3DH7A 1F2JA 3VE7A 4FF7A 3TE9A 1TV7A 3L5AA 1LBLA 1M5WA 5CPMA 4TIMA 4E38A 2DP3A 3NZ1A 5D2YA 5G5IA 5AHNA 3FJLA 5HWNA 1XC4A 3P7YA 1KFLA 3MHFA 3BVJA 3UWQA 1AL8A 3TK7A 3W1MA 2I14A 2XN0A 5AOUA 5DCEA 4Z1BA 4JR5A 4M6PA 1LLWA 3L21A 4WY0B 4UTWC 4CQ9A 1W5QA 1EUNA 1O5XA 1ME7A 4OE7A 3EWZA 3CQ0A 3PULA 4HNUA 1PCWA 3P5ZA 3SR7A 3G8EA 3UPBA 2D73A 1K8XA 4NXSA 2DU2A 2XN2A 5D2TA 4CQ8A 1UBSA 3LOTA 3A22A 2G97A 1PS9A 1UUOA 3P61A 3T44A 3M43A 1XBYA 3GB6A 3MHGA 1F6PA 1VYRA 2EPHA 5FF7A 3EXSA 3N9RA 5AYXA 1D3GA 3NPVA 3ZR4A 4O15A 3QMTA 4AMAA 1E51A 5TIMA 4K38A 4UR8A 1L6SA 1K7EA 3R8RA 2J88A 4I9AA 1NFBA 1VZWA 4BF9A 4RJEA 2Y61A 1QWGA 2ZCGA 2H8XA 4UIOA 3O16A 3N14A 3L2IA 2V2CA 3O15A 2BZNA 2VFGA 3M5YA 3W83A 3STEA 5CPLA 1O4UA 2X1UA 1TPB1 4ZZ9A 4NZJA 3CT7A 5AN7A 2QJGA 3M7WA 3NM3A 4IMFA 1WX0A 3LCIA 3U6WA 1OFQA 3NOEA 3PAJA 3W2NA 3MP3A 1JRCA 3N73A 4UTMA 1OK4A 2CLLA 4JYFA 3P81A 2B7NA 3Q94A 1I2OA 3C8FA 1OFBA 2H3DA 3MW7A 3QQ0A 3M5VA 3U8GA 5HWMA 4MZ1A 1VH7A 3HG3A 3V75A 3W7LA 4JTKA 3DENA 1O94A 4Q33A 2XN1A 1QDSA 4BK9A 3LHVA 3NQFA 2XFWA 1S5WA 3TJXA 1QNVA 5AB3A 1EPXA 4LVDA 4OWGA 1B3OA 5CZTA 3IIPA 3S6DA 2HSAA 4HN4A 3HGRA 1TPH1 3TC6A 3UXAA 1J4EA 4PFMA 4NQ1A 2JBMA 5F1VA 4JTTA 1R47A 1WXJA 3TIMA 1LOQA 3L66A 3LERA 1YTEA 5FEWA 4WQ6A 1ZCOA 4ZQOA 3PM6A 1H7OA 2RDUA 2QDGA 1W3NA 3BGJA 1GT8A 1PCKA 1JJKA 5CSRA 1TTQA 4O8RA 1VR6A 4O57A 3CIXA 3G1YA 1HUVA 3F4NA 3P62A 2ATMA 4O1DA 2PRMA 1I2RA 3QW3A 2WNNA 1ICQA 1LOLA 4GE8A 1KA9F 2QR6A 1KV8A 4ML9A 3IVSA 3I7SA 3WK2A 4UTJA 2W6RA 3DFTA 1W5MA 4TU1A 5K2ZA 1OG0A 2ZRYA 4WD0A 4EVZA 1GTHA 2QJIA 1DJQA 3MP5A 3TJLA 2QEZA 1SUXA 3HBLA 3L9CA 1C9DA 2YR1A 3W1AA 5F1UA 5D2XA 2ZZ4A 5I3IA 5HJLA 4Q4KA 1YDNA 1UUMA 3OBKA 5I3KA 3FLUA 1OX6A 3DFNA 1Z41A 2NXGA 3A23A 1ZAIA 2F84A 1OHLA 4JTIA 4UFKA 3W71A 3KRSA 2NUXA 3IIZA 3W22A 2QCMA 3C0JA 2RHGA 2VOMA 2TSYA 3NQ7A 3NR0A 5EPDA 3GKAA 4Z1DA 3NQ6A 5F4SA 1A5CA 3O6YX 2EKCA 3NAVA 3W1NA 4R7JA 2YX0A 1FDZA 2Y7EA 2YFNA 4QAIA 4MZ8A 2CW6A 4ADSA 3R5EA 4NT0A 4XKYA 5IM51 1H5YA 3BW2A 1SO3A 1PE1A 3BLEA 3GDRA 2ZBTA 4FX7A 3PS7A 3SIZA 4FHAA 3UNDA 1MZHA 1S5TA 2QCHA 1C8VA 2NX1A 3NL2A 2HMCA 4EIVA 1QFEA 2RFGA 4IX0A 2I1OA 1N55A 3NDOA 4KKXA 5A8GA 3QSRA 5LNVA 3G0SA 4IXXA 3UWWA 2V81A 4FNQA 3AO0A 3FIGA 3L65A 3M5ZA 4JX5A 5LZLA 1P5BA 1ZENA 2AGKA 2E5BA 5I3FA 3KVKA 5GVJA 1KV5A 2YYTA 4LS2A 1NSJA 2QUTA 4S2CA 1TTPA 3GR7A 2F7FA 1SW7A 1L2UA 5U7SA 5DXXA 1KBIA 5CKSA 1KTNA 1GEQA 4AF0A 3NVTA 1SSGA 3R2GA 4HSOA 3M0ZA 4K7YA 2J9XA 1FXPA 4IGHA 5D30A 3EWUA 4AHPA 1W54A 2NUYA 2WV8A 4GC4A 1Q6RA 4HSNA 5C6MA 3QMRA 3TFCA 4FNTA 1P0KA 1X7FA 3IVUA 1B57A 3R12A 4WXZA 3ZFHA 3VNDA 3LV5A 3P8JA 3N34A 4ZVJA 4D2JA 1R46A 2OJPA 4LRSA 3GNDA 3HG4A 2C15A 4ORMA 5FF2A 3VE9A 1R2RA 4HT3A 4WJEA 1KM0A 2YSWA 1UCWA 1FWTA 1CX9A 3KAOA 3MWAA 3ZWSA 2QUVA 4MKNA 5AHFA 3T4CA 4JY9A 4LW7A 3MBFA 1OX4B 3QEZA 1FX6A 1SO5A 3NZRA 1VYPX 4NJHA 1S3HA 1M6JA 4UTKA 3W9ZA 4BI5A 1EA0A 1Z42A 4CNNA 1P1XA 1XDMA 2DZUA 3L67A 3MHUA 1HO4A 1SO4A 3O05A 3PWAA 3EWYA 3ATYA 3UWYA 5FF4A 5D33A 3V1PA 4AB4A 3G0XA 2E5CA 3M9YA 2VFFA 3W7JA 3N2XA 3LTPA 1UJPA 4YCOA 3LHZA 4FO4A 3DXIA 1YDOA 5DXYA 2H8ZA 3UYCA 4N9EA 1RZMA 1GTEA 3FKKA 3B06A 3GKFA 3MP4A 4OGZA 4OT7A 2YPIA 1H60A 5KZMA 3M47A 3CPRA 4YXGA 2NXIA 1JQXA 2ZTKA 4GUJA 1KFKA 2ZDRA 4A2RA 4YWIA 3TQVA 4JTLA 4JDYA 2VFHA 4K8HA 1NF0A 2GJLA 2ISSA 5FESA 3S5YA 3GX9A 1DL3A 1H61A 3W7CA 1OFEA 4MFEA 4ORIA 2CZ5A 3NQGA 2J9ZA 4AEOA 2QCNA 3H55A 4BFAA 5G4WA 1QPQA 3L68A 2DZWA 4N9CA 5DY3A 6TIMA 5G1YA 4QNEA 5AHLA 4UMCA 1VJIA 1TTJA 2V8ZA 4A2SA 3LV6A 3QQ1A 4EF8A 4DBEA 3HIJA 3GZ3A 3W7EA 4NXKA 2CLOA 4LY8A 3T40A 4LC6A 3LLFA 1DJNA 4LVFA 5L6UA 1RR2A 3CEUA 5L9FA 1AW5A 4ZQMA 1SZEA 3W88A 1EUAA 4LVBA 3O6DA 2VEPA 3W85A 3GLCA 1MO0A 1VGAA 3QC3A 5CZJA 1XCFA 3THAA 3H54A 3GNNA 2E6FA 2C13A 1XL9A 4LVGA 1K8YA 2C3ZA 3P74A 1YYAA 4UNKA 2DZXA 3PR2A 4N4QA 3P60A 1BTMA 5EL1A 3O06A 3RF9A 3ABSA 1EX5A 3CIWA 5I3HA 4O0ZA 3DFQA 3L0GA 4K8EA 2V5BA 1VCFA 3SECA 1H50A 1X6UA 4PH6A 3S8HA 3LXCA 2A7RA 3NQAA 4MY1A 4TMBA 1HG3A 1H7XA 4HKPA 4NJKA 3IGXA 1G6CA 4PC8A 4ZQNA 5I3JA 2R94A 2WJZA 1W8SA 2ZZ6A 1R2SA 2VEKA 3DKLA 4Y8FA 2ZRZA 2ZYFA 1R30A 4O1BA 2VFEA 3GAYA 5T26A 3HQ1A 3B0VC 1YPIA 3HF3A 2YFOA 3G3DA 4WY0A 4RXGA 1WAUA 1KM1A 4K6AA 1G4PA 2ZZ7A 3CWNA 4Z1CA 4KFNA 4OBTA 3PG9A 3QW4B 4E0CA 1XKYA 4UTIA 3TMQA 3W74A 3S5ZA 3BV4A 1XUUA 4R53A 5AYZA 4UTLA 4NJGA 1GPWA 2NV1A 1QR7A 2OT0A 5HR6A 2J9YA 4QITA 1VRDA 1OFDA 4GBUA 3P8IA 3MJYA 1SFLA 4HPJA 1EIXA 4KWVA 1YLVA 4K36A 3FFSA 3FS2A 3W7GA 1A5BA 1IXOA 3LBMA 3C2RA 4UTWA 2VXNA 3W1UA 3M44A 1BWKA 2QAFA 3BARA 4GUFA 1OF6A 2GJNA 2Q3RA 3A24A 4RR4A 3U2OA 1LZOA 1F7BA 4LOCA 4L4LA 4RXFA 3IIXA 3RMJA 3FA5A 1VPXA 3E12A 5AHIA 1WDWA 1SW0A 4JDBA 2GUUA 4HNTA 1FCUA 3G18A 2RH9A 3UQNA 3W2MA 3QMSA 4O0KA 1TPFA 3KX6A 1GVFA 1F05A 1WV2A 4UUIA 4NJJA 1MEHA 2UV8G 3N2MA 1FWNA 2R14A 3TQ0A 3DFSA 4N2YA 4ADTA 3DFOA 1FWRA 2QCFA 2CLMA 4H4IA 3TMLA 5G2HA 4CQAA 3C2OA 4I7UA 2OZ0A 5EYWA 1B9BA 3G3MA 1ZALA 2QKFA 2VEIA 1Q6OA 1QPNA 3E02A 2A0NA 2GQAA 3E49A 1LTDA 2E6AA 3UWZA 3MYOA 3GXTA 4RKAA 5DBUA 3PUEA 4QSHA 1L6YA 2E09A 3WJXA 4DQWA 4XBSA 2FJKA 4RZ6A 1QCWA 4IMDA 1OABA 2X30A 1L6WA 1LBMA 3MUXA 1I2QA 5EY5A 3S1WA 4GNJA 4E2BA 2I9EA 3B03A 3KRZA 1X8FA 3BO9A 1T8XA 2B4GA 3NQCA 5G4EA 4NZFA 1TREA 2WPBA 3BPWA 2FLIA 3IIVA 3B4UA 3TX9A 3TCEA 4B5NA 3W72A 2RDTA 3M1ZA 3EEGA 1LDCA 1SZGA 1TO3A 2H6RA 5H91A 3EX1A 2J27A 3TR2A 4TX9A 5F4XA 3O6CA 1XDLA 4NJIA 7TIMA 3W1TA 4FXRA 4ZQRA 1I2PA 3D0CA 1ICPA 4MFDA 3IIOA 2FFCA 1HTIA 5C5YA 4U28A 2WNZA 3QM3A 4UCGA 3UZ5A 2C0AA 2ZZ3A 3S1XA 4MZYA 4Y9AA 3WJSA 2CZDA 2NZLA 4A22A 4LVAA 3M41A 2CZFA 2AAMA 3LCFA 2Y85A 4CLMA 3T78A 1KFBA 3CLMA 3S42A 3G1AA 3NL3A 2Y7FA 3GDMA 4IPJA 1G4EA 2NX9A 1JULA 4EOUA 3SGZA 1H62A 1ME9A 3KOFA 4NNCA 4M7SA 3NYZA 2TMDA 1GQNA 4RCXA 3NO5A 5D03A 2WKJA 3DHFA 2JKAA 3TKFA 4IX2A 3CU2A 1VHCA 4JIPA 2A21A 4RLIA 4Z1AA 4R34A 1Y0EA 5HQEA 4XZ9A 2Z6JA 4CNPA 1LRQA 5HMSA 3EX2A 3TXZA 3S5NA 2Z0IA 3SI9A 1X1OA 5E93A 3G1XA 2E6YA 4IMGA 1DBTA 3LHUA 3RNDA 3YPIA 1W0MA 4Z0SA 1AMKA 1VQTA 3C52A 1LRTA 1KTBA 3DI1A 3W1LA 1QOPA 3UY7A 2O7QA 4M19A 5KITA 5H2ZA 1HO1A 1LRNA 3DZ1A 1EWEA 5LNRA 5LNUA 1LLZA 1KM4A 4O13A 1QMLA 1K8ZA 2Y62A 1VYSX 1W3IA 3HGOA 5C2XA 3DAQA 1IIGA 3TW6A 5LNWA 5EBUA 4DO6A 5K3VA 4W9TA 3PB0A 3QPYA 4UNLA 2FTPA 2RDWA 3FEMA 1W37A 3DU0A 1MEIA 5HWJA 3QSTA 4ZL1A 1GVQA 3BG9A 3W7MA 4XTIA 2ZA2A 3LRMA 1T99A 3FOKA 5TQLA 4UMAA 3PBUA 2X1SA 4FX6M 3QPZA 4JXCA 1A5AA 2PRLA 3C4UA 2Q8LA 1KM5A 5D37A 4PTNA 3L0NA 3SSJA 5BNKA 4FEZA 1J5TA 4LTSA 1OFOA 4LRTA 4JYDA 1TCDA 2OT1A 1DVJA 1EP1A 3OG3A 3UWUA 2VKZG 1DHPA 4O12A 5LSMA 2ATSA 2X1TA 4DPQA 3KRUA 3RK8A 3DHDA 3HPXA 1TB3A 2FB2A 2CU0A 1V7YA 4U4MA 4NU7A 1ZNNA 3H53A 5CSSA 4ALDA 4WY0F 1RQEA 4XTDA 4FNPA 1DKWA 2OMAA 3W2KA 1JCLA 1TSIA 1XBXA 8TIMA 1LORA 3IV3A 2X2GA 4WXYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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