2PE4A

Structure of human hyaluronidase 1, a hyaluronan hydrolyzing enzyme involved in tumor growth and angiogenesis
Total Genus 139
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
139
sequence length
417
structure length
417
Chain Sequence
RSFRGPLLPNRPFTTVWNANTQWCLERHGVDVDVSVFDVVANPGQTFRGPDMTIFYSSQLGTYPYYTPTGEPVFGGLPQNASLIAHLARTFQDILAAIPAPDFSGLAVIDWEAWRPRWAFNWDTKDIYRQRSRALVQAQHPDWPAPQVEAVAQDQFQGAARAWMAGTLQLGRALRPRGLWGFYGFPDCYNYDFLSPNYTGQCPSGIRAQNDQLGWLWGQSRALYPSIYMPAVLEGTGKSQMYVQHRVAEAFRVAVAAGDPNLPVLPYVQIFYDTTNHFLPLDELEHSLGESAAQGAAGVVLWVSWENTRTKESCQAIKEYMDTTLGPFILNVTSGALLCSQALCSGHGRCVRRTSHPKALLLLNPASFSIQLTPGGGPLSLRGALSLEDQAQMAVEFKCRCYPGWQAPWCERKSMWT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of Human Hyaluronidase-1, a Hyaluronan Hydrolyzing Enzyme Involved in Tumor Growth and Angiogenesis
pubmed doi rcsb
molecule keywords Hyaluronidase-1
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
total genus 139
structure length 417
sequence length 417
ec nomenclature ec 3.2.1.35: Hyaluronoglucosaminidase.
pdb deposition date 2007-04-02

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01630 Glyco_hydro_56 Hyaluronidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 2pe4A00
2B7QA 3OIXA 1RV8A 3RLVA 5KTLA 2X30A 2E1DA 4UFJA 5AFDA 1UBSA 3NL6A 2P0OA 2BX7A 3O07A 3BPWA 1XBXA 3PY2A 3EEGA 3P8IA 5F4XA 4RXFA 3JRKA 3PBWA 3S42A 1IXQA 4UTHA 1WX0A 2HSAA 3GNNA 3M5XA 4XTIA 1Y0EA 2GOUA 2ZZ3A 4RX0A 4JX6A 3FOKA 2ZZ5A 5G2WA 3LHTA 1NAL1 1R2SA 4E38A 5FEZA 4DO6A 4EF8A 4JR5A 4P61A 4MFDA 1X8FA 3SR7A 2GJNA 1JVNA 3DBPA 4BR1A 3TC7A 1OX5A 4NUWA 1TPH1 3C0JA 4U28A 2YX0A 3GDMA 2O7QA 2QCDB 3L5AA 4JTHA 4HNTA 5H91A 1KW1A 1K8ZA 4LVGA 3LGEA 3M44A 2B7OA 1KFEA 3B0VC 1MSSA 2CFFA 2P10A 5C6MA 2Y61A 4K6AA 4N9EA 4R53A 2J9YA 5CPOA 4O57A 4X22A 5AOUA 3HG4A 1N7KA 4DF2A 4UTWA 3TQVA 2V8ZA 4R33A 2ABAA 1I45A 1VHNA 1KM1A 3BLEA 3DHDA 3O16A 5CZJA 3A24A 3C2RA 4ADSA 1LOLA 4LVFA 2DZSA 3W9ZA 1XDMA 3W1TA 4UIOA 1PHQA 5DN1A 3UNDA 1OX4B 4HHPA 3E0IA 1KTNA 1EUNA 3EWZA 4HT3A 1C9DA 4E2DA 1M7PA 4IMDA 3DH7A 1VHCA 4NNCA 1VYSX 1UCWA 2IQTA 1EP3A 1OFOA 3DFQA 4LNYA 4N4QA 3C2EA 4UTWC 3GZ3A 1Z44A 4A3UA 1JRCA 1PVNA 3T7VA 3B03A 1HL2A 3F4NA 1YYAA 2BLEA 1X1OA 4AHOA 3F4WA 3FA5A 2V9DA 2C6QA 3PB0A 4LS0A 3GDLA 5K9DA 1TTJA 1F6KA 1ME9A 3L68A 3MHUA 3IV3A 3D0CA 3HGOA 3LDVA 1DQXA 1XBYA 3WJZA 2YDAA 4BI5A 1EWDA 2H3BA 4K7VA 2QCNA 2E6YA 4I7UA 3LHYA 3W1MA 1TRDA 2B7PA 2CU0A 1VQTA 4GE8A 1OFEA 3W74A 1QAPA 3LHZA 4MIMA 1TSIA 3W72A 4CCEA 1TCDA 1W5OA 2C19A 5G2IA 1VLWA 1NSJA 3UZ5A 5HWMA 5HR6A 4RJEA 1EP2A 5A5WA 3QMSA 4IUOA 3WJXA 3LHUA 1YDNA 5G4WA 3VE9A 5DBUA 2TRSA 1JUEA 2VKZG 4TMCA 1SW7A 4H6KA 2FB3A 2NX9A 1FWTA 4UTTA 4O14A 1OYBA 4OQVA 3R13A 2WSYA 1PCKA 1OFAA 3TFCA 1E51A 2O7SA 3I7SA 1ZFJA 1J2WA 3NPUA 2E5CA 2Y63A 1AG1O 3R89A 1KA9F 3W07A 2GJLA 3PB2A 3A5FA 3WJYA 2JGYA 3B0PA 3YPIA 4EF9A 2ISVA 1EA0A 2Z6IA 2NXHA 3P7YA 4K38A 4O50A 1WA3A 4Q4KA 3GYEA 2A7NA 3DU0A 3W7QA 3KXQA 4UTTC 3L5LA 4GUIA 2C0AA 1P0KA 3CC1A 4NQ1A 4RZ6A 2ZRVA 1XXXA 3UWQA 1W5MA 4TU1A 1ZENA 1H61A 2NZLA 4BFAA 1YPFA 4MOZA 3NL3A 3TAKA 2C16A 2ZQ0A 1MO0A 3NQ7A 4WY0F 3C4UA 5F4SA 4ALDA 3LCLA 1QO5A 3QQ1A 4I7WA 4RXGA 1SZEA 1IIHA 2QDGA 2ISWA 2GQ8A 5D37A 3TMLA 3IVUA 5CZSA 4TIMA 4W9TA 4RCXA 3TXVA 2NWRA 2ZRZA 1R46A 3HGRA 4DXVA 4LVDA 2YFNA 4CCCA 3MO7A 3IVTA 5DXXA 5TIMA 3W7IA 2CLEA 4QNEA 4JGDA 2A21A 3ZWTA 4BK9A 4O4VA 3TSDA 2Q3RA 4IOTA 1UJPA 4WOQA 4JY9A 4TR9A 1VYPX 3BG3A 2VELA 5LSMA 4LRSA 3C61A 1OK6A 4LS1A 5CPNA 4K39A 3FKKA 1TQXA 3MJYA 4GBUA 5F1UA 5LNSA 5CPLA 3BW2A 1LORA 3O15A 1FWNA 4FNSA 1IXPA 4GUFA 4BI7A 4AF0B 5LNUA 3THAA 3M5ZA 1T99A 2NXIA 1KFCA 3SFKA 3G18A 4UNKA 2EGZA 1YTKA 5LNWA 4QM1A 1OJXA 1Q6OA 2A85A 4UMBA 3DFNA 3W87A 3N19B 1NVMA 2B4GA 3S5NA 4GJ1A 4I7VA 3SI9A 4ZQCA 1HO4A 1WOAA 4MKNA 4Z08A 5AC8A 2RDTA 3F1QA 3Q94A 3W1XA 3W83A 4FXSA 3I6RA 3MHGA 4QISA 1FWSA 2H6RA 2NX1A 3HF3A 4OV4A 1P5BA 4MZ1A 2CLKA 1ME7A 1JCJA 1JCNA 4JXCA 1GEQA 1ICQA 2FQIA 1FWWA 3P60A 4XKYB 1B4EA 3G24A 4YXGA 2QCEA 4LWWA 3S5YA 3LXAA 1OF6A 3Q37A 2RDWA 3C2FA 5FF7A 4JDYA 4AWUA 3CWNA 1TB3A 3N9SA 1RZMA 1KLZA 2FLIA 2ZRXA 3EWUA 1KTCA 2Y7GA 5TQLA 4FX8A 1YXYA 1JQVA 2PRLA 2W0UA 2YPIA 1QPRA 2F84A 1RQBA 1GPWA 1D3GA 3ABQA 4KFPA 2TSYA 4XBSA 1VGAA 1TV8A 4IJBA 1GQNA 4HPXA 4IMEA 4PH6A 3LCIA 4ZZ9A 3PVFA 3STGA 2B0MA 4QIUA 2VEPA 3EXSA 4PC8A 5G1YA 4O1AA 2OT0A 1K8XA 3C52A 3NR0A 4OT7A 1Z42A 2DZPA 1QR7A 3HPZA 1MEWA 1N55A 3FIGA 4GXMA 3STCA 1TPFA 2I14A 3HB9A 2AGKA 5AC7A 5FI8A 1JCMP 1KM3A 3P8JA 2J9ZA 5LHFA 1LYXA 3SSJA 4EIVA 1S5VA 3DI1A 4E0CA 3GKFA 1DVJA 2QJGA 3GAYA 3TU9A 4O16A 4IMGA 2Z1BA 4NX0A 3N9RA 2V2DA 3P5ZA 3W1LA 1F2JA 2ZZ7A 3MYPA 4M5PA 4RK8A 4WZHA 2ALDA 1XUUA 4JEQA 3NQDA 2PRMA 5EL1A 4UR7A 1P0NA 1AMKA 4MZ8A 3S0CA 2CLIA 1NEYA 1XC4A 4ZQMA 3KX6A 3LLDA 4O54A 2ZRWA 4PL2A 4JTFA 1K8YA 2DORA 3ELFA 1U5JA 3A5VA 1K7EA 3NZ1A 2VFIA 3NM3A 3PR2A 3EB2A 4FNUA 1H50A 1PS9A 2H90A 3LRLA 4MVAA 5EMUA 1TQJA 3TROA 4OV9A 4WXZA 2A7RA 3IIZA 2V81A 3FFSA 3T78A 3FJ6A 2R91A 4O15A 4UCGA 5F2LA 1EEPA 2XN1A 4RV8A 2HMCA 4HSNA 4N9CA 5D09A 1FX6A 2EHHA 5SWUA 4G1KA 1KV8A 3W73A 3NQVA 1IXOA 1LRNA 2JKAA 3HBLA 2C18A 3LV5A 3TC6A 4K36A 1WBHA 3G1VA 3MP4A 1T8XA 4FEZA 4AHQA 3L2IA 5C54A 4DBDA 2YGYA 1XFBA 5FF4A 1VCFA 3GLCA 2EPHA 2C3ZA 2PC4A 3BW3A 4WX2A 3UY7A 3TSMA 1W5PA 3IRDA 4A2SA 3G1HA 3L65A 1LCOA 5HR7A 3RLUA 3PULA 4O1DA 2Y89A 4WY0B 4Y90A 4PTNA 2R8WA 1ALDA 3QPYA 5FESA 2QKFA 4B5NA 3ATYA 3W7JA 3TK7A 4PEKA 4O4WA 3LI0A 2C13A 2QUVA 2J24A 1MEIA 2JK2A 1ME8A 3OVPA 1KFBA 2B7NA 1XM3A 1SW3A 1LLZA 4XKYA 5D05A 1NF7A 4JTGA 3GXNA 3LCHA 2QCHA 2XFWA 1LZOA 3KVLA 4FNQA 4FX6M 3HJZA 2Q8LA 3GR8A 2Q8ZA 4IPJA 3E9AA 4A29A 5C2XA 3TE9A 3TDFA 3AO0A 1I2RA 4AEOA 2OMAA 1TO3A 5EY5A 5IBXA 3W2LA 1SO5A 3F03K 3P80A 3GIYA 2TPSA 1A5CA 1QNVA 4JTTA 1H7XA 4OU1A 1DKWA 1SO6A 1YDVA 1FWRA 3R8RA 3K30A 3SJ3A 1WXJA 3C2VA 3NQMA 3USBA 3LXBA 3UQNA 1RQEA 3ANYA 3GKAA 3W7GA 3BGGA 5K9CA 3RU6A 3PBVA 1HG3A 5BW6A 4IX2A 2D73A 3PBUA 2J27A 1TREA 4PFMA 4NXKA 3B04A 1J4EA 3TAOA 5CZTA 3LTPA 3KRUA 5IBXC 3STFA 1QOQA 3W23A 5F2MA 1KM0A 5D32A 3W70A 1S5WA 2WJZA 4N6FA 3W3OA 5LGXA 1AL8A 3S5ZA 3QJAA 4O17A 2GPTA 3ABRA 3CHVA 3W84A 2WSRA 3LV6A 3LXCA 3LCXA 3FJLA 3U8GA 4MY1A 1Q45A 3TV8A 3BLFA 1T0OA 5U7SA 3MI3A 1VPXA 3NO5A 2YXGA 1QWGA 3I7QA 3Q2DA 3OEXA 4AXKA 4AB4A 4QNWA 1H63A 4X2RA 3HOJA 2WNQA 5CG7A 3KAOA 4WD0A 1JUBA 1W0MA 2YW3A 4ADTA 3LCWA 3LCFA 1JCLA 1I4NA 3P82A 1QDSA 2QAFA 3MI2A 1B3OA 5E93A 1XDLA 1VCVA 3B0UX 3LHVA 4D2JA 1DJNA 1IIGA 4ZQRA 3WJSA 4ZVJA 5L9FA 5KZDA 2KZHA 3B8DA 3EXRA 1A5BA 3DFPA 5CKSA 3CT7A 3N73A 1YADA 2E6DA 1HTIA 3LB0A 1FUYA 3BG9A 4DELA 2Y70A 5CGQA 3T55A 5EYWA 4LVBA 3CEPA 3TMQA 2ISSA 3CLMA 1JRBA 2NX3A 2A0NA 1SO3A 1DJQA 4FNPA 1TRIA 4ADUA 4JY8A 3M7WA 4N6EA 4MYXA 4FO4A 1DV7A 4JTKA 3CIXA 2YYTA 3W1PA 1TJRA 1KFLA 3TH6A 3S6DA 3TKFA 1FDZA 4LV4A 2DZUA 1JQXA 1EX5A 1TPEA 2CLMA 3TXZA 4C1LA 4MY9A 4O53A 3LHWA 4O8RA 6TIMA 4WY0A 3UWUA 2QJHA 4Z0SA 5EKYA 1XI3A 3VI2A 4AVFA 2GUUA 3IIPA 2A7PA 1M5WA 4JTJA 1OFQA 3S1VA 1TJPA 3QYQA 3MUXA 3DHFA 4M7TA 3KOFA 4OE7A 3G1XA 1L9WA 3S1XA 2H8ZA 1KLYA 4YLWA 3NXFA 4QAIA 2QEZA 3QMRA 3TW6A 2WKJA 3KFTA 1BTMA 1YXDA 3DXIA 3PG9A 5HUOA 1GVFA 4AH7A 3S8HA 2TYSA 4FIRA 4IX0A 3NQGA 4QSHA 4IPIA 1G7VA 4UNLA 2E6AA 5HMSA 4MJMA 1YPIA 4QITA 1H7WA 3E96A 3KVMA 3MWAA 4O0KA 4FIQA 3BG5A 3P61A 3P84A 3UWVA 4WOZA 3BVJA 4DF0A 3GAKA 2LLEA 4Y6GA 1FCVA 1G4SA 1O95A 2RDUA 3PWAA 1IGSA 5FEWA 1QPOA 3M0ZA 3NEVA 2YW4A 4O0ZA 4UMCA 1XBVA 1R2TA 4GFSA 4HNVA 3WK1A 2CLFA 4JTLA 4LUIA 3IGUA 3V75A 4FHAA 1QOPA 4WJEA 3RFAA 4GNJA 4L4LA 4N02A 3UWZA 3WK0A 4KFNA 2ZZ2A 2V30A 4JX4A 5C55A 3LLFA 3P74A 4HN4A 1H1ZA 3NQEA 3G0XA 3NOEA 2E5BA 1KBIA 1F7BA 2Z6JA 1L6YA 3MBDA 3S9YA 2FDSA 4KKXA 3BV4A 4NXSA 4DPQA 6ALDA 5D2XA 3W1UA 2GQ9A 1FCBA 1W56A 1OFDA 4JX5A 1W8SA 2VFFA 1IF2A 5CSRA 2Q3OA 4H3DA 1C29A 5FEXA 3QM3A 4NZJA 3LERA 5K3VA 4UFIA 5DCDA 2ZZ1A 3H53A 1L6WA 1W5QA 5DBTA 3U2OA 1D3HA 1GYNA 3INPA 3LOTA 3HG3A 3QMTA 1FXQA 3P67A 3C8FA 3O06A 3M1ZA 4AWSA 5AYXA 1KM2A 2TMDA 2J88A 2CZ5A 3N34A 3OVQA 4UTUA 3T44A 3E49A 5HQEA 1G67A 1TV5A 4ONVA 5A8GA 3ABOA 1SZGA 4JYFA 3SW6A 2DZXA 3O63A 1I2NA 4O1BA 1PL9A 1WBJA 1GVOA 1SSGA 4RZ5A 2V2CA 1BEUA 1G4TA 4BWLC 3W7PA 1AW5A 4YL2A 1LP6A 5FF3A 1KM5A 4OHQA 4XBKA 2CLHA 1FXPA 5DY2A 4LW7A 3W75A 4O18A 4JTEA 3TQKA 4S1FA 1R2RA 3NL5A 1RR2A 4DPPA 1WAUA 3OBKA 4CCDA 5FF2A 5BOOA 3VFLA 4GRSA 2WQPA 3NPVA 2V5BA 1FQ0A 4AAJA 1TTIA 3NQAA 4O13A 3RK8A 2AAMA 2Z2UA 2CLOA 2OZ0A 1X6UA 2NV1A 5AYYA 3BGJA 3SGZA 5KMYA 2CZDA 2QF7A 1PCWA 3A22A 3PG8A 1CW2A 1AK5A 4JS3A 3W2MA 3EWXA 1FY6A 3FLUA 4ZL1A 4IMCA 2X1RA 3W88A 5U4NA 4NJJA 3W22A 1VH7A 1NFBA 3VE7A 2EF9A 3W7RA 4NJGA 2A6LA 4I9AA 3W7EA 1K03A 1PV8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2B7Q A;  3OIX A;  3VIG A;  2XG9 A;  5KTL A;  4J3Z A;  1UBS A;  3NL6 A;  3E3H A;  3R8G A;  3O07 A;  1BF2 A;  4F2B A;  2PTY A;  3JRK A;  3RGT A;  1WX0 A;  2HSA A;  3M5X A;  5E0F A;  5A69 A;  1Y0E A;  1RY8 A;  2VGI A;  1GCY A;  3FOK A;  3QN3 A;  4GNK B;  4CD4 A;  2ZZ5 A;  3FGC B;  2WBK A;  1BRL A;  1NAL 1;  5FEZ A;  1O1H A;  2WC3 A;  2E25 A;  4CN1 A;  3MVI A;  2HQA A;  1JZ6 A;  1KBL A;  2UZ9 A;  4BR1 A;  5DRC A;  3VIP A;  1OX5 A;  3KCO A;  1TPH 1;  3GDM A;  1Q85 A;  2QCD B;  5C2C A;  1LUC A;  1KW1 A;  3OOQ A;  4I90 A;  4Y7E A;  4JKL A;  2B7O A;  3B0V C;  3CHD A;  1BD0 A;  5C6M A;  1E6S M;  4R53 A;  3U48 A;  1W1V A;  2ZVI A;  4C6I A;  3A13 A;  1TEL A;  4UTW A;  5CG0 A;  4R33 A;  2ABA A;  3WQ8 A;  1VHN A;  4S38 A;  2PDL A;  4CU6 A;  3ME3 A;  5CZJ A;  2DUA A;  4UIO A;  2GUB A;  2YXX A;  1XRV A;  1C9D A;  4AG0 A;  4NNC A;  4NAS A;  1U5H A;  2OTD A;  1EQC A;  3VIL A;  3KEH A;  3WF0 A;  4L6H A;  1H11 A;  4HNO A;  1CGV A;  2YBU A;  1HKJ A;  1HL2 A;  1X1O A;  4AHO A;  3MC5 A;  4L6D A;  4BHY A;  4FR6 A; 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