2B7QA

Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from helicobacter pylori with nicotinate mononucleotide
Total Genus 66
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
66
sequence length
273
structure length
273
Chain Sequence
MEIRTFLERALKEDLGHGDLFERVLEKDFKATAFVRAKQEGVFSGEKYALELLEMTGIECVQTIKDKERFKPKDALMEIRGDFSMLLKVERTLLNLLQHSSGIATLTSRFVEALNSHKVRLLDTRKTRPLLRIFEKYSVLNGGASNHRLGLDDALMLKDTHLRHVKDLKSFLTHARKNLPFTAKIEIECESFEEAKNAMNAGADIVMCDNLSVLETKEIAAYRDAHYPFVLLEASGNISLESINAYAKSGVDAISVGALIHQATFIDMHMKMA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of quinolinic acid phosphoribosyltransferase from Helicobacter pylori
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase
molecule tags Transferase
source organism Helicobacter pylori
total genus 66
structure length 273
sequence length 273
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 2.4.2.19: Nicotinate-nucleotide diphosphorylase (carboxylating).
pdb deposition date 2005-10-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01729 QRPTase_C Quinolinate phosphoribosyl transferase, C-terminal domain
A PF02749 QRPTase_N Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2b7qA02
3.90.1170.20 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aldehyde Oxidoreductase; domain 3 Quinolinate phosphoribosyl transferase, N-terminal domain 2b7qA01
1DJQA 4M6VA 3SECA 4IGHA 1XBZA 2NXHA 4IMFA 3LCLA 1JRBA 1H62A 5EY5A 4X3ZA 4O4VA 3W7IA 2C15A 3NZRA 2OMAA 4IOTA 1MEWA 3G3MA 5F2MA 1EWDA 3N3MA 3QMTA 2CLEA 4ZQCA 5HNRA 3F4WA 1T0OA 2GVGA 3NQMA 4I7UA 4WOZA 3W86A 4A2SA 4MJMA 4PH6A 4CNOA 3KVLA 4W9TA 3LDVA 1G4SA 3BLIA 1QFEA 4JGDA 3S1WA 2VEMA 5A5WA 4N6EA 4MY9A 3QEZA 4MFDA 1GT8A 3LRLA 1UB3A 4RCXA 5HWMA 1ZALA 3KVJA 1YXCA 2Y7EA 1H63A 2ZRYA 3HOJA 2VFDA 2JK2A 4UFJA 2WSYA 2Y85A 4YLWA 4BI5A 2Y89A 2DZPA 2YGYA 2OZ0A 1YXYA 1LORA 4UTWC 1B4EA 3T7VA 7TIMA 1GTEA 1UBSA 1ONRA 3LHTA 3UPWA 1LDCA 3CWNA 3EX2A 1K8XA 2A7RA 4Z1DA 4FXRA 2YX0A 3LCXA 4MLRA 1QPQA 4ORMA 3DBPA 2VFIA 2W79A 4MIMA 4PTNA 1DORA 4QM1A 3LLFA 3IV3A 3HPZA 3L21A 4Z1BA 4JX4A 3TCEA 1DQXA 2V9DA 3PM6A 4OT7A 4EWND 1UUOA 3YPIA 3CEPA 2V2DA 4FNPA 4UMBA 4NZFA 3Q2DA 5AHMA 2YFOA 4I7WA 1KTCA 3W1QA 2FDSA 2A7NA 4BWLA 2QCCA 3W7JA 1JUKA 5DELA 3BG3A 4UXDA 3FS2A 4CNPA 2YXGA 1YPIA 5G2WA 3M7WA 4DO5A 3ZWSA 4ORIA 5G2HA 4K6AA 1H7NA 1L6SA 4JYDA 1KFKA 4R7JA 1K7XA 5G5IA 1TYGA 3NQVA 3NVTA 3UYCA 4ZMGA 3UWYA 1QWGA 3GDMA 2WNNA 2CZDA 3W87A 4LVGA 3E96A 3C8FA 1EX5A 2FPYA 3OVQA 2Y61A 1WOBA 4MFEA 3LTSA 3FA5A 3UD6A 1VYRA 1LYXA 2ZBTA 1TCDA 4JTTA 3LCWA 3FIGA 4M6PA 3PWAA 3DFSA 4A3UA 5AC7A 3DAQA 5DCEA 3P82A 3T78A 5F2LA 5CSSA 1MEHA 5K7JA 1KM6A 3M5YA 4QISA 3TE9A 4TIMA 2EGZA 4LS1A 4UFIA 5C6MA 4MZ8A 4NJHA 3EX4A 3TW7A 3ZS4A 3NQ6A 4S2CA 3QJAA 4K8HA 3EWYA 4N6FA 4UC5A 1OABA 3IVTA 4IMGA 2E5CA 2E5DA 3TJXA 3UZJA 1O4UA 4L4LA 5KINA 4GRSA 1LRTA 1SW3A 1DQWA 1OFQA 5CSRA 1JCYA 2ISWA 1OFPA 3NL6A 1PHWA 2QJIA 3NNTA 1BWLA 3WK0A 1GPWA 4RJEA 1H1ZA 3NQ8A 4EF9A 1FBAA 3RU6A 4EOUA 2ZZ4A 4N9EA 5DN1A 3W3OA 1LOQA 2NLIA 1Q6RA 4AWUA 4GUIA 4BI7A 4XBSA 5C2XA 4NNAA 3C0JA 3W2MA 1FWSA 1H60A 1XUZA 2Z6IA 4QJ1A 4IWWA 3O1NA 4ZVJA 5J5RA 2YFNA 4MY8A 3PAJA 4LS2A 3GDLA 4FX8A 3QSRA 4JIQA 3GKFA 3LBMA 3LI1A 3KX6A 1ME7A 4JTSA 3GX9A 5LNVA 3M5XA 2I9EA 3O15A 3P74A 4U4MA 5DBTA 1QPOA 1JJKA 3TMQA 2WQPA 2Y62A 4CQ9A 3PSWA 5LGZA 4WX2A 5LNSA 1KM1A 4C1KA 3S1XA 5HMSA 2A5HA 3EKLA 3DKLA 4UNKA 3SY5A 3G1FA 1XXXA 4MPQA 4XBKA 1TV7A 1ICSA 3LERA 1KFCA 4DF2A 5G2IA 4JY8A 4LU0A 2Q3OA 4WY0F 5F4XA 4UTKA 3WK1A 3SFKA 3I65A 2ZTJA 1HO1A 3VE7A 3P80A 1GVOA 2WNQA 2QAPA 4M7SA 3LLDA 3U6WA 4O19A 3KFTA 4NVTA 4FX7A 3LHVA 3N19B 4NNBA 3E9AA 2GVLA 1N8FA 4M5PA 1EPXA 1PV8A 1PVNA 4O50A 5L9FA 1FCVA 4O1BA 1NVMA 2VFEA 2YSWA 3TC7A 4UTWA 3TSBA 3W7CA 4TMCA 1GVRA 3S5OA 3HG4A 3GR8A 3O06A 3HBLA 3WK3A 2ZRUA 4MYXA 1KM4A 2TYSA 1KM5A 3A23A 3PF3A 2G5WA 2RDWA 1L2UA 3QF0A 1AL7A 3I7RA 3CM4A 3T55A 4CQ8A 1EA0A 3L5LA 2CLLA 1F5ZA 4DF0A 1PIIA 4Z0SA 1F73A 2I1OA 2X2GA 1WBHA 1O95A 3TNOA 4XKYA 5CZ0A 1VC4A 3KVMA 2I14A 3THAA 2GQ9A 1OFOA 1E51A 1VCFA 2VELA 4JXCA 5HUOA 3S6DA 3M6YA 2ATSA 3N14A 3LCGA 4JDYA 3SW6A 3SSJA 3MO7A 3NXFA 1FCUA 3DZ1A 4N2YA 3G18A 8TIMA 2EAWA 1FXQA 1W56A 4N4PA 3VI2A 1AMKA 1TQXA 3TKFA 1PHQA 2CLOA 1SZEA 4O4WA 4WUIA 3M5ZA 3W1TA 1KFBA 4AB4A 3M43A 1R47A 5KZEA 3PBUA 5HJLA 1HG3A 3HJZA 3SI9A 3F4NA 3BW4A 4AXKA 4GUHA 2DORA 4FIRA 2ABAA 2NX3A 4FNSA 1FCBA 2X1SA 1SZNA 1QO2A 3BW3A 1A5CA 4LT9A 5EYWA 1TMHA 3GVGA 4FNQA 3TJLA 2VENA 3M41A 3HMJG 4E38A 3OBKA 2GPTA 2C16A 4WZHA 1YTDA 2H6RA 1JULA 1H7RA 1U5JA 5EA9A 5FEXA 3W07A 4BR1A 1L9WA 4RLIA 5LHFA 3G24A 1F05A 5C54A 5D04C 4IMCA 2C6QA 4X9SA 1JCJA 2E6YA 2ZZ5A 4N4QA 5AHIA 4O15A 4KFOA 2OT1A 4TMBA 2FPTA 4XUGA 2Z6JA 2CZEA 3W7EA 4JIPA 1RD5A 2QAFA 1F6KA 3KRUA 3NQCA 3HGSA 3CWOX 2CWNA 1DJNA 4IMDA 5KZMA 5FEZA 3G0SA 4O11A 1RPXA 4RZ4A 5HULA 2X16A 3GDKA 4O16A 2C19A 1TTQA 5U4NA 2P10A 4DBEA 1IXPA 3NA8A 4PODA 1X1OA 5F2IA 3N73A 2Y7DA 3H54A 3B0UX 2AAMA 4LVAA 4XWUA 2CLFA 4QSHA 1ZHAA 2QUUA 3WJXA 4GNJA 3PY2A 3EWXA 2O7SA 1EUNA 5F2GA 1TB3A 1KBJA 4Z08A 3S5YA 4PC8A 1GZGA 3UWQA 3LI0A 2QCFA 3MJYA 5I3IA 1BKSA 2G95A 3TAOA 4OQVA 4UMAA 4LS0A 5I3JA 4QAIA 2Q8ZA 4ZZ9A 3W7PA 1Z42A 1W5NA 1OF6A 5KSWA 3QMRA 4LC6A 1GG1A 3O63A 4JTGA 5AYZA 4O57A 1QOPA 2CFFA 4Y96A 1F6PA 1UCWA 1C9DA 3E49A 3VKJA 5FF0A 3EX3A 1I2RA 1MXSA 3DFTA 1FWNA 2CLIA 3FFSA 2B4GA 3W23A 3PS7A 2PE4A 1D3HA 1TRDA 2NV1A 2YDAA 1SFLA 5U7SA 5D05A 1ZCOA 1H7WA 3M47A 3TDFA 1G6CA 4OWGA 4IMEA 3OIXA 4O12A 3DHDA 4HPJA 3A5FA 2VEIA 2QCMA 4NQ1A 2VEPA 2NZLA 4JTEA 2OX1A 1JCNA 4DO6A 1QDSA 2LLEA 2WOQA 5EL1A 4X22A 2ZZ2A 1B4KA 3NEVA 3TUUA 4O8RA 1ZY9A 2ZDRA 2Y6ZA 2GQAA 4HNNA 3PUOA 4FXSA 3C2VA 3W74A 3STCA 4KWVA 4LVDA 3ZFHA 1RQBA 1QO5A 2HS8A 3TX9A 1B57A 3STGA 5FF7A 5CKSA 1FDYA 3VFLA 3STFA 3W1UA 4TU1A 4RXFA 4L4MA 2JBMA 4JDBA 2BSLA 2R91A 1Q6LA 4UIOA 1W5QA 3SGZA 3PULA 1OX5A 4UFHA 2FB3A 5HUPA 3A5VA 2H90A 3L2IA 5TQLA 2FIQA 5F1VA 1TPDA 4RR4A 2VXNA 5D09A 1XI3A 1K02A 3V1PA 2QDGA 4CCCA 1U83A 4C1LA 2ZQ0A 3TXVA 3W85A 1ZENA 2Z0IA 1JUEA 1JQVA 3L0KA 1W37A 3G1AA 5EMUA 5HWNA 3LHWA 5BRBA 3W7OA 3NG3A 1J2WA 2VFGA 3M5VA 3IIVA 2RFGA 1KFLA 1QPRA 3P61A 5TBOA 4YCOA 2QCHA 1AK5A 3ZWTA 3W7NA 3GR7A 1W3IA 4HSNA 3LXAA 3B06A 4LRSA 4P61A 2QCLA 4AVFA 2HSAA 2DZWA 5AOUA 3CT7A 1KLYA 1MSSA 1VRDA 1RVGA 1EP3A 1ZNNA 3BPWA 1PCWA 1G67A 4JS3A 3NDOA 2EF9A 1L6WA 3DHFA 3W1XA 3LCFA 3MI3A 3H53A 4X2RA 1OX6A 3AO0A 5GVJA 4EVZA 1YLVA 1CI1A 4QQ3A 3BARA 1XFBA 1WYIA 4ZQNA 1WXJA 3MBFA 1KV8A 1OG0A 1OK6A 2E09A 3VNDA 3WJYA 1HO4A 3B0PA 2FB2A 3R13A 3Q37A 1HL2A 1N7KA 4O1DA 1SO6A 3MHFA 1VHNA 3U8GA 3TSDA 3Q94A 3WK2A 3W83A 4GUFA 3QFEA 4YWIA 3W7QA 1W54A 3BG5A 4Q32A 2XN2A 3IIXA 3NAVA 5C55A 2EKCA 3MWAA 3NR0A 3V75A 1SPQA 1LRQA 1FY6A 5L6UA 5DLCA 1AL8A 1FQ0A 2V81A 4HT3A 2OCZA 3N2XA 2P1FA 5DY2A 1H7OA 2J9XA 5EBUA 4DXVA 3TIMA 3FJLA 3DFPA 2ZRZA 1TV8A 2EPHA 3TQ0A 3F03K 5AHEA 5I3FA 2YW4A 3QZEA 4JTFA 4AF0B 2NWSA 1SSGA 3CPRA 5I3KA 5K2ZA 4BFAA 3WJWA 5F4WA 2A2IA 4AHQA 1NEYA 1LBMA 1XUUA 1A53A 4AEOA 3OG3A 3L0GA 1UUMA 2J6XA 3A21A 3L66A 1IXOA 4NJKA 4E0CA 1TRIA 3ZR4A 1DV7A 4XZ9A 3MYOA 4FX6M 2VEKA 2ZZ7A 1P0KA 1BTMA 4LOCA 2ZA1A 5K9DA 2ZYFA 5FESA 3NQEA 4ONVA 3CB8A 2YYTA 4UFMA 2YCEA 5D03A 1I2QA 3UY8A 3IIOA 1J5TA 1H7PA 4O54A 4OV9A 3P67A 4FNRA 1FDZA 3C2FA 4JY9A 3EWUA 1ZAIA 3P8JA 4ZL1A 4LUIA 5LHEA 5LNUA 3H55A 3EX6A 1FX6A 3R89A 3C2EA 2A6NA 1AW2A 2BZNA 2ISVA 2YW3A 3KXQA 4UTIA 3QM3A 1ZFJA 1J4EA 4LV9A 1QPNA 4NJGA 1WV2A 4MVAA 4JEQA 5D2TA 2AQWA 4JX5A 3FLUA 1Z48A 4NUWA 4D2JA 1QNVA 3EX1A 5I3GA 5G4EA 1W3TA 4TX9A 3SGUA 2GVJA 1SR9A 1AW1A 2CLHA 4AF0A 1EIXA 3FKRA 2HS6A 3W73A 1ICQA 3NPWA 1OYAA 3GDRA 4IXHA 1X7FA 3UWZA 3L0NA 1R30A 3T4CA 3O16A 4GC4A 3EXTA 4N9CA 5G1TA 1K3UA 3DI1A 3SIZA 1BEUA 1ML1A 3ABOA 4NZJA 4GUJA 1I2PA 4WOQA 2EHHA 1NFBA 1OYBA 2C1HA 3TQKA 3EKZA 3LV6A 4RX0A 3G1SA 2Z2UA 1GWJA 4A22A 4UTHA 1W5MA 4DEFA 3HF3A 1VZWA 4XKYB 4CCEA 4WJEA 2CZFA 3BG9A 3MP3A 4XQ6A 1W31A 3TFCA 3N34A 4ADUA 5DCDA 3DU0A 2H3DA 5AN7A 5D2XA 1TO3A 4DPQA 3PBYA 3IVSA 3GAKA 3W7KA 4OU1A 1YADA 1YTKA 3GNDA 2VFFA 3I68A 3P62A 3S5NA 2R14A 2BXVA 3LXBA 4JICA 3STEA 1OHLA 1KLZA 1VYSX 5H2ZA 1I2NA 3MP4A 4RK8A 1LROA 2QUTA 1KM0A 2JKAA 4FEZA 3BLEA 3N9SA 4NXKA 1DBTA 2VOMA 3HG5A 4NNCA 5FI8A 3AJXA 2WSQA 1M7OA 1ZAHA 3QW4B 4FIQA 1T96A 3TFXA 1JR1A 3THQA 3LTPA 1A5BA 2RDUA 3HGJA 2H8XA 2B7QA 4DBDA 4HSOA 4O14A 3BW2A 3QPZA 4K38A 2BLEA 1YXDA 3LV5A 2O7QA 2QCNA 3FYPA 1KTBA 1G4EA 5KITA 3NQGA 3I6RA 3W7MA 1IGSA 3QRHA 2QCEA 3CHVA 3UXAA 3ELFA 3NYZA 1WQ5A 3CEUA 4PL2A 1XC4A 2BX7A 1R46A 2RKXA 2WSRA 3KOFA 4O0ZA 4Z1CA 1XDMA 2E6DA 3KHJA 4OE7A 1DL3A 3DKJA 4O17A 2H3BA 4OHQA 4O28A 4ADTA 3M16A 2GOUA 1A5AA 1VHCA 2CLKA 4UFKA 2QJGA 3OVPA 4MZ1A 1H50A 1TPFA 2WO5A 2TSYA 2J9YA 1IF2A 1K03A 4O18A 1UASA 1R2TA 3PB2A 4LC8A 5D02A 2B7OA 3JRKA 1GVSA 4UTUA 3TMLA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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